تسلسل كوزاك المتفق عليه
تُعدّ متتالية كوزاك التوافقية ( أو متتالية كوزاك ) نمطًا من الأحماض النووية يعمل كموقع بدء ترجمة البروتين في معظم نسخ mRNA حقيقية النواة . [ 1 ] تُعتبر هذه المتتالية، التي تُعدّ المتتالية الأمثل لبدء الترجمة في حقيقيات النوى ، جزءًا لا يتجزأ من تنظيم البروتين والصحة الخلوية العامة، كما أن لها آثارًا في الأمراض البشرية. [ 1 ] [ 2 ] فهي تضمن ترجمة البروتين بشكل صحيح من الرسالة الجينية، وتُسهّل تجميع الريبوسومات وبدء الترجمة. قد يؤدي موقع بدء خاطئ إلى بروتينات غير وظيفية. [ 3 ] مع ازدياد الدراسات حولها، ظهرت توسعات في متتالية النيوكليوتيدات، وقواعد ذات أهمية، واستثناءات ملحوظة. [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] سُمّيت المتتالية نسبةً إلى العالمة التي اكتشفتها، مارلين كوزاك . اكتشفت كوزاك المتتالية من خلال تحليل مُفصّل لمتتاليات الحمض النووي الجينومي. [ 6 ]
لا ينبغي الخلط بين تسلسل كوزاك وموقع ارتباط الريبوسوم (RBS)، والذي يكون إما غطاء 5′ للحمض النووي الريبوزي الرسول أو موقع دخول الريبوسوم الداخلي (IRES).
تسلسل
تم تحديد تسلسل كوزاك من خلال تسلسل 699 من الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) للفقاريات، وتم التحقق منه باستخدام الطفرات الموجهة للموقع . [ 7 ] في حين اقتصرت الدراسات الأولية على مجموعة فرعية من الفقاريات ( مثل الإنسان، والبقرة، والقط، والكلب، والدجاج، وخنزير غينيا، والهامستر، والفأر، والخنزير، والأرنب، والخروف، والضفدع الأفريقي )، أكدت الدراسات اللاحقة حفظه في حقيقيات النوى العليا بشكل عام. [ 1 ] تم تعريف التسلسل على أنه 5' -3' ( ملخص ترميز القواعد النيتروجينية وفقًا للاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية هنا) حيث: [ 7 ](gcc)gccRccAUGG
- تشير النيوكليوتيدات المسطرة إلى كودون بدء الترجمة ، الذي يرمز إلى الميثيونين .
- تشير الأحرف الكبيرة إلى القواعد المحفوظة بدرجة عالية ، أي أن تسلسل "AUGG" ثابت أو نادرًا ما يتغير، إن لم يكن أبدًا. [ 8 ]
- يشير الحرف "R" إلى أنه يتم دائمًا ملاحظة وجود بيورين ( أدينين أو جوانين ) في هذا الموضع (مع كون الأدينين أكثر شيوعًا وفقًا لكوزاك).
- يشير الحرف الصغير إلى القاعدة الأكثر شيوعًا في موضع يمكن أن تختلف فيه القاعدة مع ذلك
- التسلسل الموجود بين قوسين (gcc) له دلالة غير مؤكدة.
يُعدّ كودون البدء AUG هو الكودون الذي يُشفّر حمض الميثيونين الأميني في الطرف الأميني للبروتين. (نادرًا ما يُستخدم كودون البدء GUG ، ولكن يبقى الميثيونين هو الحمض الأميني الأول لأنه جزيء tRNA الخاص بالميثيونين في مُركّب البدء الذي يرتبط بجزيء mRNA). يُغيّر التباين في تسلسل كوزاك من "قوته". تُشير قوة تسلسل كوزاك إلى مدى ملاءمة البدء، مما يؤثر على كمية البروتين المُصنّعة من جزيء mRNA مُعيّن. [ 4 ] [ 9 ] يُشار إلى النيوكليوتيد A في كودون البدء AUG بالرمز +1 في تسلسلات mRNA، بينما يُشار إلى القاعدة السابقة له بالرمز -1، أي لا يوجد موضع 0. وللحصول على توافق "قوي"، يجب أن تتطابق النيوكليوتيدات في الموضعين +4 (أي G في التوافق) و-3 (أي إما A أو G في التوافق) بالنسبة إلى النيوكليوتيد +1 مع التوافق. يحتوي التوافق "الكافي" على موقع