علم الجينوم

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 12 صور
الموسوعة الحرة

علم الجينوم هو مجال متعدد التخصصات في البيولوجيا الجزيئية ، يركز على بنية الجينوم ووظيفته وتطوره ورسم خرائطه وتعديله . الجينوم هو المجموعة الكاملة من الحمض النووي (DNA) للكائن الحي ، بما في ذلك جميع جيناته وتكوينه الهيكلي الهرمي ثلاثي الأبعاد. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] على عكس علم الوراثة ، الذي يُعنى بدراسة الجينات الفردية وأدوارها في الوراثة، يهدف علم الجينوم إلى التوصيف والقياس الكمي لجميع جينات الكائن الحي، وعلاقاتها المتبادلة وتأثيرها عليه. [ 4 ] قد توجه الجينات إنتاج البروتينات بمساعدة الإنزيمات وجزيئات الإشارة. بدورها، تُشكل البروتينات تراكيب الجسم كالأعضاء والأنسجة، كما تتحكم في التفاعلات الكيميائية وتنقل الإشارات بين الخلايا. يشمل علم الجينوم أيضًا تسلسل الجينومات وتحليلها باستخدام تقنيات تسلسل الحمض النووي عالية الإنتاجية والمعلوماتية الحيوية لتجميع وتحليل وظيفة وبنية الجينومات الكاملة. [ 5 ] [ 6 ] أدت التطورات في علم الجينوم إلى ثورة في البحث القائم على الاكتشاف وعلم الأحياء النظمي لتسهيل فهم حتى أكثر الأنظمة البيولوجية تعقيدًا مثل الدماغ. [ 7 ]

يشمل هذا المجال أيضاً دراسات الظواهر داخل الجينوم (داخل الجينوم) مثل التفاعل الجيني (تأثير جين واحد على آخر)، وتعدد التأثير الجيني (تأثير جين واحد على أكثر من صفة واحدة)، وقوة الهجين (قوة الهجين)، وغيرها من التفاعلات بين المواقع الجينية والأليلات داخل الجينوم. [ 8 ]

تاريخ

أصل الكلمة

من الكلمة اليونانية ΓΕΝ [ 9 ] gen ، وتعني "جين" (غاما، إبسيلون، نو، إبسيلون) بمعنى "يصير، يخلق، خلق، ولادة"، وما تلاها من صيغ: علم الأنساب، التكوين، علم الوراثة، جيني، جينومير، النمط الجيني، جنس، إلخ. بينما كانت كلمة جينوم (من الكلمة الألمانية Genom ، المنسوبة إلى هانز وينكلر ) مستخدمة في اللغة الإنجليزية منذ عام 1926، [ 10 ] فقد صاغ مصطلح علم الجينوم توم رودريك، عالم الوراثة في مختبر جاكسون ( بار هاربور، مين )، أثناء جلسة مع جيمس إي. ووماك ، وتوم شوز، وستيفن أوبراين في اجتماع عُقد في ماريلاند عام 1986 لمناقشة رسم خريطة الجينوم البشري. [ 11 ] في البداية كاسم لمجلة جديدة ، ثم كتخصص علمي جديد بالكامل. [ 12 ]

جهود التسلسل المبكر

بعد تأكيد روزاليند فرانكلين على البنية الحلزونية للحمض النووي DNA، [ 13 ] ونشر جيمس د. واتسون وفرانسيس كريك لبنية الحمض النووي DNA عام 1953، ونشر فريد سانجر لتسلسل الأحماض الأمينية للأنسولين عام 1955، أصبح تسلسل الأحماض النووية هدفًا رئيسيًا لعلماء الأحياء الجزيئية الأوائل . [ 14 ] في عام 1964، نشر روبرت و. هولي وزملاؤه أول تسلسل للأحماض النووية تم تحديده على الإطلاق، وهو تسلسل النيوكليوتيدات الريبية لحمض الألانين الناقل RNA . [ 15 ] [ 16 ] وتوسيعًا لهذا العمل، كشف مارشال نيرنبرغ وفيليب ليدر عن الطبيعة الثلاثية للشيفرة الوراثية ، وتمكنا من تحديد تسلسل 54 من أصل 64 كودونًا في تجاربهما. [ 17 ] في عام 1972، كان والتر فيرز وفريقه في مختبر البيولوجيا الجزيئية بجامعة غنت ( غنت ، بلجيكا ) أول من حدد تسلسل جين: جين البروتين الغلافي لفيروس العاثية MS2 . [ 18 ] توسع فريق فيرز في عملهم على البروتين الغلافي لفيروس MS2، فحددوا التسلسل النيوكليوتيدي الكامل لـ RNA الخاص بفيروس العاثية MS2 (الذي يشفر جينومه أربعة جينات فقط في 3569 زوجًا قاعديًا ) وفيروس القرود 40 في عامي 1976 و1978 على التوالي . [ 19 ] [ 20 ]

تم تطوير تقنية تسلسل الحمض النووي

فريدريك سانجر
والتر جيلبرت
تقاسم فريدريك سانجر ووالتر جيلبرت نصف جائزة نوبل في الكيمياء لعام 1980 لتطويرهما بشكل مستقل طرقًا لتسلسل الحمض النووي.

إضافةً إلى عمله الرائد في تسلسل الأحماض الأمينية للأنسولين، لعب فريدريك سانجر وزملاؤه دورًا محوريًا في تطوير تقنيات تسلسل الحمض النووي التي مكّنت من إنشاء مشاريع شاملة لتسلسل الجينوم. [ 8 ] في عام 1975، نشر هو وآلان كولسون إجراءً للتسلسل باستخدام بوليميراز الحمض النووي مع نيوكليوتيدات موسومة إشعاعيًا، أطلق عليه اسم تقنية "الزائد والناقص" . [ 21 ] [ 22 ] تضمنت هذه التقنية طريقتين متقاربتين تُنتجان قليل النيوكليوتيدات قصيرًا بنهايات 3' محددة. يمكن فصل هذه النيوكليوتيدات بالرحلان الكهربائي على هلام متعدد الأكريلاميد (يُسمى الرحلان الكهربائي على هلام متعدد الأكريلاميد) وتصويرها باستخدام التصوير الإشعاعي الذاتي. كان الإجراء قادرًا على تسلسل ما يصل إلى 80 نيوكليوتيدًا في خطوة واحدة، وكان بمثابة تحسن كبير، ولكنه كان لا يزال شاقًا للغاية. مع ذلك، تمكن فريقه في عام 1977 من تحديد تسلسل معظم النيوكليوتيدات البالغ عددها 5386 نيوكليوتيدًا من العاثية أحادية السلسلة φX174 ، مُكملين بذلك أول جينوم كامل التسلسل قائم على الحمض النووي. [ 23 ] أدى تحسين طريقة " الزائد والناقص" إلى ظهور طريقة إنهاء السلسلة، أو طريقة سانجر (انظر أدناه )، والتي شكلت أساس تقنيات تسلسل الحمض النووي، ورسم خرائط الجينوم، وتخزين البيانات، والتحليل المعلوماتي الحيوي، وهي التقنيات الأكثر استخدامًا على نطاق واسع خلال ربع القرن التالي من الأبحاث. [ 24 ] [ 25 ] في العام نفسه، طور والتر جيلبرت وآلان ماكسام من جامعة هارفارد بشكل مستقل طريقة ماكسام-جيلبرت (المعروفة أيضًا بالطريقة الكيميائية ) لتسلسل الحمض النووي، والتي تتضمن القطع التفضيلي للحمض النووي عند قواعد معروفة، وهي طريقة أقل كفاءة. [ 26 ] [ 27 ] لعملهم الرائد في تسلسل الأحماض النووية، تقاسم جيلبرت وسانجر نصف جائزة نوبل في الكيمياء لعام 1980 مع بول بيرج ( الحمض النووي المؤتلف ).

الجينومات الكاملة

أدى ظهور هذه التقنيات إلى تسارع كبير في نطاق وسرعة إنجاز مشاريع تسلسل الجينوم . وقد نُشر أول تسلسل جينومي كامل لعضية حقيقية النواة ، وهي الميتوكوندريا البشرية (16568 زوجًا قاعديًا، حوالي 16.6 كيلوبايت ) ، في عام 1981، [ 28 ] وتلاه أول تسلسل لجينومات البلاستيدات الخضراء في عام 1986. [ 29 ] [ 30 ] وفي عام 1992، تم تسلسل أول كروموسوم حقيقي النواة ، وهو الكروموسوم الثالث من خميرة البيرة Saccharomyces cerevisiae (315 كيلوبايت). [ 31 ] كان أول كائن حي حر المعيشة يتم تحديد تسلسله الجيني هو بكتيريا المستدمية النزلية (1.8 ميجابايت ) في عام 1995. [ 32 ] في العام التالي ، أعلن اتحاد من الباحثين من مختبرات في أمريكا الشمالية وأوروبا واليابان عن إتمام أول تسلسل جينومي كامل لكائن حقيقي النواة، وهو الخميرة (12.1 ميجابايت)، ومنذ ذلك الحين استمر تحديد تسلسل الجينومات بوتيرة متسارعة. [ 33 ] اعتبارًا من أكتوبر 2011 تتوفر التسلسلات الكاملة لما يلي: 2719 فيروسًا ، و1115 من العتائق والبكتيريا ، و36 من حقيقيات النوى ، نصفها تقريبًا من الفطريات . [ 34 ] [ 35 ]

رسم بياني على شكل "عصا الهوكي" يوضح النمو الأسي لقواعد بيانات التسلسل العامة.
ازداد عدد مشاريع الجينوم مع استمرار التحسينات التكنولوجية في خفض تكلفة التسلسل. (أ) النمو المتسارع لقواعد بيانات تسلسل الجينوم منذ عام ١٩٩٥. (ب) تكلفة تسلسل مليون قاعدة بالدولار الأمريكي. (ج) تكلفة تسلسل جينوم بحجم ٣٠٠٠ ميجابايت (بحجم جينوم الإنسان) على مقياس لوغاريتمي بالدولار الأمريكي.

