تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة

📅 آخر تحديث: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣١ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 3 صور
الموسوعة الحرة
يختلف جزيء الحمض النووي العلوي عن جزيء الحمض النووي السفلي في موقع زوج قاعدي واحد (تعدد الأشكال G/A).

في علم الوراثة والمعلوماتية الحيوية ، يُعرف تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ( SNP ) بأنه استبدال نيوكليوتيد واحد في موقع محدد من الجينوم في الخلايا الجرثومية . ورغم أن بعض التعريفات تشترط وجود هذا الاستبدال في نسبة كبيرة من السكان (مثل 1% أو أكثر)، [ 1 ] فإن العديد من المنشورات [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] لا تعتمد هذا الحد الأدنى للتكرار .

على سبيل المثال، قد يُستبدل النيوكليوتيد G الموجود في موقع محدد في جينوم مرجعي بالنيوكليوتيد A لدى نسبة قليلة من الأفراد. يُطلق على النيوكليوتيدين المحتملين لهذا التعدد النوكليوتيدي المفرد (SNP)  - G أو A  - اسم الأليلات . [ 5 ]

يمكن أن تساعد الطفرات النقطية المفردة (SNPs) في تفسير الاختلافات في قابلية الإصابة بمجموعة واسعة من الأمراض بين أفراد المجتمع. على سبيل المثال، ترتبط طفرة نقطية مفردة شائعة في جين CFH بزيادة خطر الإصابة بالتنكس البقعي المرتبط بالعمر . [ 6 ] كما قد تكون الاختلافات في شدة المرض أو الاستجابة للعلاجات من مظاهر التباينات الجينية الناتجة عن الطفرات النقطية المفردة. فعلى سبيل المثال، تؤدي طفرتان نقطيتان مفردتان شائعتان في جين APOE ، وهما rs429358 وrs7412، إلى ثلاثة أليلات رئيسية من APO-E ذات مخاطر مختلفة للإصابة بمرض الزهايمر وعمر بدء ظهور المرض. [ 7 ]

تُسمى استبدالات النوكليوتيدات المفردة التي يقل تردد أليلها عن 1% أحيانًا بالمتغيرات أحادية النوكليوتيد. [ 8 ] كما يُستخدم مصطلح "المتغير" كمصطلح عام لأي تغيير في نيوكليوتيد واحد في تسلسل الحمض النووي، [ 9 ] ويشمل كلاً من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة الشائعة والطفرات النادرة ، سواء كانت وراثية أو جسدية . [ 10 ] [ 11 ] ولذلك، يُستخدم مصطلح "المتغير أحادي النوكليوتيد" للإشارة إلى الطفرات النقطية الموجودة في الخلايا السرطانية. [ 12 ] ويجب أيضًا مراعاة متغيرات الحمض النووي في تطبيقات التشخيص الجزيئي، مثل تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) للكشف عن الفيروسات، حيث قد تحتوي عينة الحمض النووي الريبي الفيروسي أو الحمض النووي على متغيرات أحادية النوكليوتيد. [ 13 ] ومع ذلك، تستخدم هذه التسمية تمييزات اعتباطية (مثل تردد أليل 1%)، ولا تُستخدم بشكل متسق في جميع المجالات؛ وقد أدى هذا التباين إلى دعوات لوضع إطار عمل أكثر اتساقًا لتسمية الاختلافات في تسلسلات الحمض النووي بين عينتين. [ 14 ] [ 15 ]

الأنواع

أنواع تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs)

قد تقع تعددات النوكليوتيدات المفردة ضمن التسلسلات المشفرة للجينات ، أو المناطق غير المشفرة منها ، أو في المناطق بين الجينات. ولا تُغير هذه التعددات ضمن التسلسل المشفر بالضرورة تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين الناتج، وذلك بسبب تعدد أشكال الشفرة الوراثية . [ 16 ]

توجد الطفرات النقطية المفردة (SNPs) في المنطقة المشفرة بنوعين: الطفرات المترادفة والطفرات غير المترادفة. لا تؤثر الطفرات المترادفة على تسلسل البروتين، بينما تغير الطفرات غير المترادفة تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين. [ 17 ]

قد تؤثر الطفرات النقطية المفردة (SNPs) التي لا تقع في مناطق ترميز البروتين على عملية تضفير الجينات ، أو ارتباط عوامل النسخ ، أو تحلل الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، أو تسلسل الحمض النووي الريبوزي غير المشفر. ويُشار إلى التعبير الجيني المتأثر بهذا النوع من الطفرات النقطية المفردة باسم eSNP (طفرة التعبير النقطية المفردة)، وقد يكون موقعها في اتجاه 5' أو 3' من الجين.

تكرار

تم تحديد أكثر من 600  مليون طفرة نيوكليوتيدية مفردة (SNPs) في الجينوم البشري لدى سكان العالم. [ 23 ] يختلف الجينوم النموذجي عن الجينوم البشري المرجعي في 4-5  ملايين موقع، معظمها (أكثر من 99.9%) يتكون من طفرات نيوكليوتيدية مفردة (SNPs) وعمليات حذف/ إضافة قصيرة . [ 24 ]

داخل الجينوم

لا يتسم التوزيع الجينومي للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة (SNPs) بالتجانس؛ إذ تتواجد هذه النيوكليوتيدات في المناطق غير المشفرة بتردد أكبر من المناطق المشفرة ، أو بشكل عام، حيث يعمل الانتقاء الطبيعي على تثبيت الأليل (وإزالة المتغيرات الأخرى) للنيوكليوتيد المفرد المتغير الذي يمثل التكيف الجيني الأمثل. [ 25 ] كما يمكن لعوامل أخرى، مثل معدل إعادة التركيب الجيني ومعدل الطفرات، أن تحدد كثافة النيوكليوتيدات المفردة المتغيرة. [ 26 ]

يمكن التنبؤ بكثافة تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) من خلال وجود التكرارات الميكروية : تُعد التكرارات الميكروية AT على وجه الخصوص مؤشرات قوية لكثافة تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة، حيث تميل سلاسل التكرار الطويلة (AT)(n) إلى التواجد في مناطق ذات كثافة منخفضة بشكل ملحوظ لتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ومحتوى منخفض من GC . [ 27 ]

ضمن مجموعة سكانية

نظراً لوجود اختلافات بين التجمعات البشرية، قد يكون أليل SNP شائعاً في مجموعة جغرافية أو عرقية ما، ولكنه نادر في مجموعة أخرى. مع ذلك، يُعدّ هذا النمط من التباين نادراً نسبياً؛ ففي عينة عالمية تضم 67.3  مليون SNP، لم يجد مشروع تنوع الجينوم البشري أي متغيرات خاصة ثابتة في قارة أو منطقة رئيسية محددة. وتُسجّل أعلى الترددات في بضع عشرات من المتغيرات الموجودة بنسبة تزيد عن 70% (وبضعة آلاف بنسبة تزيد عن 50%) في أفريقيا والأمريكتين وأوقيانوسيا. في المقابل، لا تتجاوز أعلى ترددات المتغيرات الخاصة بأوروبا وشرق آسيا والشرق الأوسط ووسط وجنوب آسيا 10 إلى 30%. [ 28 ]

ضمن مجموعة سكانية، يمكن تحديد تردد الأليل الأقل شيوعًا (MAF) للعلامات الجينية أحادية النوكليوتيد (SNPs)، وهو أدنى تردد للأليل في موقع جيني معين يُلاحظ في تلك المجموعة السكانية. [ 29 ] وهذا ببساطة هو التردد الأقل من بين ترددي الأليل للعلامات الجينية أحادية النوكليوتيد.

بفضل هذه المعرفة، طوّر العلماء أساليب جديدة لتحليل التركيب السكاني في الأنواع الأقل دراسة. [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] وباستخدام تقنيات التجميع، انخفضت تكلفة التحليل بشكل ملحوظ. [ 33 ] تعتمد هذه التقنيات على تسلسل جينوم مجموعة سكانية في عينة مجمعة بدلاً من تسلسل كل فرد على حدة. وباستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية الحديثة، أصبح من الممكن دراسة التركيب السكاني، وتدفق الجينات، وهجرة الجينات من خلال رصد ترددات الأليلات في جميع أفراد المجموعة السكانية. وتتيح هذه البروتوكولات إمكانية الجمع بين مزايا تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) وعلامات الأقمار الصناعية الدقيقة. [ 34 ] [ 35 ] ومع ذلك، تُفقد بعض المعلومات خلال هذه العملية، مثل معلومات عدم التوازن الارتباطي ومعلومات الزيجوتية.

