تضفير البروتين

تُعدّ عملية ربط البروتينات تفاعلاً جزيئياً داخلياً لبروتين معين، حيث يُزال جزء بروتيني داخلي (يُسمى الإنتين) من بروتين طليعي، مع ربط بروتينين خارجيين (يُسميان الإكستين ) من كلا الطرفين (C و N ). يتكون موضع الربط في البروتين الطليعي بشكل أساسي من السيستين أو السيرين ، وهما حمضان أمينيان يحتويان على سلسلة جانبية محبة للنواة . لا تتطلب تفاعلات ربط البروتينات المعروفة حالياً عوامل مساعدة خارجية أو مصادر طاقة مثل الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP) أو الجوانوزين ثلاثي الفوسفات (GTP). عادةً، يرتبط الربط فقط بربط ما قبل mRNA . يحتوي هذا البروتين الطليعي على ثلاثة أجزاء: إكستين N، يليه الإنتين، ثم إكستين C. بعد اكتمال الربط، يحتوي البروتين الناتج على الإكستين N المرتبط بالإكستين C. يُطلق على هذا المنتج الناتج عن عملية الربط أيضًا اسم الإكستين.
تاريخ
اكتُشف أول إنتين عام 1988 من خلال مقارنة تسلسل جين ATPase الفجوي في فطر Neurospora crassa [ 1 ] والجزر [ 2 ] (بدون إنتين) مع الجين المماثل في الخميرة (مع إنتين) الذي وُصف لأول مرة بأنه ناقل محتمل لأيونات الكالسيوم . [ 3 ] في عام 1990، أثبت هيراتا وآخرون [ 4 ] أن التسلسل الإضافي في جين الخميرة يُنسخ إلى mRNA ولا ينفصل عن البروتين المضيف إلا بعد الترجمة. ومنذ ذلك الحين، وُجدت الإنتينات في جميع نطاقات الحياة الثلاثة ( حقيقيات النوى ، والبكتيريا ، والعتائق ) وفي الفيروسات .
كان تضفير البروتين أمرًا غير متوقع، وقد اكتشفت مجموعتان بحثيتان (أنراكو [ 5 ] وستيفنز [ 6 ] ) آلياته في عام 1990. اكتشفت كلتاهما بروتين VMA1 من خميرة Saccharomyces cerevisiae في طليعة إنزيم H + -ATPase الفجوي . تطابق تسلسل الأحماض الأمينية في الطرفين الأميني والكربوكسيلي مع 70% من تسلسل الحمض النووي لإنزيم H + -ATPase الفجوي من كائنات حية أخرى، بينما تطابق تسلسل الأحماض الأمينية في الموقع المركزي مع 30% من إجمالي تسلسل الحمض النووي لإنزيم HO النيوكلياز في الخميرة .
تحتوي العديد من الجينات على أجزاء ترميزية للإنترين غير مرتبطة ببعضها البعض، مُدرجة في مواقع مختلفة. لهذه الأسباب وغيرها، تُسمى الإنتينات (أو بالأحرى، أجزاء الجينات التي تُرمز للإنترينات) أحيانًا بالعناصر الجينية الأنانية ، ولكن قد يكون من الأدق تسميتها بالعناصر الطفيلية . وفقًا للنظرة التطورية التي تتمحور حول الجينات، فإن معظم الجينات "أنانية" فقط من حيث التنافس مع جينات أو أليلات أخرى ، ولكنها عادةً ما تؤدي وظيفةً للكائنات الحية، في حين أن "العناصر الجينية الطفيلية"، على الأقل في البداية، لا تُساهم بشكل إيجابي في لياقة الكائن الحي. [ 7 ] [ 8 ]
اعتبارًا من ديسمبر 2019، احتوت قاعدة بيانات UniProtKB على 188 مدخلًا مُصنَّفًا يدويًا على أنه إنتينات، تتراوح أطوالها من عشرات الأحماض الأمينية إلى آلافها. [ 9 ] عُثر على أول إنتين مُشفَّرًا ضمن جين VMA في خميرة Saccharomyces cerevisiae . لاحقًا، وُجدت هذه الإنتينات في الفطريات ( الفطريات الزقية ، والفطريات البازيدية ، والفطريات الزيجوميسيتية ، والفطريات الكيتريدية ) وفي بروتينات متنوعة أيضًا. وُصِف بروتين ذو صلة بعيدة بالبروتينات المعروفة التي تحتوي على إنتينات، ولكنه وثيق الصلة ببروتينات القنفذ في الحيوانات متعددة الخلايا، بأنه يحمل تسلسل الإنتين من شعبة Glomeromycota . تحتوي العديد من الإنتينات الموصوفة حديثًا على إنزيمات نووية داخلية موجهة ، ويبدو أن بعضها نشط. [ 10 ] يشير وفرة الإنتينات في الفطريات إلى انتقال أفقي للجينات الحاملة لها. بينما يوجد في البكتيريا الحقيقية والعتائق 289 و182 إنتينًا معروفًا حاليًا على التوالي. ليس من المستغرب أن معظم الإنتين في البكتيريا الحقيقية والعتائق يتم إدخالها في بروتين استقلاب الأحماض النووية، مثل الفطريات. [ 10 ]
