فسفرة البروتين

نموذج لبقايا السيرين المفسفرة
السيرين في سلسلة الأحماض الأمينية، قبل وبعد الفسفرة.

فسفرة البروتين هي تعديل عكسي يحدث بعد الترجمة، حيث يقوم بروتين كيناز بفسفرة حمض أميني بإضافة مجموعة فوسفات مرتبطة تساهميًا. تُغير الفسفرة البنية التركيبية للبروتين، مما يؤدي إلى تنشيطه أو تعطيله أو تعديل وظيفته. [ 1 ] يوجد ما يقارب 13000 بروتين بشري تحتوي على مواقع فسفرة. [ 2 ]

يُطلق على التفاعل العكسي للفسفرة اسم إزالة الفسفرة ، ويتم تحفيزه بواسطة فوسفاتازات البروتين . تعمل كينازات البروتين والفوسفاتازات بشكل مستقل ومتوازن لتنظيم وظيفة البروتينات. [ 3 ]

الأحماض الأمينية الأكثر شيوعًا في الفسفرة هي السيرين ، والثريونين ، والتيروسين ، والهيستيدين . [ 4 ] [ 5 ] تلعب هذه الفسفرة أدوارًا مهمة وموصوفة جيدًا في مسارات الإشارات وعمليات الأيض . مع ذلك، يمكن أيضًا فسفرة أحماض أمينية أخرى بعد الترجمة، بما في ذلك الأرجينين ، واللايسين ، وحمض الأسبارتيك ، وحمض الجلوتاميك، والسيستين . وقد تم تحديد وجود هذه الأحماض الأمينية المفسفرة في مستخلصات الخلايا البشرية والخلايا البشرية المثبتة باستخدام مزيج من التحليل القائم على الأجسام المضادة (للهيستيدين) وقياس الطيف الكتلي (لجميع الأحماض الأمينية الأخرى). [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]

أُبلغ عن فسفرة البروتين لأول مرة عام 1906 على يد فوبوس ليفين في معهد روكفلر للأبحاث الطبية باكتشافه بروتين الفيتيلين المفسفر . [ 9 ] ومع ذلك، استغرق الأمر ما يقرب من 50 عامًا حتى تم اكتشاف الفسفرة الإنزيمية للبروتينات بواسطة كينازات البروتين . [ 10 ]

تاريخ

اكتُشف البروتين الغني بالفوسفات في وقت مبكر. ففي عام 1906، درس ليفين وألسبرغ نواتج تحلل بروتين فيتيلين صفار البيض ، وأظهرا إمكانية الحصول على جزء بروتيني غني بالفوسفور منه. [ 9 ] وفي عام 1933، اكتشف فريتز ليبمان الفوسفوسيرين في الكازين . [ 11 ] وفي عام 1948، عُزل بروتين غني بالفوسفات بشكل خاص من صفار البيض، وسُمّي فوسفيتين . [ 12 ]

اكتُشفت إنزيمات الفوسفوريلاز لاحقًا. اكتشف كارل وجيرتي كوري أول إنزيم فوسفوريلاز في أواخر ثلاثينيات القرن العشرين. وجد كارل وجيرتي كوري شكلين من فوسفوريلاز الجليكوجين أطلقا عليهما اسمي A وB، لكنهما لم يفهما آلية تحويل الشكل B إلى الشكل A فهمًا صحيحًا. في عام 1954، اكتُشف إنزيم آخر ينقل الفوسفات من جزيء ATP إلى بروتين. [ 10 ] لكن وظيفته الفيزيولوجية ظلت مجهولة آنذاك.

أصبح فسفرة الجليكوجين مفهومًا بشكل أفضل لاحقًا. وصف إدموند فيشر وإدوين كريبس التحول المتبادل بين فوسفوريلاز b وفوسفوريلاز a ، والذي يتضمن آلية فسفرة/إزالة فسفرة. [ 13 ] وُجد أن إنزيمًا يُسمى كيناز الفوسفوريلاز وMg-ATP ضروريان لفسفرة فوسفوريلاز الجليكوجين، وذلك بالمساعدة في نقل مجموعة غاما-فوسفوريل من ATP إلى بقايا سيرين على فوسفوريلاز b. يستطيع بروتين فوسفاتاز 1 تحفيز إزالة الفسفرة من الإنزيمات المفسفرة عن طريق إزالة مجموعة الفوسفات.

اكتشف ساذرلاند وكوريس أن الإبينفرين يعمل عن طريق تنشيط الفوسفوريلاز، مما يؤدي إلى تكوين الجلوكوز من الجليكوجين. ثم درس ساذرلاند الآلية ووجد أن زيادة تكوين الفوسفوريلاز في الكبد تتوسطها مادة معينة، سُميت فيما بعد cAMP . [ 14 ]

في ذلك الوقت، كانت هذه الوظيفة الفسيولوجية الوحيدة المعروفة للفسفرة الإنزيمية، كآلية تحكم فسيولوجية لمسار أيضي واحد ، حتى عام 1969، عندما اكتُشف أن مُركّب نازعة هيدروجين البيروفات الميتوكوندري يُعطَّل عن طريق الفسفرة. [ 15 ] وفي سبعينيات القرن العشرين أيضًا، صِيغ مصطلح الفسفرة متعددة المواقع ، لوصف الاكتشاف الجديد بأن بعض البروتينات تُفسفر على اثنين أو أكثر من البقايا بواسطة اثنين أو أكثر من الكينازات. [ 16 ]

في عام 1975، تبين أن بروتينات الكيناز المعتمدة على cAMP تقوم بفسفرة بقايا السيرين على أنماط تسلسل الأحماض الأمينية المحددة. اكتشف راي إريكسون أن v-Src هو كيناز، ووجد توني هنتر أن v-Src يقوم بفسفرة بقايا التيروسين على البروتينات في سبعينيات القرن الماضي. [ 17 ]

في أوائل ثمانينيات القرن العشرين، تم تحديد تسلسل الأحماض الأمينية لأول بروتين كيناز، مما ساعد علماء الوراثة على فهم وظائف الجينات التنظيمية. وفي أواخر الثمانينيات وأوائل التسعينيات، تم تنقية أول بروتين فوسفاتاز التيروزين (PTP1B)، كما تم اكتشاف واستنساخ كينازات JAK ، مما دفع الكثيرين في المجتمع العلمي إلى تسمية التسعينيات بعقد كينازات البروتين المتسلسلة. [ 18 ] [ 19 ] مُنح إدموند فيشر وإدوين كريبس جائزة نوبل عام 1992 "لاكتشافاتهما المتعلقة بفسفرة البروتين العكسية كآلية تنظيم بيولوجية". [ 20 ]

وفرة

يُعدّ الفسفرة العكسية للبروتينات ظاهرةً شائعةً في كلٍّ من بدائيات النوى، وأكثر شيوعًا في حقيقيات النوى . [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] فعلى سبيل المثال، يُعتقد أن 5-10% من جميع البروتينات في البكتيريا مُفسفرة. [ 25 ] [ 26 ] في المقابل، يُقدّر أن ثلث جميع البروتينات البشرية مُفسفرة في أي وقت، مع وجود 230,000 و156,000 و40,000 موقع فسفرة فريد في الإنسان والفأر والخميرة على التوالي. [ 2 ] في الخميرة، يتسبب حوالي 120 كينازًا (من أصل 6,000 بروتين تقريبًا) في 8,814 حدث فسفرة مُنظّم معروف، مما يُنتج حوالي 3,600 بروتين مُفسفر (حوالي 60% من جميع بروتينات الخميرة). [ 27 ] [ 28 ] لذا، يُعدّ الفسفرة آلية تنظيمية عامة تؤثر على جزء كبير من البروتينات. حتى لو لم يكن البروتين نفسه مُفسفرًا، فقد تُنظَّم تفاعلاته مع البروتينات الأخرى عن طريق فسفرة هذه البروتينات المتفاعلة.

آليات ووظائف الفسفرة

تُدخل الفسفرة مجموعةً مشحونةً ومحبةً للماء في السلسلة الجانبية للأحماض الأمينية، مما قد يُغير بنية البروتين عن طريق تعديل التفاعلات مع الأحماض الأمينية المجاورة. تحتوي بعض البروتينات، مثل p53 ، على مواقع فسفرة متعددة، مما يُسهل تنظيمًا معقدًا ومتعدد المستويات. نظرًا لسهولة فسفرة البروتينات وإزالة الفسفرة منها، يُعد هذا النوع من التعديل آليةً مرنةً للخلايا للاستجابة للإشارات الخارجية والظروف البيئية. [ 29 ]

تقوم الكينازات بفسفرة البروتينات، بينما تقوم الفوسفاتازات بإزالة الفسفرة منها. يتم تنشيط أو تعطيل العديد من الإنزيمات والمستقبلات عن طريق الفسفرة وإزالة الفسفرة. تؤدي الفسفرة العكسية إلى تغيير في بنية العديد من الإنزيمات والمستقبلات ، مما يؤدي إلى تنشيطها أو تعطيلها. تحدث الفسفرة عادةً على بقايا السيرين ، والثريونين ، والتيروسين، والهيستيدين في البروتينات حقيقية النواة. ويبدو أن فسفرة الهيستيدين في البروتينات حقيقية النواة أكثر شيوعًا من فسفرة التيروسين . [ 30 ] أما في البروتينات بدائية النواة ، فتحدث الفسفرة على بقايا السيرين، والثريونين، والتيروسين، والهيستيدين، والأرجينين ، أو الليسين. [ 21 ] [ 22 ] [ 30 ] [ 31 ] يمكن لإضافة جزيء فوسفات (PO43- ) إلى مجموعة R غير قطبية في بقايا حمض أميني أن تحوّل جزءًا كارهًا للماء من البروتين إلى جزء قطبي ومحب للماء للغاية. وبهذه الطريقة، يمكن لديناميكيات البروتين أن تُحدث تغييرًا في بنيته الفراغية عبر التفاعل التآزري بعيد المدى مع بقايا أخرى كارهة للماء ومحبة للماء في البروتين.

من الأمثلة على الدور التنظيمي الذي يلعبه الفسفرة بروتين p53 الكابت للورم. يخضع بروتين p53 لتنظيم دقيق [ 32 ] ويحتوي على أكثر من 18 موقع فسفرة مختلف. يمكن أن يؤدي تنشيط p53 إلى توقف دورة الخلية، وهو ما يمكن عكسه في بعض الحالات، أو إلى موت الخلية المبرمج [ 33 ] . يحدث هذا النشاط فقط في حالات تلف الخلية أو اضطراب وظائفها الحيوية لدى الأفراد الأصحاء.