واحد فقط من هذه المواقع، بينما لا يحتوي التوافق "الضعيف" على أي منها. لا تُحفظ تسلسلات cc في الموقعين -1 و-2 بنفس القدر، لكنها تُساهم في القوة الإجمالية. [ 10 ] هناك أيضًا أدلة على أن وجود الجوانين في الموقع -6 مهم في بدء عملية الترجمة. [ 4 ] في حين أن الموقعين +4 و-3 في تسلسل كوزاك لهما الأهمية النسبية الأكبر في تهيئة سياق بدء مناسب، فقد وُجد أن نمط CC أو AA في الموقعين -2 و-1 مهم في بدء عملية الترجمة في نباتات التبغ والذرة. [ 11 ] وُجد أن تخليق البروتين في الخميرة يتأثر بشدة بتركيب تسلسل كوزاك، حيث يؤدي إثراء الأدينين إلى مستويات أعلى من التعبير الجيني. [ 12 ] يمكن لتسلسل كوزاك غير الأمثل أن يسمح لمركب ما قبل البدء (PIC) بمسح ما بعد موقع AUG الأول وبدء عملية البدء عند كودون AUG لاحق. [ 13 ] [ 2 ]

تجميع الريبوسوم
يتجمع الريبوسوم على كودون البدء (AUG) الموجود ضمن تسلسل كوزاك. قبل بدء الترجمة، يقوم مُركّب ما قبل البدء (PIC) بعملية المسح. يتكون مُركّب ما قبل البدء من الوحدة الفرعية الريبوسومية الصغيرة 40S المرتبطة بالمُركّب الثلاثي eIF2 - GTP-intiatorMet tRNA (TC) لتشكيل الريبوسوم 43S. وبمساعدة عدة عوامل بدء أخرى ( eIF1 وeIF1A و eIF5 و eIF3 وبروتين ربط ذيل البولي أدينين ) ، يتم استقطابه إلى الطرف 5′ من الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). يُغطى الحمض النووي الريبوزي الرسول حقيقي النواة بنوكليوتيد 7-ميثيل غوانوزين (m7G) الذي يُساعد في استقطاب مُركّب ما قبل البدء إلى الحمض النووي الريبوزي الرسول وبدء عملية المسح. يدعم هذا الاستقطاب إلى غطاء m7G 5′ عدم قدرة الريبوسومات حقيقية النواة على ترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول الدائري، الذي لا يحتوي على طرف 5′. [ 14 ] بمجرد ارتباط مركب بدء الترجمة (PIC) بالحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، يبدأ بالمسح حتى يصل إلى أول كودون AUG في تسلسل كوزاك. [ 15 ] [ 16 ] يُشار إلى هذا المسح بآلية مسح بدء الترجمة.

تبدأ آلية المسح الخاصة ببدء عملية النسخ عندما يرتبط مركب بدء النسخ (PIC) بالنهاية 5′ لجزيء mRNA. ويتم تحفيز عملية المسح بواسطة بروتينات Dhx29 و Ddx3/Ded1 و eIF4 . [ 1 ] يُعدّ كل من Dhx29 وDdx3/Ded1 من إنزيمات الهيليكاز من نوع DEAD-box، والتي تساعد على فك أي بنية ثانوية لجزيء mRNA قد تعيق عملية المسح. [ 17 ] يستمر مسح جزيء mRNA حتى الوصول إلى كودون AUG الأول، وهو ما يُعرف بـ "قاعدة كودون AUG الأول". [ 1 ] على الرغم من وجود استثناءات لهذه القاعدة، إلا أن معظمها يحدث عند كودون AUG ثانٍ يقع على بُعد 3 إلى 5 نيوكليوتيدات من كودون AUG الأول، أو ضمن 10 نيوكليوتيدات من النهاية 5′ لجزيء mRNA. [ 18 ] عند كودون AUG، يتعرف كودون mRNA على مضاد كودون الميثيونين في tRNA . [ 19 ] عند اقتران القاعدة بكودون البدء، يساعد عامل بدء الترجمة eIF5 في مركب ما قبل البدء (PIC) على تحلل غوانوزين ثلاثي الفوسفات (GTP) المرتبط بـ eIF2. [ 20 ] [ 21 ] يؤدي هذا إلى إعادة ترتيب بنيوي يُلزم مركب ما قبل البدء (PIC) بالارتباط بالوحدة الريبوسومية الكبيرة (60S) وتكوين المركب الريبوسومي (80S). بمجرد تكوين المركب الريبوسومي 80S، تبدأ مرحلة استطالة الترجمة.