معظم الكائنات الدقيقة التي تم تحديد تسلسل جينوماتها بالكامل هي مسببات أمراض معقدة ، مثل المستدمية النزلية ، مما أدى إلى تحيز واضح في توزيعها التطوري مقارنةً باتساع التنوع الميكروبي. [ 36 ] [ 37 ] أما الأنواع الأخرى التي تم تحديد تسلسل جينوماتها، فقد تم اختيار معظمها لكونها كائنات نموذجية مدروسة جيدًا أو واعدة بأن تصبح نماذج جيدة. لطالما كانت الخميرة ( Saccharomyces cerevisiae ) كائنًا نموذجيًا مهمًا للخلايا حقيقية النواة ، بينما كانت ذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster) أداة بالغة الأهمية (خاصةً في المراحل المبكرة من علم الوراثة ما قبل الجزيئية ). تُعد دودة Caenorhabditis elegans نموذجًا بسيطًا يُستخدم غالبًا للكائنات متعددة الخلايا . تُستخدم سمكة الزيبرا (Brachydanio rerio) في العديد من الدراسات التطورية على المستوى الجزيئي، ويُعد نبات Arabidopsis thaliana كائنًا نموذجيًا للنباتات المزهرة. تُعدّ سمكة البخاخ اليابانية ( Takifugu rubripes ) وسمكة البخاخ الخضراء المرقطة ( Tetraodon nigroviridis ) مثيرتين للاهتمام نظرًا لصغر حجم جينوماتهما وكثافتها، والتي تحتوي على كمية ضئيلة جدًا من الحمض النووي غير المشفر مقارنةً بمعظم الأنواع. [ 38 ] [ 39 ] أما الثدييات، كالكلب ( Canis familiaris ) [ 40 ] والجرذ البني ( Rattus norvegicus ) والفأر ( Mus musculus ) والشمبانزي ( Pan troglodytes )، فتُعتبر جميعها حيوانات نموذجية مهمة في البحوث الطبية. [ 27 ]

أُنجزت مسودة أولية للجينوم البشري من قِبل مشروع الجينوم البشري في أوائل عام 2001، ما أثار ضجة كبيرة. [ 41 ] وقد اكتمل هذا المشروع في عام 2003، حيث تم فيه تسلسل الجينوم الكامل لشخص واحد، وبحلول عام 2007 أُعلن عن اكتمال هذا التسلسل (بأقل من خطأ واحد لكل 20,000 قاعدة، وتجميع جميع الكروموسومات). [ 41 ] وفي السنوات اللاحقة، تم تسلسل جينومات العديد من الأفراد الآخرين، جزئيًا تحت رعاية مشروع الألف جينوم ، الذي أعلن عن تسلسل 1,092 جينومًا في أكتوبر 2012. [ 42 ] وقد أُتيح إنجاز هذا المشروع بفضل تطوير تقنيات تسلسل أكثر كفاءة بشكل كبير، وتطلب تخصيص موارد معلوماتية حيوية كبيرة من تعاون دولي واسع النطاق. [ 43 ] إن استمرار تحليل البيانات الجينومية البشرية له تداعيات سياسية واجتماعية عميقة على المجتمعات البشرية. [ 44 ]

ثورة "الأوميكس"

مخطط عام يوضح العلاقات بين الجينوم ، والترانسكريبتوم ، والبروتيوم ، والميتابولوم ( الليبيدوم )

يشير مصطلح " omics" الإنجليزي الجديد ، بشكل غير رسمي، إلى مجال دراسي في علم الأحياء ينتهي بـ "-omics" ، مثل علم الجينوم، وعلم البروتينات ، وعلم الأيض . ويُستخدم اللاحق " -ome" للإشارة إلى موضوعات الدراسة في هذه المجالات، مثل الجينوم ، والبروتيوم ، والأيض ( أو الليبيدوم ) على التوالي. ويشير اللاحق "-ome" في علم الأحياء الجزيئي إلى الكلّية ؛ وبالمثل، أصبح مصطلح "omics" يُشير عمومًا إلى دراسة مجموعات البيانات البيولوجية الكبيرة والشاملة. وبينما دفع تزايد استخدام هذا المصطلح بعض العلماء ( جوناثان آيزن ، وآخرون [ 45 ] ) إلى الادعاء بأنه قد أُفرط في استخدامه، [ 46 ] فإنه يعكس التحول في التوجه نحو التحليل الكمي للتشكيلة الكاملة أو شبه الكاملة لجميع مكونات النظام. [ 47 ] في دراسة التكافل ، على سبيل المثال، أصبح بإمكان الباحثين الذين كانوا يقتصرون في السابق على دراسة منتج جيني واحد، الآن مقارنة المجموعة الكاملة من عدة أنواع من الجزيئات البيولوجية في آن واحد. [ 48 ] [ 49 ]

تحليل الجينوم

بعد اختيار الكائن الحي، تتضمن مشاريع الجينوم ثلاثة مكونات: تسلسل الحمض النووي، وتجميع هذا التسلسل لإنشاء تمثيل للكروموسوم الأصلي، وشرح وتحليل هذا التمثيل. [ 8 ]

نظرة عامة على مشروع الجينوم. أولًا، يجب اختيار الجينوم، وهو ما ينطوي على عدة عوامل منها التكلفة والأهمية. ثانيًا، يتم توليد التسلسل وتجميعه في مركز تسلسل محدد (مثل BGI أو DOE JGI ). ثالثًا، يتم شرح تسلسل الجينوم على مستويات متعددة: الحمض النووي، والبروتين، ومسارات الجينات، أو بشكل مقارن.

التسلسل

تاريخيًا، كان تسلسل الجينوم يُجرى في مراكز متخصصة ، وهي مرافق مركزية (تتراوح بين مؤسسات مستقلة كبيرة مثل معهد الجينوم المشترك الذي يُجري تسلسل عشرات التيرابايتات سنويًا، إلى مرافق البيولوجيا الجزيئية المحلية) تضم مختبرات بحثية مزودة بالأجهزة المتطورة والدعم التقني اللازم. ومع استمرار تطور تقنية التسلسل، أصبح جيل جديد من أجهزة التسلسل المكتبية الفعالة وسريعة الإنجاز في متناول المختبرات الأكاديمية. [ 50 ] [ 51 ] وبشكل عام، تنقسم أساليب تسلسل الجينوم إلى فئتين رئيسيتين: التسلسل العشوائي (Shotgun ) والتسلسل عالي الإنتاجية (أو تسلسل الجيل التالي ). [ 8 ]

تسلسل البندقية

جهاز تحليل جيني ABI PRISM 3100. وقد ساهمت هذه الأجهزة ذات التسلسل الشعيري في أتمتة جهود تسلسل الجينوم واسعة النطاق في المراحل المبكرة.

يُعدّ تسلسل الشوتجن طريقةً لتحليل تسلسلات الحمض النووي التي يزيد طولها عن 1000 زوج قاعدي، بما في ذلك الكروموسومات الكاملة. [ 52 ] وقد سُمّي بهذا الاسم تشبيهًا بنمط إطلاق النار العشوائي شبه الكامل لبندقية الصيد . ولأنّ تسلسل الرحلان الكهربائي الهلامي لا يُستخدم إلا مع التسلسلات القصيرة نسبيًا (من 100 إلى 1000 زوج قاعدي)، يجب تقسيم تسلسلات الحمض النووي الأطول إلى أجزاء صغيرة عشوائية، ثمّ يتمّ تسلسلها للحصول على قراءات . ويتمّ الحصول على قراءات متداخلة متعددة للحمض النووي المستهدف من خلال إجراء عدّة جولات من التجزئة والتسلسل. ثمّ تستخدم برامج الحاسوب النهايات المتداخلة للقراءات المختلفة لتجميعها في تسلسل متصل. [ 52 ] [ 53 ] يُعدّ تسلسل الشوتجن عملية أخذ عينات عشوائية، تتطلّب أخذ عينات زائدة لضمان تمثيل نيوكليوتيد مُعيّن في التسلسل المُعاد بناؤه. يُشار إلى متوسط ​​عدد القراءات التي يتم من خلالها أخذ عينات زائدة من الجينوم باسم التغطية . [ 54 ]

لطالما اعتمدت تقنية تسلسل الحمض النووي العشوائي (Shotgun) على طريقة إنهاء السلسلة الكلاسيكية، أو ما يُعرف بـ" طريقة سانجر "، والتي تقوم على دمج ثنائي ديوكسي نيوكليوتيدات إنهاء السلسلة بشكل انتقائي بواسطة بوليميراز الحمض النووي أثناء تضاعف الحمض النووي في المختبر . [ 23 ] [ 55 ] في الآونة الأخيرة، حلت طرق التسلسل عالية الإنتاجية محل تقنية التسلسل العشوائي، لا سيما في تحليلات الجينوم الآلية واسعة النطاق . ومع ذلك، لا تزال طريقة سانجر مستخدمة على نطاق واسع، وخاصة في المشاريع الصغيرة وللحصول على قراءات متجاورة طويلة جدًا من تسلسل الحمض النووي (>500 نيوكليوتيد). [ 56 ] تتطلب طرق إنهاء السلسلة قالبًا من الحمض النووي أحادي السلسلة، وبادئًا للحمض النووي، وبوليميراز الحمض النووي ، ونيوكليوتيدات ديوكسي نيوكليوتيدات ثلاثية الفوسفات (dNTPs) عادية، ونيوكليوتيدات معدلة (ثنائي ديوكسي نيوكليوتيدات ثلاثية الفوسفات) تُنهي استطالة سلسلة الحمض النووي. تفتقر هذه النيوكليوتيدات المُنهية للسلسلة إلى مجموعة 3'- OH اللازمة لتكوين رابطة فوسفودايستر بين نيوكليوتيدين، مما يؤدي إلى توقف بوليميراز الحمض النووي عن استطالة الحمض النووي عند دمج ddNTP. يمكن وسم ddNTPs إشعاعيًا أو فلوريًا للكشف عنها في أجهزة تسلسل الحمض النووي . [ 8 ] عادةً، تستطيع هذه الأجهزة تسلسل ما يصل إلى 96 عينة من الحمض النووي في دفعة واحدة (تشغيل) في ما يصل إلى 48 تشغيلًا يوميًا. [ 57 ]