التطبيقات

تُعدّ تعددات النوكليوتيدات المفردة مؤشرات جزيئية فعّالة في البحوث الجينية المعاصرة والممارسة السريرية. وتمثل دراسات الارتباط، ولا سيما دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) ، التطبيق الأساسي لتقنية تعددات النوكليوتيدات المفردة لتحديد المتغيرات الجينية المرتبطة بالأمراض والصفات البشرية. [ 36 ] تُجري هذه التحليلات الشاملة فحصًا لمئات الآلاف من المؤشرات الجينية في آنٍ واحد للكشف عن الارتباطات الإحصائية بين تعددات النوكليوتيدات المفردة المحددة والخصائص الظاهرية، مما يُمكّن الباحثين من الكشف عن المساهمات الجينية في الاضطرابات المعقدة ، بما في ذلك أمراض القلب والأوعية الدموية ، وداء السكري ، والأمراض العصبية . [ 37 ]

لقد ساهم تطوير منهجية علامات SNP بشكل كبير في تحسين كفاءة الدراسات الجينومية من خلال استغلال أنماط عدم التوازن الارتباطي عبر الجينوم البشري . تعمل علامات SNP كعلامات تمثيلية تلتقط التباين الجيني ضمن مناطق كروموسومية محددة، مما يسمح للباحثين بمسح مناطق جينومية واسعة دون الحاجة إلى تحديد النمط الجيني لكل متغير على حدة. [ 38 ] يقلل هذا النهج من التكلفة المالية والعبء الحسابي للدراسات الجينية واسعة النطاق مع الحفاظ على قدرة كافية للكشف عن المواقع المرتبطة بالأمراض. يعتمد اختيار علامات SNP المثلى على خوارزميات متطورة تحدد العلامات القادرة على التقاط أكبر قدر من المعلومات الجينية ضمن فترات جينومية محددة. [ 39 ]

يمثل إعادة بناء النمط الفرداني تطبيقًا أساسيًا آخر تُمكّن فيه تعددات النوكليوتيدات المفردة (SNPs) من توصيف الكتل الجينية الموروثة. يستخدم الباحثون خرائط SNPs الكثيفة لتحديد وتحليل بنى الأنماط الفردانية، التي تتكون من مجموعات من الأليلات المرتبطة ارتباطًا وثيقًا والتي تميل إلى الانتقال معًا عبر الأجيال. [ 40 ] توفر أنماط الأنماط الفردانية هذه رؤى ثاقبة حول تاريخ السكان، والأحداث الديموغرافية، والعمليات التطورية التي شكلت التنوع الجيني المعاصر. وقد جسّد مشروع HapMap الدولي هذا التطبيق من خلال إنشاء خرائط شاملة لأنماط الأنماط الفردانية الشائعة عبر مختلف التجمعات البشرية. [ 41 ]

يشكل تحليل اختلال التوازن الارتباطي الأساس النظري للعديد من التطبيقات القائمة على تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) في علم الوراثة السكانية ورسم خرائط الأمراض. تصف هذه الظاهرة الارتباط غير العشوائي للأليلات في مواقع جينومية مختلفة، والذي يحدث عندما تُورث المتغيرات معًا بتردد أكبر مما هو متوقع بالصدفة وحدها. [ 42 ] يعتمد مدى اختلال التوازن الارتباطي بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بشكل أساسي على المسافة الفيزيائية على طول الكروموسومات ومعدلات إعادة التركيب المحلية ، حيث تُظهر المتغيرات الأقرب عمومًا ارتباطات أقوى. يُمكّن فهم هذه الأنماط الباحثين من التنبؤ بتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) التي ستوفر معلومات زائدة، ويوجه اختيار المؤشرات المفيدة لدراسات الارتباط. [ 43 ]

في علم الأوبئة الجيني ، برزت تعددات النوكليوتيدات المفردة (SNPs) كأدوات أساسية لدراسة أنماط انتقال الأمراض وبنية السكان. تستخدم تقنيات تسلسل الجينوم الكامل تنوع تعددات النوكليوتيدات المفردة لتحديد مجموعات انتقال العدوى في تفشي الأمراض المعدية، حيث قد تمثل الحالات التي تُظهر أنماطًا جينية متشابهة أحداث انتقال مرتبطة. [ 44 ] وقد أثبت هذا التطبيق أهميته بشكل خاص في مراقبة مرض السل وتتبع المخالطين، حيث قد تفشل الطرق الوبائية التقليدية في تحديد جميع روابط انتقال العدوى. بالإضافة إلى ذلك، تُسهم التحليلات القائمة على تعددات النوكليوتيدات المفردة في فهم التباين السكاني والأصل، وهما عاملان حاسمان في تصميم ضوابط الدراسة المناسبة وتفسير نتائج الارتباط عبر مختلف المجموعات العرقية. [ 45 ]

أهمية

يمكن أن تؤثر الاختلافات في تسلسل الحمض النووي البشري على كيفية تطور الأمراض لدى الإنسان واستجابته لمسببات الأمراض والمواد الكيميائية والأدوية واللقاحات وغيرها من العوامل. كما تُعدّ تعددات النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بالغة الأهمية للطب الشخصي . [ 46 ] وتشمل الأمثلة البحوث الطبية الحيوية، وعلم الأدلة الجنائية، وعلم الصيدلة الجينية، وأسباب الأمراض، كما هو موضح أدناه.

البحوث السريرية

دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS)

يُعدّ تحليل الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) أحد أهمّ إسهامات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) في البحوث السريرية. [ 47 ] ويمكن توليد البيانات الجينية على مستوى الجينوم باستخدام تقنيات متعددة، بما في ذلك مصفوفة SNP وتسلسل الجينوم الكامل. وقد شاع استخدام GWAS في تحديد SNPs المرتبطة بالأمراض أو الأنماط الظاهرية أو الصفات السريرية. ولأن GWAS تقييمٌ على مستوى الجينوم، فإنه يتطلب عينة كبيرة للحصول على قوة إحصائية كافية للكشف عن جميع الارتباطات المحتملة. بعض SNPs لها تأثير ضئيل نسبيًا على الأمراض أو الأنماط الظاهرية أو الصفات السريرية. ولتقدير قوة الدراسة، يجب مراعاة النموذج الجيني للمرض، مثل التأثيرات السائدة أو المتنحية أو التراكمية. ونظرًا للتغاير الجيني، يجب تعديل تحليل GWAS وفقًا للعرق.

دراسة ارتباط الجينات المرشحة

كانت دراسة ارتباط الجينات المرشحة شائعة الاستخدام في الدراسات الجينية قبل ظهور تقنيات التنميط الجيني أو التسلسل عالي الإنتاجية. [ 48 ] تهدف هذه الدراسة إلى فحص عدد محدود من المتغيرات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) المحددة مسبقًا، بحثًا عن ارتباطها بالأمراض أو الأنماط الظاهرية أو الصفات السريرية. لذا، فهي تعتمد على فرضية مسبقة. ونظرًا لاختبار عدد محدود فقط من المتغيرات النوكليوتيدية المفردة، يكفي حجم عينة صغير نسبيًا للكشف عن الارتباط. كما يُستخدم نهج ارتباط الجينات المرشحة بشكل شائع لتأكيد نتائج دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) في عينات مستقلة.

تحديد مواقع التماثل الجيني في الأمراض

يمكن استخدام بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة على مستوى الجينوم لرسم خرائط التماثل الجيني. [ 49 ] رسم خرائط التماثل الجيني هو أسلوب يُستخدم لتحديد المواقع الجينية المتنحية المتماثلة، والتي يمكن أن تكون أداة فعالة لرسم خرائط المناطق الجينومية أو الجينات المتورطة في إمراضية الأمراض.

أنماط المثيلة

العلاقات بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة، وأنماط المثيلة، والتعبير الجيني للصفات البيولوجية

أشارت نتائج أولية حديثة إلى أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) تُعدّ مكونات مهمة للبرنامج فوق الجيني في الكائنات الحية. [ 50 ] [ 51 ] علاوة على ذلك، كشفت دراسات عالمية أجريت على سكان أوروبيين وجنوب آسيويين عن تأثير تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة في مثيلة مواقع CpG محددة. [ 52 ] بالإضافة إلى ذلك، أظهر تحليل إثراء meQTL باستخدام قاعدة بيانات GWAS أن هذه الارتباطات مهمة للتنبؤ بالصفات البيولوجية. [ 52 ] [ 53 ] [ 54 ]

العلوم الجنائية

لطالما استُخدمت تعددات النوكليوتيدات المفردة (SNPs) لمطابقة عينة الحمض النووي الجنائي مع المشتبه به، إلا أن هذه التقنية أصبحت متقادمة مع تطور تقنيات بصمة الحمض النووي القائمة على تكرارات التتابع القصيرة المترادفة ( STR ) . ومع ذلك، قد يُتيح تطوير تقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS) فرصًا أكبر لاستخدام تعددات النوكليوتيدات المفردة في تحديد السمات الظاهرية ، مثل العرق ولون الشعر ولون العينين ، باحتمالية عالية للمطابقة. ويمكن تطبيق ذلك أيضًا لزيادة دقة إعادة بناء ملامح الوجه من خلال توفير معلومات قد تكون مجهولة لولا ذلك، ويمكن استخدام هذه المعلومات للمساعدة في تحديد المشتبه بهم حتى في غياب تطابق في ملف تعريف الحمض النووي القائم على تكرارات التتابع القصيرة المترادفة .

