علم التخلق

علم التخلق هو دراسة التغيرات في التعبير الجيني التي تحدث دون تغيير تسلسل الحمض النووي . ^{[ 1 ]} يشير البادئة اليونانية " إبي- " (ἐπι-، وتعني "فوق، خارج، حول") في علم التخلق إلى سمات "فوق" أو "بالإضافة إلى" آلية الوراثة التقليدية القائمة على تسلسل الحمض النووي. ^{[ 2 ]} عادةً ما يتضمن علم التخلق تغيرات تستمر عبر انقسام الخلايا، وتؤثر على تنظيم التعبير الجيني. ^{[ 3 ]} قد تنتج هذه التأثيرات على الصفات الخلوية والفسيولوجية عن عوامل بيئية، أو تكون جزءًا من النمو الطبيعي.

يشير المصطلح أيضًا إلى الآلية الكامنة وراء هذه التغييرات: وهي تعديلات وظيفية مهمة في الجينوم لا تتضمن طفرات في تسلسل النيوكليوتيدات . ومن أمثلة الآليات التي تُنتج مثل هذه التغييرات مثيلة الحمض النووي وتعديل الهيستون ، حيث يُغير كل منهما كيفية التعبير عن الجينات دون تغيير تسلسل الحمض النووي الأساسي . ^{[ 4 ]} علاوة على ذلك، فقد ثبت أن تسلسلات الحمض النووي الريبوزي غير المشفر تلعب دورًا رئيسيًا في تنظيم التعبير الجيني. ^{[ 5 ]} يمكن التحكم في التعبير الجيني من خلال عمل البروتينات الكابتة التي ترتبط بمناطق كبت التعبير في الحمض النووي. قد تستمر هذه التغييرات فوق الجينية خلال انقسامات الخلايا طوال عمر الخلية، وقد تستمر أيضًا لأجيال متعددة، على الرغم من أنها لا تتضمن تغييرات في تسلسل الحمض النووي الأساسي للكائن الحي؛ ^{[ 6 ]} بدلاً من ذلك، تتسبب عوامل غير جينية في اختلاف سلوك جينات الكائن الحي (أو "تعبيرها عن نفسها"). ^{[ 7 ]}

من الأمثلة على التغيرات فوق الجينية في بيولوجيا حقيقيات النوى عملية التمايز الخلوي . خلال التكوين المورفولوجي ، تتحول الخلايا الجذعية متعددة القدرات إلى سلالات الخلايا متعددة القدرات المختلفة في الجنين ، والتي بدورها تصبح خلايا متمايزة تمامًا. بعبارة أخرى، مع استمرار انقسام البويضة المخصبة - الزيجوت - تتطور الخلايا البنت الناتجة إلى أنواع الخلايا المختلفة في الكائن الحي، بما في ذلك الخلايا العصبية ، والخلايا العضلية ، والظهارة ، وبطانة الأوعية الدموية ، وغيرها، وذلك عن طريق تنشيط بعض الجينات وتثبيط التعبير عن جينات أخرى. ^[⁸^]

التعريفات

يُستخدم مصطلح "التخلق المتوالي " بمعنى عام هو "النمو الزائد"، وهو مصطلح شائع في اللغة الإنجليزية منذ القرن السابع عشر. ^{[ 9 ]} في المنشورات العلمية، بدأ مصطلح "علم التخلق المتوالي" بالظهور في ثلاثينيات القرن العشرين (انظر الشكل على اليمين). إلا أن معناه المعاصر لم يتبلور إلا في تسعينيات القرن العشرين. ^{[ 10 ]}

تم تعريف مفهوم السمة فوق الجينية بأنها "نمط ظاهري مستقر وراثيًا ناتج عن تغيرات في الكروموسوم دون تغييرات في تسلسل الحمض النووي" في اجتماع كولد سبرينغ هاربور عام 2008، ^{[ 11 ]} على الرغم من أن التعريفات البديلة التي تشمل السمات غير الوراثية لا تزال مستخدمة على نطاق واسع. ^{[ 12 ]}

قناة وادينغتون، الأربعينيات

طرح عالم الأحياء الروسي نيكولاي كولتسوف فرضية التغيرات فوق الجينية التي تؤثر على التعبير الجيني للكروموسومات . ^[¹³^] ومن المعنى العام، والصفة المرتبطة به "فوق جيني" ، صاغ عالم الأجنة البريطاني سي إتش وادينجتون مصطلح "علم التخلق" عام 1942، مشيرًا إلى عملية التخلق ، بالتوازي مع مصطلح "علم الوراثة الظاهرية" ( Phänogenetik ) لفالنتين هاكر . ^[¹⁴^] وكان مصطلح "التخلق " في سياق بيولوجيا تلك الفترة يشير إلى تمايز الخلايا من حالتها الأولية متعددة القدرات خلال التطور الجنيني . ^[¹⁵^]

عندما صاغ وادينجتون هذا المصطلح، لم تكن الطبيعة الفيزيائية للجينات ودورها في الوراثة معروفة. استخدمه بدلاً من ذلك كنموذج مفاهيمي لكيفية تفاعل المكونات الجينية مع بيئتها لإنتاج النمط الظاهري ؛ واستخدم عبارة " المشهد فوق الجيني " كاستعارة للتطور البيولوجي . اعتقد وادينجتون أن مصائر الخلايا تتحدد أثناء النمو في عملية أطلق عليها اسم "التوجيه"، تمامًا كما تتدحرج كرة زجاجية إلى أدنى نقطة في المنطقة . ^{[ 16 ]} اقترح وادينجتون تصور تزايد عدم قابلية انعكاس تمايز أنواع الخلايا على شكل تلال ترتفع بين الوديان التي تتحرك فيها الكرات الزجاجية (المشابهة للخلايا). ^{[ 17 ]}

في الآونة الأخيرة، تمّت صياغة مفهوم وادينجتون عن المشهد فوق الجيني بشكل دقيق في سياق منهج ديناميكيات الأنظمة لدراسة مصير الخلية. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} من المتوقع أن يُظهر تحديد مصير الخلية ديناميكيات معينة، مثل تقارب الجاذب (يمكن أن يكون الجاذب نقطة توازن، أو دورة حدية، أو جاذب غريب ) أو تذبذبي. ^{[ 19 ]}

معاصر

في عام 1990، عرّف روبن هوليداي علم التخلق بأنه "دراسة آليات التحكم الزمني والمكاني في نشاط الجينات أثناء تطور الكائنات الحية المعقدة". ^{[ 20 ]}

أما الاستخدام الأحدث للكلمة في علم الأحياء فيتبع تعريفات أكثر دقة. وكما عرّفها آرثر ريغز وزملاؤه، فهي "دراسة التغيرات الوراثية في وظيفة الجينات التي يمكن توريثها عن طريق الانقسام المتساوي و/أو الانقسام الاختزالي والتي لا يمكن تفسيرها بتغيرات في تسلسل الحمض النووي". ^{[ 21 ]}

مع ذلك، استُخدم المصطلح أيضًا لوصف عمليات لم يُثبت أنها قابلة للتوريث، مثل بعض أشكال تعديل الهيستون. ونتيجةً لذلك، تُبذل محاولات لإعادة تعريف "علم التخلق" بمصطلحات أوسع تتجاوز شرط التوريث . فعلى سبيل المثال، عرّف أدريان بيرد علم التخلق بأنه "التكيف البنيوي للمناطق الكروموسومية لتسجيل حالات النشاط المتغيرة أو الإشارة إليها أو استمرارها". ^{[ 6 ]} يشمل هذا التعريف التعديلات العابرة المرتبطة بإصلاح الحمض النووي أو مراحل دورة الخلية ، بالإضافة إلى التغيرات المستقرة التي تستمر عبر أجيال خلوية متعددة، ولكنه يستثني تعديلات أخرى مثل قالب بنية الغشاء والبريونات ما لم تؤثر على وظيفة الكروموسوم. مع ذلك، لا تحظى هذه التعريفات الجديدة بقبول عالمي، ولا تزال محل نقاش. ^{[ 22 ]} يستخدم مشروع "خارطة طريق علم التخلق" التابع للمعاهد الوطنية للصحة ، والذي استمر من عام 2008 إلى عام 2017، التعريف التالي: "لأغراض هذا البرنامج، يشير علم التخلق إلى كل من التغيرات الوراثية في نشاط الجينات وتعبيرها ( في نسل الخلايا أو الأفراد)، وكذلك التغيرات المستقرة طويلة الأمد في القدرة النسخية للخلية والتي لا تكون بالضرورة وراثية." ^{[ 23 ]} في عام 2008، تم التوصل إلى تعريف توافقي للصفة التخلقية، وهو "نمط ظاهري وراثي مستقر ناتج عن تغيرات في الكروموسوم دون تغييرات في تسلسل الحمض النووي"، وذلك في اجتماع كولد سبرينغ هاربور . ^{[ 11 ]}

أدى تشابه كلمة "الإبيجينوم" مع كلمة "علم الوراثة" إلى ظهور استخدامات متوازية عديدة. فمصطلح " الإبيجينوم " يُشابه مصطلح " الجينوم "، إذ يُشير إلى الحالة الإبيجينية الشاملة للخلية، بينما يُشير مصطلح "الإبيجينوميات " إلى التحليلات الشاملة للتغيرات الإبيجينية عبر الجينوم بأكمله. ^{[ 12 ]} كما تم تكييف عبارة " الشفرة الوراثية " - حيث استُخدم مصطلح " الشفرة الإبيجينية " لوصف مجموعة السمات الإبيجينية التي تُنتج أنماطًا ظاهرية مختلفة في خلايا مختلفة من نفس تسلسل الحمض النووي الأساسي. وفي أقصى تجلياته، يُمكن أن تُمثل "الشفرة الإبيجينية" الحالة الكاملة للخلية، مع تحديد موقع كل جزيء في خريطة إبيجينومية ، وهي تمثيل تخطيطي لتعبير الجينات، ومثيلة الحمض النووي، وحالة تعديل الهيستون في منطقة جينومية مُحددة. وفي أغلب الأحيان، يُستخدم المصطلح للإشارة إلى الجهود المنهجية لقياس أشكال مُحددة وذات صلة من المعلومات الإبيجينية، مثل شفرة الهيستون أو أنماط مثيلة الحمض النووي .

الآليات

يلعب التعديل التساهمي للحمض النووي (مثل مثيلة السيتوزين وهيدروكسي مثيلته) أو لبروتينات الهيستون (مثل أستلة الليسين، ومثيلة الليسين والأرجينين، وفسفرة السيرين والثريونين، ويوبيكويتين الليسين وسومويليشنه) أدوارًا محورية في العديد من أنواع الوراثة فوق الجينية. ولذلك، يُستخدم مصطلح "علم الوراثة فوق الجينية" أحيانًا كمرادف لهذه العمليات. مع ذلك، قد يكون هذا مُضللًا، إذ لا تُورَث إعادة تشكيل الكروماتين دائمًا، ولا تتضمن جميع أنواع الوراثة فوق الجينية إعادة تشكيل الكروماتين. ^{[ 24 ]} في عام 2019، ظهر تعديل آخر لليسين في الأدبيات العلمية يربط بين التعديل فوق الجيني واستقلاب الخلية، وهو اللاكتلة. ^{[ 25 ]}

بما أن النمط الظاهري للخلية أو الفرد يتأثر بنوع الجينات التي يتم نسخها، فإن حالات النسخ الوراثية قد تُحدث تأثيرات فوق جينية. توجد عدة مستويات لتنظيم التعبير الجيني . إحدى طرق تنظيم الجينات هي إعادة تشكيل الكروماتين. الكروماتين هو مُركّب من الحمض النووي (DNA) وبروتينات الهيستون التي يرتبط بها. إذا تغيرت طريقة التفاف الحمض النووي حول الهيستونات، فقد يتغير التعبير الجيني أيضًا. تتم إعادة تشكيل الكروماتين من خلال آليتين رئيسيتين:

