بنية حلزونية-حلقية-حلزونية أساسية

يُعدّ تركيب اللولب -الحلقة-اللولب الأساسي ( bHLH ) نمطًا بنيويًا بروتينيًا يُميّز إحدى أكبر عائلات عوامل النسخ الثنائية . ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]} لا تشير كلمة "أساسي" إلى التعقيد، بل إلى التركيب الكيميائي لهذا النمط، لأن عوامل النسخ عمومًا تحتوي على بقايا أحماض أمينية أساسية لتسهيل ارتباطها بالحمض النووي . ^{[ 6 ]}

تُعدّ عوامل النسخ bHLH مهمة في كثير من الأحيان في النمو أو نشاط الخلايا. فعلى سبيل المثال، يُعتبر BMAL1-Clock (المعروف أيضًا باسم ARNTL ) مُركّب نسخ أساسي في الساعة البيولوجية الجزيئية. كما رُبطت جينات أخرى، مثل c-Myc و HIF-1 ، بالسرطان نظرًا لتأثيرها على نمو الخلايا واستقلابها.

يتميز هذا النمط بوجود حلزونين ألفا متصلين بحلقة . عمومًا، تكون عوامل النسخ (بما في ذلك هذا النوع) ثنائية ، حيث يحتوي كل حلزون على بقايا أحماض أمينية قاعدية تُسهّل ارتباط الحمض النووي . ^{[ 6 ]} عادةً ما يكون أحد الحلزونين أصغر حجمًا، وبفضل مرونة هذه الحلقة، يسمح بتكوين ثنائي من خلال الطي والتراص مقابل الحلزون الآخر. يحتوي الحلزون الأكبر عادةً على مناطق ارتباط الحمض النووي. ترتبط بروتينات bHLH عادةً بتسلسل توافقي يُسمى صندوق E ، وهو CANNTG. ^{[ 7 ]} صندوق E المتعارف عليه هو CACGTG ( متناظر )، ومع ذلك، ترتبط بعض عوامل النسخ bHLH، ولا سيما تلك التابعة لعائلة bHLH- PAS ، بتسلسلات غير متناظرة ذات صلة، تشبه صندوق E. قد تُكوّن عوامل النسخ bHLH ثنائيات متجانسة أو غير متجانسة مع عوامل نسخ bHLH أخرى، مُشكّلةً مجموعة واسعة من الثنائيات، لكل منها وظائف محددة. ^{[ 8 ]}

أشارت دراسة تحليلية للتطور السلالي إلى أن بروتينات bHLH تنقسم إلى ست مجموعات رئيسية، يُشار إليها بالأحرف من A إلى F. ^{[ 9 ]} ومن أمثلة عوامل النسخ التي تحتوي على bHLH ما يلي:

نظرًا لأن العديد من عوامل النسخ bHLH ثنائية الوحدات الفرعية، ^{[ 8 ]} فإن نشاطها غالبًا ما يُنظَّم بدقة من خلال ازدواج الوحدات الفرعية. غالبًا ما يُتحكَّم في تعبير إحدى الوحدات الفرعية أو توافرها، بينما تُعبَّر الوحدة الفرعية الأخرى بشكلٍ دائم. تمتلك العديد من البروتينات التنظيمية المعروفة، مثل بروتين extramacrochaetae في ذبابة الفاكهة ، بنية حلزونية-حلقية-حلزونية، لكنها تفتقر إلى المنطقة القاعدية، مما يجعلها غير قادرة على الارتباط بالحمض النووي DNA بمفردها. ومع ذلك، فهي قادرة على تكوين ثنائيات غير متجانسة مع البروتينات التي تمتلك بنية bHLH، مما يُعطِّل قدراتها كعوامل نسخ. ^{[ 10 ]}

