فيروس أورثوفلافي
فيروسات أورثوفلافيفيروس ( المعروفة سابقًا باسم فلافيفيروس قبل عام 2023؛أو باسم أورثوفلافيفيروس أو أورثوفلافيفيروسات [ 2 ] ) هي جنس من فيروسات الحمض النووي الريبي أحادي السلسلة الموجبة، تنتمي إلى عائلة فلافيفيريداي . يشمل هذا الجنس فيروس غرب النيل ، وفيروس حمى الضنك ، وفيروس التهاب الدماغ المنقول بالقراد ، وفيروس الحمى الصفراء ، وفيروس زيكا ، والعديد من الفيروسات الأخرى التي قد تسبب التهاب الدماغ ، [ 3 ] بالإضافة إلى فيروسات فلافيفيروس خاصة بالحشرات، مثل فيروس عامل اندماج الخلايا (CFAV)، وفيروس بالم كريك (PCV)، وفيروس نهر باراماتا (PaRV). [ 4 ] في حين أن فيروسات فلافيفيروس ثنائية العائل قادرة على إصابة الفقاريات والمفصليات، فإن فيروسات فلافيفيروس الخاصة بالحشرات تقتصر على المفصليات التي تصيبها. [ 5 ] تعتمد الوسائل التي تُرسّخ بها الفيروسات المصفرة عدوى مستمرة في نواقلها المؤهلة وتُسبب المرض لدى البشر على العديد من التفاعلات بين الفيروس والمضيف، بما في ذلك التفاعل المعقد بين مضادات المناعة المشفرة بواسطة الفيروس المصفرة وجزيئات المناعة الفطرية المضادة للفيروسات لدى المضيف. [ 6 ]
سُميت الفيروسات الأورثوفلافية نسبةً إلى فيروس الحمى الصفراء؛ فكلمة "flavus" تعني "أصفر" باللاتينية ، والحمى الصفراء بدورها سميت بهذا الاسم لميلها إلى التسبب في اليرقان الأصفر لدى المصابين بها. [ 7 ]
تشترك فيروسات Orthoflaviviruses في العديد من الجوانب المشتركة: الحجم المشترك (40-65 نانومتر)، والتناظر ( مغلفة ، غلاف نووي عشريني الوجوه )، والحمض النووي ( حمض نووي ريبوزي أحادي السلسلة موجب الاتجاه حوالي 10000-11000 قاعدة)، والمظهر تحت المجهر الإلكتروني .
Most of these viruses are primarily transmitted by the bite from an infected arthropod (mosquito or tick), and hence are classified as arboviruses. Human infections with most of these arboviruses are incidental, as humans are unable to replicate the virus to high enough titers to reinfect the arthropods needed to continue the virus life-cycle – humans are then a dead end host. The exceptions to this are the yellow fever virus, Dengue virus and Zika virus. These three viruses still require mosquito vectors but are well-enough adapted to humans as to not necessarily depend upon animal hosts (although they continue to have important animal transmission routes, as well).
Other virus transmission routes for arboviruses include handling infected animal carcasses, blood transfusion, sex, childbirth and consumption of unpasteurised milk products. Transmission from nonhuman vertebrates to humans without an intermediate vector arthropod however mostly occurs with low probability. For example, early tests with yellow fever showed that the disease is not contagious.
The known non-arboviruses of the flavivirus family reproduce in either arthropods or vertebrates, but not both, with one odd member of the genus affecting a nematode.[8]
History and name
Yellow fever is the first human viral disease extensively investigated and the nature of the infection established. In 1900, the U.S. military programme, the Yellow Fever Commission, announced that the disease was transmitted by mosquitoes.[9] In 1927, a British physician Adrian Stokes identified the virus in Ghana.[10]
تم اكتشاف فيروسات أخرى، مثل فيروس غرب النيل، وفيروس التهاب الدماغ الياباني، وفيروس التهاب الدماغ المنقول بالقراد، وفيروس زيكا، وفيروس حمى الضنك، في أوائل القرن العشرين. [ 11 ] عندما نشرت اللجنة الدولية لتسمية الفيروسات (ICNV)، وهي الجهة المسؤولة عن تصنيف الفيروسات، تقريرها الأول عام 1971، صُنفت جميع الفيروسات تحت جنس الفيروسات المنقولة بالمفصليات، المجموعة ب . [ 12 ] في عام 1974، اعتمدت اللجنة الدولية لتسمية الفيروسات اسمًا أكثر تخصصًا ، وهو Flavivirus ، المشتق من الكلمة اللاتينية flavi التي تعني " أصفر " ، وذلك بعد اعتماد فيروس الحمى الصفراء كنوع نموذجي . [ 13 ] كما غيرت اللجنة الدولية لتسمية الفيروسات اسمها إلى اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV). وتم أيضًا استحداث اسم عائلة Togaviridae لمجموعة الفيروسات، والذي تم تغييره إلى Flaviviridae عام 1984. [ 12 ]
كان من المعتاد تسمية أفراد عائلة الفيروسات المصفرة (Flaviviridae) وجنسها (Flavivirus) بأسماء شائعة مثل flavivirus وflaviviral وflaviviruses. إلا أن الالتباس نشأ عند وصف فيروسات أخرى من نفس العائلة ولكن من أجناس مختلفة، مثل Hepacivirus و Pegivirus و Pestivirus . ولحل هذه المشكلة، قررت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV) في عام 2022 تغيير اسم الجنس إلى Orthoflavivirus، وهو الاسم الذي اعتُمد في عام 2023. وبموجب الاسم الجديد، يُفترض أن يُعرف جنس Orthoflavivirus بأسماء شائعة مثل orthoflavivirus وorthoflaviviral وorthoflaviviruses . [ 14 ] وفقًا لقرار اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV):
لتجنب هذا الالتباس المحتمل، قُدِّم اقتراح تصنيفي (TaxoProp 2022.007SAFlaviviridae_1genren_sprenamed) إلى اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV) في عام 2022. واقترح هذا الاقتراح إعادة تسمية جنس Flavivirus إلى Orthoflavivirus ، والذي يُترجم تقريبًا إلى "فيروسات Flavivirus الحقيقية" أو "فيروسات Flavivirus بالمعنى الدقيق ". وقد وافقت اللجنة التنفيذية للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات على هذا الاقتراح في أواخر عام 2022، وصادقت عليه اللجنة في أبريل 2023. وبناءً على ذلك، ينبغي استخدام المصطلحات "flaviviral" و"flavivirus" و"flaviviruses" للإشارة إلى جميع أفراد عائلة Flaviviridae ، بينما ينبغي استخدام المصطلحات "orthoflaviviral" و"orthoflavivirus" و"orthoflaviviruses" للإشارة إلى فيروسات جنس Orthoflavivirus (جميع فيروسات Orthoflaviviruses هي من جنس Flaviviruses، ولكن ليس كل فيروس Flaviviruses من جنس Orthoflaviviruses). [ 2 ]
بناء

فيروسات أورثوفلافيفيروس مغلفة وكروية الشكل، ولها هندسة عشرينية الوجوه ذات تناظر زائف T=3. يبلغ قطر جسيم الفيروس حوالي 50 نانومتر. [ 15 ]
الجينوم
تمتلك فيروسات أورثوفلافيفيروس جينومات من الحمض النووي الريبي أحادي السلسلة موجب الاتجاه ، وهي غير مجزأة ويبلغ طولها حوالي 10-11 كيلوبايت. [ 15 ] بشكل عام، يشفر الجينوم ثلاثة بروتينات هيكلية (الكابسيد، وprM، والغلاف) وسبعة بروتينات غير هيكلية (NS1، وNS2A، وNS2B، وNS3، وNS4A، وNS4B، وNS5). [ 16 ] يتم تعديل الحمض النووي الريبي الجينومي عند الطرف 5′ للحمض النووي الريبي الجينومي موجب الاتجاه ببنية غطاء-1 (me7 - GpppA-me2 ) . [ 17 ]
دورة الحياة

تتكاثر فيروسات أورثوفلافيفيروس في سيتوبلازم الخلايا المضيفة. ويحاكي جينومها جزيء mRNA الخلوي في جميع جوانبه باستثناء غياب ذيل البولي أدينيلات (poly-A) . تسمح هذه الخاصية للفيروس باستغلال آليات الخلية لتخليق البروتينات التركيبية وغير التركيبية أثناء التكاثر . يُعد الريبوسوم الخلوي أساسيًا لتكاثر فيروس الفلافيفيروس، حيث يقوم بترجمة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بطريقة مشابهة لترجمة mRNA الخلوي، مما يؤدي إلى تخليق بروتين متعدد واحد . [ 16 ]
تتشكل بنى غطاء الحمض النووي الريبي الخلوي بفعل إنزيم ثلاثي فوسفاتاز الحمض النووي الريبي ، الذي يحتوي على غوانيل ترانسفيراز ، وميثيل ترانسفيراز- N7، وميثيل ترانسفيراز-2′-O. يشفر الفيروس هذه الأنشطة في بروتيناته غير البنيوية. يشفر البروتين NS3 إنزيم ثلاثي فوسفاتاز الحمض النووي الريبي ضمن نطاقه الحلزوني . يستخدم هذا البروتين موقع تحلل ATP الخاص بالحلزون لإزالة مجموعة الفوسفات γ من الطرف 5′ للحمض النووي الريبي. يحتوي النطاق الطرفي N للبروتين غير البنيوي 5 (NS5) على نشاطي ميثيل ترانسفيراز-N7 وغوانيل ترانسفيراز اللازمين لتكوين بنى غطاء الحمض النووي الريبي الناضجة. تقل ألفة ارتباط الحمض النووي الريبي بوجود ATP أو GTP ، وتزداد بوجود S-أدينوزيل ميثيونين . [ 17 ] يشفر هذا البروتين أيضًا ميثيل ترانسفيراز-2′-O.

