أوترون

الأوترون هو تسلسل نيوكليوتيدي يقع في الطرف 5' من النسخة الأولية للجين، ويُزال بواسطة نوع خاص من عملية ربط الحمض النووي الريبوزي (RNA) أثناء نضج منتج الحمض النووي الريبوزي النهائي. [ 1 ] بينما تقع تسلسلات الإنترون داخل الجين، تقع تسلسلات الأوترون خارجه. [ 2 ]

صفات

يُعدّ الأوترون تسلسلًا شبيهًا بالإنترون، يمتلك خصائص مماثلة مثل محتوى G+C [ 3 ] وموقع استقبال الربط الذي يُمثّل إشارة الربط العابر . [ 4 ] [ 5 ] ويُعرَّف موقع الربط العابر هذا أساسًا بأنه موقع ربط مستقبل (3') بدون موقع ربط مانح (5') في الاتجاه المعاكس.

في حقيقيات النوى مثل اليوجلينوزوا والدينوفلاجيلات والإسفنج والديدان الخيطية واللاسعات والمشطيات والديدان المسطحة والقشريات والأسواط الدوارة والغلاليات ، يتراوح طول الأجزاء الخارجية للقائد الموصول (SL) من 30 إلى 102 نيوكليوتيد ( nt ) ، ويتراوح طول الإكسون SL من 16 إلى 51 نيوكليوتيد، ويتراوح طول الحمض النووي الريبي SL الكامل من 46 إلى 141 نيوكليوتيد. [ 3 ]

يعالج

في عملية الربط الموضعي التقليدية ، يتطلب الأمر وجود موقع ربط مانح في الموضع العلوي، بالإضافة إلى موقع ربط مستقبل في الموضع السفلي على نفس جزيء الحمض النووي الريبوزي الأولي. في المقابل، تعتمد عملية الربط الموضعي العابر على موقع ربط مستقبل في الطرف 3' على الجزء الخارجي، وموقع ربط مانح في الطرف 5' (ثنائي النوكليوتيد GU) على جزيء حمض نووي ريبوزي منفصل، وهو الحمض النووي الريبوزي العابر. [ 3 ] علاوة على ذلك، يحتوي الجزء الخارجي من الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي على أدينوزين نقطة تفرع - متبوعًا بسلسلة من متعددات البيريميدين في الموضع السفلي - والذي يتفاعل مع الجزء الشبيه بالإنترون من الحمض النووي الريبوزي العابر لتكوين ناتج ثانوي متفرع على شكل حرف "Y"، يشبه بنية الحلقة المتكونة أثناء ربط الإنترون. ثم تقوم الآلية النووية بحل بنية التفرع هذه على شكل حرف "Y" عن طريق الربط الموضعي العابر لتسلسل الحمض النووي الريبوزي العابر إلى موقع الربط المستقبل العابر في الطرف 3' (ثنائي النوكليوتيد AG) للحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي. [ 2 ]

عند معالجة الأوترونات، يتم ربط إكسون SL بشكل منفصل بمواقع مستقبلة غير مزدوجة تقع في اتجاه المصب، مجاورة لكل إطار قراءة مفتوح من الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي متعدد الجينات، مما يؤدي إلى نسخ ناضجة مميزة ذات غطاء. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. كونراد، ريتشارد؛ فين ليو، روي؛ بلومنتال، توماس (25 فبراير 1993). "التحليل الوظيفي لمستقبل الربط العابر في الدودة الأسطوانية C. elegans" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 21 (4): 913-919 . doi : 10.1093/nar/21.4.913 . ISSN 0305-1048 . PMC 309224. PMID 8451190 .   
  2. 1 2 ستوفر، نيكولاس أ.؛ كاي، ميشيل س.؛ كافالكانتي، أندريه ر.و. (10 يناير 2006). "الوصل العابر للقائد الموصول" . علم الأحياء الحالي . 16 (1): R8– R9. رمز Bibcode : 2006CBio...16...R8S . doi : 10.1016/j.cub.2005.12.019 . ISSN 0960-9822 . PMID 16401417 .  
  3. 1 2 3 لاسدا، إريكا ل.؛ بلومنتال، توماس (2011-05-01). " الوصل العابر ". مراجعات وايلي متعددة التخصصات: الحمض النووي الريبي . 2 ( 3): 417-434 . doi : 10.1002/wrna.71 . PMID 21957027. S2CID 209567118 .  
  4. "مرجع أكسفورد - أوترون" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 سبتمبر 2019 .
  5. "متصفح علم الوجود لتسلسل MISO - Outron (SO:0001475)" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 سبتمبر 2019 .
  6. كلايتون، كريستين إي. (15 أبريل 2002). "الحياة بدون تحكم في النسخ؟ من الذبابة إلى الإنسان والعودة" . مجلة EMBO . 21 (8): 1881-1888 . doi : 10.1093/emboj/ 21.8.1881 . ISSN 1460-2075 . PMC 125970. PMID 11953307 .   
  7. بلومنتال، توماس؛ غليسون، كاثي سيجرسون (فبراير 2003). " أوبرونات Caenorhabditis elegans : الشكل والوظيفة". Nature Reviews Genetics . 4 (2): 110–118 . doi : 10.1038 / nrg995 . ISSN 1471-0056 . PMID 12560808. S2CID 9864778 .   
  8. لي كيو، لي سي، زو زد، هوانغ سي، تشنغ إتش، تشو آر (مارس 2016). "رؤى تطورية حول عملية الربط العابر للحمض النووي الريبوزي في الفقاريات" . علم الأحياء التطوري وعلم الجينوم . 8 (3): 562-77 . doi : 10.1093/gbe/evw025 . PMC 4824033. PMID 26966239 .