كرر استخدام WD40
يُعد تكرار WD40 ( المعروف أيضًا باسم تكرار WD أو تكرار بيتا-ترانسدوسين ) وحدة بنائية قصيرة تتكون من حوالي 40 حمضًا أمينيًا ، وغالبًا ما تنتهي بثنائي ببتيد تريبتوفان - حمض الأسبارتيك (WD). [ 2 ] عادةً ما تتشابك النسخ المتتالية من هذه التكرارات لتشكيل نوع من نطاق البروتين الحلزوني الدائري يُسمى نطاق WD40 .
بناء
تحتوي البروتينات الحاوية على نطاق WD40 على ما بين 4 إلى 16 وحدة متكررة، يُعتقد أنها جميعًا تُشكّل بنية حلزونية بيتا (انظر الشكل على اليمين). [ 3 ] [ 4 ] يتكون نطاق WD40 من حوالي 40 إلى 60 حمضًا أمينيًا [ 4 ]، مع ثنائي ببتيد من الجليسين والهيستيدين بالقرب من الطرف الأميني، وثنائي ببتيد من التربتوفان وحمض الأسبارتيك في الغالب عند الطرف الكربوكسيلي. توجد منطقتان متغيرتان. تُشكّل التكرارات عادةً صفيحة بيتا رباعية الخيوط متوازية عكسيًا أو شفرة. تتحد هذه الشفرات لتشكيل مروحة، وأكثرها شيوعًا هي مروحة بيتا سباعية الشفرات. تتشابك الشفرات بحيث يتحد خيط بيتا الأخير من تكرار واحد مع الخيوط الثلاثة الأولى من التكرار التالي لتشكيل بنية الشفرة ثلاثية الأبعاد. [ 3 ] [ 4 ]
وظيفة
تُعدّ بروتينات WD40 المتكررة عائلة كبيرة موجودة في جميع حقيقيات النوى، وتشارك في وظائف متنوعة تتراوح بين نقل الإشارات وتنظيم النسخ ، وصولًا إلى التحكم في دورة الخلية ، والالتهام الذاتي، والاستماتة الخلوية . [ 5 ] تتمثل الوظيفة الأساسية المشتركة لجميع بروتينات WD40 المتكررة في تنسيق تجمعات معقدات بروتينية متعددة، حيث تعمل الوحدات المتكررة كدعامة صلبة لتفاعلات البروتينات. وتُحدد خصوصية البروتينات من خلال التسلسلات الموجودة خارج التكرارات نفسها. ومن أمثلة هذه المعقدات بروتينات G (الوحدة الفرعية بيتا عبارة عن مروحة بيتا)، وعامل النسخ TAFII ، وإنزيم E3 يوبيكويتين ليغاز . [ 3 ] [ 4 ]
أمثلة
بحسب التحليل الأولي للجينوم البشري، تُعدّ تكرارات WD40 ثامن أكبر عائلة من البروتينات، إذ تمّ تحديد 277 بروتينًا تحتوي عليها. [ 6 ] تشمل الجينات البشرية التي تُشفّر بروتينات تحتوي على هذا النطاق ما يلي:
- AAAS ، AAMP ، AHI1 ، AMBRA1 ، APAF1 ، ARPC1A ، ARPC1B ، ATG16L1 ،
- BOP1 ، BRWD1 ، BRWD3 ، BTRC ، BUB3 ،
- C6orf11 ، CDC20 ، CDC40 ، CDRT1 ، CHAF1B ، CIAO1 ، CIRH1A ، COPA ، COPB2 ، CORO1A ، CORO1B ، CORO1C ، CORO2A ، CORO2B ، CORO6 ، CORO7 ، CSTF1 ،
- DDB2 ، DENND3 ، DMWD ، DMXL1 ، DMXL2 ، DNAI1 ، DNAI2 ، DNCI1 ، DTL ، DYNC1I1 ، DYNC1I2 ، EDC4 ،
- EED ، EIF3S2 ، ELP2 ، EML1 ، EML2 ، EML3 ، EML4 ، EML4-ALK ، EML5 ، ERCC8 ،
- FBXW10 ، FBXW11 ، FBXW2 ، FBXW4 ، FBXW5 ، FBXW7 ، FBXW8 ، FBXW9 ، FZR1 ،
- GBL، GEMIN5 ، GNB1 ، GNB1L ، GNB2 ، GNB2L1 ، GNB3 ، GNB4 ، GNB5 ، GRWD1 ، GTF3C2 ،
- HERC1 ، HIRA ، HZGJ ،
- IFT121 ، IFT122 ، IFT140 ، IFT172 ، IFT80 ، IQWD1 ،
- KATNB1 ، KIAA1336 ، KIF21A ، KIF21B ، KM-PA-2 ،
- KEAP1 ،
- LLGL1 ، LLGL2 ، LRBA ، LRRK1 ، LRRK2 ، LRWD1 ، ليست ،
- MAPKBP1 ، MED16 ، MORG1 ،
- NBEA, NBEAL1, NEDD1, NLE1, NSMAF, NUP37, NUP43, NWD1,
