قاعدة بيانات تصنيف وسائل النقل

قاعدة بيانات تصنيف النواقل ( TCDB ) هي نظام تصنيف معتمد من الاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية (IUBMB) لبروتينات النقل الغشائية ، بما في ذلك قنوات الأيونات . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]

تصنيف

أعلى مستوى للتصنيف وبعض الأمثلة على البروتينات ذات البنية ثلاثية الأبعاد المعروفة:

1. القنوات والمسام

1. قنوات من النوع ألفا

1.ب. بروتينات البورين ذات البرميل بيتا وبروتينات الغشاء الخارجي الأخرى

1.ج السموم المكونة للمسام (البروتينات والببتيدات)

1.D قنوات غير مصنعة بواسطة الريبوسوم

  • 1.د.1 عائلة قنوات غراميسيدين أ
  • 1.د.2 عائلة السيرينغوميسين المُشكِّلة للقنوات
  • 1.د.3 عائلة السيرينجوببتين المُشكِّلة للقنوات
  • 1.د.4 عائلة قنوات تولاسين
  • 1.د.5 عائلة المضادات الحيوية المُشكِّلة للقنوات من نوع ألاميثيسين أو بيبتايبول
  • 1.د.6 عائلة قنوات الكالسيوم المعقدة متعددة 3-هيدروكسي بوتيرات ( cPHB-CC)
  • 1.د.7 عائلة بيتيكولين
  • 1.د.8 عائلة الصابونين
  • 1.د.9 عائلة قنوات أيونات البولي جلوتامين (PG-IC)
  • 1.د.10 عائلة قنوات تكوين السيراميد
  • 1.د.11 عائلة السورفاكتين
  • 1.د.12 عائلة بيوفيريسين (Beauvericin)
  • 1.D.13 المضادات الحيوية الببتيدية الأمفيباثية لتوصيل الحمض النووي (DAPA)
  • 1.د.14 عائلة الببتيدات الاصطناعية المكونة للقنوات الأمفيباثية من نوع ليو/سير (l/S-SCP)
  • 1.د.15 عائلة دابتوميسين (دابتوميسين)
  • 1.د.16 عائلة الببتيدات السباعية المُكوِّنة للمسام ذات الطبيعة الأمفيباثية الاصطناعية (SAPH)
  • 1.D.17 عائلة الببتيدات المصممة تركيبياً، والمكونة للمسام، ذات بنية بيتا شيت
  • 1.د.18 عائلة مركبات غوانوزين-حمض الصفراء المُشكِّلة للمسام
  • 1.D.19 دواء مُشكِّل لقنوات الكالسيوم (Ca2 +) ، من عائلة الديجيتوكسين
  • 1.D.20 عائلة المضادات الحيوية/الفطرية من نوع البوليين ماكروليد المُشكِّلة للمسام (PMAA)
  • 1.D.21 عائلة المسام النانوية الدهنية (LipNP)
  • 1.د.22 صبغة الكاروتينويد الناقلة للبروتونات، عائلة الزياكسانثين
  • 1.D.23 عائلة مضادات الميكروبات المكونة للمسام من فينيلين إيثينيلين (PEPA)
  • 1.د.24 عائلة بوليثيوناميد ب (pTB) في الإسفنج البحري
  • 1.D.25 عائلة مطويات الأريلامين (AAF)
  • 1.د.26 عائلة كحول ثنائي هيدرو ديهيدروديكونيفيريل 9'-O-β-D-جلوكوزيد (DDDC9G)
  • 1.د.27 عائلة ثيوريا إيزوستيريس
  • 1.د.28 عائلة الليبوببتيد
  • 1.د.29 عائلة الأوليغوكولات الحلقية الكبيرة
  • 1.د.30 عائلة قنوات الهيدرازيد الاصطناعية الملحقة بالبيلار[5]أرين (HAPA-C)
  • 1.د.31 عائلة الأمفوتريسين ب
  • 1.د.32 عائلة نوفيسيدين المُشكِّلة للمسام
  • 1.د.33 عائلة بوليثيوناميد ب المُشكِّلة للقنوات
  • 1.د.34 جزيئات البولامفيبيل قليلة الإستر المُشكِّلة للقنوات
  • 1.د.35 عائلة الببتيدات الدهنية الحلقية المُشكِّلة للمسام
  • 1.د.36 عائلة قنوات أيون الأوليغوبورنين