بعد الترجمة ، يُشطر البروتين المتعدد بواسطة مزيج من البروتيازات الفيروسية والمضيفة لإطلاق منتجات عديد الببتيد الناضجة. [ 18 ] ومع ذلك، فإن التعديل الخلوي بعد الترجمة يعتمد على وجود ذيل عديد الأدينين؛ لذا فإن هذه العملية لا تعتمد على المضيف. بدلاً من ذلك، يحتوي البروتين المتعدد على خاصية التحفيز الذاتي التي تُطلق تلقائيًا الببتيد الأول، وهو إنزيم خاص بالفيروس. يستطيع هذا الإنزيم بعد ذلك شطر البروتين المتعدد المتبقي إلى المنتجات الفردية. أحد المنتجات المشطورة هو بوليميراز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي الريبي ، المسؤول عن تخليق جزيء الحمض النووي الريبي ذي السلسلة السالبة. بالتالي، يعمل هذا الجزيء كقالب لتخليق الحمض النووي الريبي الجينومي الناتج .
يحدث تضاعف الحمض النووي الريبي الجينومي لفيروسات الفلافيفيروس على أغشية الشبكة الإندوبلازمية الخشنة في حجيرات غشائية. ثم تتشكل جزيئات فيروسية جديدة. يحدث هذا أثناء عملية التبرعم ، وهي المسؤولة أيضاً عن تراكم الغلاف الفيروسي وتحلل الخلية .
يبدو أن كيناز مستقبلات البروتين المقترن AG 2 (المعروف أيضًا باسم ADRBK1) مهم في دخول وتكاثر العديد من الفيروسات في عائلة Flaviviridae . [ 19 ]
يُعدّ الإنسان والثدييات والبعوض والقراد عوائل طبيعية للمرض. وتشمل طرق انتقاله الأمراض الحيوانية المنشأ واللدغات. [ 15 ]
| جنس | تفاصيل المضيف | التوجه النسيجي | تفاصيل الدخول | تفاصيل الإصدار | موقع النسخ | موقع التجميع | الانتقال |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| فيروس فلافيفيروس | البشر؛ الثدييات؛ البعوض؛ القراد | الظهارة: الجلد؛ الظهارة: الكلى؛ الظهارة: الأمعاء؛ الظهارة: الخصيتان | الالتقام الخلوي بوساطة الكلاثرين | إفراز | السيتوبلازم | السيتوبلازم | الأمراض الحيوانية المنشأ؛ لدغة المفصليات |
عناصر البنية الثانوية للحمض النووي الريبي

يحتوي جينوم الحمض النووي الريبي ذو الاتجاه الموجب لفيروس Flavivirus على مناطق غير مترجمة 5' و 3' (UTRs).
5'UTR
يبلغ طول منطقة 5'UTR في فيروس حمى الضنك 95-101 نيوكليوتيدًا . [ 20 ] يوجد عنصران بنيويان محفوظان في منطقة 5'UTR لفيروسات الفلافيفيروس ، وهما حلقة ساقية كبيرة (SLA) وحلقة ساقية قصيرة (SLB). تتخذ حلقة الساقية الكبيرة (SLA) شكل حرف Y مع حلقة ساقية جانبية وحلقة علوية صغيرة. [ 20 ] [ 21 ] من المرجح أن تعمل حلقة الساقية الكبيرة (SLA) كمحفز، وهي ضرورية لتخليق الحمض النووي الريبي الفيروسي. [ 22 ] [ 23 ] تشارك حلقة الساقية القصيرة (SLB) في التفاعلات بين منطقتي 5'UTR و3'UTR، مما يؤدي إلى تكوين حلقة في الحمض النووي الريبي الفيروسي، وهو أمر ضروري لتضاعف الفيروس. [ 24 ]
3'UTR

يبلغ طول منطقة 3'UTR عادةً 0.3-0.5 كيلوبايت، وتحتوي على عدد من البنى الثانوية المحفوظة بدرجة عالية ، والتي تقتصر على فيروسات الأورثوفلافيفيروس. وقد أُجريت معظم التحليلات باستخدام فيروس غرب النيل (WNV) لدراسة وظيفة منطقة 3'UTR.
تم تحديد ثمانية تراكيب ثانوية ضمن منطقة 3'UTR لفيروس غرب النيل، وهي (بحسب ترتيب وجودها في منطقة 3'UTR): SL-I، SL-II، SL-III، SL-IV، DB1، DB2، وCRE. [ 25 ] [ 26 ] وقد تم توصيف بعض هذه التراكيب الثانوية، وهي مهمة في تسهيل تضاعف الفيروس وحماية منطقة 3'UTR من هضم الإندونوكلياز 5' . وتحمي مقاومة النيوكلياز قطعة الحمض النووي الريبي (RNA) الموجودة أسفل منطقة 3'UTR من التحلل، وهي ضرورية للتأثيرات المرضية للفيروس على الخلايا.
- SL-II
يُعتقد أن SL-II يُساهم في مقاومة النيوكلياز. [ 26 ] وقد يكون مرتبطًا بحلقة دبوسية أخرى تم تحديدها في منطقة 5'UTR لجينوم فيروس التهاب الدماغ الياباني (JEV). [ 27 ] وتُلاحظ وفرة ملحوظة في بنية الحلقة الدبوسية لفيروس التهاب الدماغ الياباني عند إصابة الخلية المضيفة، ويُعتقد أن هذه البنية قد تلعب دورًا في تنظيم تخليق الحمض النووي الريبي (RNA).
- SL-IV
يقع هذا التركيب الثانوي ضمن منطقة 3'UTR من جينوم فيروس Flavivirus، في اتجاه 5' من عناصر DB. وظيفة هذا التركيب المحفوظ غير معروفة، ولكن يُعتقد أنه يُساهم في مقاومة الريبونوكلياز.
- DB1/DB2

تُعرف هاتان البنيتان الثانويتان المحفوظتان أيضًا باسم عناصر التكرار الزائف. وقد تم تحديدهما في الأصل ضمن جينوم فيروس حمى الضنك، وتوجدان متجاورتين في منطقة 3'UTR. ويبدو أنهما محفوظتان على نطاق واسع عبر عائلة الفيروسات المصفرة (Flaviviradae). تتكون بنية عناصر DB الثانوية من ثلاثة حلزونات، وتلعب دورًا في ضمان كفاءة الترجمة. يؤدي حذف DB1 إلى انخفاض طفيف ولكنه ذو دلالة إحصائية في الترجمة، بينما يكون تأثير حذف DB2 ضئيلاً. وقد أدى حذف كل من DB1 وDB2 إلى خفض كفاءة ترجمة الجينوم الفيروسي إلى 25%. [ 25 ]
- العقارات التجارية
يُعدّ عنصر CRE عنصر التضاعف المؤثر في الموقع نفسه، والمعروف أيضًا بعناصر RNA 3'SL، ويُعتقد أنه ضروري لتضاعف الفيروس من خلال تسهيل تكوين "مركب التضاعف". [ 28 ] على الرغم من وجود أدلة على وجود بنية عقدة كاذبة في هذا الحمض النووي الريبي، إلا أنها لا تبدو محفوظة جيدًا عبر فيروسات الأورثوفلافيفيروس. [ 29 ] وقد ثبت أن حذف منطقة 3' غير المترجمة (3' UTR) لفيروسات الأورثوفلافيفيروس يؤدي إلى موت النسخ المعدية.