لا يُتعرف دائمًا على كودون البدء الأول الأقرب إلى الطرف 5′ من السلسلة إذا لم يكن موجودًا ضمن تسلسل شبيه بكوزاك. يُعدّ Lmx1b مثالًا على جين ذي تسلسل كوزاك ضعيف. [ 22 ] لبدء الترجمة من هذا الموقع، يلزم وجود خصائص أخرى في تسلسل mRNA لكي يتعرف الريبوسوم على كودون البدء. قد تحدث استثناءات لقاعدة AUG الأولى إذا لم يكن موجودًا ضمن تسلسل شبيه بكوزاك. يُسمى هذا المسح المُسرّب ، وقد يكون وسيلة محتملة للتحكم في الترجمة من خلال البدء. [ 23 ] لبدء الترجمة من هذا الموقع، يلزم وجود خصائص أخرى في تسلسل mRNA لكي يتعرف الريبوسوم على كودون البدء.
يُعتقد أن مُركَّب ما قبل البدء (PIC) يتوقف عند تسلسل كوزاك نتيجةً لتفاعلات بين عامل بدء الترجمة eIF2 والنيوكليوتيدات -3 و+4 في موضع كوزاك. [ 24 ] يتيح هذا التوقف لكودون البدء والكودون المضاد المقابل له الوقت الكافي لتكوين الروابط الهيدروجينية الصحيحة . يُعد تسلسل كوزاك شائعًا جدًا لدرجة أن تشابه التسلسل المحيط بكودون AUG مع تسلسل كوزاك يُستخدم كمعيار لتحديد كودونات البدء في حقيقيات النوى. [ 25 ]
الاختلافات عن بدء العدوى البكتيرية
توجد آلية المسح لبدء الترجمة، التي تستخدم تسلسل كوزاك، حصريًا في حقيقيات النوى، وتختلف اختلافًا كبيرًا عن طريقة بدء الترجمة في البكتيريا. ويكمن الاختلاف الأكبر في وجود تسلسل شاين-دالغارنو (SD) في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) لدى البكتيريا. يقع تسلسل SD بالقرب من كودون البدء، على عكس تسلسل كوزاك الذي يحتوي فعليًا على كودون البدء. يسمح تسلسل شاين-دالغارنو للوحدة الفرعية 16S من الريبوسوم الصغير بالارتباط بكودون البدء AUG (أو كودون البدء البديل) مباشرةً. في المقابل، ينتج عن المسح على طول الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عملية اختيار أكثر دقة لكودون AUG مقارنةً بالبكتيريا. [ 26 ] ومن الأمثلة على تعدد استخدامات كودون البدء في البكتيريا استخدام كودوني البدء البديلين UUG وGUG لبعض الجينات. [ 27 ]
تستخدم النسخ الجينية للعتائق مزيجًا من تسلسل SD، وتسلسل كوزاك، وبدء النسخ بدون تسلسل قائد . ومن المعروف أن العتائق المحبة للملوحة تحتوي على نسخة مختلفة من تسلسل كوزاك المتفق عليه في جينات Hsp70 الخاصة بها. [ 28 ]
الطفرات والأمراض
أثبتت مارلين كوزاك، من خلال دراسة منهجية للطفرات النقطية، أن أي طفرات في تسلسل توافقي قوي في الموضع -3 أو إلى الموضع +4 تؤدي إلى ضعف شديد في بدء الترجمة سواء في المختبر أو في الجسم الحي . [ 29 ] [ 30 ]

أظهرت الأبحاث أن طفرة استبدال النيوكليوتيد G بالنيوكليوتيد C في الموضع -6 من جين بيتا غلوبين (β+45؛ بشري) تُعطّل الوظيفة الدموية والوظيفية الحيوية. وكانت هذه أول طفرة تُكتشف في تسلسل كوزاك، وقد أظهرت انخفاضًا بنسبة 30% في كفاءة الترجمة. وُجدت هذه الطفرة في عائلة من جنوب شرق إيطاليا، وكان أفرادها يعانون من الثلاسيميا المتوسطة . [ 4 ]
لوحظت نتائج مماثلة فيما يتعلق بالطفرات في الموضع -5 من كودون البدء، AUG. أظهر السيتوزين في هذا الموضع، على عكس الثايمين، ترجمة أكثر كفاءة وزيادة في التعبير عن مستقبل التصاق الصفائح الدموية، وهو البروتين السكري Ibα، لدى البشر. [ 33 ]