- PAAF1, PAFAH1B1, PAK1IP1, PEX7, PHIP, PIK3R4, PLAA, PLRG1, PPP2R2A, PPP2R2B, PPP2R2C, PPP2R2D, PPWD1, PREB, PRPF19, PRPF4, PWP1, PWP2,
- RAE1, RPTOR, RBBP4, RBBP5, RBBP7, RFWD2, RFWD3, RRP9,
- SCAP, SEC13, SEC31A, SEC31B, SEH1L, SHKBP1, SMU1, SPAG16, SPG, STRAP, STRN, STRN3, STRN4, STXBP5, STXBP5L,
- TAF5, TAF5L, TBL1X, TBL1XR1, TBL1Y, TBL2, TBL3, TEP1, THOC3, THOC6, TLE1, TLE2, TLE3, TLE4, TLE6, TRAF7, TSSC1, TULP4, TUWD12,
- UTP15, UTP18,
- WAIT1 ، WDF3 ، WDFY1 ، WDFY2 ، WDFY3 ، WDFY4 ، WDHD1 ، WDR1 ، WDR10 ، WDR11 ، WDR12 ، WDR13 ، WDR16 ، WDR17 ، WDR18 ، WDR19 ، WDR20 ، WDR21A ، WDR21C ، WDR22 ، WDR23 ، WDR24 ، WDR25 ، WDR26 ، WDR27 ، WDR3 ، WDR31 ، WDR32 ، WDR33 ، WDR34 ، WDR35 ، WDR36 ، WDR37 ، WDR38 ، WDR4 ، WDR40A ، WDR40B ، WDR40C ، WDR41 ، WDR42A WDR42B ، WDR43 ، WDR44 ، WDR46 ، WDR47 ، WDR48 ، WDR49 ، WDR5 ، WDR51A ، WDR51B ، WDR52 ، WDR53 ، WDR54 ، WDR55 ، WDR57 ، WDR59 ، WDR5B ، WDR6 ، WDR60 ، WDR61 ، WDR62 ، WDR63 ، WDR64 ، WDR65 ، WDR66 ، WDR67 ، WDR68 ، WDR69 ، WDR7 ، WDR70 ، WDR72 ، WDR73 ، WDR74 ، WDR75 ، WDR76 ، WDR77 ، WDR78 ، WDR79 ، WDR8 ، WDR81 ، WDR82 ، WDR85 ، WDR86 ، WDR88 ، WDR89 ، WDR90 ، WDR91 ، WDR92 ، WDSOF1 ، WDSUB1 ، WDTC1، WSB1 ، WSB2 ،
- ZFP106
| جين WDR | أسماء جينية أخرى | معرف الجين في قاعدة بيانات NCBI Entrez | الأمراض البشرية المرتبطة بالطفرات |
|---|---|---|---|
| WDR1 | AIP1؛ NORI-1؛ HEL-S-52 | 9948 | |
| WDR2 | CORO2A ؛ IR10؛ CLIPINB | 7464 | |
| WDR3 | DIP2؛ UTP12 | 10885 | |
| WDR4 | TRM82؛ TRMT82 | 10785 | |
| WDR5 | SWD3؛ BIG-3؛ CFAP89 | 11091 | |
| WDR6 | 11180 | ||
| WDR7 | TRAG؛ KIAA0541; رابكونيكتين 3 بيتا | 23335 | |
| WDR8 | WRAP73 | 49856 | |
| WDR9 | BRWD1 ؛ N143؛ C21orf107 | 54014 | |
| WDR10 | IFT122 ؛ CED؛ SPG؛ CED1؛ WDR10p؛ WDR140 | 55764 | متلازمة سينسنبرينر |
| WDR11 | DR11؛ HH14؛ BRWD2؛ WDR15 | 55717 | متلازمة كالمان |
| WDR12 | YTM1 | 55759 | |
| WDR13 | MG21 | 64743 | |
| WDR14 | GNB1L ؛ GY2؛ FKSG1؛ ودفكف؛ DGCRK3 | 54584 | |
| WDR15 | WDR11 | ||
| WDR16 | CFAP52 ؛ WDRPUH | 146845 | |
| WDR17 | 116966 | ||
| WDR18 | Ipi3 | 57418 | |
| WDR19 | ATD5; CED4؛ دي واي إف-2؛ ORF26؛ أوسيج6؛ بودمب؛ SRTD5؛ IFT144; NPHP13 | 57728 | متلازمة سينسنبرينر ، متلازمة جون |
| WDR20 | DMR | 91833 | |
| WDR21 | DCAF4 ؛ WDR21A | 26094 | |
| WDR22 | DCAF5 ؛ BCRG2؛ BCRP2 | 8816 | |
| WDR23 | DCAF11 ؛ GL014؛ PRO2389 | 80344 | |
| WDR24 | JFP7؛ C16orf21 | 84219 | |
| WDR25 | C14orf67 | 79446 | |
| WDR26 | CDW2؛ GID7؛ MIP2 | 80232 | |
| WDR27 | 253769 | ||
| WDR28 | GRWD1؛ CDW4؛ GRWD؛ RRB1 | 83743 | |
| WDR29 | SPAG16 ; PF20 | 79582 | |
| WDR30 | ATG16L1 ؛ IBD10؛ APG16L؛ ATG16A؛ ATG16L | 55054 | مرض كرون |
| WDR31 | 114987 | ||