تتنوع الإنتينات بشكل كبير، ولكن العديد من البروتينات الحاوية على الإنتينات نفسها موجودة في عدد من الأنواع. على سبيل المثال، يحتوي بروتين عامل معالجة ما قبل mRNA 8 (Prp8)، وهو بروتين أساسي في الجسيم الرابط ، على سبعة مواقع إدخال إنتين مختلفة عبر أنواع حقيقيات النوى. [ 11 ] يوجد Prp8 الحاوي على الإنتينات بشكل شائع في الفطريات، ولكنه يُلاحظ أيضًا في الأميبوزوا ، والطحالب الخضراء ، والكابساسبورا ، والتشوانوفلاجيليدا . تحتوي العديد من المتفطرات على إنتينات ضمن DnaB (إنزيم الهيليكاز التضاعفي البكتيري)، و RecA (إنزيم إعادة تركيب الحمض النووي البكتيري)، وSufB ( بروتين تجميع عناقيد الحديد والكبريت ). [ 12 ] [ 13 ] يوجد تنوع ملحوظ في بنية وعدد إنتينات DnaB، سواء داخل جنس المتفطرات أو خارجه. ومن المثير للاهتمام أن بروتين DnaB المحتوي على الإنتين موجود أيضًا في بلاستيدات الطحالب الخضراء. [ 14 ] تشمل البروتينات المحتوية على الإنتين الموجودة في العتائق RadA (المماثل لـ RecA)، وRFC، وPolB، وRNR. [ 15 ] يوجد العديد من البروتينات المحتوية على الإنتين نفسها (أو نظائرها) في نطاقين أو حتى في جميع نطاقات الحياة الثلاثة. كما تُلاحظ الإنتينات في البروتينات المشفرة بواسطة العاثيات والفيروسات حقيقية النواة. ربما تكون الفيروسات قد لعبت دورًا كناقلات لتوزيع الإنتين عبر مجموعة واسعة من الكائنات الحية المحتوية على الإنتين. [ 15 ]
الآلية
تبدأ عملية تكوين الإنتينات من الفئة الأولى بانتقال NO أو NS، حيث تهاجم السلسلة الجانبية لأول حمض أميني ( سيرين ، ثريونين ، أو سيستين ) في جزء الإنتين من البروتين الطليعي، رابطة الببتيد للحمض الأميني المجاور له مباشرةً (أي آخر حمض أميني في الإكستين N)، لتكوين وسيط إستري خطي (أو ثيوإستر ). يحدث تبادل إستري عندما تهاجم السلسلة الجانبية لأول حمض أميني في الإكستين C الإستر (أو الثيوإستر) المتكون حديثًا لتحرير الطرف الأميني للإنتين. ينتج عن ذلك وسيط متفرع يرتبط فيه الإكستين N والإكستين C، وإن لم يكن ذلك عبر رابطة ببتيدية. آخر بقايا الإنتين هي دائمًا الأسباراجين (Asn)، وتقوم ذرة النيتروجين الأميدية في هذه السلسلة الجانبية بفصل الرابطة الببتيدية بين الإنتين والإكستين C، مما ينتج عنه جزء إنتين حر ذو إيميد حلقي طرفي . أخيرًا، تهاجم مجموعة الأمين الحرة في الإكستين C رابطة (ثيو)إستر التي تربط الإكستين N والإكستين C معًا. ينتج عن تحول ON أو SN رابطة ببتيدية وبروتين وظيفي مرتبط . [ 16 ]
لا تحتوي الإنتينات من الفئة الثانية على سلسلة جانبية أولى محبة للنواة، بل تحتوي فقط على ألانين. وبدلاً من ذلك، يبدأ التفاعل مباشرةً بإزاحة محبة للنواة، حيث يهاجم أول حمض أميني في الإكستين C مجموعة الكربوكسيل الببتيدية على آخر حمض أميني في الإكستين N. ويستمر التفاعل كالمعتاد، بدءًا بتحول الأسباراجين إلى إيميد حلقي. [ 17 ]
لا تحتوي الإنتينات من الفئة 3 على سلسلة جانبية أولى محبة للنواة، بل على ألانين فقط، ومع ذلك فهي تحتوي على وحدة "WCT" داخلية غير متصلة. يهاجم بقايا السيستين الداخلي (C) مجموعة الكربوكسيل الببتيدية على البقايا الأخيرة من الإكستين N (إزاحة محبة للنواة). تحدث عملية تبادل الأسترة عندما يهاجم البقايا الأول من الإكستين C رابطة الثيوإستر المتكونة حديثًا. وتستمر بقية العملية كالمعتاد. [ 18 ]
إن آلية تأثير الربط هي تشابه طبيعي مع تقنية توليد البروتينات متوسطة الحجم كيميائياً والتي تسمى الربط الكيميائي الأصلي .