عند تلقي إشارة التعطيل، يُزال الفسفرة من البروتين مرة أخرى ويتوقف عن العمل. [ 34 ] هذه هي الآلية المتبعة في العديد من أشكال نقل الإشارة ، على سبيل المثال الطريقة التي تتم بها معالجة الضوء الوارد في الخلايا الحساسة للضوء في شبكية العين .

تشمل الأدوار التنظيمية للفسفرة ما يلي:

النقل عبر الأغشية

تحلل البروتين

تنظيم الإنزيمات (التنشيط والتثبيط)

  • كان إنزيم فوسفوريلاز الجليكوجين أول مثال يُكتشف لتنظيم البروتين عن طريق الفسفرة . وقد وصف العالمان الحائزان على جائزة نوبل ، إدموند إتش. فيشر وإدوين جي. كريبس ، كيف أن فسفرة فوسفوريلاز الجليكوجين ب تحوله إلى فوسفوريلاز الجليكوجين أ النشط. وسرعان ما اكتُشف أن إنزيم سينثاز الجليكوجين، وهو إنزيم أيضي آخر، يُعطَّل عن طريق الفسفرة. [ 39 ]
  • فسفرة إنزيم GSK-3 بواسطة AKT (بروتين كيناز B) كجزء من مسار إشارات الأنسولين. [ 35 ]
  • يؤدي فسفرة كيناز التيروسين Src بواسطة كيناز Src الطرفي C إلى تعطيل Src عن طريق إحداث تغيير في التكوين يحجب نطاق الكيناز الخاص به. [ 36 ]
  • يُعدّ فسفرة هيستونات H2AX على السيرين 139، ضمن مليوني قاعدة (0.03% من الكروماتين) المحيطة بكسر مزدوج في الحمض النووي، ضروريًا لإصلاح هذا الكسر. [ 40 ] كما أن فسفرة إنزيم ميثيل بيورين دي إن إيه جليكوزيلاز على السيرين 172 ضرورية لإصلاح تلف القواعد المؤلكلة عن طريق استئصال القاعدة. [ 41 ]

التفاعلات بين البروتينات

  • تلعب فسفرة المكونات السيتوبلازمية لأكسيداز NADPH ، وهو إنزيم متعدد البروتينات كبير مرتبط بالغشاء موجود في الخلايا البلعمية ، دورًا مهمًا في تنظيم التفاعلات بين البروتينات في الإنزيم. [ 42 ]
  • مهم في تحلل البروتين.
    • في أواخر التسعينيات، تبيّن أن فسفرة بعض البروتينات تؤدي إلى تحللها عبر مسار اليوبيكويتين /البروتيازوم المعتمد على الأدينوسين ثلاثي الفوسفات. وتصبح هذه البروتينات المستهدفة ركائز لإنزيمات اليوبيكويتين ليغاز E3 معينة فقط عند فسفرتها.

شبكات الإشارة

قد يكون توضيح أحداث الفسفرة في مسارات الإشارات الخلوية المعقدة أمرًا صعبًا. ففي هذه المسارات، يقوم البروتين A بفسفرة البروتين B، ثم يقوم B بفسفرة البروتين C. بينما في مسار إشارات آخر، يقوم البروتين D بفسفرة البروتين A، أو البروتين C. وقد استُخدمت مناهج شاملة، مثل علم البروتينات المفسفرة (دراسة البروتينات المفسفرة، وهو فرع من علم البروتينات )، بالإضافة إلى علم البروتينات القائم على قياس الطيف الكتلي ، لتحديد وقياس التغيرات الديناميكية في البروتينات المفسفرة بمرور الوقت. وتكتسب هذه التقنيات أهمية متزايدة في التحليل المنهجي لشبكات الفسفرة المعقدة. [ 43 ] وقد استُخدمت بنجاح لتحديد التغيرات الديناميكية في حالة فسفرة أكثر من 6000 موقع بعد التحفيز بعامل نمو البشرة . [ 44 ] وهناك منهج آخر لفهم شبكة الفسفرة، وهو قياس التفاعلات الجينية بين العديد من البروتينات المفسفرة وأهدافها. يكشف هذا عن أنماط تفاعلات متكررة مثيرة للاهتمام - أنماط شبكية. [ 45 ] وقد طُوِّرت أساليب حسابية لنمذجة شبكات الفسفرة [ 46 ] [ 47 ] والتنبؤ باستجاباتها في ظل اضطرابات مختلفة. [ 48 ]

فسفرة الهستونات

يُنظَّم الحمض النووي في حقيقيات النوى بواسطة بروتينات الهيستون في مركبات محددة تُسمى الكروماتين. تُسهِّل بنية الكروماتين عملية تغليف وتنظيم وتوزيع الحمض النووي في حقيقيات النوى. مع ذلك، فإنها تُؤثر سلبًا على العديد من العمليات البيولوجية الأساسية، مثل النسخ والتضاعف وإصلاح الحمض النووي، وذلك بتقييد وصول بعض الإنزيمات والبروتينات. وقد أظهرت الدراسات أن التعديلات اللاحقة للترجمة على الهيستونات، مثل فسفرة الهيستون، تُعدِّل بنية الكروماتين عن طريق تغيير تفاعلات البروتين مع الحمض النووي أو تفاعلات البروتين مع البروتين. [ 49 ] تُعدِّل التعديلات اللاحقة للترجمة على الهيستونات بنية الكروماتين. وتحدث فسفرة الهيستون، وهي الأكثر شيوعًا، أثناء استجابات الخلايا لتلف الحمض النووي، حيث يفصل الهيستون H2A المُفسفر نطاقات كروماتينية كبيرة حول موقع كسر الحمض النووي. [ 50 ] وقد بحث الباحثون فيما إذا كانت تعديلات الهيستونات تُؤثر بشكل مباشر على عملية النسخ التي يُوجِّهها بوليميراز الحمض النووي الريبي II. اختار الباحثون بروتينات معروفة بتعديل الهستونات لاختبار تأثيرها على عملية النسخ، ووجدوا أن الكيناز المُحفَّز بالإجهاد، MSK1، يُثبِّط تخليق الحمض النووي الريبوزي (RNA). وكان تثبيط النسخ بواسطة MSK1 أكثر فعالية عندما كان قالب الحمض النووي موجودًا في الكروماتين، حيث كانت قوالب الحمض النووي غير الموجودة في الكروماتين مقاومة لتأثيرات MSK1. وقد تبيَّن أن MSK1 يُفسفر الهستون H2A على السيرين 1، وأن استبدال السيرين 1 بالألانين يمنع تثبيط النسخ بواسطة MSK1. وبالتالي، تشير النتائج إلى أن أستلة الهستونات يمكن أن تُحفِّز النسخ عن طريق كبح الفسفرة المُثبِّطة بواسطة كيناز مثل MSK1. [ 51 ]

الكينازات

يمكن أن تحدث الفسفرة داخل البروتين على عدة أحماض أمينية . يُعتقد أن الفسفرة على السيرين هي الأكثر شيوعًا، تليها الفسفرة على الثريونين. أما الفسفرة على التيروسين فهي نادرة نسبيًا، لكنها تقع في مقدمة العديد من مسارات إشارات فسفرة البروتين (مثل مستقبلات التيروسين كيناز) في معظم حقيقيات النوى. تؤدي الفسفرة على الأحماض الأمينية، مثل السيرين والثريونين والتيروسين، إلى تكوين بروتين مُفسفر، عندما تتفاعل مجموعة الفوسفات في هذا البروتين مع مجموعة الهيدروكسيل (-OH) في السلسلة الجانبية للسيرين أو الثريونين أو التيروسين في تفاعل أسترة . [ 52 ] ومع ذلك، نظرًا لسهولة تنقية البروتينات المُفسفرة على التيروسين باستخدام الأجسام المضادة ، فإن مواقع فسفرة التيروسين مفهومة جيدًا نسبيًا. تحدث فسفرة الهيستيدين والأسبارتات في بدائيات النوى كجزء من نظام الإشارات ثنائي المكونات ، وفي بعض الحالات في حقيقيات النوى ضمن مسارات نقل الإشارة. يُعد تحليل الهيستيدين المفسفر باستخدام الطرق الكيميائية الحيوية القياسية وقياس الطيف الكتلي أكثر صعوبة من تحليل السيرين أو الثريونين أو التيروسين. [ 53 ] [ 7 ] [ 5 ] و [ 54 ] في بدائيات النوى والعتائق وبعض حقيقيات النوى الدنيا، يعمل نيتروجين الهيستيدين ككاشف نيوكليوفيلي ويرتبط بمجموعة فوسفات. [ 55 ] بمجرد فسفرة الهيستيدين، يحفز النطاق التنظيمي لمنظم الاستجابة نقل الفوسفات إلى الأسبارتات.

مستقبلات التيروزين كيناز

يُظهر مستقبل التيروزين كيناز AXL تناظر المستقبلات المتماثلة

على الرغم من أن فسفرة التيروسين نادرة نسبيًا، إلا أنها تحظى بدراسة وافية نظرًا لسهولة تنقية التيروسين المفسفر باستخدام الأجسام المضادة. تُعد مستقبلات التيروسين كيناز عائلة مهمة من مستقبلات سطح الخلية، وتشارك في نقل الإشارات خارج الخلوية، مثل الهرمونات وعوامل النمو والسيتوكينات. يرتبط الليجاند بمستقبل التيروسين كيناز أحادي الوحدة، مما يُثبّت التفاعلات بين وحدتين أحاديتين لتكوين ثنائي ، وبعد ذلك يقوم المستقبلان المرتبطان بفسفرة بقايا التيروسين بشكل غير مباشر . تُفعّل فسفرة المستقبل وتنشيطه مسارًا إشاريًا من خلال النشاط الإنزيمي والتفاعلات مع البروتينات المُكيّفة. [ 56 ] يُعدّ الإرسال الإشاري عبر مستقبل عامل نمو البشرة (EGFR) ، وهو مستقبل تيروسين كيناز، بالغ الأهمية لتطور العديد من أجهزة الجسم، بما في ذلك الجلد والرئة والقلب والدماغ. ويُلاحظ فرط الإرسال الإشاري عبر مسار EGFR في العديد من أنواع السرطان البشري. [ 57 ]

