متعدد الكيتيد

في الكيمياء العضوية ، تُعدّ البوليكيتيدات فئة من المنتجات الطبيعية المشتقة من جزيء أولي يتكون من سلسلة من مجموعات الكيتون ( >C=O ، أو أشكالها المختزلة ) والميثيلين ( >CH₂ ) المتناوبة: [ −C(=O)−CH₂− ]. [ 1 ] بدأت دراسة البوليكيتيدات في أوائل القرن العشرين، ومنذ ذلك الحين تطورت عمليات اكتشافها وتخليقها الحيوي وتطبيقاتها. وهي مجموعة كبيرة ومتنوعة من المستقلبات الثانوية، ناتجة عن عملية تخليقها الحيوي المعقدة التي تُشبه عملية تخليق الأحماض الدهنية . وبسبب هذا التنوع، يمكن أن يكون للبوليكيتيدات تطبيقات طبية وزراعية وصناعية متعددة. العديد من البوليكيتيدات لها خصائص طبية أو تُظهر سمية حادة. وقد مكّنت التقنية الحيوية من اكتشاف المزيد من البوليكيتيدات الموجودة في الطبيعة، وتطوير بوليكيتيدات جديدة ذات فعالية حيوية جديدة أو محسّنة.

تاريخ

استُخدمت البوليكيتيدات المنتجة طبيعيًا بواسطة نباتات وكائنات حية مختلفة من قِبل البشر منذ ما قبل بدء الدراسات عليها في القرنين التاسع عشر والعشرين. في عام 1893، قام ج. نورمان كولي بتخليق كميات قابلة للكشف من الأورسينول عن طريق تسخين حمض الديهيدراسيتيك مع هيدروكسيد الباريوم، مما أدى إلى فتح حلقة البيرون إلى ثلاثي الكيتيد. [ 2 ] وفي دراسات لاحقة أجراها كولي عام 1903 على وسيط ثلاثي الكيتون متعدد الكيتيد، لاحظ حدوث تكثيف بين المركبات التي تحتوي على مجموعات كيتين متعددة، ومن هنا جاء مصطلح البوليكيتيدات. [ 3 ]

التخليق الحيوي لحمض الأورسيلينيك من وسيط البوليكيتيد.

لم يُفهم التخليق الحيوي للبوليكيتيدات إلا في عام 1955. [ 4 ] استخدم آرثر بيرش تقنية الوسم بالنظائر المشعة للكربون في الأسيتات لتتبع التخليق الحيوي لحمض 2-هيدروكسي-6-ميثيل بنزويك في فطر البنسيليوم باتولوم ، وأثبت ارتباط أحماض الأسيتيك من الرأس إلى الذيل لتكوين البوليكيتيد. [ 5 ] في ثمانينيات وتسعينيات القرن العشرين، سمحت التطورات في علم الوراثة بعزل الجينات المرتبطة بالبوليكيتيدات لفهم عملية التخليق الحيوي. [ 4 ]

اكتشاف

يمكن إنتاج البوليكيتيدات في البكتيريا والفطريات والنباتات وبعض الكائنات البحرية. [ 6 ] وقد تضمن الاكتشاف المبكر للبوليكيتيدات الطبيعية عزل المركبات التي ينتجها الكائن الحي المحدد باستخدام طرق تنقية الكيمياء العضوية القائمة على فحص النشاط الحيوي . [ 7 ] وفي وقت لاحق، أتاحت التقنيات عزل الجينات والتعبير غير المتجانس عنها لفهم عملية التخليق الحيوي. [ 8 ] بالإضافة إلى ذلك، سمحت التطورات اللاحقة في مجال التقنية الحيوية باستخدام علم الجينوم البيئي واستخراج الجينوم للعثور على بوليكيتيدات جديدة باستخدام إنزيمات مشابهة لتلك المستخدمة في البوليكيتيدات المعروفة. [ 9 ]