دبوس الشعر المحفوظ cHP
تم لاحقًا اكتشاف بنية دبوس الشعر المحفوظة (cHP) في العديد من جينومات فيروسات الأورثوفلافيفيروس ، ويُعتقد أنها توجه ترجمة بروتينات الغلاف. تقع هذه البنية مباشرةً بعد كودون البدء AUG . [ 30 ]
دور البنى الثانوية للحمض النووي الريبي في إنتاج الحمض النووي الريبي الصغير

يُعدّ الحمض النووي الريبي الفيروسي الفرعي (sfRNA) امتدادًا لمنطقة 3' غير المترجمة (3' UTR)، وقد ثبت دوره في تضاعف الفيروسات المصفرة وإمراضيتها. [ 31 ] يُنتَج sfRNA نتيجةً لعدم اكتمال تحلل الحمض النووي الريبي الفيروسي الجينومي بواسطة إنزيم إكسوريبونوكلياز 1 (XRN1) الموجود في الخلايا المضيفة. [ 32 ] أثناء تحلل الحمض النووي الريبي الفيروسي بواسطة XRN1، يتوقف عند الحلقات الجذعية المتكونة من البنية الثانوية لمنطقتي 5' و3' غير المترجمتين. [ 33 ] ينتج عن هذا التوقف جزء غير مهضوم من الحمض النووي الريبي الجينومي يُعرف باسم sfRNA. يؤثر sfRNA على دورة حياة الفيروس المصفر بطريقة تعتمد على تركيزه. يؤدي تراكم الحمض النووي الريبي الفيروسي الصغير (sfRNA) إلى: (1) تثبيط الاستجابة المناعية الفطرية للخلايا، مما يقلل من دفاعات الجسم المضيف ضد الفيروس [ 34 ]، (2) تثبيط نشاط إنزيمي XRN1 وDicer لتعديل مسارات التداخل الريبي (RNAi) التي تدمر الحمض النووي الريبي الفيروسي [ 35 ]، (3) تعديل معقد تضاعف الفيروس لزيادة تكاثره [ 36 ] . وبشكل عام، يُعتقد أن الحمض النووي الريبي الفيروسي الصغير (sfRNA) يشارك في مسارات متعددة تُضعف دفاعات الجسم المضيف وتُعزز الإصابة بفيروسات الأورثوفلافيفيروس.
تطور

يمكن تقسيم فيروسات أورثولافي إلى مجموعتين: إحداهما تضم فيروسات تنتقل عن طريق النواقل، والأخرى لا يوجد لها ناقل معروف. [ 37 ] ويمكن تقسيم مجموعة النواقل بدورها إلى مجموعتين فرعيتين: مجموعة تنتقل عن طريق البعوض، ومجموعة تنتقل عن طريق القراد. ويمكن تقسيم هاتين المجموعتين مرة أخرى. [ 38 ]
يمكن تقسيم مجموعة البعوض إلى فرعين: الأول يضم الفيروسات العصبية، والتي غالباً ما ترتبط بأمراض التهاب الدماغ لدى البشر أو الماشية. ينتشر هذا الفرع عادةً عن طريق أنواع البعوض من جنس كيولكس ، وتكون الطيور هي الخزانات الرئيسية لهذه الفيروسات. أما الفرع الثاني فيضم الفيروسات غير العصبية المرتبطة بأمراض النزف لدى البشر. وتنتشر هذه الفيروسات عادةً عن طريق أنواع البعوض من جنس إيديس ، وتكون الرئيسيات هي المضيفات الرئيسية .
تشكل الفيروسات المنقولة بالقراد أيضاً مجموعتين متميزتين: إحداهما مرتبطة بالطيور البحرية والأخرى - فيروسات التهاب الدماغ المنقولة بالقراد - مرتبطة بشكل أساسي بالقوارض .
يمكن تقسيم الفيروسات التي تفتقر إلى ناقل معروف إلى ثلاث مجموعات: مجموعة واحدة وثيقة الصلة بالفيروسات التي ينقلها البعوض، والتي ترتبط بالخفافيش ؛ ومجموعة ثانية، أبعد وراثيًا، ترتبط أيضًا بالخفافيش؛ ومجموعة ثالثة مرتبطة بالقوارض.
أظهرت العلاقات التطورية بين العناصر الفيروسية الداخلية لفيروسات الأورثوفلافيفيروس وفيروسات الفلافيفيروس المعاصرة، باستخدام أساليب الاحتمال الأقصى، أن فيروسات الفلافيفيروس المنقولة بواسطة المفصليات قد نشأت على الأرجح من مصدر عنكبوتي. [ 39 ] وهذا يتعارض مع دراسات سابقة أجريت على عدد أقل من الفيروسات الموجودة، والتي أظهرت أن الفيروسات المنقولة بالقراد نشأت من مجموعة من الفيروسات المنقولة بالبعوض. [ 40 ]
عُثر على العديد من الجينومات الجزئية والكاملة لفيروسات أورثوفلافيفيروس في اللافقاريات المائية، مثل عنكبوت البحر إنديس سبينوزا [ 41 ] والعديد من القشريات ورأسيات الأرجل [ 42 ] . ويبدو أن هذه التسلسلات مرتبطة بتلك الموجودة في فيروسات أورثوفلافيفيروس الخاصة بالحشرات، وكذلك بمجموعات فيروسات خفافيش تامانا. وبينما لا يزال من غير الواضح حاليًا كيف تندرج فيروسات أورثوفلافيفيروس المائية ضمن تطور هذه المجموعة من الفيروسات، إلا أن هناك بعض الأدلة على أن أحد هذه الفيروسات، وهو فيروس ونتشو لأسماك القرش فلافيفيروس، يصيب كلاً من القشريات ( بورتونوس تريتوبركولاتوس ) وقرش المحيط الهادئ ذي الأنف المجرف ( سكوليودون ماكرورينكوس ) [ 43 ] [ 42 ] ، مما يشير إلى دورة حياة فيروسية مائية منقولة بالمفصليات.

تم تقدير أوقات تباعد العديد من هذه الفيروسات. [ 44 ] ويبدو أن أصل هذه الفيروسات يعود إلى ما لا يقل عن 9400 إلى 14000 عام. تباعدت سلالات حمى الضنك في العالم القديم والجديد بين 150 و450 عامًا مضت. تباعدت سلالات التهاب الدماغ المنقولة بالقراد في أوروبا والشرق الأقصى منذ حوالي 1087 عامًا (1610-649 عامًا). تباعدت فيروسات التهاب الدماغ ومرض اللوبينغ المنقولة بالقراد في أوروبا منذ حوالي 572 عامًا (844-328 عامًا). يتوافق هذا التقدير الأخير مع السجلات التاريخية. تباعد فيروس كونجين عن فيروس غرب النيل منذ حوالي 277 عامًا (475-137 عامًا). يتوافق هذا الوقت مع استيطان أستراليا من أوروبا. يبدو أن مجموعة التهاب الدماغ الياباني قد تطورت في أفريقيا منذ 2000-3000 عام، ثم انتشرت في البداية إلى جنوب شرق آسيا قبل أن تنتقل إلى بقية أنحاء آسيا.
