البلازميد

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 7 صور
الموسوعة الحرة

رسم تخطيطي لبكتيريا يوضح الحمض النووي الصبغي والبلازميدات (ليس وفقًا للمقياس)

البلازميد هو جزيء صغير من الحمض النووي خارج الكروموسومات داخل الخلية، منفصل فيزيائيًا عن الحمض النووي الكروموسومي، وقادر على التضاعف بشكل مستقل. توجد البلازميدات عادةً على شكل جزيئات دائرية صغيرة مزدوجة السلاسل من الحمض النووي في البكتيريا [1] والعتائق [ 2 ] ؛ ومع ذلك ، توجد البلازميدات أحيانًا في الكائنات حقيقية النواة أيضًا . [ 3 ] [ 4 ] غالبًا ما تحمل البلازميدات جينات مفيدة، مثل تلك المسؤولة عن مقاومة المضادات الحيوية ، والضراوة [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]، والتمثيل الغذائي الثانوي [ 8 ] ، والمعالجة الحيوية [ 9 ] [ 10 ] . بينما الكروموسومات كبيرة وتحتوي على جميع المعلومات الوراثية الأساسية للحياة في الظروف الطبيعية، فإن البلازميدات عادةً ما تكون صغيرة جدًا وتحتوي على جينات إضافية لظروف خاصة.

تُستخدم البلازميدات الاصطناعية على نطاق واسع كناقلات في الاستنساخ الجزيئي ، حيث تعمل على توجيه تضاعف تسلسلات الحمض النووي المؤتلف داخل الكائنات المضيفة. في المختبر، يمكن إدخال البلازميدات إلى الخلية عن طريق التحويل . تتوفر البلازميدات الاصطناعية للشراء عبر الإنترنت من قبل موردين مختلفين باستخدام تسلسلات مُقدمة، مصممة عادةً باستخدام برامج حاسوبية. في حال عدم نجاح التصميم، قد يُجري المورد تعديلات إضافية على التسلسل المُقدم. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]

تُعتبر البلازميدات وحداتٍ من الحمض النووي ( DNA) قادرة على التضاعف الذاتي داخل عائل مناسب. ومع ذلك، لا تُصنّف البلازميدات، كالفيروسات ، عمومًا ضمن الكائنات الحية . [ 14 ] تنتقل البلازميدات من بكتيريا إلى أخرى (حتى من نوع آخر) غالبًا عن طريق الاقتران . [ 5 ] يُعدّ هذا الانتقال للمادة الوراثية بين العوائل إحدى آليات النقل الجيني الأفقي ، وتُعتبر البلازميدات جزءًا من الموبيلوم . على عكس الفيروسات، التي تُغلّف مادتها الوراثية بغلاف بروتيني واقٍ يُسمى القفيصة ، فإن البلازميدات عبارة عن حمض نووي "عارٍ" ولا تُشفّر الجينات اللازمة لتغليف المادة الوراثية لنقلها إلى عائل جديد؛ مع ذلك، تُشفّر بعض أنواع البلازميدات شعيرة الاقتران "الجنسية" الضرورية لانتقالها. يتراوح حجم البلازميدات من 1 إلى أكثر من 400 ألف زوج قاعدي ، [ 15 ] ويمكن أن يتراوح عدد البلازميدات المتطابقة في الخلية الواحدة من واحد إلى آلاف.

تاريخ

صاغ عالم الأحياء الجزيئية الأمريكي جوشوا ليدربيرغ مصطلح "البلازميد " عام 1952 للإشارة إلى "أي مُحدد وراثي خارج الكروموسوم". [ 16 ] [ 17 ] شمل الاستخدام المبكر للمصطلح أي مادة وراثية بكتيرية موجودة خارج الكروموسوم لجزء على الأقل من دورة تضاعفها، ولكن نظرًا لأن هذا الوصف يشمل الفيروسات البكتيرية، فقد تم تحسين مفهوم البلازميد بمرور الوقت للإشارة إلى العناصر الوراثية التي تتكاثر ذاتيًا. [ 18 ] وفي وقت لاحق من عام 1968، تقرر اعتماد مصطلح "البلازميد" للإشارة إلى العنصر الوراثي خارج الكروموسوم، [ 19 ] ولتمييزه عن الفيروسات، تم تضييق التعريف ليشمل العناصر الوراثية الموجودة حصريًا أو بشكل رئيسي خارج الكروموسوم، والتي يمكنها التضاعف ذاتيًا، وتساهم في نقل العناصر المتحركة بين البكتيريا غير المرتبطة. [ 5 ] [ 6 ] [ 18 ]

الخصائص والمميزات

هناك نوعان من اندماج البلازميد في البكتيريا المضيفة: البلازميدات غير المندمجة تتضاعف كما هو الحال في المثال العلوي، بينما يمكن أن تندمج البلازميدات الحلقية ، وهي المثال السفلي، في كروموسوم المضيف .

لكي تتضاعف البلازميدات بشكل مستقل داخل الخلية، يجب أن تحتوي على جزء من الحمض النووي (DNA) يعمل كمنشأ للتضاعف . تُسمى الوحدة ذاتية التضاعف، وهي البلازميد في هذه الحالة، بالريبليكون . قد يتكون الريبليكون البكتيري النموذجي من عدة عناصر، مثل جين بروتين بدء التضاعف الخاص بالبلازميد (Rep)، ووحدات متكررة تُسمى التكرارات ، وصناديق DnaA ، ومنطقة مجاورة غنية بالأدينين والثايمين. [ 18 ] تستخدم البلازميدات الأصغر حجمًا إنزيمات التضاعف الخاصة بالخلية المضيفة لإنتاج نسخ من نفسها، بينما قد تحمل البلازميدات الأكبر حجمًا جينات خاصة بتضاعف تلك البلازميدات. يمكن لبعض أنواع البلازميدات أيضًا أن تندمج في كروموسوم الخلية المضيفة، وتُسمى هذه البلازميدات التكاملية أحيانًا بالبلازميدات الحلقية في بدائيات النوى . [ 20 ]

تحمل البلازميدات عادةً جينًا واحدًا على الأقل. العديد من الجينات التي تحملها البلازميد مفيدة للخلايا المضيفة، على سبيل المثال: تمكين الخلية المضيفة من البقاء في بيئة قد تكون قاتلة أو معيقة للنمو. بعض هذه الجينات يشفر سمات مقاومة للمضادات الحيوية أو مقاومة للمعادن الثقيلة، بينما قد ينتج البعض الآخر عوامل ضراوة تمكّن البكتيريا من استعمار المضيف والتغلب على دفاعاته، أو لها وظائف أيضية محددة تسمح للبكتيريا باستخدام مغذيات معينة، بما في ذلك القدرة على تحليل المركبات العضوية المقاومة أو السامة. [ 21 ] يمكن للبلازميدات أيضًا أن تمنح البكتيريا القدرة على تثبيت النيتروجين . بعض البلازميدات، التي تسمى البلازميدات الخفية ، لا يبدو أنها توفر أي ميزة واضحة لمضيفها، ومع ذلك تستمر في الوجود في التجمعات البكتيرية. [ 22 ] ومع ذلك، تُظهر الدراسات الحديثة أنها قد تلعب دورًا في مقاومة المضادات الحيوية من خلال المساهمة في المقاومة المتباينة داخل التجمعات البكتيرية. [ 23 ]

تتفاوت البلازميدات الطبيعية بشكل كبير في خصائصها الفيزيائية. يتراوح حجمها من بلازميدات صغيرة جدًا (أقل من كيلو قاعدة) إلى بلازميدات ضخمة (عدة ميغابايت). في الطرف الأعلى، لا يوجد فرق يُذكر بين البلازميد الضخم والكروموسوم المصغر . عادةً ما تكون البلازميدات دائرية، ولكن توجد أيضًا أمثلة على البلازميدات الخطية. تتطلب هذه البلازميدات الخطية آليات متخصصة لتضاعف أطرافها. [ 18 ]

قد تتواجد البلازميدات في الخلية الواحدة بأعداد متفاوتة، تتراوح من نسخة واحدة إلى عدة مئات. يُطلق على العدد الطبيعي لنسخ البلازميد الموجودة في الخلية الواحدة اسم عدد نسخ البلازميد ، ويتحدد هذا العدد بناءً على كيفية تنظيم بدء التضاعف وحجم الجزيء. تميل البلازميدات الأكبر حجمًا إلى امتلاك عدد نسخ أقل. [ 20 ] البلازميدات ذات عدد النسخ المنخفض، والتي توجد بنسخة واحدة أو بضع نسخ فقط في كل بكتيريا، تكون، عند انقسام الخلية ، مُعرّضة لخطر الفقدان في إحدى البكتيريا المنفصلة. تمتلك هذه البلازميدات أحادية النسخة أنظمة تحاول توزيع نسخة منها بنشاط على كلتا الخليتين البنتين. غالبًا ما يُشار إلى هذه الأنظمة، والتي تشمل نظام parABS ونظام parMRC ، باسم نظام التوزيع أو وظيفة التوزيع للبلازميد. [ 24 ]

البلازميدات ذات الشكل الخطي غير معروفة بين مسببات الأمراض النباتية باستثناء واحد، وهو Rhodococcus fascians . [ 25 ]

التصنيفات والأنواع

لمحة عامة عن الاقتران البكتيري
صورة مجهرية إلكترونية لحزمة ألياف الحمض النووي، يُفترض أنها حلقة كروموسوم بكتيري واحد
صورة مجهرية إلكترونية لبلازميد الحمض النووي البكتيري (جزء من الكروموسوم)

يمكن تصنيف البلازميدات بعدة طرق. ويمكن تصنيفها بشكل عام إلى بلازميدات اقترانية وبلازميدات غير اقترانية. تحتوي البلازميدات الاقترانية على مجموعة من جينات النقل التي تُعزز الاقتران الجنسي بين الخلايا المختلفة. [ 20 ] في عملية الاقتران المعقدة ، قد تنتقل البلازميدات من بكتيريا إلى أخرى عبر الأهداب الجنسية المشفرة بواسطة بعض جينات النقل (انظر الشكل). [ 26 ] أما البلازميدات غير الاقترانية فهي غير قادرة على بدء الاقتران، وبالتالي لا يمكن نقلها إلا بمساعدة البلازميدات الاقترانية. وهناك فئة وسيطة من البلازميدات قابلة للنقل، وتحمل فقط مجموعة فرعية من الجينات اللازمة للنقل. ويمكنها أن تتطفل على البلازميد الاقتراني، وتنتقل بتردد عالٍ فقط في وجوده. [ 27 ]