التسلسل عالي الإنتاجية

أدى الطلب المتزايد على تقنيات التسلسل منخفضة التكلفة إلى تطوير تقنيات التسلسل عالية الإنتاجية التي تُجري عملية التسلسل بالتوازي ، مما يُنتج آلافًا أو ملايين التسلسلات دفعة واحدة. [ 58 ] [ 59 ] يهدف التسلسل عالي الإنتاجية إلى خفض تكلفة تسلسل الحمض النووي إلى ما هو أبعد من الممكن تحقيقه باستخدام طرق إنهاء الصبغة التقليدية. في التسلسل فائق الإنتاجية، يمكن تشغيل ما يصل إلى 500,000 عملية تسلسل بالتخليق بالتوازي. [ 60 ] [ 61 ]

نظام تحليل الجينوم Illumina Genome Analyzer II. لقد وضعت تقنيات Illumina معيارًا للتسلسل المتوازي عالي الإنتاجية. [ 50 ]

تعتمد طريقة تسلسل الصبغة من Illumina على مُنهيات الصبغة العكسية، وقد طُوّرت عام 1996 في معهد جنيف للأبحاث الطبية الحيوية على يد باسكال ماير ولوران فارينيلي. [ 62 ] في هذه الطريقة، تُثبّت جزيئات الحمض النووي والبادئات أولًا على شريحة، ثم تُضخّم باستخدام إنزيم البوليميراز لتكوين مستعمرات استنساخية محلية، سُمّيت في البداية "مستعمرات الحمض النووي". ولتحديد التسلسل، تُضاف أربعة أنواع من قواعد الإنهاء العكسية (قواعد RT)، وتُزال النيوكليوتيدات غير المُدمجة بالغسل. على عكس التسلسل الناري، تُمدّد سلاسل الحمض النووي نيوكليوتيدًا واحدًا في كل مرة، ويمكن التقاط الصور في لحظة متأخرة، مما يسمح بالتقاط مصفوفات كبيرة جدًا من مستعمرات الحمض النووي من خلال صور متسلسلة مُلتقطة بكاميرا واحدة. يتيح فصل التفاعل الإنزيمي عن التقاط الصور إنتاجية مثالية وقدرة تسلسل غير محدودة نظريًا. مع التكوين الأمثل، تعتمد الإنتاجية القصوى للجهاز فقط على معدل تحويل الإشارة التناظرية إلى الرقمية للكاميرا. تلتقط الكاميرا صورًا للنيوكليوتيدات الموسومة بالفلورة ، ثم تُزال الصبغة مع حاجب الطرف 3' كيميائيًا من الحمض النووي، مما يسمح بالدورة التالية. [ 63 ]

يعتمد أسلوب بديل، وهو تسلسل أشباه الموصلات الأيونية، على كيمياء تضاعف الحمض النووي القياسية. تقيس هذه التقنية إطلاق أيون هيدروجين في كل مرة يتم فيها دمج قاعدة. يتم ملء بئر دقيق يحتوي على قالب الحمض النووي بنوكليوتيد واحد ، فإذا كان هذا النوكليوتيد مكملاً لسلسلة القالب، فسيتم دمجه وسيتم إطلاق أيون هيدروجين. يؤدي هذا الإطلاق إلى تشغيل مستشعر أيوني من نوع ISFET . في حال وجود متجانس بوليمر في تسلسل القالب، فسيتم دمج عدة نيوكليوتيدات في دورة ملء واحدة، وستكون الإشارة الكهربائية المكتشفة أعلى نسبيًا. [ 64 ]

حَشد

تشكل القراءات المتداخلة أجزاءً متصلة؛ وتشكل الأجزاء المتصلة والفجوات ذات الطول المعروف سقالات.
تمت مطابقة قراءات النهاية المزدوجة لبيانات التسلسل من الجيل التالي مع جينوم مرجعي.
يجب تجميع قراءات التسلسل المتعددة والمجزأة معًا على أساس مناطق التداخل الخاصة بها.

يشير تجميع التسلسل إلى محاذاة ودمج أجزاء من تسلسل DNA أطول بكثير لإعادة بناء التسلسل الأصلي. [ 8 ] هذا ضروري لأن تقنية تسلسل DNA الحالية لا تستطيع قراءة الجينومات الكاملة كتسلسل متصل، بل تقرأ أجزاءً صغيرة تتراوح بين 20 و1000 قاعدة، وذلك حسب التقنية المستخدمة. تُنتج تقنيات التسلسل من الجيل الثالث، مثل PacBio أو Oxford Nanopore، قراءات تسلسلية بطول 10-100 كيلوبايت بشكل روتيني؛ ومع ذلك، فإن معدل الخطأ فيها مرتفع ويبلغ حوالي 1%. [ 65 ] [ 66 ] عادةً ما تنتج الأجزاء القصيرة، التي تُسمى قراءات، من تسلسل الحمض النووي الجينومي بتقنية التسلسل العشوائي ، أو من نسخ الجينات ( ESTs ). [ 8 ]

أساليب التجميع

يمكن تصنيف عملية التجميع الجيني بشكل عام إلى منهجين رئيسيين: التجميع من الصفر ، للجينومات التي لا تشبه أي جينوم تم تسلسله سابقًا، والتجميع المقارن، الذي يستخدم التسلسل الموجود لكائن حي وثيق الصلة كمرجع أثناء التجميع. [ 54 ] بالمقارنة مع التجميع المقارن، يُعد التجميع من الصفر صعبًا حسابيًا ( NP-hard )، مما يجعله أقل ملاءمة لتقنيات التسلسل الجيني من الجيل التالي ذات القراءات القصيرة. ضمن نموذج التجميع من الصفر، توجد استراتيجيتان أساسيتان للتجميع: استراتيجيات المسار الأويلري، واستراتيجيات التوافق في التخطيط المتداخل (OLC). تحاول استراتيجيات OLC في النهاية إنشاء مسار هاميلتوني عبر رسم بياني متداخل، وهي مشكلة NP-hard. أما استراتيجيات المسار الأويلري فهي أسهل حسابيًا لأنها تحاول إيجاد مسار أويلري عبر رسم بياني دي بروين. [ 54 ]

التشطيب

تُعرَّف الجينومات المكتملة بأنها تحتوي على تسلسل متصل واحد بدون أي غموض يمثل كل نسخة متماثلة . [ 67 ]

شرح

لا يُعد تجميع تسلسل الحمض النووي وحده ذا قيمة تُذكر دون تحليل إضافي. [ 8 ] تُعرف عملية ترميز الجينوم بأنها عملية ربط المعلومات البيولوجية بالتسلسلات ، وتتكون من ثلاث خطوات رئيسية: [ 68 ]

  1. تحديد أجزاء الجينوم التي لا تشفر البروتينات
  2. تحديد العناصر الموجودة على الجينوم ، وهي عملية تسمى التنبؤ الجيني ، و
  3. ربط المعلومات البيولوجية بهذه العناصر.

تحاول أدوات التعليق التلقائي تنفيذ هذه الخطوات باستخدام المحاكاة الحاسوبية ، على عكس التعليق اليدوي (المعروف أيضًا بالتنسيق) الذي يتطلب خبرة بشرية وإمكانية التحقق التجريبي. [ 69 ] من الناحية المثالية، تتعايش هذه الأساليب وتكمل بعضها البعض في نفس مسار التعليق (انظر أيضًا أدناه ).

تقليديًا، يعتمد المستوى الأساسي للترميز على استخدام برنامج BLAST لإيجاد أوجه التشابه، ثم ترميز الجينومات بناءً على الجينات المتماثلة. [ 8 ] ومؤخرًا، أُضيفت معلومات إضافية إلى منصة الترميز. تُمكّن هذه المعلومات الإضافية المُرمِّزين اليدويين من فكّ التناقضات بين الجينات التي تحمل نفس الترميز. تستخدم بعض قواعد البيانات معلومات سياق الجينوم، ودرجات التشابه، والبيانات التجريبية، وتكامل موارد أخرى لتوفير ترميزات الجينوم من خلال منهجية الأنظمة الفرعية. بينما تعتمد قواعد بيانات أخرى (مثل Ensembl ) على مصادر بيانات مُنسَّقة، بالإضافة إلى مجموعة من أدوات البرمجيات في مسار ترميز الجينوم الآلي. [ 70 ] يتضمن الترميز البنيوي تحديد العناصر الجينومية، وخاصةً إطارات القراءة المفتوحة (ORFs) ومواقعها، أو بنية الجين. أما الترميز الوظيفي فيتضمن ربط المعلومات البيولوجية بالعناصر الجينومية.

خطوط أنابيب التسلسل وقواعد البيانات

إن الحاجة إلى إمكانية التكرار والإدارة الفعالة للكمية الكبيرة من البيانات المرتبطة بمشاريع الجينوم تعني أن خطوط المعالجة الحاسوبية لها تطبيقات مهمة في علم الجينوم. [ 71 ]

مجالات البحث

علم الجينوم الوظيفي

علم الجينوم الوظيفي هو فرع من فروع البيولوجيا الجزيئية يسعى إلى الاستفادة من الكم الهائل من البيانات الناتجة عن مشاريع الجينوم (مثل مشاريع تسلسل الجينوم ) لوصف وظائف الجينات ( والبروتينات ) وتفاعلاتها. يركز علم الجينوم الوظيفي على الجوانب الديناميكية، مثل نسخ الجينات وترجمتها وتفاعلات البروتين-بروتين ، بدلاً من الجوانب الثابتة للمعلومات الجينومية، مثل تسلسل الحمض النووي أو بنيته. ويسعى هذا العلم إلى الإجابة عن تساؤلات حول وظيفة الحمض النووي على مستوى الجينات، ونسخ الحمض النووي الريبوزي، والبروتينات الناتجة. ومن السمات الرئيسية لدراسات علم الجينوم الوظيفي اعتمادها على منهجية شاملة للجينوم للإجابة عن هذه التساؤلات، والتي تتضمن عادةً استخدام أساليب عالية الإنتاجية بدلاً من المنهجية التقليدية التي تعتمد على دراسة كل جين على حدة.