Phylogenetic studies of the West Nile virus has shown that it emerged as a distinct virus around 1000 years ago.[45] This initial virus developed into two distinct lineages, lineage 1 and its multiple profiles is the source of the epidemic transmission in Africa and throughout the world. Lineage 2 was considered an Africa zoonosis. However, in 2008, lineage 2, previously only seen in horses in sub-Saharan Africa and Madagascar, began to appear in horses in Europe, where the first known outbreak affected 18 animals in Hungary in 2008.[46] Lineage 1 West Nile virus was detected in South Africa in 2010 in a mare and her aborted fetus; previously, only lineage 2 West Nile virus had been detected in horses and humans in South Africa.[47] A 2007 fatal case in a killer whale in Texas broadened the known host range of West Nile virus to include cetaceans.[48]
Omsk haemorrhagic fever virus appears to have evolved within the last 1000 years.[49] The viral genomes can be divided into 2 clades — A and B. Clade A has five genotypes, and clade B has one. These clades separated about 700 years ago. This separation appears to have occurred in the Kurgan province. Clade A subsequently underwent division into clade C, D and E 230 years ago. Clade C and E appear to have originated in the Novosibirsk and Omsk Provinces, respectively. The muskrat Ondatra zibethicus, which is highly susceptible to this virus, was introduced into this area in the 1930s.
Taxonomy
Species
The genus contains the following species, listed by subgenus and scientific name and followed by the exemplar virus of the species:[50]
Subgenus: Crangovirus
- Orthoflavivirus aphei, Crangon crangon flavivirus
- Subgenus: Euflavivirus
- Orthoflavivirus apoiense, Apoi virus
- Orthoflavivirus aroaense, Aroa virus
- Orthoflavivirus bagazaense, Bagaza virus
- Orthoflavivirus banziense, Banzi virus
- Orthoflavivirus boubouiense, Bouboui virus
- Orthoflavivirus bravoense, Rio Bravo virus
- Orthoflavivirus bukalasaense, Bukalasa bat virus
- Orthoflavivirus cacipacoreense, Cacipacore virus
- Orthoflavivirus careyense, Carey Island virus
- فيروس أورثوفلافيفيروس كاوبونينس ، فيروس كاوبون ريدج
- Orthoflavivirus dakarense ، فيروس داكار الخفافيش
- فيروس حمى الضنك ( Orthoflavivirus denguei)
- فيروس إيدج هيل ( Orthoflavivirus edgehillense )
- فيروس أورثوفلافيفيروس إنتيبينس ، فيروس خفافيش إنتيبي
- فيروس الحمى الصفراء ( Orthoflavivirus flavi)
- فيروس أورثوفلافيفيروس جادجيتسنس ، فيروس جادجيتس جولي
- فيروس الأرثوفلافي إلهيوسنس ، فيروس إيلهيوس
- فيروس Orthoflavivirus israelense ، إسرائيل تركيا تركيا فيروس التهاب السحايا والدماغ
- فيروس التهاب الدماغ الياباني ( Orthoflavivirus japonicum)
- فيروس أورثوفلافيفيروس جوغراينس ، فيروس جوغرا
- فيروس أورثوفلافي جوتياباينس ، فيروس جوتيابا
- فيروس أورثوفلافي كادامينس ، فيروس كادام
- فيروس أورثوفلافي كيدوغوينس ، فيروس كيدوغو
- فيروس كوكوبيرا ( Orthoflavivirus kokoberaorum )
- فيروس أورثوفلافي كوتانجوينسي ، فيروس كوتانجو
- فيروس مرض غابة كياسانور ( Orthoflavivirus kyasanurense)
- فيروس لانغات ( Orthoflavivirus langatense )
- فيروس التهاب الدماغ سانت لويس ( Orthoflavivirus louisense)
- Orthoflavivirus loupingi ، فيروس Louping ill
- فيروس أورثوفلافيفيروس ميابانينس ، فيروس مياباني
- فيروس التهاب الدماغ لدى الأغنام التركية ( Orthoflavivirus mediterranense)
- فيروس مودوك ( Orthoflavivirus modocense )
- فيروس Orthoflavivirus montanaense ، فيروس التهاب الدماغ الأبيض في مونتانا
- فيروس التهاب الدماغ في وادي موراي ، أو فيروس أورثوفلافيفيروس موراينس
- فيروس التهاب الدماغ المنقول بالقراد 2 ( Orthoflavivirus neudoerflense )
- فيروس Orthoflavivirus nilense ، فيروس غرب النيل
- فيروس أورثوفلافي ntayaense ، فيروس نتايا
- فيروس أورثوفلافيفيروس أومسكنس ، فيروس حمى أومسك النزفية
- فيروس أورثوفلافي بيرليتانسي ، فيروس سان بيرليتا
- فيروس أورثوفلافيفيروس بنوم بنه ، فيروس الخفافيش بنوم بنه
- فيروس بواسان ( Orthoflavivirus powassanense )
- فيروس أورثوفلافيفيروس رويالينس ، فيروس المزرعة الملكية
- فيروس أورثو فلافي سابويانسي ، فيروس سابويا
- فيروس Orthoflavivirus saumarezense ، فيروس Saumarez Reef
- فيروس أورثوفلافيفيروس سيبكينس ، فيروس سيبك
- فيروس أورثوفلافي تمبوسو ، فيروس تمبوسو
- Orthoflavivirus tyuleniyense, Tyuleniy virus
- Orthoflavivirus ugandaense, Uganda S virus
- Orthoflavivirus usutuense, Usutu virus
- Orthoflavivirus viejaense, Sal Vieja virus
- Orthoflavivirus wesselsbronense, Wesselsbron virus
- Orthoflavivirus yaoundeense, Yaounde virus
- Orthoflavivirus yokoseense, Yokose virus
- Orthoflavivirus zikaense, Zika virus
- Orthoflavivirus zilberi, Tick-borne encephalitis virus 1
Subgenus: Fusivirus
- Orthoflavivirus iunctionis, Cell-fusing agent virus
Sorted by vector

Species and strains sorted by vectors:
Tick-borne viruses

Mammalian tick-borne virus group
- Greek goat encephalitis virus (GGEV)
- Kadam virus (KADV)
- Krasnodar virus (KRDV)
- Mogiana tick virus (MGTV)
- Ngoye virus (NGOV)
- Sokuluk virus (SOKV)
- Spanish sheep encephalomyelitis virus (SSEV)
- Turkish sheep encephalitis virus (TSE)
- Tick-borne encephalitis virus serocomplex
- Absettarov virus
- Deer tick virus (DT)
- Gadgets Gully virus (GGYV)
- Karshi virus
- Kyasanur Forest disease virus (KFDV)
- Langat virus (LGTV)
- Louping ill virus (LIV)
- Omsk hemorrhagic fever virus (OHFV)
- Powassan virus (POWV)
- Royal Farm virus (RFV)
- Tick-borne encephalitis virus (TBEV)
Seabird tick-borne virus group
- Kama virus (KAMV)
- Meaban virus (MEAV)
- Saumarez Reef virus (SREV)
- Tyuleniy virus (TYUV)
Mosquito-borne viruses
- Without known vertebrate host
- Cell fusing clade
- Aedes galloisi flavivirus
- Barkedji virus
- Calbertado virus
- Chaoyang virus
- Culex flavivirus
- Culex theileri flavivirus
- Culiseta flavivirus
- Donggang virus
- Hanko virus
- Ilomantsi virus
- Kamiti River virus
- Lammi virus
- Marisma mosquito virus
- Nakiwogo virus
- Nhumirim virus
- فيروس نينوكوي
- فيروس نونان
- فيروس بالم كريك
- فيروس بانمونجوم المصفر
- فيروس كوانغ بينه
- مجموعة فيروسات أرو
- فيروس أرو (AROAV)
- فيروس بوسوكوارا (BSQV)
- فيروس إيغوابي (IGUV)
- فيروس نارنجال (NJLV)
- مجموعة فيروسات حمى الضنك
- فيروس حمى الضنك (DENV)