يمكن تصنيف البلازميدات أيضًا إلى مجموعات عدم توافق. قد يحمل الميكروب أنواعًا مختلفة من البلازميدات، ولكن لا يمكن أن توجد بلازميدات مختلفة في خلية بكتيرية واحدة إلا إذا كانت متوافقة. إذا لم يكن بلازميدان متوافقين، فسيفقد أحدهما أو الآخر بسرعة من الخلية. لذلك، يمكن تصنيف البلازميدات المختلفة إلى مجموعات عدم توافق مختلفة اعتمادًا على قدرتها على التعايش. تشترك البلازميدات غير المتوافقة (التي تنتمي إلى نفس مجموعة عدم التوافق) عادةً في آليات التضاعف أو الانقسام نفسها، وبالتالي لا يمكن الاحتفاظ بها معًا في خلية واحدة. [ 28 ] [ 29 ] كان يتم تحديد نمط عدم التوافق (أو نمط Inc) تقليديًا باستخدام طرق النمط الظاهري الجيني، لاختبار ما إذا كانت الخلايا تنقل أزواج البلازميدات بشكل مستقر إلى نسلها. [ 30 ] وقد تم استبدال هذه الطرق إلى حد كبير بالطرق الجينية مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، ومؤخرًا بطرق تسلسل الجينوم الكامل باستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية مثل PlasmidFinder. [ 31 ]

هناك طريقة أخرى لتصنيف البلازميدات وهي حسب وظيفتها. وهناك خمس فئات رئيسية:

  • بلازميدات الخصوبة F ، التي تحتوي على جينات tra ، قادرة على الاقتران وتؤدي إلى ظهور الأهداب الجنسية . [ 17 ] [ 32 ] تُصنف بلازميدات F إلى نوعين: (+) و(-)، ويساهم ذلك في تحديد ما إذا كانت مانحة أم مستقبلة أثناء الاقتران. [ 17 ] [ 32 ] [ 33 ]
  • تم اكتشاف بلازميدات المقاومة (R)، التي تحتوي على جينات تُكسب البكتيريا مقاومة للمضادات الحيوية أو العوامل المضادة للبكتيريا، لأول مرة عام 1959. [ 34 ] كانت عوامل المقاومة (R) تُعتبر عاملاً مساهماً في انتشار مقاومة المضادات الحيوية المتعددة في البكتيريا، كما أن بعض بلازميدات المقاومة (R) تُساعد في نقل عوامل مقاومة أخرى غير ذاتية الانتقال. [ 35 ] [ 36 ] كانت تُعرف تاريخياً باسم عوامل المقاومة (R) قبل فهم طبيعة البلازميدات.
  • البلازميدات Col، التي تحتوي على جينات تشفر البكتيريوسينات ، وهي بروتينات يمكنها قتل البكتيريا الأخرى.
  • البلازميدات المحللة، التي تمكن من هضم المواد غير العادية، مثل التولوين وحمض الساليسيليك .
  • البلازميدات المسببة للضراوة، التي تحوّل البكتيريا إلى ممرضة ، مثل بلازميد Ti في بكتيريا Agrobacterium tumefaciens . تحتفظ البكتيريا الخاضعة لضغط انتقائي بالبلازميدات التي تحتوي على عوامل الضراوة، لأن ذلك يمثل توازناً بين التكلفة والفائدة للبقاء على قيد الحياة. قد يؤدي زوال الضغط الانتقائي إلى فقدان البلازميد، إذ يصبح استهلاك الطاقة اللازمة للحفاظ عليه غير مبرر. [ 7 ] [ 37 ]

يمكن أن تنتمي البلازميدات إلى أكثر من مجموعة وظيفية واحدة من هذه المجموعات.

تحديد نوع البلازميد بناءً على التسلسل

مع ازدياد توفر تقنيات تسلسل الجينوم الكامل، القادرة على التقاط التسلسل الجيني للبلازميدات، طُوّرت طرق لتصنيف البلازميدات أو تجميعها بناءً على محتواها التسلسلي. يعتمد تصنيف البلازميدات متعدد المواقع (pMLST) على تصنيف الكروموسومات متعدد المواقع، وذلك بمطابقة تسلسل جينات آلية التضاعف مع قواعد بيانات التسلسلات المصنفة مسبقًا. إذا تطابق أليل التسلسل مع قاعدة البيانات، يُستخدم هذا التطابق لتصنيف البلازميد، وبالتالي يتميز بحساسية أعلى من اختبار وجود أو غياب هذه الجينات فقط. [ 31 ]

تتمثل إحدى الطرق ذات الصلة في استخدام متوسط ​​تطابق النيوكليوتيدات بين البلازميدات للعثور على جيران جينيين قريبين. ومن الأدوات التي تستخدم هذا النهج COPLA [ 38 ] وMOB-cluster [ 39 ] .

أثبتت الدراسات أن إنشاء تصنيفات الأنماط باستخدام التعلم غير الخاضع للإشراف ، أي بدون قاعدة بيانات مسبقة أو "بدون مرجع"، مفيد في تجميع البلازميدات في مجموعات بيانات جديدة دون تحيز أو اقتصار على تمثيلات في قاعدة بيانات مُعدة مسبقًا - ومن الأدوات المستخدمة في ذلك mge-cluster. [ 40 ] نظرًا لأن البلازميدات تُغير محتواها الجيني وترتيبه بشكل متكرر، فإن نمذجة المسافات الجينية بينها باستخدام طرق مصممة للطفرات النقطية قد تؤدي إلى تقديرات غير دقيقة للمسافة التطورية الحقيقية بين البلازميدات. تعمل أدوات مثل pling على إيجاد مناطق التسلسل المتماثل بين البلازميدات، وإعادة بناء عدد الأحداث التطورية ( المتغيرات البنيوية ) بين كل زوج بدقة أكبر، ثم تستخدم أساليب التجميع غير الخاضعة للإشراف لتجميع البلازميدات. [ 41 ]

بلازميدات الحمض النووي الريبي

على الرغم من أن معظم البلازميدات عبارة عن جزيئات DNA مزدوجة السلسلة، إلا أن بعضها يتكون من DNA أحادي السلسلة ، أو RNA مزدوج السلسلة في الغالب . بلازميدات RNA هي جزيئات RNA خطية غير معدية خارج الكروموسومات، سواء كانت مغلفة أو غير مغلفة، وقد وُجدت في الفطريات وأنواع مختلفة من النباتات، من الطحالب إلى النباتات البرية. مع ذلك، في كثير من الحالات، قد يكون من الصعب أو المستحيل التمييز بوضوح بين بلازميدات RNA وفيروسات RNA وغيرها من جزيئات RNA المعدية. [ 42 ]

الكروميدات

الكروميدات هي عناصر تقع على الحد الفاصل بين الكروموسوم والبلازميد، وتوجد في حوالي 10% من أنواع البكتيريا التي تم تسلسلها حتى عام 2009. تحمل هذه العناصر جينات أساسية وتستخدم كودونات مشابهة للكروموسوم، ولكنها تستخدم آلية تضاعف شبيهة بالبلازميد، مثل RepABC ذي العدد المنخفض من النسخ. ونتيجة لذلك، تم تصنيفها سابقًا على أنها كروموسومات مصغرة أو بلازميدات ضخمة. [ 43 ] في بكتيريا الضمة (Vibrio) ، تُزامن البكتيريا تضاعف الكروموسوم والكروميد من خلال نسبة حجم جينوم محفوظة. [ 44 ]

المتجهات

يمكن استخدام البلازميدات المصنعة كحوامل في الهندسة الوراثية . تُعد هذه البلازميدات أدوات مهمة في مختبرات علم الوراثة والتكنولوجيا الحيوية، حيث تُستخدم عادةً لاستنساخ وتضخيم (إنتاج نسخ متعددة من) أو التعبير عن جينات معينة. [ 45 ] تتوفر مجموعة واسعة من البلازميدات تجاريًا لهذه الاستخدامات. يُدرج الجين المراد استنساخه عادةً في بلازميد يحتوي على عدد من الخصائص اللازمة لاستخدامه. تشمل هذه الخصائص جينًا يُكسب مقاومة لمضادات حيوية معينة ( يُستخدم الأمبيسيلين بشكل شائع للسلالات البكتيرية)، ومنشأ تضاعف يسمح للخلايا البكتيرية بنسخ الحمض النووي للبلازميد، وموقعًا مناسبًا للاستنساخ (يُشار إليه بموقع استنساخ متعدد ).

يمكن تعريف عدم استقرار بنية الحمض النووي بأنه سلسلة من الأحداث التلقائية التي تتوج بإعادة ترتيب غير متوقعة، أو فقدان، أو اكتساب للمادة الوراثية. غالبًا ما تُحفز هذه الأحداث بانتقال العناصر المتحركة أو بوجود عناصر غير مستقرة مثل البنى غير التقليدية (غير B). قد تشارك المناطق الملحقة بالهيكل البكتيري في مجموعة واسعة من ظواهر عدم الاستقرار البنيوي. تشمل المحفزات المعروفة لعدم الاستقرار الجيني التكرارات المباشرة والمعكوسة والمتتالية، والتي من المعروف أنها بارزة في عدد كبير من نواقل الاستنساخ والتعبير المتوفرة تجاريًا. [ 46 ] يمكن أن تؤثر تسلسلات الإدخال أيضًا بشدة على وظيفة البلازميد وإنتاجيته، من خلال التسبب في عمليات حذف وإعادة ترتيب، وتنشيط، أو تثبيط، أو تعطيل التعبير الجيني المجاور . [ 47 ] لذلك، فإن تقليل أو إزالة تسلسلات العمود الفقري غير المشفرة الزائدة سيقلل بشكل ملحوظ من احتمالية حدوث مثل هذه الأحداث، وبالتالي، من القدرة الإجمالية للبلازميد على إعادة التركيب. [ 48 ] [ 49 ]

رسم تخطيطي للبلازميد pBR322 ، وهو أحد أوائل البلازميدات التي استُخدمت على نطاق واسع كناقل استنساخ . يوضح الرسم التخطيطي للبلازميد الجينات المشفرة ( amp و tet لمقاومة الأمبيسيلين والتتراسيكلين على التوالي)، وأصل التضاعف ( ori )، ومواقع التقييد المختلفة (المشار إليها باللون الأزرق).