الكينازات المعتمدة على السيكلين

الكينازات المعتمدة على السيكلين (CDKs) هي كينازات سيرين-ثريونين تُنظم تقدم دورة الخلية في حقيقيات النوى . وتكون هذه الكينازات نشطة تحفيزيًا فقط عند ارتباطها بسيكلين مُنظم . تحتوي الخلايا الحيوانية على تسعة أنواع مختلفة على الأقل من الكينازات المعتمدة على السيكلين، والتي ترتبط بسيكلينات متنوعة بدرجة عالية من التخصص. تعمل مثبطات الكينازات المعتمدة على السيكلين (CKIs) على تثبيط نشاط الكيناز في مُركب السيكلين-CDK لإيقاف دورة الخلية في المرحلة G1 أو استجابةً للإشارات البيئية أو تلف الحمض النووي. يُنشط نشاط الكينازات المعتمدة على السيكلين المختلفة مسارات إشارات الخلية وعوامل النسخ التي تُنظم أحداثًا رئيسية في الانقسام المتساوي، مثل الانتقال من المرحلة G1 إلى المرحلة S. تُوفر مُركبات السيكلين-CDK السابقة الإشارة لتنشيط مُركبات السيكلين-CDK اللاحقة. [ 58 ]

المواقع

يوجد آلاف من مواقع الفسفرة المتميزة في الخلية الواحدة، وذلك للأسباب التالية:

  1. يوجد آلاف البروتينات في أي خلية معينة.
  2. تشير التقديرات إلى أن ما بين 1/10 إلى 1/2 من البروتينات يتم فسفرتها في بعض الحالات الخلوية.
  3. قد تخضع نسبة تتراوح بين 30 و65% من البروتينات في البشر ونحو 50% من البروتينات في الخميرة لعملية الفسفرة. [ 19 ] [ 2 ]
  4. يُقدّر عدد مواقع الفسفرة في الإنسان والفأر والخميرة بنحو 230,000 و156,000 و40,000 موقع على التوالي. [ 2 ]
  5. غالباً ما تحدث عملية الفسفرة في مواقع متعددة ومختلفة على بروتين معين.

بما أن فسفرة أي موقع على بروتين معين قد تُغير وظيفته أو موضعه، فإن فهم "حالة" الخلية يتطلب معرفة حالة فسفرة بروتيناتها. على سبيل المثال، بشكل عام، إذا كان الحمض الأميني سيرين-473 في بروتين AKT مُفسفرًا، فإن AKT يكون نشطًا وظيفيًا ككيناز، وإذا لم يكن مُفسفرًا، فإن AKT يكون كينازًا غير نشط.

تُعدّ مواقع الفسفرة ضرورية للبروتينات ونقلها ووظائفها. وهي عبارة عن تعديل تساهمي للبروتينات من خلال فسفرة عكسية. وهذا يُتيح للبروتينات البقاء داخل الخلية، حيث يمنع موقع الفسفرة السالب نفاذيتها عبر الغشاء الخلوي. كما تُتيح إزالة الفسفرة من البروتين للخلية تجديد الفوسفات من خلال إطلاق البيروفوسفات، مما يُوفر استهلاك ATP في الخلية. [ 59 ] ومن الأمثلة على إنزيمات الفسفرة بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli ). إذ تحتوي هذه البكتيريا على إنزيم الفوسفاتاز القلوي في المنطقة المحيطة بالبلازم من غشائها. ويُعدّ الغشاء الخارجي نفاذاً للجزيئات المُفسفرة، بينما يكون الغشاء السيتوبلازمي الداخلي غير نفاذ بسبب الشحنات السالبة الكبيرة. [ 60 ] وبهذه الطريقة، تُخزّن بكتيريا الإشريكية القولونية البروتينات والبيروفوسفات في غشائها المحيط بالبلازم إلى حين الحاجة إليها داخل الخلية.

أدى التقدم الحديث في تحديد البروتينات الفوسفورية إلى اكتشاف عدد لا يحصى من مواقع الفسفرة في البروتينات. وقد استلزم ذلك وجود وسيط متكامل لبيانات يسهل الوصول إليها، حيث تُنظَّم مواقع الفسفرة المعروفة في البروتينات. تم إنشاء قاعدة بيانات مُنسَّقة باسم dbPAF، تحتوي على مواقع الفسفرة المعروفة في الإنسان (H. sapiensوالفأر (M. musculus) ، والجرذ النرويجي (R. norvegicus) ، وذبابة الفاكهة ( D. melanogaster ) ، والديدان الأسطوانية (C. elegans) ، والخميرة الانشطارية (S. pombe) ، والخميرة الجعوية (S. cerevisiae) . تضم قاعدة البيانات حاليًا 294,370 موقع فسفرة غير متكرر لـ 40,432 بروتينًا. [ 61 ] تشمل الأدوات الأخرى للتنبؤ بالفسفرة في البروتينات NetPhos [ 62 ] للكائنات حقيقية النواة، وNetPhosBac [ 62 ] للبكتيريا، وViralPhos [ 63 ] للفيروسات.

السيرين والثريونين

توجد مجموعة كبيرة ومتنوعة من بقايا السيرين، ويمكن أن يؤدي فسفرة كل بقايا إلى عواقب أيضية مختلفة.

  • يُعدّ بروتين كيناز N1 مسؤولاً عن فسفرة عامل مستقبل عامل نخر الورم (TRAF1) على السيرين 139 في ظروف محددة. كما يُفسفر TRAF1 الفأري بواسطة نفس الكيناز، مما يؤدي إلى تثبيط نشاط IKK/NF-κB. ويمكن إزالة الفسفرة على السيرين 139 باستبدال TRAF1 ببقايا ألانين، مما يؤدي بالتالي إلى تحسين استقطاب TBK1. [ 64 ]
  • عند بقايا السيرين 789، يتم فسفرة FGFR1 بواسطة RSK2 عندما يكون الكيناز في حالته النشطة. ويمكن أن تضعف الفسفرة قدرات الإشارة لـ FGFR1 عند موقع السيرين 777. وقد رُبط كل من السيرين 1047 والسيرين 1048 بانخفاض ألفة ارتباط إنزيم يوبيكويتين ليغاز c-Cbl بـ EFGR عند فسفرتهما. [ 65 ]
  • عندما يتم فسفرة السيرين 349، تتعزز قوة الارتباط بين معقد البروتين p62 والبروتين Keap1، وهو ما يرتبط بالاستجابة للإجهاد. [ 66 ]
  • عندما يتم فسفرة السيرين 337 بواسطة بروتين كيناز A في المختبر، تزداد كفاءة ارتباط الحمض النووي للوحدة الفرعية p50 من NF-κB بشكل كبير. [ 67 ]

من المعروف أن فسفرة بقايا السيرين والثريونين تتداخل مع تعديل O -GlcNAc لبقايا السيرين والثريونين.

التيروسين

يُعدّ فسفرة التيروسين تفاعلًا سريعًا وعكوسًا، وهو أحد الآليات التنظيمية الرئيسية في نقل الإشارات . وتُحافظ فسفرة التيروسين على نمو الخلايا وتمايزها وهجرتها واستتبابها الأيضي ، وهي عمليات خلوية . وتعمل كينازات بروتين التيروسين وفوسفاتاز بروتين التيروسين على موازنة مستوى فسفرة التيروسين على أي بروتين. وقد رُبط خلل سلاسل محددة من كينازات بروتين التيروسين وفوسفاتاز بروتين التيروسين بالعديد من الأمراض البشرية، مثل السمنة ومقاومة الأنسولين وداء السكري من النوع الثاني . [ 68 ] تحدث فسفرة التيروسين في حقيقيات النوى، وأنواع بكتيرية مُختارة، وتوجد أيضًا في بدائيات النوى. وتُحافظ فسفرة التيروسين على التنظيم الخلوي في البكتيريا، على غرار وظيفتها في حقيقيات النوى. [ 69 ]

أرجينين

يُعد فسفرة الأرجينين في العديد من البكتيريا موجبة الجرام علامة على البروتينات لتحللها بواسطة بروتياز Clp . [ 38 ]

الفسفرة غير التقليدية على الهيستيدين، والأسبارتات، والسيستين، والغلوتامات، والأرجينين، والليسين في الخلايا البشرية

يحدث فسفرة واسعة النطاق للبروتينات البشرية على العديد من الأحماض الأمينية غير التقليدية، بما في ذلك الأنماط التي تحتوي على الهيستيدين المفسفر (الموقعين 1 و3)، والأسبارتات، والسيستين، والغلوتامات، والأرجينين، والليسين في مستخلصات خلايا هيلا. ونظرًا لعدم استقرار هذه البقايا المفسفرة كيميائيًا وحراريًا، فإن إجراءات خاصة وتقنيات فصل ضرورية لحفظها جنبًا إلى جنب مع فسفرة السيرين، والثريونين، والتيروسين "الكلاسيكية" المستقرة حراريًا. [ 70 ]

الكشف والتمييز

يمكن استخدام الأجسام المضادة كأداة فعّالة للكشف عما إذا كان البروتين مُفسفرًا في موقع مُحدد. ترتبط الأجسام المضادة بالبروتين وتكشف عن التغيرات البنيوية الناتجة عن الفسفرة. تُسمى هذه الأجسام المضادة بالأجسام المضادة المُخصصة للفسفرة، ويتوفر منها حاليًا المئات. وقد أصبحت هذه الأجسام المضادة من الكواشف الأساسية في كلٍ من البحوث الأساسية والتشخيص السريري.

مثال على التعديل ما بعد الترجمة الذي تم اكتشافه على هلام ثنائي الأبعاد (تم تحديد حدود البقع بواسطة برنامج التحليل، والتعرف عليها بواسطة مطياف الكتلة، P46462 هو معرف البروتين في Expasy)

يمكن الكشف بسهولة عن نظائر التعديلات ما بعد الترجمة (PTM) على هلامات ثنائية الأبعاد . في الواقع، يستبدل الفسفرة مجموعات الهيدروكسيل المتعادلة على السيرين أو الثريونين أو التيروسين بمجموعات فوسفات سالبة الشحنة ذات قيم pK قريبة من 1.2 و 6.5. وبالتالي، عند درجة حموضة أقل من 5.5، تضيف الفوسفات شحنة سالبة واحدة؛ وعند درجة حموضة قريبة من 6.5، تضيف 1.5 شحنة سالبة؛ وعند درجة حموضة أعلى من 7.5، تضيف شحنتين سالبتين. كما يمكن تحديد الكمية النسبية لكل نظير بسهولة وسرعة من خلال شدة التلوين على هلامات ثنائية الأبعاد.