قد تُحدث الطفرات في تسلسل كوزاك آثارًا وخيمة على صحة الإنسان؛ فبعض أنواع أمراض القلب الخلقية تحديدًا تنتج عن طفرات في تسلسل كوزاك في المنطقة غير المترجمة 5' من جين GATA4 . يُعدّ جين GATA4 مسؤولًا عن التعبير الجيني في مجموعة واسعة من الأنسجة، بما في ذلك القلب. [ 34 ] عندما يتحول الغوانوزين في الموضع -6 من تسلسل كوزاك في جين GATA4 إلى سيتوزين، ينخفض مستوى بروتين GATA4، مما يؤدي إلى انخفاض في التعبير عن الجينات التي ينظمها عامل النسخ GATA4 والمرتبطة بتطور عيب الحاجز الأذيني. [ 35 ]
تُتيح قدرة تسلسل كوزاك على تحسين عملية الترجمة ظهور كودونات بدء جديدة في المنطقة غير المترجمة عادةً من الطرف 5′ (5′ UTR) لنسخة mRNA. وقد وصف بوهلين وآخرون (2017) طفرة AG إلى A في منطقة شبيهة بتسلسل كوزاك في جين SOX9 ، مما أدى إلى ظهور كودون بدء ترجمة جديد في إطار قراءة مفتوح خارج الإطار . يقع كودون البدء الصحيح في منطقة لا تتطابق مع تسلسل كوزاك المتفق عليه بنفس دقة تطابق التسلسل المحيط بموقع البدء الجديد في الاتجاه المعاكس، مما أدى إلى انخفاض كفاءة ترجمة بروتين SOX9 الوظيفي. وقد أصيب المريض الذي تم اكتشاف هذه الطفرة لديه بخلل التنسج العظمي التقوسي ، وهو اضطراب نمائي يُسبب مشاكل هيكلية وتناسلية وتنفسية نتيجةً لعدم كفاية التعبير عن جين SOX9 . [ 32 ]
اختلافات في التسلسل المتفق عليه
وقد تم وصف إجماع كوزاك بأشكال مختلفة على النحو التالي: [ 36 ]
65432-+234 (gcc)gccRccAUGG (Kozak 1987) أغناوغن أناوغ ACCAUGG (سبوتس وآخرون، 1997، مذكور في Kozak 2002) GACACCAUGG ( H. sapiens HBB, HBD , R. norvegicus Hbb , إلخ.)
| الكائنات الحية | الشعبة | تسلسلات توافقية |
|---|---|---|
| الفقاريات (كوزاك 1987) | gccRccATGG[ 7 ] | |
| ذبابة الفاكهة ( دروسوفيلا spp.) | مفصليات الأرجل | atMAAMATGamc[ 37 ] |
| الخميرة المتبرعمة ( Saccharomyces cerevisiae ) | الفطريات الزقية | aAaAaAATGTCt[ 38 ] |
| العفن المخاطي ( Dictyostelium discoideum ) | الأميبوزوا | aaaAAAATGRna[ 39 ] |
| الهدبيات | الهدبيات | nTaAAAATGRct[ 39 ] |
| الطفيليات الأولية المسببة للملاريا ( Plasmodium spp.) | الأبيكومبلكسا | taaAAAATGAan[ 39 ] |
| التوكسوبلازما ( التوكسوبلازما جوندي ) | الأبيكومبلكسا | gncAaaATGg[ 40 ] |
| عائلة التريبانوسومات | اليوجلينوزوا | nnnAnnATGnC[ 39 ] |
| النباتات الأرضية | acAACAATGGC[ 41 ] | |
| الطحالب الدقيقة (Chlamydomonas reinhardtii ) | الطحالب الخضراء | gccAaCATGGcg[ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] |
انظر أيضاً
- الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) ، وهو الحمض النووي الرسول الذي يعمل كوسيط في العقيدة المركزية لعلم الأحياء
- الريبوسوم ، الآلة الجزيئية المسؤولة عن تخليق البروتين
- تسلسل شاين-دالغارنو ، موقع ارتباط الريبوسوم في بدائيات النوى .
- الترجمة ، عملية تخليق الببتيد
مراجع
- 1 2 3 4 5 6 كوزاك، م. (فبراير 1989). "نموذج المسح للترجمة: تحديث" . مجلة بيولوجيا الخلية . 108 (2): 229-241 . doi : 10.1083 / jcb.108.2.229 . ISSN 0021-9525 . PMC 2115416. PMID 2645293 .
- 1 2 كوزاك، مارلين (16 أكتوبر 2002). "توسيع آفاق آلية المسح لبدء الترجمة" . جين . 299 (1): 1-34 . doi : 10.1016 / S0378-1119(02)01056-9 . ISSN 0378-1119 . PMC 7126118. PMID 12459250 .
- ↑ كوزاك، مارلين (8 يوليو 1999). "بدء الترجمة في بدائيات النوى وحقيقيات النوى". جين . 234 (2): 187-208 . doi : 10.1016/S0378-1119(99)00210-3 . ISSN 0378-1119 . PMID 10395892 .