استنساخ

تُعدّ البلازميدات أكثر نواقل الاستنساخ البكتيرية شيوعًا. [ 50 ] تحتوي هذه النواقل على موقع يسمح بإدخال أجزاء من الحمض النووي، مثل موقع استنساخ متعدد أو رابط متعدد يحتوي على عدة مواقع تقييد شائعة الاستخدام لربط أجزاء الحمض النووي . بعد إدخال الجين المطلوب، تُدخل البلازميدات إلى البكتيريا بعملية تُسمى التحويل . تحتوي هذه البلازميدات على علامة اختيارية ، عادةً ما تكون جين مقاومة للمضادات الحيوية، تُكسب البكتيريا القدرة على البقاء والتكاثر في وسط نمو انتقائي يحتوي على مضادات حيوية محددة. تُعرَّض الخلايا بعد التحويل للوسط الانتقائي، ولا تنجو إلا الخلايا التي تحتوي على البلازميد. وبهذه الطريقة، تعمل المضادات الحيوية كمرشح لاختيار البكتيريا التي تحتوي على الحمض النووي للبلازميد فقط. قد يحتوي الناقل أيضًا على جينات علامة أخرى أو جينات مُبلِّغة لتسهيل اختيار البلازميدات ذات الإدخالات المستنسخة. يمكن بعد ذلك زراعة البكتيريا التي تحتوي على البلازميد بكميات كبيرة، ثم حصادها، ويمكن بعد ذلك عزل البلازميد المطلوب باستخدام طرق مختلفة لتحضير البلازميد .

يُستخدم ناقل استنساخ البلازميد عادةً لاستنساخ أجزاء الحمض النووي التي يصل طولها إلى 15 كيلو قاعدة . [ 51 ] لاستنساخ أطوال أطول من الحمض النووي، تُستخدم عاثيات لامدا المحذوفة منها جينات التحلل، أو الكوزميدات ، أو الكروموسومات الاصطناعية البكتيرية ، أو الكروموسومات الاصطناعية للخميرة .

نواقل الانتحار (البلازميدات)

النواقل الانتحارية هي بلازميدات غير قادرة على التكاثر في الخلية المضيفة، وبالتالي يجب أن تندمج في الكروموسوم أو تختفي. [ 52 ] أحد الأمثلة على هذه النواقل هو بلازميد pMQ30. يحتوي هذا البلازميد على جين SacB من بكتيريا Bacillus subtilis ، والذي يمكن تحفيزه بواسطة السكروز، وسيكون قاتلاً عند التعبير عنه في البكتيريا سالبة الغرام. [ 53 ] تظهر فائدة هذا النظام (مراقبة النجاح على مرحلتين) عندما يتطلب تصميم التجربة دمج جين مستهدف في كروموسوم البكتيريا المضيفة. في المرحلة الأولى، بعد تحويل الخلايا المضيفة بالبلازميد، يمكن استخدام وسط يحتوي على مضاد حيوي محدد لاختيار البكتيريا التي تحتوي على البلازميد. تضمن المرحلة الثانية بقاء البكتيريا التي اندمج فيها البلازميد فقط. بما أن البلازميد يحتوي على جين SacB الذي يحفز السمية في وجود السكروز، فإن البكتيريا التي اندمج فيها البلازميد في كروموسومها فقط هي التي ستعيش وتنمو.

إنتاج البروتين

الأنسولين

يُعدّ إنتاج كميات كبيرة من البروتينات استخدامًا رئيسيًا آخر للبلازميدات. في هذه الحالة، يقوم الباحثون بتنمية بكتيريا تحتوي على بلازميد يحمل الجين المطلوب. وكما تُنتج البكتيريا بروتينات تُكسبها مقاومة للمضادات الحيوية، يُمكن أيضًا تحفيزها لإنتاج كميات كبيرة من البروتينات من الجين المُدخل. تُعتبر هذه طريقة سهلة وغير مكلفة لإنتاج البروتين بكميات كبيرة، فعلى سبيل المثال، يؤدي استغلال التكاثر السريع لبكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) الحاملة لبلازميد يحتوي على جين الأنسولين إلى إنتاج كميات كبيرة من الأنسولين. [ 54 ] [ 55 ] [ 56 ]

العلاج الجيني

يمكن استخدام البلازميدات أيضًا لنقل الجينات كعلاج محتمل في العلاج الجيني ، وذلك لإنتاج البروتين الناقص في الخلايا. تتطلب بعض أنواع العلاج الجيني إدخال جينات علاجية في مواقع كروموسومية مستهدفة محددة مسبقًا ضمن الجينوم البشري . تُعد نواقل البلازميد إحدى الطرق العديدة التي يمكن استخدامها لهذا الغرض. توفر نوكليازات أصابع الزنك (ZFNs) وسيلة لإحداث قطع مزدوج السلسلة في موقع محدد في جينوم الحمض النووي، مما يؤدي إلى إعادة التركيب المتماثل . يمكن للبلازميدات التي تُشفّر ZFN أن تساعد في توصيل الجين العلاجي إلى موقع محدد، وبالتالي تجنب تلف الخلايا ، والطفرات المسببة للسرطان، أو الاستجابة المناعية . [ 57 ]

نماذج الأمراض

استُخدمت البلازميدات تاريخيًا في الهندسة الوراثية للخلايا الجذعية الجنينية للفئران لإنشاء نماذج لأمراض وراثية فيها. إلا أن محدودية كفاءة التقنيات القائمة على البلازميدات حالت دون استخدامها في إنشاء نماذج أكثر دقة للخلايا البشرية. مع ذلك، فقد مكّنت التطورات في تقنيات إعادة تركيب الفيروسات الغدية المرتبطة ، والنيوكليازات ذات الأصابع الزنكية ، من إنشاء جيل جديد من نماذج الأمراض البشرية المتماثلة جينيًا .

مجموعة الجينات الحيوية (BGC)

تساعد البلازميدات في نقل مجموعات الجينات الحيوية - وهي مجموعة من الجينات التي تحتوي على جميع الإنزيمات اللازمة لإنتاج مستقلبات خاصة (تُعرف رسميًا باسم المستقلبات الثانوية ). [ 58 ] تتجلى إحدى فوائد استخدام البلازميدات لنقل مجموعات الجينات الحيوية في استخدام مضيف مناسب قادر على إنتاج كميات كبيرة من المستقلبات المتخصصة، حيث تستطيع بعض هذه الجزيئات التحكم في التجمعات الميكروبية. [ 59 ] [ 60 ] يمكن للبلازميدات أن تحتوي على العديد من مجموعات الجينات الحيوية وتُعبّر عنها، مع وجود عدد قليل من البلازميدات المعروفة بتخصصها في نقل هذه المجموعات. [ 60 ] كما يمكن نقل مجموعات الجينات الحيوية إلى كروموسوم الكائن المضيف باستخدام ناقل بلازميدي، مما يسمح بإجراء دراسات في تجارب تعطيل الجينات. [ 61 ] باستخدام البلازميدات لامتصاص مجموعات الجينات الحيوية، يمكن للكائنات الدقيقة أن تكتسب ميزة، حيث لا يقتصر الإنتاج على جينات التخليق الحيوي المقاومة للمضادات الحيوية فحسب ، بل يشمل أيضًا إنتاج السموم /مضادات السموم. [ 62 ]

الإبيسومات

استُخدم مصطلح "إبيسوم" لأول مرة من قِبل فرانسوا جاكوب وإيلي وولمان عام 1958 للإشارة إلى المادة الوراثية خارج الكروموسوم التي قد تتضاعف ذاتيًا أو تندمج في الكروموسوم. [ 63 ] [ 64 ] إلا أن استخدام المصطلح قد تغير منذ ذلك الحين، إذ أصبح مصطلح "بلازميد " هو المصطلح المُفضّل للإشارة إلى الحمض النووي خارج الكروموسوم الذي يتضاعف ذاتيًا. وفي ندوة عُقدت عام 1968 في لندن، اقترح بعض المشاركين التخلي عن مصطلح "إبيسوم" ، بينما استمر آخرون في استخدامه مع تغيير في المعنى. [ 65 ] [ 66 ]

يستخدم بعض المؤلفين اليوم مصطلح "إبيسوم" في سياق بدائيات النوى للإشارة إلى بلازميد قادر على الاندماج في الكروموسوم. قد تتضاعف البلازميدات المندمجة وتُحفظ بثبات في الخلية عبر أجيال متعددة، ولكنها في مرحلة ما ستوجد كجزيء بلازميد مستقل. [ 67 ]

في سياق حقيقيات النوى، يُستخدم مصطلح "إبيسوم" للدلالة على جزيء DNA دائري مغلق خارج الكروموسوم غير مُدمج، والذي قد يتضاعف داخل النواة. [ 68 ] [ 69 ] تُعد الفيروسات من أكثر الأمثلة شيوعًا على ذلك، مثل فيروسات الهربس ، والفيروسات الغدية ، وفيروسات البوليوما ، ولكن بعضها عبارة عن بلازميدات. تشمل الأمثلة الأخرى شظايا كروموسومية شاذة، مثل الكروموسومات الدقيقة المزدوجة ، التي قد تنشأ أثناء تضخيم الجينات الاصطناعي أو في العمليات المرضية (مثل تحول الخلايا السرطانية). تتصرف الإبيسومات في حقيقيات النوى بشكل مشابه للبلازميدات في بدائيات النوى، حيث يُحافظ على DNA بشكل مستقر ويتضاعف مع الخلية المضيفة. كما يمكن أن تحدث الإبيسومات الفيروسية السيتوبلازمية (كما في عدوى فيروسات الجدري ). تتضاعف بعض الإبيسومات، مثل فيروسات الهربس، بآلية دائرية متدحرجة ، على غرار العاثيات (فيروسات العاثيات البكتيرية). تتكاثر أنواع أخرى عبر آلية تضاعف ثنائية الاتجاه ( بلازميدات من نوع ثيتا ). في كلتا الحالتين، تبقى الإبيزومات منفصلة فيزيائيًا عن كروموسومات الخلية المضيفة. تُحفظ العديد من فيروسات السرطان، بما في ذلك فيروس إبشتاين-بار وفيروس الهربس المرتبط بساركوما كابوزي، كإبيزومات كامنة ومتميزة كروموسوميًا في الخلايا السرطانية، حيث تُعبّر الفيروسات عن جينات ورمية تُعزز تكاثر الخلايا السرطانية. في السرطانات، تتضاعف هذه الإبيزومات بشكل سلبي مع كروموسومات الخلية المضيفة عند انقسام الخلية. عندما تبدأ هذه الإبيزومات الفيروسية التضاعف الانحلالي لتوليد جزيئات فيروسية متعددة، فإنها تُفعّل عادةً آليات الدفاع المناعي الفطري الخلوي التي تقتل الخلية المضيفة.