  • 1.د.37 عائلة هيبكوسلايد سي
  • 1.د.38 عائلة الأنابيب النانوية الببتيدية الحلقية (cPepNT)
  • 1.د.39 عائلة قنوات الأيونات الجزيئية الأمفيبية القائمة على الأزوبنزين والمتحكم بها بالضوء (AAM-IC)
  • 1.D.40 عائلة المسام الحلقية الدهنية المحفزة بالبروتين
  • 1.د.41 عائلة الأيونوفور من نوع سبيروهكسانوليد (Sprotetonate-type Ionophore)
  • 1.D.42 عائلة قنوات فينيل ألانين-أرجينين ثلاثية الببتيد-بيلار[5]أرين (TPPA-C)
  • 1.د.43 عائلة قنوات ثنائي نيوكليوزيد الغوانوزين المصممة بالتريازول (TT-GDN-C)
  • 1.د.44 عائلة قنوات الأيونات الاصطناعية مع الفيروسين النشط للأكسدة والاختزال (ICRF)
  • 1.د.45 عائلة مسام الغشاء بتقنية التثقيب الصوتي والتثقيب الكهربائي (SEMP)
  • 1.د.46 عائلة المسام النانوية للحمض النووي (DnaNP)
  • 1.د.47 عائلة الببتيدات الحلقية الاصطناعية المُشكِّلة للمسام (PSCP)
  • 1.د.48 عائلة السيرينغوميسين إي المُشكِّلة للمسام
  • 1.د.49 عائلة قنوات الكاروتينويد الجذرية عبر الغشاء (CRC)
  • 1.D.50 عائلة ناقلات الأنيونات ثنائية الكاتيكول المحبة للماء والدهون (AC-AT)
  • 1.D.51 عائلة المسام النانوية البروتينية (ProNP)
  • 1.D.52 عائلة المسام النانوية ذات الحلقة الكبيرة من الأوليغواميد العطري (OmnNP)
  • 1.D.53 عائلة أنابيب الببتيد النانوية ألفا، غاما (α,γPepNT)
  • 1.D.54 عائلة قنوات أيونات هيكسيل-بنزويريد-15-كراون-5-إيثر الانتقائية للبوتاسيوم (HBEC)
  • 1.D.55 عائلة المسام النانوية القائمة على البورفيرين (PorNP)
  • 1.D.56 عائلة المسام النانوية قليلة الوحدات ألفا-أمينوأيزوبيوتيرات (AibNP)
  • 1.D.57 عائلة المسام الكهربائية الدهنية (LEP)
  • 1.D.58 عائلة البروديجوزين (البروديجوسين) الناقلة للأنيونات
  • 1.D.59 عائلة بروتينات البيرينوسين الناقلة للأنيونات (بيرينوسين)
  • 1.D.60 عائلة الببتيد الحلقي ألفا، جاما (AGCP)
  • 1.د.61 عائلة 2،6-ثنائي(بنزيميدازول-2-يل)بيريدين (ABBP) الأنيونوفورية
  • 1.D.62 عائلة مشتقات ثنائي غوانوزين ثنائي التريازوليل المُشكِّلة للقنوات (TDG)
  • 1.D.63 عائلة المسام النانوية القائمة على الببتيد (PepNP)
  • 1.د.64 عائلة أنابيب الكربون النانوية (CarNT)
  • 1.D.65 عائلة الأمفيدينول (Amphidinol) المُكوِّنة للمسام
  • 1.D.66 عائلة المسام النانوية الجزيئية الكبيرة الحلزونية (HmmNP)
  • 1.D.67 عائلة قنوات أيونات الببتيد الحلزونية المعدلة بإيثر التاج (CEHP)
  • 1.D.68 عائلة بوليمرات الكتل البليورونية المُشكِّلة للمسام (PPBP)
  • 1.D.69 عائلة المسام النانوية المخروطية (ConNP)
  • 1.D.70 عائلة المسام النانوية المعدنية (الذهب/الفضة/البلاتين/الجرافين) (MetNP)
  • 1.D.71 عائلة الببتيد الاصطناعي TP359 (TP359)
  • 1.D.72 عائلة مستقبلات ثلاثي الأرجل القائمة على التريازين لناقل الكلوريد (CCTTR)
  • 1.D.73 عائلة المسام النانوية من السيليكا المسامية (SilNP)
  • 1.D.74 عائلة المسام الصلبة الاصطناعية المستجيبة للمؤثرات الخارجية من نوع p-Octiphenyl (SSROP)