التخليق الحيوي

تُصنَّع البوليكيتيدات بواسطة عديدات ببتيد متعددة الإنزيمات تُشبه إنزيمات تخليق الأحماض الدهنية في حقيقيات النوى، ولكنها غالبًا ما تكون أكبر حجمًا. [ 4 ] وهي تتضمن نطاقات حاملة للأسيل بالإضافة إلى مجموعة متنوعة من الوحدات الإنزيمية التي يمكنها العمل بطريقة تكرارية، حيث تُكرر نفس خطوات الاستطالة/التعديل (كما هو الحال في تخليق الأحماض الدهنية)، أو بطريقة متسلسلة لتوليد أنواع أكثر تنوعًا من البوليكيتيدات. [ 10 ]

التخليق الحيوي لحمض الكارمينيك

إنزيم بوليكيتيد سينثاز

تُنتَج البوليكيتيدات بواسطة إنزيمات بوليكيتيد سينثاز (PKSs). تتضمن عملية التخليق الحيوي الأساسية تكثيفًا تدريجيًا لوحدة بادئة (عادةً أسيتيل-CoA أو بروبيونيل-CoA ) مع وحدة مُمدِّدة (إما مالونيل-CoA أو ميثيل مالونيل-CoA). يترافق تفاعل التكثيف مع نزع الكربوكسيل من الوحدة المُمدِّدة، مما يُنتج مجموعة وظيفية بيتا-كيتو ويُحرِّر ثاني أكسيد الكربون. [ 10 ] يُنتج التكثيف الأول مجموعة أسيتوأسيتيل، وهي ثنائي كيتيد. تُنتج التكثيفات اللاحقة ثلاثي كيتيدات، ورباعي كيتيدات، وما إلى ذلك. [ 11 ] تشمل الوحدات البادئة الأخرى المرتبطة بمرافق الإنزيم A: إيزوبيوتيرات ، وسيكلوهكسان كاربوكسيلات ، ومالونات ، وبنزوات . [ 12 ]

إنزيمات بولي كيتيد سينثاز (PKSs) هي إنزيمات متعددة المجالات أو معقدات إنزيمية تتكون من مجالات متنوعة. سلاسل البولي كيتيد التي ينتجها إنزيم بولي كيتيد سينثاز بسيط (يتكون من أسيل ترانسفيراز وكيتوسينثاز للتكثيف التدريجي للوحدة البادئة ووحدات التمديد) تخضع لتعديلات شبه دائمة. [ 13 ] يتميز كل إنزيم بولي كيتيد سينثاز بخصائص فريدة لكل سلسلة بولي كيتيد، لاحتوائه على تركيبات مختلفة من المجالات التي تختزل مجموعة الكربونيل إلى هيدروكسيل (عن طريق كيتوريدوكتاز )، أو أوليفين (عن طريق ديهايدراتاز )، أو ميثيلين (عن طريق إينويل ريدوكتاز ). [ 14 ]

قد تختلف آلية إنهاء عملية التخليق الحيوي لهيكل البوليكيتيد. ففي بعض الأحيان، يصاحبها إنزيم ثيوإستراز الذي يُحرر البوليكيتيد عبر ترطيب رابطة الثيوإستر (كما في تخليق الأحماض الدهنية)، مُكَوِّنًا هيكلًا خطيًا من البوليكيتيد. مع ذلك، إذا لم يتمكن الماء من الوصول إلى الموقع النشط، فلن يحدث تفاعل الترطيب، ويكون التفاعل داخل الجزيء أكثر احتمالًا، مُكَوِّنًا بوليكيتيدًا حلقيًا كبيرًا. ثمة احتمال آخر وهو التحلل المائي التلقائي دون مساعدة إنزيم ثيوإستراز. [ 15 ]

إنزيمات ما بعد التعديل

يمكن إجراء تعديلات إضافية محتملة على هياكل البوليكيتيد. قد يشمل ذلك إضافة جزيئات سكرية عبر إنزيم ناقل الجلوكوزيل أو الأكسدة عبر إنزيم أحادي الأكسجيناز . [ 16 ] وبالمثل، يمكن إدخال عملية التكوير الحلقي والأروماتة عبر إنزيم حلقي ، وقد يسبقها أحيانًا متصاوغات الإينول للبوليكيتيد. [ 17 ] لا تُعد هذه الإنزيمات جزءًا من نطاقات إنزيم بوليكيتيد سينثاز، بل توجد في تجمعات جينية في الجينوم بالقرب من جينات بوليكيتيد سينثاز. [ 18 ]

