علم الجينوم القديم

علم الجينوم القديم هو فرع من العلوم يعتمد على إعادة بناء وتحليل المعلومات الجينومية في الأنواع المنقرضة . وقد ساهمت الطرق المحسّنة لاستخلاص الحمض النووي القديم (aDNA) من القطع الأثرية في المتاحف، وعينات الجليد ، والمواقع الأثرية أو الأحفورية، وتقنيات التسلسل الجيني من الجيل التالي، في ازدهار هذا المجال. أصبح من الممكن الآن رصد الانحراف الوراثي ، وهجرات السكان القديمة وعلاقاتها المتبادلة، والتاريخ التطوري للنباتات والحيوانات وأنواع الإنسان المنقرضة ، وتحديد السمات الظاهرية عبر المناطق الجغرافية. كما يمكن للعلماء استخدام علم الجينوم القديم لمقارنة الأسلاف القدماء بالبشر المعاصرين. [ 1 ] وتتجلى الأهمية المتزايدة لعلم الجينوم القديم في منح جائزة نوبل في الطب أو علم وظائف الأعضاء لعام 2022 لعالم الوراثة السويدي سفانتي بابو [1955-]، الذي عمل في مجال علم الجينوم القديم.

خلفية

في البداية، تضمن تسلسل الحمض النووي القديم استنساخ أجزاء صغيرة منه في البكتيريا، وهو ما كان يتم بكفاءة منخفضة بسبب التلف التأكسدي الذي تعرض له الحمض النووي القديم على مر آلاف السنين. [ 2 ] يصعب تحليل الحمض النووي القديم نظرًا لتحلله السريع بواسطة النيوكليازات ؛ وقد حسّنت بيئات محددة وظروف ما بعد الوفاة من عملية العزل والتحليل. وكانت بروتوكولات الاستخلاص والتلوث ضرورية لإجراء تحليلات موثوقة. [ 3 ] مع تطوير تفاعل البوليميراز المتسلسل ( PCR ) في عام 1983، تمكن العلماء من دراسة عينات الحمض النووي التي يصل عمرها إلى حوالي 100,000 عام، وهو ما كان يمثل قيدًا بسبب قصر الأجزاء المعزولة نسبيًا. ومن خلال التقدم في العزل والتضخيم والتسلسل وإعادة بناء البيانات، أصبح من الممكن تحليل عينات أقدم فأقدم. على مدى الثلاثين عامًا الماضية، تمكن الحمض النووي للميتوكوندريا ذو العدد الكبير من النسخ من الإجابة على العديد من الأسئلة؛ وقد أدى ظهور تقنيات التسلسل من الجيل التالي (NGS) إلى ظهور المزيد من الأسئلة. علاوة على ذلك، سمحت هذه الثورة التكنولوجية بالانتقال من علم الوراثة القديمة إلى علم الجينوم القديم. [ 1 ]

طرق التسلسل

التحديات والتقنيات

تتوفر تقنيات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) والجيل الثاني من تقنيات التسلسل الجيني من الجيل الجديد (NGS) والعديد من طرق تحليل المكتبات لتسلسل الحمض النووي القديم (aDNA)، بالإضافة إلى العديد من أدوات المعلوماتية الحيوية . عند التعامل مع أي من هذه الطرق، من المهم مراعاة أن الحمض النووي القديم قد يتعرض للتغيير بعد الوفاة. [ 2 ] تنشأ تغييرات محددة من:

  • بيانات تسلسل أنماط الطفرات الأساسية (طفرة C->T)
  • الروابط المتقاطعة
  • نزع الأمين من السيتوزين (يزداد باتجاه نهايات القراءة)
  • إزالة البيورين
  • تجزئة الجينوم

تساعد الأنماط المحددة وبداية هذه التغيرات العلماء على تقدير عمر العينة.