1. إي هولينز

  • 1.F.1 عائلة مسام اندماج الحويصلات المشبكية (SVF-Pore)
  • 1.F.2 عائلة الإكسوسيت الثماني (الإكسوسيت)
  • 1.G.1 عائلة بروتين اندماج الغشاء الفيروسي المُشكِّل للمسام-1 (VMFP1)
  • 1.G.2 عائلة بروتين اندماج الغشاء الفيروسي المُشكِّل للمسام-2 (VMFP2)
  • 1.G.3 عائلة بروتين اندماج الغشاء الفيروسي المُشكِّل للمسام-3 (VMFP3)
  • 1.G.4 عائلة بروتين اندماج الغشاء الفيروسي المُشكِّل للمسام-4 (VMFP4)
  • 1.G.5 عائلة بروتين اندماج الغشاء الفيروسي المُشكِّل للمسام-5 (VMFP5)
  • 1.G.6 عائلة بروتين الاندماج S لفيروس التهاب الكبد B (بروتين HBV-S)
  • 1.G.7 عائلة بروتين الاندماج السريع لفيروس الريو (R-FAST)
  • 1.G.8 عائلة بروتين اندماج فيروسات أرينا (AV-FP)
  • 1.G.9 عائلة السينسيتين (Syncytin)
  • 1.G.10 عائلة معقد اندماج غشاء فيروس الهربس البسيط (HSV-MFC)
  • 1. عائلة معقد بروتين دخول الخلية لفيروس الجدري G.11 (PEP-C)
  • 1.G.12 عائلة بروتين الاندماج gp95 لفيروس ابيضاض الدم الطيري (ALV-gp95)
  • 1.G.13 عائلة البروتينات الغشائية الصغيرة المرتبطة بالاندماج لفيروسات أورثوريو (FAST)
  • 1.G.14 عائلة بروتين الهيماغلوتينين/بروتين تكوين مسام الاندماج لفيروس الإنفلونزا (Influza-H/FPP)
  • 1.G.15 عائلة البروتين السكري الرئيسي للغلاف GP64 (GP64) لفيروس التحلل النووي متعدد الأوجه Autographa californica
  • 1.G.16 عائلة ببتيد الاندماج لفيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1 (HIV-1) (HIV-FP)
  • 1.G.17 عائلة بروتين الغلاف السكري لفيروس ابيضاض الدم البقري (BLV-Env)
  • 1.G.18 ببتيد اندماج فيروس سارس-كوف في عائلة بروتين سبايك جليكوبروتين السلفي (SARS-FP)
  • 1.G.19 عائلة معقد اندماج الغشاء المُشكِّل للمسام لفيروس الروتا (Rotavirus MFC)
  • 1.G.20 عائلة بروتين اندماج غلاف فيروس هانتا (Gc-EFG)
  • 1.G.21 عائلة فيروس إبشتاين بار (فيروس الهربس البشري 4) Gp42 (Gp42)
  • 1.G.22 عائلة البروتين السكري gO (gO) لفيروس مضخم الخلايا (فيروس الهربس البشري 5)

