كرر استخدام WD40

يُعد تكرار WD40 ( المعروف أيضًا باسم تكرار WD أو تكرار بيتا-ترانسدوسين ) وحدة بنائية قصيرة تتكون من حوالي 40 حمضًا أمينيًا ، وغالبًا ما تنتهي بثنائي ببتيد تريبتوفان - حمض الأسبارتيك (WD). [ 2 ] عادةً ما تتشابك النسخ المتتالية من هذه التكرارات لتشكيل نوع من نطاق البروتين الحلزوني الدائري يُسمى نطاق WD40 .

بناء

تحتوي البروتينات الحاوية على نطاق WD40 على ما بين 4 إلى 16 وحدة متكررة، يُعتقد أنها جميعًا تُشكّل بنية حلزونية بيتا (انظر الشكل على اليمين). [ 3 ] [ 4 ] يتكون نطاق WD40 من حوالي 40 إلى 60 حمضًا أمينيًا [ 4 مع ثنائي ببتيد من الجليسين والهيستيدين بالقرب من الطرف الأميني، وثنائي ببتيد من التربتوفان وحمض الأسبارتيك في الغالب عند الطرف الكربوكسيلي. توجد منطقتان متغيرتان. تُشكّل التكرارات عادةً صفيحة بيتا رباعية الخيوط متوازية عكسيًا أو شفرة. تتحد هذه الشفرات لتشكيل مروحة، وأكثرها شيوعًا هي مروحة بيتا سباعية الشفرات. تتشابك الشفرات بحيث يتحد خيط بيتا الأخير من تكرار واحد مع الخيوط الثلاثة الأولى من التكرار التالي لتشكيل بنية الشفرة ثلاثية الأبعاد. [ 3 ] [ 4 ]

وظيفة

تُعدّ بروتينات WD40 المتكررة عائلة كبيرة موجودة في جميع حقيقيات النوى، وتشارك في وظائف متنوعة تتراوح بين نقل الإشارات وتنظيم النسخ ، وصولًا إلى التحكم في دورة الخلية ، والالتهام الذاتي، والاستماتة الخلوية . [ 5 ] تتمثل الوظيفة الأساسية المشتركة لجميع بروتينات WD40 المتكررة في تنسيق تجمعات معقدات بروتينية متعددة، حيث تعمل الوحدات المتكررة كدعامة صلبة لتفاعلات البروتينات. وتُحدد خصوصية البروتينات من خلال التسلسلات الموجودة خارج التكرارات نفسها. ومن أمثلة هذه المعقدات بروتينات G (الوحدة الفرعية بيتا عبارة عن مروحة بيتا)، وعامل النسخ TAFII ، وإنزيم E3 يوبيكويتين ليغاز . [ 3 ] [ 4 ]

أمثلة

بحسب التحليل الأولي للجينوم البشري، تُعدّ تكرارات WD40 ثامن أكبر عائلة من البروتينات، إذ تمّ تحديد 277 بروتينًا تحتوي عليها. [ 6 ] تشمل الجينات البشرية التي تُشفّر بروتينات تحتوي على هذا النطاق ما يلي:

