الربط العابر
الربط العابر هو شكل خاص من معالجة الحمض النووي الريبوزي (RNA) حيثيتم ربط الإكسونات من نسختين أوليّتين مختلفتين من الحمض النووي الريبوزي (RNA) من طرف إلى طرف . يوجد عادةً في حقيقيات النوى ويتم بوساطة الجسيم الرابط ، على الرغم من أن بعض البكتيريا والعتائق تمتلك أيضًا "أنصاف جينات" للحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA) . [ 1 ]
الربط الجيني العابر
بينما تعالج عملية التضفير "العادية" ( cis ) جزيئًا واحدًا، فإن عملية التضفير العابرة (trans) تُنتج نسخة واحدة من الحمض النووي الريبوزي (RNA) من عدة نسخ أولية منفصلة من الحمض النووي الريبوزي الرسول (pre-mRNA) . يمكن استغلال هذه الظاهرة في العلاج الجزيئي لمعالجة منتجات الجينات المتحولة. [ 2 ] يسمح التضفير العابر الجيني بتنوع الحمض النووي الريبوزي (RNA) ويزيد من تعقيد البروتينات. [ 3 ]
التسرطن
بينما تحدث بعض النسخ الاندماجية عبر عملية الربط العابر في الخلايا البشرية الطبيعية، [ 1 ] يمكن أن يكون الربط العابر أيضًا هو الآلية الكامنة وراء بعض النسخ الاندماجية المسببة للأورام . [ 4 ] [ 5 ]
الربط العابر SL
تستخدم بعض الكائنات الدقيقة، ولا سيما الطلائعيات من فئة الكينيتوبلاستيا، عملية الربط العابر (trans -splicing ) المعروفة باسم "القائد المُرَكَّب" (SL)، للتعبير عن الجينات. في هذه الكائنات، يُنسخ جزيء RNA قائد مُرَكَّب مُغطّى، وفي الوقت نفسه، تُنسخ الجينات في سلاسل طويلة متعددة الجينات (polycistrons). [ 6 ] يُرَكَّب القائد المُرَكَّب المُغطّى على كل جين لإنتاج نسخ أحادية الجين مُغطّاة ومُذيّلة بذيل متعدد الأدينين. [ 7 ] تستخدم هذه حقيقيات النوى المبكرة التفرع عددًا قليلًا من الإنترونات ، ويُظهر الجسيم الرابط (spliceosome) الذي تمتلكه بعض الاختلافات غير العادية في تركيبه. [ 7 ] [ 8 ] كما أنها تمتلك أيضًا العديد من نظائر eIF4E ذات أدوار متخصصة في التغطية. [ 9 ] يُعد تسلسل القائد المُرَكَّب محفوظًا للغاية في الأنواع الدنيا التي تخضع لعملية الربط العابر، مثل التريبانوسومات. على الرغم من أن دور القائد المُرَكَّب غير معروف في الخلية، يُعتقد أنه يشارك في بدء عملية الترجمة. في دودة C. elegans ، يحدث ربط التسلسل القائد بالقرب من كودون البدء. ويشير بعض العلماء أيضًا إلى أن هذا التسلسل ضروري لبقاء الخلية. أما في دودة Ascaris، فإن التسلسل القائد المربوط ضروري لنسخ جين الحمض النووي الريبوزي (RNA). وقد يكون هذا التسلسل مسؤولاً عن بدء النسخ، وتحديد موقع الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، وبدء الترجمة أو تثبيطها. [ 10 ]
تستخدم بعض حقيقيات النوى الأخرى، ولا سيما بين الدياتومات السوطية ، والإسفنجيات ، والديدان الأسطوانية ، واللاسعات ، والمشطيات ، والديدان المسطحة ، والقشريات ، والأسهميات ، والروتيفيرات ، والأسيديات، عملية الربط العابر SL بدرجات متفاوتة . [ 1 ] [ 11 ] في الأسيديات Ciona intestinalis ، يُوصف مدى الربط العابر SL بشكل أفضل من خلال منظور كمي يُميز بين الجينات التي تخضع للربط العابر بشكل متكرر وتلك التي تخضع له بشكل غير متكرر، بدلاً من التصنيف الثنائي التقليدي للجينات التي تخضع للربط العابر مقابل الجينات التي لا تخضع له . [ 12 ]
تُسهم عملية الربط العابر SL في فصل النسخ متعددة الجينات للأوبيرونات إلى جزيئات mRNA فردية ذات غطاء 5'. وتتم هذه العملية عندما تُربط الأوترونات عبر الربط العابر بمواقع مستقبلة غير مزدوجة تقع في اتجاه المصب، مجاورة لأطر القراءة المفتوحة للجينات . [ 13 ] [ 14 ]
الآلية