| WDR32 | DCAF10 | 79269 | |
| WDR33 | NET14؛ WDC146 | 55339 | |
| WDR34 | DIC5؛ FAP133؛ SRTD11 | 89891 | متلازمة جون |
| WDR35 | CED2؛ IFTA1؛ SRTD7؛ IFT121 | 57539 | متلازمة سينسنبرينر |
| WDR36 | GLC1G؛ UTP21؛ TAWDRP؛ TA-WDRP | 134430 | الجلوكوما الأولية مفتوحة الزاوية |
| WDR37 | 22884 | ||
| WDR38 | 401551 | ||
| WDR39 | CIAO1 ؛ CIA1 | 9391 | |
| WDR40A | DCAF12 ؛ CT102؛ TCC52؛ KIAA1892 | 25853 | |
| WDR41 | MSTP048 | 55255 | |
| WDR43 | UTP5؛ NET12 | 23160 | |
| WDR44 | RPH11؛ RAB11BP | 54521 | |
| WDR45 | JM5؛ NBIA4؛ NBIA5؛ WDRX1؛ WIPI4؛ ويبي-4 | 11152 | التنكس العصبي المرتبط ببروتين بيتا بروبيلر (BPAN) |
| WDR46 | UTP7؛ BING4؛ FP221؛ C6orf11 | 9277 | |
| WDR47 | نيميتين؛ KIAA0893 | 22911 | |
| WDR48 | P80؛ UAF1؛ SPG60 | 57599 | |
| WDR49 | 151790 | ||
| WDR50 | UTP18 ؛ CGI-48 | 51096 | |
| WDR52 | CFAP44 | 55779 | |
| WDR53 | 348793 | ||
| WDR54 | 84058 | ||
| WDR55 | 54853 | ||
| WDR56 | IFT80 ؛ ATD2؛ SRTD2 | 57560 | متلازمة جون |
| WDR57 | SNRNP40 ؛ SPF38؛ PRP8BP؛ HPRP8BP؛ PRPF8BP | 9410 | |
| WDR58 | THOC6 ؛ BBIS؛ fSAP35 | 79228 | |
| WDR59 | FP977 | 79726 | |
| WDR60 | SRPS6؛ SRTD8؛ FAP163 | 55112 | متلازمة جون |
| WDR61 | SKI8؛ REC14 | 80349 | |
| WDR62 | MCPH2؛ C19orf14 | 284403 | صغر الرأس |
| WDR63 | DIC3؛ NYD-SP29 | 126820 | |
| WDR64 | 128025 | ||
| WDR65 | CFAP57 ؛ VWS2 | 149465 | متلازمة فان دير وود |
| WDR66 | CaM-IP4 | 144406 | |
| WDR67 | TBC1D31 ؛ Gm85 | 93594 | |
| WDR68 | DCAF7 ؛ AN11؛ HAN11؛ SWAN-1 | 10238 | |
| WDR69 | DAW1 ؛ ODA16 | 164781 | |
| WDR70 | 55100 | ||
| WDR71 | PAAF1 ؛ PAAF؛ Rpn14 | 80227 | |
| WDR72 | AI2A3 | 256764 | تكوين المينا الناقص |
| WDR73 | HSPC264 | 84942 | |
| WDR74 | 54663 | ||
| WDR75 | NET16؛ UTP17 | 84128 | |
| WDR76 | CDW14 | 79968 | |
| WDR77 | ص44؛ MEP50؛ MEP-50؛ HKMT1069؛ Nbla10071؛ ص44/Mep50 | 79084 | |
| WDR78 | DIC4 | 79819 | |
| WDR79 | WRAP53 ؛ DKCB3؛ TCAB1 | 55135 | |
| WDR80 | ATG16L ؛ ATG16B | 89849 | |
| WDR81 | CAMRQ2؛ PPP1R166 | 124997 | متلازمة ترنح المخيخ، والتخلف العقلي، واضطراب التوازن-2 |
| WDR82 | SWD2؛ MST107؛ WDR82A؛ MSTP107؛ PRO2730؛ TMEM113؛ PRO34047 | 80335 | |
| WDR83 | مورغ1 | 84292 | |
| WDR84 | PAK1IP1 ؛ PIP1؛ MAK11 | 55003 | |
| WDR85 | DPH7 ؛ RRT2؛ C9orf112 | 92715 | |
| WDR86 | 349136 | ||
| WDR87 | NYD-SP11 | 83889 | |
| WDR88 | PQWD | 126248 | |
| WDR89 | MSTP050؛ C14orf150 | 112840 | |
| WDR90 | C16orf15؛ C16orf16؛ C16orf17؛ C16orf18؛ C16orf19 | 197335 | |
| WDR91 | HSPC049 | 29062 | |
| WDR92 | موناد | 116143 | |
| WDR93 | 56964 | ||
| WDR94 | AMBRA1 ؛ DCAF3 | 55626 | |
| WDR96 | CFAP43 ؛ C10orf79 | 80217 |
انظر أيضاً
- مروحة بيتا
- توموسين ، وهو بروتين يحتوي على نطاقين WD40