في السابق، كان العلماء يشخصون الأضرار التي تلحق بالجثث بعد الوفاة باستخدام التفاعلات الإنزيمية أو كروماتوغرافيا الغاز المقترنة بقياس الطيف الكتلي ؛ وفي السنوات الأخيرة، بدأ العلماء في الكشف عنها من خلال استغلال بيانات تسلسل الطفرات. تتيح هذه الاستراتيجية تحديد الزيادة في طفرات C->T بعد المعالجة بإنزيم يوراسيل دي إن إيه جليكوزيلاز . أما اليوم، فيُستخدم التسلسل عالي الإنتاجية (HTS) لتحديد إزالة البيورين (وهي عملية تُحفز تفتت الحمض النووي بعد الوفاة، حيث تحتوي العينات الأصغر سنًا على نسبة أدينين أعلى من الجوانينوكسور السلسلة المفردة في اللولب المزدوج للحمض النووي، والمواقع الخالية من القاعدة (الناتجة عن طفرة C->T). يمكن تسلسل جزء واحد من الحمض النووي القديم (aDNA) بطوله الكامل باستخدام HTS. وباستخدام هذه البيانات، يمكننا إنشاء توزيع يُمثل منحنى اضمحلال الحجم، مما يُتيح إجراء مقارنة كمية مباشرة للتفتت بين العينات عبر المكان والظروف البيئية. ومن خلال منحنى الاضمحلال، يُمكن الحصول على متوسط ​​طول الجزء المُحدد من الحمض النووي القديم. يعكس هذا الطول مستويات التفتت بعد الوفاة، والتي تزداد عمومًا مع درجة حرارة الترسيب. [ 4 ]

المكتبات

يمكن إجراء مكتبتين مختلفتين لتسلسل الحمض النووي القديم باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل لتضخيم الجينوم :

  • مكتبة الحمض النووي القديم ثنائي السلسلة (مكتبة الحمض النووي ثنائي السلسلة)
  • مكتبة الحمض النووي القديم أحادي السلسلة (مكتبة الحمض النووي)

تُصنع الطريقة الأولى باستخدام تقنية النهايات غير المتداخلة. تعتمد هذه التقنية على نوعين مختلفين من المحولات: يرتبط كل محول بالقطعة بشكل عشوائي، مما يسمح بتضخيمها. أما القطعة التي لا تحتوي على كلا المحولين، فلا يمكن تضخيمها، مما يُسبب خطأً. وللحد من هذا الخطأ، طُورت تقنية ربط Illumina T/A: تعتمد هذه الطريقة على إضافة ذيل الأدينين (A) إلى عينة الحمض النووي لتسهيل ربط المحولات ذات ذيل الثايمين (T). تُحسّن هذه الطريقة عملية تضخيم الحمض النووي القديم (aDNA).

للحصول على مكتبات الحمض النووي أحادي السلسلة (ssDNA)، يتم أولاً فصل سلسلتي الحمض النووي بالحرارة. ثم يتم ربط الحمض النووي أحادي السلسلة الناتج بمحولين لتوليد السلسلة المكملة ، وأخيراً يتم تطبيق تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) . [ 4 ]

إثراء الحمض النووي القديم

بما أن الحمض النووي القديم قد يحتوي على حمض نووي بكتيري أو كائنات دقيقة أخرى، فإن العملية تتطلب إثراءً. ولفصل الأجزاء الداخلية والخارجية، تُستخدم طرق مختلفة:

