الرسومات الجزيئية

📅 آخر تحديث: ٢٦ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٦ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 5 صور
الموسوعة الحرة

فوليرين C60 ذو سطح متساوي الكثافة

الرسومات الجزيئية هي علم وفلسفة دراسة الجزيئات وخصائصها من خلال التمثيل البياني. [ 1 ] يقتصر تعريف الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) على التمثيلات المعروضة على "جهاز عرض رسومي". [ 2 ] منذ اكتشاف ذرات دالتون وبنزين كيكولي ، كان هناك تاريخ حافل بالرسومات اليدوية للذرات والجزيئات، وقد كان لهذه التمثيلات تأثير كبير على الرسومات الجزيئية الحديثة.

تُستخدم الرسومات الجزيئية الملونة بشكل فني على أغلفة المجلات الكيميائية. [ 3 ]

تاريخ

قبل استخدام رسومات الحاسوب في تمثيل التركيب الجزيئي، طوّر روبرت كوري ولينوس باولينغ نظامًا لتمثيل الذرات أو مجموعات الذرات من الخشب الصلب بمقياس 1 بوصة = 1 أنغستروم، موصولة بجهاز تثبيت للحفاظ على التكوين الجزيئي. [ 4 ] كما أرست هذه النماذج المبكرة نظام تلوين CPK الذي لا يزال يُستخدم حتى اليوم لتمييز أنواع الذرات المختلفة في النماذج الجزيئية (مثل الكربون = أسود، الأكسجين = أحمر، النيتروجين = أزرق، إلخ). وقد طُوّر هذا النموذج المبكر عام 1966 على يد دبليو إل كولتون، ويُعرف الآن بنماذج كوري-باولينغ-كولتون (CPK). [ 5 ]

بدأت أولى الجهود لإنتاج نماذج للبنية الجزيئية من خلال مشروع MAC باستخدام نماذج هيكلية سلكية عُرضت على أنبوب أشعة الكاثود في منتصف الستينيات. في عام 1965، وزّع كارول جونسون مخطط أوك ريدج الحراري الإهليلجي (ORTEP) الذي يُصوّر الجزيئات كنموذج كروي وعصوي ، حيث تمثل الخطوط الروابط بين الذرات، بينما تمثل الأشكال الإهليلجية احتمالية الحركة الحرارية. [ 6 ] سرعان ما أصبحت مخططات الأشكال الإهليلجية الحرارية المعيار الفعلي المستخدم في عرض بيانات علم البلورات بالأشعة السينية ، ولا تزال تُستخدم على نطاق واسع حتى اليوم. [ 6 ] كان أول استخدام عملي للرسومات الجزيئية هو عرض بسيط لبروتين الميوغلوبين باستخدام تمثيل هيكلي سلكي في عام 1966 من قِبل سايروس ليفينثال وروبرت لانغريدج العاملين في مشروع MAC. [ 7 ]

ومن بين الإنجازات البارزة في مجال الرسومات الجزيئية عالية الأداء، كان عمل نيلسون ماكس في العرض "الواقعي" للجزيئات الكبيرة باستخدام الكرات العاكسة .

زوج من نظارات CrystalEyes ذات الغالق

في البداية، ركزت معظم التقنيات على الرسومات ثلاثية الأبعاد عالية الأداء . [ 8 ] خلال سبعينيات القرن العشرين، طُوّرت طرق لعرض الرسومات ثلاثية الأبعاد باستخدام أنابيب أشعة الكاثود، وذلك باستخدام رسومات الحاسوب ذات التدرج اللوني المستمر بالاشتراك مع أجهزة عرض مزودة بمصراع كهروضوئي. [ 9 ] استخدمت الأجهزة الأولى نظام مصراع ثلاثي الأبعاد نشط ، يُولّد مناظر منظور مختلفة للقناتين اليمنى واليسرى لتوفير وهم الرؤية ثلاثية الأبعاد. صُممت نظارات الرؤية المجسمة باستخدام سيراميك زركونات تيتانات الرصاص واللانثانوم (PLZT) كعناصر مصراع يتم التحكم فيها إلكترونيًا. [ 10 ] تتطلب النظارات ثلاثية الأبعاد النشطة بطاريات، وتعمل بالتنسيق مع الشاشة لتغيير العرض بشكل فعال بواسطة العدسات لعيون المستخدم. تستخدم العديد من النظارات ثلاثية الأبعاد الحديثة نظامًا ثلاثي الأبعاد سلبيًا مستقطبًا، يمكّن المستخدم من تصور التأثيرات ثلاثية الأبعاد بناءً على إدراكه الخاص. أصبحت النظارات ثلاثية الأبعاد السلبية أكثر شيوعًا اليوم نظرًا لانخفاض تكلفتها. [ 11 ]