2. ناقلات مدفوعة بالجهد الكهروكيميائي

  • 2.أ.1 عائلة البروتينات الناقلة الرئيسية (MFS)، انظر أيضًا: بروتين نفاذية اللاكتوز ، وبروتين نفاذية الفوسفات ، وناقل الجلوكوز
  • 2.أ.2 عائلة ناقلات الكاتيونات المشتركة من نوع جليكوسيد-بنتوسيد-هيكسورونيد (GPH):
  • 2.أ.3 عائلة الأحماض الأمينية-بولي أمين-أورجانوكايون (APC)
  • 2.أ.4 عائلة مُسهِّلات انتشار الكاتيونات (CDF)
  • 2.أ.5 عائلة بروتينات نفاذية الزنك (Zn 2+ ) والحديد (Fe 2+ )
  • 2.أ.6 عائلة البروتينات المقاومة-العقدية-انقسام الخلايا ، انظر أيضًا بروتين SecDF - بروتين غشائي تصديري
  • 2.أ.7 عائلة ناقلات الأدوية/المستقلبات (DMT)
  • 2.أ.8 عائلة ناقلات الغلوكونات:H + المتزامنة (GntP)
  • 2.أ.9 عائلة إنزيمات إدخال البروتينات الغشائية (YidC/Alb3/Oxa1)
  • 2.أ.10 عائلة ناقلات 2-كيتو-3-ديوكسي جلوكونات (KdgT)
  • 2.أ.11 عائلة ناقلات السترات-Mg2 + :H + (CitM) وناقلات السترات-Ca2 + :H + (CitH) (CitMHS)
  • 2.أ.12 عائلة ناقلات ATP:ADP المضادة
  • 2.أ.13 عائلة امتصاص ثنائي الكربوكسيلات C4 (Dcu)
  • 2.أ.14 عائلة نفاذية اللاكتات
  • 2.أ.15 عائلة ناقلات البيتين/الكارنيتين/الكولين (BCCT)
  • 2.أ.16 ​​عائلة ناقلات مقاومة التيلوريت/ثنائي الكربوكسيلات
  • 2.أ.17 عائلة ناقلات الببتيدات قليلة الوحدات المعتمدة على البروتون
  • 2.أ.18 عائلة إنزيمات نقل الأحماض الأمينية/الأوكسين (AAAP)
  • 2.أ.19 عائلة ناقلات الكالسيوم : كاتيونات المضادة (CaCA)
  • 2.أ.20 عائلة ناقلات الفوسفات غير العضوية (PiT)
  • 2.أ.21 المذاب: عائلة ناقلات الصوديوم المتزامنة
  • 2.أ.22 عائلة ناقلات الصوديوم والناقلات العصبية
  • 2.أ.23 عائلة ناقلات ثنائي الكربوكسيلات/الأحماض الأمينية:كاتيون (Na + أو H + ) (DAACS)
  • 2.أ.24 عائلة ناقلات 2-هيدروكسي كاربوكسيلات (2-HCT)
  • 2.أ.25 عائلة ناقلات الأيونات الموجبة للألانين أو الجليسين (AGCS)
  • 2.أ.26 عائلة ناقلات الأحماض الأمينية المتفرعة السلسلة: الكاتيونات (LIVCS)
  • 2.أ.27 عائلة ناقلات الغلوتامات:الصوديوم المتزامنة (ESS)
  • 2.A.28 حمض الصفراء: Na + عائلة Symporter
  • 2.أ.29 عائلة حاملة الميتوكوندريا
  • 2.أ.30 عائلة ناقلات الكاتيونات والكلوريد المشتركة (CCC)
  • 2.أ.31 عائلة مبادلات الأنيونات
  • 2.أ.32 عائلة ناقلات السيليكون (Sit)
  • 2.A.33 عائلة NhaA Na + :H + Antiporter (NhaA).
  • 2.أ.34 عائلة ناقلات الصوديوم والهيدروجين المضادة (NhaB)
  • 2.أ.35 عائلة ناقلات الصوديوم والهيدروجين المضادة (NhaC)
  • 2.أ.36 عائلة ناقل أحادي التكافؤ: بروتون مضاد-1 (CPA1)
  • 2.أ.37 عائلة ناقل أحادي التكافؤ: بروتون مضاد-2 (CPA2)
  • 2.A.38 K + عائلة ناقل (Trk)
  • 2.أ.39 عائلة ناقلات القاعدة النيتروجينية: الكاتيونات المتزامنة-1 (NCS1)
  • 2.أ.40 عائلة ناقلات القاعدة النيتروجينية: الكاتيونات المتزامنة-2 (NCS2)
  • 2.أ.41 عائلة ناقلات النيوكليوزيد المركزة (CNT)
  • 2.أ.42 عائلة بروتينات نقل الأحماض الأمينية الهيدروكسية/العطرية (HAAAP)
  • 2.أ.43 عائلة ناقلات السيستين الليزوزومية (LCT)
  • 2.أ.45 عائلة تدفق الزرنيخ والأنتيمونيت
  • 2.أ.46 عائلة ناقلات البنزوات:H + المتزامنة (BenE)
  • 2.A.47 أنيون ثنائي التكافؤ: عائلة Na + Symporter (DASS).
  • 2.أ.48 عائلة ناقلات الفولات المختزلة (RFC)
  • 2.أ.49 عائلة ناقلات/قنوات الكلوريد (ClC)
  • 2.أ.50 عائلة امتصاص الجلسرين (GUP)
  • 2.أ.51 عائلة ناقلات أيونات الكرومات (CHR)
  • 2.أ.52 عائلة ناقلات Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT)
  • 2.أ.53 عائلة بروتينات نقل الكبريتات (SulP)
  • 2.أ.54 عائلة ناقلات ثلاثي الكربوكسيلات الميتوكوندريا (MTC)
  • 2.أ.55 عائلة ناقلات أيونات المعادن (Mn 2+ - حديد) (Nramp)
  • 2.أ.56 عائلة ناقلات الفراغ المحيطي الثلاثية المستقلة عن الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (TRAP-T)
  • 2.أ.57 عائلة ناقلات النيوكليوزيد المتوازنة (ENT)
  • 2.أ.58 عائلة ناقلات الفوسفات والصوديوم المتزامنة (PNaS)
  • 2.أ.59 عائلة مقاومة الزرنيخ-3 (ACR3)
  • 2.أ.60 عائلة ناقلات الأنيونات العضوية (OAT)
  • 2.أ.61 عائلة امتصاص ثنائي الكربوكسيلات C4 (DcuC)