صيانة البلازميد

تتضمن بعض البلازميدات أو العوائل الميكروبية نظام إدمان أو نظام قتل ما بعد الانفصال (PSK)، مثل نظام hok/sok (قتل المضيف/كبح القتل) للبلازميد R1 في بكتيريا الإشريكية القولونية . [ 70 ] ينتج هذا النوع سمًا طويل الأمد وترياقًا قصير الأمد . وُصفت عدة أنواع من أنظمة إدمان البلازميد (السم/مضاد السم، والأنظمة القائمة على الأيض، وأنظمة ORT) في الأدبيات العلمية [ 71 ] ، واستُخدمت في تطبيقات التكنولوجيا الحيوية (التخمير) أو التطبيقات الطبية الحيوية (العلاج باللقاحات). تبقى الخلايا الوليدة التي تحتفظ بنسخة من البلازميد على قيد الحياة، بينما تموت الخلية الوليدة التي لا ترث البلازميد أو تعاني من انخفاض معدل النمو بسبب السم المتبقي من الخلية الأم. وأخيرًا، يمكن تحسين الإنتاجية الإجمالية.

في المقابل، نادراً ما تحتوي البلازميدات المستخدمة في التكنولوجيا الحيوية، مثل pUC18 و pBR322 والمتجهات المشتقة منها، على أنظمة إدمان السموم ومضادات السموم، وبالتالي يجب إبقاؤها تحت ضغط المضادات الحيوية لتجنب فقدان البلازميد.

البلازميدات في حقيقيات النوى

قد تتواجد البلازميدات التي تتضاعف وتُعبَّر عنها بواسطة آليات الخلية حقيقية النواة في السيتوبلازم أو نواة الخلية، ولكل بلازميدات مختلفة تفضيلاتها الخاصة. إضافةً إلى ذلك، تمتلك حقيقيات النوى عُضَيتين تكافليتين داخليتين، لكل منهما جينومها وآليتها الوراثية الخاصة - الميتوكوندريا والبلاستيدة الخضراء - ويمكن لكل منهما أن يحمل بلازميدات إلى جانب جزيء الجينوم الرئيسي للعُضَية.

البلازميدات السيتوبلازمية حقيقية النواة

بلازميدات سيتوبلازمية الخميرة

تُعد بلازميدات pGKL الخطية الطبيعية من خميرة Kluyveromyces lactis مسؤولة عن الأنماط الظاهرية القاتلة . ويمكن إدخالها في خميرة الخباز الشائعة S. cerevisiae . [ 72 ]

البلازميدات النووية حقيقية النواة

تدخل البلازميدات إلى النواة أثناء انقسام الخلية، حيث تلتف داخل الغلاف النووي أثناء إعادة تشكيله. ونتيجة لذلك، لا تعمل البلازميدات النووية في الخلايا غير المنقسمة. [ 73 ]

بلازميدات نووية الخميرة

يوجد البلازميد الطبيعي الذي يبلغ حجمه 2 ميكرون (سمي بهذا الاسم نسبةً  إلى حجمه الذي يبلغ حوالي 2 ميكرومتر) في خميرة الخباز الشائعة S. cerevisiae . ويتواجد في النواة بواقع 30 إلى 40 نسخة لكل خلية. وغالبًا ما يتم تعديله لأغراض الهندسة الوراثية للخميرة. [ 74 ]

ترتبط أنواع أخرى من البلازميدات غالبًا بنواقل استنساخ الخميرة التي تشمل:

  • البلازميد التكاملي للخميرة (YIp) ، هو ناقل خميرة يعتمد على الاندماج في كروموسوم المضيف للبقاء والتكاثر. عادةً ما يتم تعديله إلى نواقل استنساخ عند دراسة وظيفة جين منفرد أو عندما يكون الجين سامًا. يرتبط أيضًا بالجين URA3 الذي يشفر إنزيمًا مرتبطًا بالتخليق الحيوي لنيوكليوتيدات البيريميدين (T، C).
  • البلازميد التضاعفي للخميرة (YRp) ، الذي ينقل تسلسلًا من الحمض النووي الصبغي يتضمن منشأ التضاعف. هذه البلازميدات أقل استقرارًا، إذ يمكن فقدانها أثناء التبرعم.

البلازميدات النووية للثدييات

تُدخل البلازميدات الاصطناعية إلى خلايا الثدييات لحثها على إنتاج منتج جيني معين. كما تُستخدم لتحديد ودراسة العناصر التنظيمية كمياً ، بافتراض أن هذه العناصر الموجودة على البلازميد ستعمل بشكل مشابه لنسختها الموجودة على الكروموسوم. [ 75 ]

التفاعل مع الكروماتين

وبما أن جزيء البلازميد عبارة عن تسلسلات الحمض النووي في النواة، فإنه يتفاعل أيضًا مع بروتينات الهيستون .

  • في الخميرة، ينتج البلازميد pBR327 كروماتينًا متماسكًا بفضل اصطفاف النيوكليوسومات بواسطة الهيستون H5. وقد وُجد أن منطقة محددة بطول 800 زوج قاعدي تحفز هذا الاصطفاف، وبدونها لا يحدث. [ 76 ]
  • في الثدييات: تُشكّل خلايا HEK 293 نيوكليوسومات حول كلٍّ من pEGFP-N1 السليم والمتضرر، لكنّ بنيتها شاذة مقارنةً بالكروماتين الطبيعي الموجود على الكروموسومات. [ 77 ] في عام 2025، اكتُشف أن تكوين الكروماتين يُوجّه بتسلسلات البلازميد (كما هو الحال على الكروموسوم)، لكن بعض التسلسلات فقط تُنتج البنية "الأصلية" الموجودة على الكروموسوم. [ 75 ]

بلازميدات العضيات حقيقية النواة

بلازميدات الميتوكوندريا النباتية الطبيعية

تحتوي الميتوكوندريا في العديد من النباتات الراقية على جزيئات DNA خطية أو دائرية خارج الكروموسومات، ذاتية التضاعف ، تُعتبر بلازميدات. يتراوح حجمها بين 0.7 و20 كيلوبايت. تُصنف البلازميدات عمومًا إلى فئتين: دائرية وخطية. [ 78 ] عُزلت البلازميدات الدائرية ووُجدت في العديد من النباتات المختلفة، وتُعد تلك الموجودة في الفول (Vicia faba) والقطيفة البيضاء (Chenopodium album) الأكثر دراسة، كما أن آلية تضاعفها معروفة. تتضاعف البلازميدات الدائرية باستخدام نموذج θ للتضاعف (كما في الفول ) ومن خلال تضاعف الدائرة المتدحرجة (كما في القطيفة البيضاء ). [ 79 ] حُددت البلازميدات الخطية في بعض أنواع النباتات مثل الشمندر الشائع ( Beta vulgaris ) واللفت (Brassica napus ) والذرة (Zea mays) ، وغيرها، ولكنها أقل شيوعًا من نظيراتها الدائرية.

لا تزال وظيفة هذه البلازميدات وأصلها غير معروفين إلى حد كبير. وقد أشير إلى أن البلازميدات الدائرية تشترك في سلف مشترك، وأن بعض الجينات في بلازميد الميتوكوندريا لها نظائر في الحمض النووي النووي، مما يشير إلى تبادل بين الحجيرات. في الوقت نفسه، تشترك البلازميدات الخطية في أوجه تشابه هيكلية، مثل الإنفرترونات، مع الحمض النووي الفيروسي والبلازميدات الفطرية، كما أنها، مثل البلازميدات الفطرية، تحتوي على نسبة منخفضة من الجوانين والسيتوزين. وقد أدت هذه الملاحظات إلى افتراضات بأن هذه البلازميدات الخطية ذات أصول فيروسية، أو أنها وصلت إلى ميتوكوندريا النباتات من خلال النقل الأفقي للجينات من الفطريات الممرضة. [ 78 ] [ 80 ]

دراسة البلازميدات

استخلاص الحمض النووي البلازميدي

تُستخدم البلازميدات غالبًا لتنقية تسلسل محدد، نظرًا لسهولة فصلها عن باقي الجينوم. ويتطلب استخدامها كناقلات، وللاستنساخ الجزيئي ، عزل البلازميدات في كثير من الأحيان.

توجد عدة طرق لعزل الحمض النووي البلازميدي من البكتيريا، بدءًا من مجموعات استخلاص البلازميد (من مجموعات التحضير المصغر إلى مجموعات التحضير الموسع أو التحضير بالجملة )، مرورًا بالتحلل القلوي ، والتحلل الإنزيمي، والتحلل الميكانيكي. [ 45 ] يمكن استخدام الطريقة الأولى لتحديد صحة البلازميد بسرعة في أي من عدة مستنسخات بكتيرية. ينتج عن هذه الطريقة كمية صغيرة من الحمض النووي البلازميدي غير النقي، وهي كافية للتحليل باستخدام إنزيمات القطع ولبعض تقنيات الاستنساخ.

في الطريقة الأخيرة، تُزرع كميات أكبر بكثير من معلق البكتيريا، ومنها يُمكن إجراء عملية تحضير واسعة النطاق. وهي في جوهرها عملية تحضير مصغرة مُوسّعة، تليها عملية تنقية إضافية. ينتج عن ذلك كميات كبيرة نسبيًا (عدة مئات من الميكروغرامات) من الحمض النووي البلازميدي عالي النقاء.

تم ابتكار العديد من المجموعات التجارية لإجراء استخلاص البلازميد على نطاقات ودرجات نقاء ومستويات أتمتة مختلفة.