  • إثراء القالب التالف: يُستخدم هذا الأسلوب عند إنشاء مكتبة الحمض النووي أحادي السلسلة (ssDNA) لأنه يستهدف تلف الحمض النووي. فعندما يملأ بوليميراز Bst الشق، تُعالج العينة بإنزيم يوراسيل دي إن إيه جليكوزيلاز وإنزيم إندونوكلياز VIII. تهاجم هذه المركبات الموقع الخالي من القاعدة. يبقى الحمض النووي غير التالف مرتبطًا بخرزات مغناطيسية مغلفة بالستربتافيدين ، ويمكن فصله عن العينة. يُعد هذا الأسلوب خاصًا بعينات إنسان نياندرتال من العصر البليستوسيني المتأخر. [ 5 ]
  • إثراء الهدف في المحلول دون تمديد: تعتمد هذه الطريقة على تهجين الهدف مع المجس. تتطلب هذه الطريقة فصل سلسلتي الحمض النووي، ثم إدخال مجسات متداخلة على طول المناطق المستهدفة. بعد ذلك، يُستخدم تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) لتضخيم الحمض النووي، وأخيرًا يتم ربط الحمض النووي بمحول بيوتينيلاتي . تُعد هذه الطريقة مفيدة لعينات من أسلاف أشباه البشر القدماء.
  • إثراء الهدف في الطور الصلب: في هذه الطريقة، يتم استخدام طريقة المصفوفة الدقيقة وطريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي بالتوازي مع فحص التسلسل العشوائي .
  • إثراء الجينوم الكامل: يُستخدم لتسلسل الجينوم الكامل لأفراد مفردين. وتُستخدم تقنية التقاط الجينوم الكامل في المحلول (WISC). [ 6 ] تبدأ هذه الطريقة بتحضير مكتبة مجسات الحمض النووي الريبوزي (RNA) على مستوى الجينوم من نوع ذي جينوم وثيق الصلة بالجينوم المستهدف في عينة الحمض النووي (DNA). [ 4 ]

تنوع السكان غير الأفارقة في الوقت الحاضر والبشر المعاصرين تشريحياً

أدت العديد من الدراسات في مختلف المجالات إلى استنتاج مفاده أن السكان غير الأفارقة الحاليين هم نتاج تنوع في عدة سلالات مختلفة من مجموعة سكانية سلفية متماسكة، كانت المحرك الرئيسي لتوسع خارج أفريقيا، حاملةً معها جزءًا من التراث الجيني الأفريقي . في هذا السياق، كان تحليل الحمض النووي القديم أساسيًا لاختبار الفرضيات المطروحة مسبقًا وتقديم رؤى جديدة. أولًا، سمح هذا التحليل بتضييق نطاق توقيت وبنية ظاهرة التنوع هذه من خلال معايرة معدل الطفرات الجسدية والميتوكوندرية . [ 7 ] وقد أظهر تحليل الاختلاط الجيني حدوث حدثين مستقلين على الأقل لتدفق الجينات بين أسلاف الإنسان الحديث والإنسان القديم، مثل إنسان نياندرتال وإنسان دينيسوفان ، مما يؤكد نموذج "الاستبدال المتسرب" لتاريخ السكان البشريين في أوراسيا. وفقًا لهذه البيانات، حدث تباين السلالات البشرية غير الأفريقية حوالي 45000 إلى 55000 سنة قبل الحاضر . [ 7 ] إضافةً إلى ذلك، سمح الحمض النووي القديم في كثير من الحالات بتتبع العمليات التاريخية التي أدت، بمرور الوقت، إلى التركيب الجيني الحالي للسكان، وهو أمر كان يصعب تحقيقه بالاعتماد فقط على تحليل الجينومات الحالية. ومن بين هذه الأسئلة التي لا تزال بلا إجابة، تُعدّ هوية أول سكان الأمريكتين، واستيطان أوروبا، وأصل الزراعة فيها من أكثر الأسئلة دراسةً. [ 1 ]

التباين الظاهري لدى البشر

يُتيح تحليل الحمض النووي القديم دراسة طفرات الصفات الظاهرية التي تحدث في أعقاب التغيرات البيئية والسلوك البشري. وقد أدت الهجرة إلى مواطن جديدة، والتحولات الغذائية الجديدة (بعد الانتقال إلى الزراعة)، وتكوين مجتمعات كبيرة إلى تعريض البشر لظروف جديدة أسفرت في نهاية المطاف عن التكيف البيولوجي .