إنترين
الإنتين هو جزء من البروتين قادر على استئصال نفسه وربط الأجزاء المتبقية ( الإكستينات ) برابطة ببتيدية أثناء عملية ربط البروتين. [ 19 ] وقد أطلق على الإنتينات أيضًا اسم إنترونات البروتين ، قياسًا على إنترونات الحمض النووي الريبي (RNA) .

اصطلاحات التسمية
يُستمد الجزء الأول من اسم الإنتين من الاسم العلمي للكائن الحي الذي يوجد فيه، بينما يُستمد الجزء الثاني من اسم الجين أو الإكستين المقابل. على سبيل المثال، يُطلق على الإنتين الموجود في بكتيريا Thermoplasma acidophilum والمرتبط بالوحدة الفرعية A من إنزيم ATPase الفجوي (VMA) اسم "Tac VMA".
عادةً، كما في هذا المثال، تكفي ثلاثة أحرف فقط لتحديد الكائن الحي، ولكن توجد اختلافات. على سبيل المثال، يمكن إضافة أحرف إضافية للإشارة إلى سلالة. إذا تم ترميز أكثر من إنترين واحد في الجين المقابل، تُعطى الإنتينات لاحقة رقمية تبدأ من 5 ′ إلى 3 ′ أو حسب ترتيب تعريفها (على سبيل المثال، "Msm dnaB-1").
يُطلق عادةً على جزء الجين الذي يُشفّر الإنتين نفس اسم الإنتين نفسه، ولكن لتجنب الالتباس، يُكتب اسم الإنتين عادةً بحرف كبير ( مثل : Pfu RIR1-1)، بينما يُكتب اسم جزء الجين المقابل بخط مائل ( مثل : Pfu rir1-1 ). وهناك اصطلاح آخر لتوضيح الأسماء، وهو وضع حرف "i" صغير بعد اسم البروتين المصدر، مثل : Msm DnaBi1. [ 20 ]
أنواع الإنتينات
يمكن تصنيف الإنتينات بناءً على العديد من المعايير.
- بناءً على كيفية انفصالها الذاتي، يمكن تصنيفها إلى نوعين: الانفصال الذاتي (أي الانفصال الذاتي) والانفصال الخارجي (أي الحاجة إلى مساعدة خارجية). معظم الإنتينات المدروسة هي من نوع الانفصال الذاتي. أما الإنتينات المنقسمة (انظر أدناه) فتتضمن عادةً نصفين يساعد كل منهما الآخر، لذا فهي من نوع الانفصال الخارجي . [ 17 ]
- يعتمد ذلك على ما إذا كانت تحتوي على نطاق الإندونوكلياز. يُطلق على تلك التي تحتوي على نطاق الإندونوكلياز اسم "ماكسي-إنتين"، وإلا تُسمى "ميني-إنتين". [ 17 ]
- استنادًا إلى آلية التضفير، التي يمكن استنتاجها جزئيًا [ 18 ] من التسلسل، يُعد الإنتين من الفئة 1 النوع الأكثر دراسة، ويتميز بوجود السيستين أو السيرين كأول حمض أميني. أما الإنتين من الفئة 2، أو "إنتين الألانين"، فيحتوي على الألانين كأول حمض أميني ولا يحتوي على وحدة WCT. بينما يحتوي الإنتين من الفئة 3 على الألانين كأول حمض أميني ووحدة WCT غير متصلة. [ 17 ] وقد اقتُرح أيضًا تصنيف الإنتينات التي تبدأ بالسيرين وتحتوي على وحدة WCT ضمن الفئة 3. [ 18 ]
وجبات كاملة ووجبات صغيرة
قد تحتوي الإنتينات على نطاق جين إندونوكلياز موجه (HEG) بالإضافة إلى نطاقات التضفير. هذا النطاق مسؤول عن انتشار الإنتين عن طريق قطع الحمض النووي عند أليل خالٍ من الإنتين على الكروموسوم المتماثل ، مما يحفز نظام إصلاح انقطاع الحمض النووي المزدوج (DSBR)، الذي يقوم بدوره بإصلاح الانقطاع، وبالتالي نسخ الحمض النووي المشفر للإنتين إلى موقع كان خاليًا منه سابقًا. [ 17 ] نطاق HEG ليس ضروريًا لتضفير الإنتين، لذا يمكن فقدانه، مما يؤدي إلى تكوين إنتين مصغر . وقد أظهرت العديد من الدراسات الطبيعة التركيبية للإنتينات من خلال إضافة أو إزالة نطاقات HEG وتحديد نشاط التركيب الجديد.