لا يزال فرع رئيسي من علم الجينوم معنيًا بتسلسل جينومات الكائنات الحية المختلفة، إلا أن معرفة الجينومات الكاملة قد أتاحت المجال لعلم الجينوم الوظيفي ، الذي يهتم بشكل أساسي بأنماط التعبير الجيني في ظل ظروف مختلفة. وتُعد المصفوفات الدقيقة والمعلوماتية الحيوية من أهم الأدوات في هذا المجال .

علم الجينوم البنيوي

مثال على بنية بروتين تم تحديدها بواسطة مركز الغرب الأوسط لعلم الجينوم البنيوي

يسعى علم الجينوم البنيوي إلى وصف البنية ثلاثية الأبعاد لكل بروتين مُشفَّر بواسطة جينوم مُحدد . [ 72 ] [ 73 ] يتيح هذا النهج القائم على الجينوم طريقة عالية الإنتاجية لتحديد البنية من خلال الجمع بين الأساليب التجريبية والنمذجة . ويكمن الفرق الرئيسي بين علم الجينوم البنيوي والتنبؤ البنيوي التقليدي في أن علم الجينوم البنيوي يحاول تحديد بنية كل بروتين مُشفَّر بواسطة الجينوم، بدلاً من التركيز على بروتين واحد مُحدد. ومع توفر تسلسلات الجينوم الكاملة، يُمكن إجراء التنبؤ بالبنية بسرعة أكبر من خلال الجمع بين الأساليب التجريبية والنمذجة، خاصةً وأن توفر أعداد كبيرة من الجينومات المُتسلسلة وبنى البروتينات التي تم حلها سابقًا يسمح للعلماء بنمذجة بنية البروتين على بنى المتماثلات التي تم حلها سابقًا. يتضمن علم الجينوم البنيوي اتباع عدد كبير من مناهج تحديد البنية، بما في ذلك الأساليب التجريبية باستخدام تسلسلات الجينوم أو الأساليب القائمة على النمذجة التي تعتمد على التشابه التسلسلي أو البنيوي مع بروتين ذي بنية معروفة أو التي تعتمد على المبادئ الكيميائية والفيزيائية لبروتين ليس له تشابه مع أي بنية معروفة. على عكس علم الأحياء البنيوي التقليدي ، فإن تحديد بنية البروتين من خلال جهود علم الجينوم البنيوي غالبًا (ولكن ليس دائمًا) يسبق معرفة أي شيء عن وظيفة البروتين. وهذا يطرح تحديات جديدة في المعلوماتية الحيوية البنيوية ، أي تحديد وظيفة البروتين من بنيته ثلاثية الأبعاد . [ 74 ]

علم التخلق

علم التخلق هو دراسة المجموعة الكاملة من التعديلات فوق الجينية على المادة الوراثية للخلية، والمعروفة باسم الجينوم فوق الجيني . [ 75 ] التعديلات فوق الجينية هي تعديلات قابلة للعكس على الحمض النووي أو الهستونات في الخلية، وتؤثر على التعبير الجيني دون تغيير تسلسل الحمض النووي (راسل 2010، ص  475). من أبرز التعديلات فوق الجينية التي تم توصيفها مثيلة الحمض النووي وتعديل الهستونات . [ 76 ] تلعب التعديلات فوق الجينية دورًا هامًا في التعبير الجيني وتنظيمه، وتشارك في العديد من العمليات الخلوية، مثل التمايز/النمو [ 77 ] وتكوّن الأورام . [ 75 ] لم تُصبح دراسة علم التخلق على المستوى الشامل ممكنة إلا مؤخرًا من خلال تكييف فحوصات الجينوم عالية الإنتاجية. [ 78 ]

علم الجينوم البيئي

يُعدّ تسلسل الحمض النووي البيئي (ESS) تقنية أساسية في علم الجينوم البيئي. (أ) أخذ العينات من الموطن؛ (ب) ترشيح الجزيئات، عادةً حسب الحجم؛ (ج) التحلل واستخلاص الحمض النووي؛ (د) الاستنساخ وبناء المكتبة؛ (هـ) تسلسل المستنسخات؛ (و) تجميع التسلسل في قطع متجاورة وهياكل.

علم الميتاجينوميات هو دراسة الميتاجينومات ، وهي المادة الوراثية المستخلصة مباشرة من العينات البيئية . ويُشار إلى هذا المجال الواسع أيضًا باسم علم الجينوم البيئي، أو علم الجينوم البيئي، أو علم جينوم المجتمعات. في حين أن علم الأحياء الدقيقة التقليدي وتسلسل الجينوم الميكروبي يعتمدان على مزارع استنساخية مُستزرعة ، فقد استنسخت تقنيات تسلسل الجينات البيئية المبكرة جينات محددة (غالبًا جين 16S rRNA ) لإنتاج صورة شاملة للتنوع في عينة طبيعية. وكشفت هذه الدراسات أن الغالبية العظمى من التنوع البيولوجي الميكروبي لم تُكتشف بالطرق القائمة على الاستزراع . [ 79 ] تستخدم الدراسات الحديثة تقنية تسلسل سانجر "الشاملة" أو تقنية التسلسل الناري المتوازي على نطاق واسع للحصول على عينات غير متحيزة إلى حد كبير من جميع الجينات من جميع أفراد المجتمعات المأخوذة منها العينات. [ 80 ] نظرًا لقدرته على الكشف عن التنوع الخفي سابقًا للحياة المجهرية، يوفر علم الميتاجينوميات منظورًا قويًا لفهم العالم الميكروبي، مما يُمكّنه من إحداث ثورة في فهمنا للعالم الحي بأكمله. [ 81 ] [ 82 ]

أنظمة النماذج

الفيروسات والبكتيريوفاجات

لعبت العاثيات البكتيرية، ولا تزال تلعب، دورًا محوريًا في علم الوراثة البكتيرية وعلم الأحياء الجزيئي . تاريخيًا، استُخدمت لتحديد بنية الجينات وتنظيمها. كما أن أول جينوم تم تسلسله كان جينوم عاثية بكتيرية . مع ذلك، لم تُسهم أبحاث العاثيات البكتيرية في إحداث ثورة في علم الجينوم، الذي يهيمن عليه علم الجينوم البكتيري بشكل واضح. لم يبرز الاهتمام بدراسة جينومات العاثيات البكتيرية إلا مؤخرًا، مما مكّن الباحثين من فهم الآليات الكامنة وراء تطور العاثيات . يمكن الحصول على تسلسلات جينوم العاثيات البكتيرية من خلال التسلسل المباشر للعاثيات المعزولة، ولكن يمكن أيضًا استخلاصها كجزء من الجينومات الميكروبية. وقد أظهر تحليل الجينومات البكتيرية أن كمية كبيرة من الحمض النووي الميكروبي تتكون من تسلسلات العاثيات الأولية وعناصر شبيهة بها. [ 83 ] يوفر التنقيب المفصل في قواعد البيانات لهذه التسلسلات رؤى ثاقبة حول دور الطليعة الفيروسية في تشكيل الجينوم البكتيري: بشكل عام، أكدت هذه الطريقة العديد من مجموعات العاثيات البكتيرية المعروفة، مما يجعلها أداة مفيدة للتنبؤ بعلاقات الطليعة الفيروسية من الجينومات البكتيرية. [ 84 ] [ 85 ]

البكتيريا الزرقاء

يوجد حاليًا 24 نوعًا من البكتيريا الزرقاء التي تتوفر لها تسلسلات جينومية كاملة. 15 منها من البيئة البحرية، وهي ست سلالات من جنس Prochlorococcus ، وسبع سلالات بحرية من جنس Synechococcus ، بالإضافة إلى Trichodesmium erythraeum IMS101 و Crocosphaera watsonii WH8501 . وقد أظهرت العديد من الدراسات كيف يمكن استخدام هذه التسلسلات بنجاح كبير لاستنتاج خصائص بيئية وفيزيولوجية مهمة للبكتيريا الزرقاء البحرية. ومع ذلك، هناك العديد من مشاريع الجينوم الأخرى قيد التنفيذ حاليًا، من بينها عزلات إضافية من Prochlorococcus و Synechococcus البحرية ، و Acaryochloris و Prochloron ، والبكتيريا الزرقاء الخيطية المثبتة للنيتروجين Nodularia spumigena و Lyngbya aestuarii و Lyngbya majuscula ، فضلًا عن العاثيات التي تصيب البكتيريا الزرقاء البحرية. وبالتالي، يمكن الاستفادة من الكم المتزايد من معلومات الجينوم بطريقة أعم لمعالجة المشكلات العالمية من خلال تطبيق منهج مقارن. ومن الأمثلة الجديدة والمثيرة للتقدم في هذا المجال تحديد جينات الحمض النووي الريبوزي التنظيمي، وفهم الأصل التطوري لعملية التمثيل الضوئي ، وتقدير مساهمة النقل الأفقي للجينات في الجينومات التي تم تحليلها. [ 86 ]

التطبيقات

مخطط كروموسومي بشري، يقدم نظرة عامة مبسطة على الجينوم البشري. وهو تمثيل بياني للنمط الكروموسومي الثنائي المثالي للإنسان ، مع توضيح النطاقات والنطاقات الفرعية . يُظهر المخطط المناطق الداكنة والبيضاء على نطاق G. كل صف محاذٍ عموديًا عند مستوى السنترومير . يُظهر المخطط 22 زوجًا من الكروموسومات الجسدية المتماثلة ، بما في ذلك النسختين الأنثوية (XX) والذكرية (XY) من الكروموسومين الجنسيين ، بالإضافة إلى جينوم الميتوكوندريا (أسفل اليسار).