من عيوب استخدام تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) مقارنةً بتكرارات التتابع القصيرة (STRs) أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) يوفر معلومات أقل من تكرارات التتابع القصيرة (STRs)، وبالتالي يتطلب الأمر عددًا أكبر من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) للتحليل قبل إنشاء ملف تعريف للمشتبه به. إضافةً إلى ذلك، يعتمد استخدام تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بشكل كبير على وجود قاعدة بيانات لإجراء التحليل المقارن للعينات. مع ذلك، في حالات العينات المتدهورة أو ذات الحجم الصغير، تُعد تقنيات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بديلاً ممتازًا لطرق تكرارات التتابع القصيرة (STRs). تتميز تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) (مقارنةً بتكرارات التتابع القصيرة (STRs)) بوفرة المؤشرات المحتملة، وإمكانية أتمتتها بالكامل، وإمكانية تقليل طول القطعة المطلوبة إلى أقل من 100  زوج قاعدي. [ 27 ]

علم الصيدلة الجينية

يركز علم الصيدلة الجينية على تحديد الاختلافات الجينية، بما في ذلك تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs)، المرتبطة بالاستجابات المختلفة للعلاج. [ 55 ] يمكن أن تتأثر العديد من الإنزيمات المسؤولة عن استقلاب الأدوية، أو أهدافها، أو مساراتها، بتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة. يمكن أن تُغير تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة المشاركة في أنشطة الإنزيمات المسؤولة عن استقلاب الأدوية من حركية الدواء، بينما يمكن أن تُغير تلك المشاركة في هدف الدواء أو مساره من ديناميكيته . لذلك، تُعد تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة مؤشرات جينية محتملة يمكن استخدامها للتنبؤ بالتعرض للدواء أو فعالية العلاج. تُسمى دراسة الصيدلة الجينية على مستوى الجينوم علم الصيدلة الجينومي . يُعد علم الصيدلة الجينية وعلم الصيدلة الجينومي مهمين في تطوير الطب الدقيق، لا سيما للأمراض الخطيرة مثل السرطانات.

مرض

قد يكون لعدد قليل من المتغيرات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) في الجينوم البشري تأثير على الأمراض البشرية. وقد أُجريت دراسات ارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) واسعة النطاق لأهم الأمراض البشرية، بما في ذلك أمراض القلب ، والأمراض الأيضية ، وأمراض المناعة الذاتية ، والاضطرابات العصبية التنكسية والنفسية . [ 47 ] وقد تم تحديد معظم المتغيرات النوكليوتيدية المفردة ذات التأثيرات الكبيرة نسبيًا على هذه الأمراض. وقد ساهمت هذه النتائج بشكل كبير في تحسين فهمنا لآلية حدوث الأمراض والمسارات الجزيئية، وسهّلت تطوير علاجات أفضل. وستكشف دراسات الارتباط على مستوى الجينوم المستقبلية، التي تُجرى على عينات أكبر، عن المتغيرات النوكليوتيدية المفردة ذات التأثير الصغير نسبيًا على الأمراض. أما بالنسبة للأمراض الشائعة والمعقدة، مثل داء السكري من النوع الثاني ، والتهاب المفاصل الروماتويدي ، ومرض الزهايمر ، فإن عوامل وراثية متعددة تتداخل في مسببات المرض. بالإضافة إلى ذلك، يلعب التفاعل بين الجينات والتفاعل بين الجينات والبيئة دورًا مهمًا في بدء المرض وتطوره. [ 56 ]

أمثلة

  • rs6311 و rs6313 عبارة عن SNPs في جين مستقبل السيروتونين 5-HT2A على الكروموسوم البشري 13. [ 57 ]
  • يُعدّ النوكليوتيد المفرد المتغير -3279C/A (rs3761548) من بين النوكليوتيدات المفردة المتغيرة الموجودة في منطقة المحفز لجين Foxp3 ، وقد يكون له دور في تطور السرطان. [ 58 ]
  • يُسبب تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) في جين F5 حالة التخثر الدموي من نوع العامل الخامس لايدن. [ 59 ]
  • rs3091244 هو مثال على SNP ثلاثي الأليلات في جين CRP على الكروموسوم البشري 1. [ 60 ]
  • يرمز TAS2R38 إلى القدرة على تذوق PTC ، ويحتوي على 6 SNPs مشروحة. [ 61 ]
  • أدى وجود الطفرتين rs148649884 و rs138055828 في جين FCN1 الذي يرمز إلى M-ficolin إلى إضعاف قدرة M-ficolin المؤتلف على الارتباط بالليجاند. [ 62 ]
  • يُغيّر النيوكليوتيد rs12821256 الموجود على وحدة تنظيمية cis كمية نسخ جين ربيطة KIT . لدى سكان شمال أوروبا، تؤدي المستويات العالية من النسخ إلى شعر بني، بينما تؤدي المستويات المنخفضة إلى شعر أشقر. هذا مثال على تغيير واضح في النمط الظاهري، ولكنه غير مرضي، ناتج عن نيوكليوتيد مفرد واحد. [ 63 ]
  • يرتبط تعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة (SNP) داخل الإنترون في جين إصلاح عدم تطابق الحمض النووي PMS2 (rs1059060، Ser775Asn) بزيادة تلف الحمض النووي للحيوانات المنوية وخطر العقم عند الذكور . [ 64 ]

قواعد البيانات

كما هو الحال بالنسبة للجينات، توجد قواعد بيانات المعلوماتية الحيوية للجينات المتغيرة (SNPs).

  • dbSNP هي قاعدة بيانات للعلامات الجينية (SNP) تابعة للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). اعتبارًا من 8 يونيو 2015 أدرجت قاعدة بيانات dbSNP 149,735,377 من المتغيرات الجينية أحادية النوكليوتيد (SNPs) لدى البشر. [ 65 ] [ 66 ]
  • Kaviar [ 67 ] عبارة عن مجموعة من SNPs من مصادر بيانات متعددة بما في ذلك dbSNP.
  • SNPedia هي قاعدة بيانات على غرار ويكي تدعم شرح وتفسير وتحليل الجينوم الشخصي.
  • تصف قاعدة بيانات OMIM العلاقة بين تعدد الأشكال والأمراض (على سبيل المثال، تقدم الأمراض في شكل نصي).
  • dbSAP – قاعدة بيانات تعدد أشكال الأحماض الأمينية المفردة للكشف عن اختلافات البروتين [ 68 ]
  • توفر قاعدة بيانات الطفرات الجينية البشرية معلومات عن الطفرات الجينية التي تسبب أو ترتبط بالأمراض الوراثية البشرية، بالإضافة إلى المتغيرات الجينية الوظيفية (SNPs).
  • مشروع هاب ماب الدولي ، حيث يقوم الباحثون بتحديد علامات SNPs لتحديد مجموعة الأنماط الفردية الموجودة في كل فرد.
  • تتيح منصة GWAS Central للمستخدمين إمكانية فحص بيانات الارتباط الفعلية على مستوى الملخص بشكل مرئي في دراسة واحدة أو أكثر من دراسات الارتباط على مستوى الجينوم .
  • قاعدة بيانات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة للعناصر الوظيفية ، وهي مرجع لجميع تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة المعروفة في الوحدات الوظيفية التي قد تؤثر على نمط ظاهري معين، وفي بعض الحالات قد يكون مرضًا.

قام فريق عمل خريطة SNP الدولية برسم خريطة التسلسل المحيط بكل SNP عن طريق محاذاته مع التسلسل الجينومي للنسخ المستنسخة ذات الإدخالات الكبيرة في بنك الجينات. حُوِّلت هذه المحاذيات إلى إحداثيات كروموسومية موضحة في الجدول  1. [ 69 ] وقد ازدادت هذه القائمة بشكل كبير منذ ذلك الحين، فعلى سبيل المثال، تضم قاعدة بيانات Kaviar الآن 162  مليون متغير من النوكليوتيدات المفردة.

كروموسومالطول (bp)جميع المتغيرات الجينية المفردةتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة في التصلب الحدبي
إجمالي عدد النيوكليوتيدات المفردة المتغيرةكيلوبايت لكل SNPإجمالي عدد النيوكليوتيدات المفردة المتغيرةكيلوبايت لكل SNP
1214,066,000129,9311.6575,1662.85
2222,889,000103,6642.1576,9852.90
3186,938,00093,1402.0163,6692.94
4169,035,00084,4262.0065,7192.57
5170,954,000117,8821.4563,5452.69
6165,022,00096,3171.7153,7973.07
7149,414,00071,7522.0842,3273.53
8125,148,00057,8342.1642,6532.93
9107,440,00062,0131.7343,0202.50
10127,894,00061,2982.0942,4663.01
11129,193,00084,6631.5347,6212.71
12125,198,00059,2452.11381363.28
1393,711,00053,0931.7735,7452.62
1489,344,000441122.0329,7463.00
1573,467,00037,8141.9426,5242.77
1674,037,00038,7351.91233283.17
1773,367,00034,6212.12193963.78
1873,078,000451351.6227,0282.70
1956,044,00025,6762.18111855.01
2063,317,00029,4782.1517,0513.71
2133,824,000209161.6291033.72
2233,786,00028,4101.1911,0563.06
X131,245,000348423.77204006.43
Y21,753,00041935.19178412.19
RefSeq15,696,67414,5341.08
الإجمالي2,710,164,0001,419,1901.91887,4503.05

التسمية

تتضمن تسمية SNPs العديد من الاختلافات لـ SNP فردي، مع عدم وجود إجماع مشترك.