تتمثل الطريقة الأولى في تعديل الأحماض الأمينية المكونة لبروتينات الهيستون بعد الترجمة . تتكون بروتينات الهيستون من سلاسل طويلة من الأحماض الأمينية. إذا تغيرت الأحماض الأمينية المكونة لهذه السلسلة، فقد يتغير شكل الهيستون. لا ينفك الحمض النووي (DNA) بالكامل أثناء التضاعف، لذا من الممكن أن تُنقل الهيستونات المعدلة إلى كل نسخة جديدة من الحمض النووي. بمجرد وصولها إلى هناك، قد تعمل هذه الهيستونات كقوالب، فتبدأ بتشكيل الهيستونات الجديدة المحيطة بها بالشكل الجديد. من خلال تغيير شكل الهيستونات المحيطة بها، تضمن هذه الهيستونات المعدلة الحفاظ على برنامج النسخ الخاص بالسلالة بعد انقسام الخلية.
الطريقة الثانية هي إضافة مجموعات الميثيل إلى الحمض النووي، وخاصةً في مواقع CpG ، لتحويل السيتوزين إلى 5-ميثيل سيتوزين . يؤدي 5-ميثيل سيتوزين وظيفة مشابهة للسيتوزين العادي، حيث يرتبط بالغوانين في الحمض النووي ثنائي السلسلة. مع ذلك، عند وجود سيتوزينات مثيلة في مواقع CpG في منطقتي المحفز والمعزز للجينات، غالبًا ما تُثبط هذه الجينات. ^[²⁶^]^[²⁷^] أما عند وجود سيتوزينات مثيلة في مواقع CpG في جسم الجين (في المنطقة المشفرة باستثناء موقع بدء النسخ) ، فغالبًا ما يُعزز التعبير الجيني. يعتمد نسخ الجين عادةً على ارتباط عامل النسخ بتسلسل تعرف (10 قواعد أو أقل) في المعزز، والذي يتفاعل مع منطقة المحفز لهذا الجين ( التعبير الجيني: المعززات، عوامل النسخ، معقد الوسيط، وحلقات الحمض النووي في نسخ الثدييات ). ^[²⁸^] يُمنع حوالي 22% من عوامل النسخ من الارتباط عندما يحتوي تسلسل التعرف على سيتوزين مثيل. إضافةً إلى ذلك، يمكن أن يجذب وجود السيتوزينات المثيلة في منطقة المحفز بروتينات نطاق ربط ميثيل-CpG (MBD). تتفاعل جميع بروتينات MBD مع معقدات إعادة تشكيل النيوكليوسوم ومعقدات نازعة أسيتيل الهيستون ، مما يؤدي إلى إسكات الجينات. علاوةً على ذلك، هناك تعديل تساهمي آخر يشمل السيتوزين المثيل، وهو إزالة مثيلته بواسطة إنزيمات TET . تحدث مئات من عمليات إزالة المثيلة هذه، على سبيل المثال، أثناء عمليات التعلم وتكوين الذاكرة في الخلايا العصبية . ^[²⁹^]^[³⁰^]

توجد غالبًا علاقة تبادلية بين مثيلة الحمض النووي ومثيلة الليسين في الهيستون. ^{[ 31 ]} على سبيل المثال، يمكن لبروتين نطاق ربط الميثيل MBD1 ، الذي ينجذب ويرتبط بالسيتوزين المثيل في موقع CpG على الحمض النووي، أن يرتبط أيضًا بنشاط ميثيل ترانسفيراز H3K9 لمثيلة الهيستون 3 عند الليسين 9. من ناحية أخرى، يبدو أن مثيلة صيانة الحمض النووي بواسطة DNMT1 تعتمد جزئيًا على التعرف على مثيلة الهيستون على النيوكليوسوم الموجود في موقع الحمض النووي لإجراء مثيلة السيتوزين على الحمض النووي المُصنّع حديثًا. ^{[ 31 ]} يوجد أيضًا تداخل بين مثيلة الحمض النووي التي يقوم بها DNMT3A و DNMT3B ومثيلة الهيستون، بحيث توجد علاقة بين التوزيع الجينومي لمثيلة الحمض النووي ومثيلة الهيستون. ^{[ 32 ]}

لا تزال آليات وراثة حالة الهيستون غير مفهومة تمامًا؛ ومع ذلك، يُعرف الكثير عن آلية وراثة حالة مثيلة الحمض النووي أثناء انقسام الخلايا وتمايزها. تعتمد وراثة حالة المثيلة على إنزيمات معينة (مثل DNMT1 ) ذات ألفة أعلى لـ 5-ميثيل سيتوزين مقارنةً بالسيتوزين. إذا وصل هذا الإنزيم إلى جزء "نصف مثيل" من الحمض النووي (حيث يوجد 5-ميثيل سيتوزين في أحد شريطي الحمض النووي فقط)، فسيقوم الإنزيم بمثيلة النصف الآخر. ومع ذلك، من المعروف الآن أن DNMT1 يتفاعل فيزيائيًا مع البروتين UHRF1 . وقد تم مؤخرًا تحديد UHRF1 كبروتين أساسي للحفاظ على مثيلة الحمض النووي بواسطة DNMT1. UHRF1 هو البروتين الذي يتعرف تحديدًا على الحمض النووي نصف المثيل، وبالتالي يجلب DNMT1 إلى ركيزته للحفاظ على مثيلة الحمض النووي. ^{[ 32 ]}

التفعيل

قمع

تُعدّ بعض عمليات الأستلة وبعض عمليات المَثْيَلَة على الليسين (رمزه K) إشارات تنشيط للنسخ عند وجودها على النيوكليوسوم ، كما هو موضح في الشكل العلوي. بينما تُعدّ بعض عمليات المَثْيَلَة على الليسين أو الأرجينين (R) إشارات تثبيط للنسخ عند وجودها على النيوكليوسوم ، كما هو موضح في الشكل السفلي. تتكون النيوكليوسومات من أربعة أزواج من بروتينات الهيستون في منطقة أساسية مُحكمة التجميع، بالإضافة إلى ما يصل إلى 30% من كل هيستون متبقٍ في ذيل غير مُنظّم بشكل جيد ^{[ 33 ]} (يظهر ذيل واحد فقط من كل زوج). يلتف الحمض النووي DNA حول بروتينات الهيستون الأساسية في الكروماتين . يُشار إلى الليسين (K) برقم يُبيّن موقعه، على سبيل المثال (K4)، مما يدل على أن الليسين هو الحمض الأميني الرابع من الطرف الأميني (N) للذيل في بروتين الهيستون. تعد عمليات الميثيل [Me] والأسيتيل [Ac] من التعديلات الشائعة بعد الترجمة على الليسينات في ذيول الهيستون.

على الرغم من أن تعديلات الهستونات تحدث في جميع أنحاء التسلسل، إلا أن النهايات الأمينية غير المنظمة للهستونات (وتُسمى ذيول الهستون) تخضع لتعديلات مكثفة بشكل خاص. تشمل هذه التعديلات الأسيتلة ، والمثيلة ، واليوبيكويتين ، والفسفرة ، والسومويل ، والريبوزيل، والسيترولين. تُعد الأسيتلة أكثر هذه التعديلات دراسةً. على سبيل المثال، ترتبط أسيتلة الليسين K14 وK9 في ذيل الهستون H3 بواسطة إنزيمات أسيتيل ترانسفيراز الهستون (HATs) عمومًا بالكفاءة النسخية ^{[ 34 ]} (انظر الشكل).

إحدى طرق التفكير هي أن ميل الأسيتيل إلى الارتباط بالنسخ "النشط" هو ذو طبيعة فيزيائية حيوية. نظرًا لاحتواء الليسين عادةً على ذرة نيتروجين موجبة الشحنة في نهايته، فإنه يستطيع الارتباط بمجموعات الفوسفات سالبة الشحنة في هيكل الحمض النووي. تحوّل عملية الأسيتيل مجموعة الأمين موجبة الشحنة في السلسلة الجانبية إلى رابطة أميدية متعادلة. يؤدي هذا إلى إزالة الشحنة الموجبة، وبالتالي فك ارتباط الحمض النووي بالهيستون. عند حدوث ذلك، تستطيع مركبات مثل SWI/SNF وعوامل النسخ الأخرى الارتباط بالحمض النووي، مما يسمح بحدوث عملية النسخ. هذا هو النموذج "الموضعي" للوظيفة فوق الجينية. بعبارة أخرى، تُحدث التغييرات في ذيول الهيستون تأثيرًا مباشرًا على الحمض النووي نفسه. ^{[ 35 ]}

يُعدّ نموذج "التأثير العابر" نموذجًا آخر للوظيفة فوق الجينية. في هذا النموذج، تؤثر التغييرات التي تطرأ على ذيول الهيستونات بشكل غير مباشر على الحمض النووي. على سبيل المثال، قد يُنشئ أستلة الليسين موقع ارتباط للإنزيمات المُعدِّلة للكروماتين (أو آليات النسخ أيضًا). يُمكن لهذا المُعدِّل للكروماتين أن يُحدث تغييرات في حالته. في الواقع، يوجد نطاق برومودومين - وهو نطاق بروتيني يرتبط تحديدًا بالليسين المُؤَسْتَل - في العديد من الإنزيمات التي تُساعد على تنشيط النسخ، بما في ذلك مُركَّب SWI/SNF. قد يكون للأستلة دورٌ في تنشيط النسخ بهذه الطريقة والطريقة السابقة.

تؤكد عملية مثيلة الهيستون أيضًا فكرة أن التعديلات تعمل كوحدات ربط لعوامل ذات صلة. لطالما ارتبطت مثيلة الليسين 9 من الهيستون H3 بالكروماتين الصامت نسخياً بشكل دائم ( الكروماتين المغاير الدائم ) (انظر الشكل السفلي). وقد ثبت أن نطاق الكرومودومين (نطاق يرتبط تحديدًا بالليسين الميثيلي) في البروتين المثبط للنسخ HP1 يستقطب HP1 إلى المناطق المثيلة عند الليسين 9. ومن الأمثلة التي تبدو وكأنها تدحض هذا النموذج الفيزيائي الحيوي للمثيلة، أن المثيلة الثلاثية للهيستون H3 عند الليسين 4 ترتبط ارتباطًا وثيقًا (بل هي ضرورية) بالتنشيط النسخي الكامل (انظر الشكل العلوي). في هذه الحالة، تُدخل المثيلة الثلاثية شحنة موجبة ثابتة على الذيل.

لقد ثبت أن إنزيم ميثيل ترانسفيراز الليسين الهستوني (KMT) مسؤول عن عملية المَثْيَلَة هذه في نمط الهيستونات H3 وH4. يستخدم هذا الإنزيم موقعًا نشطًا تحفيزيًا يُسمى نطاق SET (كابح التباين، مُحسِّن الزيست، تريثوراكس). نطاق SET هو تسلسل مكون من 130 حمضًا أمينيًا يشارك في تنظيم أنشطة الجينات. وقد ثبت أن هذا النطاق يرتبط بذيل الهيستون ويتسبب في مَثْيَلَته. ^{[ 36 ]}

من المرجح أن تؤدي تعديلات الهيستون المختلفة وظائف متباينة؛ فالأستلة في موضع ما قد تختلف عن الأستلة في موضع آخر. كما قد تحدث تعديلات متعددة في الوقت نفسه، وقد تعمل هذه التعديلات معًا لتغيير سلوك النيوكليوسوم . تُعرف فكرة أن تعديلات ديناميكية متعددة تنظم نسخ الجينات بطريقة منهجية وقابلة للتكرار باسم " شفرة الهيستون" ، على الرغم من أن فكرة إمكانية قراءة حالة الهيستون بشكل خطي كناقل معلومات رقمي قد تم دحضها إلى حد كبير. يُعد نظام إسكات الجينات القائم على بروتين SIR في الخميرة، والذي يُعنى بتحديد نوع التزاوج الخفي HML وHMR، أحد أفضل الأنظمة فهمًا التي تُنسق إسكات الجينات القائم على الكروماتين .