- 1 2 3 4 دي أنجيوليتي إم، لاسيرا جي، ساباتو في، كاريستيا سي (2004). "Beta+45 G → C: طفرة بيتا ثلاسيميا الصامتة الجديدة، الأولى في تسلسل كوزاك" . بر ي هيماتول . 124 (2): 224–31 . دوى : 10.1046/j.1365-2141.2003.04754.x . بميد 14687034 . S2CID 86704907 .
- ↑ هيرنانديز، غريكو؛ أوسنايا، فينسنت ج.؛ بيريز-مارتينيز، زوتشيل (25 يوليو 2019). "حفظ وتنوع سياق كودون البدء AUG في حقيقيات النوى" . اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 44 (12): 1009-1021 . doi : 10.1016/j.tibs.2019.07.001 . ISSN 0968-0004 . PMID 31353284 .
- ↑ كوزاك، م. (25 يناير 1984). "تجميع وتحليل التسلسلات الواقعة قبل موقع بدء الترجمة في الحمض النووي الريبوزي الرسول حقيقي النواة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 12 (2): 857-872 . doi : 10.1093/nar/12.2.857 . ISSN 0305-1048 . PMC 318541. PMID 6694911 .
- 1 2 3 كوزاك م (أكتوبر 1987). "تحليل التسلسلات غير المشفرة في الطرف 5' من 699 من الحمض النووي الريبوزي الرسول للفقاريات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 15 (20): 8125-8148 . doi : 10.1093/nar/ 15.20.8125 . PMC 306349. PMID 3313277 .
- ↑ تسمية القواعد غير المحددة بالكامل في تسلسلات الأحماض النووية ، NC-IUB، 1984.
- ↑ كوزاك م (1984). "الطفرات النقطية القريبة من كودون البدء AUG تؤثر على كفاءة ترجمة بروتين ما قبل البروأنسولين في الفئران في الجسم الحي". مجلة نيتشر . 308 (5956): 241-246 . Bibcode : 1984Natur.308..241K . doi : 10.1038/308241a0 . PMID 6700727. S2CID 4366379 .
- ↑ كوزاك م (1986). "الطفرات النقطية تحدد تسلسلًا يحيط بكودون البدء AUG الذي ينظم الترجمة بواسطة الريبوسومات حقيقية النواة" . الخلية . 44 (2): 283-292 . doi : 10.1016/0092-8674(86) 90762-2 . PMID 3943125. S2CID 15613863 .
- ↑ لوكاسيفيتش، مارسين؛ فويرمان، مارك؛ جيروفيل، بينيديكت؛ ستاس، أرنو؛ بوتري، مارك (15 مايو 2000). "التقييم الحيوي لتسلسل سياق كودون بدء الترجمة في النباتات". علوم النبات . 154 (1): 89-98 . doi : 10.1016/S0168-9452(00)00195-3 . ISSN 0168-9452 . PMID 10725562 .
- ↑ لي، جينغ؛ ليانغ، تشيانغ؛ سونغ، وينجيانغ؛ مارشيزيو، ماريو أندريا (2017). "تؤثر النيوكليوتيدات الواقعة قبل تسلسل كوزاك بشكل كبير على التعبير الجيني في خميرة S. cerevisiae" . مجلة الهندسة البيولوجية . 11 : 25. doi : 10.1186/s13036-017-0068-1 . ISSN 1754-1611 . PMC 5563945. PMID 28835771 .
- ↑ كوتشيتوف، أليكس ف. (2005-04-01). "تُعدّ كودونات AUG في بداية تسلسلات ترميز البروتين شائعة في الحمض النووي الريبوزي الرسول حقيقي النواة ذي سياق كودون بدء غير مثالي" . المعلوماتية الحيوية . 21 (7): 837-840 . doi : 10.1093/bioinformatics/bti136 . ISSN 1367-4803 . PMID 15531618 .
- ↑ كوزاك، مارلين (يوليو 1979). "عدم قدرة الحمض النووي الريبوزي الرسول الدائري على الارتباط بالريبوسومات حقيقية النواة". مجلة نيتشر . 280 ( 5717): 82-85 . Bibcode : 1979Natur.280...82K . doi : 10.1038/280082a0 . ISSN 1476-4687 . PMID 15305588. S2CID 4319259 .
- ↑ شميت، إيمانويل؛ كوريو، بيير-داميان؛ مونستير، أوريان؛ دوبيز، إتيان؛ ميشولام، إيف (21-02-2019). "التعرف على كودون البدء في بدء الترجمة في حقيقيات النوى والعتائق: نواة هيكلية مشتركة" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 20 (4): 939. doi : 10.3390/ijms20040939 . ISSN 1422-0067 . PMC 6412873. PMID 30795538 .