- فيروس كيدوغو (KEDV) [ 51 ] [ 52 ]
- مجموعة فيروس التهاب الدماغ الياباني
- فيروس كاسيباكور (CPCV)
- فيروس كوتانجو (KOUV)
- فيروس كونجين
- فيروس إيلهيوس (ILHV)
- فيروس التهاب الدماغ الياباني (JEV)
- فيروس التهاب الدماغ في وادي موراي (MVEV)
- فيروس التهاب الدماغ سانت لويس (SLEV)
- فيروس أوسوتو (USUV)
- فيروس غرب النيل (WNV)
- فيروس ياوندي (YAOV)
- مجموعة فيروس كوكوبيرا
- فيروس كوكوبيرا (KOKV)
- فيروس مابون الجديد (NMV)
- فيروس ستراتفورد (STRV)
- مجموعة فيروس نتايا
- فيروس باغازا (BAGV)
- فيروس بايانغديان (BYDV)
- فيروس متلازمة انخفاض إنتاج بيض البط (DEDSV)
- فيروس إيلهيوس (ILHV)
- فيروس التهاب السحايا والدماغ في إسرائيل وتركيا (ITV)
- فيروس جيانغسو (JSV)
- فيروس الطبقة الرقيقة
- فيروس نتايا (NTAV)
- فيروس روسيو (ROCV)
- فيروس سيتياوان (STWV)
- فيروس تي هو
- فيروس تيمبوسو (TMUV)
- مجموعة فيروسات سبوندويني
- فيروس سبوندويني (SPOV)
- فيروس زيكا (ZIKV)
- مجموعة فيروسات الحمى الصفراء
- فيروس بانزي (BANV)
- فيروس باماجا (BGV)
- فيروس بوبوي (BOUV)
- فيروس إيدج هيل (EHV)
- فيروس نهر فيتزروي
- فيروس جوجرا (JUGV)
- فيروس سابويا (SABV)
- فيروس سيبك (SEPV)
- فيروس أوغندا إس (UGSV)
- فيروس ويسيلسبرون (WESSV)
- فيروس الحمى الصفراء (YFV)
- آحرون
فيروسات ليس لها ناقل مفصلي معروف
- فيروس تامانا للخفافيش (TABV)
- مجموعة فيروسات عنتيبي
- فيروس خفافيش عنتيبي (ENTV)
- فيروس يوكوز (YOKV)
- مجموعة فيروسات مودوك
- فيروس أبوي (APOIV)
- فيروس كاوبون ريدج (CRV)
- فيروس جوتيابا (JUTV)
- فيروس مودوك (MODV)
- فيروس سال فييخا (SVV)
- فيروس سان بيرليتا (SPV)
- مجموعة فيروس ريو برافو
- فيروس بوكالاسا الخفافيشي (BBV)
- فيروس جزيرة كاري (CIV)
- فيروس خفافيش داكار (DBV)
- فيروس التهاب الدماغ والدماغ في مونتانا (MMLV)
- Phnom Penh bat virus (PPBV)
- Rio Bravo virus (RBV)
Non vertebrate viruses
- Assam virus
- Bamaga virus[53]
- Crangon crangon flavivirus[54]
- Cuacua virus
- Donggang virus
- Firefly squid flavivirus[54]
- Gammarus chevreuxi flavivirus[54]
- Gammarus pulex flavivirus[54]
- Karumba virus (KRBV)
- Hanko virus
- Haslams Creek virus
- Mac Peak virus (McPV)
- Marisma mosquito virus
- Mediterranean Ochlerotatus flavivirus
- Menghai flavivirus
- Nakiwogo virus (NAKV)
- Nanay virus
- Nounané virus
- Ochlerotatus caspius flavivirus
- Palm Creek virus
- Parramatta River virus
- Southern Pygmy squid flavivirus[54]
- Soybean cyst nematode virus 5[8]
- Xishuangbanna Aedes flavivirus
Viruses known only from sequencing
Vaccines

The very successful yellow fever 17D vaccine, introduced in 1937, produced dramatic reductions in epidemic activity.
Effective inactivated Japanese encephalitis and Tick-borne encephalitis vaccines were introduced in the middle of the 20th century. Unacceptable adverse events have prompted change from a mouse-brain inactivated Japanese encephalitis vaccine to safer and more effective second generation Japanese encephalitis vaccines. These may come into wide use to effectively prevent this severe disease in the huge populations of Asia—North, South and Southeast.
The dengue viruses produce many millions of infections annually due to transmission by a successful global mosquito vector. As mosquito control has failed, several dengue vaccines are in varying stages of development. CYD-TDV, sold under the trade name Dengvaxia, is a tetravalent chimeric vaccine that splices structural genes of the four dengue viruses onto a 17D yellow fever backbone.[55][56] Dengvaxia is approved in five countries.[57]
يعتمد نهج بديل لتطوير نواقل لقاحات الفيروسات المصفرة على استخدام الفيروسات التي تصيب الحشرات. لا تستطيع الفيروسات المصفرة المتخصصة بالحشرات، مثل فيروس بنجاري، التكاثر في خلايا الفقاريات. ومع ذلك، فإن الفيروسات المُعاد تركيبها، التي استُبدلت فيها جينات البروتينات التركيبية (prME) لفيروس بنجاري بجينات فيروسات أخرى مثل فيروس حمى الضنك، وفيروس زيكا، وفيروس غرب النيل، وفيروس الحمى الصفراء، أو فيروس التهاب الدماغ الياباني، تتكاثر بكفاءة في خلايا الحشرات حيث تُنتج تراكيز عالية من جزيئات الفيروس المُعدية. وقد وفر تحصين الفئران بلقاح بنجاري الحامل للبروتينات التركيبية لفيروس زيكا حمايةً لها من المرض بعد الإصابة . ويستخدم نهج مماثل فيروس إيلات، وهو فيروس ألفا متخصص بالحشرات، كمنصة للقاح . ... تمثل منصات اللقاح الجديدة هذه، المُستخلصة من الفيروسات المصفرة وفيروسات ألفا المتخصصة بالحشرات، مناهج فعالة وآمنة وميسورة التكلفة للتطوير السريع للقاحات مُعدية مُضعفة ضد مسببات الأمراض من هاتين العائلتين الفيروسيتين. [ 58 ]
مراجع
- ↑ سيروهي د، تشين ز، صن ل، كلوز ت، بيرسون ت.س، روسمان م.ج، كون ر.ج (أبريل 2016). "بنية فيروس زيكا بتقنية المجهر الإلكتروني فائق البرودة بدقة 3.8 أنغستروم" . مجلة ساينس . 352 (6284): 467-470 . Bibcode : 2016Sci...352..467S . doi : 10.1126/science.aaf5316 . PMC 4845755. PMID 27033547 .
- 1 2 بوستلر تي إس، بير إم، بليتفيتش بي جيه، بوخ جيه، دي لامباليري إكس، دريكسلر جيه إف، إمري إيه، كابور إيه، وآخرون . (10 أغسطس 2023). "إعادة تسمية جنس Flavivirus إلى Orthoflavivirus وتوسيع أسماء الأنواع الثنائية ضمن عائلة Flaviviridae" . أرشيف علم الفيروسات . 168 (9): 224. doi : 10.1007/s00705-023-05835-1 . ISSN 1432-8798 . PMID 37561168 .
- ↑ شي، بي واي، محرر. (2012). علم الفيروسات الجزيئي ومكافحة الفيروسات المصفرة . دار كايستر الأكاديمية للنشر . رقم ISBN 978-1-904455-92-9.
- ↑ ماكلين بي جيه، هوبسون-بيترز جيه، ويب سي إي، واترسون دي، برو إن إيه، نغوين إتش دي، هول-مندلين إس، واريلو دي، جوهانسن سي إيه، جانسن سي سي، فان دن هورك إيه إف، بيبي إن دبليو، شنيتلر إي، بارنارد آر تي، هول آر إيه (2015). "فيروس فلافيفيروس جديد خاص بالحشرات يتكاثر فقط في الخلايا المشتقة من بعوضة الزاعجة، ويستمر انتشاره بنسبة عالية في تجمعات بعوضة الزاعجة البرية (Aedes vigilax) في سيدني، أستراليا" . علم الفيروسات . 486 : 272-283 . doi : 10.1016/j.virol.2015.07.021 . PMID 26519596 .
- ↑ الرفاعي، أ.م.، وعبد النبي، ر.، وروزاليس روزاس، أ.ل.، ووانغ، ل.، وباسو، س.، وديلانغ، ل. (سبتمبر 2020). "فهم الآليات الكامنة وراء تقييد العائل للفيروسات المتخصصة بالحشرات" . الفيروسات . 12 (9): 964. doi : 10.3390/v12090964 . PMC 7552076. PMID 32878245 .
- ↑ الرفاعي، أ.م.، هولينغهيرست، ب.، رايتمير، س.م.، ألفي، ل.، مارينجر، ك. (نوفمبر 2021). " التضاد المناعي الفطري لفيروسات الفلافيفيروس المنقولة بالبعوض لدى البشر والبعوض" . الفيروسات . 13 (11): 2116. doi : 10.3390/v13112116 . PMC 8624719. PMID 34834923 .