• في عام 1989، أظهر مور وآخرون أن ثنائيات بروتينات bHLH المختلفة ترتبط بنمط DNA قصير (يُسمى لاحقًا صندوق E ). ^{[ 11 ]} يتكون صندوق E هذا من تسلسل DNA المسمى CANNTG، حيث يمكن أن يكون N أي نيوكليوتيد . ^{[ 7 ]}
• 1994: قامت مجموعتا هاريسون ^{[ 12 ]} وبابو ^{[ 13 ]} بتبلور بروتينات bHLH المرتبطة بصناديق E، مما يدل على أن حلقة الزخرفة المتوازية المكونة من 4 حلزونات توجه التسلسلات الأساسية للتفاعل مع النيوكليوتيدات المحددة في الأخدود الرئيسي لصندوق E.
• 1994: حدد وارتون وآخرون صناديق E غير المتماثلة المرتبطة بمجموعة فرعية من بروتينات bHLH ذات نطاقات PAS (بروتينات bHLH-PAS)، بما في ذلك Single-minded (Sim) ومستقبل الهيدروكربون العطري. ^{[ 14 ]}
• 1995: حددت مجموعة سيمينزا عامل نقص الأكسجين القابل للتحفيز (HIF) على أنه ثنائي غير متجانس bHLH-PAS يرتبط بصندوق E غير متماثل ذي صلة. ^{[ 15 ]}
• في عام 2009، حدد غروف ودي ماسي وآخرون أنماطًا جديدة قصيرة من الحمض النووي، ترتبط بها مجموعة فرعية من بروتينات bHLH، والتي أطلقوا عليها اسم "تسلسلات شبيهة بصندوق E". تأتي هذه التسلسلات على شكل CAYRMK، حيث يرمز Y إلى C أو T، وR إلى A أو G، وM إلى A أو C، وK إلى G أو T. ^{[ 16 ]}

AHR ؛ AHRR ؛ ARNT ؛ ARNT2 ؛ ARNTL ؛ ARNTL2 ؛ ASCL1 ؛ ASCL2 ؛ ASCL3 ؛ ASCL4 ؛ ATOH1 ؛ ATOH7 ؛ ATOH8 ؛ BHLHB2 ؛ BHLHB3 ؛ BHLHB4 ؛ BHLHB5 ؛ BHLHB8 ؛ CLOCK ؛ EPAS1 ؛ FERD3L ؛ FIGLA ؛ HAND1 ؛ HAND2 ؛ HES1 ؛ HES2 ؛ HES3 ؛ HES4 ؛ HES5 ؛ HES6 ؛ HES7 ؛ HEY1 ؛ HEY2 ؛ HIF1A ؛ ID1 ؛ ID2 ؛ ID3 ؛ ID4 ؛ KIAA2018 ؛ LYL1 ؛ MASH1 ؛ MATH2 ؛ MAX ؛ MESP1 ؛ MESP2 ؛ MIST1 ؛ MITF ؛ MLX ؛ MLXIP ؛ MLXIPL ؛ MNT ؛ MSC ؛ MSGN1 ؛ MXD1 ؛ MXD3 ؛ MXD4 ؛ MXI1 ؛ MYC ؛ MYCL1 ؛ MYCL2 ؛ MYCN ؛ MYF5 ؛ MYF6 ؛ MYOD1 ؛ MYOG ؛ NCOA1 ؛ NCOA3 ؛ NEUROD1 ؛ NEUROD2 ؛ NEUROD4 ؛ NEUROD6 ؛ NEUROG1 ؛ NEUROG2 ؛ NEUROG3 ؛ NHLH1 ؛ NHLH2 ؛ NPAS1 ؛ NPAS2 ؛ NPAS3 ؛ NPAS4 ؛ OAF1 ؛ OLIG1 ؛ OLIG2 ؛ OLIG3 ؛ PTF1A ؛ SCL ؛ SCXB ؛ SIM1 ؛ SIM2 ؛ SOHLH1 ؛ SOHLH2 ؛ SREBF1 ؛ SREBF2 ؛ TAL1 ؛ TAL2 ؛ TCF12 ؛ TCF15 ؛ TCF21 ؛ TCF3 ؛ TCF4 ؛ TCFL5 ؛ TFAP4 ؛ TFE3 ؛ TFEB ؛ TFEC ؛ TWIST1 ؛ TWIST2 ؛ USF1 ؛ USF2 .

• عوامل النسخ الأساسية ذات بنية اللولب-الحلقة-اللولب الليوسينية

• PDOC00038 في PROSITE
• عوامل النسخ الأساسية ذات بنية اللولب-الحلقة-اللولب في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) بالمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
• عائلة bHLH مؤرشفة بتاريخ 22 أبريل 2016 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine) ضمن قاعدة بيانات عوامل النسخ النباتية (PlantTFDB).