في بعض الحالات المحددة جدًا، يُمكن الكشف عن الفسفرة من خلال تغير في حركة البروتين الكهربائية على هلامات SDS-PAGE أحادية البعد، كما هو موضح، على سبيل المثال، بالنسبة لمنشط النسخ المساعد بواسطة كوفاكس وآخرون [ 71 ] . يُعتقد أن التغيرات البنيوية القوية المرتبطة بالفسفرة (والتي تستمر في المحاليل المحتوية على المنظفات) هي السبب وراء هذه الظاهرة. تندرج معظم مواقع الفسفرة التي وُصفت فيها هذه التغيرات في الحركة ضمن فئة مواقع SP وTP (أي أن بقايا البرولين تلي بقايا السيرين أو الثريونين المفسفرة).

استُخدمت تحليلات مطياف الكتلة واسعة النطاق لتحديد مواقع فسفرة البروتينات. نُشرت عشرات الدراسات، حددت كل منها آلاف المواقع، العديد منها لم يُوصف سابقًا. [ 72 ] [ 73 ] يُعد مطياف الكتلة مثاليًا لمثل هذه التحليلات باستخدام تجزئة HCD أو ETD ، حيث تؤدي إضافة الفسفرة إلى زيادة في كتلة البروتين وبقايا البروتين المفسفرة. تتطلب هذه الدراسات أجهزة مطياف كتلة متطورة وعالية الدقة، مما يحد من استخدام هذه التقنية في المختبرات التي تمتلك أجهزة مطياف كتلة متطورة. مع ذلك، لا يزال تحليل الببتيدات المفسفرة بواسطة مطياف الكتلة ليس بالسهولة نفسها لتحليل الببتيدات "العادية" غير المعدلة. طُوّرت تقنية EThcD التي تجمع بين نقل الإلكترون وتفكك التصادم عالي الطاقة. بالمقارنة مع طرق التجزئة المعتادة، توفر تقنية EThcD أطياف MS/MS أكثر إفادة لتحديد موقع الفسفرة بدقة. [ 74 ]

يُعدّ التوصيف الدقيق لمواقع الفسفرة أمرًا بالغ الصعوبة، ويتطلب قياس كمية فسفرة البروتين باستخدام مطياف الكتلة استخدام معايير داخلية نظائرية. [ 75 ] ويمكن الحصول على قياس كمي نسبي باستخدام مجموعة متنوعة من تقنيات الوسم النظائري التفاضلي. [ 76 ] كما توجد عدة طرق لقياس كمية فسفرة البروتين، بما في ذلك المقايسات المناعية الفلورية، والترحيل الحراري على نطاق ميكروي ، ونقل طاقة الرنين الفلوري (FRET) ، والتألق الزمني الفلوري (TRF)، واستقطاب الفلورة، وإخماد الفلورة، وانزياح الحركة، والكشف القائم على الخرز، والتقنيات الخلوية. [ 77 ] [ 78 ]

في حالة البروتينات غير المنتظمة بنيويًا (IDPs)، يمكن استخدام المناهج الطوبولوجية لتحديد تحولات الحالة التركيبية عند الفسفرة. يمكن أن تتخذ هذه البروتينات حالات غير منتظمة ممتدة أو مضغوطة طوبولوجيًا. في مستقبلات الجلوكوكورتيكويد، يتغير شغل هذه الحالات عند الفسفرة، وهو ما يمكن رصده باستخدام المناهج الطوبولوجية. [ 79 ]

تطور

يُعدّ فسفرة البروتينات عملية شائعة في جميع فروع الحياة، بما في ذلك جميع الحيوانات والنباتات والفطريات والبكتيريا والعتائق. تعود أصول آليات فسفرة البروتينات إلى أسلافها، وقد تباينت بشكل كبير بين الأنواع المختلفة. في حقيقيات النوى، يُقدّر أن ما بين 30 و65% من جميع البروتينات قد تكون مُفسفرة، مع وجود عشرات أو حتى مئات الآلاف من مواقع الفسفرة المتميزة. [ 80 ] [ 2 ] يبدو أن بعض مواقع الفسفرة قد تطورت كمفاتيح "إيقاف" مشروطة، تُعطّل الموقع النشط للإنزيم، كما هو الحال في إنزيم إيزوسيترات ديهيدروجينيز الأيضي بدائيات النوى. مع ذلك، في حالة البروتينات التي يجب فسفرتها لتكون نشطة، يبقى من غير الواضح كيف نشأت من أسلاف غير مُفسفرة. وقد ثبت أن مجموعة فرعية من مواقع فسفرة السيرين غالبًا ما تُستبدل ببقايا حمضية مثل الأسبارتات والغلوتامات بين الأنواع المختلفة. يمكن لهذه البقايا الأنيونية أن تتفاعل مع البقايا الكاتيونية مثل الليسين والأرجينين لتكوين جسور ملحية ، وهي تفاعلات غير تساهمية مستقرة تُغير بنية البروتين. غالبًا ما تشارك مواقع الفسفرة هذه في الجسور الملحية، مما يشير إلى أن بعض مواقع الفسفرة تطورت كمفاتيح تشغيل مشروطة للجسور الملحية، مما يسمح لهذه البروتينات باتخاذ هيئة نشطة فقط استجابةً لإشارة محددة. [ 81 ]

يوجد حوالي 600 نوع معروف من كينازات البروتين في حقيقيات النوى، مما يجعلها إحدى أكبر عائلات الجينات في حقيقيات النوى. تتم معظم عمليات الفسفرة بواسطة عائلة فائقة واحدة من كينازات البروتين التي تشترك في نطاق كيناز محفوظ. تُعد فسفرة البروتين محفوظة بشكل كبير في المسارات المركزية لبقاء الخلية، مثل تقدم دورة الخلية الذي يعتمد على كينازات السيكلين المعتمدة (CDKs)، ولكن مواقع الفسفرة الفردية غالبًا ما تكون مرنة. غالبًا ما تحتوي أهداف فسفرة CDK على مواقع فسفرة في أجزاء غير منتظمة ، والتي توجد في مواقع غير متطابقة حتى في الأنواع المتقاربة. على العكس من ذلك، فإن أهداف فسفرة CDK في المناطق المحددة هيكليًا تكون أكثر حفظًا. في حين أن نشاط CDK ضروري لنمو الخلية وبقائها في جميع حقيقيات النوى، فإن عددًا قليلًا جدًا من مواقع الفسفرة يُظهر حفظًا قويًا لمواقعها الدقيقة. من المرجح أن يكون التموضع ذا أهمية بالغة للفوسفات التي تنظم بنية البروتين بشكل غير مباشر، ولكنه أكثر مرونة بالنسبة للفوسفات التي تتفاعل مع نطاقات ربط الببتيد الفوسفوري لاستقطاب البروتينات التنظيمية. [ 82 ]

مقارنات بين حقيقيات النوى وبدائيات النوى

يُعدّ فسفرة البروتين تعديلًا عكسيًا يحدث بعد الترجمة للبروتينات. في حقيقيات النوى، تؤدي فسفرة البروتين وظائف مهمة في الإشارات الخلوية، والتعبير الجيني، والتمايز. كما أنها تُشارك في تضاعف الحمض النووي خلال دورة الخلية، وفي الآليات التي تُعالج حالات توقف التضاعف الناتجة عن الإجهاد. بالمقارنة مع حقيقيات النوى، تستخدم بدائيات النوى كينازات وفوسفاتازات من نوع هانكس لنقل الإشارات. ولا يزال من غير الواضح ما إذا كانت فسفرة البروتينات في البكتيريا قادرة على تنظيم عمليات مثل إصلاح الحمض النووي أو تضاعفه. [ 83 ]

بالمقارنة مع فسفرة البروتينات في بدائيات النوى، حظيت دراسات فسفرة البروتينات في حقيقيات النوى، بدءًا من الخميرة وصولًا إلى الخلايا البشرية، باهتمام واسع. من المعروف أن حقيقيات النوى تعتمد على فسفرة مجموعة الهيدروكسيل على السلاسل الجانبية للسيرين والثريونين والتيروسين في الإشارات الخلوية. تُعد هذه التعديلات التنظيمية الرئيسية بعد الترجمة في خلايا حقيقيات النوى، بينما لم تحظَ فسفرة البروتينات في بدائيات النوى بنفس القدر من الدراسة. في حين أن السيرين والثريونين والتيروسين تُفسفر في حقيقيات النوى، فإن الهيستيدين والأسبارتات يُفسفران في كل من بدائيات النوى وحقيقيات النوى. في البكتيريا، تحدث فسفرة الهيستيدين في أنظمة الفوسفوتراسفيراز المعتمدة على الفوسفينول بيروفات (PTSs)، والتي تُشارك في عملية الاستيعاب الداخلي بالإضافة إلى فسفرة السكريات. [ 84 ]

تم إثبات فسفرة البروتين بواسطة كيناز البروتين لأول مرة في بكتيريا الإشريكية القولونية والسالمونيلا التيفية ، ومنذ ذلك الحين تم إثباتها في العديد من الخلايا البكتيرية الأخرى. [ 85 ] وقد وُجد أن البكتيريا تستخدم فسفرة الهيستيدين والأسبارتات كنموذج لنقل الإشارات البكتيرية. كما توجد فسفرة السيرين والثريونين والتيروسين في البكتيريا. تحمل البكتيريا كينازات وفوسفاتازات مشابهة لتلك الموجودة في نظيراتها حقيقية النواة، كما طورت كينازات وفوسفاتازات فريدة غير موجودة في حقيقيات النوى. [ 84 ]

علم الأمراض

وقد تم ربط فسفرة البروتين غير الطبيعية بعدد من الأمراض، بما في ذلك السرطان ومرض الزهايمر ومرض باركنسون واضطرابات تنكسية أخرى .