- ↑ غريغورسكي، ستيفن جيه؛ كياري، إستيل إف؛ روبنز، إيمي؛ كيش، فيليب إي؛ كاهانا، ألون (2014). " التباين الطبيعي لتسلسلات كوزاك يرتبط بالوظيفة في نموذج سمكة الزيبرا" . PLOS ONE . 9 (9) e108475. Bibcode : 2014PLoSO...9j8475G . doi : 10.1371/journal.pone.0108475 . PMC 4172775. PMID 25248153 .
- ↑ هينيبوش، آلان ج. (2014). "آلية المسح لبدء الترجمة في حقيقيات النوى". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 83 (1): 779-812 . doi : 10.1146/annurev-biochem-060713-035802 . PMID 24499181 .
- ↑ كوزاك، م. (28 مارس 1995). "الالتزام بقاعدة كودون البدء الأول (AUG) عند وجود كودون بدء ثانٍ يتبعه مباشرةً" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 92 (7): 2662-2666 . Bibcode : 1995PNAS...92.2662K . doi : 10.1073/pnas.92.7.2662 . ISSN 0027-8424 . PMC 42278. PMID 7708701 .
- ↑ سيجان، أ.م.؛ فينغ، ل.؛ دوناهو، ت.ف. (1988-10-07). "يؤدي tRNAi(met) وظيفة توجيه الريبوسوم الماسح إلى موقع بدء الترجمة". مجلة ساينس . 242 (4875): 93-97 . Bibcode : 1988Sci...242...93C . doi : 10.1126/science.3051379 . ISSN 0036-8075 . PMID 3051379 .
- ↑ بيستوفا، تاتيانا ف.؛ لوماكين، إيفان ب.؛ لي، جون هـ.؛ تشوي، سانغ كي؛ ديفر، توماس إي.؛ هيلين، كريستوفر يو تي (يناير 2000). "يتطلب ربط الوحدات الفرعية للريبوسوم في حقيقيات النوى وجود عامل بدء الترجمة eIF5B". مجلة نيتشر . 403 (6767): 332-335 . Bibcode : 2000Natur.403..332P . doi : 10.1038/35002118 . ISSN 1476-4687 . PMID 10659855. S2CID 3739106 .
- ↑ ألجير، ميكيل أ.؛ ماج، ديفيد؛ لورش، جون ر. (28-10-2005). "إطلاق الفوسفات غير العضوي من عامل بدء الترجمة eIF2، وليس تحلل GTP، هو الخطوة التي يتحكم بها اختيار موقع البدء أثناء بدء الترجمة في حقيقيات النوى" . الخلية الجزيئية . 20 (2): 251-262 . doi : 10.1016/j.molcel.2005.09.008 . ISSN 1097-2765 . PMID 16246727 .
- ↑ دانستون، جيه. إيه.، وهاملينغتون، جيه. دي.، وزافيري، جيه.، وآخرون . (سبتمبر 2004). "جين LMX1B البشري: وحدة النسخ، والمحفز، والطفرات المسببة للأمراض". علم الجينوم . 84 (3): 565-76 . doi : 10.1016/j.ygeno.2004.06.002 . PMID 15498463 .
- ↑ أليخينا، أوم؛ فاسيلينكو، ك.س. (2012). " بدء الترجمة في حقيقيات النوى: تنوع نموذج المسح". الكيمياء الحيوية (موسكو) . 77 (13): 1465-1477 . doi : 10.1134/s0006297912130056 . PMID 23379522. S2CID 14157104 .
- ↑ هينيبوش، آلان ج. (سبتمبر 2011). "الآلية الجزيئية للمسح واختيار كودون البدء في حقيقيات النوى" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 75 (3 ) : 434-467 . doi : 10.1128/MMBR.00008-11 . ISSN 1092-2172 . PMC 3165540. PMID 21885680 .
- ↑ لويس، بي جي؛ غانوزا، إم سي (1988). "الإشارات التي تحدد التعرف على موقع بدء الترجمة في حقيقيات النوى ودورها في التنبؤ بأطر القراءة الجينية". تقارير البيولوجيا الجزيئية . 13 (2): 103-115 . doi : 10.1007/bf00539058 . ISSN 0301-4851 . PMID 3221841. S2CID 25936805 .
- ↑ هوانغ، هان-كوي؛ يون، هيجيونغ؛ هانيغ، إرنست م.؛ دوناهو، توماس ف. (15-09-1997). " يتحكم تحلل GTP في الاختيار الدقيق لكودون البدء AUG أثناء بدء الترجمة في الخميرة Saccharomyces cerevisiae" . الجينات والتطور . 11 (18): 2396-2413 . doi : 10.1101/gad.11.18.2396 . ISSN 0890-9369 . PMC 316512. PMID 9308967 .