لون البشرة

هجرة البشر من أفريقيا إلى خطوط العرض العليا أدت إلى انخفاض تعرضهم لأشعة الشمس. ولأن أشعة UVA و UVB ضرورية لتكوين فيتامين د ، الذي ينظم امتصاص الكالسيوم وبالتالي فهو أساسي لصحة العظام، فإن العيش في خطوط العرض العليا يعني انخفاضًا كبيرًا في تكوين فيتامين د . وقد فرض هذا ضغطًا انتقائيًا جديدًا على سمة لون البشرة، مفضلًا لون البشرة الفاتح في خطوط العرض العليا. يُعدّ الجينان SLC24A5 وSLC45A2 من أهم الجينات المسؤولة عن تصبغ الجلد. في الوقت الحاضر، استقرت أليلات "البشرة الفاتحة" لهذين الجينين في أوروبا، لكنها لم تصل إلى تردد عالٍ نسبيًا إلا مؤخرًا (منذ حوالي 5000 عام). [ 7 ] تشير عملية فقدان التصبغ البطيئة هذه إلى أن الأوروبيين القدماء ربما واجهوا آثارًا سلبية لانخفاض إنتاج فيتامين د، مثل أمراض الجهاز العضلي الهيكلي وأمراض القلب والأوعية الدموية. وهناك فرضية أخرى مفادها أن الأوروبيين قبل الزراعة ربما كانوا يحصلون على احتياجاتهم من فيتامين د من خلال نظامهم الغذائي (حيث يحتوي اللحم والسمك على بعض فيتامين د). [ 8 ]

التكيف مع النظام الغذائي الزراعي

من أبرز الأمثلة على التكيف بعد التحول إلى النظام الغذائي الزراعي استمرار إنتاج إنزيم اللاكتيز في مرحلة البلوغ. هذا الإنزيم ضروري لهضم اللاكتوز الموجود في الحليب ومنتجات الألبان، ويؤدي غيابه إلى الإسهال بعد تناول هذه المنتجات. يُحدد استمرار إنتاج اللاكتيز بشكل أساسي من خلال طفرة في قاعدة واحدة في جين MCM6، وتشير بيانات الحمض النووي القديم إلى أن هذه الطفرة لم تنتشر إلا خلال الخمسة آلاف سنة الماضية، أي بعد آلاف السنين من بدء ممارسات إنتاج الألبان. [ 7 ] وبالتالي، حتى في حالة استمرار إنتاج اللاكتيز، هناك فترة زمنية طويلة بين بدء عادة جديدة وانتشار الأليل المتكيف، ولذلك ربما اقتصر استهلاك الحليب على الأطفال أو على المنتجات قليلة اللاكتوز.

ومن الأمثلة الأخرى على الطفرات التي تم اختيارها إيجابياً نتيجة التحول إلى الزراعة، عدد نسخ جين AMY1. يشفر جين AMY1 إنزيم الأميليز الهاضم للنشا الموجود في اللعاب، ويمتلك البشر المعاصرون عدداً أكبر من نسخ هذا الجين مقارنةً بالشمبانزي . [ 8 ]

الجهاز المناعي

خضع الجهاز المناعي البشري لعملية انتقاء مكثفة عبر آلاف السنين، متكيفًا مع بيئات مسببات الأمراض المختلفة. وقد فرضت العديد من التغيرات البيئية والثقافية ضغطًا انتقائيًا على جينات مختلفة مرتبطة بالمناعة. فعلى سبيل المثال، عرّضت الهجرات البشر لموائل جديدة تحمل مسببات أمراض جديدة أو نواقل لها (مثل البعوض). كما أن التحول إلى الزراعة تضمن التعرض لمسببات أمراض وحالات صحية مختلفة، نتيجة لزيادة الكثافة السكانية والعيش بالقرب من الماشية. ومع ذلك، يصعب ربط تغيرات جينومية قديمة محددة بتحسن مقاومة مسببات أمراض معينة بشكل مباشر، نظرًا لاتساع وتعقيد الجهاز المناعي البشري. وإلى جانب دراسة التغيرات في الجهاز المناعي البشري بشكل مباشر، من الممكن أيضًا دراسة الجينومات القديمة لمسببات الأمراض، مثل تلك التي تسبب السل والجذام والطاعون والجدري والملاريا . على سبيل المثال، اكتشف الباحثون أن جميع سلالات يرسينيا الطاعونية قبل 3600 عام كانت تفتقر إلى جين ymt ، وهو ضروري لبقاء العامل الممرض في أمعاء البراغيث . [ 8 ] يشير هذا إلى أن الطاعون في الماضي القديم ربما كان أقل ضراوة مقارنة بتفشيات يرسينيا الطاعونية الحديثة .