- ↑ أول ذكر لـ"الحمى الصفراء" يظهر في مخطوطة تعود لعام 1744 من تأليف جون ميتشل من فرجينيا؛ أُرسلت نسخ من المخطوطة إلى السيد كادوالادر كولدين ، وهو طبيب في نيويورك، وإلى بنيامين راش من فيلادلفيا؛ وأُعيد طبع المخطوطة في النهاية عام 1814. انظر:
- ميتشل، جون (كتب: 1744؛ أعيد طبعه: 1814) "تقرير عن الحمى الصفراء التي سادت في فرجينيا في الأعوام 1737 و1741 و1742، في رسالة إلى المرحوم كادوالادر كولدين، من نيويورك، من المرحوم جون ميتشل، الحاصل على درجة الماجستير في الطب والبحوث من فرجينيا" ، السجل الطبي والفلسفي الأمريكي ، 4 : 181-215.
- 1 2 بيكال إس، دومير إل إل، جونفا بي، ماكوبين إن كيه، لامبرت كي إن، باليراو كيه (2014). "فيروس فلافي جديد في نيماتودا كيس فول الصويا" . مجلة علم الفيروسات العامة . 95 (الجزء 6): 1272–1280 . دوى : 10.1099/vir.0.060889-0 . بميد 24643877 .
- ↑ هولبروك م (30 أبريل 2017). " وجهات نظر تاريخية حول أبحاث الفيروسات المصفرة" . الفيروسات . 9 (5): 97. doi : 10.3390/v9050097 . ISSN 1999-4915 . PMC 5454410. PMID 28468299 .
- ↑ جيانتشيكي إي، سيانكي في، توريلي أ، مونتومولي إي (27 فبراير 2022). "الحمى الصفراء: الأصل، والوبائيات، والاستراتيجيات الوقائية، والآفاق المستقبلية" . اللقاحات . 10 ( 3): 372. doi : 10.3390/vaccines10030372 . ISSN 2076-393X . PMC 8955180. PMID 35335004 .
- ↑ هولبروك م (30 أبريل 2017). " وجهات نظر تاريخية حول أبحاث الفيروسات المصفرة" . الفيروسات . 9 (5): 97. doi : 10.3390/v9050097 . ISSN 1999-4915 . PMC 5454410. PMID 28468299 .
- 1 2 "تفاصيل التصنيف | مجموعة الفيروسات المنقولة بالمفصليات ب" . ictv.global . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 يوليو 2025 .
- ↑ فينير، ف.، بيريرا، هـ. ج.، بورترفيلد، ج. س.، جوكليك، و. ك.، داوني، أ. و. (1974). "أسماء العائلات والأجناس للفيروسات المعتمدة من قبل اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات، يونيو 1974" . علم الفيروسات . 3 (3): 193-198 . doi : 10.1159/000149755 . ISSN 1423-0100 . PMID 4443189 .
- ↑ زيربيني إف إم، سيديل إس جي، ليفكوفيتز إي جيه، موشيجيان إيه آر، أدريانسنز إي إم، ألفيناس-زيربيني بي، ديمبسي دي إم، دوتيل بي إي، وآخرون . (10 يونيو 2023). "التغييرات التي طرأت على تصنيف الفيروسات ونظام اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV) والتي صادقت عليها اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (2023)" . أرشيف علم الفيروسات . 168 (7): 175. doi : 10.1007/s00705-023-05797-4 . ISSN 1432-8798 . PMC 10861154. PMID 37296227 .
- 1 2 3 "المنطقة الفيروسية" . ExPASy. مؤرشف من الأصل بتاريخ 17 يونيو 2015. تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 يونيو 2015 .
- 1 2 رايس سي، لينشيز إي، إيدي إس، شين إس، شيتس آر، شتراوس جيه (23 أغسطس 1985). "تسلسل النيوكليوتيدات لفيروس الحمى الصفراء: دلالات على التعبير الجيني وتطور فيروسات الفلافيفيروس" . مجلة ساينس . 229 (4715): 726-733 . Bibcode : 1985Sci...229..726R . doi : 10.1126/science.4023707 . PMID 4023707. تاريخ الاسترجاع: 14 نوفمبر 2016 .
- 1 2 هندرسون بي آر، سعيدي بي جيه، كامبانيولا جي، جيس بي جيه (2011). جيانغ كيه (محرر). " تحليل ارتباط الحمض النووي الريبي بواسطة إنزيم تغطية الحمض النووي الريبي NS5 لفيروس حمى الضنك" . PLOS ONE . 6 (10) e25795. Bibcode : 2011PLoSO...625795H . doi : 10.1371/journal.pone.0025795 . PMC 3192115. PMID 22022449 .
- ↑ صن جي، لارسن سي، باومغارث إن، كليم إي، شويرمان آر (26 يناير 2017). "شرح شامل للببتيدات الناضجة والأنماط الجينية لفيروس زيكا" . PLOS ONE . 12 (1) e0170462. Bibcode : 2017PLoSO..1270462S . doi : 10.1371/journal.pone.0170462 . PMC 5268401. PMID 28125631 .
- ↑ لو سومر سي، باروز إن جيه، برادريك إس إس، بيرسون جيه إل، غارسيا بلانكو إم إيه (2012). مايكل إس إف (محرر). "كيناز مستقبلات البروتين جي المقترن 2 يعزز دخول فيروسات الفلافيفيريداي وتكاثرها" . مجلة PLOS للأمراض المدارية المهملة . 6 (9) e1820. doi : 10.1371/journal.pntd.0001820 . PMC 3441407. PMID 23029581 .
- 1 2 جيبهارد إل جي، Filomatori CV، Gamarnik AV (2011). "عناصر الحمض النووي الريبي الوظيفية في جينوم فيروس حمى الضنك" . الفيروسات . 3 (9): 1739-1756 . دوى : 10.3390 / v3091739 . بمك 3187688 . بميد 21994804 .
- ↑ برينتون، إم. أ.، وديسبوتو، ج. هـ. (1988). "تحليل التسلسل والبنية الثانوية للمنطقة الطرفية 5' من الحمض النووي الريبي لجينوم فيروسات الفلافيفيروس". علم الفيروسات . 162 (2): 290-299 . doi : 10.1016/0042-6822(88)90468-0 . PMID 2829420 .
- ↑ Filomatori CV، Lodeiro MF، Alvarez DE، Samsa MM، Pietrasanta L، Gamarnik AV (2006). "عنصر RNA 5 يعزز تخليق الحمض النووي الريبي لفيروس حمى الضنك على جينوم دائري" . الجينات ديف . 20 (16): 2238-2249 . دوى : 10.1101/gad.1444206 . بمك 1553207 . بميد 16882970 .
- ↑ يو إل، نوماجوتشي إم، بادمانابهان آر، ماركوف إل (2008). "متطلبات محددة لعناصر المناطق الطرفية 5' و3' في تخليق الحمض النووي الريبي لفيروسات الفلافيفيروس وتضاعف الفيروس" . علم الفيروسات . 374 (1): 170-185 . doi : 10.1016/j.virol.2007.12.035 . PMC 3368002. PMID 18234265 .
- ^ ألفاريز دي، لوديرو إم إف، لودوينيا إس جيه، بيتراسانتا لي، جامارنيك إيه في (2005). "تفاعلات RNA-RNA طويلة المدى تعمل على تعميم جينوم فيروس حمى الضنك" . جي فيرول . 79 (11): 6631–6643 . دوى : 10.1128/JVI.79.11.6631-6643.2005 . بمك 1112138 . بميد 15890901 .
- 1 2 تشيو، دبليو دبليو، وكيني، آر إم، ودريهر، تي دبليو (يوليو 2005). "التحكم في الترجمة بواسطة المناطق الطرفية 5′ و3′ لجينوم فيروس حمى الضنك" . مجلة علم الفيروسات . 79 (13): 8303-8315 . doi : 10.1128/JVI.79.13.8303-8315.2005 . PMC 1143759. PMID 15956576 .