- ↑ غواليرزي، سي أو؛ بون، سي إل (26-06-1990). "بدء ترجمة الحمض النووي الريبوزي الرسول في بدائيات النوى". الكيمياء الحيوية . 29 (25): 5881-5889 . doi : 10.1021/bi00477a001 . ISSN 0006-2960 . PMID 2200518 .
- ↑ تشين، وينتشاو؛ يانغ، غوبينغ؛ هي، يو؛ تشانغ، شاومينغ؛ تشين، هاييان؛ شين، بينغ؛ تشين، شيانغدونغ؛ هوانغ، يو-بينغ (17 سبتمبر 2015). "النيوكليوتيدات المحيطة بكودون البدء في mRNAs الخاصة بـ hsp70 ذات المناطق غير المترجمة القصيرة جدًا 5' تؤثر بشكل كبير على التعبير الجيني في هالواركيا" . PLOS ONE . 10 (9) e0138473. Bibcode : 2015PLoSO..1038473C . doi : 10.1371/journal.pone.0138473 . PMC 4574771. PMID 26379277 .
- ↑ كوزاك، مارلين (31 يناير 1986). "تُحدد الطفرات النقطية تسلسلًا يُحيط بكودون البدء AUG، ويُعدِّل عملية الترجمة بواسطة الريبوسومات حقيقية النواة". الخلية . 44 ( 2): 283-292 . doi : 10.1016/0092-8674(86)90762-2 . ISSN 0092-8674 . PMID 3943125. S2CID 15613863 .
- ↑ كوزاك، مارلين (مارس 1984). "الطفرات النقطية القريبة من كودون البدء AUG تؤثر على كفاءة ترجمة بروتين ما قبل البروأنسولين في الفئران في الجسم الحي". مجلة نيتشر . 308 (5956): 241-246 . Bibcode : 1984Natur.308..241K . doi : 10.1038/308241a0 . ISSN 1476-4687 . PMID 6700727. S2CID 4366379 .
- ↑ أونغر، شيلا؛ شيرر، جيرد؛ سوبرتي-فورغا، أندريا (1993). "خلل التنسج العظمي" . GeneReviews . سياتل: جامعة واشنطن. PMID 20301724 – عبر المكتبة الوطنية للطب التابعة للمعاهد الوطنية للصحة، المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية.
- 1 2 بوهلين، آنا إي. فون؛ بوم، يوهان؛ بوب، رامونا؛ جونسون، ديانا إس.؛ تولمي، جون؛ ستوكر، رالف؛ موريس-روزندال، ديبورا؛ شيرر، جيرد (2017). "طفرة تُنشئ كودون بدء في الجزء العلوي من منطقة 5′ غير المترجمة لجين SOX9 تُسبب خلل التنسج العظمي العظمي عديم التقوس" . علم الوراثة الجزيئية والطب الجينومي . 5 (3): 261-268 . doi : 10.1002/mgg3.282 . ISSN 2324-9269 . PMC 5441400. PMID 28546996 .
- ↑ أفشار-خارغان، وحيد؛ لي، تشيستر كيو؛ خوشنويس-أصل، محمد؛ لوبيز، خوسيه أ. (1999). "تعدد أشكال تسلسل كوزاك لجين البروتين السكري (GP) Ib هو عامل رئيسي في تحديد مستويات غشاء البلازما لمركب GP Ib-IX-V للصفائح الدموية". مجلة الدم . 94 : 186-191 . doi : 10.1182/blood.v94.1.186.413k19_186_191 .
- ↑ لي، ي.؛ شيوي، ت.؛ كاساهارا، هـ.؛ جوب، س.م.؛ ويز، ر.ج.؛ ماركهام، ب.إ.؛ إيزومو، س. (يونيو 1998). "بروتين هوميوكس Csx/Nkx2.5، المقتصر على أنسجة القلب، يرتبط فيزيائيًا ببروتين GATA4 ذي الأصابع الزنكية، وينشط بشكل تعاوني التعبير الجيني لعامل إدرار الصوديوم الأذيني" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 18 (6): 3120-3129 . doi : 10.1128/mcb.18.6.3120 . ISSN 0270-7306 . PMC 108894. PMID 9584153 .
- ^ موهان، راجيف أ. إنجلين، كلارتجي فان؛ ستيفانوفيتش، سونيا؛ بارنيت، فيل؛ إلجون، أهو؛ بارس، ماريك ج.ه. بوما، بيرتو J .؛ مولدر، باربرا جيه إم؛ كريستوفلز، فنسنت م.؛ بوستما، أليكس ف. (2014). “طفرة في تسلسل كوزاك لـ GATA4 تعيق الترجمة في عائلة تعاني من عيوب الحاجز الأذيني”. المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية الجزء أ . 164 (11): 2732–2738 . دوى : 10.1002/ajmg.a.36703 . ردمك 1552-4833 . بميد 25099673 . S2CID 32674053 .