ينتمي بروتين تاو إلى مجموعة البروتينات المرتبطة بالأنيبيبات الدقيقة (MAPs) التي تُساعد على تثبيت الأنيبيبات الدقيقة في الخلايا، بما في ذلك الخلايا العصبية. [ 86 ] يعتمد ارتباط بروتين تاو ونشاطه التثبيتي على حالته المُفسفرة. في مرض الزهايمر، وبسبب الطي الخاطئ والتغيرات التركيبية غير الطبيعية في بنية بروتين تاو، يصبح غير فعال في الارتباط بالأنيبيبات الدقيقة وغير قادر على الحفاظ على تنظيم الهيكل الخلوي العصبي أثناء العمليات العصبية. يُثبط بروتين تاو غير الطبيعي تنظيم الأنيبيبات الدقيقة ويُعطله، كما يُفصل بروتين تاو الطبيعي عن الأنيبيبات الدقيقة إلى الطور السيتوبلازمي. [ 87 ] يؤدي الطي الخاطئ إلى التجمع غير الطبيعي في تشابكات ليفية داخل الخلايا العصبية. يحتاج بروتين تاو إلى الفسفرة لكي يعمل، ولكن فرط فسفرة بروتين تاو يُعد أحد العوامل الرئيسية التي تُؤثر على عدم قدرته على الارتباط. [ 87 ] تقوم الفوسفاتازات PP1 وPP2A وPP2B وPP2C بإزالة الفوسفات من بروتين تاو في المختبر ، ويقل نشاطها في مناطق الدماغ لدى مرضى الزهايمر. [ 87 ] [ 88 ] يكون بروتين تاو الفسفوري مفرط الفسفرة بمقدار ثلاثة إلى أربعة أضعاف لدى مريض الزهايمر مقارنةً بشخص مسن غير مصاب. يبدو أن بروتين تاو في مرض الزهايمر يزيل MAP1 وMAP2 (بروتينين رئيسيين آخرين مرتبطين به) من الأنيبيبات الدقيقة، وينعكس هذا التأثير الضار عند إزالة الفوسفات، مما يدل على أن فرط الفسفرة هو السبب الوحيد لضعف النشاط. [ 87 ]

مرض باركنسون

بروتين ألفا-سينوكلين هو بروتين مرتبط بمرض باركنسون. [ 89 ] في البشر، يُشفّر هذا البروتين بواسطة جين SNCA . [ 90 ] يشارك ألفا-سينوكلين في إعادة تدوير الحويصلات المشبكية التي تحمل النواقل العصبية، ويوجد بشكل طبيعي في صورة غير مطوية. تُلاحظ مستويات مرتفعة من ألفا-سينوكلين لدى مرضى باركنسون. هناك ارتباط بين تركيز ألفا-سينوكلين غير المُفسفر لدى المريض وشدة مرض باركنسون. [ 91 ] على وجه التحديد، يؤثر فسفرة سيرين 129 في ألفا-سينوكلين على شدة المرض. يُلاحظ أن المرضى الأصحاء لديهم مستويات أعلى من ألفا-سينوكلين غير المُفسفر مقارنةً بمرضى باركنسون. قد يكون قياس التغير في نسبة تركيز بروتين ألفا-سينوكلين المُفسفر إلى تركيز بروتين ألفا-سينوكلين غير المُفسفر لدى المريض مؤشرًا على تطور المرض. وتُستخدم الأجسام المضادة التي تستهدف بروتين ألفا-سينوكلين عند الموقع المُفسفر Ser129 لدراسة الجوانب الجزيئية لأمراض السينوكلين. [ 92 ] [ 93 ]

يرتبط فسفرة سيرين 129 بتجمع البروتين وإلحاق المزيد من الضرر بالجهاز العصبي. ويمكن تعزيز تجمع ألفا-سينوكلين المفسفر في حال وجود بروتين سقالة ما قبل المشبك، Sept4، بكميات غير كافية. ويؤدي التفاعل المباشر بين ألفا-سينوكلين وSept4 إلى تثبيط فسفرة سيرين 129. [ 94 ] [ 95 ] [ 96 ] ومع ذلك، يمكن ملاحظة فسفرة سيرين 129 دون تجمع السينوكلين في حالات فرط التعبير. [ 97 ]