- 1 2 بيلمان جي بي، فونك أ، كوندراتيفا ن، وآخرون . (ديسمبر 2008). "يُعدّ الحمض النووي الريبي غير المشفر عالي البنية والمقاوم للنيوكلياز، والذي تنتجه الفيروسات المصفرة، ضروريًا لإمراضيتها" . مجلة Cell Host Microbe . 4 (6): 579-591 . doi : 10.1016/j.chom.2008.10.007 . PMID 19064258 .
- ↑ لين كيه سي، تشانغ إتش إل، تشانغ آر واي (مايو 2004). "تراكم جزء من الجينوم الطرفي 3′ في خلايا الثدييات والبعوض المصابة بفيروس التهاب الدماغ الياباني" . مجلة علم الفيروسات . 78 (10): 5133-5138 . doi : 10.1128/JVI.78.10.5133-5138.2004 . PMC 400339. PMID 15113895 .
- ↑ زينغ إل، فالغوت بي، ماركوف إل (سبتمبر 1998). "تحديد تسلسلات نيوكليوتيدية محددة ضمن منطقة 3′-SL المحفوظة في جينوم فيروس حمى الضنك من النوع 2، واللازمة للتضاعف" . مجلة علم الفيروسات . 72 (9): 7510-7522 . doi : 10.1128/JVI.72.9.7510-7522.1998 . PMC 109990. PMID 9696848 .
- ↑ شي بي واي، برينتون إم إيه، فيل جيه إم، تشونغ واي واي، ويلسون دبليو دي (أبريل 1996). "دليل على وجود بنية عقدة كاذبة في الطرف 3' من الحمض النووي الريبي الجينومي لفيروس الفلافيفيروس". الكيمياء الحيوية . 35 (13): 4222-4230 . doi : 10.1021/bi952398v . PMID 8672458 .
- ↑ كلايد ك، هاريس إي (2006). "البنية الثانوية للحمض النووي الريبي في المنطقة المشفرة لفيروس حمى الضنك من النوع 2 توجه اختيار كودون بدء الترجمة وهي ضرورية لتكاثر الفيروس" . مجلة علم الفيروسات . 80 (5): 2170-2182 . doi : 10.1128/JVI.80.5.2170-2182.2006 . PMC 1395379. PMID 16474125 .
- ↑ بيديت ك، غارسيا بلانكو م.أ. (1 سبتمبر 2014). "الحمض النووي الريبي الفيروسي المصفر: أسلحة وأهداف في الحرب بين الفيروس والمضيف". مجلة الكيمياء الحيوية . 462 (2): 215-230 . doi : 10.1042/BJ20140456 . ISSN 0264-6021 . PMID 25102029 .
- ↑ تشابمان إي جي، كوستانتينو دي إيه، رابي جيه إل، مون إس إل، ويلوز جيه، نيكس جيه سي، كيفت جيه إس (18 أبريل 2014). " الأساس البنيوي لإنتاج الحمض النووي الريبي الفرعي الممرض لفيروسات الفلافيفيروس (sfRNA)" . مجلة ساينس . 344 (6181): 307-310 . Bibcode : 2014Sci...344..307C . doi : 10.1126/science.1250897 . ISSN 0036-8075 . PMC 4163914. PMID 24744377 .
- ^ Funk A، Truong K، Nagasaki T، Torres S، Floden N، Melian EB، Edmonds J، Dong H، Shi PY (1 نوفمبر 2010). "هياكل الحمض النووي الريبي (RNA) المطلوبة لإنتاج الحمض النووي الريبي (RNA) للفيروسات المصفرة تحت الجينومية" . مجلة علم الفيروسات . 84 (21): 11407-11417 . دوى : 10.1128/JVI.01159-10 . ISSN 0022-538X . بمك 2953152 . بميد 20719943 .
- ↑ تشانغ آر واي، هسو تي دبليو، تشين واي إل، ليو إس إف، تساي واي جيه، لين واي تي، تشين واي إس، فان واي إتش (27 سبتمبر 2013). "يُثبِّط الحمض النووي الريبي غير المشفر لفيروس التهاب الدماغ الياباني تنشيط الإنترفيرون عن طريق منع انتقال عامل تنظيم الإنترفيرون 3 إلى النواة". علم الأحياء الدقيقة البيطرية . 166 ( 1-2 ): 11-21 . doi : 10.1016/j.vetmic.2013.04.026 . PMID 23755934 .
- ^ مون إس إل، أندرسون جي آر، كوماجاي واي، ويلوسز سي جيه، أكيرا إس، كروميخ إيه إيه، ويلوسز جي (1 نوفمبر 2012). "إن الحمض النووي الريبي غير المشفر الذي تنتجه الفيروسات المصفرة المنقولة بالمفصليات يثبط إكسوريبونوكلياز XRN1 الخلوي ويغير استقرار mRNA المضيف" . الحمض النووي الريبي . 18 (11): 2029-2040 . دوى : 10.1261 / rna.034330.112 . ردمك 1355-8382 . بمك 3479393 . بميد 23006624 .
- ↑ كلارك، ب. د.، روبي، ج. أ.، سلونتشاك، أ.، خروميك، أ. أ. (3 أغسطس 2015). "حمض نووي ريبوزي وظيفي غير مشفر مشتق من المنطقة غير المترجمة 3′ لفيروسات الفلافيفيروس". أبحاث الفيروسات . عدد خاص: وظائف نهايات جينومات فيروسات الحمض النووي الريبوزي أحادي السلسلة الموجبة. 206 : 53-61 . doi : 10.1016/j.virusres.2015.01.026 . PMID 25660582 .
- ^ كونو جي، تشانغ جي جي، تسوتشيا خمير الحمر، كاراباتسوس ن، كروب سي بي (1998). "سلالة جنس Flavivirus" . جي فيرول . 72 (1): 73– 83. بيب كود : 1998JVir...72...73K . دوى : 10.1128/JVI.72.1.73-83.1998 . بمك 109351 . بميد 9420202 .
- ↑ غونت إم دبليو، سال إيه إيه، دي لامباليري إكس، فالكونار إيه كيه، دزيفانيان تي آي، غولد إي إيه (2001). "العلاقات التطورية لفيروسات الفلافيفيروس ترتبط بعلم الأوبئة، وارتباطها بالأمراض، وتوزيعها الجغرافي" . مجلة علم الفيروسات العام . 82 (8): 1867-1876 . doi : 10.1099/0022-1317-82-8-1867 . PMID 11457992 .
- ↑ بامفورد سي جي، دي سوزا دبليو إم، باري آر، جيفورد آر جيه (2022). "تحليل مقارن لتسلسلات الفيروسات المشفرة في الجينوم يكشف التاريخ التطوري للفيروسات المصفرة (عائلة الفيروسات المصفرة)" . تطور الفيروسات . 8 (2) veac085. doi : 10.1093/ve/veac085 . PMC 9752770. PMID 36533146 .
- ↑ كوك إس، هولمز إي سي (2006). "تحليل متعدد الجينات للعلاقات التطورية بين الفيروسات المصفرة (العائلة: Flaviviridae) وتطور انتقال النواقل" . أرشيف علم الفيروسات . 151 (2): 309-325 . doi : 10.1007/s00705-005-0626-6 . PMID 16172840 .
- ↑ كونواي ، إم جيه (2015). "تحديد تسلسل فيروس فلافيفيروس في مفصليات بحرية" . PLOS ONE . 10 (12) e0146037. Bibcode : 2015PLoSO..1046037C . doi : 10.1371/journal.pone.0146037 . PMC 4699914. PMID 26717191 .
- 1 2 باري ر، أسغاري س (2019). "اكتشاف فيروسات فلافية جديدة في القشريات ورأسيات الأرجل: رؤى حول تطور وانتشار الفيروسات الفلافية بين العوائل اللافقارية والفقارية البحرية" . مجلة علم الفيروسات . 93 (14) e00432-19. doi : 10.1128/JVI.00432-19 . PMC 6600200. PMID 31068424 .
- ↑ شي م، لين إكس دي، تشين إكس، تيان جيه إتش، تشين إل جيه، لي كيه، وآخرون (2018). "التاريخ التطوري لفيروسات الحمض النووي الريبي في الفقاريات" . مجلة نيتشر . 556 (7700): 197-202 . Bibcode : 2018Natur.556..197S . doi : 10.1038/ s41586-018-0012-7 . PMID 29618816. S2CID 256771319 .