الإنزيم المنفصل
أحيانًا، يأتي الإنتين الخاص بالبروتين الطليعي من جينين. في هذه الحالة، يُطلق على الإنتين اسم الإنتين المنقسم . على سبيل المثال، في البكتيريا الزرقاء ، يُشفّر DnaE ، الوحدة الفرعية المحفزة α لبوليميراز الحمض النووي III ، بواسطة جينين منفصلين، هما dnaE-n و dnaE-c . يتكون ناتج dnaE-n من تسلسل إكستين N متبوعًا بتسلسل إنتين مكون من 123 حمضًا أمينيًا، بينما يتكون ناتج dnaE-c من تسلسل إنتين مكون من 36 حمضًا أمينيًا متبوعًا بتسلسل إكستين C. [ 21 ]
تطبيقات في مجال التكنولوجيا الحيوية
تُعدّ الإنتينات فعّالة للغاية في عملية ربط البروتينات، ولذا فقد لعبت دورًا هامًا في مجال التقنية الحيوية . تمّ تحديد أكثر من 200 نوع من الإنتينات حتى الآن، وتتراوح أحجامها بين 100 و 800 حمض أميني . وقد تمّ هندسة الإنتينات لتطبيقات مُحدّدة، مثل التخليق الجزئي للبروتينات [ 22 ] والوسم الانتقائي لقطاعات البروتين، وهو أمرٌ مفيدٌ لدراسات الرنين المغناطيسي النووي للبروتينات الكبيرة. [ 23 ]
قد يكون التثبيط الدوائي لاستئصال الإنتين أداة مفيدة لتطوير الأدوية ؛ فالبروتين الذي يحتوي على الإنتين لن يقوم بوظيفته الطبيعية إذا لم يتم استئصال الإنتين، لأن بنيته ستتعطل.
لقد اقتُرح أن تكون الإنتينات مفيدة لتحقيق التعبير غير الطبيعي لبعض البروتينات شديدة الكراهية للماء ، والتي تُشفَّر عادةً بواسطة جينوم الميتوكوندريا ، على سبيل المثال في العلاج الجيني . [ 24 ] تُشكل كراهية الماء لهذه البروتينات عائقًا أمام دخولها إلى الميتوكوندريا. لذلك، قد يسمح إدخال إنتين غير كاره للماء بإتمام هذا الدخول. ثم يؤدي استئصال الإنتين بعد الدخول إلى استعادة البروتين إلى حالته الطبيعية .
تُستخدم علامات التقارب على نطاق واسع لتنقية البروتينات المُعاد تركيبها، إذ تسمح بتراكم البروتين المُعاد تركيبه مع الحد الأدنى من الشوائب. مع ذلك، يجب إزالة علامة التقارب بواسطة البروتيازات في خطوة التنقية النهائية. تُثير خطوة التحلل البروتيني الإضافية مشكلات تتعلق بخصوصية البروتياز في إزالة علامات التقارب من البروتين المُعاد تركيبه، وإزالة ناتج الهضم. يُمكن تجنب هذه المشكلة عن طريق دمج علامة التقارب مع الإنتينات ذاتية الانقسام في بيئة مُحكمة. استخدم الجيل الأول من نواقل التعبير من هذا النوع إنتين VMA المُعدَّل من خميرة Saccharomyces cerevisiae (Sce VMA). استخدم تشونغ وآخرون [ 25 ] نطاق ربط الكيتين (CBD) من بكتيريا Bacillus circulans كعلامة تقارب، ودمجوا هذه العلامة مع إنتين Sce VMA المُعدَّل. يخضع الإنتين المُعدَّل لتفاعل انشطار ذاتي عند رابطة الببتيد الطرفية N مع 1،4-دايثيوثريتول (DTT) أو بيتا-ميركابتوإيثانول (β-ME) أو السيستين عند درجات حرارة منخفضة ضمن نطاق واسع من الرقم الهيدروجيني. بعد التعبير عن البروتين المُعاد تركيبه، يُمرَّر مُتجانس الخلية عبر عمود يحتوي على الكيتين . يسمح هذا لنطاق ربط الكيتين (CBD) للبروتين الهجين بالارتباط بالعمود. علاوة على ذلك، عند خفض درجة الحرارة ومرور الجزيئات المذكورة أعلاه عبر العمود، يخضع البروتين الهجين لعملية ربط ذاتي، ويتم استخلاص البروتين المستهدف فقط. تُغني هذه التقنية المبتكرة عن الحاجة إلى خطوة التحلل البروتيني، ويبقى Sce VMA المُعدَّل في العمود مرتبطًا بالكيتين عبر نطاق ربط الكيتين (CBD). [ 25 ]