لقد وفر علم الجينوم تطبيقات في العديد من المجالات، بما في ذلك الطب والتكنولوجيا الحيوية وعلم الإنسان والعلوم الاجتماعية الأخرى . [ 44 ]

الطب الجينومي

تتيح تقنيات الجينوم من الجيل التالي للأطباء والباحثين في مجال الطب الحيوي زيادة كمية البيانات الجينومية التي يتم جمعها من مجموعات دراسية كبيرة بشكل كبير. [ 87 ] وعند دمجها مع مناهج المعلوماتية الحيوية الجديدة التي تدمج أنواعًا متعددة من البيانات مع البيانات الجينومية في أبحاث الأمراض، فإن ذلك يسمح للباحثين بفهم أفضل للأسس الجينية للاستجابة للأدوية والأمراض. [ 88 ] [ 89 ]

تشمل الجهود المبكرة لتطبيق علم الجينوم في الطب جهود فريق من كلية الطب في ويسكونسن بقيادة هوارد جاكوب، الذي طور أولى الأدوات للتفسير الطبي لكل من الإكسوم والجينوم البشري الكامل في عام 2009 [ 90 ] [ 91 ] . وفي الوقت نفسه، كان فريق من جامعة ستانفورد بقيادة إيوان آشلي يعمل أيضًا على تطوير أدوات للتفسير الطبي للجينوم البشري [ 92 ] [ 93 ] [ 94 ]. تأسس برنامج أبحاث Genomes2People في مستشفى بريغهام والنساء ، ومعهد برود ، وكلية الطب بجامعة هارفارد في عام 2012 لإجراء بحوث تجريبية في ترجمة علم الجينوم إلى مجال الصحة. افتتح مستشفى بريغهام والنساء عيادة علم الجينوم الوقائي في أغسطس 2019، وتبعه مستشفى ماساتشوستس العام بعد شهر. [ 95 ] [ 96 ] يهدف برنامج أبحاث "كلنا" إلى جمع بيانات تسلسل الجينوم من مليون مشارك ليصبح مكونًا أساسيًا في منصة أبحاث الطب الدقيق [ 97 ] ، وقد درست مبادرة البنك الحيوي في المملكة المتحدة أكثر من 500 ألف فرد ببيانات جينومية وظاهرية معمقة. [ 98 ]

البيولوجيا التركيبية والهندسة الحيوية

أتاح نمو المعرفة الجينومية تطبيقات متطورة بشكل متزايد لعلم الأحياء التركيبي . [ 99 ] في عام 2010، أعلن باحثون في معهد جيه كريج فينتر عن إنشاء نوع من البكتيريا شبه التركيبية ، يُدعى ميكوبلازما لابوراتوريوم ، مشتق من جينوم ميكوبلازما جينيتاليوم . [ 100 ]

علم الجينوم السكاني والحفظ

تطورت علم جينوم السكان ليصبح مجالًا بحثيًا شائعًا، حيث تُستخدم فيه تقنيات تسلسل الجينوم لإجراء مقارنات واسعة النطاق لتسلسلات الحمض النووي بين المجموعات السكانية، متجاوزةً بذلك حدود المؤشرات الجينية مثلمنتجات تفاعل البوليميراز المتسلسل قصير المدى أو المؤشرات الميكروساتلية المستخدمة تقليديًا في علم الوراثة السكانية . يدرس علم جينوم السكان التأثيرات على مستوى الجينوم لتحسين فهمنا للتطور الدقيق، ما يُتيح لنا معرفةالتاريخ التطوري والتركيبة السكانية. [ 101 ] تُستخدم أساليب علم جينوم السكان في العديد من المجالات المختلفة، بما في ذلك علم الأحياء التطوري ، وعلم البيئة ، والجغرافيا الحيوية ، وعلم الأحياء الحفظي ، وإدارة مصايد الأسماك . وبالمثل،تطور علم جينوم المناظر الطبيعية من علم وراثة المناظر الطبيعية، ليستخدم الأساليب الجينومية في تحديد العلاقات بين أنماط التباين البيئي والجيني.