  • 2.A.62 عائلة NhaD Na + :H + Antiporter (NhaD).
  • 2.أ.63 عائلة ناقل البروتون المضاد أحادي التكافؤ (K + أو Na + )-3 (CPA3)
  • 2.أ.64 عائلة استهداف الأرجينين المزدوج (Tat)
  • 2.أ.65 عائلة ناقلات البيليروبين (BRT)
  • 2.أ.66 عائلة إنزيمات فليباز متعددة الأدوية/قليلة السكريات-الدهون/عديدة السكريات (MOP)
  • 2.أ.67 عائلة ناقلات الببتيدات قليلة الوحدات (OPT)
  • 2.أ.68 عائلة ناقلات بارا-أمينوبنزويل-غلوتامات (AbgT)
  • 2.أ.69 عائلة ناقلات تدفق الأوكسين (AEC)
  • 2.أ.70 عائلة ناقلات المالونات: الصوديوم (MSS)
  • 2.أ.71 عائلة ناقلات الفولات-بيوبترين (FBT)
  • 2.أ.72 عائلة بروتينات امتصاص البوتاسيوم ( KUP)
  • 2.أ.73 عائلة امتصاص الأحماض الدهنية قصيرة السلسلة (AtoE)
  • 2.أ.74 عائلة ناقلات الأدوية المتعددة ذات 4 نطاقات عبر الغشاء (MET)
  • 2.أ.75 عائلة مُصدِّر الليسين (LysE)
  • 2.أ.76 عائلة مقاومة الهوموسيرين/الثريونين (RhtB)
  • 2.أ.77 عائلة مقاومة الكادميوم (CadD)
  • 2.أ.78 عائلة مُصدِّر الأحماض الأمينية المتفرعة السلسلة (LIV-E)
  • 2.أ.79 عائلة مُصدِّر الثريونين/السيرين (ThrE)
  • 2.أ.80 عائلة ناقلات ثلاثي الكربوكسيلات (TTT)
  • 2.أ.81 عائلة مبادل الأسبارتات:ألانين (AAEx)
  • 2.أ.82 عائلة ناقلات المذاب العضوي (OST)
  • 2.أ.83 عائلة ناقلات البيكربونات المعتمدة على الصوديوم ( SBT)
  • 2.أ.84 عائلة مُصدِّر المالتوز في البلاستيدات الخضراء (MEX)
  • 2.أ.85 عائلة مُصدِّرات الأحماض العطرية (ArAE)
  • 2.A.86 عائلة مُصدِّر المُحفِّز التلقائي-2 (AI-2E) (سابقًا عائلة PerM، TC #9.B.22)
  • 2.أ.87 عائلة ناقلات الريبوفلافين بدائية النواة (P-RFT)
  • 2.A.88 عائلة ناقلات امتصاص الفيتامينات (VUT أو ECF)
  • 2.أ.89 عائلة ناقلات الحديد الفجوية (VIT)
  • 2.A.90 عائلة مستقبلات/ناقلات فيتامين أ ( STRA6 )
  • 2.A.91 مركب استيراد الحمض النووي الريبوزي الناقل للميتوكوندريا (M-RIC) (سابقًا 9.C.8)
  • 2.أ.92 عائلة ناقلات الكولين الشبيهة (CTL)
  • 2.أ.94 عائلة بروتين نفاذية الفوسفات (Pho1)
  • 2.أ.95 عائلة ناقلات الأحماض الأمينية المحايدة ذات 6 أجزاء عبر الغشاء (NAAT)
  • 2.أ.96 عائلة ناقلات امتصاص الأسيتات (AceTr)
  • 2.أ.97 عائلة مبادل البوتاسيوم /الهيدروجين والكالسيوم / الهيدروجين في الغشاء الداخلي للميتوكوندريا (LetM1)
  • 2.أ.98 عائلة مُصدِّر الكبريتات المفترض (PSE)
  • 2.أ.99 عائلة ناقلات امتصاص أيونات النيكل 2+ ذات 6 نطاقات عبر الغشاء (HupE-UreJ)
  • 2.أ.100 عائلة الفيروبورتين (Fpn)
  • 2.أ.101 عائلة امتصاص المالونات (MatC) (سابقًا UIT1)
  • 2.أ.102 عائلة بروتين امتصاص سلفونات التولوين 4 (TSUP)
  • 2.أ.103 عائلة مُصدِّر سلائف المورين البكتيري (MPE)
  • 2.أ.104 عائلة مُصدِّر الألانين-L (AlaE)
  • 2.أ.105 عائلة ناقلات البيروفات الميتوكوندرية (MPC)
  • 2.أ.106 عائلة ناقل الكالسيوم 2+ :H + المضاد-2 (CaCA2)
  • 2.أ.107 عائلة مُصدِّرات المنغنيز الثنائي (MntP)
  • 2.أ.108 عائلة ناقلات الحديد/الرصاص (ILT)
  • 2.أ.109 عائلة مقاومة أيون التيلوريوم (TerC)
  • 2.أ.110 عائلة بروتينات الجينات المستجيبة للهيم (HRG)
  • 2.أ.111 عائلة ناقل الصوديوم /الهيدروجين المضاد- E (NhaE)
  • 2.أ.112 عائلة مستضدات فصيلة الدم KX (KXA)
  • 2.أ.113 عائلة ناقلات النيكل/الكوبالت (NicO)
  • 2.أ.114 عائلة ناقلات الببتيد المفترضة لنقص الكربون CstA (CstA)
  • 2.أ.115 عائلة مُصدِّر نوفوبيوسين (NbcE)
  • 2.أ.116 عائلة بروتينات معالجة الببتيدوغليكوليبيد (GAP)
  • 2.أ.117 عائلة مُصدِّر الكلورهيكسيدين (CHX)
  • 2.أ.118 عائلة ناقلات الأحماض الأمينية الأساسية (ArcD)
  • 2.أ.119 عائلة مُصدِّرات الزرنيخ العضوية (ArsP)
  • 2.أ.120 عائلة بروتينات نقل الأحماض الأمينية المفترضة (PAAP)
  • 2.أ.121 عائلة ناقلات الكبريتات (CysZ)
  • 2.أ.122 عائلة البروتينات المساعدة الشبيهة بالهولين LrgB/CidB (LrgB/CidB)
  • 2.أ.123 ذا سويت؛ حلقة PQ؛ لعاب؛ عائلة MtN3 (سويت)
  • 2.أ.124 عائلة مُصدِّر الليسين (LysO)
  • 2.أ.125 عائلة ناقلات الريبوفلافين حقيقية النواة (E-RFT)
  • 2.أ.126 عائلة مُصدِّر الأحماض الدهنية (FAX)
  • 2.أ.127 عائلة ناقلات الكارديوليبين المعوية (CLT)