معيار rs### هو المعيار الذي اعتمدته قاعدة بيانات dbSNP ، ويستخدم البادئة "rs" اختصارًا لـ "المتغير الجيني المرجعي"، متبوعة برقم فريد وعشوائي. [ 70 ] غالبًا ما يُشار إلى المتغيرات الجينية برقم rs الخاص بها في قاعدة بيانات dbSNP، كما في الأمثلة المذكورة أعلاه.

تستخدم جمعية تنوع الجينوم البشري (HGVS) معيارًا يوفر معلوماتٍ أكثر تفصيلًا حول تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP). عادةً ما يكون القسم الأول مُعرِّفًا للكروموسوم أو الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، مثل NC_000023.10 (DNA) أو NM_004006.3 (mRNA). ويُشار إلى نوع التغيير بسلسلة نصية.

  • >يشير (أكبر من) إلى استبدال (على مستوى الحمض النووي DNA والحمض النووي RNA)؛ g.123456G>A، r.123c>u (ينطبق على الحمض النووي DNA والحمض النووي RNA).
  • delيشير إلى حذف؛ c.76del (ينطبق على الحمض النووي DNA، والحمض النووي الريبي RNA، والبروتين).
  • dupيشير إلى تكرار؛ c.76dup (ينطبق على الحمض النووي DNA، والحمض النووي الريبي RNA، والبروتين).
  • insيشير إلى إدخال؛ c.76_77insG (ينطبق على الحمض النووي DNA، والحمض النووي الريبي RNA، والبروتين). توصف عمليات الإدخال المتكررة بأنها تكرارات، وليس كإدخالات.
  • invيشير إلى انقلاب؛ c.76_83inv (ينطبق على الحمض النووي DNA والحمض النووي RNA). لا يُستخدم على مستوى البروتين، ويُوصف عادةً بأنه حذف-إدخال.
  • fsيشير إلى انزياح الإطار؛ p.Arg456GlyfsTer17.
  • extيشير إلى امتداد؛ ص.Met1ext-5 (انظر الامتداد).

ومن الأمثلة على ذلك:

  • c.76A > T: "c." للدلالة على منطقة الترميز ، متبوعًا برقم لموقع النيوكليوتيد، متبوعًا باختصار من حرف واحد للنيوكليوتيد (A أو C أو G أو T أو U)، متبوعًا بعلامة أكبر من (">") للإشارة إلى الاستبدال، متبوعًا باختصار النيوكليوتيد الذي يحل محل السابق [ 71 ] [ 72 ] [ 73 ]
  • p.Ser123Arg: "p." للبروتين، متبوعًا باختصار من ثلاثة أحرف للحمض الأميني، متبوعًا برقم لموقع الحمض الأميني، متبوعًا باختصار الحمض الأميني الذي يحل محل الأول. [ 74 ]
  • g.1234_2345inv: "g." لمنطقة الجينوم، متبوعة برقم لإحداثيات البداية والنهاية، و"inv" للدلالة على الانقلاب.

تحليل SNP

يمكن تحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) بسهولة نظرًا لاحتوائها على أليلين محتملين فقط وثلاثة أنماط جينية محتملة تشمل هذين الأليلين: متماثل الزيجوت A، ومتماثل الزيجوت B، ومتباين الزيجوت AB، مما يتيح استخدام العديد من تقنيات التحليل. تشمل بعض هذه التقنيات: تسلسل الحمض النووي ، والرحلان الكهربائي الشعيري ، وقياس الطيف الكتلي ، وتعدد أشكال التوافق أحادي السلسلة (SSCP)، وتمديد القاعدة المفردة ، والتحليل الكهروكيميائي، والفصل الكروماتوغرافي السائل عالي الأداء (HPLC) والرحلان الكهربائي الهلامي ، وتعدد أطوال قطع التقييد ، وتحليل التهجين .

برامج للتنبؤ بتأثيرات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة

تُعدّ الطفرات النقطية التي تُسبب تغييرًا في الأحماض الأمينية على مستوى البروتين مجموعةً مهمةً من الطفرات النقطية المفردة (SNPs). ويمكن أن تُحدث الطفرة النقطية في بقايا معينة تأثيراتٍ مختلفة على وظيفة البروتين (من انعدام التأثير إلى تعطيل وظيفته تمامًا). عادةً، يكون لتغيير الأحماض الأمينية ذات الحجم والخصائص الفيزيائية والكيميائية المتشابهة (مثل استبدال الليوسين بالفالين) تأثيرٌ طفيف، والعكس صحيح. وبالمثل، إذا أدت الطفرة النقطية المفردة إلى تعطيل عناصر البنية الثانوية (مثل استبدال الليوسين بالبرولين في منطقة الحلزون ألفا )، فقد تؤثر هذه الطفرة عادةً على بنية البروتين ووظيفته بالكامل. وباستخدام هذه القواعد البسيطة والعديد من القواعد الأخرى المستمدة من التعلم الآلي، تم تطوير مجموعة من البرامج للتنبؤ بتأثير الطفرات النقطية المفردة: [ 75 ]