التشكيلات

قد يظهر الحمض النووي البلازميدي في أحد خمسة أشكال، والتي تتحرك (لحجم معين) بسرعات مختلفة في الهلام أثناء عملية الفصل الكهربائي . فيما يلي قائمة بالأشكال مرتبة حسب سرعة حركتها الكهربائية (السرعة عند تطبيق جهد كهربائي معين) من الأبطأ إلى الأسرع:

  • يحتوي الحمض النووي الدائري المفتوح المقطوع على شريط واحد مقطوع.
  • يكون الحمض النووي الدائري المُرخى سليمًا تمامًا، حيث لا يكون أي من الشريطين مقطوعًا، ولكنه قد خضع لعملية إرخاء إنزيمية (إزالة الالتفافات الفائقة). ويمكن محاكاة ذلك بترك سلك تمديد ملتوي ينفك ويرتخي، ثم توصيله بنفسه.
  • يحتوي الحمض النووي الخطي على نهايات حرة، إما بسبب قطع كلا الشريطين أو لأن الحمض النووي كان خطيًا في الكائن الحي . ويمكن محاكاة ذلك باستخدام سلك تمديد كهربائي غير موصول بنفسه.
  • يكون الحمض النووي فائق الالتفاف (أو الدائري المغلق تساهميًا ) سليمًا تمامًا، حيث لا يكون أي من الشريطين مقطوعًا، ويحتوي على التواء متكامل، مما ينتج عنه شكل مضغوط. ويمكن محاكاة ذلك عن طريق لف سلك تمديد ثم توصيله بنفسه.
  • يشبه الحمض النووي المتفكك ذو الالتفاف الفائق الحمض النووي ذو الالتفاف الفائق ، ولكنه يحتوي على مناطق غير مزدوجة تجعله أقل كثافة قليلاً؛ ويمكن أن ينتج هذا عن القلوية المفرطة أثناء تحضير البلازميد.

تتناسب سرعة هجرة الأجزاء الخطية الصغيرة طرديًا مع الجهد الكهربائي المُطبق عند الفولتيات المنخفضة. أما عند الفولتيات العالية، فتهاجر الأجزاء الأكبر حجمًا بسرعات متزايدة باستمرار ولكنها متفاوتة. وبالتالي، تقل دقة الفصل في الهلام مع زيادة الجهد الكهربائي.

عند جهد منخفض محدد، يكون معدل هجرة شظايا الحمض النووي الخطية الصغيرة دالةً لطولها. أما الشظايا الخطية الكبيرة (أكثر من 20 كيلوبايت تقريبًا) فتهاجر بمعدل ثابت بغض النظر عن طولها. ويعود ذلك إلى أن الجزيئات "تتنفس"، حيث يتبع الجزء الأكبر من الجزيء الطرف الأمامي عبر مصفوفة الهلام. تُستخدم عمليات الهضم بالإنزيمات القاطعة بشكل متكرر لتحليل البلازميدات المنقاة. تعمل هذه الإنزيمات على كسر الحمض النووي تحديدًا عند تسلسلات قصيرة معينة. تشكل الشظايا الخطية الناتجة "حزمًا" بعد الفصل الكهربائي الهلامي . من الممكن تنقية بعض الشظايا عن طريق قص الحزم من الهلام وإذابة الهلام لتحرير شظايا الحمض النووي.

بسبب بنيته المحكمة، فإن الحمض النووي فائق الالتفاف ينتقل بشكل أسرع عبر الهلام مقارنة بالحمض النووي الخطي أو الدائري المفتوح.

برامج المعلوماتية الحيوية والتصميم

يدعم استخدام البلازميدات كتقنية في البيولوجيا الجزيئية برامج المعلوماتية الحيوية . تسجل هذه البرامج تسلسل الحمض النووي لناقلات البلازميد، وتساعد في التنبؤ بمواقع قطع إنزيمات التقييد ، وتخطيط عمليات المعالجة. من أمثلة حزم البرامج التي تتعامل مع خرائط البلازميد: ApE، و Clone Manager ، وGeneConstructionKit، وGeneious، و Genome Compiler ، وLabGenius، وLasergene، وMacVector ، وpDraw32، وSerial Cloner، وUGENE ، وVectorFriends، و Vector NTI ، وWebDSV. تساعد هذه البرامج في إجراء التجارب كاملةً على مستوى الحاسوب قبل إجراء التجارب العملية. [ 81 ]

مجموعات البلازميد

تم ابتكار العديد من البلازميدات على مر السنين، وقد أتاح الباحثون بعضها لقواعد بيانات البلازميدات، مثل مؤسستي Addgene و BCCM/GeneCorner غير الربحيتين . يمكن البحث عن البلازميدات وطلبها من هذه القواعد لأغراض البحث. كما يقوم الباحثون غالبًا بتحميل تسلسلات البلازميدات إلى قاعدة بيانات NCBI ، والتي يمكن من خلالها استرجاع تسلسلات بلازميدات محددة. بُذلت جهودٌ حثيثة لإنشاء قواعد بيانات مُدققة ومُراقبة الجودة من هذه التسلسلات المُحمّلة؛ ومن الأمثلة المبكرة على ذلك قاعدة بيانات Orlek et al [ 82 ] ، التي اقتصرت على بلازميدات Enterobacteriaceae ، بينما شملت قاعدة بيانات COMPASS أيضًا بلازميدات من أنواع أخرى من البكتيريا. وفي الآونة الأخيرة، تم إنشاء PLSDB [ 83 ] كقاعدة بيانات مُدققة ومُحدّثة لبلازميدات NCBI، وتحتوي اعتبارًا من عام 2024 على أكثر من 72000 مدخل [ 84 ] . وتُعد قاعدة بيانات pATLAS قاعدة بيانات مماثلة، تتضمن أيضًا أدوات تحليل مرئي لإظهار العلاقات بين البلازميدات. [ 85 ] تُعد قاعدة بيانات IMG/PR أكبر قاعدة بيانات للبلازميدات تم إنشاؤها من بيانات متاحة للجمهور، وهي لا تحتوي فقط على تسلسلات البلازميدات الكاملة المسترجعة من NCBI، بل تحتوي أيضًا على جينومات بلازميدية جديدة تم العثور عليها من الميتاجينومات والميتا ترانسكريبتومات. [ 86 ]

تم إنشاء مجموعات بيانات أخرى عن طريق تسلسل وحساب جينومات البلازميد من مجموعات بكتيرية موجودة مسبقًا، مثل مجموعة NORM [ 87 ] [ 88 ] ومجموعة Murray [ 89 ] [ 90 ] .