دفعت متطلبات علم البلورات الجزيئية الكبيرة إلى تطوير الرسومات الجزيئية، نظرًا لعدم قدرة التقنيات التقليدية لبناء النماذج الفيزيائية على التوسع. تم بناء أول بنيتين بروتينيتين تم حلهما باستخدام الرسومات الجزيئية دون الاستعانة بصندوق ريتشاردز، وذلك باستخدام برنامج FIT لستان سوانسون على شاشة عرض Vector General في مختبر إدغار ماير بجامعة تكساس إيه آند إم. في البداية، حلت مارج ليغ في مختبر آل كوتون بالجامعة بنية ثانية ذات دقة أعلى لإنزيم نوكلياز المكورات العنقودية (1975)، ثم حل جيم هوغل بنية الليزوزيم أحادي الميل في عام 1976. مر عام كامل قبل استخدام أنظمة رسومات أخرى لتحل محل صندوق ريتشاردز في نمذجة الكثافة ثلاثية الأبعاد. تم تطوير برنامج FRODO لألوين جونز (وبرنامج "O" لاحقًا) لدمج كثافة الإلكترون الجزيئية المُحددة من علم البلورات بالأشعة السينية مع البنية الجزيئية الافتراضية.

الجدول الزمني

المطور(ون)التاريخ التقريبيتكنولوجياتعليقات
علماء البلورات< 1960رسم يدويالهياكل البلورية، مع إزالة الذرات والروابط المخفية. غالباً ما تكون إسقاطات مائلة.
جونسون، ماذرويلحوالي عام 1970راسمة قلميةبرنامجا ORTEP و PLUTO. يستخدمان على نطاق واسع جداً لنشر هياكل البلورات.
سايروس ليفينثال ، بوب لانغريدج، وارد، ستوتس [ 12 ]1966نظام عرض Project MAC، ذو درجتي حرية، عصا تحكم بالسرعة ذات ارتداد زنبركي لتدوير الصورة.أول عرض للبروتين على الشاشة. نظام لبناء هياكل البروتين بشكل تفاعلي.
باري [ 13 ]1969جهاز كمبيوتر LINC 300 مزود بشاشة عرض راسم إشارة ثنائية المسار.نظام عرض تفاعلي لبنية الجزيئات. أمثلة مبكرة على الدوران الديناميكي، وتحديد عمق الكثافة، والتصوير المجسم جنبًا إلى جنب. استخدام مبكر لتقريبات الزاوية الصغيرة (a = sin a، 1 = cos a) لتسريع حسابات الدوران الرسومية.
أورتوني1971صممت جهاز عرض مجسم (براءة اختراع بريطانية رقم 13844/70) لرسومات الحاسوب الجزيئية.تجمع المرآة الأفقية ثنائية الاتجاه (نصف مطلية بالفضة) الصور المرسومة على النصفين العلوي والسفلي من شاشة CRT. تعمل المستقطبات المتقاطعة على عزل الصور لكل عين.
أورتوني [ 14 ]1971قلم ضوئي، مقبض.نظام تفاعلي لعرض بنية الجزيئات. حدد الرابطة بتدوير مقبض آخر حتى تضيء الرابطة المطلوبة بالتتابع، وهي تقنية استُخدمت لاحقًا في نظام MMS-4 الموضح أدناه، أو بالنقر باستخدام قلم الضوء. تُحدد النقاط في الفضاء باستخدام "مؤشر" ثلاثي الأبعاد قابل للتحكم الديناميكي.
باري، غرايسر، مارشال [ 15 ]1971CHEMAST: جهاز كمبيوتر LINC 300 يقوم بتشغيل راسم الإشارة. عصا تحكم ثنائية المحاور، مشابهة لتلك المستخدمة لاحقًا بواسطة GRIP-75 (أدناه).نظام عرض تفاعلي لبنية الجزيئات. يتم تدوير الهياكل ديناميكيًا باستخدام عصا التحكم.
تونتاس وكاتز [ 16 ]1971شاشة Adage AGT/50نظام عرض تفاعلي لبنية الجزيئات. رياضيات الدوران المتداخل ودوران الفضاء المختبري.
بيركنز، بايبر، تاتام، وايت [ 17 ]1971حاسوب هانيويل DDP 516، حاسوب تناظري EAL TR48، راسم إشارة لانيلك، 7 مقاييس جهد خطية. ستيريو.نظام عرض تفاعلي لبنية الجزيئات.