أكدت دراسة للحمض النووي القديم أو دعمت [ 9 ] أن التطور البشري الحديث لمقاومة العدوى بمسببات الأمراض قد زاد أيضًا من خطر الإصابة بالأمراض الالتهابية لدى الأوروبيين بعد العصر الحجري الحديث على مدى العشرة آلاف سنة الماضية، مع تقدير طبيعة وقوة ووقت بدء الانتقاءات الناتجة عن مسببات الأمراض. [ 10 ]

النباتات والحيوانات

أُعيد بناء العديد من الفقاريات غير البشرية - كالماموث القديم والدب القطبي والكلب والحصان - من خلال استخلاص الحمض النووي القديم من الأحافير والعينات المحفوظة في درجات حرارة منخفضة أو على ارتفاعات عالية. وتُعدّ دراسات الماموث الأكثر شيوعًا نظرًا لوجود كميات كبيرة من الأنسجة الرخوة والشعر من التربة الصقيعية، وتُستخدم لتحديد العلاقة والتغيرات الديموغرافية مع الأفيال الحديثة . تُجرى دراسات الدب القطبي لتحديد تأثير تغير المناخ على التطور والتنوع البيولوجي . تُقدّم دراسات الكلب والحصان رؤى ثاقبة حول التدجين . في النباتات، عُزل الحمض النووي القديم من البذور وحبوب اللقاح والخشب . وقد حُدّدت علاقة بين الشعير القديم والشعير الحالي . ومن التطبيقات الأخرى الكشف عن عملية تدجين الذرة وتكيفها، والتي تشمل جينات تحمل الجفاف ومحتوى السكر . [ 1 ]

التحديات والآفاق المستقبلية

أحدث تحليل الجينومات القديمة للإنسان الحديث تشريحيًا ثورةً شاملةً في السنوات الأخيرة في منهجنا لدراسة هجرات السكان وتحولاتهم وتطورهم. ومع ذلك، لا يزال الكثير مجهولًا. تتمثل المشكلة الأولى والواضحة المتعلقة بهذا النهج، والتي سيتم التغلب عليها جزئيًا من خلال التحسين المستمر لتقنيات استخلاص الحمض النووي القديم، في صعوبة استعادة الجينومات القديمة المحفوظة جيدًا، وهو تحدٍّ يُلاحظ بشكل خاص في أفريقيا وآسيا، حيث درجات الحرارة أعلى من المناطق الباردة الأخرى في العالم. علاوة على ذلك، تُعد أفريقيا، من بين جميع القارات، القارة التي تضم أكبر تنوع جيني . [ 7 ] إلى جانب تدهور الحمض النووي، يُحدّ التلوث الخارجي أيضًا من عمليات تسلسل وتجميع الجينوم القديم. [ 1 ] ولأننا لا نمتلك حمضًا نوويًا قديمًا من زمن ومكان سكنهما أسلاف السكان غير الأفارقة الحاليين، فإننا لا نزال نعرف القليل عن بنيتهم ​​وموقعهم. يتمثل التحدي الثاني والأهم في استخلاص الحمض النووي من الإنسان الحديث المبكر (100,000 - 200,000 سنة قبل الحاضر). ستُمكّن هذه البيانات، إلى جانب عدد كبير من الجينومات القديمة التي تحتاج إلى تحليل، ومعرفة توقيت وتوزيع الاختلاط الجيني القديم، العلماء من إعادة بناء تاريخ جنسنا البشري بسهولة أكبر. في الواقع، سيُتيح لنا جمع المزيد من البيانات حول تاريخنا الجيني تتبع التطور البشري ليس فقط من حيث الهجرات والانتقاء الطبيعي ، بل أيضًا من حيث الثقافة. في العقد القادم، سيركز مجال أبحاث علم الجينوم القديم اهتمامه بشكل أساسي على ثلاثة مواضيع: تحديد التفاعلات البشرية الماضية بتفاصيل دقيقة من خلال أخذ عينات أكثر كثافة، وفهم كيفية مساهمة هذه التفاعلات في التحول الزراعي من خلال تحليل الحمض النووي للمناطق التي لم تُدرس بشكل كافٍ، وأخيرًا، تحديد مساهمة الانتقاء الطبيعي في الأنماط الظاهرية الحالية. لتفسير كل هذه البيانات، سيُطلب من علماء الوراثة التعاون، كما فعلوا بالفعل مع علماء الأنثروبولوجيا وعلماء الآثار ، مع المؤرخين . [ 7 ]

