بيو ركسيف
نوع الموقع | علوم |
|---|---|
| متوفر في | إنجليزي |
| مالك | مختبر كولد سبرينج هاربور |
| عنوان URL | biorxiv.org |
| تجاري | لا |
| تم إطلاقه | نوفمبر 2013 |
| الحالة الحالية | متصل |
bioRxiv (يُنطق "بيو-أرشيف" [1] [2] ) هو مستودع مفتوح المصدر للمطبوعات المسبقة للعلوم البيولوجية ، أسسه جون إنجليس وريتشارد سيفر في نوفمبر 2013. [3] [4] ويستضيفه مختبر كولد سبرينج هاربور (CSHL). [5]
باعتبارها مسودات أولية، لا تخضع الأوراق البحثية المستضافة على bioRxiv لمراجعة الأقران (على الرغم من أن الأوراق المقدمة قد تخضع لمراجعة الأقران وقد يتم نشر مراجعات الأقران من مصادر أخرى إلى جانب المسودات الأولية). ومع ذلك، تخضع جميع الأوراق المقدمة لعملية تدقيق أساسية، والتي تتضمن فحوصات الحماية، وفحصًا آليًا للانتحال وتقييمًا للملاءمة. وعلاوة على ذلك، يجوز للقراء نشر التعليقات.
لقد تم قياس أن ثلثي الأوراق المنشورة في bioRxiv يتم نشرها لاحقًا في مجلات تمت مراجعتها من قبل الأقران. [6] كان BioRxiv وموقعه الشقيق، medRxiv ، من المصادر الرئيسية لنشر أبحاث COVID-19 . [7] [8]
تاريخ
استوحيت فكرة BioRxiv من مستودع arXiv ، الذي يركز في الغالب على الرياضيات والفيزياء والتخصصات المرتبطة، والذي أطلقه بول جينسبارج في عام 1991 (الذي يخدم أيضًا في المجلس الاستشاري لـ bioRxiv). وقد تلقت دعمًا من كل من CSHL ومؤسسة Lourie. [9] تم تأكيد التمويل الإضافي من مبادرة تشان زوكربيرج في أبريل 2017. [10] [11]
قبل إنشاء bioRxiv، انقسم العلماء البيولوجيون حول قضية وجود مستودع مفتوح الوصول مخصص للمطبوعات الأولية . [3] كان لدى العديد منهم مخاوف من أن يستحوذ المنافسون على أبحاثهم ويخسرون مطالبهم بالاكتشاف . ومع ذلك، قدم العديد من علماء الوراثة أوراقًا إلى قسم " علم الأحياء الكمي " في مستودع arXiv (الذي تم إطلاقه في عام 2003) ولم يعد لديهم هذه المخاوف، حيث يمكنهم الإشارة إلى المطبوعات الأولية لدعم مطالباتهم بالاكتشاف. [3] [12]
معدل الإرسال
قالت جوسلين كايزر من مجلة ساينس إن المستودع في عامه الأول "اجتذب تدفقًا متواضعًا ولكنه متزايد من الأوراق البحثية"، حيث استضاف 824 ورقة بحثية مسبقة الطبع. [13] تم نشر أكثر من 20000 تغريدة حول الأوراق البحثية المسبقة المستضافة على bioRxiv في عام 2015. [9]
في فبراير 2016، زاد معدل الإرسال إلى bioRxiv بشكل مطرد من 60 إلى 200 شهريًا. [9] في عام 2017، ارتفع عدد الإرساليات الشهرية من أكثر من 800 في مارس [14] إلى أكثر من 1000 في يوليو [15] بإجمالي عدد 10722 ورقة مقدمة في عام 2017. [16]
في عام 2018، تم تقديم ما مجموعه 20.000 مخطوطة، مما ينتج عنه متوسط شهري يبلغ 1600 ورقة. [17]
في عام 2019، تم تقديم أكثر من 31000 مخطوطة، مما أدى إلى متوسط شهري قدره 2600 ورقة (والتي تسارعت إلى ما يزيد قليلاً عن 3000 ورقة شهريًا في الربع الأخير من عام 2019). [18]