- تكرارات البروتين المتتالية
مراجع
- ↑ PDB : 1erj ؛سبراغ إي آر، ريد إم جيه، جونسون إيه دي، وولبرغر سي (يونيو 2000). "بنية النطاق الطرفي الكربوكسيلي لبروتين Tup1، وهو مثبط مشترك للنسخ في الخميرة" . مجلة EMBO . 19 (12): 3016-27 . doi : 10.1093/emboj/19.12.3016 . PMC 203344. PMID 10856245 .
- ↑ نير إي جيه، شميدت سي جيه، نامبودريباد آر، سميث تي إف (سبتمبر 1994). "عائلة البروتينات التنظيمية القديمة لبروتينات تكرار WD". نيتشر . 371 ( 6495): 297-300 . Bibcode : 1994Natur.371..297N . doi : 10.1038/371297a0 . PMID 8090199. S2CID 600856 .
- 1 2 3 سميث تي إف، غايتاتزيس سي، ساكسينا كيه، نير إي جيه (مايو 1999). "تكرار WD40: بنية مشتركة لوظائف متنوعة" . تريندز بيوكيم. ساينس . 24 (5): 181-185 . doi : 10.1016/S0968-0004(99)01384-5 . PMID 10322433 .
- 1 2 3 4 لي د، روبرتس ر (ديسمبر 2001). "بروتينات التكرار WD: خصائصها البنيوية، ووظيفتها البيولوجية، ودورها في الأمراض البشرية" . مجلة علوم الخلية والجزيئات الحيوية . 58 ( 14): 2085-2097 . doi : 10.1007/PL00000838 . PMC 11337334. PMID 11814058. S2CID 20646422 .
- ↑ ستيرنيمان سي يو، بيتسالاكي إي، راسل آر بي، مولر سي دبليو (مايو 2010). "بروتينات WD40 تدفع الشبكات الخلوية". تريندز بيوكيم. ساينس . 35 (10): 565-74 . doi : 10.1016/j.tibs.2010.04.003 . PMID 20451393 .
- ↑ لاندر إي إس، لينتون إل إم، بيرين بي، وآخرون (فبراير 2001). "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري" (ملف PDF) . مجلة نيتشر . 409 (6822): 860-921 . doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011 .
روابط خارجية
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_APCC_Dbox_1
- مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة، فئة الزخارف LIG_APCC_KENbox_2
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة فئة النمط LIG_COP1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_CRL4_Cdt2_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_CRL4_Cdt2_2
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_EH1_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_GLEBS_BUB3_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_RAPTOR_TOS_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_SCF_FBW7_1
- مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة، فئة الزخارف LIG_SCF_FBW7_2
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة فئة النمط LIG_SCF-TrCP1_1
- فئة الزخارف LIG_WRPW_1 لموارد الزخارف الخطية حقيقية النواة
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة، فئة النمط LIG_WRPW_2
- فئة الزخارف الخطية لمورد حقيقيات النوى TRG_ER_diArg_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة فئة النمط TRG_ER_diLys_1
- مورد النمط الخطي حقيقي النواة فئة النمط TRG_Golgi_diPhe_1
- مورد الزخارف الخطية حقيقية النواة فئة الزخارف TRG_PTS2
- تكرارات البروتين المتتالية