استُخدمت الإنتينات مؤخرًا لتنقية البروتينات بالاعتماد على الببتيدات ذاتية التجميع. تُعدّ عديدات الببتيد الشبيهة بالإيلاستين (ELPs) أداةً مفيدةً في مجال التقنية الحيوية. عند دمجها مع البروتين المستهدف، تميل هذه الببتيدات إلى تكوين تجمعات داخل الخلايا. [ 26 ] وهذا يُغني عن خطوة الفصل الكروماتوغرافي اللازمة لتنقية البروتين. استُخدمت علامات ELP في البروتين المدمج مع الإنتين، بحيث يُمكن عزل التجمعات دون الحاجة إلى الفصل الكروماتوغرافي (عن طريق الطرد المركزي)، ثم يُمكن فصل الإنتين والعلامة بطريقة مُتحكّم بها لإطلاق البروتين المستهدف في المحلول. يُمكن إجراء عملية عزل البروتين هذه باستخدام تدفق مستمر للوسط، مما يُنتج كميات كبيرة من البروتين، ويجعل هذه العملية أكثر كفاءةً من الناحية الاقتصادية من الطرق التقليدية. [ 26 ] استخدمت مجموعة أخرى من الباحثين علامات أصغر ذاتية التجميع لعزل البروتين المستهدف. استُخدمت الببتيدات الأمفيباثية الصغيرة 18A وELK16 (الشكل 5) لتكوين بروتين مُجمّع ذاتي الانقسام. [ 27 ]
تطبيقات في تطوير مضادات الميكروبات
على مدى العشرين عامًا الماضية، ازداد الاهتمام بتوظيف الإنتينات في التطبيقات المضادة للميكروبات . [ 12 ] يوجد ربط الإنتينات حصريًا في الكائنات وحيدة الخلية، وبكثرة خاصة في الكائنات الدقيقة الممرضة. [ 28 ] علاوة على ذلك، توجد الإنتينات عادةً ضمن البروتينات الأساسية و/أو البروتينات المشاركة في بقاء الكائن الحي داخل جسم الإنسان. يُعدّ إزالة الإنتينات بعد الترجمة ضروريًا لكي يطوى البروتين ويؤدي وظيفته بشكل صحيح. على سبيل المثال، أثبتت غايل هويه وآخرون أن بروتين SufB غير المربوط في بكتيريا السل يمنع تكوين معقد SufBCD، وهو أحد مكونات آلية SUF. [ 29 ] وبذلك، قد يُشكّل تثبيط ربط الإنتينات منصةً فعّالة لتطوير مضادات الميكروبات.
تركز الأبحاث الحالية على مثبطات ربط الإنتين على تطوير مضادات للبكتيريا المتفطرة ( تحتوي المتفطرة السلية على ثلاثة بروتينات تحتوي على الإنتين)، بالإضافة إلى عوامل فعالة ضد الفطريات الممرضة مثل الكريبتوكوكس والأسبرجيلوس . [ 13 ] يثبط السيسبلاتين ومركبات البلاتين المماثلة ربط إنتين RecA الخاص بالمتفطرة السلية من خلال التنسيق مع البقايا التحفيزية. [ 30 ] تعمل الكاتيونات ثنائية التكافؤ، مثل أيونات النحاس (II) والزنك (II)، بطريقة مماثلة لتثبيط الربط بشكل عكسي. [ 12 ] ومع ذلك، لا تُعد أي من هاتين الطريقتين مناسبة حاليًا لمضاد حيوي فعال وآمن. كما يتم تثبيط إنتين Prp8 الفطري بواسطة الكاتيونات ثنائية التكافؤ والسيسبلاتين من خلال التداخل مع بقايا السيستين 1 التحفيزية. [ 12 ] في عام 2021، قام لي وآخرون... أظهرت الدراسات أن مثبطات الجزيئات الصغيرة لعملية ربط الإنتين Prp8 كانت انتقائية وفعالة في إبطاء نمو C. neoformans و C. gattii ، مما يوفر دليلاً مثيراً للاهتمام على الإمكانات المضادة للميكروبات لمثبطات ربط الإنتين. [ 31 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ بومان، إي جيه؛ تيني، كيه؛ بومان، بي جيه (أكتوبر 1988). "عزل الجينات المشفرة لإنزيم ATPase الفجوي في فطر نيوروسبورا. تحليل vma-1 المشفر للوحدة الفرعية 67 كيلو دالتون يكشف عن تشابه مع إنزيمات ATPase أخرى" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 263 (28): 13994-4001 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)68175-X . PMID 2971651 .