مثيلة الحمض النووي

تحدث مثيلة الحمض النووي غالبًا في تسلسلات متكررة، وتساعد على كبح التعبير عن العناصر القابلة للنقل وانتقالها : ^{[ 37 ]} نظرًا لأن 5-ميثيل سيتوزين يمكن أن يتحول تلقائيًا إلى ثيميدين (باستبدال النيتروجين بالأكسجين)، فإن مواقع CpG تتعرض للطفرات بشكل متكرر وأصبحت نادرة في الجينوم، باستثناء جزر CpG حيث تبقى عادةً غير مثيلة. وبالتالي، فإن التغيرات فوق الجينية من هذا النوع لديها القدرة على توجيه زيادة في معدلات الطفرات الجينية الدائمة. من المعروف أن أنماط مثيلة الحمض النووي تتشكل وتُعدَّل استجابةً للعوامل البيئية من خلال تفاعل معقد بين ثلاثة إنزيمات مثيلة الحمض النووي مستقلة على الأقل ، وهي DNMT1 وDNMT3A وDNMT3B، وفقدان أي منها قاتل في الفئران. ^{[ 38 ]} يُعدّ DNMT1 أكثر أنواع ميثيل ترانسفيراز وفرةً في الخلايا الجسدية، ^{[ 39 ]} ويتمركز في بؤر التضاعف، ^{[ 40 ]} وله ميلٌ يتراوح بين 10 و40 ضعفًا للحمض النووي نصف الميثيلي ويتفاعل مع مستضد النواة للخلايا المتكاثرة (PCNA). ^{[ 41 ]}

يقوم إنزيم DNMT1، من خلال تعديل الحمض النووي نصف الميثيلي بشكل تفضيلي، بنقل أنماط الميثلة إلى سلسلة مُصنّعة حديثًا بعد تضاعف الحمض النووي ، ولذلك يُشار إليه غالبًا باسم "ميثيل ترانسفيراز الصيانة". ^{[ 42 ]} يُعدّ DNMT1 ضروريًا للنمو الجنيني السليم، والبصمة الوراثية، وتعطيل الكروموسوم X. ^{[ 38 ]}^{[ 43 ]} وللتأكيد على اختلاف هذه الآلية الجزيئية للوراثة عن آلية اقتران قواعد واتسون-كريك التقليدية لنقل المعلومات الوراثية، تمّ تقديم مصطلح "القوالب فوق الجينية". ^{[ 44 ]} علاوة على ذلك، بالإضافة إلى صيانة ونقل حالات الحمض النووي الميثيلي، يمكن أن يعمل المبدأ نفسه في صيانة ونقل تعديلات الهيستون، وحتى الحالات الوراثية السيتوبلازمية ( البنيوية ). ^{[ 45 ]}

مثيلة الحمض النووي الريبي

تم مؤخراً الاعتراف بأن مثيلة الحمض النووي الريبي (RNA) لـ N6-ميثيل الأدينوزين (m6A) باعتبارها أكثر تعديلات الحمض النووي الريبي وفرة في حقيقيات النوى، هي آلية تنظيم جيني مهمة. ^{[ 46 ]}

في عام 2011، ثبت أن مثيلة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) تلعب دورًا حاسمًا في استتباب الطاقة لدى الإنسان. وقد تبين أن جين FTO المرتبط بالسمنة قادر على إزالة مثيلة N6-ميثيل الأدينوزين في الحمض النووي الريبوزي. ^{[ 47 ]}^{[ 48 ]}

تعديلات الهيستون

يمكن أيضًا تعديل الهيستونات H3 وH4 عن طريق إزالة مجموعة الميثيل باستخدام إنزيم نازع ميثيل الليسين من الهيستون (KDM). يحتوي هذا الإنزيم، الذي تم اكتشافه مؤخرًا، على موقع نشط تحفيزيًا يُسمى نطاق جومونجي (JmjC). تحدث عملية إزالة مجموعة الميثيل عندما يستخدم JmjC عوامل مساعدة متعددة لهدرجة مجموعة الميثيل، وبالتالي إزالتها. يتميز JmjC بقدرته على إزالة مجموعة الميثيل من الركائز أحادية وثنائية وثلاثية الميثيل. ^{[ 49 ]}

يمكن للمناطق الكروموسومية أن تتخذ حالات بديلة مستقرة وقابلة للتوريث، مما يؤدي إلى تعبير جيني ثنائي الاستقرار دون تغييرات في تسلسل الحمض النووي. غالبًا ما يرتبط التحكم فوق الجيني بتعديلات تساهمية بديلة للهستونات. ^{[ 50 ]} يُعتقد أن استقرار حالات المناطق الكروموسومية الأكبر حجمًا وقابليتها للتوريث ينطوي على تغذية راجعة إيجابية، حيث تستقطب النيوكليوسومات المعدلة إنزيمات تُعدّل بدورها النيوكليوسومات المجاورة. ^{[ 51 ]} يوجد هنا نموذج عشوائي مبسط لهذا النوع من علم فوق الجينات. ^{[ 52 ]}^{[ 53 ]}

لقد أشير إلى أن تنظيم النسخ القائم على الكروماتين قد يكون وسيطًا لتأثير الحمض النووي الريبوزي الصغير. يمكن للحمض النووي الريبوزي المتداخل الصغير تعديل التعبير الجيني النسخي عبر التعديل اللاجيني للمحفزات المستهدفة . ^{[ 54 ]}

نسخ الحمض النووي الريبوزي

أحيانًا، يقوم الجين، بمجرد تنشيطه، بنسخ منتج يدعم نشاطه بشكل مباشر أو غير مباشر. على سبيل المثال، يعزز كل من Hnf4 و MyoD نسخ العديد من الجينات الخاصة بالكبد والعضلات على التوالي، بما في ذلك جيناتهما الخاصة، من خلال نشاط عوامل النسخ للبروتينات التي يشفرانها. تشمل إشارات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التوظيف التفاضلي لتسلسل هرمي من معقدات تعديل الكروماتين العامة وإنزيمات نقل ميثيل الحمض النووي (DNA methyltransferases) إلى مواقع محددة بواسطة الحمض النووي الريبوزي (RNA) أثناء التمايز والنمو. ^{[ 55 ]} تتوسط التغيرات فوق الجينية الأخرى إنتاج أشكال ربط مختلفة من الحمض النووي الريبوزي (RNA )، أو تكوين الحمض النووي الريبوزي ثنائي السلسلة ( RNAi ). سترث ذرية الخلية التي تم فيها تنشيط الجين هذا النشاط، حتى لو لم يعد المحفز الأصلي لتنشيط الجين موجودًا. غالبًا ما يتم تفعيل هذه الجينات أو تعطيلها عن طريق نقل الإشارات ، مع أنه في بعض الأنظمة التي تلعب فيها الخلايا المتعددة النوى أو الوصلات الفجوية دورًا هامًا، قد ينتشر الحمض النووي الريبوزي (RNA) مباشرةً إلى خلايا أو نوى أخرى عن طريق الانتشار . تُساهم الأم بكمية كبيرة من الحمض النووي الريبوزي والبروتين في الزيجوت أثناء تكوين البويضات أو عبر الخلايا المغذية ، مما ينتج عنه أنماط ظاهرية ذات تأثير أمومي . تنتقل كمية أقل من الحمض النووي الريبوزي للحيوانات المنوية من الأب، ولكن هناك أدلة حديثة تشير إلى أن هذه المعلومات فوق الجينية يمكن أن تؤدي إلى تغييرات مرئية في عدة أجيال من النسل. ^{[ 56 ]}

الميكرو الحمض النووي الريبوزي

تُعدّ الحموض النووية الريبية الميكروية (miRNAs) من أنواع الحموض النووية الريبية غير المشفرة ، ويتراوح حجمها بين 17 و25 نيوكليوتيدًا. تُنظّم هذه الحموض مجموعة واسعة من الوظائف البيولوجية في النباتات والحيوانات. ^{[ 57 ]} حتى عام 2013، تم اكتشاف حوالي 2000 نوع من الحموض النووية الريبية الميكروية في الإنسان، ويمكن العثور عليها عبر الإنترنت في قاعدة بيانات الحموض النووية الريبية الميكروية. ^{[ 58 ]} قد يستهدف كل نوع من الحموض النووية الريبية الميكروية المُعبَّر عنه في الخلية ما بين 100 و200 نوع من الحموض النووية الريبية الرسولية (mRNAs) التي يُثبّطها. ^{[ 59 ]} يحدث معظم تثبيط الحموض النووية الريبية الرسولية عن طريق التسبب في تحلل الحمض النووي الريبي الرسولي المستهدف، بينما يحدث بعض التثبيط على مستوى الترجمة إلى بروتين. ^{[ 60 ]}

يبدو أن حوالي 60% من الجينات البشرية المشفرة للبروتينات تخضع لتنظيم جزيئات miRNA. ^{[ 61 ]} ويخضع العديد من جزيئات miRNA لتنظيم فوق جيني. يرتبط حوالي 50% من جينات miRNA بجزر CpG، ^{[ 57 ]} التي قد تُثبط بواسطة مثيلة فوق جينية. ويُثبط النسخ من جزر CpG المثيلة بقوة وبشكل وراثي. ^{[ 62 ]} بينما تخضع جزيئات miRNA الأخرى لتنظيم فوق جيني إما عن طريق تعديلات الهيستون أو عن طريق مثيلة الحمض النووي وتعديل الهيستون معًا. ^{[ 57 ]}

الحمض النووي الريبي الصغير

تُعدّ جزيئات الحمض النووي الريبوزي الصغيرة ( sRNAs ) أجزاءً صغيرة (50-250 نيوكليوتيدًا) من الحمض النووي الريبوزي غير المشفر، ذات بنية عالية، وتوجد في البكتيريا. تتحكم هذه الجزيئات في التعبير الجيني، بما في ذلك جينات الضراوة في مسببات الأمراض، وتُعتبر أهدافًا جديدة في مكافحة البكتيريا المقاومة للأدوية. ^{[ 63 ]} تلعب هذه الجزيئات دورًا هامًا في العديد من العمليات البيولوجية، حيث ترتبط بجزيئات الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) والبروتينات المستهدفة في بدائيات النوى. تُستخدم تحليلاتها التطورية، على سبيل المثال من خلال تفاعلات sRNA-mRNA المستهدفة أو خصائص ارتباطها بالبروتينات ، لبناء قواعد بيانات شاملة. ^{[ 64 ]} كما يتم إنشاء خرائط جينية لجزيئات sRNA بناءً على أهدافها في الجينومات الميكروبية. ^{[ 65 ]}

الحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر

أظهرت دراسات عديدة الدور المحوري للحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر (lncRNAs) في تنظيم التعبير الجيني والتعديلات الكروموسومية، مما يُسهم بشكل كبير في التحكم في تمايز الخلايا. كما يُسهم هذا الحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر في البصمة الجينية وتعطيل الكروموسوم X. ^{[ 66 ]} في اللافقاريات، مثل الحشرات الاجتماعية كالنحل، تم الكشف عن الحمض النووي الريبوزي الطويل غير المشفر كآلية فوق جينية محتملة عبر جينات خاصة بالأليلات مسؤولة عن العدوانية من خلال التزاوج المتبادل. ^{[ 67 ]}

البريونات

البريونات هي أشكال معدية من البروتينات . عمومًا، تتخذ البروتينات شكل وحدات منفصلة تؤدي وظائف خلوية متميزة، لكن بعض البروتينات قادرة أيضًا على تكوين حالة بنيوية معدية تُعرف بالبريون. على الرغم من أن البريونات تُنظر إليها غالبًا في سياق الأمراض المعدية ، إلا أن تعريفها أوسع نطاقًا، إذ تُقاس بقدرتها على تحويل نسخ أخرى من البروتين نفسه، في حالتها الطبيعية، إلى حالة بنيوية معدية. من هذا المنطلق، يمكن اعتبارها عوامل فوق جينية قادرة على إحداث تغيير ظاهري دون تعديل الجينوم. ^{[ 68 ]}

يعتبر البعض أن البريونات الفطرية ذات تأثير فوق جيني، لأن النمط الظاهري المعدي الذي تسببه يمكن أن يُورث دون تعديل في الجينوم. يُعدّ كل من PSI+ وURE3، اللذان اكتُشفا في الخميرة عامي 1965 و1971 على التوالي، من أكثر أنواع البريونات دراسةً. ^{[ 69 ]}^{[ 70 ]} يمكن أن تُحدث البريونات تأثيرًا ظاهريًا من خلال عزل البروتين في تجمعات، مما يُقلل من نشاطه. في خلايا PSI+، يؤدي فقدان بروتين Sup35 (المسؤول عن إنهاء الترجمة) إلى زيادة معدل قراءة الريبوسومات لكودونات التوقف ، وهو تأثير ينتج عنه كبح الطفرات غير المنطقية في جينات أخرى. ^{[ 71 ]} قد تكون قدرة Sup35 على تكوين البريونات سمة محفوظة. وقد تُمنح هذه القدرة ميزة تكيفية من خلال تمكين الخلايا من التحول إلى حالة PSI+ والتعبير عن السمات الوراثية الكامنة التي تُنهى عادةً بطفرات كودون التوقف. ^{[ 72 ]}^{[ 73 ]}^{[ 74 ]}^{[ 75 ]}