رايت [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]1972GRIP-71 في جامعة نورث كارولينا في تشابل هيل: جهاز كمبيوتر IBM System/360 موديل 40 ذو مشاركة زمنية، وشاشة IBM 2250، وأزرار، وقلم ضوئي، ولوحة مفاتيح.معالجة منفصلة واسترخاء طاقة لهياكل البروتين. أصبح رمز البرنامج أساس نظام GRIP-75 الموضح أدناه.
باري ونورث [ 21 ]1972جامعة أكسفورد : جهاز كمبيوتر فيرانتي أرجوس 500، شاشة فيرانتي موديل 30، لوحة مفاتيح، كرة تتبع، زر واحد. ستيريو.نظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي. تقوم كرة التتبع بتدوير الرابطة، ويقوم المقبض بتفتيح خريطة كثافة الإلكترون مقابل الجزيء.
نورث، فورد، واتسونأوائل سبعينيات القرن العشرينجامعة ليدز : جهاز كمبيوتر DEC PDP·11/40، شاشة عرض من هيوليت-باكارد. 16 مقبضًا، لوحة مفاتيح، عصا تحكم بنابض ارتدادي. ستيريو.نظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي. ستة مقابض تدور وتحرك جزيئًا صغيرًا.
باري، بوشارد، إليس، مارشال، فريتش، جاكوبي1974MMS-4: [ 22 ] [ 23 ] جامعة واشنطن في سانت لويس ، حاسوب LINC 300 وشاشة عرض LDS-1 / LINC 300، ووحدات عرض مخصصة. عصا تحكم دوارة، ومقابض. صوت ستيريو.نظام نموذجي لحل بنية البلورات الجزيئية الكبيرة. حدد الرابطة المراد تدويرها عن طريق تدوير مقبض آخر حتى تضيء الرابطة المطلوبة بالتتابع.
كوهين وفيلدمان [ 24 ]1974حاسوب DEC PDP-10، شاشة عرض Adage، أزرار ضغط، لوحة مفاتيح، مقابضنظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي.
ستيلمان [ 25 ]1975جامعة برينستون : حاسوب PDP-10، شاشة عرض LDS-1، مقابضنظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي. لم يتم عرض خريطة كثافة الإلكترون؛ وبدلاً من ذلك، يتم تحديث قيمة "عامل H" كمؤشر للجودة مع تعديل التركيب الجزيئي.
كولينز، كوتون، هازن، ماير، موريموتو1975CRYSNET، [ 26 ] جامعة تكساس إيه آند إم. حاسوب DEC PDP-11/40، شاشة Vector General Series 3، مقابض، لوحة مفاتيح. ستيريو.نظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي. مجموعة متنوعة من أوضاع العرض: التأرجح، والدوران، والعديد من أوضاع العرض المجسم.
كورنيليوس وكراوت1976 (تقريبًا)جامعة كاليفورنيا في سان دييغو : جهاز محاكاة DEC PDP-11/40 (CalData 135)، وشاشة نظام الصور Evans and Sutherland، ولوحة مفاتيح، و6 مقابض. ستيريو.نظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي.
(جامعة ييل)1976 (تقريبًا)الخنازير: جهاز كمبيوتر DEC PDP-11/70، وشاشة عرض Evans and Sutherland Picture System 2، ولوحة بيانات، ومقابض.نظام حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة كنموذج أولي. تم استخدام القرص في معظم التفاعلات.
فيلدمان وبورتر1976معاهد الصحة الوطنية: جهاز كمبيوتر DEC PDP-11/70. نظام عرض Evans and Sutherland Picture System 2، مقابض. ستيريو.نظام عرض تفاعلي لبنية الجزيئات. يهدف إلى عرض البيانات الجزيئية بشكل تفاعلي من أطلس AMSOM - أطلس بنية الجزيئات الكبيرة على الميكروفيش. [ 27 ]