مراجع

  1. كوهين، فيليب (1 مايو 2002). "أصول فسفرة البروتين". بيولوجيا الخلية الطبيعية . 4 (5): E127–130. Bibcode : 2002NaCB....4E.127C . doi : 10.1038/ncb0502- e127 . ISSN 1465-7392 . PMID 11988757. S2CID 29601670 .   
  2. 1 2 3 4 5 فلاستاريديس، بانايوتيس؛ كيرياكيدو، بيلاجيا؛ تشاليوتيس، أنارغيروس؛ فان دي بير، إيف؛ أوليفر، ستيفن ج.؛ أموتزياس، غريغوريس د. (2017-02-01). "تقدير العدد الإجمالي للبروتينات الفسفورية ومواقع الفسفرة في البروتينات حقيقية النواة" . GigaScience . 6 (2) giw015: 1–11 . doi : 10.1093 /gigascience/giw015 . PMC 5466708. PMID 28327990 .  
  3. إيلان سمولي، نيتا شيمش، ميخال زيف-أوكيلسون، أنات بن-زفي، إستي ييغر-لوتيم (يناير 2017). "تنظيم متوازن غير متماثل للكينازات مقابل الفوسفاتازات عبر حقيقيات النوى يحدد تأثيراتها المتميزة" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 13 (1) e1005221. Bibcode : 2017PLSCB..13E5221S . doi : 10.1371/journal.pcbi.1005221 . PMC 5279721. PMID 28135269 .  {{cite journal}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين ( رابط )
  4. بوتيل، كليمنت م.؛ لين، مياو-هسيا؛ هيك، ألبرت جيه آر؛ ليمير، سيمون (مارس 2018). " كشف عن فسفرة الهيستيدين واسعة النطاق في البروتينات البكتيرية باستخدام علم البروتينات القائم على قياس الطيف الكتلي" . Nature Methods . 15 (3): 187–190 . doi : 10.1038/nmeth.4580 . hdl : 1874/362159 . ISSN 1548-7105 . PMID 29377012. S2CID 3367416 .   
  5. 1 2 3 Fuhs SR, Meisenhelder J, Aslanian A, Ma L, Zagorska A, Stankova M, Binnie A, Al-Obeidi F, Mauger J, Lemke G, Yates JR 3rd, Hunter T (2015). "الأجسام المضادة وحيدة النسيلة للفوسفوهيستيدين 1 و3: أدوات جديدة لدراسة فسفرة الهيستيدين" . Cell . 162 ( 1): 198–210 . doi : 10.1016/j.cell.2015.05.046 . PMC 4491144. PMID 26140597 .  
  6. هاردمان جي، بيركنز إس، براونريدج بي جيه، كلارك سي جيه، بيرن دي بي، كامبل إيه إي، كاليوزني إيه، ميال إيه، إيرز بي إيه، جونز إيه آر، إيرز سي إي (2019). "يكشف تحليل البروتينات الفوسفورية بوساطة التبادل الأيوني القوي عن فسفرة غير تقليدية واسعة النطاق في الإنسان" . مجلة EMBO . 38 (21) e100847. doi : 10.15252/embj.2018100847 . PMC 6826212. PMID 31433507 .  
  7. 1 2 Fuhs SR, Hunter T (2017). " فسفرة الهيستيدين: ظهور فسفرة الهيستيدين كتعديل تنظيمي قابل للعكس" . Curr Opin Cell Biol . 45 : 8–16 . doi : 10.1016/j.ceb.2016.12.010 . PMC 5482761. PMID 28129587 .  
  8. Cieśla J; Frączyk T; Rode W (2011). "فسفرة بقايا الأحماض الأمينية القاعدية في البروتينات: مهمة ولكن يسهل إغفالها" (ملف PDF) . Acta Biochimica Polonica . 58 (2): 137–147 . doi : 10.18388/abp.2011_2258 . PMID 21623415 . 
  9. 1 2 ليفين، ب. أ.؛ ألسبرغ، س. ل. (1906). "نواتج انشطار الفيتيلين" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 2 (1): 127-133 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)46054-6 .
  10. 1 2 بورنيت جي؛ كينيدي إي بي (ديسمبر 1954). "الفسفرة الأنزيمية للبروتينات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 211 (2): 969-80 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)71184-8 . PMID 13221602 . 
  11. ليبمان، ف. أ.؛ ليفين، ب. أ. (أكتوبر 1932). "حمض السيرينفوسفوريك الناتج عن تحلل حمض الفيتيلينيك" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 98 (1): 109-114 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)76142-5 .
  12. ميتشام، د.ك.؛ أولكوت، هـ.س. (مارس 1948). "بروتين صفار البيض يحتوي على 10% فسفور". وقائع الاتحاد . 7 (جزء 1): 173. الرقم الدولي الموحد للدوريات 0014-9446 . الرقم المرجعي في PubMed 18858189 .  
  13. كريسج، نيكول؛ سيموني، روبرت د.؛ هيل، روبرت ل. (21 يناير 2011). "عملية الفسفرة العكسية: عمل إدموند هـ. فيشر" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 286 (3): e1– e2. doi : 10.1074/jbc.O110.000242 . ISSN 0021-9258 . PMC 3023531. PMID 21294299 .   
  14. كريسج، نيكول؛ سيموني، روبرت د.؛ هيل، روبرت ل. (21 أكتوبر 2005). "اكتشاف إيرل دبليو ساذرلاند لأحادي فوسفات الأدينين الحلقي ونظام الرسول الثاني" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 280 (42): e39– e40. doi : 10.1016/S0021-9258(19)48258-6 . ISSN 0021-9258 . 
  15. لين، تي سي؛ بيتيت، إف إتش؛ هوشو، إف؛ ريد، إل جيه (سبتمبر 1969). "مركبات نازعة هيدروجين حمض ألفا كيتو. الحادي عشر. دراسات مقارنة للخصائص التنظيمية لمركبات نازعة هيدروجين البيروفات من ميتوكوندريا الكلى والقلب والكبد" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 64 (1): 227-234 . Bibcode : 1969PNAS...64..227L . doi : 10.1073/pnas.64.1.227 . ISSN 0027-8424 . PMC 286151. PMID 4312751 .   
  16. كوهين، فيليب (1976-01-01). "تنظيم وظيفة البروتين عن طريق الفسفرة متعددة المواقع" . اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 1 (2): 38-40 . doi : 10.1016/S0968-0004(76)80180-6 . ISSN 0968-0004 . 
  17. هانتر، توني (30 يونيو 2015). " اكتشاف أول كيناز تيروسين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 112 (26): 7877-7882 . Bibcode : 2015PNAS..112.7877H . doi : 10.1073/pnas.1508223112 . ISSN 0027-8424 . PMC 4491733. PMID 26130799 .   
  18. فيشر، إدموند هـ . (2010). "الفوسفوريلاز وأصل فسفرة البروتين العكسية". الكيمياء الحيوية . 391 (2/3): 131-137 . doi : 10.1515/bc.2010.011 . PMID 20030590. S2CID 29724939 .  
  19. 1 2 كوهين، فيليب (2002-05-01). "أصول فسفرة البروتين". بيولوجيا الخلية الطبيعية . 4 (5): E127–130. Bibcode : 2002NaCB....4E.127C . doi : 10.1038/ncb0502- e127 . ISSN 1465-7392 . PMID 11988757. S2CID 29601670 .   
  20. «جائزة نوبل في الطب أو علم وظائف الأعضاء لعام 1992» . www.nobelprize.org . تاريخ الاطلاع: 19 مايو 2016 .
  21. 1 2 كوزون إيه جيه (1988). "فسفرة البروتين في بدائيات النوى". المجلة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 42 : 97-125 . doi : 10.1146/annurev.mi.42.100188.000525 . PMID 2849375 . 
  22. 1 2 ستوك جيه بي؛ نينفا إيه جيه؛ ستوك إيه إم (ديسمبر 1989). " فسفرة البروتين وتنظيم الاستجابات التكيفية في البكتيريا" . مراجعة علم الأحياء الدقيقة 53 (4): 450-90 . doi : 10.1128/MMBR.53.4.450-490.1989 . PMC 372749. PMID 2556636 .  
  23. تشانغ سي؛ ستيوارت آر سي (يوليو 1998). "نظام المكونين: تنظيم مسارات الإشارات المتنوعة في بدائيات النوى وحقيقيات النوى" . علم وظائف النبات . 117 (3): 723-731 . doi : 10.1104/pp.117.3.723 . PMC 1539182. PMID 9662515 .  
  24. بارفورد د؛ داس أ.ك؛ إيغلوف م.ب (1998). "بنية وآلية عمل فوسفاتازات البروتين: رؤى حول التحفيز والتنظيم". المراجعة السنوية للفيزياء الحيوية والبنية الجزيئية الحيوية 27 : 133-164 . doi : 10.1146 /annurev.biophys.27.1.133 . PMID 9646865. S2CID 12138601 .  
  25. بييتاك، نيكو؛ بيشر، دورته؛ شميدل، سيباستيان ر.؛ ساير، ميلتون هـ.؛ هيكر، مايكل؛ كوميشاو، فابيان م.؛ ستولكه، يورغ (2010). "الفسفرة المختبرية للإنزيمات الأيضية الرئيسية من بكتيريا Bacillus subtilis: يقوم PrkC بفسفرة الإنزيمات من فروع مختلفة من الأيض الأساسي" . مجلة علم الأحياء الدقيقة الجزيئي والتكنولوجيا الحيوية . 18 (3): 129-140 . doi : 10.1159/000308512 . ISSN 1660-2412 . PMID 20389117. S2CID 19535600 .   
  26. شميدل، سيباستيان ر.؛ غروناو، كاترين؛ بيتاك، نيكو؛ هيكر، مايكل؛ بيشر، دورته؛ ستولكه، يورغ (يونيو 2010). "البروتينات الفوسفورية لبكتيريا الميكوبلازما الرئوية البسيطة: تحليل الكينوم الكامل المعروف للسيرين/ثريونين يشير إلى وجود كينازات جديدة" . علم البروتينات الجزيئي والخلوي . 9 (6): 1228-1242 . doi : 10.1074/mcp.M900267-MCP200 . ISSN 1535-9484 . PMC 2877983. PMID 20097688 .   
  27. بودينميلر، بيرند؛ وانكا، ستيفاني؛ كرافت، كلودين؛ أوربان، يورغ؛ كامبل، ديفيد؛ بيدريولي، باتريك ج.؛ جيريتس، ​​بيرتران؛ بيكوتي، باولا ؛ لام، هنري؛ فيتيك، أولغا ؛ بروسنياك، مي-يون (21-12-2010). " تحليل البروتينات الفوسفورية يكشف عن استجابات مترابطة على مستوى النظام لاضطرابات الكينازات والفوسفاتازات في الخميرة" . ساينس سيغنالينغ . 3 (153): rs4. doi : 10.1126/scisignal.2001182 . ISSN 1937-9145 . PMC 3072779. PMID 21177495 .   
  28. ياتشي، نوزومو؛ سايتو، رينتارو؛ سوجياما، ناويوكي؛ توميتا، ماسارو؛ إيشيهاما، ياسوشي (27 يناير 2011). "الخصائص التكاملية للفوسفوبورتيوم في الخميرة وخريطة تفاعل البروتين-البروتين" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 7 (1) e1001064. رمز Bibcode : 2011PLSCB...7E1064Y . doi : 10.1371/journal.pcbi.1001064 . ISSN 1553-7358 . PMC 3029238. PMID 21298081 .   
  29. جونسون، إل. إن.، وبارفورد، د. (1993). "تأثيرات الفسفرة على بنية ووظيفة البروتينات[J]". المراجعة السنوية للفيزياء الحيوية وبنية الجزيئات الحيوية . 22 (1): 199-232 . doi : 10.1146/annurev.bb.22.060193.001215 . PMID 8347989 . 
  30. 1 2 سيسلا ج؛ فراكزيك ت؛ رود و (2011). "فسفرة بقايا الأحماض الأمينية القاعدية في البروتينات: مهمة ولكن يسهل إغفالها" . أكتا بيوشيم. بول . 58 (2): 137-147 . doi : 10.18388/abp.2011_2258 . PMID 21623415 . 
  31. دويتشير، ج.؛ ساير، ج. (2005). "فسفرة بروتينات سيرين/ثريونين/تيروسين في البكتيريا - مهملة لفترة طويلة، ومثبتة الآن". مجلة علم الأحياء الدقيقة الجزيئي والتكنولوجيا الحيوية . 9 ( 3-4 ): 125-131 . doi : 10.1159/000089641 . PMID 16415586. S2CID 13093867 .  