وقد لوحظت أيضًا علم التخلق القائم على البريون في الخميرة Saccharomyces cerevisiae . ^{[ 76 ]}

الأساس الجزيئي

تُعدّل التغيرات فوق الجينية تنشيط بعض الجينات، لكنها لا تُغيّر تسلسل الشفرة الوراثية للحمض النووي. ^{[ 77 ]} قد تتغير البنية المجهرية (وليس الشفرة) للحمض النووي نفسه أو بروتينات الكروماتين المرتبطة به ، مما يؤدي إلى تنشيطه أو تثبيطه. تُمكّن هذه الآلية الخلايا المتمايزة في الكائن متعدد الخلايا من التعبير فقط عن الجينات الضرورية لنشاطها. تُحفظ التغيرات فوق الجينية عند انقسام الخلايا. تحدث معظم هذه التغيرات خلال حياة الكائن الحي فقط؛ ومع ذلك، يمكن أن تنتقل هذه التغيرات إلى نسل الكائن الحي من خلال عملية تُسمى الوراثة فوق الجينية عبر الأجيال . علاوة على ذلك، إذا حدث تثبيط للجين في حيوان منوي أو بويضة مما أدى إلى الإخصاب، فقد ينتقل هذا التعديل فوق الجيني أيضًا إلى الجيل التالي. ^{[ 78 ]}

تشمل العمليات فوق الجينية المحددة ما يلي: الطفرة الموازية ، ووضع العلامات المرجعية ، والبصمة الجينية، وإسكات الجينات ، وتعطيل الكروموسوم X ، وتأثير الموقع ، وإعادة برمجة مثيلة الحمض النووي ، والانتقال الجيني ، والتأثيرات الأمومية ، وتطور التسرطن ، والعديد من تأثيرات المواد المشوهة للأجنة ، وتنظيم تعديلات الهيستون والكروماتين المغاير ، والقيود التقنية التي تؤثر على التوالد العذري والاستنساخ . ^[⁷⁹^]^[⁸⁰^]^[⁸¹^]

تلف الحمض النووي

يمكن أن يتسبب تلف الحمض النووي أيضًا في حدوث تغيرات فوق جينية. ^{[ 82 ]}^{[ 83 ]}^{[ 84 ]} يُعد تلف الحمض النووي شائعًا جدًا، حيث يحدث بمعدل 60,000 مرة يوميًا لكل خلية في جسم الإنسان (انظر: تلف الحمض النووي (الطبيعي) ). يتم إصلاح هذه الأضرار إلى حد كبير، ومع ذلك، قد تبقى بعض التغيرات فوق الجينية في موقع إصلاح الحمض النووي. على وجه الخصوص، يمكن أن يؤدي انقطاع السلسلة المزدوجة في الحمض النووي إلى بدء إسكات جيني فوق جيني غير مبرمج، وذلك من خلال التسبب في مثيلة الحمض النووي، وكذلك من خلال تعزيز أنواع إسكات تعديلات الهيستون (إعادة تشكيل الكروماتين - انظر القسم التالي). ^[⁸⁵^] بالإضافة إلى ذلك، يتراكم إنزيم Parp1 (بوليميراز عديد (ADP)-ريبوز) ومنتجه عديد (ADP)-ريبوز (PAR) في مواقع تلف الحمض النووي كجزء من عملية الإصلاح. ^[⁸⁶^] يؤدي هذا التراكم بدوره إلى توجيه استقطاب وتفعيل بروتين إعادة تشكيل الكروماتين ALC1، الذي قد يُسبب إعادة تشكيل النيوكليوسومات . ^[⁸⁷^] وقد وُجد أن إعادة تشكيل النيوكليوسومات تُسبب، على سبيل المثال، إسكاتًا جينيًا لجين إصلاح الحمض النووي MLH1. ^[²¹^]^[⁸⁸^] تُسبب المواد الكيميائية المُتلفة للحمض النووي، مثل البنزين والهيدروكينون والستايرين ورابع كلوريد الكربون وثلاثي كلورو الإيثيلين ^، نقصًا كبيرًا في مثيلة الحمض النووي، بعضها من خلال تنشيط مسارات الإجهاد التأكسدي . ^[⁸⁹ ]

من المعروف أن الأطعمة تُغير التركيب الجيني للفئران عند اتباعها أنظمة غذائية مختلفة. ^{[ 90 ]} تزيد بعض مكونات الطعام، عبر آليات جينية، من مستويات إنزيمات إصلاح الحمض النووي مثل MGMT و MLH1 ^{[ 91 ]} و p53 . ^{[ 92 ]} بينما تُقلل مكونات غذائية أخرى من تلف الحمض النووي، مثل إيزوفلافونات الصويا . في إحدى الدراسات، انخفضت مؤشرات الإجهاد التأكسدي، مثل النيوكليوتيدات المُعدلة التي قد تنتج عن تلف الحمض النووي، بعد اتباع نظام غذائي مُدعم بالصويا لمدة ثلاثة أسابيع. ^{[ 93 ]} كما لوحظ انخفاض في تلف الحمض النووي التأكسدي بعد ساعتين من تناول مستخلص ثفل التوت البري ( Vaccinium myrtillius L.) الغني بالأنثوسيانين . ^[⁹⁴^]

إصلاح الحمض النووي

يُعدّ تلف الحمض النووي شائعًا جدًا، ويخضع لإصلاح مستمر. قد تُصاحب عملية إصلاح الحمض النووي التأكسدي أو انقطاعات السلسلة المزدوجة تغيرات جينية. في الخلايا البشرية، يحدث تلف الحمض النووي التأكسدي حوالي 10000 مرة يوميًا، بينما تحدث انقطاعات السلسلة المزدوجة للحمض النووي من 10 إلى 50 مرة في دورة الخلية الواحدة في الخلايا الجسدية المتكاثرة (انظر: تلف الحمض النووي (الطبيعي) ). تكمن الميزة الانتقائية لإصلاح الحمض النووي في تمكين الخلية من البقاء على قيد الحياة في مواجهة تلف الحمض النووي. أما الميزة الانتقائية للتغيرات الجينية التي تحدث مع إصلاح الحمض النووي، فلا تزال غير واضحة.

يمكن أن يؤدي إصلاح تلف الحمض النووي التأكسدي إلى تغيير المؤشرات فوق الجينية

في الحالة المستقرة (مع حدوث الأضرار الداخلية وإصلاحها)، يوجد حوالي 2400 جزيء غوانين متضرر بالأكسدة، يُشكّل 8-أوكسو-2'-ديوكسي غوانوزين (8-OHdG) في الحمض النووي للخلايا الثديية المتوسطة. ^{[ 95 ]} يُشكّل 8-OHdG حوالي 5% من الأضرار التأكسدية الشائعة في الحمض النووي. ^{[ 96 ]} لا تتوزع جزيئات الغوانين المؤكسدة عشوائيًا بين جميع جزيئات الغوانين في الحمض النووي، بل يوجد تفضيل تسلسلي للغوانين في موقع CpG مثيل (سيتوزين متبوعًا بغوانين على امتداد اتجاهه 5' → 3' ، حيث يكون السيتوزين مثيلًا (5-mCpG)). ^{[ 97 ]} يتميز موقع 5-mCpG بأقل جهد تأين لأكسدة الغوانين.

يمتلك الغوانين المؤكسد قدرة على إحداث اختلالات في الاقتران، كما أنه مُطفر. ^{[ 99 ]} يُعد إنزيم أوكسوجوانين جليكوزيلاز (OGG1) الإنزيم الرئيسي المسؤول عن استئصال الغوانين المؤكسد أثناء إصلاح الحمض النووي. يعثر OGG1 على 8-OHdG ويرتبط به في غضون ثوانٍ معدودة. ^{[ 100 ]} مع ذلك، لا يستأصل OGG1 جزيء 8-OHdG فورًا. في خلايا هيلا، يحدث نصف الحد الأقصى لإزالة 8-OHdG خلال 30 دقيقة، ^{[ 101 ]} وفي الفئران المُشعَّعة، تُزال جزيئات 8-OHdG المُستحثة في كبد الفأر بنصف عمر يبلغ 11 دقيقة. ^{[ 96 ]}

عندما يتواجد إنزيم OGG1 عند قاعدة غوانين مؤكسدة ضمن موقع CpG مثيل، فإنه يستقطب إنزيم TET1 إلى موقع 8-OHdG المتضرر (انظر الشكل). وهذا يسمح لإنزيم TET1 بإزالة مجموعة الميثيل من قاعدة سيتوزين مثيلة مجاورة. وتُعد إزالة مجموعة الميثيل من السيتوزين تغييراً فوق جينياً.

على سبيل المثال، عند معالجة خلايا ظهارة الثدي البشرية ببيروكسيد الهيدروجين ( _H₂O₂₎ لمدة ست ساعات، ازداد مستوى 8-OHdG في الحمض النووي بمقدار 3.5 أضعاف تقريبًا، مما أدى إلى إزالة مثيلة حوالي 80% من 5-ميثيل سيتوزين في الجينوم. ^{[ 98 ]} تؤدي إزالة مثيلة مواقع CpG في مُحفِّز الجين بواسطة نشاط إنزيم TET إلى زيادة نسخ الجين إلى الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA). _[^{102 ] في} الخلايا المعالجة ببيروكسيد _{الهيدروجين} ، تم فحص جين واحد على وجه الخصوص، وهو BACE1 . ^[⁹⁸^] انخفض مستوى مثيلة جزيرة CpG الخاصة بجين BACE1 (وهو تغيير فوق جيني)، مما سمح بزيادة تعبير الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الخاص بجين BACE1 بمقدار 6.5 أضعاف تقريبًا .

بينما يؤدي حضن الخلايا مع بيروكسيد الهيدروجين ( _H₂O₂₎ لمدة ست ساعات إلى إزالة كبيرة لمجموعة الميثيل من مواقع 5-mCpG، يبدو أن فترات أقصر من الحضن مع بيروكسيد الهيدروجين _تُحفز تغيرات جينية أخرى. يؤدي تعريض الخلايا لبيروكسيد الهيدروجين _{لمدة 30 دقيقة إلى استقطاب بروتين إصلاح عدم التطابق MSH2-MSH6}_{، وهو ثنائي غير متجانس}_، لإنزيم ناقل ميثيل الحمض النووي 1 ( DNMT1 ) إلى مواقع بعض أنواع تلف الحمض النووي التأكسدي. ^[¹⁰³^] قد يُسبب هذا زيادة في مثيلة السيتوزينات (تغيرات جينية) في هذه المواقع.

قام جيانغ وآخرون ^{[ 104 ]} بمعالجة _خلاياHEK 293 بعوامل مُسببة لتلف الحمض النووي التأكسدي، ( برومات البوتاسيوم (KBrO3 ₎ أو كرومات البوتاسيوم ( _K2CrO4 )). حدث إصلاح استئصال القاعدة (BER) للتلف التأكسدي، حيث تموضع إنزيم إصلاح الحمض النووي بوليميراز بيتا على قواعد الغوانين المؤكسدة. يُعد بوليميراز بيتا البوليميراز البشري الرئيسي في إصلاح استئصال القاعدة قصير المدى لتلف الحمض النووي التأكسدي. كما وجد جيانغ وآخرون ^[¹⁰⁴^] أن بوليميراز بيتا استقطب بروتين ناقل ميثيل الحمض النووي DNMT3b إلى مواقع إصلاح استئصال القاعدة. ثم قاموا بتقييم نمط المَثْيَلَة على مستوى النوكليوتيد الواحد في منطقة صغيرة من الحمض النووي تشمل منطقة المحفز ومنطقة النسخ المبكر لجين BRCA1 . أدى تلف الحمض النووي التأكسدي الناتج عن البرومات إلى تعديل نمط مَثْيَلَة الحمض النووي (مُسببًا تغييرات فوق جينية) في مواقع CpG ضمن منطقة الحمض النووي المدروسة. في الخلايا غير المعالجة، احتوت مواقع CpG الموجودة عند -189، -134، -29، -19، +16، و+19 من جين BRCA1 على سيتوزينات مثيلة (حيث يُمثل الترقيم موقع بدء نسخ الحمض النووي الريبوزي الرسول ، وتشير الأرقام السالبة إلى النيوكليوتيدات في منطقة المحفز العلوي). أدى التأكسد الناتج عن المعالجة بالبرومات إلى فقدان مثيلة السيتوزين عند -189، -134، +16، و+19، بينما أدى أيضًا إلى تكوين مثيلة جديدة عند مواقع CpG الموجودة عند -80، -55، -21، و+8 بعد السماح بإصلاح الحمض النووي.