- ↑ زيمنياك، ل؛ ديتريش، ب؛ جوجارتن، ج ب؛ كيباك، هـ؛ تايز، ل (يوليو 1988). "تسلسل الحمض النووي المكمل للوحدة الفرعية 69 كيلو دالتون من إنزيم H+-ATPase الفجوي للجزر. التشابه مع السلسلة بيتا من إنزيمات F0F1-ATPase" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 263 (19): 9102-12 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)76514-4 . PMID 2897965 .
- ↑ شيه، سي كيه؛ فاغنر، آر؛ فاينشتاين، إس؛ كانيك-إينولات، سي؛ نيف، إن (أغسطس 1988). "جين مقاومة التريفلوبيرازين السائد من الخميرة Saccharomyces cerevisiae له تشابه مع إنزيم F0F1 ATP synthase ويمنح نموًا حساسًا للكالسيوم" . بيولوجيا الخلية الجزيئية . 8 (8): 3094-103 . doi : 10.1128/mcb.8.8.3094 . PMC 363536. PMID 2905423 .
- ↑ هيراتا، ر؛ أوسومك، ي؛ ناكانو، أ؛ كاواساكي، هـ؛ سوزوكي، ك؛ أنراكو، ي (أبريل 1990). "البنية الجزيئية لجين VMA1، الذي يرمز للوحدة الفرعية المحفزة لإنزيم أدينوسين ثلاثي الفوسفات الناقل لأيونات الهيدروجين من أغشية الفجوات في خميرة Saccharomyces cerevisiae" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 265 (12): 6726-33 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)39210-5 . PMID 2139027 .
- ↑ هيراتا ر، أوسومك ي، ناكانو أ، كاواساكي ه، سوزوكي ك، أنراكو ي (أبريل 1990). "البنية الجزيئية لجين VMA1، الذي يرمز للوحدة الفرعية المحفزة لإنزيم أدينوسين ثلاثي الفوسفات الناقل لأيونات الهيدروجين من أغشية الفجوات في خميرة Saccharomyces cerevisiae" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 265 (12): 6726-33 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)39210-5 . PMID 2139027 .
- ↑ كين، بي. إم.، ياماشيرو، سي. تي.، وولكزيك، دي. إف.، نيف، إن.، غوبل، إم.، ستيفنز، تي. إتش. (نوفمبر 1990). "يحوّل ربط البروتين ناتج جين TFP1 في الخميرة إلى الوحدة الفرعية 69 كيلو دالتون من إنزيم أدينوسين ثلاثي الفوسفات الفجوي H(+)". مجلة ساينس . 250 (4981): 651-657 . Bibcode : 1990Sci...250..651K . doi : 10.1126/science.2146742 . PMID 2146742 .
- ↑ سويثرز، كريستين س.؛ سوسي، شانون م.؛ جوجارتن، ج. بيتر (2012). "دور التطور الشبكي في خلق الابتكار والتعقيد" . المجلة الدولية لعلم الأحياء التطوري . 2012 : 1-10 . doi : 10.1155/2012/418964 . ISSN 2090-8032 . PMC 3403396. PMID 22844638 .
- ↑ دوكينز، ريتشارد (1976). الجين الأناني . مطبعة جامعة أكسفورد.
- ↑ " UniProt: قاعدة بيانات البروتينات العالمية" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 45 (D1): D158– D169. 29-11-2016. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ISSN 0305-1048 . PMC 5210571. PMID 27899622 .
- 1 2 بيرلر، إف بي (2002). "InBase: قاعدة بيانات الإنتين" . أبحاث الأحماض النووية . 30 (1): 383-384 . doi : 10.1093 / nar/30.1.383 . ISSN 1362-4962 . PMC 99080. PMID 11752343 .
- ↑ غرين، كاثلين م.؛ لي، تشونغ؛ سميث، آرون د.؛ نوفيكوفا، أولغا؛ باكوت-ديفيس، فالجان ر.؛ غاو، فينغشان؛ هو، سايانغ؛ بانافالي، نيليش ك.؛ ثيل، دينيس ج.؛ لي، هونغمين؛ بيلفورت، مارلين (10-10-2019). "إنتين Prp8 الخاص بالجسيم الرابط عند مفترق طرق ربط البروتين والحمض النووي الريبي" . مجلة PLOS Biology . 17 (10) e3000104. doi : 10.1371/journal.pbio.3000104 . ISSN 1545-7885 . PMC 6805012. PMID 31600193 .
- 1 2 3 4 ثارابيل، أنيل ماثيو؛ لي، تشونغ؛ لي، هونغمين (2022). "الإنتينات كأهداف دوائية وأدوات علاجية" . مجلة فرونتيرز في العلوم البيولوجية الجزيئية . 9 821146. doi : 10.3389/fmolb.2022.821146 . ISSN 2296-889X . PMC 8861304. PMID 35211511 .