تتميز عملية الربط العابر بربط إكسونين منفصلين من الحمض النووي الريبوزي المنسوخ. إشارة هذا الربط هي الإكسون الخارجي في الطرف 5' من الحمض النووي الريبوزي الرسول، في غياب موقع ربط وظيفي في الطرف 5' في الجزء العلوي. عند ربط الإكسون الخارجي، يتفرع موقع الربط 5' للحمض النووي الريبوزي الرائد المربوط إلى الإكسون الخارجي، مكونًا وسيطًا. [ 10 ] ينتج عن هذه الخطوة إكسون رائد مربوط حر. ثم يُربط هذا الإكسون بالإكسون الأول على الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي، ويُحرر الوسيط. يختلف الربط العابر عن الربط الموضعي في عدم وجود موقع ربط 5' على الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي. بدلًا من ذلك، يُوفر تسلسل SL موقع الربط 5'. [ 14 ]
الربط المتبادل بين خيوط الحمض النووي ذات المعنى وخيوط الحمض النووي ذات المعنى المعاكس
نتيجةً لعملية النسخ التي تخضع لها السلسلة الموجبة، يتشكل جزيء ما قبل mRNA يُكمل السلسلة الموجبة. كما تُنسخ السلسلة السالبة، مما ينتج عنه جزيء ما قبل mRNA مكمل لها. تُدمج الإكسونات من النسختين معًا لتكوين جزيء mRNA هجين. [ 15 ]
الربط البديل
يشمل التضفير البديل التضفير داخل الجين والتضفير بين الجينات. يتضمن التضفير داخل الجين تكرار الإكسونات في الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي (pre-mRNA). أما التضفير بين الجينات فيتميز بتضفير الإكسونات المكونة للحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي لجينين مختلفين، مما ينتج عنه حمض نووي ريبوزي رسول معدل وراثيًا. [ 16 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 3 لي كيو، لي سي، زو زد، هوانغ سي، تشنغ إتش، تشو آر (مارس 2016). "رؤى تطورية حول عملية الربط العابر للحمض النووي الريبوزي في الفقاريات" . علم الأحياء التطوري وعلم الجينوم . 8 (3): 562-77 . doi : 10.1093/gbe/evw025 . PMC 4824033. PMID 26966239 .
- ↑ إيواساكي ر، كيوتشي هـ، إيهارا م، موري ت، كاواكامي م، أويدا هـ (يوليو 2009). "الوصل العابر كطريقة جديدة لإنتاج بروتينات اندماج الأجسام المضادة بسرعة" . مجلة الاتصالات البحثية في الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 384 (3): 316-321 . Bibcode : 2009BBRC..384..316I . doi : 10.1016/j.bbrc.2009.04.122 . PMID 19409879 .
- ↑ لاسدا، إريكا ل.؛ بلومنتال، توماس (2011). "الوصل العابر" . مجلة WIREs RNA . 2 (3): 417-434 . doi : 10.1002/wrna.71 . ISSN 1757-7012 . PMID 21957027. S2CID 209567118 .
- ↑ لي هـ، وانغ ج، مور ج، سكلار ج (سبتمبر 2008). "اندماج جيني ورمي يحاكي عملية الربط العابر للحمض النووي الريبوزي في الخلايا البشرية الطبيعية". مجلة ساينس . 321 (5894): 1357-1361 . Bibcode : 2008Sci...321.1357L . doi : 10.1126/science.1156725 . PMID 18772439. S2CID 13605087 .
- ↑ ريكمان دي إس، بفلوغر دي، موس بي، فاندورين في إي، تشين سي إكس، دي لا تايل إيه، وآخرون (أبريل 2009). " SLC45A3-ELK4 هو نسخة جينية اندماجية جديدة وشائعة خاصة بتحول الأرومات الحمراء في سرطان البروستاتا" . أبحاث السرطان . 69 (7): 2734-2738 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-4926 . PMC 4063441. PMID 19293179 .
- ↑ كامبل، د. أ.، ستورم، ن. ر.، يو، م. س. (فبراير 2000). "نسخ جين الحمض النووي الريبوزي الرائد الموصول في الكينيتوبلاستيدات". علم الطفيليات اليوم . 16 (2): 78-82 . doi : 10.1016/s0169-4758(99)01545-8 . PMID 10652494 .
- 1 2 ليانغ إكس إتش، هاريتان إيه، أولييل إس، ميكايلي إس (أكتوبر 2003). "الوصل العابر والمتجاور في التريبانوسومات: الآلية والعوامل والتنظيم" . الخلية حقيقية النواة . 2 (5): 830-40 . doi : 10.1128/EC.2.5.830-840.2003 . PMC 219355. PMID 14555465 .
- ↑ غونزل أ (أغسطس 2010). "آلية تضفير ما قبل الحمض النووي الريبوزي الرسول في التريبانوسومات: معقدة أم مبسطة؟" . الخلية حقيقية النواة . 9 (8): 1159-1170 . doi : 10.1128/EC.00113-10 . PMC 2918933. PMID 20581293 .