يؤدي إصلاح إعادة التركيب المتماثل إلى تغيير المؤشرات فوق الجينية

تشير عدة مقالات إلى استقطاب إنزيم ناقل ميثيل الحمض النووي 1 (DNMT1) إلى مواقع انقطاعات الحمض النووي المزدوجة. ^{[ 105 ]}^{[ 106 ]}^{[ 107 ]} أثناء إصلاح الانقطاع المزدوج عن طريق إعادة التركيب المتماثل (HR) ، يؤدي وجود DNMT1 إلى اختلاف مستويات السيتوزينات الميثيلية في سلسلتي الحمض النووي المُصلحتين. تصبح إحدى السلسلتين ميثيلية بشكل متكرر في حوالي 21 موقع CpG أسفل موقع الانقطاع المزدوج المُصلح. بينما تفقد السلسلة الأخرى الميثيلية في حوالي ستة مواقع CpG كانت ميثيلية سابقًا أسفل موقع الانقطاع المزدوج، بالإضافة إلى فقدانها الميثيلية في حوالي خمسة مواقع CpG كانت ميثيلية سابقًا أعلى موقع الانقطاع المزدوج. عند تضاعف الكروموسوم، ينتج عن ذلك كروموسوم ابنة واحد ميثيلي بكثافة أسفل موقع الانقطاع السابق، وآخر غير ميثيلي في المنطقة الواقعة أعلى وأسفل موقع الانقطاع السابق. فيما يتعلق بالجين الذي تضرر نتيجةً لكسر الحمض النووي المزدوج، فإن نصف الخلايا الناتجة تُظهر تعبيرًا عاليًا لهذا الجين، بينما يُثبط التعبير عنه في النصف الآخر. وعندما تم الحفاظ على مستنسخات هذه الخلايا لمدة ثلاث سنوات، استمرت أنماط المثيلة الجديدة طوال تلك الفترة. ^{[ 108 ]}

في الفئران التي خضعت لعملية إدخال إعادة تركيب موجهة بالتماثل بوساطة تقنية كريسبر في جينومها، لوحظ وجود عدد كبير من عمليات المثيلة المتزايدة لمواقع CpG داخل الإدخال المرتبط بكسر السلسلة المزدوجة. ^{[ 109 ]}

قد يؤدي الربط غير المتجانس للنهايات إلى حدوث بعض التغيرات في المؤشرات فوق الجينية.

قد يؤدي إصلاح انقطاع الحمض النووي المزدوج بواسطة آلية الربط غير المتجانس للنهايات (NHEJ) في الخلية إلى ظهور خلايا ذرية ذات تعبير منخفض للجين الذي يحمل الانقطاع الأولي، وخلايا ذرية أخرى ذات تعبير عالٍ لهذا الجين نتيجةً لتغيرات فوق جينية مرتبطة بإصلاح NHEJ. ويُقدّر معدل حدوث هذه التغيرات الفوق جينية التي تُسبب تثبيط الجين بعد إصلاح انقطاع الحمض النووي المزدوج بواسطة NHEJ بنحو 0.9%. ^{[ 106 ]}

الوراثة الهيكلية

في الهدبيات مثل التتراهيمينا والبراميسيوم ، تُظهر الخلايا المتطابقة جينيًا اختلافات وراثية في أنماط صفوف الأهداب على سطحها. ويمكن توريث الأنماط المُعدّلة تجريبيًا إلى الخلايا الوليدة. ويبدو أن التراكيب الموجودة تعمل كقوالب لتراكيب جديدة. آليات هذا التوريث غير واضحة، ولكن توجد أسباب تدعو إلى افتراض أن الكائنات متعددة الخلايا تستخدم أيضًا تراكيب الخلايا الموجودة لتكوين تراكيب جديدة. ^{[ 110 ]}^{[ 111 ]}^{[ 112 ]}

تحديد موقع النيوكليوسوم

تحتوي الجينومات حقيقية النواة على العديد من النيوكليوسومات . ولا يتم تحديد موقع النيوكليوسومات عشوائيًا، بل يحدد مدى سهولة وصول البروتينات التنظيمية إلى الحمض النووي. وقد تبين أن المحفزات النشطة في الأنسجة المختلفة لها خصائص مختلفة في تحديد موقع النيوكليوسومات. ^{[ 113 ]} وهذا ما يحدد الاختلافات في التعبير الجيني وتمايز الخلايا. وقد تبين أن بعض النيوكليوسومات على الأقل تبقى في الخلايا المنوية (حيث يتم استبدال معظم الهستونات، وليس جميعها، بالبروتامينات ). وبالتالي، فإن تحديد موقع النيوكليوسومات قابل للتوريث إلى حد ما. وقد كشفت دراسات حديثة عن وجود صلات بين تحديد موقع النيوكليوسومات وعوامل فوق جينية أخرى، مثل مثيلة الحمض النووي وهيدروكسي مثيلته. ^{[ 114 ]}

متغيرات الهيستون

تُدمج أنواع مختلفة من الهيستون في مناطق محددة من الجينوم بطريقة غير عشوائية. ويمكن أن تؤثر خصائصها الكيميائية الحيوية المختلفة على وظائف الجينوم من خلال أدوارها في تنظيم الجينات، ^{[ 115 ]} والحفاظ على بنية الكروموسومات. ^{[ 116 ]}

البنية الجينومية

يُعد التكوين ثلاثي الأبعاد للجينوم (الجينوم ثلاثي الأبعاد) معقدًا وديناميكيًا وحاسمًا لتنظيم الوظيفة الجينومية والعمليات النووية مثل تضاعف الحمض النووي، والنسخ، وإصلاح تلف الحمض النووي. ^{[ 117 ]}

الوظائف والنتائج

في الدماغ

ذاكرة

يعود تكوين الذاكرة والحفاظ عليها إلى التغيرات اللاجينية التي تسبب التغيرات الديناميكية المطلوبة في نسخ الجينات التي تخلق الذاكرة وتجددها في الخلايا العصبية. ^{[ 30 ]}

يمكن لحدث ما أن يطلق سلسلة من التفاعلات التي تؤدي إلى تغييرات في مثيلة مجموعة كبيرة من الجينات في الخلايا العصبية، مما يعطي تمثيلاً للحدث، أي ذاكرة. ^{[ 30 ]}

تشمل مناطق الدماغ المهمة في تكوين الذكريات الحصين، والقشرة الجبهية الإنسية (mPFC)، والقشرة الحزامية الأمامية، واللوزة الدماغية، كما هو موضح في الرسم التخطيطي للدماغ البشري في هذا القسم. ^{[ 118 ]}

عند تكوين ذاكرة قوية، كما هو الحال في الفئران التي تخضع لتكييف الخوف السياقي (CFC)، فإن من أوائل الأحداث التي تحدث هو تكوّن أكثر من 100 كسر في سلسلتي الحمض النووي (DNA) بواسطة إنزيم توبويزوميراز IIB في خلايا عصبية في الحصين والقشرة الجبهية الأمامية الإنسية (mPFC). ^{[ 119 ]} تقع هذه الكسور في مواقع محددة تسمح بتنشيط نسخ الجينات المبكرة الفورية (IEGs) المهمة في تكوين الذاكرة، مما يسمح بتعبيرها في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) ، حيث يبلغ نسخ mRNA ذروته بعد سبع إلى عشر دقائق من التكييف السياقي للخوف. ^{[ 119 ]}^{[ 120 ]}

يُعدّ كلٌّ من EGR1 ^{[ 121 ]} ومتغير المحفز البديل لـ DNMT3A ، وهو DNMT3A2 ^{[ 122 ]} ، من أهم الجينات المبكرة الفورية (IEGs) في تكوين الذاكرة . يرتبط بروتين EGR1 بالحمض النووي DNA عند مواقع ارتباطه، 5′-GCGTGGGCG-3′ أو 5′-GCGGGGGCGG-3′، ويوجد حوالي 12000 موقع في الجينوم يمكن لبروتين EGR1 الارتباط بها ^{[ 123 ]} . يرتبط بروتين EGR1 بالحمض النووي DNA في مناطق محفزات الجينات ومعززاتها . يقوم EGR1 بتجنيد إنزيم إزالة الميثيل TET1 إلى موقع ارتباطه، وينقل TET1 إلى حوالي 600 موقع على الجينوم حيث يمكنه إزالة الميثيل وتنشيط الجينات المرتبطة به ^[¹²³^{] .}

تستطيع إنزيمات مثيلة الحمض النووي DNMT3A1 وDNMT3A2 وDNMT3B مثيلة السيتوزينات (انظر الصورة في هذا القسم) في مواقع CpG داخل أو بالقرب من محفزات الجينات. وكما أوضح مانزو وآخرون ^{[ 124 ]} ، تختلف هذه الإنزيمات الثلاثة في مواقع ارتباطها الجينومية ونشاط مثيلة الحمض النووي في مواقع تنظيمية مختلفة. وقد حدد مانزو وآخرون 3970 منطقة جينومية غنية حصريًا بـ DNMT3A1، و3838 منطقة لـ DNMT3A2، و3432 منطقة لـ DNMT3B. وعندما يُحفز DNMT3A2 حديثًا كجين فوري الاستجابة (عند تنشيط الخلايا العصبية)، تحدث العديد من مثيلات السيتوزين الجديدة، على الأرجح في المناطق المستهدفة لـ DNMT3A2. ^{[ 122 ]} وجد أن مستويات IEG المستحثة بالنشاط العصبي لـ Dnmt3a2 في الحصين تحدد القدرة على تكوين ذكريات طويلة المدى.

تُكوّن الفئران ذكريات ترابطية طويلة الأمد بعد التكييف الشرطي للخوف السياقي. ^{[ 125 ]} وجد ديوك وآخرون ^{[ 29 ]} أنه بعد 24 ساعة من التكييف الشرطي للخوف السياقي في الفئران، لوحظ تغير في مثيلة 2097 جينًا (9.17% من جينات جينوم الفأر) في خلايا عصبية الحصين. عندما توجد سيتوزينات مثيلة حديثًا في مواقع CpG في مناطق المحفزات الجينية، غالبًا ما تُثبّط هذه الجينات، بينما قد تُنشّط عندما توجد سيتوزينات غير مثيلة حديثًا. ^{[ 126 ]} بعد التكييف الشرطي للخوف السياقي، لوحظ انخفاض في التعبير الجيني لـ 1048 جينًا، وارتفاع في التعبير الجيني لـ 564 جينًا. وبالمثل، عند خضوع الفئران للتكييف الشرطي للخوف السياقي، لوحظ بعد ساعة واحدة في منطقة الحصين من دماغ الفأر وجود 675 جينًا غير مثيل و613 جينًا مفرط المثيلة. ^{[ 127 ]} مع ذلك، لا تبقى الذكريات في الحصين، بل تُخزَّن بعد أربعة أو خمسة أسابيع في القشرة الحزامية الأمامية. ^{[ 128 ]} في الدراسات التي أُجريت على الفئران بعد التكييف الإجرائي للتكييف، أظهر هالدر وآخرون ^{[ 127 ]} أنه بعد أربعة أسابيع من التكييف الإجرائي للتكييف، كان هناك ما لا يقل عن 1000 جين مُتَماثِل بشكلٍ مختلف وأكثر من 1000 جين مُعَبَّر عنه بشكلٍ مختلف في القشرة الحزامية الأمامية، بينما في الوقت نفسه، انعكست التغيرات في مثيلة الحمض النووي في الحصين.