يستطيع دعاة الحفاظ على البيئة استخدام المعلومات التي يتم جمعها من خلال التسلسل الجينومي لتقييم العوامل الوراثية الرئيسية لحماية الأنواع بشكل أفضل، مثل التنوع الجيني للسكان أو ما إذا كان الفرد يحمل نسخة واحدة من جين اضطراب وراثي متنحي. [ 102 ] وباستخدام البيانات الجينومية لتقييم آثار العمليات التطورية والكشف عن أنماط التباين في جميع أنحاء السكان، يستطيع دعاة الحفاظ على البيئة وضع خطط لمساعدة نوع معين مع تقليل عدد المتغيرات المجهولة مقارنةً بالأساليب الجينية التقليدية . [ 103 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ ساتزينجر هـ (مارس 2008). " ثيودور ومارسيلا بوفيري: الكروموسومات والسيتوبلازم في الوراثة والتطور". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 9 (3): 231-238 . doi : 10.1038/nrg2311 . PMID 18268510. S2CID 15829893 .  
  2. ↑ كريمر تي، كريمر سي (2006). "صعود وسقوط وعودة مناطق الكروموسومات: منظور تاريخي. الجزء الأول: صعود مناطق الكروموسومات". المجلة الأوروبية لعلم الأنسجة . 50 (3): 161-176 . PMID 16920639 . 
  3. ↑ روسي، إم جيه؛ كونتال، بي كيه؛ لاي، دبليو كيه إم؛ يامادا، إن؛ بادجاتيا، إن؛ ميتال، سي؛ كوزو، جي؛ بوكلوند، كيه؛ فاريل، إن بي؛ بلاندا، تي آر؛ مايروز، جيه دي؛ باستينغ، إيه في؛ ميستريتا، كيه إس؛ روكو، دي جيه؛ بيركنسون، إي إس؛ كيلوغ، جي دي؛ ماهوني، إس؛ بو، بي إف (مارس 2021). "بنية بروتينية عالية الدقة لجينوم الخميرة المتبرعمة" . نيتشر . 592 (7853): 309-314 . Bibcode : 2021Natur.592..309R . doi : 10.1038/s41586-021-03314-8 . PMC 8035251 . PMID 33692541 .  
  4. ↑ "تعريفات منظمة الصحة العالمية لعلم الوراثة وعلم الجينوم" . منظمة الصحة العالمية. مؤرشف من الأصل في 30 يونيو 2004.
  5. ↑ مفاهيم علم الوراثة ( الطبعة العاشرة). سان فرانسيسكو: بيرسون للتعليم. 2012. ISBN  978-0-321-72412-0.
  6. ↑ كولفر، ك. و.، ولابو، م. أ. (8 نوفمبر 2002). "علم الجينوم" . في روبنسون، ر. (محرر). علم الوراثة . مكتبة ماكميلان للعلوم. مرجع ماكميلان الولايات المتحدة الأمريكية. ISBN 978-0-02-865606-9.
  7. ↑ كاداكوزا بي إم، بوثانفيتيل إس في (يوليو 2013). "علم الجينوم وعلم البروتينات في حل تعقيد الدماغ" . الأنظمة الحيوية الجزيئية . 9 (7): 1807-1821 . doi : 10.1039/C3MB25391K . PMC 6425491. PMID 23615871 .  
  8. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 بيفسنر ج (2009). المعلوماتية الحيوية وعلم الجينوم الوظيفي ( الطبعة الثانية). هوبوكين، نيوجيرسي: وايلي-بلاك ويل. ISBN  978-0-470-08585-1.
  9. ↑ ليدل إتش جي، سكوت آر (2013). معجم يوناني-إنجليزي متوسط . مارتينو فاين بوكس. ISBN 978-1-61427-397-4.
  10. ↑ "جينوم، اسم" . قاموس أكسفورد الإنجليزي ( الطبعة الثالثة). مطبعة جامعة أكسفورد. 2008. تم الاطلاع عليه بتاريخ 1 ديسمبر 2012 . (الاشتراك مطلوب)
  11. ↑ ياداف ، إس. بي. (ديسمبر 2007). "الكمال في اللاحقة -omics، -omes، وكلمة om" . مجلة التقنيات الجزيئية الحيوية . 18 (5): 277. PMC 2392988. PMID 18166670 .  
  12. ↑ أوبراين إس جيه (يونيو 2022). " عقد من العلوم العملاقة: منظور حول علم الوراثة الحفظية" . GigaScience . 11 giac055. doi : 10.1093/gigascience/giac055 . PMC 9197679. PMID 35701371 .  
  13. ↑ فرانكلين، ر. إي.، وجوسلينج، ر. ج. (أبريل 1953). "التركيب الجزيئي في نواة الصوديوم". مجلة نيتشر . 171 (4356): 740-741 . Bibcode : 1953Natur.171..740F . doi : 10.1038/171740a0 . PMID: 13054694. S2CID : 4268222 .  
  14. ↑ أنكيني، ر. أ. (يونيو 2003). "تسلسل الجينوم من الديدان الأسطوانية إلى الإنسان: تغيير الأساليب، تغيير العلم". إنديفور . 27 (2): 87-92 . doi : 10.1016/S0160-9327(03)00061-9 . PMID 12798815 . 
  15. ↑ هولي، ر. و.، إيفريت، ج. أ.، ماديسون، ج. ت.، زمير، أ. (مايو 1965). "تسلسلات النيوكليوتيدات في الحمض النووي الريبوزي الناقل للألانين في الخميرة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 240 (5): 2122-2128 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)97435-1 . PMID 14299636 . 
  16. ↑ هولي، ر. و.، أبغار، ج.، إيفريت، ج. أ.، ماديسون، ج. ت.، ماركيزي، م.، ميريل، ش. هـ.، وآخرون . (مارس 1965). "بنية الحمض النووي الريبي". مجلة ساينس . 147 (3664): 1462-1465 . رمز Bibcode : 1965Sci ... 147.1462H . doi : 10.1126/science.147.3664.1462 . PMID 14263761. S2CID 40989800 .   
  17. ↑ نيرنبرغ م، ليدر ب، بيرنفيلد م، بريماكومب ر، تروبين ج، روتمان ف، أونيل س (مايو 1965). "شفرات الحمض النووي الريبوزي وتخليق البروتين، الجزء السابع: حول الطبيعة العامة لشفرة الحمض النووي الريبوزي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 53 (5): 1161-1168 . Bibcode : 1965PNAS...53.1161N . doi : 10.1073 / pnas.53.5.1161 . PMC 301388. PMID 5330357 .  
  18. ↑ مين جو و، هيغمان ج، يسيبيرت م، فيرز و (مايو 1972). "تسلسل النيوكليوتيدات للجين المشفر لبروتين غلاف العاثية MS2". نيتشر . 237 ( 5350): 82-88 . Bibcode : 1972Natur.237...82J . doi : 10.1038/237082a0 . PMID 4555447. S2CID 4153893 .  
  19. ↑ فيرز دبليو، كونتريراس آر، دويرنك إف، هيغمان جي، إيزيرينتان دي، ميرغارت جيه، وآخرون (أبريل 1976). " التسلسل النيوكليوتيدي الكامل لحمض RNA الخاص بالعاثية MS2: البنية الأولية والثانوية لجين الناسخ". نيتشر . 260 (5551): 500-507 . Bibcode : 1976Natur.260..500F . doi : 10.1038/260500a0 . PMID 1264203. S2CID 4289674 .   
  20. ^ فيرس دبليو، كونتريراس آر، هيجيمان جي، روجرز آر، فان دي فورد أ، فان هوفيرسوين إتش، وآخرون . (مايو 1978). “تسلسل النيوكليوتيدات الكامل للحمض النووي SV40”. طبيعة . 273 (5658): 113– 120. بيب كود : 1978Natur.273..113F . دوى : 10.1038/273113a0 . بميد 205802 . S2CID 1634424 .   
  21. ^ تامارين ر (2004). مبادئ علم الوراثة (7 ed.). لندن: ماكجرو هيل. رقم ISBN  978-0-07-124320-9.
  22. ↑ سانجر ف (1980). "محاضرة نوبل: تحديد تسلسل النيوكليوتيدات في الحمض النووي" (ملف PDF) . Nobelprize.org . تاريخ الاسترجاع: 18-10-2010 .
  23. 1 2 سانجر إف، إير جي إم، باريل بي جي، براون إن إل، كولسون إيه آر، فيدز سي إيه، وآخرون . (فبراير 1977). "تسلسل النيوكليوتيدات لحمض نووي بكتيريوفاج فاي إكس 174". نيتشر . 265 (5596): 687-695 . Bibcode : 1977Natur.265..687S . doi : 10.1038 / 265687a0 . PMID 870828. S2CID 4206886 .   
  24. ↑ كايزر أو، بارتلز د، بيكل ت، غوسمان أ، كيسبول س، بولر أ، ماير ف (ديسمبر 2003). "تسلسل الجينوم الكامل بتقنية التجزئة الموجهة بواسطة برامج المعلوماتية الحيوية - نهج مُحسَّن لتقنية راسخة". مجلة التكنولوجيا الحيوية . 106 ( 2-3 ): 121-133 . doi : 10.1016/j.jbiotec.2003.08.008 . PMID 14651855 . 
  25. ↑ سانجر ف، نيكلين س، كولسون أ.ر (ديسمبر 1977). "تسلسل الحمض النووي باستخدام مثبطات إنهاء السلسلة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 74 (12): 5463-5467 . Bibcode : 1977PNAS...74.5463S . doi : 10.1073/pnas.74.12.5463 . PMC 431765. PMID 271968 .  
  26. ↑ ماكسام إيه إم، جيلبرت دبليو (فبراير 1977). "طريقة جديدة لتسلسل الحمض النووي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 74 (2): 560-564 . Bibcode : 1977PNAS...74..560M . doi : 10.1073 / pnas.74.2.560 . PMC 392330. PMID 265521 .  
  27. 1 2 داردن إل، تابيري جيه (2010). "علم الأحياء الجزيئي" . في زالتا إي إن (محرر). موسوعة ستانفورد للفلسفة ( طبعة خريف 2010). 
  28. ↑ أندرسون إس، بانكير إيه تي، باريل بي جي، دي بروين إم إتش، كولسون إيه آر، دروين جيه، وآخرون (أبريل 1981) . "تسلسل وتنظيم جينوم الميتوكوندريا البشري". نيتشر . 290 (5806): 457-465 . Bibcode : 1981Natur.290..457A . doi : 10.1038/290457a0 . PMID 7219534. S2CID 4355527 .   (الاشتراك مطلوب)
  29. ↑ شينوزاكي ك، أومي م، تاناكا م، واكاسوجي ت، هاياشيدا ن، ماتسوباياشي ت، وآخرون (سبتمبر 1986). " التسلسل النيوكليوتيدي الكامل لجينوم بلاستيدات التبغ: تنظيم الجينات وتعبيرها" . مجلة EMBO . 5 (9): 2043-2049 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04464.x . PMC 1167080. PMID 16453699 .   
  30. ↑ أوهياما ك، فوكوزاوا هـ، كوتشي ت، شيراي هـ، سانو ت، سانو س، وآخرون (1986). "تنظيم جينات البلاستيدات الخضراء المستنتج من التسلسل الكامل لحمض نووي البلاستيدات الخضراء لنبات حشيشة الكبد Marchantia polymorpha". مجلة Nature . 322 (6079): 572-574 . Bibcode : 1986Natur.322..572O . doi : 10.1038/322572a0 . S2CID 4311952 .  
  31. ↑ أوليفر إس جي ، فان دير آرت كيو جيه، أغوستوني-كاربون إم إل، إيجل إم، ألبرغينا إل، ألكسندراكي دي، وآخرون (مايو 1992). "التسلسل الكامل للحمض النووي لكروموسوم الخميرة الثالث". نيتشر . 357 (6373): 38-46 . Bibcode : 1992Natur.357...38O . doi : 10.1038/357038a0 . PMID 1574125. S2CID 4271784 .   