  • يوفر برنامج SIFT نظرة ثاقبة حول كيفية تأثير الطفرة غير المترادفة أو الطفرة غير المترادفة التي تحدث في المختبر على وظيفة البروتين بناءً على الخصائص الفيزيائية للأحماض الأمينية وتماثل التسلسل.
  • يُقدّر برنامج LIST (الهوية المحلية والتصنيفات المشتركة) [ 76 ] [ 77 ] مدى الضرر المحتمل للطفرات الناتجة عن تغيير وظائف البروتينات. ويستند هذا البرنامج إلى افتراض أن الاختلافات الملحوظة في الأنواع وثيقة الصلة تكون أكثر أهمية عند تقييم مستوى الحفظ مقارنةً بتلك الموجودة في الأنواع المتباعدة الصلة.
  • SNAP2
  • يشتبه
  • بوليفين-2
  • PredictSNP
  • موقع MutationTaster الرسمي
  • مُتنبئ تأثير المتغيرات من مشروع Ensembl
  • SNPViz مؤرشف في 2020-08-07 في Wayback Machine : [ 78 ] يوفر هذا البرنامج تمثيلًا ثلاثي الأبعاد للبروتين المتأثر، مع تسليط الضوء على تغيير الأحماض الأمينية حتى يتمكن الأطباء من تحديد مدى إمراضية البروتين الطافر.
  • أثبت
  • PhyreRisk هي قاعدة بيانات تربط المتغيرات بالبنى البروتينية التجريبية والمتوقعة. [ 79 ]
  • Missense3D هي أداة توفر تقريرًا كيميائيًا فراغيًا حول تأثير المتغيرات غير المترادفة على بنية البروتين. [ 80 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ "تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة / SNP | تعلم العلوم على Scitable" . www.nature.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 نوفمبر 2015. تم الاطلاع عليه بتاريخ 13 نوفمبر 2015 .
  2. ↑ شيري، إس تي؛ وارد، إم؛ سيروتكين، ك. (1999). "dbSNP - قاعدة بيانات لتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة وأنواع أخرى من التباين الجيني الطفيف" . أبحاث الجينوم . 9 (8): 677-679 . doi : 10.1101/gr.9.8.677 . PMID 10447503. S2CID 10775908 .  
  3. ↑ لاندر، إي إس؛ وآخرون (2001). "التسلسل الأولي وتحليل الجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 409 (6822): 860-921 . Bibcode : 2001Natur.409..860L . doi : 10.1038/35057062 . hdl : 2027.42/62798 . PMID 11237011 .  
  4. ↑ أوتون، آدم؛ وآخرون (2015). " مرجع عالمي للتنوع الجيني البشري" . مجلة نيتشر . 526 (7571): 68-74 . Bibcode : 2015Natur.526...68T . doi : 10.1038/nature15393 . PMC 4750478. PMID 26432245 .   
  5. ↑ مونغا، إيشا؛ قريشي، عابد؛ ثاكور، نيشانت؛ غوبتا، أميت كومار؛ كومار، مانوج (سبتمبر 2017). " ASPsiRNA: مورد لـ ASP-siRNAs ذات إمكانات علاجية للاضطرابات الوراثية البشرية وخوارزمية للتنبؤ بفعاليتها التثبيطية" . G3 . 7 (9): 2931-2943 . doi : 10.1534/g3.117.044024 . PMC 5592921. PMID 28696921 .  
  6. ↑ كاليب، برتراند؛ غيونو، كزافييه؛ سينلوب، فلوريان (مارس 2014). "عامل المتممة H والبروتينات ذات الصلة في التنكس البقعي المرتبط بالعمر" . Comptes Rendus Biologies . 337 (3): 178–184 . doi : 10.1016/j.crvi.2013.12.003 . ISSN 1631-0691 . PMID 24702844 .  
  7. ↑ حسين، محمد أمير؛ لوران، بينوا؛ بلورد، ميلاني (17 فبراير 2021). "APOE ومرض الزهايمر: من نقل الدهون إلى الفيزيولوجيا المرضية والعلاجات" . مجلة فرونتيرز إن نيوروساينس . 15 630502. doi : 10.3389/fnins.2021.630502 . ISSN 1662-453X . PMC 7925634. PMID 33679311 .   
  8. ↑ "تعريف متغير النوكليوتيد المفرد - قاموس المصطلحات الوراثية التابع للمعهد الوطني للسرطان" . www.cancer.gov . 2012-07-20 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2023-05-02 .
  9. ↑ رايت، آلان ف. (23 سبتمبر 2005)، "التنوع الجيني: تعدد الأشكال والطفرات"، eLS ، وايلي، doi : 10.1038/npg.els.0005005 ، ISBN 978-0-470-01617-6، S2CID 82415195 
  10. ↑ غويا، ر.؛ صن، م.ج.؛ مورين، ر.د.؛ ليونغ، ج.؛ ها، ج.؛ ويغاند، ك.س.؛ سينز، ج.؛ كريسان، أ.؛ مارا، م.أ.؛ هيرست، م.؛ هانتسمان، د.؛ مورفي، ك.ب.؛ أباريسيو، س.؛ شاه، س.ب. (2010). "SNVMix: التنبؤ بالمتغيرات النوكليوتيدية المفردة من التسلسل الجيني للأورام من الجيل التالي" . المعلوماتية الحيوية . 26 (6): 730-736 . doi : 10.1093/bioinformatics/btq040 . PMC 2832826. PMID 20130035 .  
  11. ↑ كاتسونيس، بانايوتيس؛ كوير، أماندا؛ ويلسون، ستيفن جوزيف؛ هسو، تينغ-كوي؛ لوا، رونالد سي؛ ويلكينز، أنجيلا داون؛ ليشتارج، أوليفييه (2014-10-20). " التغيرات في النوكليوتيدات المفردة: التأثير البيولوجي والتفسير النظري" . علم البروتين . 23 (12): 1650-1666 . doi : 10.1002/pro.2552 . ISSN 0961-8368 . PMC 4253807. PMID 25234433 .   
  12. ↑ خورانا، إيكتا؛ فو، ياو؛ تشاكرافارتي، ديمبل؛ ديميشيليس، فرانشيسكا؛ روبين، مارك أ.؛ جيرستين، مارك (19 يناير 2016). "دور متغيرات التسلسل غير المشفر في السرطان". مجلة Nature Reviews Genetics . 17 (2): 93-108 . doi : 10.1038/nrg.2015.17 . ISSN 1471-0056 . PMID 26781813. S2CID 14433306 .   
  13. ^ دونغ، هونغجي؛ وانغ شواي. تشانغ، جونمي. تشانغ، كوندي. تشانغ، فنغيو. وانغ، هونغوي. شيه، شيلينغ. هو، وي؛ قو، ليتشوان (2021). "التصميم التمهيدي القائم على الهيكل يقلل من خطر فشل PCR الناجم عن طفرات SARS-CoV-2" . الحدود في علم الأحياء الدقيقة الخلوي والعدوى . 11 741147. دوى : 10.3389/fcimb.2021.741147 . ISSN 2235-2988 . بمك 8573093 . بميد 34760717 .   
  14. ↑ كاركي، روشان؛ بانديا، ديب؛ إلستون، روبرت سي؛ فيرليني، كريستيانو (15 يوليو 2015). "تعريف "الطفرة" و"تعدد الأشكال" في عصر علم الجينوم الشخصي" . مجلة BMC Medical Genomics . 8 (1). Springer Science and Business Media LLC: 37. doi : 10.1186/s12920-015-0115-z . ISSN 1755-8794 . PMC 4502642. PMID 26173390 .   
  15. ↑ لي، هينغ (15 مارس 2021). "SNP مقابل SNV" . مدونة هينغ لي . تم الاطلاع عليه في 3 مايو 2023 .
  16. ↑ سبنسر، بايج س.؛ بارال، خوسيه م. (2012). "تكرار الشفرة الوراثية وتأثيره على عديدات الببتيد المشفرة" . مجلة التكنولوجيا الحيوية الحاسوبية والبنيوية . 1 e201204006. doi : 10.5936/csbj.201204006 . ISSN 2001-0370 . PMC 3962081. PMID 24688635 .   
  17. ↑ تشو، دوان؛ وي، لاي (16 أبريل 2019). "الطفرات غير المترادفة والمترادفة والطفرات غير المنطقية في الجينات البشرية المرتبطة بالسرطان تخضع لعمليات انتقاء تطهيري أقوى من المتوقع" . مجلة BMC Cancer . 19 (1): 359. doi : 10.1186/s12885-019-5572-x . ISSN 1471-2407 . PMC 6469204. PMID 30991970 .   
  18. ↑ لي جي، بان تي، غو دي، لي إل سي (2014). "المتغيرات التنظيمية والأمراض: تعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة E-Cadherin -160C/A كمثال" . مجلة البيولوجيا الجزيئية الدولية . 2014 967565. doi : 10.1155/2014/967565 . PMC 4167656. PMID 25276428 .  
  19. ↑ لو واي إف، ماوجر دي إم، غولدشتاين دي بي، أوربان تي جيه، ويكس كيه إم، برادريك إس إس (نوفمبر 2015). " إعادة تشكيل بنية mRNA لـ IFNL3 بواسطة تعدد أشكال وظيفي غير مشفر مرتبط بتطهير فيروس التهاب الكبد الوبائي سي" . التقارير العلمية . 5 16037. Bibcode : 2015NatSR...516037L . doi : 10.1038/srep16037 . PMC 4631997. PMID 26531896 .  
  20. ↑ كيمتشي-سارفاتي سي، أوه جيه إم، كيم آي دبليو، ساونا زد إي، كالكانيو إيه إم، أمبودكار إس في، غوتسمان إم إم (يناير 2007). " تعدد أشكال "صامت" في جين MDR1 يغير خصوصية الركيزة" . مجلة ساينس . 315 (5811): 525-528 . Bibcode : 2007Sci...315..525K . doi : 10.1126/science.1135308 . PMID 17185560. S2CID 15146955 .  