روزنبرغر وآخرون1976MMS-X: [ 28 ] جامعة واشنطن في سانت لويس ، جهاز كمبيوتر TI 980B، شاشة عرض Hewlett-Packard 1321A، طرفية فيديو Beehive، وحدات عرض مخصصة، زوج من عصي التحكم ثلاثية الأبعاد ذات الإرجاع الزنبركي، مقابض.نظام أولي (ونجح لاحقًا) لحل بنية البلورات الجزيئية الكبيرة. وهو النظام الذي خلف نظام MMS-4 المذكور أعلاه. تقوم عصا التحكم ثلاثية الأبعاد ذات الارتداد الزنبركي إما بتحريك وتدوير البنية الجزيئية لعرضها أو البنية الجزيئية الفرعية لملاءمتها، ويتم التحكم في الوضع بواسطة مفتاح تبديل.
بريتون، ليبسكومب، بيك، رايت، بروكس1977GRIP-75 [ 20 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] في جامعة نورث كارولينا في تشابل هيل : جهاز كمبيوتر IBM System/360 Model 75 ذو مشاركة زمنية، وجهاز كمبيوتر DEC PDP 11/45، وشاشة Vector General Series 3، وصندوق حركة ثلاثي الأبعاد من AM Noll وعصا تحكم ثلاثية الأبعاد بنابض إرجاع لمعالجة البنية الفرعية، وعصا تحكم متداخلة من Measurement Systems، ومقابض، ومنزلقات، وأزرار، ولوحة مفاتيح، وقلم ضوئي.أول حل لبنية بلورية لجزيء كبير. [ 33 ]
جونز1978FRODO و RING [ 34 ] [ 35 ] معهد ماكس بلانك، ألمانيا، RING: أجهزة كمبيوتر DEC PDP-11/40 و Siemens 4004، شاشة Vector General 3404، 6 مقابض.حل التركيب البلوري للجزيئات الكبيرة. ربما تم تشغيل برنامج FRODO على جهاز DEC VAX-780 كبرنامج لاحق لبرنامج RING.
الماس1978Bilder [ 36 ] كامبريدج، إنجلترا، جهاز كمبيوتر DEC PDP-11/50، شاشة نظام الصور Evans and Sutherland، جهاز لوحي.حلّ البنية البلورية للجزيئات الكبيرة. يتم إدخال جميع البيانات عبر جهاز لوحي. تُبنى البنى الجزيئية مباشرةً باستخدام الهندسة المثالية. ثم تُجرى عمليات تمديد الروابط باستخدام التبسيط.
لانغريدج، وايت، مارشالأواخر السبعينياتالأنظمة الإدارية ( PDP-11 ، شاشات Tektronix أو DEC-VT11، على سبيل المثال MMS-X)مزيج من الحوسبة التجارية مع شاشات العرض المبكرة.
ديفيز، هوباردمنتصف ثمانينيات القرن العشرينCHEM-X، HYDRAأنظمة المختبرات المزودة بأجهزة متعددة الألوان، وأجهزة نقطية، وأجهزة متجهة (Sigmex، PS300).
بيوسيم، تريبوس، بوليجينمنتصف ثمانينيات القرن العشرينPS300 ومحطات طرفية بسيطة منخفضة التكلفة (VT200، SIGMEX)حزم نمذجة وعرض متكاملة تجارية.
سيليكون جرافيكس ، صنأواخر ثمانينيات القرن العشرينمحطات عمل IRIS GL (UNIX)محطات عمل فردية بأسعار معقولة مزودة بشاشة عرض مجسمة.
مختبر البيولوجيا الجزيئية - ماذا لو1989، 2000مستقل عن الآلةمجاني تقريبًا، متعدد الوظائف، ولا يزال مدعومًا بالكامل، ويعتمد عليه العديد من الخوادم المجانية
سايل، ريتشاردسون1992، 1993راسمول ، كينماجMG مستقل عن المنصة.
MDL (فان فليت، مافيت، أدلر، هولت)1995–1998رنينبرنامج C++ خاص؛ إضافة متصفح مجانية لأجهزة Mac (OS9) وأجهزة الكمبيوتر الشخصية
مولسوفت1997–حتى الآنمتصفح ICMبرنامج احتكاري؛ تحميل مجاني لأنظمة ويندوز وماك ولينكس. [ 37 ] [ 38 ]
كيماكسون1998-مارفن سكتش ومارفن فيو. مارفن سبيس (2005)تطبيق جافا صغير خاص أو تطبيق مستقل .