- وول ، ديانا أ.؛ تارانت، سيانان ب.؛ وانغ، تشونيو؛ ميلز، كينيث ف.؛ لينون، كريستوفر و. (2021). " مثبطات الإنتين كمضادات ميكروبية جديدة: تضفير البروتين في مسببات الأمراض البشرية، وطرق الفحص، واعتبارات التأثيرات الجانبية" . مجلة فرونتيرز في العلوم البيولوجية الجزيئية . 8 752824. doi : 10.3389/fmolb.2021.752824 . ISSN 2296-889X . PMC 8529194. PMID 34692773 .
- ↑ غرين، كاثلين م.؛ نوفيكوفا، أولغا؛ بيلفورت، مارلين (24 يناير 2018). "المشهد الديناميكي للإنترين في حقيقيات النوى" . الحمض النووي المتنقل . 9 (1): 4. doi : 10.1186/s13100-018-0111-x . ISSN 1759-8753 . PMC 5784728. PMID 29416568 .
- 1 2 نوفيكوفا، أولغا؛ توبيلينا، ناتاليا؛ بيلفورت، مارلين (مايو 2014). "التوزيع الغامض، والتطور، ووظيفة الإنتينات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 289 (21): 14490-14497 . doi : 10.1074/jbc.r114.548255 . ISSN 0021-9258 . PMC 4031506. PMID 24695741 .
- ↑ نورين سي جيه، وانغ جيه، بيرلر إف بي (2000). "تشريح كيمياء ربط البروتين وتطبيقاتها". Angew Chem Int Ed Engl . 39 (3): 450–66 . doi : 10.1002/(sici)1521-3773(20000204)39:3 < 450::aid-anie450 > 3.3.co ; 2-6 . PMID 10671234 .
- 1 2 3 4 5 ناندا، أ؛ ناسكر، س س؛ مهرا، أ؛ باندا، س؛ ناياك، س (16 ديسمبر 2020). " الإنترونات في العلوم: من التطور إلى التطبيق" . الكائنات الدقيقة . 8 (12): 2004. doi : 10.3390/microorganisms8122004 . PMC 7765530. PMID 33339089 .
- توري ، ك ؛ بيرلر، ف.ب. (أبريل 2011). "توسيع تعريف الإنتينات من الفئة 3 وأصلها المقترح من العاثيات" . مجلة علم البكتيريا . 193 (8): 2035-2041 . doi : 10.1128/JB.01407-10 . PMC 3133030. PMID 21317331 .
- ↑ أنراكو، ي؛ ميزوتاني، ر؛ ساتو، ي (2005). "وصل البروتين: اكتشافه وفهمه البنيوي للآليات الكيميائية الجديدة" . مجلة IUBMB Life . 57 (8): 563-74 . doi : 10.1080/15216540500215499 . PMID 16118114 .
- ↑ كيلي، دانييل س.؛ لينون، كريستوفر و.؛ لي، تشونغ؛ ميلر، مايكل ر.؛ بانافالي، نيليش ك.؛ لي، هونغمين؛ بيلفورت، مارلين (19 أكتوبر 2018). "إنزيم هيليكاز DnaB البكتيري كمستشعر للإجهاد التأكسدي" . مجلة نيتشر كوميونيكيشنز . 9 (1): 4363. Bibcode : 2018NatCo...9.4363K . doi : 10.1038/s41467-018-06554- x . PMC 6195587. PMID 30341292 .
- ↑ وو، هـ.؛ هو، ز.؛ ليو، إكس كيو (1998). "الوصل البروتيني العابر بواسطة إنترين منقسم مُشفَّر في جين DnaE منقسم من Synechocystis sp. PCC6803" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 95 (16): 9226-9231 . Bibcode : 1998PNAS...95.9226W . doi : 10.1073 / pnas.95.16.9226 . PMC 21320. PMID 9689062 .
- ↑ شوارزر د، كول ب.أ. (2005). "التخليق الجزئي للبروتين وربط البروتين المُعبَّر عنه: مطاردة ذيل البروتين". الرأي الحالي في الكيمياء الحيوية . 9 (6): 561-569 . doi : 10.1016/j.cbpa.2005.09.018 . PMID 16226484 .
- ↑ موراليداران، ف.، وموير ، ت. و. (2006). "ربط البروتينات: تقنية تمكينية للتحليل الفيزيائي الحيوي للبروتينات". نات. ميثودز . 3 (6): 429-38 . doi : 10.1038/nmeth886 . PMID 16721376. S2CID 12550693 .
- ↑ دي غراي، أوبراي دي إن جيه (2000). "العلاج الجيني للميتوكوندريا: مجال للاستخدام الطبي الحيوي للإنترينات". اتجاهات في التكنولوجيا الحيوية . 18 (9): 394-399 . doi : 10.1016/S0167-7799(00)01476-1 . ISSN 0167-7799 . PMID 10942964 .