الأخلاقيات الحيوية

تُعنى الأخلاقيات الحيوية في علم الجينوم القديم بالمسائل الأخلاقية التي تنشأ عند دراسة البقايا البشرية القديمة، نظرًا للعلاقات المعقدة بين العلماء والحكومات والسكان الأصليين . إضافةً إلى ذلك، قد تُلحق دراسات علم الجينوم القديم ضررًا بتاريخ المجتمعات أو الأفراد وهوياتهم، فضلًا عن كشف معلومات مُسيئة عن أحفادهم. لهذه الأسباب، لا تزال هذه الدراسات موضوعًا حساسًا. قد تُؤدي دراسات علم الجينوم القديم إلى عواقب سلبية، ويرجع ذلك أساسًا إلى التناقضات بين صياغة المبادئ الأخلاقية والممارسات. في الواقع، تُعتبر رفات الأجداد عادةً، قانونيًا وعلميًا، "قطعًا أثرية" وليست "أفرادًا"، مما يُبرر سلوكيات مشكوك فيها وقلة تفاعل المجتمعات . لذلك، يُستخدم فحص رفات الأجداد في النزاعات والمطالبات في المعاهدات وإعادة الرفات إلى أوطانها، أو في قضايا قانونية أخرى. إن إدراك أهمية هذا الموضوع وحساسيته يُسهم في وضع التزام أخلاقي وتوجيهات قابلة للتطبيق في سياقات مختلفة، وذلك للحفاظ على كرامة رفات الأجداد وتجنب المشكلات الأخلاقية. [ 11 ] وأخيرًا، يُعد مشروع "إعادة إحياء الأنواع المنقرضة" مجالًا رائدًا آخرًا، ويهدف إلى إعادة إحياء الأنواع المنقرضة، مثل الماموث. هذا المشروع، الذي يبدو ممكنًا بفضل تقنية CRISPR/Cas9 ، يرتبط ارتباطًا وثيقًا بالعديد من القضايا الأخلاقية. [ 1 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 4 5 6 لان تي وليندكفيست سي. 2018. علم الجينوم القديم: تحليل على نطاق الجينوم للحمض النووي القديم والاستدلالات الجينومية السكانية والتطورية . في: علم جينوم السكان، سبرينغر، تشام. ص 1-38.
  2. 1 2 بابو، س. (1989-03-01). "الحمض النووي القديم: الاستخلاص، والتمييز، والاستنساخ الجزيئي، والتضخيم الإنزيمي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 86 (6): 1939-1943 . Bibcode : 1989PNAS...86.1939P . doi : 10.1073/pnas.86.6.1939 . ISSN 1091-6490 . PMC 286820. PMID 2928314 .   
  3. ^ لالويزا فوكس، كارليس؛ كاستريسانا، خوسيه؛ بيرترانبيتيت، جاومي؛ الكوفر، جوزيب أنتوني؛ بوفر، بيري. جيجلي، إيلينا؛ راميريز ، أوسكار (2009-05-22). "علم الحفريات القديمة في بيئة معتدلة: تسلسل البندقية من كابرين البحر الأبيض المتوسط ​​المنقرض" . بلوس واحد . 4 (5) هـ5670. بيب كود : 2009PLoSO...4.5670R . دوى : 10.1371/journal.pone.0005670 . ردمك 1932-6203 . بمك 2680946 . بميد 19461892 .   