  21. ^ الحجار م، ماديج-بيلارتشيك أ، كوزلوفسكي إل، بوجنيكي جي إم، يحيى إس، عبد الهادي د، شمس أ، أحمد ن، حامد إس، بوزيانوسكا-كوزنيكا إم (نوفمبر 2012). "طفرة متجانسة جديدة p.Arg527Leu LMNA في عائلتين مصريتين غير مرتبطتين تسبب خلل التنسج الفكي السفلي العجزي ومتلازمة بروجيريا" . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 20 (11): 1134–40 . دوى : 10.1038/ejhg.2012.77 . بمك 3476705 . بميد 22549407 .  
  22. ↑ كوردوفادو إس كيه، وهندريكس إم، وغرين سي إن، وموشال إس، وإيرلي إم سي، وفاريل بي إم، وخرازي إم، وهانون دبليو إتش، ومولر بي دبليو (فبراير 2012). " تحليل طفرة CFTR وارتباطات النمط الفرداني لدى مرضى التليف الكيسي" . علم الوراثة الجزيئية والأيض . 105 (2): 249-254 . doi : 10.1016/j.ymgme.2011.10.013 . PMC 3551260. PMID 22137130 .  
  23. ↑ "ما هي تعددات أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs)؟: MedlinePlus Genetics" . medlineplus.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 22-03-2023 .
  24. ↑ Auton A، Brooks LD، Durbin RM، Garrison EP، Kang HM، Korbel JO، Marchini JL، McCarthy S، McVean GA، Abecasis GR (أكتوبر 2015). "مرجع عالمي للتنوع الوراثي البشري" . طبيعة . 526 (7571): 68–74 . بيب كود : 2015Natur.526...68T . دوى : 10.1038 / طبيعة 15393 . بمك 4750478 . بميد 26432245 .  
  25. ^ باريرو إل بي، لافال جي، كوتش إتش، باتين إي، كوينتانا-مورسي إل (مارس 2008). “لقد أدى الانتقاء الطبيعي إلى التمايز السكاني لدى البشر المعاصرين”. علم الوراثة الطبيعة . 40 (3): 340-5 . دوى : 10.1038 / ng.78 . بميد 18246066 . S2CID 205357396 .  
  26. ↑ ناشمان، م. و. (سبتمبر 2001). "تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ومعدل إعادة التركيب لدى البشر". اتجاهات في علم الوراثة . 17 (9): 481-485 . doi : 10.1016/S0168-9525(01)02409-X . PMID 11525814 . 
  27. 1 2 فاريلا إم إيه، آموس دبليو (مارس 2010). "التوزيع غير المتجانس للنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة في الجينوم البشري: الأقمار الميكروية كمؤشرات لتنوع النيوكليوتيدات واختلافها". علم الجينوم . 95 (3): 151-159 . doi : 10.1016/j.ygeno.2009.12.003 . PMID 20026267 . 
  28. ↑ بيرغستروم أ، مكارثي س أ، هوي ر، المري م أ، أيوب ق، دانيك ب؛ وآخرون . (2020). "رؤى حول التباين الجيني البشري وتاريخ السكان من 929 جينومًا متنوعًا" . مجلة ساينس . 367 (6484) eaay5012. doi : 10.1126/science.aay5012 . PMC 7115999. PMID 32193295 .   {{cite journal}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين ( رابط )
  29. ↑ تشو ز، يوان د، لو د، لو إكس، هوانغ إس (24 يوليو 2015). "إثراء الأليلات الثانوية للنيوكليوتيدات المفردة الشائعة وتحسين التنبؤ بخطر الإصابة بمرض باركنسون" . PLOS ONE . 10 (7) e0133421. Bibcode : 2015PLoSO..1033421Z . doi : 10.1371/journal.pone.0133421 . PMC 4514478. PMID 26207627 .  
  30. ↑ هيفرت، فالنتين؛ ليبلوا، رافائيل؛ بيتي، إريك جيه؛ غوتييه، ماثيو؛ فيتاليس، رينو (30 يوليو 2018). " قياس التمايز الجيني من بيانات تسلسل التجميع" . علم الوراثة . 210 (1): 315-330 . doi : 10.1534/genetics.118.300900 . ISSN 0016-6731 . PMC 6116966. PMID 30061425 .   
  31. ↑ إيكبلوم، ر؛ غاليندو، ج (2010-12-08). "تطبيقات تسلسل الجيل التالي في علم البيئة الجزيئية للكائنات غير النموذجية" . الوراثة . 107 ( 1): 1-15 . doi : 10.1038/hdy.2010.152 . ISSN 0018-067X . PMC 3186121. PMID 21139633 .   
  32. ↑ إليغرين، هانز (يناير 2014). "تسلسل الجينوم وعلم جينوم السكان في الكائنات غير النموذجية". اتجاهات في علم البيئة والتطور . 29 (1): 51-63 . Bibcode : 2014TEcoE..29...51E . doi : 10.1016/j.tree.2013.09.008 . ISSN 0169-5347 . PMID 24139972 .  
  33. ^ تشن تشاو. باريجو، ميلاني؛ مؤمني، جمال؛ لانجا، خورخي. نيلسن، راسموس O .؛ شي، وي؛ Smartbees Wp Diversity Contributors, null; فينجبورج، ريكي؛ كريجر، لكل؛ بوجا، ماريا؛ إستونبا، أندوني؛ ميكسنر ، مارينا (2022/01/21). "التركيبة السكانية والتنوع في نحل العسل الأوروبي (Apismellifera L.) - مقارنة تجريبية لتسلسل الجينوم الكامل والمفرد" . الجينات . 13 (2): 182. دوى : 10.3390 / الجينات 13020182 . ردمك 2073-4425 . بمك 8872436 . بميد 35205227 .   {{cite journal}}له |last7=اسم عام ( مساعدة )
  34. ↑ دورانت، يان؛ بينستان، لورا؛ روجيمون، كوينتين؛ نورماندو، إريك؛ بويل، برايان؛ روشيت، ريمي؛ بيرناتشيز، لويس (2019). "مقارنة تقنيات التنميط الجيني Pool-seq وRapture وGBS لاستنتاج بنية التجمعات السكانية الضعيفة: جراد البحر الأمريكي (Homarus americanus) كدراسة حالة" . علم البيئة والتطور . 9 (11): 6606-6623 . Bibcode : 2019EcoEv...9.6606D . doi : 10.1002/ece3.5240 . ISSN 2045-7758 . PMC 6580275. PMID 31236247 .   
  35. ↑ فيندرامي، ديفيد إل جيه؛ تيليسكا، لوكا؛ ويغاند، هانا؛ فايس، مارتينا؛ فوسيت، كاتي؛ ليمان، كاترين؛ كلارك، إم إس؛ ليز، فلوريان؛ ماكمين، كاري؛ مور، هيذر؛ هوفمان، جوزيف آي. (2017). " تسلسل RAD يكشف عن بنية سكانية دقيقة في اللافقاريات القاعية: دلالات لفهم المرونة الظاهرية" . مجلة الجمعية الملكية للعلوم المفتوحة . 4 (2) 160548. Bibcode : 2017RSOS....460548V . doi : 10.1098/rsos.160548 . PMC 5367306. PMID 28386419 .  
  36. ↑ أوفلمان، إميل؛ هوانغ، تشين تشين؛ مونونغ، نتشانغوي سينتيا؛ دي فريس، جانتينا؛ أوكادا، يوكينوري؛ مارتن، أليسيا ر.؛ مارتن، هيلاري س.؛ لابالاينن، تولي؛ بوستوما، دانييل (2021-08-26). "دراسات الارتباط على مستوى الجينوم" . مجلة Nature Reviews Methods Primers . 1 (1): 59. doi : 10.1038/s43586-021-00056-9 . hdl : 1871.1/66fb93bd-20f0-498c-923a-88626cbba8c8 . ISSN 2662-8449 . 
  37. ^ بونييلو ، أناليزا. ماك آرثر، جاكلين آل؛ سيريزو، ماريا؛ هاريس، لورا دبليو. هايهورست، جيمس. مالانجون، سينزيا؛ مكماهون، أويف؛ موراليس، جوانيلا؛ ماونت جوي، إدوارد؛ سوليس، إليوت. سوفجيس، دانيال. فروسغو، أولغا؛ ويتزل، باتريشيا L.؛ عامود، رضوان؛ غيلين ، خوسيه أ. (2019-01-08). "كتالوج NHGRI-EBI GWAS لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم المنشورة والمصفوفات المستهدفة والإحصائيات الموجزة 2019" . أبحاث الأحماض النووية . 47 (د1): د1005 – د1012. دوى : 10.1093/نار/gky1120 . ردمك 1362-4962 . بمك 6323933 . PMID 30445434 .   
  38. ↑ كارلسون، كريستوفر س.؛ إيبرلي، مايكل أ.؛ ريدر، مارك ج.؛ يي، تشيان؛ كروغلياك، ليونيد؛ نيكرسون، ديبورا أ. (يناير 2004). "اختيار مجموعة ذات معلومات قصوى من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لتحليلات الارتباط باستخدام اختلال التوازن الارتباطي" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 74 (1): 106-120 . doi : 10.1086/381000 . ISSN 0002-9297 . PMC 1181897. PMID 14681826 .   
  39. ↑ سيباستياني، باولا؛ لازاروس، روس؛ فايس، سكوت ت.؛ كونكل، لويس م.؛ كوهان، إسحاق س.؛ راموني، ماركو ف. (19 أغسطس/آب 2003). "الوسم الأدنى للنمط الفرداني" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 100 (17): 9900-9905 . Bibcode : 2003PNAS..100.9900S . doi : 10.1073 / pnas.1633613100 . ISSN 0027-8424 . PMC 187880. PMID 12900503 .   