تصنيف

البوليكيتيدات عائلة متنوعة بنيوياً. [ 19 ] وتشمل فئاتها الفرعية: المركبات العطرية ، والماكرولاكتونات/ الماكروليدات ، والمركبات التي تحتوي على حلقة ديكالين ، والبولي إيثر ، والبوليينات . [ 15 ]

تنقسم إنزيمات بولي كيتيد سينثاز بشكل عام إلى ثلاث فئات: النوع الأول (إنزيمات ضخمة متعددة الوحدات غير متكررة، تنتج غالبًا الماكروليدات والإيثرات المتعددة والبوليينات)، والنوع الثاني (إنزيمات منفصلة ذات عمل متكرر، تنتج غالبًا المركبات العطرية)، والنوع الثالث ( شبيهة بإنزيمات سينثاز الكالكون ، تنتج جزيئات عطرية صغيرة). [ 20 ]

إضافةً إلى هذه الفئات الفرعية، توجد أيضًا عديدات الكيتيد المهجنة مع الببتيدات غير الريبوزومية (الهجينة NRP-PK وPK-NRP). ولأن خطوط تجميع الببتيدات غير الريبوزومية تستخدم بروتينات حاملة مشابهة لتلك المستخدمة في مُركِّبات عديدات الكيتيد، فقد تطور تقارب النظامين لتكوين هجائن، مما أدى إلى عديدات ببتيد تحتوي على النيتروجين في هيكلها الأساسي ومجموعات وظيفية معقدة مشابهة لتلك الموجودة في الأحماض الأمينية. [ 21 ]

التطبيقات

تُستخدم المضادات الحيوية متعددة الكيتيدات ، [ 22 ] ومضادات الفطريات ، [ 23 ] ومثبطات نمو الخلايا ، [ 24 ] ومضادات الكوليسترول ، [ 25 ] ومضادات الطفيليات ، [ 23 ] ومضادات الكوكسيديا ، ومحفزات نمو الحيوانات والمبيدات الحشرية الطبيعية [ 26 ] تجاريًا.

طبي

يوجد أكثر من 10,000 نوع معروف من البوليكيتيدات، 1% منها فقط معروفة بإمكانية استخدامها كأدوية. [ 27 ] تشكل البوليكيتيدات 20% من الأدوية الأكثر مبيعًا، بإيرادات عالمية إجمالية تتجاوز 18 مليار دولار أمريكي سنويًا. [ 28 ]

البوليكيتيدات
جيلداناميسين ، وهو مضاد حيوي.دوكسيسايكلين ، وهو مضاد حيوي.الإريثروميسين ، وهو مضاد حيوي.الأفلاتوكسين ب1 مركب مسرطن معروف .

أمثلة

الزراعة

يمكن استخدام البوليكيتيدات لحماية المحاصيل كمبيدات حشرية . [ 32 ]

أمثلة

صناعي

يمكن استخدام البوليكيتيدات لأغراض صناعية، مثل التصبغ [ 33 ] والفلافونويدات الغذائية. [ 34 ]

أمثلة

التكنولوجيا الحيوية

فتحت هندسة البروتين آفاقًا جديدة لإنتاج متعددات الكيتيد غير الموجودة في الطبيعة. فعلى سبيل المثال، تسمح الطبيعة التركيبية لمركبات متعددات الكيتيد باستبدال أو إضافة أو حذف نطاقاتها. كما أن إدخال التنوع في خطوط التجميع يُمكّن من اكتشاف متعددات كيتيد جديدة ذات فعالية بيولوجية مُحسّنة أو ذات فعالية بيولوجية جديدة. [ 21 ]