ارتفع عدد المخطوطات السنوية إلى 38088 في عام 2020، ثم ارتفع قليلاً إلى 40223 في عام 2021، تلا ذلك نشر 36417 مخطوطة في عام 2022. وحتى 31 ديسمبر 2022، تم قبول ما يقرب من 180.000 طبعة أولية في المجموع. [19]
الحقول
يقبل bioRxiv الطبعات المسبقة في التخصصات التالية
- سلوك الحيوان والإدراك
- الكيمياء الحيوية
- الهندسة الحيوية
- المعلوماتية الحيوية
- الفيزياء الحيوية
- علم الأحياء السرطاني
- علم الأحياء الخلوي
- التجارب السريرية
- علم الأحياء التنموي
- علم البيئة
- علم الأوبئة
- علم الأحياء التطوري
- علم الوراثة
- علم الجينوميات
- علم المناعة
- علم الأحياء الدقيقة
- علم الأحياء الجزيئي
- علم الأعصاب
- علم الحفريات
- علم الأمراض
- علم الأدوية والسموم
- علم وظائف الأعضاء
- علم الأحياء النباتية
- الإتصال العلمي والتعليم
- علم الأحياء الاصطناعي
- علم الأحياء النظمي
- علم الحيوان
bioRxiv، والمجلات، ومراجعة الأقران المفتوحة
نتيجة لشعبية bioRxiv، قامت العديد من المجلات العلمية بتحديث سياساتها بشأن المطبوعات المسبقة، [9] [13] موضحة أنها لا تعتبر المطبوعات المسبقة "نشرًا مسبقًا" لغرض قاعدة إنجيلفينجر .
تتيح مبادرة bioRxiv to Journals (B2J) للمؤلفين إرسال مخطوطاتهم مباشرةً إلى نظام إرسال المجلات من خلال bioRxiv. اعتبارًا من مايو 2020، شاركت 177 مجلة في المبادرة. [1]
في عام 2019، بدأت BioRxiv في السماح بنشر المراجعات جنبًا إلى جنب مع الطبعات المسبقة، بالإضافة إلى السماح بالتعليقات على الطبعات المسبقة. يمكن أن تأتي المراجعات من المجلات أو من منصات مثل Review Commons. [20]
انظر أيضا
مراجع
- ^ "تعزيز مشاركة نتائج الأبحاث في علوم الحياة". bioRxiv . تم الاسترجاع في 12 ديسمبر 2018 .
- ^ سيفر، ريتشارد؛ رودر، تيد؛ هيندل، سامانثا؛ سوسمان، ليندا؛ بلاك، كيفن جون؛ الأرجنتيني، جانيت؛ مانوس، واين؛ إنجليس، جون ر. (6 نوفمبر 2019). "bioRxiv: خادم ما قبل الطباعة لعلم الأحياء". bioRxiv 10.1101/833400 .
- ^ abc Callaway, Ewen (12 نوفمبر 2013). "Preprints come to life". Nature . 503 (7475): 180. Bibcode :2013Natur.503..180C. doi : 10.1038/503180a . PMID 24226869.
- ^ مختبر كولد سبرينج هاربور. "يمكن الآن تقديم المطبوعات الأولية لـ bioRxiv مباشرة إلى المجلات البحثية الرائدة". PhysOrg . تم الاسترجاع في 2018-03-17 .
- ^ "حول bioRxiv". bioRxiv . مختبر كولد سبرينج هاربور . تم الاسترجاع في 2016-09-07 .
- ^ عبدل، ريتشارد جيه (24 أبريل 2019) . "البحث التلوي، تتبع شعبية ونتائج جميع المطبوعات الأولية لـ bioRxiv". eLife . 8 : e45133. doi : 10.7554/eLife.45133 . PMC 6510536. PMID 31017570. S2CID 129944106.
- ^ يان، وودان (2020-04-14). "فيروس كورونا يختبر حاجة العلم إلى تحديد السرعة". نيويورك تايمز . ISSN 0362-4331 . تم الاسترجاع في 2020-05-01 .