  40. ↑ غابرييل، ستايسي ب.؛ شافنر، ستيفن ف.؛ نغوين، هوي؛ مور، جيمي م.؛ روي، جيسيكا؛ بلومنشتيل، بريندان؛ هيغينز، جون؛ ديفيليس، ماثيو؛ لوكنر، إيمي؛ فاغارت، مورا؛ ليو-كورديرو، شاو نين؛ روتيمي، تشارلز؛ أديمو، أديبوال؛ كوبر، ريتشارد؛ وارد، ريك (21-06-2002). "بنية كتل النمط الفرداني في الجينوم البشري". مجلة ساينس . 296 (5576): 2225-2229 . رمز Bibcode : 2002Sci...296.2225G . doi : 10.1126/science.1069424 . ISSN 1095-9203 . PMID 12029063 .  
  41. ↑ ألتشولر، ديفيد؛ دونيلي، بيتر؛ اتحاد هاب ماب الدولي (أكتوبر 2005). "خريطة النمط الفرداني للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 437 (7063): 1299-1320 . رمز Bibcode : 2005Natur.437.1299T . doi : 10.1038 / nature04226 . ISSN 1476-4687 . PMC 1880871. PMID 16255080 .   
  42. ↑ سلاتكين، مونتغمري (يونيو 2008). "اختلال التوازن الارتباطي - فهم الماضي التطوري ورسم ملامح المستقبل الطبي" . مراجعات الطبيعة . علم الوراثة . 9 (6): 477-485 . doi : 10.1038/nrg2361 . ISSN 1471-0064 . PMC 5124487. PMID 18427557 .   
  43. ↑ وول، جيفري د.؛ بريتشارد، جوناثان ك. (سبتمبر 2003). "تقييم أداء نموذج كتلة النمط الفرداني لعدم التوازن الارتباطي" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 73 (3): 502-515 . doi : 10.1086/378099 . ISSN 0002-9297 . PMC 1180676. PMID 12916017 .   
  44. ↑ ووكر، تيموثي م.؛ إيب، كاميلا إل سي؛ هاريل، روث هـ.؛ إيفانز، جيسون ت.؛ كاباتي، جورجيا؛ ديديكوت، مارتن ج.؛ إير، ديفيد و.؛ ويلسون، دانيال ج.؛ هوكي، بيتر م.؛ كروك، ديريك و.؛ باركهيل، جوليان؛ هاريس، ديفيد؛ ووكر، أ. سارة؛ باودن، روري؛ مونك، فيليب (فبراير 2013). "تسلسل الجينوم الكامل لتحديد تفشي بكتيريا السل: دراسة رصدية استرجاعية" . مجلة لانسيت للأمراض المعدية . 13 (2): 137-146 . doi : 10.1016/S1473-3099(12)70277-3 . ISSN 1474-4457 . PMC 3556524 . PMID 23158499 .   
  45. ↑ برايس، ألكيس ل.؛ باترسون، نيك ج.؛ بلينج، روبرت م.؛ واينبلات، مايكل إي.؛ شاديك، نانسي أ.؛ رايش، ديفيد (أغسطس 2006). "تحليل المكونات الرئيسية يُصحح التباين الطبقي في دراسات الارتباط على مستوى الجينوم" . مجلة نيتشر جينيتكس . 38 (8): 904-909 . doi : 10.1038/ng1847 . ISSN 1546-1718 . PMID 16862161 .  
  46. ↑ كارلسون، بروس (15 يونيو 2008). "تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة - طريق مختصر للطب الشخصي" . أخبار الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية . 28 (12). ماري آن ليبرت، المحدودة. مؤرشف من الأصل في 26 ديسمبر 2010. تم الاسترجاع في 6 يوليو 2008. (عنوان فرعي) من المتوقع أن تشهد التطبيقات الطبية نموًا في السوق .
  47. 1 2 فيشر، بيتر م.؛ راي، نعومي ر.؛ تشانغ، تشيان؛ سكلار، باميلا؛ مكارثي، مارك آي.؛ براون، ماثيو أ.؛ يانغ، جيان (يوليو 2017). "10 سنوات من اكتشافات دراسات الارتباط على مستوى الجينوم: البيولوجيا، والوظيفة، والترجمة" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 101 (1): 5-22 . doi : 10.1016/j.ajhg.2017.06.005 . ISSN 0002-9297 . PMC 5501872. PMID 28686856 .   
  48. ↑ دونغ، ليندا م.؛ بوتر، جون د.؛ وايت، إميلي؛ أولريش، كورنيليا م.؛ كاردون، لون ر.؛ بيترز، أولريك (28 مايو 2008). "الاستعداد الوراثي للسرطان" . مجلة الجمعية الطبية الأمريكية . 299 (20): 2423-2436 . doi : 10.1001 / jama.299.20.2423 . ISSN 0098-7484 . PMC 2772197. PMID 18505952 .   
  49. ↑ الكريا، فوزان س. (أبريل 2010). "تحديد مواقع التماثل الجيني: أداة إضافية في ترسانة أخصائي علم الوراثة السريرية" . علم الوراثة في الطب . 12 (4): 236-239 . doi : 10.1097/gim.0b013e3181ceb95d . ISSN 1098-3600 . PMID 20134328. S2CID 10789932 .   
  50. ↑ فوهرا، مانيك؛ شارما، أنو رادها؛ برابهو ب، نافيا؛ راي، بادمالاثا س. (2020). "تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة في مواقع مثيلة الحمض النووي، وارتباط عوامل النسخ، وأهداف الحمض النووي الريبوزي الميكروي المؤدية إلى التعبير الجيني الخاص بالأليل والمساهمة في خطر الإصابة بالأمراض المعقدة: مراجعة منهجية" . علم جينوم الصحة العامة . 23 ( 5-6 ): 155-170 . doi : 10.1159/000510253 . ISSN 1662-4246 . PMID 32966991. S2CID 221886624 .   
  51. ↑ وانغ، جينغ؛ ما، شياو تشين؛ تشانغ، تشي؛ تشن، يينغ هوي؛ وو، دان؛ تشاو، بنغ جون؛ يو، يو (2021). "تحليل التفاعل بين متغيرات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة ومثيلة الحمض النووي يكشف عن جينات جديدة مُسببة للأمراض في أمراض القلب الخلقية" . مجلة فرونتيرز في بيولوجيا الخلية والتطور . 9 665514. doi : 10.3389/fcell.2021.665514 . ISSN 2296-634X . PMC 8143053. PMID 34041244 .   
  52. هاوي ، يوهان س.؛ ويلسون، روري؛ شميد، كاتارينا ت .؛ تشو، لي؛ لاكشمانان، لاكشمي نارايانان؛ لينه، بنجامين س.؛ كوهنيل، بريجيت؛ سكوت، ويليام ر.؛ ويلشر، ماتياس؛ يو، ييك وينغ؛ باومباخ، كليمنس؛ لي، دومينيك ب.؛ مارولي، إيريني؛ برنارد، مانون؛ فايفر، ليليان (يناير 2022). "التنوع الجيني المؤثر على مثيلة الحمض النووي يوفر رؤى ثاقبة حول الآليات الجزيئية التي تنظم الوظيفة الجينومية" . علم الوراثة الطبيعية . 54 (1): 18-29 . doi : 10.1038/s41588-021-00969-x . ISSN 1546-1718 . PMC 7617265 . PMID 34980917 . S2CID 256821844 .    
  53. ↑ بيرزل مانديل، كيرا أ.؛ إيجلز، نيكولاس ج.؛ ويلتون، ريتشارد؛ برايس، أماندا ج.؛ سيميك، ستيفن أ.؛ كولادو-توريس، ليوناردو؛ أولريش، ويليام س.؛ تاو، ران؛ هان، شيزهونغ؛ زالاي، ألكسندر س.؛ هايد، توماس م.؛ كلاينمان، جويل إي.؛ واينبرغر، دانيال ر.؛ جافي، أندرو إي. (2021-09-02). "تحديد مواقع السمات الكمية للمثيلة ودورها في خطر الإصابة بالفصام باستخدام التسلسل على مستوى الجينوم" . نيتشر كوميونيكيشنز . 12 (1): 5251. Bibcode : 2021NatCo..12.5251P . doi : 10.1038/s41467-021-25517-3 . ISSN 2041-1723 . PMC 8413445. PMID 34475392 .​   
  54. ↑ هوفمان، أنكه؛ زيلر، مايكل؛ سبينغلر، ديتمار (ديسمبر 2016). "المستقبل هو الماضي: مواقع الصفات الكمية للمثيلة في الفصام" . الجينات . 7 ( 12): 104. doi : 10.3390/genes7120104 . ISSN 2073-4425 . PMC 5192480. PMID 27886132 .   
  55. ↑ دالي، آن ك. (11 أكتوبر 2017). "علم الصيدلة الجينية: مراجعة عامة للتقدم المحرز حتى الآن" . النشرة الطبية البريطانية . 124 (1): 65-79 . doi : 10.1093/bmb/ldx035 . ISSN 0007-1420 . PMID 29040422 .  
  56. ↑ موسكي، راشيل جيه؛ أوغستينافيسيوس، جورا إل؛ فولك، هيذر (13 أغسطس/آب 2019). "التفاعلات بين الجينات والبيئة في الطب النفسي: أدلة حديثة وآثار سريرية" . تقارير الطب النفسي الحالية . 21 (9): 81. doi : 10.1007/s11920-019-1065-5 . ISSN 1523-3812 . PMC 7340157. PMID 31410638 .   
  57. ↑ جيجلينج، آي.، هارتمان، أ.م.، مولر، هـ.ج.، روجيسكو، د. (نوفمبر 2006). "ترتبط سمات الغضب والعدوان بتعدد الأشكال في جين 5-HT-2A". مجلة الاضطرابات العاطفية . 96 ( 1-2 ): 75-81 . doi : 10.1016/j.jad.2006.05.016 . PMID 16814396 . 
  58. ↑ عز الدينى ر، سومي م ح، تاغيخاني م، مؤدب سي، مسنادي شيرازي ك، شيرمحمدي م، افتخارسادات أت، صادقي مقدم ب، سالك فروخي أ (فبراير 2021). "رابطة تعدد الأشكال Foxp3 rs3761548 مع تركيز السيتوكينات في مرضى سرطان المعدة الغدي". السيتوكين . 138 155351. دوى : 10.1016/j.cyto.2020.155351 . ردمك 1043-4666 . بميد 33127257 . S2CID 226218796 .   
  59. ↑ كوجوفيتش جيه إل (يناير 2011). "التخثر الدموي الناتج عن العامل الخامس لايدن" . علم الوراثة في الطب . 13 (1): 1-16 . doi : 10.1097/GIM.0b013e3181faa0f2 . PMID 21116184 . 