2.ب. ناقلات غير ريبوسومية

  • 2.ب.1 عائلة ناقلات الفالينوميسين
  • 2.ب.2 عائلة مونينسين
  • 2.ب.3 عائلة النيجيريسين
  • 2.ب.4 عائلة المضادات الحيوية من عائلة الماكروتيتروليد (MA)
  • 2.ب.5 عائلة البولي إيثر الحلقي الكبير (MP)
  • 2.ب.6 عائلة الأيونوميسين
  • 2.ب.7 عائلة نقل الفوسفوليبيدات الببتيدية الحلزونية ألفا عبر الغشاء (TMP-PLT)
  • 2.ب.8 عائلة بافيلوميسين أ1 (بافيلوميسين)
  • 2.ب.9 عائلة الببتيدات المخترقة للخلايا (CPP) الوظيفية
  • 2.ب.10 عائلة ناقلات الببتيد الخلوي الاصطناعية
  • 2.ب.11 عائلة حاملات الأيونوفور من نوع الكالسيميسين أو A23187
  • 2.ب.12 عائلة سالينوميسين
  • 2.ب.13 عائلة ناقلات الأنيونات الحلقية الكبيرة رباعية البيرول (TPMC-AA)
  • 2.ب.14 عائلة لاسالوسيد أ أو إكس-537أ أيونوفور (لاسالوسيد)
  • 2.ب.15 عائلة حاملات الكلوريد ثلاثية الأرجل القائمة على ثلاثي الثيوريا (TTT-CC)
  • 2.ب.16 عائلة ناقلات الأنيونات المركبة المحتوية على رابطة هالوجينية (HCAC)
  • 2.ب.17 عائلة ناقلات البروتونات والكلوريدات المشتركة المشتقة من الإيزوفثالامين (IDC)
  • 2.ب.18 عائلة ناقلات البروتونات والكلوريدات المشتركة من مشتقات البيريدين-2،6-ديكاربوكسامين (PDCA)
  • 2.ب.19 عائلة مشتقات الكاليكس(4)بيرول (C4P)
  • 2.ب.20 عائلة مبادلات الكلوريد/البيكربونات من البروديجوزين (بروديجوسين)
  • 2.ب.21 عائلة ناقلات الأنيونات المشتقة من أورثو-فينيلين ديامين-بيس-يوريا (oPDA-U)
  • 2.ب.22 عائلة ناقلات الأنيونات الوظيفية بالإيميدازوليوم (IAT)
  • 2.ب.23 ناقل البروتون الاصطناعي المتجانس رباعي الوحدات عبر الغشاء Zn 2+ /Co 2+ ، عائلة الروكر (Rocker)
  • 2.ب.24 عائلة ناقلات الأنيونات 2،6-ثنائي(بنزيميدازول-2-يل)بيريدين (BBP-AC)
  • 2.ب.25 عائلة انقلاب الدهون بوساطة الببتيد (PLFF)
  • 2.ب.26 عائلة مركبات ثنائي (إيميدازوليل) الوظيفية ثنائية (كولويل) (BIBCC)
  • 2.ب.27 عائلة ناقلات أنيونات ثلاثي اليوريا
  • 2.ب.29 عائلة تامبجامين من القلويدات البحرية الأنيونية

2. ج. أجهزة تنشيط تعمل بتدرج الأيونات

  • 2.ج.1 عائلة بروتينات TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) المساعدة لتنشيط النقل النشط بوساطة مستقبلات الغشاء الخارجي (OMR)