  32. آش كروفت م؛ كوبوتات م.هـ؛ فوسدن ك.هـ (مارس 1999). " تنظيم وظيفة واستقرار البروتين p53 عن طريق الفسفرة" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 19 (3): 1751-1758 . doi : 10.1128/mcb.19.3.1751 . PMC 83968. PMID 10022862 .  
  33. بيتس إس؛ فوسدن كيه إتش (فبراير 1996). "بروتين p53 في إشارات توقف نقطة التفتيش أو موت الخلايا المبرمج" . الرأي الحالي في علم الوراثة والتطور . 6 (1): 12-8 . doi : 10.1016/S0959-437X(96)90004-0 . PMID 8791489 . 
  34. learnwithalbert (2016-09-16). "ما الفرق بين الفسفرة وإزالة الفسفرة؟" . مدونة ألبرت . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2019-02-01 .
  35. 1 2 فان ويرن، بي سي؛ دي بروين، كيه إم؛ دي فريس-سميتس، إيه إم؛ فان لينت، جيه؛ بورغيرينغ، بي إم (مايو 1998). "الدور الأساسي لبروتين كيناز ب (PKB) في تعطيل كيناز سينثاز الجليكوجين 3 الناتج عن الأنسولين. توصيف الطفرة السائدة السلبية لـ PKB" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 273 (21): 13150-13156 . doi : 10.1074/jbc.273.21.13150 . PMID 9582355 . 
  36. 1 2 كول، ب. أ.؛ شين، ك.؛ تشياو، ي.؛ وانغ، د. (أكتوبر 2003). "كينازات التيروزين البروتينية Src وCsk: حكاية ذيل". الرأي الحالي في الكيمياء الحيوية . 7 (5): 580-585 . doi : 10.1016/j.cbpa.2003.08.009 . PMID 14580561 . 
  37. زوباريفا، ف.م.؛ لاباشينا، أ.س.؛ شوغايفا، ت.إ.؛ ليتفين، أ.ف.؛ فينيوك، ب.أ. (ديسمبر 2020). "إنزيمات ATPases/ATP synthases الدوارة الناقلة للأيونات: التنوع، أوجه التشابه، والاختلاف". الكيمياء الحيوية. بيوكيميا . 85 (12): 1613-1630 . doi : 10.1134/S0006297920120135 . ISSN 1608-3040 . PMID 33705299. S2CID 229701146 .   
  38. 1 2 بروش ترينتيني، ديبورا (2016). "فسفرة الأرجينين تُعلِّم البروتينات لتحللها بواسطة بروتياز Clp" . مجلة نيتشر . 539 (7627): 48-53 . Bibcode : 2016Natur.539...48T . doi : 10.1038/nature20122 . PMC 6640040. PMID 27749819 .  
  39. جونسون، لويز ن. (2009-08-01). "تنظيم فسفرة البروتين". معاملات الجمعية الكيميائية الحيوية . 37 (الجزء 4): 627-641 . doi : 10.1042/BST0370627 . ISSN 1470-8752 . PMID 19614568 .  
  40. روغاكو إي بي، بيلش دي آر، أور إيه إتش، إيفانوفا في إس، بونر دبليو إم (مارس 1998). "تؤدي فواصل الحمض النووي المزدوجة إلى فسفرة الهيستون H2AX على السيرين 139" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 273 (10): 5858-68 . doi : 10.1074/jbc.273.10.5858 . PMID 9488723 . 
  41. كارتر آر جيه، بارسونز جيه إل (مايو 2016). "إصلاح استئصال القاعدة، مسار مُنظَّم بواسطة تعديلات ما بعد الترجمة" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 36 (10): 1426-1437 . doi : 10.1128/MCB.00030-16 . PMC 4859697. PMID 26976642 .  
  42. بابيور، ب.م. (مارس 1999). "أكسيداز NADPH: تحديث". مجلة الدم . 93 (5): 1464-1476 . doi : 10.1182/blood.V93.5.1464 . PMID 10029572 . 
  43. أولسن جيه في؛ بلاغويف بي؛ غناد إف؛ ماسيك بي؛ كومار سي؛ مورتنسن بي؛ مان إم (نوفمبر 2006). " ديناميكيات الفسفرة العالمية، والحيوية، والموضعية في شبكات الإشارات" . مجلة Cell . 127 (3): 635-48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .  
  44. لي رونغ واي؛ إسحاق إتش جيه؛ فينسترا تي دي (2007). "علم البروتينات الفوسفورية لاكتشاف الكينازات كعلامات حيوية للسرطان وأهداف دوائية". علم البروتينات: التطبيقات السريرية . 1 (9): 1042-1057 . doi : 10.1002/prca.200700102 . PMID 21136756. S2CID 33999702 .  
  45. ^ فيدلر د، برابيرج إتش، ميهتا إم، تشيشيك جي، كاجني جي، موخيرجي بي، سيلفا إيه سي، شالز إم، وآخرون . (2009). "التنظيم الوظيفي لشبكة الفسفرة S. cerevisiae" . خلية . 136 (5): 952-963 . دوى : 10.1016/j.cell.2008.12.039 . بمك 2856666 . بميد 19269370 .   
  46. شوبرل، ب؛ إيخلر-جونسون، س؛ جيلز، إي دي؛ مولر، ج (أبريل 2002). "النمذجة الحاسوبية لديناميكيات سلسلة كيناز البروتين المنشط بالمايتوجين (MAPK) المنشطة بواسطة مستقبلات عامل نمو البشرة (EGF) السطحية والداخلية". مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 20 (4): 370-375 . doi : 10.1038/nbt0402-370 . PMID 11923843. S2CID 9851026 .  
  47. ألدريدج، ب.ب.؛ بيرك، ج.م.؛ لوفنبرغر، د.أ.؛ سورغر، ب.ك. (نوفمبر 2006). "النمذجة الفيزيائية الكيميائية لمسارات إشارات الخلايا". بيولوجيا الخلية الطبيعية . 8 (11): 1195-203 . doi : 10.1038/ncb1497 . PMID 17060902. S2CID 14586526 .  
  48. تشو، ف؛ غوان، ي (11 يونيو 2014). " التنبؤ باستجابة شبكة الإشارات الديناميكية في ظل اضطرابات غير مرئية" . المعلوماتية الحيوية . 30 (19): 2772-2778 . doi : 10.1093/bioinformatics/btu382 . PMC 4173019. PMID 24919880 .  
  49. ساويكا، آنا؛ سيزر، كريستيان (2014-08-01). "استشعار فسفرة الهيستون الأساسي - مسألة توقيت مثالي" . مجلة بيوكيميكا وبيوفيزيكا أكتا (BBA) - آليات تنظيم الجينات . 1839 (8): 711-718 . doi : 10.1016/j.bbagrm.2014.04.013 . PMC 4103482. PMID 24747175 .  
  50. روسيتو، دورين؛ أففاكوموف، نيكيتا؛ كوتيه، جاك (2012-10-01). " فسفرة الهيستون" . علم التخلق . 7 (10): 1098-1108 . doi : 10.4161/epi.21975 . ISSN 1559-2294 . PMC 3469451. PMID 22948226 .   
  51. تشانغ، يي؛ غريفين، كارين؛ موندال، نيليما؛ بارفين، جيفري د. (21-05-2004). "فسفرة الهيستون H2A تثبط النسخ على قوالب الكروماتين" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 279 (21): 21866-21872 . doi : 10.1074/jbc.M400099200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15010469 .  
  52. غريشام، ريجينالد هـ. غاريت، تشارلز م. (2013). الكيمياء الحيوية ( الطبعة الخامسة). بيلمونت، كاليفورنيا: بروكس/كول، سينغيج ليرنينغ. ISBN  978-1-133-10629-6.{{cite book}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين ( رابط )
  53. غونزاليس-سانشيز إم بي، لانوكارا إف، هيلم إم، إيرز سي إي (2013). "محاولة إعادة كتابة التاريخ: تحديات تحليل الببتيدات المفسفرة بالهيستيدين". معاملات الجمعية الكيميائية الحيوية . 41 (4): 1089-1095 . doi : 10.1042/bst20130072 . PMID 23863184 . 
  54. توماسون ب؛ كاي ر (سبتمبر 2000). "نقل الإشارات في حقيقيات النوى عبر سلسلة فوسفات الهيستيدين-أسبارتات" (ملف PDF) . مجلة علوم الخلية . 113 (18): 3141-50 . doi : 10.1242/jcs.113.18.3141 . PMID 10954413 . 
  55. بوتيك، جينيفر؛ بيكر، إدوارد ن.؛ ديلباير، لويس ت. ج. (2008). "فسفرة الهيستيدين في الأنظمة البيولوجية". مجلة بيوشيميكا وبيوفيزيكا أكتا (BBA) - البروتينات والبروتيوميات . 1784 (1): 100-105 . doi : 10.1016/j.bbapap.2007.07.008 . ISSN 1570-9639 . PMID 17728195 .  
  56. ليمون، مارك أشليسنجر، جوزيف ( يونيو 2010). "إشارات الخلية بواسطة مستقبلات التيروزين كيناز" . الخلية . 141 (7): 1117-1134 . doi : 10.1016/j.cell.2010.06.011 . PMC 2914105. PMID 20602996 .  
  57. تشو إتش إس، ليهي دي جيه؛ ليهي (2002). "بنية المنطقة خارج الخلوية لـ HER3 تكشف عن رابط بين المجالات" . مجلة ساينس . 297 (5585): 1330-1333 . Bibcode : 2002Sci...297.1330C . doi : 10.1126/science.1074611 . PMID 12154198. S2CID 23069349 .  
  58. مورغان، ديفيد أو. (2007). دورة الخلية: مبادئ التحكم. لندن: دار النشر للعلوم الجديدة، الطبعة الأولى.
  59. غاريت، ريجينالد هـ.؛ غريشام، تشارلز م. (2013). الكيمياء الحيوية . ماري فينش، سينغيج ليرنينغ. ص 489-491 . 
  60. نينفا، ألكسندر؛ ديفيد ب. بالو، ديفيد (1998). مناهج المختبر الأساسية للكيمياء الحيوية والتكنولوجيا الحيوية ( الطبعة الثانية). دار فيتزجيرالد للعلوم. الصفحات 230-231 .  
  61. الله، شهيد؛ لين، شاو فنغ (2016). "dbPAF: قاعدة بيانات تكاملية لفسفرة البروتين في الحيوانات والفطريات" . التقارير العلمية . 6 23534. Bibcode : 2016NatSR...623534U . doi : 10.1038/srep23534 . PMC 4806352. PMID 27010073. تاريخ الاسترجاع: 17 مايو 2016 .  
  62. 1 2 بلوم، نيكولاي؛ جاميلتوفت، ستين؛ بروناك، سورين (1999/12/17). “التنبؤ بالتسلسل والهيكل لمواقع فسفرة البروتين حقيقية النواة 1”. مجلة البيولوجيا الجزيئية . 294 (5): 1351–1362 . دوى : 10.1006/jmbi.1999.3310 . بميد 10600390 . 
  63. هوانغ، كاي ياو؛ لو، تشنغ تسونغ؛ بريتانيا، نيل أرفين؛ لي، تسونغ يي؛ تشانغ، تزو هاو (2013-01-01). "ViralPhos: دمج طريقة إحصائية تكرارية للتنبؤ بمواقع الفسفرة على بروتينات الفيروس" . BMC Bioinformatics . 14 (16): S10. doi : 10.1186/1471-2105-14-S16- S10 . ISSN 1471-2105 . PMC 3853219. PMID 24564381 .   
  64. أوسا، ن. أ. (1 مارس 2013). "فسفرة TRAF1 على سيرين 139 تُعدّل نشاط NF-κB في مسار 4-1BB في الخلايا التائية". مجلة الاتصالات البحثية البيوكيميائية والبيوفيزيائية . 432 (1): 129-134 . Bibcode : 2013BBRC..432..129O . doi : 10.1016/j.bbrc.2013.01.073 . PMID 23376065 . 
  65. نادراتوفسكا-ويسولوفسكا، ب (21 أكتوبر 2016). "ينظم RSK2 عملية الإدخال الخلوي لمستقبل FGF 1 عن طريق الفسفرة على سيرين 789" . أونكوجين . 33 (40): 4823-4836 . doi : 10.1038/onc.2013.425 . PMID 24141780 . 
  66. تانجي، كونيكازو (3 مايو 2014). " فسفرة السيرين 349 من البروتين p62 في دماغ مرضى الزهايمر" . مجلة Acta Neuropathologica Communications . 2 (50) 50. doi : 10.1186/2051-5960-2-50 . PMC 4035093. PMID 24886973 .  
  67. هو، شيهي (14 نوفمبر 2003). "فسفرة السيرين 337 من NF-kappaB p50 ضرورية لارتباط الحمض النووي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 (46): 45994-8 . doi : 10.1074/jbc.m307971200 . PMID 12947093 . 
  68. المحررة، كيندرا ك. بينس (2013). تنظيم فوسفاتاز التيروزين البروتيني لعملية الأيض . نيويورك، نيويورك: سبرينغر نيويورك. ISBN 978-1-4614-7855-3.{{cite book}}له |last1=اسم عام ( مساعدة )