علاوة على ذلك، يسمح استخدام التنقيب الجينومي باكتشاف البوليكيتيدات الطبيعية الجديدة وخطوط تجميعها. [ 9 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC موسوعة المصطلحات الكيميائية ، الطبعة الخامسة (الكتاب الذهبي) (2025). النسخة الإلكترونية: (2006 ) " البوليكيتيدات ". doi : 10.1351/goldbook.P04734
  2. كولي ن، مايرز دبليو إس (1893). "السابع - تكوين الأورسينول ونواتج التكثيف الأخرى من حمض ديهيدراسيتيك" . مجلة الجمعية الكيميائية، المعاملات . 63 : 122-128 . doi : 10.1039/CT8936300122 . ISSN 0368-1645 . 
  3. كولي جيه إن (1907). "CLXXI.—مشتقات مجموعة الكيتين المتعددة" . مجلة الجمعية الكيميائية، المعاملات . 91 : 1806-1813 . doi : 10.1039/CT9079101806 . ISSN 0368-1645 . 
  4. 1 2 3 سميث إس، تساي إس سي (أكتوبر 2007). "إنزيمات تخليق الأحماض الدهنية والبوليكيتيدات من النوع الأول: قصة إنزيمين ضخمين" . تقارير المنتجات الطبيعية . 24 (5): 1041-1072 . doi : 10.1039/B603600G . PMC 2263081. PMID 17898897 .  
  5. بيرش إيه جيه، ماسي-ويستروب آر إيه، موي سي جيه (1955). "دراسات تتعلق بالتخليق الحيوي. السابع. حمض 2-هيدروكسي-6-ميثيل بنزويك في فطر البنسيليوم غريزوفولفوم ديركس" . المجلة الأسترالية للكيمياء . 8 (4): 539-544 . doi : 10.1071/ch9550539 . ISSN 1445-0038 . 
  6. لين إيه إل، مور بي إس (فبراير 2011). "بحر من التخليق الحيوي: المنتجات الطبيعية البحرية تلتقي بالعصر الجزيئي" . تقارير المنتجات الطبيعية . 28 (2): 411-428 . doi : 10.1039/C0NP90032J . PMC 3101795. PMID 21170424 .  
  7. جونستون سي، إبراهيم أ، ماغارفي ن (2012-08-01). "استراتيجيات معلوماتية لاكتشاف البوليكيتيدات والببتيدات غير الريبوزومية". MedChemComm . 3 (8): 932–937 . doi : 10.1039/C2MD20120H . ISSN 2040-2511 . 
  8. فايفر، ب. أ.، وخوسلا ، س. (مارس 2001). "التخليق الحيوي للبوليكيتيدات في مضيفات غير متجانسة" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 65 (1): 106-118 . doi : 10.1128/MMBR.65.1.106-118.2001 . PMC 99020. PMID 11238987 .  
  9. 1 2 غوميز إي إس، شوخ في، دي ماسيدو ليموس إي جي (ديسمبر 2013). "التكنولوجيا الحيوية للبوليكيتيدات: نفحة جديدة لاكتشاف المسارات الجينية للمضادات الحيوية الجديدة من خلال علم الجينوم البيئي" . المجلة البرازيلية لعلم الأحياء الدقيقة . 44 (4): 1007-1034 . doi : 10.1590/s1517-83822013000400002 . PMC 3958165. PMID 24688489 .  
  10. 1 2 فويت د ، فويت جي جي ، برات سي دبليو (2013). أساسيات الكيمياء الحيوية: الحياة على المستوى الجزيئي ( الطبعة الرابعة). جون وايلي وأولاده . ص 688. ISBN   978-0-470-54784-7.
  11. ستونتون ج، ويسمان كيه جيه (أغسطس 2001). "تخليق البوليكيتيد: مراجعة للألفية". تقارير المنتجات الطبيعية . 18 (4): 380-416 . doi : 10.1039/a909079g . PMID 11548049 . 
  12. مور، بي إس، وهيرتويك، سي (فبراير 2002). "التخليق الحيوي وربط وحدات بدء جديدة من إنزيم بولي كيتيد سينثاز البكتيري". تقارير المنتجات الطبيعية . 19 (1): 70-99 . doi : 10.1039/B003939J . PMID 11902441 . 