يُؤدي التغيير اللاجيني في مثيلة الحمض النووي الريبوزي الرسول ( mRNA) بعد تكوين ذاكرة جديدة إلى إنشاء مجموعة مختلفة من جزيئات mRNA النووية. وكما استعرض بيرنشتاين ^{[ 30 ]،} غالبًا ما تُعبأ هذه المجموعة الجديدة من جزيئات mRNA النووية، المُحددة لاجينيًا، في حبيبات عصبية، أو ما يُعرف بـ mRNA-NP ، والتي تتكون من mRNA، ووحدات فرعية ريبوسومية صغيرة وكبيرة ، وعوامل بدء الترجمة، وبروتينات ربط الحمض النووي الريبوزي التي تُنظم وظيفة mRNA. تُنقل هذه الحبيبات العصبية من نواة الخلية العصبية، وتُوجه، وفقًا للمناطق غير المترجمة 3′ من mRNA في الحبيبات (التي تُعرف بـ "رموزها البريدية")، إلى التغصنات العصبية . قد يتمركز ما يقرب من 2500 جزيء mRNA في تغصنات الخلايا العصبية الهرمية في الحصين، وربما يوجد 450 نسخة في النهايات العصبية قبل المشبكية المثيرة (الأشواك التغصنية). تختلف حساسية مجموعات النسخ الجينية المتغيرة (الناتجة عن التغيرات فوق الجينية في نواة الخلية العصبية) للإشارات، وهو ما يُشكل أساس اللدونة المشبكية المتغيرة. وغالبًا ما تُعتبر اللدونة المشبكية المتغيرة الأساس الكيميائي العصبي للتعلم والذاكرة.

شيخوخة

تلعب علم التخلق دورًا رئيسيًا في شيخوخة الدماغ والتدهور المعرفي المرتبط بالعمر، مما يؤثر على إطالة العمر . ^{[ 129 ]}^{[ 130 ]}^{[ 131 ]}^{[ 132 ]}^{[ 133 ]}

أخرى وعامة

في مرحلة البلوغ، تُعدّ التغيرات في الإبيجينوم مهمةً للعديد من الوظائف الإدراكية العليا. ويرتبط خلل تنظيم الآليات الإبيجينية بالاضطرابات والأمراض التنكسية العصبية. وتتميز التعديلات الإبيجينية في الخلايا العصبية بأنها ديناميكية وقابلة للعكس. ^{[ 134 ]} ويؤثر التنظيم الإبيجيني على نشاط الخلايا العصبية، مما يؤثر على التعلم والذاكرة والعمليات الإدراكية الأخرى . ^{[ 135 ]}

يمكن للأحداث المبكرة، بما في ذلك أثناء التطور الجنيني ، أن تؤثر على النمو والإدراك والنتائج الصحية من خلال آليات فوق جينية . ^{[ 136 ]}

تم اقتراح الآليات اللاجينية باعتبارها "آلية جزيئية محتملة لتأثيرات الهرمونات الداخلية على تنظيم دوائر الدماغ النامية". ^{[ 137 ]}

قد تتفاعل العناصر الغذائية مع الإبيجينوم "لحماية أو تعزيز العمليات المعرفية طوال فترة الحياة". ^{[ 138 ]}^{[ 139 ]}

تشير مراجعة إلى أن التأثيرات العصبية البيولوجية للتمارين البدنية عبر علم التخلق تبدو "محورية في بناء "ذاكرة فوق جينية" للتأثير على وظائف الدماغ والسلوك على المدى الطويل"، وقد تكون قابلة للتوريث. ^{[ 140 ]}

في المشبك المحوري الهدبي ، يوجد تواصل بين المحاور العصبية السيروتونينية والأهداب الأولية الشبيهة بالهوائيات للخلايا العصبية الهرمية CA1، مما يُغير الحالة فوق الجينية للخلايا العصبية في النواة عبر إشارات تختلف عن تلك الموجودة في غشاء البلازما (وعلى المدى الطويل). ^[¹⁴¹^]^[¹⁴²^]

تلعب علم التخلق أيضًا دورًا رئيسيًا في تطور الدماغ لدى البشر . ^{[ 143 ]}

تطوير

يمكن تقسيم علم التخلق النمائي إلى نوعين: التخلق المحدد مسبقًا والتخلق الاحتمالي. التخلق المحدد مسبقًا هو حركة أحادية الاتجاه من التطور البنيوي في الحمض النووي إلى النضج الوظيفي للبروتين. ويعني مصطلح "محدد مسبقًا" هنا أن التطور مُخطط له وقابل للتنبؤ. أما التخلق الاحتمالي، فهو تطور ثنائي الاتجاه بين البنية والوظيفة، يتأثر بالخبرات والتأثيرات الخارجية. ^{[ 144 ]}

يُعدّ التوارث فوق الجيني الجسدي، ولا سيما من خلال تعديلات الحمض النووي والهيستونات التساهمية وإعادة تموضع النيوكليوسومات ، بالغ الأهمية في نمو الكائنات حقيقية النواة متعددة الخلايا. ^{[ 114 ]} تسلسل الجينوم ثابت (مع بعض الاستثناءات الملحوظة)، لكن الخلايا تتمايز إلى أنواع عديدة مختلفة، تؤدي وظائف متباينة، وتستجيب بشكل مختلف للبيئة والإشارات بين الخلايا. وهكذا، مع نمو الأفراد، تُفعّل المورفوجينات أو تُثبّط الجينات بطريقة وراثية فوق جينية، مما يُكسب الخلايا ذاكرة. في الثدييات، تتمايز معظم الخلايا نهائيًا، مع احتفاظ الخلايا الجذعية فقط بالقدرة على التمايز إلى أنواع خلوية متعددة ("القدرة على التمايز إلى جميع أنواع الخلايا" و"القدرة على التمايز إلى أنواع متعددة"). في الثدييات ، تستمر بعض الخلايا الجذعية في إنتاج خلايا متمايزة حديثًا طوال الحياة، كما هو الحال في تكوين الخلايا العصبية ، لكن الثدييات غير قادرة على الاستجابة لفقدان بعض الأنسجة، على سبيل المثال، عدم القدرة على تجديد الأطراف، وهو ما تستطيع بعض الحيوانات الأخرى فعله. تنظم التعديلات فوق الجينية عملية الانتقال من الخلايا الجذعية العصبية إلى الخلايا السلفية الدبقية (على سبيل المثال، يتم تنظيم التمايز إلى خلايا قليلة التغصن عن طريق إزالة الأسيتيل ومثيلة الهستونات). ^{[ 145 ]} على عكس الحيوانات، لا تتمايز الخلايا النباتية بشكل نهائي، بل تظل قادرة على التمايز إلى أي نوع من الخلايا، مما يمنحها القدرة على إنتاج نبات جديد. وبينما تستخدم النباتات العديد من الآليات فوق الجينية نفسها التي تستخدمها الحيوانات، مثل إعادة تشكيل الكروماتين ، فقد افترض الباحثون أن بعض أنواع الخلايا النباتية لا تستخدم أو لا تحتاج إلى "ذاكرة خلوية"، بل تعيد ضبط أنماط التعبير الجيني لديها باستخدام المعلومات الموضعية من البيئة والخلايا المحيطة لتحديد مصيرها. ^{[ 146 ]}

قد تحدث تغيرات فوق جينية استجابةً للتعرض البيئي؛ فعلى سبيل المثال، يؤدي تناول الأم لمكملات الجينيستين الغذائية (250 ملغم/كغم) إلى تغيرات فوق جينية تؤثر على التعبير الجيني للأغوتي ، مما يؤثر بدوره على لون الفراء والوزن وميل الحيوانات للإصابة بالسرطان. ^{[ 147 ]}^{[ 148 ]}^{[ 149 ]} وتركز الأبحاث الجارية على استكشاف تأثير عوامل التشوه الخلقي الأخرى المعروفة ، مثل اعتلال الجنين السكري ، على بصمات المثيلة . ^{[ 150 ]}

أشارت نتائج مثيرة للجدل من إحدى الدراسات إلى أن التجارب الصادمة قد تُنتج إشارة فوق جينية قابلة للانتقال إلى الأجيال القادمة. دُرِّبت فئران، باستخدام صدمات كهربائية في القدم، على الخوف من رائحة زهر الكرز. وأفاد الباحثون أن نسل الفئران أظهر نفورًا متزايدًا من هذه الرائحة تحديدًا. ^{[ 151 ]}^{[ 152 ]} واقترحوا حدوث تغيرات فوق جينية تزيد من التعبير الجيني، وليس في الحمض النووي نفسه، في جين M71، الذي يتحكم في وظيفة مستقبلات الروائح في الأنف، والتي تستجيب تحديدًا لرائحة زهر الكرز. ولوحظت تغيرات جسدية مرتبطة بوظيفة حاسة الشم في أدمغة الفئران المدربة ونسلها. ووُجهت عدة انتقادات، منها ضعف القوة الإحصائية للدراسة كدليل على وجود بعض المخالفات، مثل التحيز في الإبلاغ عن النتائج. ^{[ 153 ]} ونظرًا لمحدودية حجم العينة، فمن المحتمل ألا يظهر التأثير ضمن الدلالة الإحصائية حتى لو كان موجودًا. أشارت الانتقادات إلى أن احتمال ظهور نتائج إيجابية في جميع التجارب المذكورة، في حال اتباع بروتوكول متطابق، بافتراض وجود التأثيرات المزعومة، لا يتجاوز 0.4%. كما لم يوضح الباحثون أيّ الفئران كانت شقيقة، وتعاملوا مع جميع الفئران على أنها مستقلة إحصائيًا. ^{[ 154 ]} وأشار الباحثون الأصليون إلى نتائج سلبية في ملحق الورقة البحثية أغفلتها الانتقادات في حساباتها، وتعهدوا بتتبع أيّ الفئران كانت شقيقة في المستقبل. ^{[ 155 ]}

عبر الأجيال

كانت الآليات فوق الجينية جزءًا ضروريًا من الأصل التطوري لتخصص الخلايا . ^{[ 156 ]} على الرغم من أن علم التخلق في الكائنات متعددة الخلايا يُعتقد عمومًا أنه آليةٌ تُسهم في التخصص، حيث تُعاد ضبط الأنماط فوق الجينية عند تكاثر الكائنات، فقد لوحظت بعض حالات الوراثة فوق الجينية عبر الأجيال (مثل ظاهرة الطفرة الموازية الملاحظة في الذرة ). مع أن معظم هذه السمات فوق الجينية متعددة الأجيال تُفقد تدريجيًا على مدى عدة أجيال، إلا أن احتمال أن يكون علم التخلق متعدد الأجيال جانبًا آخر من جوانب التطور والتكيف يبقى قائمًا. وكما ذُكر سابقًا، يُعرّف البعض علم التخلق بأنه قابل للتوريث.

يُعدّ عزل الخط الجرثومي أو حاجز فايسمان خاصًا بالحيوانات، بينما يُعدّ التوارث فوق الجيني أكثر شيوعًا في النباتات والكائنات الدقيقة. وقد جادل كلٌّ من إيفا جابلونكا ، وماريون ج. لامب ، وإتيان دانشان بأن هذه التأثيرات قد تتطلب تحسينات على الإطار المفاهيمي القياسي للتوليف الحديث ، ودعوا إلى توليف تطوري موسع . ^{[ 157 ]}^{[ 158 ]}^{[ 159 ]} وقد أدرج علماء أحياء تطوريون آخرون، مثل جون ماينارد سميث ، التوارث فوق الجيني في نماذج علم الوراثة السكانية ^{[ 160 ]} أو أنهم يشككون علنًا في التوليف التطوري الموسع ( مايكل لينش ). ^{[ 161 ]} ويذكر توماس ديكنز وقاضي رحمن أن الآليات فوق الجينية، مثل مثيلة الحمض النووي وتعديل الهيستون، تُورَث جينيًا تحت سيطرة الانتقاء الطبيعي ، وبالتالي فهي تندرج تحت "التوليف الحديث" السابق . ^{[ 162 ]}

هناك طريقتان مهمتان يمكن أن يختلف بهما التوارث اللاجيني عن التوارث الجيني التقليدي، مع ما يترتب على ذلك من عواقب مهمة على التطور، وهما:

يمكن أن تكون معدلات الطفرات فوق الجينية أسرع بكثير من معدلات الطفرات ^{[ 163 ]}
تكون الطفرات فوق الجينية قابلة للعكس بسهولة أكبر ^{[ 164 ]}

في النباتات، تزيد احتمالية حدوث طفرات مثيلة الحمض النووي الوراثية بمقدار 100,000 مرة مقارنةً بطفرات الحمض النووي. ^{[ 165 ]} يمكن لعنصر وراثي فوق جيني، مثل نظام PSI+، أن يعمل كآلية مؤقتة، كافية للتكيف قصير الأجل، مما يسمح للسلالة بالبقاء لفترة كافية لحدوث طفرة و/أو إعادة تركيب جيني لاستيعاب التغير الظاهري التكيفي وراثيًا . ^{[ 166 ]} وجود هذه الإمكانية يزيد من قابلية النوع للتطور .