- ↑ مورو جي، كوك إس، ليمي بي، نوغاريد إيه، فورستر إن إل، خاسناتينوف إم، شاريل آر إن، فيرث إيه إي، غولد إي إيه، دي لامباليري إكس (2015). "رؤى جديدة حول تطور فيروسات الفلافيفيروس وتصنيفها وتاريخها الجغرافي الحيوي، موسعة بتحليل تسلسلات الترميز الأساسية والبديلة" . PLOS ONE . 10 (2) e0117849. Bibcode : 2015PLoSO..1017849M . doi : 10.1371/journal.pone.0117849 . PMC 4342338. PMID 25719412 .
- ↑ غالي م، بيرنيني ف، زيهيندر ج (يوليو 2004). "الإسكندر الأكبر والتهاب الدماغ بفيروس غرب النيل" . الأمراض المعدية الناشئة. 10 ( 7): 1330-1332 ، رد المؤلف 1332-1333. doi : 10.3201/eid1007.040396 . PMID 15338540 .
- ↑ ويست، كريستي (8 فبراير 2010). "هل تتطور سلالة جينية مختلفة لفيروس غرب النيل؟" . مجلة ذا هورس . مؤرشف من الأصل في 17 فبراير 2010. تم الاطلاع عليه في 10 فبراير 2010 .من تصريحات أورسوليا كوتاسي، طبيبة بيطرية، من جامعة سانت إشتفان، المجر، في مؤتمر الجمعية الأمريكية لممارسي طب الخيول لعام 2009، 5-9 ديسمبر 2009.
- ↑ فينتر م، هيومان س، فان نيرك س، ويليامز ج، فان إيدن س، فريمان ف (أغسطس 2011). " مرض عصبي مميت وإجهاض في فرس مصابة بفيروس غرب النيل من السلالة 1، جنوب أفريقيا" . الأمراض المعدية الناشئة. 17 ( 8): 1534-1536 . doi : 10.3201/eid1708.101794 . PMC 3381566. PMID 21801644 .
- ↑ سانت ليجر ج، وو ج، أندرسون م، دالتون ل، نيلسون إي، وانغ د (2011). "عدوى فيروس غرب النيل في حوت قاتل، تكساس، الولايات المتحدة الأمريكية، 2007" . الأمراض المعدية الناشئة. 17 ( 8): 1531-1533 . doi : 10.3201/eid1708.101979 . PMC 3381582. PMID 21801643 .
- ^ كاران إل إس، سيكوزي إم، ياكيمينكو في في، بريستي آل، سيلا إي، زيندر جي، ريزا جي، بلاتونوف إيه إي (2014). “تاريخ التطور المستنتج لفيروس حمى أومسك النزفية”. مجلة علم الفيروسات الطبية . 86 (7): 1181-1187 . دوى : 10.1002/jmv.23856 . بميد 24259273 . S2CID 36929638 .
- ↑ "قائمة الأنواع: Flaviviridae " . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاطلاع عليه بتاريخ 25 مارس 2026 .
- ^ روبن واي، كورنيه إم، لو جونيديك جي، شاتو آر، هيم جي (1978). “[فيروس كيدوغو (Ar D14701): فيروس أربو جديد ("Flavivirus") معزول في السنغال (ترجمة المؤلف)]". آن ميكروبيول (باريس) . 129 (2): 239 – 244. بميد 677616 .
- ^ يانسن فان فورين بي، باري آر، خروميخ AA، باويسكا جي تي (2021). "عزلة فيروس كيدوغو (KEDV) عام 1958 من ندومو، جنوب أفريقيا، توسع النطاق الجغرافي والزمني لفيروس كيدوغو في أفريقيا" . الفيروسات . 13 (7): 1368. دوى : 10.3390 / v13071368 . بمك 8309962 . بميد 34372574 .
- ↑ فان دن هورك إيه إف، سوين دبليو دبليو، هول آر إيه، أوبراين سي إيه، بيليفيلدت-أومان إتش، هوبسون-بيترز جيه، كولمانت إيه إم (2016). " فيروس فلافيفيروس مكتشف حديثًا من مجموعة فيروسات الحمى الصفراء يُظهر تكاثرًا محدودًا في الفقاريات" . مجلة علم الفيروسات العام . 97 (5): 1087-1093 . doi : 10.1099/jgv.0.000430 . PMID 26878841. S2CID 43127614 .
- 1 2 3 4 5 باري ر، أسغاري س (15 يوليو 2019). "اكتشاف فيروسات فلافية جديدة في القشريات ورأسيات الأرجل: رؤى حول تطور وانتشار الفيروسات الفلافية بين العوائل اللافقارية والفقارية البحرية" . مجلة علم الفيروسات . 93 (14) e00432-19. doi : 10.1128/JVI.00432-19 . PMC 6600200. PMID 31068424 .
- ↑ ثيسياكورن يو (2014). " آخر التطورات والاتجاهات المستقبلية في لقاحات حمى الضنك" . التطورات العلاجية في اللقاحات . 2 (1): 3-9 . doi : 10.1177/2051013613507862 . PMC 3991153. PMID 24757522 .
- ^ ياوتش لو (2014). تطوير لقاح فيروس حمى الضنك . التقدم في أبحاث الفيروسات. المجلد. 88. ص 315 – 372. دوى : 10.1016 / B978-0-12-800098-4.00007-6 . رقم ISBN 978-0-12-800098-4PMID 24373316
- ↑ "أسئلة وأجوبة منظمة الصحة العالمية حول لقاحات حمى الضنك" . WHO.int. مؤرشف من الأصل في 1 نوفمبر 2020. تم الاطلاع عليه في 1 أكتوبر 2016 .
- ↑ فلينت جيه، راكانييلو في آر، رال جي إف، هاتزياننو تي، سكالكا إيه إم (3 أغسطس 2020). مبادئ علم الفيروسات، المجلد 2: التسبب في الأمراض ومكافحتها ( الطبعة الخامسة). جون وايلي وأولاده. ص 327. ISBN 978-1-68367-283-8.
للمزيد من القراءة
- كونو جي، تشانغ جي جي، تسوتشيا كر، كاراباتسوس إن، كروب سي بي (يناير 1998). "سلالة جنس Flavivirus " . جي فيرول . 72 (1): 73– 83. بيب كود : 1998JVir...72...73K . دوى : 10.1128/JVI.72.1.73-83.1998 . بمك 109351 . بميد 9420202 .
- زانوتو، بي. إم.، غولد، إي. إيه.، غاو، جي. إف.، هارفي، بي. إتش.، هولمز، إي. سي. (1996). "ديناميكيات تجمعات الفيروسات المصفرة كما كشفت عنها السلالات الجزيئية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 93 (2): 548-553 . Bibcode : 1996PNAS ... 93..548Z . doi : 10.1073/pnas.93.2.548 . PMC 40088. PMID 8570593 .
- كاليتزكي م (2006). البيولوجيا الجزيئية لفيروسات الفلافيفيروس . ويموندام: هورايزون بيوساينس. ISBN 978-1-904933-22-9.
- شي بي واي (2012). علم الفيروسات الجزيئي ومكافحة الفيروسات المصفرة . نورفولك، المملكة المتحدة: دار كايستر الأكاديمية للنشر. رقم ISBN 978-1-904455-92-9.
- موراي سي إل، جونز سي تي، رايس سي إم (2008). "مهندسو التجميع: أدوار البروتينات غير البنيوية لفيروسات الفلافيفيريداي في تكوين الفيروس" . مجلة نيتشر ريفيوز مايكروبيولوجي . 6 (9): 699-708 . doi : 10.1038/nrmicro1928 . PMC 2764292. PMID 18587411 .
روابط خارجية
- بايتس علم الأحياء الدقيقة: الفيروسات المصفرة
- معهد نوفارتس للأمراض الاستوائية (NITD) – أبحاث حمى الضنك في معهد نوفارتس للأمراض الاستوائية (NITD)
- Dengueinfo.org – مستودع بيانات التسلسل الجينومي لفيروس حمى الضنك
- Viralzone : Flavivirus ( مؤرشف بتاريخ 13 يونيو 2010 في Wayback Machine)
- قاعدة بيانات مسببات الأمراض الفيروسية ومورد التحليل (ViPR): Flaviviridae
- الفيروسات المصفرة
- الأمراض التي تنقلها القوارض
- عائلة الفيروسات المصفرة
- أجناس الفيروسات