بالإضافة إلى المستودعات الأكاديمية وغير الربحية، يتم إنتاج الحمض النووي البلازميدي أيضًا على نطاق صناعي من قبل شركات التكنولوجيا الحيوية المتخصصة التي تدعم العلاج الجيني وتطوير المستحضرات الصيدلانية الحيوية، بما في ذلك Aldevron و Cobra Biologics و 3PBIOVIAN . [ 91 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ لويد جي إس، توماس سي إم (يوليو 2023). " مقدمة في علم الأحياء الدقيقة: منطق البلازميدات البكتيرية" . علم الأحياء الدقيقة . 169 (7): 001336. doi : 10.1099/mic.0.001336 . PMC 10433415. PMID 37395112 .  
  2. ↑ وانغ هـ، بنغ ن، شاه س أ، هوانغ ل، شي كيو (مارس 2015). "العناصر الوراثية خارج الكروموسومات في العتائق" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 79 (1): 117-152 . doi : 10.1128/MMBR.00042-14 . PMC 4402960. PMID 25694123 .  
  3. ↑ إيسر ك، كوك يو، لانغ-هينريش سي، ليمكه ب، أوسيفاكز إتش دي، ستال يو، وآخرون (1986). بلازميدات حقيقيات النوى: الأساسيات والتطبيقات . برلين: سبرينغر-فيرلاغ. ISBN  978-3-540-15798-4.
  4. ↑ ويكنر آر بي، هينيبوش إيه، لامبويتز إيه إم، غونسالوس آي سي، هولاندر إيه، محررو (1987). "بلازميدات الميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء". العناصر خارج الكروموسومات في حقيقيات النوى الدنيا . بوسطن، ماساتشوستس: سبرينغر الولايات المتحدة. الصفحات 81-146 . ISBN  978-1-4684-5251-8.
  5. 1 2 3 Smillie C، Garcillán-Barcia MP، Francia MV، Rocha EP، de la Cruz F (سبتمبر 2010). "تنقل البلازميدات" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 74 (3): 434-452 . دوى : 10.1128/MMBR.00020-10 . بمك 2937521 . بميد 20805406 .  
  6. 1 2 كاراتولي أ (أغسطس 2013). "البلازميدات وانتشار المقاومة". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة الطبية . عدد خاص: مقاومة المضادات الحيوية. 303 ( 6-7 ): 298-304 . doi : 10.1016/j.ijmm.2013.02.001 . PMID 23499304 . 
  7. 1 2 سان ميلان أ، ماكلين آر سي (22 سبتمبر 2017). باكيرو إف، بوزا إي، غوتيريز-فوينتيس جيه، كوك تي إم (محررون). " تكاليف لياقة البلازميدات: حد لانتقال البلازميدات" . ميكروبيولوجي سبيكتروم . 5 (5) 5.5.02. doi : 10.1128/microbiolspec.MTBP-0016-2017 . PMC 11687550. PMID 28944751 .  
  8. ↑ ساتي-سانتاماريا ز (17 أغسطس 2023). " خريطة عالمية للمستقلبات المتخصصة المشفرة في بلازميدات بدائيات النوى" . ميكروبيولوجي سبيكتروم . 11 (4) e01523-23: e0152323. doi : 10.1128/spectrum.01523-23 . PMC 10434180. PMID 37310275 .  
  9. ↑ بهات ب، بهانداري ج، بهات ك، مايثاني د، ميشرا س، جانجولا س، وآخرون . (أكتوبر 2021). "الهدم بوساطة البلازميد لإزالة المواد الغريبة من البيئة". مجلة المواد الخطرة . 420 126618. Bibcode : 2021JHzM..42026618B . doi : 10.1016/j.jhazmat.2021.126618 . PMID 34329102 .  
  10. ^ ساتي سانتاماريا زد، نافارو غوميز بي، مارتينيز مانسيبو جا، خواريز موغارزا إم، فلوريس أ، كانوسا الأول (25 يناير 2025). "إعادة الترتيب الجيني والأنواع في الاتحادات الميكروبية تؤثر على إمكانية التحلل البيولوجي" . مجلة ISME . 19 راف014. دوى : 10.1093/ismejo/wraf014 . بمك 11892951 . بميد 39861970 .  
  11. ↑ "GenBrick Gene Synthesis - Long DNA Sequences | GenScript" .
  12. ↑ "تخليق الجينات | IDT" . تقنيات الحمض النووي المتكاملة .
  13. ↑ "Invitrogen GeneArt Gene Synthesis" .
  14. ↑ سينكوفيتش ج، هورفاث ج، هوراك أ (1998). "أصل الفيروسات وتطورها (مراجعة)". مجلة Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica . 45 ( 3-4 ): 349-390 . PMID 9873943 . 
  15. ↑ توماس سي إم، سامرز دي (2008). "بلازميدات البكتيريا". موسوعة علوم الحياة . doi : 10.1002/9780470015902.a0000468.pub2 . ISBN 978-0-470-01617-6.
  16. ↑ ليدربيرغ ج (أكتوبر 1952). "علم الوراثة الخلوية والتكافل الوراثي". المراجعات الفسيولوجية . 32 (4): 403-430 . CiteSeerX 10.1.1.458.985 . doi : 10.1152/physrev.1952.32.4.403 . PMID 13003535 .  
  17. 1 2 3 هيلينسكي، د. ر. (ديسمبر 2022). كابر، ج. ب. (محرر). "نبذة تاريخية عن البلازميدات" . إيكوسال بلس . 10 (1) eESP-0028-2021: eESP00282021. doi : 10.1128/ecosalplus.ESP-0028-2021 . PMC 10729939. PMID 35373578 .  
  18. 1 2 3 4 هايز، ف. (2003). "الفصل 1 - وظيفة البلازميدات وتنظيمها" . في: كاسالي، ن.، وبريستو، أ. (محرران). نواقل بلازميد الإشريكية القولونية: الطرق والتطبيقات . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 235. دار هومانا للنشر. الصفحات 1-5 . ISBN   978-1-58829-151-6.
  19. ↑ فالكو إس. "علم الجينوم الميكروبي: الوقوف على أكتاف العمالقة" . جمعية علم الأحياء الدقيقة .
  20. 1 2 3 براون، ت. أ. (2010). "الفصل 2 - نواقل استنساخ الجينات: البلازميدات والباكتيريوفاجات" . استنساخ الجينات وتحليل الحمض النووي: مقدمة ( الطبعة السادسة). وايلي-بلاك ويل. ISBN  978-1-4051-8173-0.
  21. ↑ سميث سي، لي آر جيه، ديلاني إس، مورفي آر إيه، والش إف (أغسطس 2022). "التحليق في الأطواق: بلازميدات تجوب العالم تنشر أكثر من مجرد جينات مقاومة للمضادات الحيوية عبر مفهوم الصحة الواحدة" . علم الجينوم الميكروبي . 8 (8): 1-10 . doi : 10.1099/mgen.0.000858 . PMC 9484753. PMID 35960657 .  
  22. ↑ فوغارتي إي سي، وشيختر إم إس، ولولانز كيه، وشيهان إم إل، وفيسيلي آي، ومور آر إم، وآخرون (فبراير 2024). "البلازميد الخفي من بين أكثر العناصر الوراثية وفرةً في أمعاء الإنسان" . مجلة Cell . 187 (5): 1206–1222.e16. doi : 10.1016/ j.cell.2024.01.039 . PMC 10973873. PMID 38428395 .   
  23. ↑ نيكولوف هـ، هيورت ك، أندرسون دي آي، وانغ هـ (مايو 2024). "ثلاث آليات متزامنة تُولّد تباينًا في عدد نسخ الجينات ومقاومةً عابرةً للمضادات الحيوية" . نيتشر كوميونيكيشنز . 15 (1) 3981. Bibcode : 2024NatCo..15.3981N . doi : 10.1038/s41467-024-48233-0 . PMC 11087502. PMID 38730266 .  
  24. ↑ دموفسكي م، جاغورا-بوردزي ج (2013). "وظائف الصيانة النشطة والمستقرة في البلازميدات ذات العدد المنخفض من النسخ في البكتيريا موجبة الجرام، الجزء الأول: أنظمة التقسيم" . المجلة البولندية لعلم الأحياء الدقيقة . 62 (1): 3-16 . doi : 10.33073/pjm-2013-001 . PMID 23829072 . 
  25. ↑ ستيس إي، فانديبوت أو إم، الجزيري إم، هولسترز إم، فيريك دي (2011). "انقلاب بكتيري ناجح: كيف تعيد بكتيريا رودوكوكوس فاسكيانز توجيه نمو النبات". المراجعة السنوية لعلم أمراض النبات . 49 (1). المراجعات السنوية : 69-86 . Bibcode : 2011AnRvP..49...69S . doi : 10.1146/annurev-phyto-072910-095217 . PMID 21495844 . 
  26. ↑ كلارك دي بي، بازديرنيك إن جيه (2012). البيولوجيا الجزيئية ( الطبعة الثانية). أكاديميك سيل. ص 795. ISBN   978-0-12-378594-7.
  27. ↑ أودو إي، جاكوب إل (يناير 1998). "الانتقال الاقتراني لمقاومة الموبيروسين عالية المستوى وتعبئة البلازميدات غير الاقترانية في المكورات العنقودية الذهبية". مقاومة الأدوية الميكروبية . 4 (3): 185-193 . doi : 10.1089/mdr.1998.4.185 . PMID 9818970 . 
  28. ↑ رادنج إل، ريتشاردز إتش (يناير 1999). "الفصل 2: ​​تطوير نواقل البلازميد" . في سميث إم سي، سوكيت آر إي (محرران). الطرق الجينية للكائنات بدائية النواة المتنوعة . طرق في علم الأحياء الدقيقة. المجلد 29. دار النشر الأكاديمية. الصفحات 51-96 (75-77). ISBN   978-0-12-652340-9.
  29. ↑ "مقدمة في البلازميدات: أصل التضاعف" . addgene.org .
  30. ↑ جونسون تي جيه، نولان إل كيه (2009). تصنيف نسخ البلازميد . طرق في البيولوجيا الجزيئية (كليفتون، نيوجيرسي). المجلد 551. الصفحات 27-35 .  
  31. 1 2 كاراتولي أ، زانكاري إي، غارسيا-فرنانديز أ، فولدبي لارسن م، لوند أو، فيلا ل، وآخرون (2014). " الكشف والتصنيف الحاسوبي للبلازميدات باستخدام PlasmidFinder وتصنيف تسلسل البلازميد متعدد المواقع" . العوامل المضادة للميكروبات والعلاج الكيميائي . 58 (7): 3895-3903 . doi : 10.1128/AAC.02412-14 . PMC 4068535. PMID 24777092 .   
  32. 1 2 واتانابي تي، نيشيدا إتش، أوغاتا سي، أراي تي، ساتو إس (سبتمبر 1964). "نقل مقاومة الأدوية بوساطة الإبيسوم في البكتيريا المعوية. السابع. نوعان من عوامل المقاومة الطبيعية" . مجلة علم البكتيريا . 88 (3): 716-726 . doi : 10.1128/jb.88.3.716-726.1964 . PMC 277371. PMID 14208512 .  
  33. ↑ مينيل إي، داتا ن (فبراير 1966). "علاقة عوامل نقل المقاومة بعامل الجنس (F) في بكتيريا الإشريكية القولونية K12" . بحوث علم الوراثة . 7 (1): 134-140 . doi : 10.1017/S0016672300009538 . PMID 5324663 . 
  34. ↑ داتا ن (1977). "تصنيف البلازميدات كوسيلة مساعدة لفهم وبائيتها وتطورها". مجلة العلاج الكيميائي المضاد للميكروبات . 3 (ملحق ج): 19-23 . doi : 10.1093/jac/3.suppl_c.19 . PMID 599130 . 