3.أ. ناقلات مدفوعة بتحلل الرابطة PP

  • 3.أ.1 ناقلات ABC بما في ذلك ناقل امتصاص الموليبدات BtuCD، ومنظم التوصيل عبر الغشاء في التليف الكيسي ، وغيرها
  • 3.أ.2 عائلة إنزيمات ATPase من النوع F ، و V ، و A التي تنقل أيونات الهيدروجين أو الصوديوم
  • 3.أ.3 عائلة إنزيمات الأدينوزين ثلاثي الفوسفات من النوع P
  • 3.أ.4 عائلة تدفق الزرنيخ-الأنتيمونيت
  • 3.أ.5 مسار الإفراز العام (Sec) ناقل (ناقل البروتين الأولي SecY)
  • 3.أ.6 عائلة المسار الإفرازي من النوع الثالث (المتعلق بالضراوة) (IIISP)
  • 3.أ.7 عائلة المسار الإفرازي من النوع الرابع (نقل الحمض النووي والبروتين بالاقتران أو VirB) (IVSP)
  • 3.أ.8 عائلة ناقل البروتين الميتوكوندري (MPT)
  • 3.أ.9 عائلة ناقلات بروتين غلاف البلاستيدات الخضراء (CEPT أو Tic-Toc)
  • 3.أ.10 عائلة البيروفوسفاتاز الناقلة لأيونات الهيدروجين والصوديوم
  • 3.أ.11 عائلة ناقلات تحويل الحمض النووي المرتبطة بالكفاءة البكتيرية (DNA-T)
  • 3.أ.12 عائلة ناقل الحمض النووي الحاجزي (S-DNA-T)
  • 3.أ.13 عائلة مُصدِّرات العاثيات الخيطية (FPhE)
  • 3.أ.14 عائلة الفيمبريلين/مصدر البروتين (FPE)
  • 3.أ.15 عائلة بروتينات الغشاء الخارجي المفرزة للفرع الطرفي الرئيسي (MTB)
  • 3.أ.16 ​​عائلة ناقلة الشبكة الإندوبلازمية الرجعية (ER-RT)
  • 3.أ.17 عائلة عاثية T7 إنجيكتيسوم (T7 إنجيكتيسوم)
  • 3.أ.18 عائلة مُصدِّر mRNA النووي (mRNA-E)
  • 3.أ.19 عائلة معقد التعرف/الإدخال في التحفيز المغناطيسي عبر الجمجمة (TRC)
  • 3.أ.20 عائلة بروتينات استيراد البيروكسيسوم (PPI)
  • 3.أ.21 عائلة معقدات تكوين/إدخال البروتينات الغشائية المرتبطة بالذيل الطرفي الكربوكسيلي (TAMP-B)
  • 3.أ.22 عائلة مُركب تصدير الحمض النووي الريبوزي الرسول النووي (TREX) المرتبط بالنسخ TREX/TAP
  • 3.أ.23 عائلة مسار الإفراز التكافلي/الضراوة من النوع السادس (VISP)
  • 3.أ.24 عائلة نظام إفراز البروتين من النوع السابع أو ESX (T7SS)
  • 3.أ.25 عائلة الآلات الشبيهة بآلية ERAD الخاصة بالكائنات التكافلية (SELMA)
  • 3.أ.26 عائلة بروتينات ناقلة البلازموديوم المصدرة (PTEX)

3.ب. ناقلات مدفوعة بإزالة الكربوكسيل

  • 3.ب.1 عائلة إنزيمات ديكاربوكسيلاز الأحماض الكربوكسيلية الناقلة لأيونات الصوديوم (NaT-DC)

3.ج. ناقلات مدفوعة بنقل الميثيل

  • 3.ج.1 عائلة ناقل ميثيل تتراهيدروميثانوبترين: مرافق الإنزيم م ميثيل ترانسفيراز (NaT-MMM) الناقل لأيونات الصوديوم

3.D. ناقلات مدفوعة بالأكسدة والاختزال

تشمل هذه البروتينات عددًا من البروتينات الغشائية الشبيهة بالسيتوكروم ب ، بما في ذلك مختزلة السيتوكروم ج مع الإنزيم المساعد Q (السيتوكروم bc1)؛ ومركب السيتوكروم b6f ؛ ونازعة هيدروجين الفورمات، ومختزلة نترات التنفس ؛ ومختزلة السكسينات مع الإنزيم المساعد Q (مختزلة الفومارات)؛ ونازعة هيدروجين السكسينات . انظر سلسلة نقل الإلكترون .

  • 3.د.1 عائلة نازعة هيدروجين NADH الناقلة لأيونات الهيدروجين أو الصوديوم ( "المعقد الأول")
  • 3.د.2 عائلة ناقلة البروتونات (PTH)
  • 3.د.3 عائلة إنزيمات اختزال الكينول: السيتوكروم ج الناقلة للبروتونات
  • 3.د.4 عائلة السيتوكروم أوكسيداز (COX) الناقلة للبروتونات
  • 3.د.5 عائلة إنزيمات نازعة هيدروجين الكينون NADH الناقلة لأيونات الصوديوم (Na-NDH أو NQR)
  • 3.د.6 عائلة إنزيمات أوكسيدوريدوكتاز NADH: فيريدوكسين (NFO أو RNF) التي تنقل الأيونات المفترضة (H + أو Na + )
  • 3.د.7 عائلة إنزيمات أوكسيدوريدوكتاز ثنائي الكبريتيد غير المتجانس H2 (HHO )
  • 3.د.8 عائلة نازعة هيدروجين الفورميل ميثانوفوران (FMF-DH) التي تضخ أيونات الصوديوم أو الهيدروجين
  • 3.د.9 عائلة إنزيمات نازعة الهيدروجين F420H2 الناقلة لأيونات الهيدروجين (F420H2DH)
  • 3.د.10 عائلة نازعة هيدروجين السكسينات بدائية النواة (SDH)