  69. كوزون، آلان ج.؛ غرانجاس، كريستوف؛ دوبليه، باتريشيا؛ دوكلوس، برتراند (1 مارس 2004). "فسفرة البروتين على التيروزين في البكتيريا". أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 181 (3): 171-181 . Bibcode : 2004ArMic.181..171C . doi : 10.1007/s00203-003-0640-6 . PMID 14745484. S2CID 37161183 .  
  70. إيرز، سي إي، وهاردمان، جي (21 أغسطس/آب 2019). "يكشف تحليل البروتينات الفوسفورية بوساطة التبادل الأيوني القوي عن فسفرة غير تقليدية واسعة النطاق في الإنسان" . مجلة EMBO . 38 (21) e100847. doi : 10.15252/embj.2018100847 . PMC 6826212. PMID 31433507 .  
  71. كوفاكس كيه إيه، شتاينمان إم، ماجيستريتي بي جيه، هالفون أو، كاردينو جيه آر (سبتمبر 2003). "أفراد عائلة بروتين ربط مُحسِّن CCAAT يستقطبون البروتين المُنشِّط المُشارك CREB-binding protein ويُحفِّزون فسفرته" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 (38): 36959-65 . doi : 10.1074/jbc.M303147200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12857754 .  
  72. مونتون آر بي، تويدي-كولين آر، ليفينغستون-زاتشي إم، ويناندي إف، وايدليش إم، لونغو دي، غيريغ بي، بوثاست إف، وآخرون . (فبراير 2007). "تحليلات نوعية وكمية لفسفرة البروتين في مستحضرات المشابك العصبية للفئران الساذجة والمحفزة" ( ملف PDF) . علم البروتينات الخلوية الجزيئية . 6 (2): 283-293 . doi : 10.1074/mcp.M600046-MCP200 . PMID 17114649. S2CID 18221665 .   
  73. ترينيداد جيه سي؛ ثالهمر إيه؛ سبيشت سي جي؛ لين إيه جيه؛ بيكر بي آر؛ شوبفر آر؛ بورلينغيم إيه إل (أبريل 2008). "التحليل الكمي للفسفرة المشبكية والتعبير البروتيني" . علم البروتينات الخلوية الجزيئية . 7 (4): 684-96 . doi : 10.1074/mcp.M700170-MCP200 . PMID 18056256 . 
  74. فريز، كريستيان؛ هوجيانغ تشو؛ توماس تاوس؛ أ. ف. مارتن ألتيلار؛ كارل ميشتلر؛ ألبرت ج. ر. هيك؛ شاباز محمد (1 مارس 2013). " تحديد موقع الفسفرة بدقة باستخدام نقل الإلكترون/تفكك التصادم عالي الطاقة (EThcD)" . مجلة أبحاث البروتينات . 12 (3): 1520-1525 . doi : 10.1021/pr301130k . PMC 3588588. PMID 23347405 .  
  75. جيربر إس إيه؛ راش جيه؛ ستيمان أو؛ كيرشنر إم دبليو؛ جيجي إس بي (يونيو 2003). "القياس الكمي المطلق للبروتينات والبروتينات الفوسفورية من مستخلصات الخلايا باستخدام مطياف الكتلة الترادفي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 100 ( 12): 6940-5 . Bibcode : 2003PNAS..100.6940G . doi : 10.1073/pnas.0832254100 . PMC 165809. PMID 12771378 .  
  76. جيجي إس بي؛ ريست بي؛ جريفين تي جيه؛ إنج جيه؛ إيبرسولد آر (2002). "تحليل البروتينات منخفضة الوفرة باستخدام كروماتوغرافيا متعددة الأبعاد وعلامات تقارب مشفرة بالنظائر". مجلة أبحاث البروتينات . 1 (1): 47-54 . doi : 10.1021/pr015509n . PMID 12643526 . 
  77. أوليف ، د.م. (أكتوبر 2004). "الأساليب الكمية لتحليل فسفرة البروتين في تطوير الأدوية". مجلة الخبراء في علم البروتينات . 1 (3): 327-341 . doi : 10.1586/14789450.1.3.327 . PMID 15966829. S2CID 30003827 .  
  78. تشين هـ، كوفار ج، سيسونز س، كوكس ك، ماتر و، تشادويل ف، لوان ب، فلاهوس سي ج، وآخرون . (مارس 2005). "فحص مناعي خلوي قائم على الخلايا لرصد مسارات إشارات الكيناز وفعالية الدواء" (ملف PDF) . مجلة الكيمياء الحيوية التحليلية . 338 (1): 136-142 . CiteSeerX 10.1.1.335.3523 . doi : 10.1016/j.ab.2004.11.015 . PMID 15707944. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 22 فبراير 2012. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 مايو 2019 .   
  79. ^ أكولوف، فاسيلي؛ خيمينيز بانيزو، ألبا؛ إستيبانيز-بيربينيا، إيفا؛ فان نورت، جون؛ مشاغي، علي رضا (17-07-2025). “التنوع المطابق الذي ينظمه الفسفرة والديناميكيات الطوبولوجية لمستقبل نووي مضطرب جوهريًا” . مجلة الكيمياء الفيزيائية ب . 129 (30): 7719– 7730. بيب كود : 2025JPCB..129.7719A . دوى : 10.1021/acs.jpcb.5c03257 . بمك 12319912 . بميد 40673718 .  
  80. كوهين، ب. (2000). "تنظيم وظيفة البروتين عن طريق الفسفرة متعددة المواقع - تحديث بعد 25 عامًا". مجلة تريندز في العلوم البيوكيميائية ، 25 (12): 596-601 . doi : 10.1016/S0968-0004(00)01712-6 . PMID 11116185 . 
  81. بيرلمان إس إم، سيربر زد، فيريل جيه إي (2011). "آلية لتطور مواقع الفسفرة" . الخلية . 147 ( 4): 934-946 . doi : 10.1016/j.cell.2011.08.052 . PMC 3220604. PMID 22078888 .  
  82. هولت إل جيه، توش بي بي، فيلين جيه، جونسون إيه دي، جيجي إس بي، مورغان دي أو (2009). " تحليل شامل لمواقع فسفرة ركيزة Cdk1 يُقدّم رؤى ثاقبة حول التطور" . مجلة ساينس . 325 (5948): 1682-1686 . Bibcode : 2009Sci...325.1682H . doi : 10.1126/science.1172867 . PMC 2813701. PMID 19779198 .  
  83. غارسيا-غارسيا، ترانسيتو (2016). "دور فسفرة البروتين في تنظيم دورة الخلية والعمليات المتعلقة بالحمض النووي في البكتيريا" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 7 : 184. doi : 10.3389/fmicb.2016.00184 . PMC 4754617. PMID 26909079 .  
  84. 1 2 ماكيك، ب.؛ ميجاكوفيتش، إ.؛ أولسن، ج.؛ غناد، ف.؛ كومار، س.؛ جنسن، ب. (2007). "بروتينات السيرين/الثريونين/التيروسين الفوسفورية لبكتيريا Bacillus subtilis النموذجية" . علم البروتينات الخلوية الجزيئية . 6 (4): 697-707 . doi : 10.1074/mcp.m600464-mcp200 . PMID 17218307 . 
  85. كوزون، أ. ج. (1988). "فسفرة البروتين في بدائيات النوى". المجلة السنوية لعلم الأحياء الدقيقة . 42 : 97-125 . doi : 10.1146/annurev.mi.42.100188.000525 . PMID 2849375 . 
  86. وولف، مايكل س . (19 ديسمبر 2012). "دور بروتين تاو في الأمراض التنكسية العصبية وإمكاناته كهدف علاجي" . ساينتيفيكا . 2012 796024. doi : 10.6064/2012/796024 . PMC 3820460. PMID 24278740 .  
  87. 1 2 3 4 كولاروفا، ميكالا؛ غارسيا سييرا، فرانسيسكو؛ بارتوس، أليس. ريكني، جان؛ ريبوفا ، دانييلا (29/05/2012). "بنية وعلم أمراض بروتين تاو في مرض الزهايمر" . المجلة الدولية لمرض الزهايمر . 2012 731526. دوى : 10.1155/2012/731526 . ISSN 2090-8024 . بمك 3368361 . بميد 22690349 .   
  88. كريسبو-بيل، ناتاليا؛ ثيونيس، كلارا؛ لوفين، فريد فان (2012-06-08). "بروتين تاو: السبب الرئيسي للتنكس المشبكي والعصبي في مرض الزهايمر" . المجلة الدولية لمرض الزهايمر . 2012 251426. doi : 10.1155/2012/251426 . ISSN 2090-8024 . PMC 3376502. PMID 22720188 .   
  89. سبيلانتيني، إم جي؛ كروثر، آر إيه؛ جايكس، آر؛ هاسيغاوا، إم؛ غوديرت، إم (26 مايو 1998). "بروتين ألفا-سينوكلين في التجمعات الخيطية لأجسام ليوي في مرض باركنسون والخرف المصاحب لأجسام ليوي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (11): 6469-73 . Bibcode : 1998PNAS...95.6469S . doi : 10.1073/pnas.95.11.6469 . PMC 27806. PMID 9600990 .  
  90. "مرجع علم الوراثة المنزلي: SNCA" . المكتبة الوطنية الأمريكية للطب. ١٢ نوفمبر ٢٠١٣. تم الاطلاع عليه بتاريخ ١٤ نوفمبر ٢٠١٣ .
  91. بوريه، ج؛ شارما، م؛ سودوف، ت.س. (1 مارس 2018). "علم الأحياء الخلوي والفيزيولوجيا المرضية لبروتين ألفا-سينوكلين" . مجلة كولد سبرينغ هاربور لوجهات نظر في الطب . 8 (3) a024091. doi : 10.1101/cshperspect.a024091 . PMC 5519445. PMID 28108534 .  
  92. روثرفورد، ن. ج.؛ بروكس، م.؛ جياسون، ب. إ. (8 أغسطس 2016). "أجسام مضادة جديدة لسيرين 129 المُفسفر في ألفا-سينوكلين وسيرين 473 في بروتين NFL تُظهر التشابه الجزيئي الوثيق بين هذه الحواتم" . مجلة Acta Neuropathologica Communications . 4 (1): 80. doi : 10.1186/s40478-016-0357-9 . PMC 4977832. PMID 27503460 .  
  93. باليولوجو، ك. إي.؛ شميد، أ. و.؛ روسبيجليوسي، س. س.؛ كيم، هـ. ي.؛ لامبرتو، ج. ر.؛ فريدنبرغ، ر. أ.؛ لانسبري، ب. ت. الابن؛ فرنانديز، س. أ.؛ إليعازر، د.؛ تسفيكستيتر، م.؛ لاشويل، هـ. أ. (13 يونيو 2008). "الفسفرة عند سيرين-129، وليس نظائر الفسفرة S129E/D، تثبط تليف ألفا-سينوكلين" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (24): 16895-905 . doi : 10.1074/jbc.M800747200 . PMC 2423264. PMID 18343814 .  
  94. "مرض باركنسون | توضيح دور الفسفرة في تعديل تراكم ألفا-سينوكلين وسميته في مرض باركنسون والاضطرابات ذات الصلة" . مرض باركنسون | مؤسسة مايكل جيه فوكس لأبحاث باركنسون . تاريخ الاسترجاع: ١٤ مايو ٢٠١٦ .
  95. وانغ، يو؛ شي، مين؛ تشونغ، كاثرين أ.؛ زابيتيان، سايروس ب.؛ ليفرينز، جيمس ب.؛ بيرغ، دانييلا؛ سروليجيس، كارين؛ ترويانوفسكي، جون كيو.؛ لي، فيرجينيا م.-ي. (15 فبراير 2012). "بروتين ألفا-سينوكلين المُفسفر في مرض باركنسون" . مجلة ساينس ترانسليشنال ميديسين . 4 (121): 121ra20. doi : 10.1126/scitranslmed.3002566 . ISSN 1946-6234 . PMC 3302662. PMID 22344688 .   
  96. ^ ستيوارت، تيساندرا. الأماكن القريبة : أصلي ، جان أو. وزوليك ، زبيغنيو ك . أويتي ، ريان ج. هاسيغاوا، كازوكو؛ يوكوياما، تيرو؛ زابيتيان ، سايروس ب ؛ ليفرينز ، جيمس ب (2015/01/31). "الفسفرة ألفا سينوكلين في مرض باركنسون: الارتباط يعتمد على شدة المرض" . اكتا نيوروباثولوجيكا للاتصالات . 3 (1): 7. دوى : 10.1186/s40478-015-0185-3 . ISSN 2051-5960 . بمك 4362824 . بميد 25637461 .   
  97. لافيريير، فلورنت؛ هي، شين؛ زينغيرينو، فيديريكا؛ دودنيكوف، إيفلين؛ فاجياني، إميلي؛ مايسنر، واسيليوس ج.؛ بيزارد، إروان؛ دي جورجي، فرانشيسكا؛ إيشاس، فرانسوا (29 أكتوبر 2020). "لا يُحاكي الإفراط في التعبير عن ألفا-سينوكلين بواسطة الخلايا الدبقية قليلة التغصن في الفئران المعدلة وراثيًا التجمع الليفي الذي يُلاحظ في ضمور الأجهزة المتعددة" . الخلايا . 9 ( 11): 2371. doi : 10.3390/cells9112371 . ISSN 2073-4409 . PMC 7693764. PMID 33138150 .