  35. ↑ واتانابي ، ت. (1963). "الوراثة المعدية لمقاومة الأدوية المتعددة في البكتيريا" . مراجعات علم البكتيريا . 27 (1): 87-115 . doi : 10.1128/mmbr.27.1.87-115.1963 . PMC 441171. PMID 13999115 .  
  36. ↑ أندرسون إي إس، لويس إم جيه (نوفمبر 1965). "توصيف عامل نقل مرتبط بمقاومة الأدوية في السالمونيلا التيفية". مجلة نيتشر . 208 (5013): 843-849 . Bibcode : 1965Natur.208..843A . doi : 10.1038/208843a0 . PMID 5331112 . 
  37. ↑ كلارك دي بي، بازديرنيك إن جيه، ماكجيهي إم آر (2019). "مقدمة الطبعة الثالثة". البيولوجيا الجزيئية . الصفحات 13-14 . doi : 10.1016/b978-0-12-813288-3.00035-5 . ISBN  978-0-12-813288-3.
  38. ↑ Redondo-Salvo S، Bartomeus-Peñalver R، Vielva L، Tagg KA، Webb HE، Fernández-López R، وآخرون . (2021). "COPLA، المصنف التصنيفي للبلازميدات" . بي إم سي للمعلوماتية الحيوية . 22 (1) 390. دوى : 10.1186/s12859-021-04299-x . بمك 8325299 . بميد 34332528 .   
  39. ↑ روبرتسون ج، ناش ج (2018). " مجموعة برامج MOB: أدوات برمجية لتجميع وإعادة بناء وتصنيف البلازميدات من التجميعات الأولية" . علم الجينوم الميكروبي . 4 (8). doi : 10.1099/mgen.0.000206 . PMC 6159552. PMID 30052170 .  
  40. ↑ Arredondo-Alonso S، Gladstone RA، Pöntinen AK، Gama JA، Schürch AC، Lanza VF، et al. (2023). "مجموعة Mge: نهج خالي من المراجع لكتابة البلازميدات البكتيرية" . NAR الجينوم والمعلوماتية الحيوية . 5 (3) lqad066. دوى : 10.1093/نرجاب/lqad066 . بمك 10331934 . بميد 37435357 .   
  41. ↑ فرولوفا د، ليما ل، روبرتس ل.و، بونينكامبر ل، ويتلر ر، ستوي ج، وآخرون (2024). " تطبيق مسافات إعادة الترتيب لتمكين علم أوبئة البلازميد باستخدام pling" . علم الجينوم الميكروبي . 10 (10): 001300. doi : 10.1099/mgen.0.001300 . PMC 11472880. PMID 39401066 .   
  42. ↑ براون جي جي، فينيغان بي إم (يناير 1989). بلازميدات الحمض النووي الريبي . المجلة الدولية لعلم الخلايا . المجلد 117. الصفحات 1-56 . doi : 10.1016/s0074-7696(08)61333-9 . ISBN   978-0-12-364517-3PMID 2684889​​ 
  43. ↑ هاريسون، ب. و.، لور، ر. ب.، كيم، ن. ك.، يونغ، ج. ب. (أبريل 2010). "تقديم 'الكروميد' البكتيري: ليس كروموسومًا، وليس بلازميدًا". اتجاهات في علم الأحياء الدقيقة . 18 (4): 141-148 . doi : 10.1016/j.tim.2009.12.010 . PMID 20080407 . 
  44. ↑ برون م، شيندلر د، كيمتر ف س، وايلي م ر، تشيس ك، كوروليفا ج إ، وآخرون . (30 نوفمبر 2018). "وظائف منشأَي التضاعف في سلالات ضمة الكوليرا ذات الكروموسوم الواحد" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 9 2932. doi : 10.3389/fmicb.2018.02932 . PMC 6284228. PMID 30559732 .   
  45. 1 2 راسل دي دبليو، سامبروك جيه (2001). الاستنساخ الجزيئي: دليل المختبر . كولد سبرينغ هاربور، نيويورك: مختبر كولد سبرينغ هاربور.
  46. ↑ أوليفيرا، بي. إتش.، براذر، كيه. جيه.، برازيريس، دي. إم.، مونتيرو، جي. إيه. (أغسطس 2010). "تحليل تكرارات الحمض النووي في البلازميدات البكتيرية يكشف عن إمكانية حدوث أحداث عدم استقرار متكررة" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والتكنولوجيا الحيوية . 87 (6): 2157-2167 . doi : 10.1007/s00253-010-2671-7 . PMID 20496146. S2CID 19780633 .  
  47. ↑ غونسالفيس، جي. إيه.، أوليفيرا، بي. إتش.، غوميز، إيه. جي.، براذر، كيه. إل.، لويس، إل. إيه.، برازيريس، دي. إم.، وآخرون . (أغسطس 2014). "دليل على أن أحداث إدخال عنصر IS2 تميل نحو تحولات تركيبية مفاجئة في الحمض النووي المستهدف وتتأثر بمجموعة متنوعة من معايير الاستزراع". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والتكنولوجيا الحيوية . 98 (15): 6609-6619 . doi : 10.1007/s00253-014-5695-6 . hdl : 1721.1/104375 . PMID: 24769900. S2CID : 9826684 .   
  48. ↑ أوليفيرا، بي. إتش.، ومايرهوفر، ج. (سبتمبر 2013). "البلازميدات الخالية من العلامات للتطبيقات البيوتكنولوجية - الآثار والآفاق". اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 31 (9): 539-547 . doi : 10.1016/j.tibtech.2013.06.001 . PMID 23830144 . 
  49. ↑ أوليفيرا، بي. إتش.، براذر، كيه. جيه.، برازيريس، دي. إم.، مونتيرو، جي. إيه. (سبتمبر 2009). "عدم استقرار البنية الصيدلانية الحيوية البلازميدية: التحديات والآثار المترتبة". اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 27 (9): 503-511 . doi : 10.1016/j.tibtech.2009.06.004 . PMID 19656584 . 
  50. ↑ جيوغيجان، ت. (2002). "التطبيقات الجزيئية" . في: ستريبس، يو. إن.، وياسبين، ر. إي. (محرران). علم الوراثة الميكروبية الحديث ( الطبعة الثانية). وايلي-بلاك ويل. ص 248. ISBN   978-0-471-38665-0.
  51. ↑ بريستون أ (2003). "الفصل 2 - اختيار ناقل الاستنساخ" . في: كاسالي ن، بريستون أ (محرران). نواقل بلازميد الإشريكية القولونية: الطرق والتطبيقات . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 235. دار هومانا للنشر. الصفحات 19-26 . ISBN   978-1-58829-151-6.
  52. ↑ هايدورن تي، كامسوند دي، هوانغ إتش إتش، ليندبرغ بي، أوليفيرا بي، ستينسيو كيه، وآخرون (2011). "البيولوجيا التركيبية في البكتيريا الزرقاء". البيولوجيا التركيبية، الجزء أ . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 497. الصفحات 539-579 . doi : 10.1016/B978-0-12-385075-1.00024-X . ISBN    978-0-12-385075-1. PMID 21601103 . البلازميدات التكاملية هي في معظم الحالات نواقل انتحارية، أي نواقل غير قادرة على التكاثر في المضيف المستهدف، وبالتالي يجب أن تندمج أو تختفي، ومن ثم، يمكن استخدام أي بلازميد يمكن نقله بكفاءة إلى المتلقي. 
  53. ↑ كواندت ج، هاينز إم إف (مايو 1993). "نواقل انتحار متعددة الاستخدامات تسمح بالاختيار المباشر لاستبدال الجينات في البكتيريا سالبة الغرام". جين . 127 (1): 15-21 . doi : 10.1016/0378-1119(93)90611-6 . PMID 8486283 . 
  54. ↑ جويدل دي في، كلايد دي جي، بوليفار إف، هينيكر إتش إل، يانسورا دي جي، كريا آر، وآخرون . (يناير 1979). "التعبير في الإشريكية القولونية عن الجينات المركبة كيميائياً للأنسولين البشري" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 76 (1): 106–110 . بيب كود : 1979PNAS...76..106G . دوى : 10.1073/pnas.76.1.106 . بمك 382885 . بميد 85300 .   
  55. ^ جوفندر ك، نايكر تي، لين جي، بايجناث إس، شوتورجون AA، عبد إن إس، وآخرون . (ديسمبر 2020). "نهج التخليق الحيوي الجديد والأكثر كفاءة لإنتاج الأنسولين البشري في الإشريكية القولونية (E. coli)" . ايه ام بي اكسبريس . 10 (1): 43. دوى : 10.1186/s13568-020-00969-ث . بمك 7062966 . بميد 32152803 .   
  56. ^ Zieliński M، Romanik-Chruścielewska A، Mikiewicz D، Łukasiewicz N، Sokołowska I، Antosik J، وآخرون . (1 مايو 2019). "التعبير وتنقية الأنسولين البشري المؤتلف من سلالة E. coli 20" . التعبير عن البروتين وتنقيته . 157 : 63– 69. دوى : 10.1016/j.pep.2019.02.002 . بميد 30735706 .  
  57. ↑ كاندفيلو ك، تشاندراسيكاران س (2008). "البلازميدات للعلاج الجيني". البلازميدات: البحوث الحالية والاتجاهات المستقبلية . دار كايستر الأكاديمية للنشر. ISBN 978-1-904455-35-6.
  58. ↑ هيمرلينغ إف، بيل جيه (مايو 2022). "استراتيجيات للوصول إلى الابتكارات الحيوية في الجينومات البكتيرية لاكتشاف الأدوية". مجلة نيتشر ريفيوز. اكتشاف الأدوية . 21 (5): 359-378 . doi : 10.1038/s41573-022-00414-6 . PMID 35296832 . 
  59. ↑ ديفيز ج (يوليو 2013). "مستقلبات ميكروبية متخصصة: وظائفها وأصولها" . مجلة المضادات الحيوية . 66 (7): 361-364 . doi : 10.1038/ja.2013.61 . PMID 23756686 . 
  60. 1 2 Saati-Santamaría Z (أغسطس 2023). Rendueles O (محرر). "خريطة عالمية للمستقلبات المتخصصة المشفرة في بلازميدات بدائيات النوى" . Microbiology Spectrum . 11 (4) e01523-23: e0152323. doi : 10.1128/spectrum.01523-23 . PMC 10434180. PMID 37310275 .  
  61. ↑ أوكينو ن، لي م، كو كيو، ناكاغاوا ت، هاياشي ي، ماتسوموتو م، وآخرون . (يوليو 2020). " إنزيمان بكتيريان لتخليق غليكوسفينغوليبيد مسؤولان عن تخليق غلوكورونوسيل سيراميد وألفا-غالاكتوسيل سيراميد" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 295 (31): 10709-10725 . doi : 10.1074/jbc.RA120.013796 . PMC 7397116. PMID 32518167 .   
  62. ↑ مارا ب، جيلر-ماكغراث د، سوتر إي، تايلور جي تي، باتشياداكي إم جي، إدجكومب في بي (مايو 2024). " مجموعات جينات التخليق الحيوي المحمولة على البلازميدات ضمن عمود مائي بحري دائم التطبق" . الكائنات الدقيقة . 12 (5): 929. doi : 10.3390/microorganisms12050929 . PMC 11123730. PMID 38792759 .  
  63. ↑ مورانج م (ديسمبر 2009). "ما يخبرنا به التاريخ 19. مفهوم الإبيسوم". مجلة العلوم البيولوجية . 34 (6): 845-848 . doi : 10.1007/s12038-009-0098-z . PMID 20093737. S2CID 11367145 .  