- ↑ تانغ، سين-لين؛ تشانغ، بيل سي إتش؛ هالغاموج، سامان ك. (أغسطس 2010). "تأثير وظيفة الجين على الكودون الثاني: دراسة واسعة النطاق لتكوين الكودون الثاني في ثلاثة نطاقات" . علم الجينوم . 96 (2): 92-101 . doi : 10.1016/j.ygeno.2010.04.001 . PMID 20417269 .
- ↑ كافينر، د. ر. (فبراير 1987). "مقارنة التسلسل المتفق عليه المحيط بمواقع بدء الترجمة في ذبابة الفاكهة والفقاريات" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 15 (4): 1353-1361 . doi : 10.1093 / nar/15.4.1353 . PMC 340553. PMID 3822832 .
- ↑ هاميلتون ر، واتانابي سي كيه، دي بوير إتش إيه (أبريل 1987). "تجميع ومقارنة سياق التسلسل حول كودونات البدء AUG في mRNAs الخميرة Saccharomyces cerevisiae" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 15 (8): 3581-93 . doi : 10.1093/nar/15.8.3581 . PMC 340751. PMID 3554144 .
- 1 2 3 4 ياماوتشي ك (مايو 1991). "التسلسل المحيط بموقع بدء الترجمة في الأوليات" . أبحاث الأحماض النووية . 19 (10): 2715-2720 . doi : 10.1093 / nar/19.10.2715 . PMC 328191. PMID 2041747 .
- ↑ سيبر، ف. (1997). " التسلسل التوافقي لمواقع بدء الترجمة من جينات توكسوبلازما جوندي ". بحوث علم الطفيليات . 83 (3): 309-311 . doi : 10.1007/s004360050254 . PMID 9089733. S2CID 10433917 .
- ↑ لوتكه، هـ. أ.، تشاو، ك. س.، ميكيل، ف. س.، موس، ك. أ.، كيرن، هـ. ف.، شيل، ج. أ. (يناير 1987). "يختلف اختيار كودونات بدء AUG في النباتات والحيوانات" . مجلة EMBO . 6 (1): 43-48 . doi : 10.1002 / j.1460-2075.1987.tb04716.x . PMC 553354. PMID 3556162 .
- ↑ كروس ف (6 فبراير 2016). " ربط الأطراف السائبة في جينوم الكلاميدوموناس : الأهمية الوظيفية لإطارات القراءة المفتوحة الوفيرة في المنطقة المجاورة للجين" . G3 (2): 435-446 . doi : 10.1534/g3.115.023119 . PMC 4751561. PMID 26701783 .
- ↑ غالاغر إس دي، كريغ آر جيه، غانيسان آي، بورفين إس أو، مكوركلي إس آر، غريموود جيه، سترينكيرت دي، دافيدي إل، روث إم إس، جيفرز تي إل، ليبتون إم إس، نيوجي كيه كيه، شموتز جيه، ثيغ إس إم، بلابي-هاس سي إي، ميرشانت إس إس (12 فبراير 2021). "التعبير الجيني متعدد السيسترونات واسع الانتشار في الطحالب الخضراء" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 118 (7). doi : 10.1073/pnas.2017714118 . PMC 7896298 .
- ↑ MA Dueñas, RJ Craig, SD Gallaher, JL Moseley,& SS Merchant, Leaky ribosomal scanning enable tunable translation of bisistronic ORFs in green algae, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 122 (9) e2417695122, https://doi.org/10.1073/pnas.2417695122 (2025).
للمزيد من القراءة
- كوزاك م (نوفمبر 1990). "البنية الثانوية في اتجاه المصب تُسهّل تعرف الريبوسومات حقيقية النواة على كودونات البدء" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 87 (21): 8301-8305 . Bibcode : 1990PNAS...87.8301K . doi : 10.1073 / pnas.87.21.8301 . PMC 54943. PMID 2236042 .
- كوزاك م (نوفمبر 1991). "تحليل تسلسلات الحمض النووي الريبوزي الرسول في الفقاريات: دلالات على التحكم في الترجمة" . مجلة بيولوجيا الخلية . 115 (4): 887-903 . doi : 10.1083/jcb.115.4.887 . PMC 2289952. PMID 1955461 .
- كوزاك م (أكتوبر 2002). "توسيع آفاق آلية المسح لبدء الترجمة" . جين . 299 ( 1-2 ): 1-34 . doi : 10.1016/ S0378-1119 (02)01056-9 . PMC 7126118. PMID 12459250 .
- تخليق البروتين