- ^ Koerth, Maggie (2021-07-08). "كيف تجاوز العلم مراجعة الأقران أثناء الوباء". FiveThirtyEight . تم الاسترجاع في 2021-08-07 .
- ^ abcd Inglis, John R.; Sever, Richard (12 فبراير 2016). "bioRxiv: a progress report". ASAPbio . تم الاسترجاع في 2016-09-11 .
- ^ كالاواي، إيوان (2017). "خادم ما قبل الطباعة BioRxiv يحصل على دفعة نقدية من مبادرة تشان زوكربيرج". نيتشر . 545 (7652): 18. رمز Bibcode : 2017Natur.545...18C. doi : 10.1038/nature.2017.21894 . PMID 28470210.
- ^ كايزر، جوسلين (26 أبريل 2017). "خادم ما قبل الطباعة BioRxiv يحصل على تمويل من مبادرة تشان زوكربيرج". العلوم . doi :10.1126/science.aal1117.
- ^ كالاواي، إيوين (31 يوليو 2012). "علماء الوراثة يراقبون إمكانات arXiv". مجلة نيتشر . 488 (7409): 19. رمز Bibcode :2012Natur.488...19C. doi : 10.1038/488019a . PMID 22859182.
- ^ ab Kaiser, Jocelyn (11 November 2014). "BioRxiv at 1 year: A promises start". Science . تم الاسترجاع في 2016-09-07 .
- ^ "جون إنجليس على تويتر". تويتر . تم الاسترجاع في 2017-03-01 .
- ^ إنجليس، جون (2017-06-30). "إنجاز مهم في مجال العلوم الحياتية قبل الطباعة: أول شهر لـ @biorxivpreprint يتجاوز 1000 مللي ثانية. شكرًا للمؤلفين والشركات التابعة والموظفين على تحقيق ذلك". @JohnRInglis . تم الاسترجاع في 2017-07-02 .
- ^ "نتائج البحث | bioRxiv". biorxiv.org . تم الاسترجاع في 2018-10-22 .
- ^ "نتائج البحث | bioRxiv".
- ^ "نتائج البحث | bioRxiv".
- ^ "نتائج البحث | bioRxiv". biorxiv.org . تم الاسترجاع في 2020-01-21 .
- ^ Brainard, Jeffrey (2019-10-10). "في محاولة لتعزيز الشفافية، يبدأ bioRxiv في نشر مراجعات الأقران بجوار المطبوعات الأولية". العلوم . الجمعية الأمريكية لتقدم العلوم (AAAS). doi :10.1126/science.aaz8160. ISSN 0036-8075. S2CID 211766434.
قراءة إضافية
- جانسن، جاكلين (12 نوفمبر 2013). "CSHL تطلق bioRxiv، خادم مطبوعات أولية يمكن الوصول إليه بحرية وقابل للاستشهاد به في مجال علم الأحياء". مختبر كولد سبرينج هاربور . مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2016. تم الاسترجاع في 11 سبتمبر 2016 .
- كايزر، جوسلين (12 نوفمبر 2013). "خادم ما قبل الطباعة الجديد يهدف إلى أن يكون إجابة علماء الأحياء على arXiv للفيزيائيين". العلوم . تم الاسترجاع في 2016-10-30 .
- "إطلاق خادم الطباعة المسبقة لـ BioRxiv". أخبار مكتبة جامعة كاليفورنيا في بيركلي . 15 نوفمبر 2013. تم الاسترجاع في 2016-09-11 .[ رابط ميت دائم ]
- كالاواي، إيوان؛ باول، كيندال (16 فبراير 2016). "حث علماء الأحياء على احتضان النسخة الأولية من البحث". نيتشر . 530 (7590): 265. رمز Bibcode :2016Natur.530..265C. doi : 10.1038/530265a . PMID 26887471.
- إنجليس، جون (22 سبتمبر 2016). "خدمة الطباعة المسبقة bioRxiv" (PDF) . COASP 2016 .
روابط خارجية
- الموقع الرسمي