  4. 1 2 3 أورلاندو إل، جيلبرت إم تي، ويلرسليف إي. 2015. إعادة بناء الجينومات والإبيجينومات القديمة . نات. ريف. جينيت. 16(7):395-408.
  5. غانسوج، ماري-تيريس؛ ماير، ماتياس (سبتمبر 2014). "الإثراء الانتقائي لجزيئات الحمض النووي التالفة لتسلسل الجينوم القديم" . أبحاث الجينوم . 24 (9): 1543-1549 . doi : 10.1101/gr.174201.114 . ISSN 1088-9051 . PMC 4158764. PMID 25081630 .   
  6. كاربنتر، ميريديث ل.؛ بوينروسترو، جيسون د.؛ فالديوسيرا، كريستينا؛ شرودر، هانز؛ ألينتوفت، مورتن إي.؛ سيكورا، مارتن؛ راسموسن، مورتن؛ جرافيل، سيمون؛ غيلين، سونيا (2013-11-07). "استخلاص 1%: التقاط الجينوم الكامل للإثراء المستهدف لمكتبات تسلسل الحمض النووي القديم" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 93 (5): 852-864 . doi : 10.1016/j.ajhg.2013.10.002 . ISSN 0002-9297 . PMC 3824117. PMID 24568772 .   
  7. 1 2 3 4 5 6 سكوجلوند ب. وماثيسون آي. 2018. علم الجينوم القديم للإنسان الحديث: العقد الأول . المجلة السنوية لعلم الجينوم البشري 19:1، 381-404.
  8. 1 2 3 مارسينياك إس، بيري جي إتش. تسخير الجينومات القديمة لدراسة تاريخ التكيف البشري . مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس، المجلد 18، الصفحات 659-674 (2017).
  9. باريرو، لويس ب.؛ كوينتانا-مورسي، لويس (يناير 2010). "من علم الوراثة التطوري إلى علم المناعة البشري: كيف يشكل الانتقاء جينات الدفاع المضيف" . مجلة Nature Reviews Genetics . 11 (1): 17-30 . doi : 10.1038/nrg2698 . ISSN 1471-0064 . PMID 19953080. S2CID 15705508 .   
  10. ^ كيرنر، غاسبارد. نيهوس، آنا لينا؛ فيليبوت، كوينتين؛ بوهلين، جوناثان. رينشاي، داراوان؛ كروش، نسيم؛ بويل، آن. تشانغ، شين يينغ؛ بواسون دوبوي، ستيفاني؛ هابيل، لوران؛ كازانوفا، جان لوران؛ باتين، إتيان؛ لافال، غيوم. كوينتانا-مورسي، لويس (8 فبراير 2023). "التكيف الوراثي مع مسببات الأمراض وزيادة خطر الاضطرابات الالتهابية في أوروبا ما بعد العصر الحجري الحديث" . علم الجينوم الخلوي . 3 (2) 100248. دوى : 10.1016/j.xgen.2022.100248 . ISSN 2666-979X . بمك 9932995 . بميد 36819665 . S2CID 250341156 .    
  11. تعزيز أخلاقيات علم الجينوم القديم: لا ينبغي اعتبار بقايا الأجداد "قطعًا أثرية" بل أقاربًا بشريين يستحقون الاحترام - جيسيكا بارديل، أليسا سي. بادر، نانيبا أ. غاريسون، ديبورا أ. بولنيك، جينيفر أ. راف، أليكسا ووكر، ريبان س. مالهي، وائتلاف التدريب الصيفي للشعوب الأصلية في علم الجينوم (SING)