الأنواع

نماذج الكرة والعصا

جزيء حمض الباميدرونيك ، كما رسمه برنامج Jmol . الهيدروجين أبيض، والكربون رمادي، والنيتروجين أزرق، والأكسجين أحمر، والفوسفور برتقالي.

في نموذج الكرة والعصا، يتم رسم الذرات على شكل كرات صغيرة متصلة بقضبان تمثل الروابط الكيميائية بينها.

نماذج تملأ الفراغ

نموذج ثلاثي الأبعاد لحمض الفورميك . الهيدروجين أبيض، والكربون رمادي، والأكسجين أحمر.

في نموذج ملء الفراغ، تُرسَم الذرات على شكل كرات صلبة للإشارة إلى الفراغ الذي تشغله، بما يتناسب مع أنصاف أقطار فان دير فالس الخاصة بها . تتداخل الذرات التي تشترك في رابطة مع بعضها البعض.

الأسطح

جزيء ماء مرسوم بسطح متساوي الجهد الكهروستاتيكي مظلل . المناطق المظللة باللون الأحمر لها كثافة شحنة موجبة صافية ، والمناطق الزرقاء لها شحنة سالبة.

في بعض النماذج، يتم تقريب سطح الجزيء وتظليله لتمثيل خاصية فيزيائية للجزيء، مثل كثافة الشحنة الإلكترونية. [ 39 ] [ 40 ]

مخططات الشريط

صورة للهيماغلوتينين حيث تظهر اللوالب ألفا على شكل أسطوانات، وبقية عديد الببتيد على شكل لفائف فضية. تم إخفاء ذرات عديد الببتيد الفردية. تظهر جميع الذرات غير الهيدروجينية في الرابطتين بالقرب من أعلى الرسم التخطيطي.