- 1 2 تشونغ، شاورونغ؛ ميرشا، فانا ب؛ كومب، دونالد ج؛ سكوت، ميليسا إي؛ لاندري، ديفيد؛ فانس، لويس م؛ بيرلر، فرانسين ب؛ بينر، جاك؛ كوتشيرا، ريبيكا ب؛ هيرفونين، كريستين أ؛ بيليتييه، جون ج؛ باولوس، هنري؛ شو، مينغ-كون (1997). "تنقية البروتينات المؤتلفة الحرة باستخدام عمود واحد وعلامة تقارب ذاتية الانقسام مشتقة من عنصر ربط البروتين". جين . 192 (2): 271-281 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00105-4 . ISSN 0378-1119 . PMID 9224900 .
- 1 2 فونغ، بالي أ؛ وود، ديفيد و (2010). "التعبير عن البروتينات المستهدفة الموسومة بـ ELP-intein وتنقيتها في تخمير الإشريكية القولونية بكثافة خلوية عالية" . مصانع الخلايا الميكروبية . 9 (1): 77. doi : 10.1186/1475-2859-9-77 . ISSN 1475-2859 . PMC 2978133. PMID 20959011 .
- ↑ شينغ، لي؛ وو، وي؛ تشو، بيهونغ؛ لين، تشانغلين (2011). "تبسيط عملية التعبير عن البروتين وتنقيته باستخدام علامات التجميع الذاتي القابلة للكسر" . مصانع الخلايا الميكروبية . 10 (1): 42. doi : 10.1186/1475-2859-10-42 . ISSN 1475-2859 . PMC 3124420. PMID 21631955 .
- ↑ شاه، نيل هـ.؛ موير، توم و. (24-12-2013). " الإنترينات: هبة الطبيعة لكيميائيي البروتين" . العلوم الكيميائية . 5 (2): 446-461 . doi : 10.1039/C3SC52951G . ISSN 2041-6539 . PMC 3949740. PMID 24634716 .
- ↑ هويه، غايل؛ كاستينغ، جان فيليب؛ فورنييه، ديدييه؛ دافي، مامادو؛ سافيس، إيزابيل (مايو 2006). "يُعدّ ربط بروتين SufB أمرًا بالغ الأهمية لوظيفة آلية SUF في المتفطرة السلية" . مجلة علم البكتيريا . 188 (9): 3412-3414 . doi : 10.1128/JB.188.9.3412-3414.2006 . ISSN 0021-9193 . PMC 1447444. PMID 16621837 .
- ↑ تشان، هون؛ بيرسون، سي. سيث؛ غرين، كاثلين م.؛ لي، تشونغ؛ تشانغ، جينغ؛ بيلفورت، جورج؛ شيختمان، أليكس؛ لي، هونغمين؛ بيلفورت، مارلين (أكتوبر 2016). "استكشاف تثبيط الإنتين بواسطة مركبات البلاتين كاستراتيجية مضادة للميكروبات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 291 (43): 22661-22670 . doi : 10.1074/jbc.m116.747824 . ISSN 0021-9258 . PMC 5077202. PMID 27609519 .
- ↑ لي، تشونغ؛ ثارابيل، أنيل ماثيو؛ شو، جيمين؛ لانغ، يوكون؛ غرين، كاثلين م.؛ تشانغ، جينغ؛ لين، تشيشان؛ تشاتورفيدي، سودها؛ تشو، جيا؛ بيلفورت، مارلين؛ لي، هونغمين (12 يناير 2021). " مثبطات الجزيئات الصغيرة لإنزيم Prp8 كعوامل مضادة للفطريات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 118 (2) e2008815118. Bibcode : 2021PNAS..11808815L . doi : 10.1073/pnas.2008815118 . ISSN 0027-8424 . PMC 7812778. PMID 33397721 .
للمزيد من القراءة
- جوجارتن، ج. بيتر؛ إيلينا هيلاريو (2006). "الإنترونات، والإنترونات الداخلية، والإنزيمات النووية الموجهة: اكتشافات حديثة حول دورة حياة العناصر الوراثية الطفيلية" . مجلة BMC Evol Biol . 6 (1): 94. doi : 10.1186/1471-2148-6-94 . ISSN 1471-2148 . PMC 1654191. PMID 17101053 .
روابط خارجية
- قاعدة بيانات الإنتين
- قاعدة بيانات Intein الخاصة بشموئيل بيتروكوفسكي
- مراجعة مختصرة
- ستاروكادومسكي، ب. ل.، ربط البروتين، 2007
- آلية ربط البروتين وبنية الإنتين
- البروتين + التضفير في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- البروتينات
- تخليق البروتين