- ↑ فراير إي آر، ستورم إن آر، كامبل دي إيه، دي ميلو نيتو أو بي (أكتوبر 2017). "دور معقدات البروتين الرابطة لغطاء mRNA السيتوبلازمي في التريبانوسوما البروسية وغيرها من التريبانوسومات" . مسببات الأمراض . 6 (4): 55. doi : 10.3390/pathogens6040055 . PMC 5750579. PMID 29077018 .
- 1 2 جيرارد، ليزا ر.؛ فيدلر، تريستان ج.؛ هاريس، تود و.؛ كارفاليو، فيليسيا؛ أنتوشيتشكين، إيغور؛ هان، مايكل؛ ستيرنبرغ، بول و.؛ شتاين، لينكولن د.؛ تشالفي، مارتن (يناير 2007). "WormBook: مراجعة إلكترونية لبيولوجيا Caenorhabditis elegans" . أبحاث الأحماض النووية . 35 (عدد قواعد البيانات): D472–475. doi : 10.1093/nar/gkl894 . ISSN 1362-4962 . PMC 1669767. PMID 17099225 .
- ↑ لاسدا إي إل، بلومنتال تي (2011-05-01). "الوصل العابر". مراجعات وايلي متعددة التخصصات: الحمض النووي الريبي . 2 (3): 417-34 . doi : 10.1002 / wrna.71 . PMID 21957027. S2CID 209567118 .
- ↑ ماتسوموتو جيه، ديوار كيه، فاسيرشيد جيه، وايلي جي بي، ماكميل إس إل، رو بي إيه، وآخرون . (مايو 2010). " تحليل تسلسل عالي الإنتاجية للرنا المرسال المنسوخ من Ciona intestinalis SL: أنماط التعبير البديلة وارتباطات وظيفة الجين" . أبحاث الجينوم . 20 (5): 636-45 . doi : 10.1101/gr.100271.109 . PMC 2860165. PMID 20212022 .
- ↑ كلايتون، كريستين إي. (15 أبريل 2002). "الحياة بدون تحكم في النسخ؟ من الذبابة إلى الإنسان والعودة" . مجلة EMBO . 21 (8): 1881-1888 . doi : 10.1093/emboj/ 21.8.1881 . ISSN 1460-2075 . PMC 125970. PMID 11953307 .
- 1 2 بلومنتال، توماس؛ جليسون، كاثي سيجرسون (فبراير 2003). " أوبرونات Caenorhabditis elegans : الشكل والوظيفة". Nature Reviews Genetics . 4 ( 2): 110–118 . doi : 10.1038/nrg995 . ISSN 1471-0056 . PMID 12560808. S2CID 9864778 .
- ↑ لي، كوان؛ لي، كونغ؛ تسو، تشي شيانغ؛ هوانغ، تشون هوا؛ تشنغ، هان هوا؛ تشو، رونغ جيا (مارس 2016). "رؤى تطورية حول عملية الربط العابر للحمض النووي الريبوزي في الفقاريات" . علم الأحياء التطوري وعلم الجينوم . 8 (3): 562-577 . doi : 10.1093/gbe/evw025 . ISSN 1759-6653 . PMC 4824033. PMID 26966239 .
- ↑ هوريوكي، تاكايوكي؛ أيغاكي، توشيرو (فبراير 2006). "التضفير البديل: نمط جديد لمعالجة ما قبل الحمض النووي الريبوزي الرسول" . بيولوجيا الخلية . 98 (2): 135-140 . doi : 10.1042/bc20050002 . ISSN 0248-4900 . PMID 16417469. S2CID 10335534 .
للمزيد من القراءة
- ديكسون آر جيه، إيبرون آي سي، ساماني إن جيه (يناير 2007). "أنماط تسلسل الإنترون التكميلية المرتبطة بتكرار الإكسون البشري: دور التفاعلات داخل الجين وبين النسخ في التعبير الجيني". المعلوماتية الحيوية . 23 (2): 150-155 . doi : 10.1093/bioinformatics/btl575 . PMID 17105720 .
- يانغ واي، والش سي إي (ديسمبر 2005). "الوصل العابر للحمض النووي الريبوزي بوساطة الجسيم الرابط" . العلاج الجزيئي . 12 (6): 1006-112 . doi : 10.1016/j.ymthe.2005.09.006 . PMID 16226059 .
- كودي تي إتش، وشابابي إم، وتوليس جي إي، ولورسون سي إل (أغسطس 2007). "استعادة وظيفة SMN: توصيل الحمض النووي الريبوزي المُعدِّل للوصل يُعيد توجيه وصل الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي لـ SMN2" . العلاج الجزيئي . 15 (8): 1471-1478 . doi : 10.1038/sj.mt.6300222 . PMID 17551501 .
- والي، في.، موراور، إي. إم.، باور، جيه. دبليو. (أغسطس 2012). "الوصل العابر بوساطة الجسيم الرابط: العلاج بالقص واللصق" . مجلة الأمراض الجلدية الاستقصائية . 132 (8): 1959-1966 . doi : 10.1038/jid.2012.101 . PMID 22495179 .
- الحمض النووي الريبي
- الجسيم الرابط
- عملية تضفير الحمض النووي الريبوزي