  13. وانغ جيه، تشانغ آر، تشين إكس، وآخرون (مايو 2020). "التخليق الحيوي للبوليكيتيدات العطرية في الكائنات الدقيقة باستخدام إنزيمات بوليكيتيد سينثاز من النوع الثاني" . مصانع الخلايا الميكروبية . 19 (1) 110. doi : 10.1186/s12934-020-01367-4 . PMC 7247197. PMID 32448179 .   
  14. موريتو إل، هيلين آر، هولرويد إن، وآخرون (فبراير 2019). "تشترك نطاقات بروتين حامل الأسيل في سينثاز البوليكيتيد من النوع الأول في طي مشترك ممتد من الطرف الأميني" . التقارير العلمية . 9 (1) 2325. Bibcode : 2019NatSR...9.2325M . doi : 10.1038/s41598-019-38747-9 . PMC 6382882. PMID 30787330 .   
  15. 1 2 والش سي، تانغ واي (2017). التخليق الحيوي للمنتجات الطبيعية . الجمعية الملكية للكيمياء. ISBN 978-1-78801-131-0. OCLC 985609285 . 
  16. ريسديان سي، موزيف تي، وينك جيه (مايو 2019). " التخليق الحيوي للبوليكيتيدات في ستربتوميسيس " . الكائنات الدقيقة . 7 (5): 124. doi : 10.3390/microorganisms7050124 . PMC 6560455. PMID 31064143 .  
  17. روبنسون، ج. أ. (مايو 1991). "معقدات بوليكيتيد سينثاز: بنيتها ووظيفتها في التخليق الحيوي للمضادات الحيوية". المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية في لندن. السلسلة ب، العلوم البيولوجية . 332 (1263): 107-114 . Bibcode : 1991RSPTB.332..107R . doi : 10.1098/rstb.1991.0038 . PMID 1678529 . 
  18. نوار، ر. د.، وداوب ، م. إ. (2016-07-07). "التنبؤ المعلوماتي الحيوي بمجموعات جينات بوليكيتيد سينثاز من ميكوسفيريلا فيجينسيس" . PLOS ONE . 11 (7) e0158471. Bibcode : 2016PLoSO..1158471N . doi : 10.1371/journal.pone.0158471 . PMC 4936691. PMID 27388157 .  
  19. كاتز ل (نوفمبر 1997). "التلاعب بإنزيمات بولي كيتيد سينثاز المعيارية". مراجعات كيميائية . 97 (7): 2557-2576 . doi : 10.1021/cr960025+ . PMID 11851471 . 
  20. شين ب (أبريل 2003). "تخليق البوليكيتيدات خارج نطاق نماذج إنزيمات البوليكيتيد سينثاز من النوع الأول والثاني والثالث". الرأي الحالي في البيولوجيا الكيميائية . 7 (2): 285-295 . doi : 10.1016/S1367-5931(03)00020-6 . PMID 12714063 . 
  21. 1 2 نيفينا أ، يويت كيه بي، هسو جيه، خوسلا سي (ديسمبر 2019). "تطور وتنوع إنزيمات بولي كيتيد سينثاز في خطوط التجميع" . مراجعات كيميائية . 119 (24): 12524-12547 . doi : 10.1021/acs.chemrev.9b00525 . PMC 6935866. PMID 31838842 .  
  22. "5.13E: المضادات الحيوية متعددة الكيتيدات" . نصوص بيولوجية ليبر . 2017-05-09 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2021-07-05 .
  23. روس سي ، أوبل في، شيرلاخ ك، هيرتويك سي (ديسمبر 2014). "التخليق الحيوي للبوليكيتيدات المضادة للفطريات والبكتيريا بواسطة بكتيريا بوركولدرية جلاديولي في مزرعة مشتركة مع فطر ريزوبوس ميكروسبوروس" . الفطريات . 57 (ملحق 3): 48-55 . doi : 10.1111/myc.12246 . PMID 25250879 . 
  24. جيانغ إل، بو إتش، شيانغ جيه، وآخرون (2018). "هوانغ لونغ مايسين إيه سي، بولي كيتيدات سامة للخلايا يتم تصنيعها حيويًا بواسطة سينثاز بولي كيتيد من النوع الثاني المفترض من ستربتوميسيس sp . CB09001" . فرونتيرز إن كيمستري . 6 254. Bibcode : 2018FrCh....6..254J . doi : 10.3389/fchem.2018.00254 . PMC 6036704. PMID 30013965 .   