تُعدّ المخططات الشريطية تمثيلات تخطيطية لبنية البروتين ، وهي من أكثر طرق تصوير البروتينات شيوعًا اليوم. يُظهر الشريط المسار العام وتنظيم العمود الفقري للبروتين ثلاثي الأبعاد، ويُستخدم كإطار بصري لعرض تفاصيل البنية الذرية الكاملة، مثل الكرات التي تُمثل ذرات الأكسجين المرتبطة بالموقع النشط للميوغلوبين في الصورة المجاورة. تُنشأ المخططات الشريطية عن طريق استيفاء منحنى سلس عبر العمود الفقري للبروتين . تُعرض الحلزونات ألفا على شكل أشرطة ملتفة أو أنابيب سميكة، وتُعرض خيوط بيتا على شكل أسهم، وتُعرض اللفائف أو الحلقات غير المتكررة على شكل خطوط أو أنابيب رفيعة. يُشار إلى اتجاه سلسلة الببتيد محليًا بواسطة الأسهم، ويمكن الإشارة إليه بشكل عام بواسطة تدرج لوني على طول الشريط. [ 41 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ ديكرسون، ر. إي.؛ جيس، إ. (1969). بنية البروتينات ووظيفتها . مينلو بارك، كاليفورنيا: دبليو إيه بنجامين.
  2. ↑ الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC )، موسوعة المصطلحات الكيميائية ، الطبعة الخامسة (الكتاب الذهبي) (2025). النسخة الإلكترونية: (1997) " الرسومات الجزيئية ". doi : 10.1351/goldbook.MT06970
  3. ↑ هاريسون، كارل؛ بوين، جوناثان ب .؛ بوين، أليس م. (2013). نغ، كيا؛ بوين، جوناثان ب.؛ ماكدايد، سارة (محررون). "التصوير الإلكتروني في الكيمياء: من الخيمياء إلى الفن" . وقائع مؤتمر EVA لندن 2013. ورش العمل الإلكترونية في الحوسبة. الجمعية البريطانية للحاسبات . الصفحات 267-274 . 
  4. ↑ كوري، روبرت ب.؛ بولينغ، لينوس (1953). "النماذج الجزيئية للأحماض الأمينية والببتيدات والبروتينات" . مراجعة الأدوات العلمية . 24 (8): 621. Bibcode : 1953RScI...24..621C . doi : 10.1063/1.1770803 . تاريخ الاسترجاع: 13 يونيو 2022 .
  5. ↑ كولتون، والتر ل. (ديسمبر 1965). "نماذج ذرية دقيقة لملء الفراغ". البوليمرات الحيوية . 3 (6): 665-679 . doi : 10.1002/bip.360030606 . PMID 4158989. S2CID 38806627 .  
  6. 1 2 أتوود، جيري ل.؛ باربور، ليونارد ج. (2003). "الرسومات الجزيئية: من العلم إلى الفن" . نمو البلورات وتصميمها . 3 (1): 3-8 . Bibcode : 2003CrGrD...3....3A . doi : 10.1021/cg020063o . تاريخ الاسترجاع: 13 يونيو 2022 .
  7. ↑ فرانكور، إريك (2002). "سايروس ليفينثال، وتقنية كلوج، وأصول الرسومات الجزيئية التفاعلية" . إنديفور . 26 (4): 127-131 . doi : 10.1016/S0160-9327(02)01468-0 . PMID 12535918. تاريخ الاسترجاع: 13 يونيو 2022 . 
  8. ↑ بورتر، ت. ك. (أغسطس 1978). "التظليل الكروي" . مجلة ACM SIGGRAPH لرسومات الحاسوب . 12 (3): 282-285 . doi : 10.1145/965139.639789 .
  9. ↑ أورتوني، أ. (مايو 1971). "نظام للعرض المجسم" . مجلة الكمبيوتر . 14 (2): 140-144 . doi : 10.1093/comjnl/14.2.140 .يظهر أيضًا في: مؤتمر الشاشات ، منشور مؤتمر معهد المهندسين الكهربائيين رقم 80 (7-10 سبتمبر 1971)، سي. بالدوين المحدودة، 225-232.
  10. ↑ روز، جون أ.؛ مكليلاري، لورانس إي. (أغسطس 1979). "الرسومات الحاسوبية المجسمة للمحاكاة والنمذجة" . مجلة ACM SIGGRAPH للرسومات الحاسوبية . 13 (2): 41-47 . doi : 10.1145/965103.807423 . تاريخ الاسترجاع: 14 يونيو 2022 .