  32. ↑ فليشمان، آر. دي.، آدامز، إم. دي.، وايت، أو.، كلايتون، آر. إيه.، كيركنس، إي. إف.، كيرلافاج، إيه. آر.، وآخرون . (يوليو 1995). "التسلسل العشوائي والتجميع الكامل لجينوم المستدمية النزلية Rd". مجلة ساينس . 269 (5223): 496-512 . Bibcode : 1995Sci...269..496F . doi : 10.1126/science.7542800 . PMID: 7542800. S2CID : 10423613 .   
  33. ↑ جوفو أ، باريل ب ج، بوساي هـ، ديفيس ر و، دوجون ب، فيلدمان هـ، وآخرون . (أكتوبر 1996). "الحياة مع 6000 جين". مجلة ساينس . 274 (5287): 546، 563-546 ، 567. رمز Bibcode : 1996Sci...274..546G . doi : 10.1126/science.274.5287.546 . PMID 8849441. S2CID 211123134 .   (الاشتراك مطلوب)
  34. ↑ "الجينومات الكاملة: الفيروسات" . المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية . 17 نوفمبر 2011. تم الاطلاع عليه بتاريخ 18 نوفمبر 2011 .
  35. ↑ "إحصائيات مشروع الجينوم" . مشروع جينوم Entrez . 7 أكتوبر 2011. تم الاطلاع عليه بتاريخ 18 نوفمبر 2011 .
  36. ↑ زيمر، سي (29 ديسمبر 2009). "علماء يبدأون فهرسًا جينوميًا للميكروبات الوفيرة على الأرض" . صحيفة نيويورك تايمز . الرقم الدولي الموحد للدوريات 0362-4331 . تاريخ الاسترجاع 21 ديسمبر 2012 . 
  37. ↑ وو د، هوغنهولتز ب، مافروماتيس ك، بوكال ر، دالين إ، إيفانوفا ن ن، وآخرون . (ديسمبر 2009). "موسوعة جينومية للبكتيريا والعتائق قائمة على علم الوراثة" . نيتشر . 462 (7276): 1056-1060 . Bibcode : 2009Natur.462.1056W . doi : 10.1038/nature08656 . PMC 3073058. PMID 20033048 .   
  38. ↑ "انخفاض حاد في عدد الجينات البشرية" . بي بي سي . 20 أكتوبر 2004. تم الاطلاع عليه بتاريخ 21 ديسمبر 2012 .
  39. ↑ يو جي إتش، لو إل سي، تشو زد واي، لين جي، فينغ إف (أبريل 2006). "التسلسل النيوكليوتيدي الكامل لجينوم الميتوكوندريا لـ Tetraodon nigroviridis". تسلسل الحمض النووي . 17 (2): 115-121 . doi : 10.1080/10425170600700378 . PMID 17076253. S2CID 21797344 .  
  40. ↑ المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (14 يوليو 2004). "تجميع جينوم الكلاب: جينوم الكلاب متاح الآن للمجتمع البحثي في ​​جميع أنحاء العالم" . Genome.gov . تم الاطلاع عليه بتاريخ 20 يناير 2012 .
  41. 1 2 ماكيلهيني، ف. (2010). رسم خريطة الحياة: داخل مشروع الجينوم البشري . نيويورك، نيويورك: بيسيك بوكس. ISBN 978-0-465-04333-0.
  42. ↑ أبيكاسيس جي آر، أوتون إيه، بروكس إل دي، ديبريستو إم إيه، دوربين آر إم، هاندساكر آر إي، وآخرون . (نوفمبر 2012). "خريطة متكاملة للتنوع الجيني من 1092 جينومًا بشريًا" . نيتشر . 491 (7422): 56-65 . Bibcode : 2012Natur.491...56T . doi : 10.1038/nature11632 . PMC 3498066. PMID 23128226 .   
  43. ↑ نيلسن ر (أكتوبر 2010). "علم الجينوم: بحثًا عن المتغيرات البشرية النادرة" . مجلة نيتشر . 467 (7319): 1050-1051 . Bibcode : 2010Natur.467.1050N . doi : 10.1038/4671050a . PMID 20981085 . 
  44. 1 2 بارنز ب، دوبري ج (2008). الجينومات وكيفية فهمها . شيكاغو: مطبعة جامعة شيكاغو. ISBN 978-0-226-17295-8.
  45. ↑ إيزن ، ج. أ. (يوليو 2012). "كلمات بادوميكس وقوة ومخاطر ميم أوم" . جيجا ساينس . 1 (1) 6. doi : 10.1186/2047-217X-1-6 . PMC 3617454. PMID 23587201 .  
  46. ↑ هوتز، آر. إل. (13 أغسطس 2012). "إليكم حكاية أومية: علماء يكتشفون لاحقة انتشار" . صحيفة وول ستريت جورنال . الرقم الدولي الموحد للدوريات 0099-9660 . تاريخ الاسترجاع 4 يناير 2013 . 
  47. ↑ سكوديلاري م (1 أكتوبر 2011). "طوفان البيانات" . مجلة ساينتست . تم الاسترجاع في 4 يناير 2013 .
  48. ↑ تشاستون ج، دوغلاس أ.إي. (أغسطس 2012). "الاستفادة القصوى من علم الجينوم والبروتيوميات في أبحاث التكافل" . النشرة البيولوجية . 223 (1): 21-29 . doi : 10.1086/BBLv223n1p21 . PMC 3491573. PMID 22983030 .  
  49. ↑ ماكوتشون، جيه بي، وفون دولين، سي دي (أغسطس 2011). "شبكة أيضية مترابطة في التكافل المتداخل لحشرات البق الدقيقي" . علم الأحياء الحالي . 21 (16): 1366-1372 . Bibcode : 2011CBio...21.1366M . doi : 10.1016/j.cub.2011.06.051 . PMC 3169327. PMID 21835622 .  
  50. 1 2 بيكر م (14 سبتمبر 2012). "أجهزة التسلسل المكتبية تُشحن" (مدونة) . مدونة أخبار الطبيعة . تم الاسترجاع في 22 ديسمبر 2012 .
  51. ↑ كويل إم إيه، سميث إم، كوبلاند بي، أوتو تي دي، هاريس إس آر، كونور تي آر، وآخرون (يوليو 2012). "قصة ثلاث منصات تسلسل الجيل التالي: مقارنة بين أجهزة التسلسل Ion Torrent و Pacific Biosciences و Illumina MiSeq" . BMC Genomics . 13 : 341. doi : 10.1186/1471-2164-13-341 . PMC 3431227. PMID 22827831 .   
  52. 1 2 ستادن ر (يونيو 1979). " استراتيجية لتسلسل الحمض النووي باستخدام برامج الحاسوب" . أبحاث الأحماض النووية . 6 (7): 2601-2610 . doi : 10.1093/nar/6.7.2601 . PMC 327874. PMID 461197 .  
  53. ↑ أندرسون س (يوليو 1981). "تسلسل الحمض النووي بتقنية الشوتجن باستخدام شظايا مستنسخة مُولَّدة بواسطة إنزيم ديوكسي ريبونيوكلياز الأول" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 9 (13): 3015-3027 . doi : 10.1093/nar/9.13.3015 . PMC 327328. PMID 6269069 .  
  54. 1 2 3 بوب م (يوليو 2009). " إعادة بناء تجميع الجينوم: تحديات حسابية حديثة" . موجزات في المعلوماتية الحيوية . 10 (4): 354-366 . doi : 10.1093/bib/bbp026 . PMC 2691937. PMID 19482960 .  
  55. ↑ سانجر ف، كولسون أ.ر. (مايو 1975). "طريقة سريعة لتحديد التسلسلات في الحمض النووي عن طريق التخليق المُحفَّز باستخدام بوليميراز الحمض النووي". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 94 (3): 441-448 . doi : 10.1016/0022-2836(75)90213-2 . PMID 1100841 . 
  56. ↑ مافروماتيس ك، لاند إم إل، بريتين تي إس، كويست دي جيه، كوبلاند إيه، كلوم إيه، وآخرون (2012). ليو زد (محرر). "المشهد سريع التغير لتقنيات التسلسل وتأثيرها على تجميعات الجينوم الميكروبي وشرحها" . PLOS ONE . 7 (12) e48837. Bibcode : 2012PLoSO...748837M . doi : 10.1371/ journal.pone.0048837 . PMC 3520994. PMID 23251337 .   
  57. ↑ شركة إلومينا (28 فبراير 2012). مقدمة في تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (ملف PDF) . سان دييغو، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية: شركة إلومينا، ص 12. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 11 أبريل 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 ديسمبر 2012 . 
  58. ↑ هول، ن. (مايو 2007). "تقنيات التسلسل المتقدمة وتأثيرها الأوسع في علم الأحياء الدقيقة" . مجلة علم الأحياء التجريبي . 210 (الجزء 9): 1518-1525 . Bibcode : 2007JExpB.210.1518H . doi : 10.1242/jeb.001370 . PMID 17449817 . 
  59. ↑ تشيرش ، جي إم (يناير 2006). "الجينوم للجميع". ساينتفك أمريكان . 294 (1): 46-54 . Bibcode : 2006SciAm.294a..46C . doi : 10.1038/scientificamerican0106-46 . PMID 16468433. S2CID 28769137 .  
  60. ↑ تين بوش جيه آر، غرودي دبليو دبليو (نوفمبر 2008). "مواكبة الجيل القادم: التسلسل المتوازي الضخم في التشخيص السريري" . مجلة التشخيص الجزيئي . 10 (6): 484-492 . doi : 10.2353/jmoldx.2008.080027 . PMC 2570630. PMID 18832462 .  
  61. ↑ تاكر تي، مارا إم، فريدمان جيه إم (أغسطس 2009). "التسلسل المتوازي الضخم: التطور الأبرز القادم في الطب الجيني" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 85 (2): 142-154 . doi : 10.1016/j.ajhg.2009.06.022 . PMC 2725244. PMID 19679224 .  
  62. ↑ US 20050100900 ، Kawashima EH ، Farinelli L ، Mayer P ، "طريقة تضخيم الحمض النووي"، نُشر في 12 مايو 2005 ، صدر في 26 يوليو 2011 ، مُخصص لشركة Solexa Ltd Great Britain. 
  63. ↑ مارديس إي آر (2008). "أساليب تسلسل الحمض النووي من الجيل التالي" (ملف PDF) . المراجعة السنوية لعلم الجينوم وعلم الوراثة البشرية . 9 : 387-402 . doi : 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359 . PMID 18576944. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 18 مايو 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 4 يناير 2013 . 
  64. ↑ ديفيز ك (2011). "تمكين الطب الوقائي" . عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية ( سبتمبر - أكتوبر). مؤرشف من الأصل في 2016-06-06 . تم الاسترجاع في 2014-12-17 .
  65. ↑ "الصفحة الرئيسية" . PacBio .
  66. ↑ "الصفحة الرئيسية" . شركة أوكسفورد لتقنيات النانو .
  67. ↑ تشين، بي إس، غرافهام، دي في، فولتون، آر إس، فيتزجيرالد، إم جي، هوستتلر، جيه، موزني، دي، وآخرون . (أكتوبر 2009). "علم الجينوم: معايير مشروع الجينوم في عصر جديد من التسلسل" . مجلة ساينس . 326 (5950): 236-237 . Bibcode : 2009Sci...326..236C . doi : 10.1126 /science.1180614 . PMC 3854948. PMID 19815760 .   
  68. ↑ شتاين ، ل. (يوليو 2001). "شرح الجينوم: من التسلسل إلى البيولوجيا". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 2 (7): 493-503 . doi : 10.1038/35080529 . PMID 11433356. S2CID 12044602 .  
  69. ↑ برنت، إم آر (يناير 2008). "التقدم المطرد والاختراقات الحديثة في دقة الشرح الآلي للجينوم" ( ملف PDF) . مجلة Nature Reviews Genetics . 9 (1): 62-73 . doi : 10.1038/nrg2220 . PMID 18087260. S2CID 20412451. مؤرشف من النسخة الأصلية (ملف PDF) بتاريخ 29 مايو 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 4 يناير 2013 .  