  25. تشان واي إيه، بوديفيلز إيه إم، كيفاني بي إم، توماس إم جي (يناير 2009). "التخليق الحيوي لوحدات تمديد بولي كيتيد سينثاز" . تقارير المنتجات الطبيعية . 26 (1): 90-114 . doi : 10.1039/b801658p . PMC 2766543. PMID 19374124 .  
  26. كيم إتش جيه، تشوي إس إتش، جيون بي إس، وآخرون . (ديسمبر 2014). "التخليق الكيميائي الإنزيمي للسبينوسين أ" . Angewandte Chemie . 53 (49): 13553–13557 . Bibcode : 2014ACIE...5313553K . doi : 10.1002/anie.201407806 . PMC 4266379. PMID 25287333 .   
  27. بايرسون إس آر، ريماندو إيه إم (11 يناير 2007). "مجموعة كبيرة من البوليكيتيدات: التراكيب، والأنشطة البيولوجية، والإنزيمات". في: ريماندو إيه إم، بايرسون إس آر (محرران). البوليكيتيدات: التخليق الحيوي، والنشاط البيولوجي، والهندسة الوراثية . سلسلة ندوات الجمعية الكيميائية الأمريكية. المجلد 955. واشنطن العاصمة: الجمعية الكيميائية الأمريكية. الصفحات 2-14 . doi : 10.1021/bk-2007-0955.ch001 . ISBN   978-0-8412-3978-4.
  28. وايزمان ك، ليدلي ب (2005). " التخليق الحيوي التوافقي للبوليكيتيدات المختزلة". مجلة نيتشر ريفيوز مايكروبيولوجي . 3 (12): 925-936 . doi : 10.1038/nrmicro1287 . PMID 16322741. S2CID 205496204 .  
  29. ^ بروكمان، هانز. هنكل ، ويلفريد (1950/01/01). "بيكرومايسين، مضاد حيوي جديد من الأكتينوميسيتين" . Naturwissenschaften (في المانيا). 37 (6): 138– 139. بيب كود : 1950NW .....37..138B . دوى : 10.1007/BF00638597 . ISSN 1432-1904 . 
  30. ^ بروكمان إتش، هنكل دبليو (1951). "بيكرومايسين، مضاد حيوي مرير من الأكتينوميسيتين" [ بيكرومايسين، مضاد حيوي مرير المذاق من فطريات شعوية ] . الكيمياء. بير. (باللغة الألمانية). 84 (3): 284-288 . دوى : 10.1002/cber.19510840306 .
  31. غاني إس جيه، ستاوت جيه إم، ليو إي، وآخرون (يوليو 2012). "تحديد إنزيم سيكلاز حمض الأوليفيتوليك من نبات القنب يكشف عن مسار تحفيزي فريد لإنتاج متعددات الكيتيد النباتية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 109 (31): 12811-12816 . Bibcode : 2012PNAS..10912811G . doi : 10.1073/pnas.1200330109 . PMC 3411943. PMID 22802619 .   
  32. لي إس، يانغ بي، تان جي واي، وآخرون . (يونيو 2021). "مبيدات حشرية متعددة الكيتيدات من الأكتينوميسيتات". الرأي الحالي في التكنولوجيا الحيوية . التكنولوجيا الحيوية الكيميائية ● التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية. 69 : 299-307 . doi : 10.1016/j.copbio.2021.05.006 . PMID 34102376. S2CID 235378697 .   
  33. كارو واي، فينكاتشالام إم، لوبو جيه، وآخرون (2016). "الأصباغ والملونات من الفطريات الخيطية". في ميريلون جيه إم، راماوات كيه جي (محرران). مستقلبات الفطريات . سلسلة المراجع في الكيمياء النباتية. تشام: سبرينغر للنشر الدولي. ص 1-70 . doi : 10.1007/978-3-319-19456-1_26-1 . ISBN   978-3-319-19456-1.
  34. تاوشين ج، هامل ل، ريمبيلوفا س، جوراسيك م (أغسطس 2020). "الفلافونويدات وأفراد مجموعة البوليكيتيدات العطرية ذات الصلة في صحة الإنسان وأمراضه: هل هي فعالة حقًا؟" . مجلة Molecules . 25 (17): 3846. doi : 10.3390/molecules25173846 . PMC 7504053. PMID 32847100 .