  11. ↑ وايلي، سوزان س. (12 مايو 2022). "ما هي النظارات ثلاثية الأبعاد السلبية؟" . إيزي تك جانكي . تم الاطلاع عليه في 14 يونيو 2022 .
  12. ↑ ليفينثال، سي. (يونيو 1966). "بناء النماذج الجزيئية باستخدام الحاسوب". مجلة ساينتفك أمريكان . 214 (6): 42-52 . Bibcode : 1966SciAm.214f..42L . doi : 10.1038/scientificamerican0666-42 . PMID 5930597 . 
  13. ↑ باري، سي دي، إليس، آر إيه، غرايسر، إس إم، ومارشال، جي آر 1969. العرض والمعالجة في ثلاثة أبعاد. مفاهيم ذات صلة في رسومات الحاسوب ، مطبعة جامعة إلينوي، 104-153.
  14. ↑ أورتوني، أ. 1971ب. مؤتمر الصور المجسمة التفاعلية حول الشاشات ، منشورات مؤتمر معهد المهندسين الكهربائيين رقم 80 (7-10 سبتمبر)، سي. بالدوين المحدودة، 185-193.
  15. ↑ باري، سي دي، إليس، آر إيه، غرايسر، إس إم، ومارشال، جي آر 1971. CHEMAST: برنامج حاسوبي لنمذجة الهياكل الجزيئية. وقائع مؤتمر IFIP لعام 1971 ، 1552-1558.
  16. ↑ تونتا، سي. وكاتز، إل. 1971. الرسومات التفاعلية في البيولوجيا الجزيئية. دوران ثلاثي الأبعاد في الوقت الحقيقي للصور وأجزاء الصور. وقائع مؤتمر محاكاة الحاسوب الصيفي، 1 ، 241-247.
  17. ↑ بيركنز، دبليو جيه؛ بايبر، إي إيه؛ تاتام، إف جي؛ وايت، جيه سي (يونيو 1971). "شاشات حاسوبية تفاعلية مجسمة للبحوث الطبية الحيوية". الحوسبة والبحوث الطبية الحيوية . 4 (3): 249-261 . doi : 10.1016/0010-4809(71)90030-9 . PMID 5562569 . 
  18. ↑ رايت، دبليو في 1972أ. ​​نظام رسوميات حاسوبية تفاعلي للدراسات الجزيئية . أطروحة دكتوراه، جامعة نورث كارولينا، تشابل هيل، نورث كارولينا.
  19. ↑ رايت، دبليو في (أكتوبر 1972). "الواجهة ثنائية الأبعاد لنظام تفاعلي للدراسات الجزيئية" . إشعارات ACM SIGPLAN . 7 (10): 76-85 . doi : 10.1145/942576.807017 .
  20. 1 2 بروكس إف بي جونيور. عالم الكمبيوتر كصانع أدوات: دراسات في رسومات الكمبيوتر التفاعلية. وقائع الاتحاد الدولي لمعالجة المعلومات ، 625-634 (1977).
  21. ↑ باري سي دي، نورث إيه سي (1972). "استخدام نظام عرض مُتحكم به بواسطة الحاسوب في دراسة التكوينات الجزيئية". ندوة كولد سبرينغ هاربور للبيولوجيا الكمية 36 : 577-84 . doi : 10.1101 /SQB.1972.036.01.072 . PMID 4508170 . 
  22. ↑ باري سي دي، بوشارد إتش إي، إليس آر إيه، مارشال جي آر (ديسمبر 1974). "نظام نمذجة جزيئية ماكروية متطورة". وقائع الاتحاد 33 (12): 2368-72 . PMID 4435239 . 
  23. ↑ فريتش، جيه إم، إليس، آر إيه، جاكوبي تي إتش، ومارشال، جي آر 1975. نظام رسومات جزيئية كبيرة لأبحاث بنية البروتين. الحواسيب والرسومات، 1 ، العدد 2/3 (سبتمبر)، 271-278.
  24. ↑ كوهين، جي إتش وفيلدمان، آر جيه 1974. MAP - برنامج حاسوبي تفاعلي للرسومات لمعالجة ومطابقة جزيئات البروتين مع خرائط كثافة الإلكترون. الجمعية الأمريكية لعلم البلورات. ربيع 23 ، (ملخص).
  25. ↑ ستيلمان، إس دي (سبتمبر 1975). "تطبيق الرسومات التفاعلية ثلاثية الأبعاد في تحليل البلورات بالأشعة السينية". الحوسبة والرسومات . 1 ( 2-3 ): 279-288 . doi : 10.1016/0097-8493(75)90019-9 .