  70. ↑ فليسيك ب، أحمد إ، أمودي إم آر، باريل د، بيل ك، برنت س، وآخرون . (يناير 2013). "Ensembl 2013" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 41 (عدد قواعد البيانات): D48– D55 . doi : 10.1093/nar/gks1236 . PMC 3531136. PMID 23203987 .   
  71. ↑ كيث جيه إم (2008). كيث جيه إم (محرر). المعلوماتية الحيوية . مناهج في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 453. الصفحات من 5 إلى 6. doi : 10.1007/978-1-60327-429-6 . ISBN   978-1-60327-428-9PMID 18720577​​ 
  72. ↑ مارسدن آر إل، لويس تي إيه، أورينغو سي إيه (مارس 2007). " نحو تغطية هيكلية شاملة للجينومات المكتملة: وجهة نظر علم الجينوم الهيكلي" . بي إم سي بيوانفورماتيكس . 8 86. doi : 10.1186/1471-2105-8-86 . PMC 1829165. PMID 17349043 .  
  73. ↑ برينر إس إي، ليفيت إم (يناير 2000). " توقعات من علم الجينوم البنيوي" . علم البروتين . 9 (1): 197-200 . doi : 10.1110/ps.9.1.197 . PMC 2144435. PMID 10739263 .  
  74. ↑ برينر ، إس. إي. (أكتوبر 2001). "جولة في علم الجينوم البنيوي". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 2 (10): 801-809 . doi : 10.1038/35093574 . PMID 11584296. S2CID 5656447 .  
  75. 1 2 فرانسيس آر سي (2011). علم التخلق: اللغز الأخير للوراثة . نيويورك: دبليو دبليو نورتون. ISBN 978-0-393-07005-7.
  76. ↑ جاليجو، إل دي؛ شنايدر، إم؛ ميتال، سي؛ رومانوسكا، أنيتي؛ جودينو كاريلو، آر إم؛ شوبرت، تي؛ بو، بي إف؛ كولر، إيه (مارس 2020). "انفصال الطور يوجه عملية إضافة اليوبيكويتين إلى نيوكليوسومات جسم الجين" . نيتشر . 579 (7800): 592-597 . Bibcode : 2020Natur.579..592G . doi : 10.1038/s41586-020-2097-z . PMC 7481934. PMID 32214243 .  
  77. ↑ سامز، ك. ل.؛ موكاي، س.؛ ماركس، ب. أ.؛ ميتال، س.؛ ديمتر، إ. أ.؛ نيلسن، س.؛ غرينييه، ج. ك.؛ تيت، أ. إ.؛ أحمد، ف.؛ كونرود، س. أ. (أكتوبر 2022). "تأخر البلوغ، واضطرابات الغدد التناسلية، وانخفاض الخصوبة لدى ذكور الفئران المعدلة وراثيًا بحذف جيني مزدوج لـ Padi2/Padi4" . مجلة بيولوجيا التكاثر والغدد الصماء . 20 ( 1): 150. doi : 10.1186/s12958-022-01018-w . PMC 9555066. PMID 36224627 .  
  78. ↑ ليرد ، ب. و. (مارس 2010). "مبادئ وتحديات تحليل مثيلة الحمض النووي على مستوى الجينوم". مجلة نيتشر ريفيوز. علم الوراثة . 11 (3): 191-203 . doi : 10.1038/nrg2732 . PMID 20125086. S2CID 6780101 .  
  79. ↑ هوغنهولتز، ب.، غوبل، ب.م.، بيس، ن.ر. (سبتمبر 1998). "تأثير الدراسات غير المعتمدة على الاستزراع على النظرة التطورية الناشئة للتنوع البكتيري" . مجلة علم البكتيريا . 180 (18): 4765-4774 . doi : 10.1128/JB.180.18.4765-4774.1998 . PMC 107498. PMID 9733676 .  
  80. ↑ إيزن، ج. أ. (مارس 2007). "التسلسل الجيني البيئي: إمكاناته وتحدياته في دراسة العالم الخفي للميكروبات" . مجلة PLOS Biology . 5 (3) e82. doi : 10.1371/journal.pbio.0050082 . PMC 1821061. PMID 17355177 .  
  81. ↑ ماركو د، محرر. (2010). علم الجينوم البيئي: النظرية والأساليب والتطبيقات . دار كايستر الأكاديمية للنشر. رقم ISBN 978-1-904455-54-7.
  82. ↑ ماركو د، محرر. (2011). علم الجينوم البيئي: الابتكارات الحالية والاتجاهات المستقبلية . دار كايستر الأكاديمية للنشر . رقم ISBN 978-1-904455-87-5.
  83. ↑ كانشايا سي، بروكس سي، فورنوس جي، بروتين إيه، بروسو إتش (يونيو 2003). "علم جينوم الطليعة الفيروسية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 67 (2): 238-276 ، جدول المحتويات. doi : 10.1128/MMBR.67.2.238-276.2003 . PMC 156470. PMID 12794192 .  
  84. ↑ ماكغراث إس، فان سينديرين دي، محرران. (2007). العاثيات: علم الوراثة والبيولوجيا الجزيئية ( الطبعة الأولى). دار كايستر الأكاديمية للنشر. رقم ISBN  978-1-904455-14-1.
  85. ↑ فوتس، د. إي. (نوفمبر 2006). " Phage_Finder: التحديد والتصنيف الآلي لمناطق البروفاج في تسلسلات الجينوم البكتيري الكاملة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 34 (20): 5839-5851 . doi : 10.1093/nar/gkl732 . PMC 1635311. PMID 17062630 .  
  86. ↑ هيريرو أ، فلوريس إي، محرران (2008). البكتيريا الزرقاء: البيولوجيا الجزيئية، وعلم الجينوم، والتطور ( الطبعة الأولى). دار كايستر الأكاديمية للنشر. رقم ISBN  978-1-904455-15-8.
  87. ↑ هدسون، ك. ل. (سبتمبر 2011). "علم الجينوم، والرعاية الصحية، والمجتمع" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 365 (11): 1033-1041 . doi : 10.1056/NEJMra1010517 . PMID 21916641 . 
  88. ↑ أودونيل سي جيه، نابل إي جي (ديسمبر 2011). "علم جينوم أمراض القلب والأوعية الدموية" . مجلة نيو إنجلاند الطبية . 365 (22): 2098-2109 . doi : 10.1056/NEJMra1105239 . PMID 22129254 . 
  89. ↑ لو واي إف، غولدشتاين دي بي، أنغريست إم، كافاليري جي (يوليو 2014). "الطب الشخصي والتنوع الجيني البشري" . مجلة كولد سبرينغ هاربور لوجهات النظر في الطب . 4 (9) a008581. doi : 10.1101/cshperspect.a008581 . PMC 4143101. PMID 25059740 .  
  90. ↑ "واحد من بين مليار: حياة صبي، لغز طبي" . Jsonline.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 5 أكتوبر 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 نوفمبر 2016 .
  91. ↑ ماير إيه إن، ديموك دي بي، أركا إم جيه، وآخرون (مارس 2011). "وصول في الوقت المناسب للطب الجينومي" . مجلة علم الوراثة الطبية . 13 (3): 195-196 . doi : 10.1097/GIM.0b013e3182095089 . PMID 21169843. S2CID 10802499 .   
  92. ↑ آشلي إي إيه، بوت إيه جيه، ويلر إم تي، تشين آر، كلاين تي إي، ديوي إف إي، وآخرون . (مايو 2010). " التقييم السريري الذي يتضمن الجينوم الشخصي" . مجلة لانسيت . 375 (9725): 1525-1535 . doi : 10.1016/S0140-6736(10)60452-7 . PMC 2937184. PMID 20435227 .   
  93. ↑ ديوي إف إي، تشين آر، كورديرو إس بي، أورموند كي إي، كاليشو سي، كارتشيفسكي كي جيه، وآخرون . (سبتمبر 2011). " المخاطر الجينية الجينومية الكاملة المرحلية في عائلة رباعية باستخدام تسلسل مرجعي للأليل الرئيسي" . PLOS Genetics . 7 (9) e1002280. doi : 10.1371/journal.pgen.1002280 . PMC 3174201. PMID 21935354 .   
  94. ↑ ديوي إف إي، غروف إم إي، بان سي، غولدشتاين بي إيه، بيرنشتاين جيه إيه، شايب إتش، وآخرون . (مارس 2014). " التفسير السريري وآثار تسلسل الجينوم الكامل" . مجلة الجمعية الطبية الأمريكية . 311 (10): 1035-1045 . doi : 10.1001/jama.2014.1717 . PMC 4119063. PMID 24618965 .   
  95. ↑ روبنز ر (16 أغسطس 2019). "مراكز طبية أمريكية رائدة تُطلق عيادات تسلسل الحمض النووي لعملاء أصحاء (وغالباً أثرياء)" . أخبار STAT .
  96. ↑ «نظامان صحيان في بوسطن يدخلان سوق تسلسل الجينات المباشر للمستهلكين المتنامي من خلال افتتاح عيادات علم الجينوم الوقائي، ولكن هل يستطيع المرضى تحمل تكلفة الخدمة؟» . دارك ديلي . مجموعة دارك إنتليجنس. 3 يناير 2020.
  97. ↑ "مراكز الجينوم الممولة من معاهد الصحة الوطنية لتسريع اكتشافات الطب الدقيق" . معاهد الصحة الوطنية: برنامج أبحاث "كلنا" . معاهد الصحة الوطنية. 25 سبتمبر 2018.
  98. ↑ بايكروفت، كلير؛ فريمان، كولين؛ بيتكوفا، ديسيسلافا؛ باند، جافين؛ إليوت، لويد ت.؛ شارب، كيفن؛ موتير، آلان؛ فوكسيفيتش، داميان؛ ديلانو، أوليفييه؛ أوكونيل، جاريد؛ كورتيس، أدريان؛ ويلش، سامانثا؛ يونغ، آلان؛ إفينغهام، مارك؛ مكفيان، جيل (أكتوبر 2018). "مورد البنك الحيوي البريطاني مع بيانات النمط الظاهري والجينومي المتعمقة" . مجلة نيتشر . 562 (7726): 203-209 . Bibcode : 2018Natur.562..203B . doi : 10.1038/s41586-018-0579-z . ISSN 1476-4687 . PMC 6786975 . PMID 30305743 .   
  99. ↑ تشيرش، جي إم، وريجيس، إي (2012). التجديد: كيف ستعيد البيولوجيا التركيبية ابتكار الطبيعة وأنفسنا . نيويورك: بيسيك بوكس. ISBN 978-0-465-02175-8.
  100. ↑ بيكر، م. (مايو 2011). "الجينومات الاصطناعية: الخطوة التالية للجينوم الاصطناعي" . مجلة نيتشر . 473 (7347): 403، 405-408 . Bibcode : 2011Natur.473..403B . doi : 10.1038/473403a . PMID: 21593873. S2CID : 205064528 .  
  101. ↑ لويكارت جي، إنجلاند بي آر، تالمون دي، جوردان إس، تابيرليه بي (ديسمبر 2003). "قوة ووعد علم جينوم السكان: من تحديد النمط الجيني إلى تحديد النمط الجينومي". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 4 (12): 981-994 . doi : 10.1038 / nrg1226 . PMID 14631358. S2CID 8516357 .  
  102. ↑ فرانكهام ر (1 سبتمبر 2010). "تحديات وفرص المناهج الجينية في الحفاظ على التنوع البيولوجي". الحفاظ على التنوع البيولوجي . 143 (9): 1922-1923 . Bibcode : 2010BCons.143.1919F . doi : 10.1016/j.biocon.2010.05.011 .
  103. ↑ أليندورف ، ف. و.، هوهنلوه، ب. أ.، لويكارت، ج. (أكتوبر 2010). "علم الجينوم ومستقبل علم الوراثة الحفظي". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 11 (10): 697-709 . doi : 10.1038/nrg2844 . PMID 20847747. S2CID 10811958 .  

للمزيد من القراءة