تم الإبلاغ عن أكثر من 100 حالة من ظواهر الوراثة اللاجينية عبر الأجيال في مجموعة واسعة من الكائنات الحية، بما في ذلك بدائيات النوى والنباتات والحيوانات. ^{[ 167 ]} على سبيل المثال، تغير فراشات الحداد لونها من خلال تغيرات هرمونية استجابةً لتجارب درجات حرارة متفاوتة. ^{[ 168 ]}

يُعدّ الفطر الخيطي Neurospora crassa نموذجًا بارزًا لفهم آلية التحكم في مثيلة السيتوزين ووظيفتها. في هذا الكائن الحي، ترتبط مثيلة الحمض النووي ببقايا نظام دفاعي جيني يُسمى RIP (الطفرة النقطية المُستحثة بالتكرار)، وتُثبّط التعبير الجيني عن طريق تثبيط استطالة النسخ. ^{[ 169 ]}

يتولد بريون الخميرة PSI نتيجة لتغير بنيوي في عامل إنهاء الترجمة، والذي يُورث للخلايا الوليدة. وهذا يوفر ميزة للبقاء في ظل الظروف المعاكسة، مما يُجسد التنظيم فوق الجيني الذي يُمكّن الكائنات وحيدة الخلية من الاستجابة السريعة للضغوط البيئية. ويمكن اعتبار البريونات عوامل فوق جينية قادرة على إحداث تغيير في النمط الظاهري دون تعديل الجينوم. ^{[ 170 ]}

يُمكن الكشف المباشر عن العلامات فوق الجينية في الكائنات الدقيقة باستخدام تقنية التسلسل في الوقت الحقيقي لجزيء واحد ، حيث تسمح حساسية البوليميراز بقياس المثيلة والتعديلات الأخرى أثناء تسلسل جزيء الحمض النووي. ^{[ 171 ]} وقد أثبتت العديد من المشاريع القدرة على جمع بيانات فوق جينومية شاملة في البكتيريا. ^{[ 172 ]}^{[ 173 ]}^{[ 174 ]}^{[ 175 ]}

علم التخلق في البكتيريا

بينما تُعدّ علم التخلق المتوالي ذا أهمية جوهرية في حقيقيات النوى ، وخاصة الحيوانات متعددة الخلايا ، فإنه يؤدي دورًا مختلفًا في البكتيريا. ^{[ 176 ]} والأهم من ذلك، أن حقيقيات النوى تستخدم آليات التخلق المتوالي بشكل أساسي لتنظيم التعبير الجيني، وهو ما نادرًا ما تفعله البكتيريا. مع ذلك، تستخدم البكتيريا على نطاق واسع مثيلة الحمض النووي بعد التضاعف للتحكم التخلقي في تفاعلات الحمض النووي مع البروتين. كما تستخدم البكتيريا مثيلة الأدينين في الحمض النووي (بدلًا من مثيلة السيتوزين ) كإشارة تخلقية. تُعدّ مثيلة الأدينين في الحمض النووي مهمة في ضراوة البكتيريا في كائنات حية مثل الإشريكية القولونية ، والسالمونيلا ، والضمة ، واليرسينيا ، والمستدمية ، والبروسيلا . في بكتيريا ألفا بروتيو ، تنظم مثيلة الأدينين دورة الخلية وتربط نسخ الجينات بتضاعف الحمض النووي. في بكتيريا غاما بروتيو ، يوفر مثيلة الأدينين إشارات لتضاعف الحمض النووي، وانفصال الكروموسومات، وإصلاح عدم تطابق القواعد، وتغليف العاثيات، ونشاط الترانسبيوزاز، وتنظيم التعبير الجيني. ^{[ 170 ]}^{[ 177 ]} يوجد مفتاح جيني يتحكم في بكتيريا المكورات الرئوية (Streptococcus pneumoniae) يسمح لها بتغيير خصائصها عشوائيًا إلى ست حالات بديلة، مما قد يمهد الطريق لتطوير لقاحات محسّنة. يتم توليد كل شكل عشوائيًا بواسطة نظام مثيلة متغير الطور. تختلف قدرة المكورات الرئوية على التسبب في عدوى مميتة في كل حالة من هذه الحالات الست. توجد أنظمة مماثلة في أجناس بكتيرية أخرى. ^{[ 178 ]} في بكتيريا باسيلوتا ، مثل المطثية العسيرة (Clostridium difficile) ، ينظم مثيلة الأدينين التبوغ ، وتكوين الأغشية الحيوية ، والتكيف مع المضيف. ^{[ 179 ]}

الدواء

لعلم التخلق تطبيقات طبية محتملة عديدة ومتنوعة. ^{[ 180 ]}

توأم

تُعدّ المقارنات المباشرة بين التوائم المتطابقة نموذجًا مثاليًا لدراسة علم التخلق البيئي . ففي حالة البشر ذوي التعرضات البيئية المختلفة، كان من المستحيل التمييز بين التوائم المتطابقة (أحادية الزيجوت) من الناحية التخلقية خلال سنواتهم الأولى، بينما أظهر التوائم الأكبر سنًا اختلافات ملحوظة في المحتوى العام والتوزيع الجينومي لـ 5-ميثيل سيتوزين في الحمض النووي وأستلة الهيستونات. ^{[ 10 ]} وكانت أزواج التوائم الذين قضوا وقتًا أقل معًا و/أو كانت لديهم اختلافات أكبر في تاريخهم الطبي هي التي أظهرت أكبر الاختلافات في مستويات 5-ميثيل سيتوزين في الحمض النووي وأستلة الهيستونات H3 وH4. ^{[ 181 ]}

تُظهر التوائم ثنائية الزيجوت (غير المتطابقة) وأحادية الزيجوت (المتطابقة) أدلة على التأثير فوق الجيني لدى البشر. ^{[ 181 ]}^{[ 182 ]}^{[ 183 ]} لا تؤثر اختلافات تسلسل الحمض النووي، التي قد تكون وفيرة في دراسة تعتمد على فرد واحد، على التحليل. يمكن أن تُحدث الاختلافات البيئية تأثيرات فوق جينية طويلة الأمد، وقد تختلف الأنواع الفرعية المختلفة من التوائم أحادية الزيجوت في مراحل نموها من حيث قابليتها للاختلاف من وجهة نظر فوق جينية. ^{[ 184 ]}

ركزت دراسة عالية الإنتاجية ، وهي تقنية تعتمد على فحص مؤشرات جينية واسعة النطاق، على الاختلافات فوق الجينية بين التوائم المتطابقة لمقارنة التغيرات العامة والموضعية في مثيلة الحمض النووي وتعديلات الهيستون في عينة مكونة من 40 زوجًا من التوائم المتطابقة. ^{[ 181 ]} في هذه الدراسة، اقتصرت الدراسة على أزواج التوائم الأصحاء، ولكن شملت نطاقًا واسعًا من الأعمار، بين 3 و74 عامًا. كان من أهم استنتاجات هذه الدراسة وجود تراكم للاختلافات فوق الجينية بين شقيقي التوائم، مرتبطًا بالعمر. يشير هذا التراكم إلى وجود "انحراف فوق جيني". يُطلق مصطلح الانحراف فوق الجيني على التعديلات فوق الجينية التي تحدث كدالة مباشرة للعمر. في حين أن العمر عامل خطر معروف للعديد من الأمراض، فقد وُجد أن مثيلة الحمض النووي المرتبطة بالعمر تحدث بشكل مختلف في مواقع محددة على طول الجينوم. بمرور الوقت، يمكن أن يؤدي ذلك إلى اختلافات قابلة للقياس بين العمر البيولوجي والعمر الزمني. وقد تبين أن التغيرات اللاجينية تعكس نمط الحياة ، وقد تعمل كمؤشرات حيوية وظيفية للأمراض قبل الوصول إلى العتبة السريرية. ^{[ 185 ]}

خلصت دراسة حديثة، حللت حالة مثيلة الحمض النووي لحوالي 6000 منطقة جينومية فريدة لدى 114 توأمًا متطابقًا و80 توأمًا غير متطابق، إلى أن التشابه فوق الجيني وقت انقسام الكيسة الأريمية قد يُسهم أيضًا في التشابهات الظاهرية بين التوائم المتطابقة. يدعم هذا فكرة أن البيئة الدقيقة في المراحل المبكرة من التطور الجنيني قد تكون بالغة الأهمية لتكوين العلامات فوق الجينية. ^{[ 182 ]} الأمراض الوراثية الخلقية مفهومة جيدًا، ومن الواضح أن علم التخلق قد يلعب دورًا، على سبيل المثال، في حالة متلازمة أنجلمان ومتلازمة برادر-ويلي . هذه أمراض وراثية طبيعية ناتجة عن حذف أو تعطيل الجينات، لكنها شائعة بشكل غير عادي لأن الأفراد يكونون في الأساس أحاديي الزيجوت بسبب البصمة الجينية ، وبالتالي يكفي تعطيل جين واحد لإحداث المرض، بينما تتطلب معظم الحالات تعطيل كلا النسختين. ^{[ 186 ]}

البصمة الجينية

ترتبط بعض الأمراض البشرية بالبصمة الجينية، وهي ظاهرة في الثدييات حيث يساهم الأب والأم بأنماط فوق جينية مختلفة لمواقع جينومية محددة في خلاياهم الجنسية . ^{[ 187 ]} أشهر مثال على البصمة الجينية في الأمراض البشرية هو متلازمة أنجلمان ومتلازمة برادر-ويلي ، وكلاهما يمكن أن ينتج عن نفس الطفرة الجينية، وهي حذف جزئي للكروموسوم 15q ، وتعتمد المتلازمة التي ستتطور على ما إذا كانت الطفرة موروثة من الأم أو من الأب. ^{[ 188 ]}

في دراسة أوفيركاليكس ، كان أحفاد الذكور من جهة الأب (وليس من جهة الأم) ^{[ 189 ]} لرجال سويديين تعرضوا للمجاعة في القرن التاسع عشر خلال مرحلة ما قبل المراهقة أقل عرضة للوفاة بأمراض القلب والأوعية الدموية. وإذا كان الطعام متوفراً بكثرة، فإن معدل الوفيات بسبب داء السكري لدى الأحفاد يزداد، مما يشير إلى أن هذا كان توارثاً جينياً عابراً للأجيال. ^{[ 190 ]} ولوحظ تأثير معاكس لدى الإناث - فقد عاشت حفيدات الذكور (وليس من جهة الأم) لنساء عانين من المجاعة أثناء وجودهن في الرحم (وبالتالي أثناء تكوين بويضاتهن) أعماراً أقصر في المتوسط. ^{[ 191 ]}

أمثلة على الأدوية التي تُغير التعبير الجيني من خلال الأحداث فوق الجينية

قد يؤدي استخدام المضادات الحيوية من نوع بيتا لاكتام إلى تغيير نشاط مستقبلات الغلوتامات وتأثير السيكلوسبورين على العديد من عوامل النسخ. بالإضافة إلى ذلك، قد يؤثر الليثيوم على الالتهام الذاتي للبروتينات الشاذة، وقد يؤدي الاستخدام المزمن للأدوية الأفيونية إلى زيادة التعبير عن الجينات المرتبطة بالأنماط الظاهرية للإدمان. ^{[ 192 ]}

قد تؤثر عوامل عديدة، منها تغذية الوالدين ، والتعرض للإجهاد أو المواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء داخل الرحم ، ^{[ 193 ]} والتأثيرات الأمومية الناتجة عن الذكور، مثل انجذاب الإناث ذوات الجودة المختلفة، وعمر الأم والأب، وجنس المولود، على ما إذا كانت الطفرة فوق الجينية ستظهر في النهاية لدى النسل، وعلى مدى استقرار الوراثة بين الأجيال. ^{[ 194 ]} ومع ذلك، يبقى من غير الواضح ما إذا كانت التأثيرات فوق الجينية تنتقل عبر الأجيال، وإلى أي مدى، لا سيما لدى البشر. ^{[ 195 ]}^{[ 196 ]}