جينات WDR البشرية والأمراض المرتبطة بها
جين WDRأسماء جينية أخرىمعرف الجين في قاعدة بيانات NCBI Entrezالأمراض البشرية المرتبطة بالطفرات
WDR1AIP1؛ NORI-1؛ HEL-S-529948
WDR2CORO2A ؛ IR10؛ CLIPINB7464
WDR3DIP2؛ UTP1210885
WDR4TRM82؛ TRMT8210785
WDR5SWD3؛ BIG-3؛ CFAP8911091
WDR611180
WDR7TRAG؛ KIAA0541; رابكونيكتين 3 بيتا23335
WDR8WRAP7349856
WDR9BRWD1 ؛ N143؛ C21orf10754014
WDR10IFT122 ؛ CED؛ SPG؛ CED1؛ WDR10p؛ WDR14055764متلازمة سينسنبرينر
WDR11DR11؛ HH14؛ BRWD2؛ WDR1555717متلازمة كالمان
WDR12YTM155759
WDR13MG2164743
WDR14GNB1L ؛ GY2؛ FKSG1؛ ودفكف؛ DGCRK354584
WDR15WDR11
WDR16CFAP52 ؛ WDRPUH146845
WDR17116966
WDR18Ipi357418
WDR19ATD5; CED4؛ دي واي إف-2؛ ORF26؛ أوسيج6؛ بودمب؛ SRTD5؛ IFT144; NPHP1357728متلازمة سينسنبرينر ، متلازمة جون
WDR20DMR91833
WDR21DCAF4 ؛ WDR21A26094
WDR22DCAF5 ؛ BCRG2؛ BCRP28816
WDR23DCAF11 ؛ GL014؛ PRO238980344
WDR24JFP7؛ C16orf2184219
WDR25C14orf6779446
WDR26CDW2؛ GID7؛ MIP280232
WDR27253769
WDR28GRWD1؛ CDW4؛ GRWD؛ RRB183743
WDR29SPAG16 ; PF2079582
WDR30ATG16L1 ؛ IBD10؛ APG16L؛ ATG16A؛ ATG16L55054مرض كرون
WDR31114987
WDR32DCAF1079269
WDR33NET14؛ WDC14655339
WDR34DIC5؛ FAP133؛ SRTD1189891متلازمة جون
WDR35CED2؛ IFTA1؛ SRTD7؛ IFT12157539متلازمة سينسنبرينر
WDR36GLC1G؛ UTP21؛ TAWDRP؛ TA-WDRP134430الجلوكوما الأولية مفتوحة الزاوية
WDR3722884
WDR38401551
WDR39CIAO1 ؛ CIA19391
WDR40ADCAF12 ؛ CT102؛ TCC52؛ KIAA189225853
WDR41MSTP04855255
WDR43UTP5؛ NET1223160
WDR44RPH11؛ RAB11BP54521
WDR45JM5؛ NBIA4؛ NBIA5؛ WDRX1؛ WIPI4؛ ويبي-411152التنكس العصبي المرتبط ببروتين بيتا بروبيلر (BPAN)
WDR46UTP7؛ BING4؛ FP221؛ C6orf119277
WDR47نيميتين؛ KIAA089322911
WDR48P80؛ UAF1؛ SPG6057599
WDR49151790
WDR50UTP18 ؛ CGI-4851096
WDR52CFAP4455779
WDR53348793
WDR5484058
WDR5554853
WDR56IFT80 ؛ ATD2؛ SRTD257560متلازمة جون
WDR57SNRNP40 ؛ SPF38؛ PRP8BP؛ HPRP8BP؛ PRPF8BP9410
WDR58THOC6 ؛ BBIS؛ fSAP3579228
WDR59FP97779726
WDR60SRPS6؛ SRTD8؛ FAP16355112متلازمة جون
WDR61SKI8؛ REC1480349
WDR62MCPH2؛ C19orf14284403صغر الرأس
WDR63DIC3؛ NYD-SP29126820
WDR64128025
WDR65CFAP57 ؛ VWS2149465متلازمة فان دير وود
WDR66CaM-IP4144406
WDR67TBC1D31 ؛ Gm8593594
WDR68DCAF7 ؛ AN11؛ HAN11؛ SWAN-110238
WDR69DAW1 ؛ ODA16164781
WDR7055100
WDR71PAAF1 ؛ PAAF؛ Rpn1480227
WDR72AI2A3256764تكوين المينا الناقص
WDR73HSPC26484942
WDR7454663
WDR75NET16؛ UTP1784128
WDR76CDW1479968
WDR77ص44؛ MEP50؛ MEP-50؛ HKMT1069؛ Nbla10071؛ ص44/Mep5079084
WDR78DIC479819
WDR79WRAP53 ؛ DKCB3؛ TCAB155135
WDR80ATG16L ؛ ATG16B89849
WDR81CAMRQ2؛ PPP1R166124997متلازمة ترنح المخيخ، والتخلف العقلي، واضطراب التوازن-2
WDR82SWD2؛ MST107؛ WDR82A؛ MSTP107؛ PRO2730؛ TMEM113؛ PRO3404780335
WDR83مورغ184292
WDR84PAK1IP1 ؛ PIP1؛ MAK1155003
WDR85DPH7 ؛ RRT2؛ C9orf11292715
WDR86349136
WDR87NYD-SP1183889
WDR88PQWD126248
WDR89MSTP050؛ C14orf150112840
WDR90C16orf15؛ C16orf16؛ C16orf17؛ C16orf18؛ C16orf19197335
WDR91HSPC04929062
WDR92موناد116143
WDR9356964
WDR94AMBRA1 ؛ DCAF355626
WDR96CFAP43 ؛ C10orf7980217

انظر أيضاً

مراجع

  1. PDB : 1erj ؛سبراغ إي آر، ريد إم جيه، جونسون إيه دي، وولبرغر سي (يونيو 2000). "بنية النطاق الطرفي الكربوكسيلي لبروتين Tup1، وهو مثبط مشترك للنسخ في الخميرة" . مجلة EMBO . 19 (12): 3016-27 . doi : 10.1093/emboj/19.12.3016 . PMC 203344. PMID 10856245 .  
  2. نير إي جيه، شميدت سي جيه، نامبودريباد آر، سميث تي إف (سبتمبر 1994). "عائلة البروتينات التنظيمية القديمة لبروتينات تكرار WD". نيتشر . 371 ( 6495): 297-300 . Bibcode : 1994Natur.371..297N . doi : 10.1038/371297a0 . PMID 8090199. S2CID 600856 .  
  3. 1 2 3 سميث تي إف، غايتاتزيس سي، ساكسينا كيه، نير إي جيه (مايو 1999). "تكرار WD40: بنية مشتركة لوظائف متنوعة" . تريندز بيوكيم. ساينس . 24 (5): 181-185 . doi : 10.1016/S0968-0004(99)01384-5 . PMID 10322433 . 
  4. 1 2 3 4 لي د، روبرتس ر (ديسمبر 2001). "بروتينات التكرار WD: خصائصها البنيوية، ووظيفتها البيولوجية، ودورها في الأمراض البشرية" . مجلة علوم الخلية والجزيئات الحيوية . 58 ( 14): 2085-2097 . doi : 10.1007/PL00000838 . PMC 11337334. PMID 11814058. S2CID 20646422 .   
  5. ستيرنيمان سي يو، بيتسالاكي إي، راسل آر بي، مولر سي دبليو (مايو 2010). "بروتينات WD40 تدفع الشبكات الخلوية". تريندز بيوكيم. ساينس . 35 (10): 565-74 . doi : 10.1016/j.tibs.2010.04.003 . PMID 20451393 . 
  6. لاندر إي إس، لينتون إل إم، بيرين بي، وآخرون (فبراير 2001). "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري" (ملف PDF) . مجلة نيتشر . 409 (6822): 860-921 . doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011 .