3.هـ. ناقلات مدفوعة بامتصاص الضوء

4. أجهزة النقل الجماعي

4. ناقلات المجموعة المدفوعة بنقل الفوسفات

4.ب ناقلات امتصاص ريبونوكليوزيد النيكوتيناميد

  • 4.ب.1 عائلة بروتينات امتصاص النيكوتيناميد الريبونوكليوزيد (NR) (PnuC)

4. ج- ناقلات مقترنة بإنزيم أسيل كو أ ليغاز

  • 4.ج.1 عائلة ناقلات الأحماض الدهنية المقترحة (FAT)
  • 4.ج.2 عائلة ناقلة أسيل الكارنيتين O (CrAT)
  • 4.ج.3 عائلة أسيل-CoA ثيوإستراز (AcoT)

4.D إنزيمات تصنيع/تصدير عديد السكاريد

  • 4.د.1 عائلة بلمرة الغليكوزيل الاتجاهية المفترضة (VGP)
  • 4.د.2 عائلة جليكوزيل ترانسفيراز 2 (GT2)
  • 4.د.3 عائلة إنزيمات نقل الجلوكوزيل للجليكان (OpgH)

4.هـ. ناقلات المجموعات المحفزة بواسطة بوليميراز متعدد الفوسفات الفجوي

  • 4.E.1 عائلة بوليميراز متعدد الفوسفات الفجوي (الحمضي الكلسي) (V-PPP)

5. نقل حاملات الإلكترون

5. ناقلات نقل الإلكترون عبر الغشاء

  • 5.أ.1 عائلة إنزيمات الأكسدة والاختزال لرابطة ثنائي الكبريتيد D (DsbD)
  • 5.أ.2 عائلة إنزيمات الأكسدة والاختزال لرابطة ثنائي الكبريتيد B (DsbB)
  • 5.أ.3 عائلة الأكسيدوريدوكتاز المحتوية على موليبدوبترين بدائيات النوى (PMO)

5.ب. ناقلات نقل الإلكترون الأحادي عبر الغشاء

  • 5.ب.1 عائلة أوكسيداز NADPH للخلايا البلعمية ( gp91phox )
  • 5.ب.2 عائلة السيتوكروم b561 (Cytb561) في حقيقيات النوى
  • 5.ب.3 عائلة نقل الإلكترون عبر الأسلاك النانوية لبكتيريا الجيوباكتر (G-NET)
  • 5.ب.4 عائلة النظام الضوئي الأول الفائق (PSI) في النباتات
  • 5.ب.5 عائلة إنزيمات الأكسدة والاختزال المعدنية خارج الخلية (EMOR)
  • 5.ب.6 عائلة بروتين المستضد الظهاري عبر الغشاء-3 المختزل الحديدي (STEAP)
  • 5.ب.7 عائلة YedZ (YedZ)
  • 5.ب.8 عائلة معقدات بورين/سيتوكروم لنقل الإلكترون عبر الغشاء الخارجي (ET-PCC)
  • 5.ب.9 عائلة بورين-سيتوكروم ج (Cyc2)

8. العوامل المساعدة المشاركة في النقل

8.أ بروتينات النقل المساعدة

8.ب. سموم بروتينية/ببتيدية مصنعة ريبوسومياً تستهدف القنوات والناقلات

8-ج- السموم المصنعة بطريقة غير ريبوسومية والتي تستهدف القنوات والناقلات

9. أنظمة النقل غير الموصوفة بشكل كامل

9.أ. ناقلات معروفة ذات آلية كيميائية حيوية غير معروفة

9.ب بروتينات النقل المفترضة

9.ج. ناقلات ذات خصائص وظيفية تفتقر إلى تسلسلات محددة

مراجع

  1. ساير، ميلتون هـ.؛ ريدي، فامسي س.؛ تامانغ، دورجي ج.؛ فاسترمارك، آكي (يناير 2014). "قاعدة بيانات تصنيف النواقل" . أبحاث الأحماض النووية . 42 (D1): D251– D258. doi : 10.1093/nar/gkt1097 . PMC 3964967. PMID 24225317 .  
  2. ساير، إم إتش؛ ين، إم آر؛ نوتو، ك؛ تامانغ، دي جي؛ إلكان، سي. (1 يناير 2009). "قاعدة بيانات تصنيف النواقل: التطورات الحديثة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 37 (قاعدة البيانات): D274– D278 . doi : 10.1093/nar/gkn862 . PMC 2686586. PMID 19022853 .  
  3. ساير، إم إتش؛ تران، سي في؛ بارابوت، آر دي (1 يناير 2006). "TCDB: قاعدة بيانات تصنيف النواقل لتحليلات ومعلومات بروتينات النقل الغشائي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (90001): D181– D186 . doi : 10.1093/nar/gkj001 . PMC 1334385. PMID 16381841 .