  26. ↑ كولينز، د.م.، كوتون، ف.أ.، هازن، إ.إ.، ماير، إ.ف.، موريموتو، س.ن. (ديسمبر 1975). "بنية بلورات البروتين: مناهج أسرع وأقل تكلفة". مجلة ساينس . 190 (4219): 1047-1053 . رمز Bibcode : 1975Sci...190.1047C . doi : 10.1126/science.1188383 . PMID: 1188383. S2CID : 44583219 .  
  27. ↑ فيلدمان، آر جيه 1976. AMSOM – أطلس بنية الجزيئات الكبيرة على الميكروفيش .. ماريلاند: شركة تراكور جيتكو.
  28. ↑ روزنبرغر، إف يو، وآخرون. 1976. مقتطفات من التقرير السنوي للمعاهد الوطنية للصحة لعام 1976. مذكرة فنية رقم 230، مختبر أنظمة الحاسوب، جامعة واشنطن في سانت لويس، ميسوري.
  29. ↑ ليبسكومب، جيه إس. إشارات ثلاثية الأبعاد لنظام رسومات حاسوبية جزيئية. أطروحة دكتوراه، جامعة نورث كارولينا في تشابل هيل، نورث كارولينا. (1981)
  30. ↑ بريتون إي، ليبسكومب جيه إس، بيك إم إي، رايت دبليو في، بروكس إف بي جونيور، بيك إم إي. واجهة الإنسان والآلة GRIP-75. مراجعة فيديو ACM SIGGRAPH ، (4)، (أغسطس 1981).
  31. ↑ بريتون، إي جي 1977. منهجية للتصميم المريح لأنظمة رسومات الحاسوب التفاعلية، وتطبيقها على علم البلورات . أطروحة دكتوراه، جامعة نورث كارولينا، تشابل هيل، نورث كارولينا.
  32. ↑ بيك، م. إي. 1980. الدوران الديناميكي المتداخل لرسومات الحاسوب . رسالة ماجستير، جامعة نورث كارولينا، تشابل هيل، نورث كارولينا.
  33. ↑ تسيرنوغلو د، بيتسكو غا، تو أ ت (أبريل 1977). "تسلسل البروتين باستخدام رسومات الحاسوب". بيوشيم. بيوفيز. أكتا . 491 (2): 605-8 . doi : 10.1016/0005-2795(77)90309-9 . PMID 857910 . 
  34. ↑ جونز، ت. أ. (أغسطس 1978). "نظام بناء وتحسين النماذج الرسومية للجزيئات الكبيرة". مجلة علم البلورات التطبيقي . 11 (4): 268-272 . Bibcode : 1978JApCr..11..268J . doi : 10.1107/S0021889878013308 .
  35. ↑ جونز، تي إيه 1978ب. جهاز RING [دليل المستخدم]. معهد ماكس بلانك للكيمياء الحيوية، 8033 مارتينسريد باي موشن، ألمانيا.
  36. ↑ دايموند، ر. 1978. صور. برنامج رسومات حاسوبية للبوليمرات الثنائية وتطبيقه على تفسير بنية أقراص بروتين فيروس تبرقش التبغ بدقة 2 أنغستروم. وقائع الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية البحتة والتطبيقية: الندوة الدولية حول البنية، والتشكيل، والوظيفة، والتطور . مدراس، الهند، (4 يناير)، دار بيرغامون للنشر.
  37. ↑ أباغيان ر، لي و.هـ، راوش إ، وآخرون (فبراير 2006). "نشر بيانات علم الجينوم البنيوي للجمهور: من مجرد تجميع للبيانات إلى قصة متحركة". مجلة تريندز في العلوم البيوكيميائية ، 31 (2): 76-78 . doi : 10.1016/j.tibs.2005.12.006 . PMID 16406633 .  
  38. ↑ راوش إي، توتروف إم، مارسدن بي دي، أباغيان آر (2009). "طريقة جديدة لنشر المحتوى ثلاثي الأبعاد" . PLOS ONE . 4 (10) e7394. Bibcode : 2009PLoSO...4.7394R . doi : 10.1371/journal.pone.0007394 . PMC 2754609. PMID 19841676 .  
  39. ↑ وولفسون، حاييم؛ دوهوفني، دينا؛ تشيرنياك، أفياد. "تمثيل السطح الجزيئي" . www.cs.tau.ac.il. تاريخ الاسترجاع: 14 يونيو 2022 .
  40. ↑ أودونيل، تي جيه. "علم وفن الأسطح الجزيئية" . www.cs.uic.edu . تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 يونيو 2022 .
  41. ↑ سميث، توماس ج. (27 أكتوبر 2005). "عرض وتحليل البنى الذرية على نظام ماكنتوش" . مركز دانفورث لعلوم النبات. مؤرشف من الأصل في 28 مارس 2002.