  60. ↑ موريتا أ، ناكاياما ت، دوبا ن، هينوهارا س، ميزوتاني ت، سوما م (يونيو 2007). "التنميط الجيني للنيوكليوتيدات المفردة ثلاثية الأليلات باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل TaqMan". مجلة Molecular and Cellular Probes . 21 (3): 171-176 . doi : 10.1016/j.mcp.2006.10.005 . PMID 17161935 . 
  61. ↑ برودي دي إيه، دراينا دي، فورابوسكو بي، بالماس إم إيه، مايسترال جي بي، بيراس دي، بيراستو إم، أنجيوس إيه (أكتوبر 2004). "دراسة الطعم المر في عينة وراثية معزولة من سردينيا تدعم ارتباط حساسية فينيل ثيوكارباميد بجين مستقبل المرارة TAS2R38" . الحواس الكيميائية . 29 (8): 697-702 . doi : 10.1093/chemse/bjh074 . PMID 15466815 . 
  62. ↑ Ammitzbøll CG، Kjær TR، Steffensen R، Stengaard-Pedersen K، Nielsen HJ، Thiel S، Bøgsted M، Jensenius JC (28 نوفمبر 2012). "الأشكال غير المترادفة في جين FCN1 تحدد قدرة ربط اللجند ومستويات مصل M-ficolin" . بلوس واحد . 7 (11) هـ50585. بيب كود : 2012PLoSO...750585A . دوى : 10.1371/journal.pone.0050585 . بمك 3509001 . بميد 23209787 .  
  63. ↑ غونتر، كاثرين أ.؛ تاسيك، بوسيلكا؛ لو، ليكن؛ بيديل، ماري أ.؛ كينغسلي، ديفيد م. (يوليو 2014). " أساس جزيئي للون الشعر الأشقر الكلاسيكي لدى الأوروبيين" . علم الوراثة الطبيعية . 46 (7): 748-752 . doi : 10.1038/ng.2991 . ISSN 1546-1718 . PMC 4704868. PMID 24880339 .   
  64. ↑ جي جي، لونغ واي، تشو واي، هوانغ سي، غو إيه، وانغ إكس (مايو 2012). "المتغيرات الشائعة في جينات إصلاح عدم تطابق الحمض النووي المرتبطة بزيادة خطر تلف الحمض النووي للحيوانات المنوية والعقم عند الذكور" . مجلة بي إم سي الطبية . 10 49. doi : 10.1186/1741-7015-10-49 . PMC 3378460. PMID 22594646 .  
  65. ↑ المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب. 2014. قاعدة بيانات NCBI dbSNP الإصدار 142 للبشر. " [ إعلان DBSNP ] قاعدة بيانات DBSNP البشرية الإصدار 142 (GRCh38 وGRCh37.p13)" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 سبتمبر 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 سبتمبر 2017 .
  66. ↑ المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب. 2015. قاعدة بيانات NCBI dbSNP الإصدار 144 للبشر. صفحة الملخص. "ملخص DBSNP" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 سبتمبر 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 سبتمبر 2017 .
  67. ↑ غلوسمان، جي.، كاباليرو، ج.، مولدين، دي. إي.، هود، إل.، روش، جيه. سي. (نوفمبر 2011). "كافيار: نظام سهل الاستخدام لاختبار حداثة الطفرات النقطية المفردة" . المعلوماتية الحيوية . 27 (22): 3216-3217 . doi : 10.1093/bioinformatics/btr540 . PMC 3208392. PMID 21965822 .  
  68. ↑ Cao R, Shi Y, Chen S, Ma Y, Chen J, Yang J, Chen G, Shi T (يناير 2017). "dbSAP: قاعدة بيانات تعدد أشكال الأحماض الأمينية المفردة للكشف عن تباين البروتين" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (D1): D827– D832 . doi : 10.1093/nar/gkw1096 . PMC 5210569. PMID 27903894 .  
  69. ↑ Sachidanandam R, Weissman D, Schmidt SC, Kakol JM, Stein LD , Marth G, Sherry S, Mullikin JC, Mortimore BJ, Willey DL, Hunt SE, Cole CG, Coggill PC, Rice CM, Ning Z, Rogers J, Bentley DR, Kwok PY, Mardis ER, Yeh RT, Schultz B, Cook L, Davenport R, Dante M, Fulton L, Hillier L, Waterston RH, McPherson JD, Gilman B, Schaffner S, Van Etten WJ, Reich D, Higgins J, Daly MJ, Blumenstiel B, Baldwin J, Stange-Thomann N, Zody MC, Linton L, Lander ES, Altshuler D (February 2001). خريطة لتنوع تسلسل الجينوم البشري تحتوي على 1.42 مليون تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة . مجلة نيتشر . 409 (6822): 928-933 . رمز Bibcode : 2001Natur.409..928S . doi : 10.1038/35057149 . PMID 11237013 . 
  70. ↑ "المجموعات المرجعية للنيوكليوتيدات المفردة (rs) وغيرها من البيانات المحسوبة داخليًا" . أرشيف الأسئلة الشائعة حول النيوكليوتيدات المفردة . بيثيسدا (ماريلاند): المركز الوطني الأمريكي لمعلومات التكنولوجيا الحيوية. 2005.
  71. ↑ جيه تي دين دانين (20 فبراير 2008). "توصيات لوصف متغيرات التسلسل" . جمعية تنوع الجينوم البشري . مؤرشف من الأصل في 14 سبتمبر 2008. تم الاطلاع عليه في 5 سبتمبر 2008 .
  72. ↑ دين دانين جيه تي، أنتوناراكيس إس إي (2000). "توسيعات تسمية الطفرات واقتراحات لوصف الطفرات المعقدة: مناقشة" . الطفرات البشرية . 15 (1): 7-12. doi : 10.1002 /(SICI)1098-1004(200001)15:1 < 7::AID-HUMU4 > 3.0.CO ; 2-N . PMID 10612815 . 
  73. ↑ أوغينو إس، غولي إم إل، دين دانين جيه تي، ويلسون آر بي (فبراير 2007). "التسمية القياسية للطفرات في التشخيص الجزيئي: تحديات عملية وتعليمية" . مجلة التشخيص الجزيئي . 9 (1): 1-6 . doi : 10.2353/jmoldx.2007.060081 . PMC 1867422. PMID 17251329 .  
  74. ↑ "تسمية متغيرات التسلسل" . varnomen.hgvs.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2019-12-02 .
  75. ↑ جونسون، أندرو د. (أكتوبر 2009). "معلوماتية حيوية حول تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة: مراجعة شاملة للموارد" . سيركوليشن: علم الوراثة القلبية الوعائية . 2 (5): 530-536 . doi : 10.1161/CIRCGENETICS.109.872010 . ISSN 1942-325X . PMC 2789466. PMID 20031630 .   
  76. ↑ ماليس ن، جونز إس جيه، جسبونر جيه (أبريل 2019). "تدابير محسّنة للحفاظ على التطور تستغل المسافات التصنيفية" . نيتشر كوميونيكيشنز . 10 (1) 1556. Bibcode : 2019NatCo..10.1556M . doi : 10.1038/ s41467-019-09583-2 . PMC 6450959. PMID 30952844 .  
  77. ↑ نوار مالهيس؛ ماثيو جاكوبسون؛ ستيفن جيه إم جونز؛ يورغ غسبونر (2020). "LIST-S2: فرز الطفرات الضارة غير المترادفة عبر الأنواع بناءً على التصنيف" . أبحاث الأحماض النووية . 48 (W1): W154– W161. doi : 10.1093/nar/gkaa288 . PMC 7319545. PMID 32352516 .  
  78. ↑ "عرض SNPViz - تصوير تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة في البروتينات" . genomicscomputbiol.org . doi : 10.18547/gcb.2018.vol4.iss1.e100048 . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2020-08-07 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2018-10-20 .
  79. ↑ أوفوغبو تي سي، ديفيد إيه، كيلي إل إيه، ميزوليس إس، إسلام إس إيه، ميرسمان إس إف، وآخرون . (يونيو 2019). "PhyreRisk: تطبيق ويب ديناميكي لربط بيانات الجينوم والبروتيوميات والبيانات الهيكلية ثلاثية الأبعاد لتوجيه تفسير المتغيرات الجينية البشرية" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 431 (13): 2460-2466 . doi : 10.1016/j.jmb.2019.04.043 . PMC 6597944. PMID 31075275 .   
  80. ↑ إيتيسوبونبيسان إس، إسلام إس إيه، خانا تي، الحزيمي إي، ديفيد إيه، ستيرنبرغ إم جيه (مايو 2019). "هل يمكن أن توفر البنى ثلاثية الأبعاد المتوقعة للبروتينات رؤى موثوقة حول ما إذا كانت الطفرات غير المترادفة مرتبطة بالأمراض؟" . مجلة البيولوجيا الجزيئية . 431 (11): 2197-2212 . doi : 10.1016/j.jmb.2019.04.009 . PMC 6544567. PMID 30995449 .  

للمزيد من القراءة

  • "مسرد المصطلحات" . مراجعات الطبيعة .
  • معلومات مشروع الجينوم البشري – صحيفة حقائق SNP