  64. ^ Jacob F، Wollman EL (1958)، “Les épisomes، Elements génétiques ajoutés”، Comptes Rendus de l'Académie des Sciences de Paris ، 247 (1): 154–56 ، PMID 13561654 
  65. ↑ هايز، دبليو (1969). "ما هي الإبيسومات والبلازميدات؟" . في: وولستنهولم، جي إي، وأوكونور، إم (محرران). الإبيسومات والبلازميدات البكتيرية . ندوة مؤسسة سيبا. الصفحات 4-8 . ISBN  978-0-7000-1405-7.
  66. ↑ وولستنهولم، جي إي، وأوكونور، إم، محرران. (1969). الإبيسومات والبلازميدات البكتيرية . ندوة مؤسسة سيبا. الصفحات 244-245 . ISBN  978-0-7000-1405-7.
  67. ^ براون تا (2011). مقدمة في علم الوراثة: نهج جزيئي . علوم جارلاند. ص. 238. ردمك  978-0-8153-6509-9.
  68. ↑ فان كرايننبروك ك، فان هوناكر ب، هيغمان ج (سبتمبر 2000). "النواقل فوق الصبغية للتعبير الجيني في خلايا الثدييات". المجلة الأوروبية للكيمياء الحيوية . 267 (18): 5665-5678 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01645.x . PMID 10971576 . 
  69. ↑ كولوسيمو أ، غونز ك ك، هولمز أ ر، كونزيلمان ك، نوفيللي ج، مالون ر و، وآخرون . (أغسطس 2000). "نقل وتعبير الجينات الغريبة في خلايا الثدييات" (ملف PDF) . BioTechniques . 29 (2): 314-318 ، 320-322 ، 324 وما بعدها. doi : 10.2144/00292rv01 . PMID 10948433. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 24 يوليو 2011.  
  70. ↑ جيرديس ك، راسموسن ب ب، مولين س (مايو 1986). "نوع فريد من وظيفة صيانة البلازميد: قتل الخلايا الخالية من البلازميد بعد الانفصال" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 83 (10): 3116-3120 . Bibcode : 1986PNAS...83.3116G . doi : 10.1073 / pnas.83.10.3116 . PMC 323463. PMID 3517851 .  
  71. ↑ كرول ج، كلينتر س، شنايدر س، فوس إ، شتاينبوشل أ (نوفمبر 2010). "أنظمة إدمان البلازميد: وجهات نظر وتطبيقات في التكنولوجيا الحيوية" . التكنولوجيا الحيوية الميكروبية . 3 (6): 634-657 . doi : 10.1111/j.1751-7915.2010.00170.x . PMC 3815339. PMID 21255361 .  
  72. ↑ غونج ن، موراتا ك، ساكاغوتشي ك (يوليو 1982). "تحويل الخميرة Saccharomyces cerevisiae باستخدام بلازميدات قاتلة من الحمض النووي الخطي من Kluyveromyces lactis" . مجلة علم البكتيريا . 151 (1): 462-464 . doi : 10.1128/JB.151.1.462-464.1982 . PMC 220260. PMID 7045080 .  
  73. ↑ هاراجوتشي تي، كوجين تي، شيندو تي، بيلير إس، أوساكادا إتش، نيشيمورا كيه، وآخرون . (20 يناير 2022). "يتم دمج الحمض النووي البلازميدي المنقول في النواة عبر إعادة تشكيل الغلاف النووي في الطور النهائي" . مجلة كوميونيكيشنز بيولوجي . 5 (1): 78. doi : 10.1038/ s42003-022-03021-8 . PMC 8776997. PMID 35058555 .   
  74. ↑ تشان كيه إم، ليو واي تي، ما سي إتش، جايارام إم، ساو إس (يوليو 2013). "بلازميد 2 ميكرون من خميرة ساكاروميسيس سيريفيسيا: جينوم أناني مصغر ذو كفاءة وظيفية مُحسَّنة". بلازميد . 70 (1): 2-17 . doi : 10.1016/j.plasmid.2013.03.001 . PMID 23541845 . 
  75. 1 2 مالوري بي جيه، توليوس تي دبليو، بيار سي جي، غوستافسون جيه إيه، بوهاكزوك إس سي، دوبوكانين دي، وآخرون (2025). "مبادئ ونتائج وظيفية لتكوين الكروماتين البلازميدي في خلايا الثدييات". bioRxiv 10.1101/2025.05.27.656122 .  
  76. ↑ جيونغ إس دبليو، لودرديل جيه دي، شتاين إيه (20 ديسمبر 1991). "تجميع الكروماتين على الحمض النووي البلازميدي في المختبر. انتشار واضح لمحاذاة النيوكليوسومات من منطقة واحدة من pBR327 بواسطة الهيستون H5". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 222 (4): 1131-1147 . doi : 10.1016/0022-2836(91)90597-y . PMID 1662288 . 
  77. ↑ ملادينوفا ف، ملادينوف إي، روسيف ج (يناير 2009). "تنظيم الحمض النووي البلازميدي في تراكيب شبيهة بالنيوكليوسومات بعد نقله إلى الخلايا حقيقية النواة". التكنولوجيا الحيوية ومعدات التكنولوجيا الحيوية . 23 (1): 1044-1047 . doi : 10.1080/13102818.2009.10817609 .
  78. 1 2 غوالبرتو جيه إم، ميليشينا دي، واليت سي، نيازي إيه كيه، ويبر-لطفي إف، ديتريش إيه (مايو 2014). "جينوم الميتوكوندريا النباتية: ديناميكياته وصيانته". بيوشيمي . 100 : 107-120 . doi : 10.1016/j.biochi.2013.09.016 . PMID 24075874 . 
  79. ↑ باكيرت إس، مايسنر ك، بورنر تي (فبراير 1997). "الخصائص الفريدة للبلازميد mp1 ذي الدائرة المتدحرجة للميتوكوندريا من نبات الكينوا البيضاء (Chenopodium album (L.)" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 25 (3): 582-589 . doi : 10.1093/nar/25.3.582 . PMC 146482. PMID 9016599 .  
  80. ↑ هاندا هـ (يناير 2008). "البلازميدات الخطية في ميتوكوندريا النبات: تعايش سلمي أم غزو خبيث؟". ميتوكوندريون . 8 (1): 15-25 . doi : 10.1016/j.mito.2007.10.002 . PMID 18326073 . 
  81. ↑ "فيديو ملاحظات حول Vector NTI" . مختبر الحمض النووي .
  82. ↑ أورليك أ، فان هـ، شيبارد أ.إ، دوميث م، إلينغتون م، بيتو ت، وآخرون (يونيو 2017). "مجموعة بيانات مُنسقة من بلازميدات كاملة لبكتيريا الأمعاء، مُجمّعة من قاعدة بيانات النيوكليوتيدات التابعة للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية" . بيانات موجزة . 12 : 423-426 . رمز Bibcode : 2017DIB....12..423O . doi : 10.1016/j.dib.2017.04.024 . PMC 5426034. PMID 28516137 .   
  83. ↑ شمارتز جي بي، هارتونغ أ، هيرش ب، كيرن ف، فيلمان ت، مولر ر، وآخرون . (7 يناير 2022). "PLSDB: تطوير قاعدة بيانات شاملة للبلازميدات البكتيرية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 50 (D1): D273– D278 . doi : 10.1093/nar/gkab1111 . PMC 8728149. PMID 34850116 .   
  84. ↑ مولانو إل إيه، هيرش بي، هانيغ إم، مولر آر، كيلر إيه (6 يناير 2025). "تحديث PLSDB 2025: شروح محسّنة ووظائف مُطوّرة لأبحاث البلازميدات الشاملة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 53 (D1): D189– D196 . doi : 10.1093/nar/gkae1095 . PMC 11701622. PMID 39565221 .  
  85. ^ Jesus TF، Ribeiro-Gonçalves B، Silva DN، Bortolaia V، Ramirez M، Carriço JA (8 يناير 2019). "أطلس البلازميد: التحليلات البصرية البلازميدية وتحديد الهوية في بيانات التسلسل عالية الإنتاجية" . أبحاث الأحماض النووية . 47 (د1): د188 – د194. دوى : 10.1093/نار/gky1073 . بمك 6323984 . بميد 30395323 .  
  86. ↑ كامارغو إيه بي، كال إل، روكس إس، نايفاش إس، هانتمان إم، بالانيابان كيه، وآخرون . (5 يناير 2024). "IMG/PR: قاعدة بيانات للبلازميدات من الجينومات والميتاجينومات مع شروح وبيانات وصفية غنية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 52 (D1): D164– D173 . doi : 10.1093/nar/gkad964 . PMC 10767988. PMID 37930866 .   
  87. ↑ غلادستون وآخرون (1 يوليو 2021). "ظهور وانتشار مقاومة المضادات الحيوية في بكتيريا الإشريكية القولونية المسببة لعدوى مجرى الدم في النرويج خلال الفترة 2002-2017: دراسة جينومية سكانية ميكروبية طولية على مستوى الدولة" . مجلة لانسيت للميكروبات . 2 (7): e331– e341. doi : 10.1016 / S2666-5247(21)00031-8 . PMC 7614948. PMID 35544167 .   
  88. ↑ أريدوندو-ألونسو إس، بونتينن أك، جاما جا، جلادستون RA، هارمز ك، تونكين هيل جي، وآخرون . (2024). “استراتيجيات يحركها البلازميد لنجاح الاستنساخ في الإشريكية القولونية ”. BioRxiv 10.1101/2023.10.14.562336 .  
  89. ↑ بيكر كيه إس، بورنيت إي، ماكجريجور إتش، ديهير-جراهام إيه، بوينيت سي، لانجريدج جي سي، وآخرون . (ديسمبر 2015). " مجموعة موراي من البكتيريا المعوية قبل عصر المضادات الحيوية: مورد بحثي فريد" . طب الجينوم . 7 (1): 97. doi : 10.1186/s13073-015-0222-7 (غير نشط في 1 يوليو 2025). PMC 4584482. PMID 26411565 .   {{cite journal}}: صيانة CS1: رقم التعريف الرقمي غير نشط اعتبارًا من يوليو 2025 ( رابط )
  90. ↑ كازاريس أ، فيغيروا و، كازاريس د، ليما ل، تورنبول جيه دي، ماكجريجور هـ، وآخرون (2024). "ما قبل وما بعد عصر المضادات الحيوية: رؤى حول الانتشار التاريخي لمقاومة مضادات الميكروبات". bioRxiv 10.1101/2024.09.03.610986 .  
  91. ↑ "شركة 3PBIOVIAN توسع قدراتها في تصنيع الحمض النووي البلازميدي" . فيرس بيوتك . تم الاطلاع عليه بتاريخ 5 مارس 2026 .

للمزيد من القراءة

أعمال عامة

  • كلاين دي دبليو، بريسكوت إل إم، هارلي جيه (1999). علم الأحياء الدقيقة . بوسطن: دبليو سي بي/ماكجرو هيل.
  • موات إيه جي، فوستر جيه دبليو، سبيكتور إم بي (2002). علم وظائف الأعضاء الميكروبية . وايلي-ليس. ISBN 978-0-471-39483-9.
  • سميث، سي يو (2002). "الفصل 5: التلاعب بالجزيئات الحيوية" . عناصر علم الأحياء العصبي الجزيئي (  الطبعة الثالثة). تشيتشستر، غرب ساسكس، إنجلترا: وايلي. الصفحات 101-111 . ISBN  978-0-470-85717-5.

الإبيسومات