مدمن

الإدمان اضطراب في نظام المكافأة بالدماغ ، ينشأ عبر آليات جينية وعصبية فوق جينية، ويتطور بمرور الوقت نتيجة التعرض المزمن لمستويات عالية من محفزات الإدمان (مثل المورفين، الكوكايين، الجماع، القمار). ^{[ 197 ]}^{[ 198 ]}^{[ 199 ]} وقد لوحظ في الدراسات قبل السريرية حدوث وراثة فوق جينية عبر الأجيال للأنماط الظاهرية للإدمان. ^{[ 200 ]}^{[ 201 ]} ومع ذلك، لم يتم بعد إثبات أدلة قوية تدعم استمرار التأثيرات فوق الجينية عبر أجيال متعددة لدى البشر؛ على سبيل المثال، التأثير فوق الجيني للتعرض للتدخين قبل الولادة والذي يُلاحظ لدى أحفاد الأحفاد الذين لم يتعرضوا له. ^{[ 195 ]}

علم التخلق والسرطان

تشير الدراسات إلى أن علم التخلق قد يلعب دورًا في السرطان، وتحديدًا في التشوهات التخلقية وبدء السرطان وتطوره. ^{[ 202 ]} وقد أدى ذلك إلى تطوير علاجات خلقية تعتمد على علم التخلق، بما في ذلك أدوية حديثة معتمدة من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية، مثل مثبطات ناقلة ميثيل الحمض النووي (DNMT)، ومثبطات نازعة أسيتيل الهيستون (HDACi)، ومثبطات ناقلة ميثيل الهيستون (HMTi)، والتي تُضاف الآن إلى علاجات السرطان الأخرى الموجودة. ^{[ 203 ]} يُعتبر السرطان مرضًا وراثيًا وخلقيًا في آنٍ واحد. ^{[ 204 ]} ويشمل ذلك مكونات مثل مثيلة الحمض النووي، وتعديلات الهيستون، وتعبير الحمض النووي الريبوزي الميكروي (microRNA)، والتي قد تؤدي إلى نمو الخلايا الخبيثة. ^{[ 204 ]}

بحث

يُطلق على شكلي المعلومات الوراثية، وهما المعلومات الجينية والوراثية اللاجينية، اسم الوراثة المزدوجة. وقد تؤثر أفراد عائلة APOBEC/AID من إنزيمات دياميناز السيتوزين في الوراثة الجينية والوراثية اللاجينية في آنٍ واحد باستخدام آليات جزيئية متشابهة، وقد تكون نقطة تداخل بين هاتين العمليتين المنفصلتين من الناحية المفاهيمية. ^{[ 205 ]}

تُحفز المضادات الحيوية من فئة الفلوروكينولونات تغييرات فوق جينية في خلايا الثدييات من خلال استخلاب الحديد . ويؤدي ذلك إلى تأثيرات فوق جينية عبر تثبيط ثنائي أوكسيجينازات ألفا-كيتوغلوتارات التي تتطلب الحديد كعامل مساعد. ^{[ 206 ]}

تُستخدم عوامل دوائية متنوعة لإنتاج الخلايا الجذعية المحفزة متعددة القدرات (iPSC) أو للحفاظ على النمط الظاهري للخلايا الجذعية الجنينية (ESC) عبر نهج فوق جيني. كما أظهرت الخلايا الجذعية البالغة، مثل خلايا نخاع العظم الجذعية، قدرة على التمايز إلى خلايا قلبية مؤهلة عند معالجتها بمثبط إنزيم ميثيل ترانسفيراز الهيستون G9a، BIX01294. ^{[ 207 ]}^{[ 208 ]}

تتطلب اللدونة الخلوية، وهي قدرة الخلايا على التكيف مع المحفزات دون تغيير في شفرتها الوراثية، تغييرات فوق جينية. وقد لوحظت هذه التغييرات في اللدونة الخلوية للخلايا السرطانية أثناء التحول الظهاري-الميزانشيمي ^{[ 209 ]} ، وكذلك في الخلايا المناعية، مثل البلاعم ^{[ 210 ]} . ومن المثير للاهتمام أن التغيرات الأيضية تكمن وراء هذه التكيفات، إذ تلعب العديد من المستقلبات أدوارًا حاسمة في كيمياء العلامات فوق الجينية. ويشمل ذلك، على سبيل المثال، ألفا-كيتوغلوتارات، وهو ضروري لإزالة مثيلة الهيستونات، وأسيتيل-كوإنزيم أ، وهو ضروري لأستلة الهيستونات.

تحرير الإبيجينوم

تشمل آليات تنظيم التعبير الجيني اللاجيني، التي يمكن تعديلها أو استخدامها في تحرير الجينوم اللاجيني ، تعديل الحمض النووي الريبوزي الرسول/الحمض النووي الريبوزي غير المشفر الطويل ، وتعديل مثيلة الحمض النووي ، وتعديل الهيستون . ^{[ 211 ]}^{[ 212 ]}^{[ 213 ]}

مواقع CpG، والنيوكليوتيدات المفردة المتغيرة، والصفات البيولوجية

يُعدّ المثيلة آليةً معروفةً على نطاق واسع لتنظيم الجينات، ولها دورٌ في تحديد الصفات البيولوجية. ومع ذلك، تُشير أدلةٌ تجريبيةٌ قويةٌ إلى أن أنماط المثيلة في تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) تُشكّل سمةً إضافيةً مهمةً للعقيدة اللاجينية الكلاسيكية للتنشيط/التثبيط. وتُحدّد بيانات التفاعل الجزيئي، المدعومة بتحليلات التموضع المشترك، مساراتٍ تنظيميةً نوويةً متعددةً، تربط بين تباين التسلسل واضطرابات مثيلة الحمض النووي (DNA) والتباين الجزيئي والظاهري. ^{[ 214 ]}

موقع UBASH3B

يشفر جين UBASH3B بروتينًا ذا نشاط فوسفاتاز التيروسين، والذي سبق ربطه بالأورام المتقدمة. ^{[ 215 ]} تم تحديد تعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة rs7115089 كعامل مؤثر على مثيلة الحمض النووي وتعبير هذا الموضع، بالإضافة إلى مؤشر كتلة الجسم (BMI). ^{[ 214 ]} في الواقع، يرتبط تعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة rs7115089 ارتباطًا وثيقًا بمؤشر كتلة الجسم ^{[ 216 ]} وبالمتغيرات الجينية المرتبطة بسمات القلب والأوعية الدموية والتمثيل الغذائي الأخرى في دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS). ^{[ 217 ]}^{[ 218 ]}^{[ 219 ]} تشير دراسات حديثة إلى أن UBASH3B قد يكون وسيطًا محتملاً للسمنة وأمراض القلب والأوعية الدموية والتمثيل الغذائي. ^{[ 214 ]} بالإضافة إلى ذلك، أظهرت النماذج الحيوانية أن تعبير UBASH3B مؤشر على تقييد السعرات الحرارية الذي قد يؤدي إلى قابلية مبرمجة للسمنة، ويرتبط بمقاييس أخرى للسمنة في الدم المحيطي البشري. ^{[ 220 ]}

موضع NFKBIE

يقع النمط الجيني rs730775 في الإنترون الأول من جين NFKBIE، وهو موقع تنظيمي كمي للتعبير الجيني ( eQTL) خاص بـ NFKBIE في الدم الكامل. ^{[ 214 ]} يثبط مثبط العامل النووي كابا بي إبسيلون (NFKBIE) نشاط NF-κB1 بشكل مباشر، ويُعبر عنه بشكل مشترك مع NF-κB1، كما أنه مرتبط بالتهاب المفاصل الروماتويدي. ^{[ 221 ]} يدعم تحليل التموضع المشترك أن المتغيرات في معظم مواقع CpG في النمط الجيني rs730775 تُسبب تباينًا جينيًا في موضع NFKBIE، والذي يُحتمل ارتباطه بالتهاب المفاصل الروماتويدي من خلال تنظيم مثيلة الحمض النووي بواسطة NF-κB. ^{[ 214 ]}

موضع FADS1

إنزيم نازع الهيدروجين من الأحماض الدهنية 1 (FADS1) هو إنزيم رئيسي في استقلاب الأحماض الدهنية. ^{[ 222 ]} علاوة على ذلك، يُظهر النمط الجيني rs174548 في جين FADS1 ارتباطًا متزايدًا بمَثْيَلَة الحمض النووي لدى الأشخاص الذين لديهم وفرة عالية من الخلايا التائية CD8+. ^{[ 214 ]} يرتبط النمط الجيني rs174548 ارتباطًا وثيقًا بتركيزات حمض الأراكيدونيك ومستقلبات أخرى في استقلاب الأحماض الدهنية، ^{[ 223 ]}^{[ 224 ]} وعدد الحمضات في الدم. ^{[ 225 ]} والأمراض الالتهابية مثل الربو. ^{[ 226 ]} أشارت نتائج التفاعل إلى وجود ارتباط بين rs174548 والربو، مما يوفر رؤى جديدة حول استقلاب الأحماض الدهنية في الخلايا التائية CD8+ ذات الأنماط الظاهرية المناعية. ^{[ 214 ]}

العلوم الزائفة

نظراً لأن علم التخلق المتوالي لا يزال في مراحله الأولى كعلم، ويحيط به قدر كبير من الإثارة في وسائل الإعلام، فقد نصح ديفيد غورسكي وعالم الوراثة آدم رذرفورد بتوخي الحذر من انتشار الاستنتاجات الزائفة وشبه العلمية التي يروج لها مؤلفو العصر الجديد ، والذين يقدمون اقتراحات لا أساس لها من الصحة بأن جينات الإنسان وصحته يمكن التلاعب بها عن طريق التحكم بالعقل . وقد أدى سوء استخدام المصطلح العلمي من قبل مؤلفين دجالين إلى انتشار معلومات مضللة بين عامة الناس. ^{[ 2 ]}^{[ 227 ]}

انظر أيضاً

مراجع

↑ دوبونت سي، أرمانت دي آر، برينر سي إيه (سبتمبر 2009). "علم التخلق: التعريف والآليات والمنظور السريري" . ندوات في طب الإنجاب . 27 (5): 351-357 . doi : 10.1055/s-0029-1237423 . PMC 2791696. PMID 19711245. في المعنى الأصلي لهذا التعريف، كان علم التخلق يشير إلى جميع المسارات الجزيئية التي تُعدّل التعبير عن النمط الجيني إلى نمط ظاهري معين. على مر السنين، ومع النمو السريع لعلم الوراثة، ضاق معنى الكلمة تدريجيًا. تم تعريف علم التخلق، وهو مقبول عمومًا اليوم، بأنه "دراسة التغيرات في وظيفة الجينات التي تُورّث انقساميًا و/أو اختزاليًا، والتي لا تستلزم تغييرًا في تسلسل الحمض النووي".
1 2 روثرفورد أ (19 يوليو 2015). "احذروا من عباقرة الجينات الزائفة" . صحيفة الغارديان .
↑ دينز سي، ماجرت كيه إيه (أبريل 2015). "ماذا تقصد بـ "علم التخلق"؟" . علم الوراثة . 199 (4): 887-896 . Bibcode : 2015Genet.199..887D . doi : 10.1534/genetics.114.173492 . PMC 4391566. PMID 25855649 .
↑ كانوال ر، غوبتا س (أبريل 2012). " التعديلات فوق الجينية في السرطان" . علم الوراثة السريرية . 81 (4): 303-311 . doi : 10.1111/j.1399-0004.2011.01809.x . PMC 3590802. PMID 22082348 .
↑ فرياس-لاسير د، فيلاغرا سي إيه (2017). "أهمية الحمض النووي الريبوزي غير المشفر كآليات فوق جينية في التباين الظاهري والتطور العضوي" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 8 2483. doi : 10.3389/fmicb.2017.02483 . PMC 5744636. PMID 29312192 .
1 2 بيرد أ (مايو 2007). "تصورات علم التخلق" . مجلة نيتشر . 447 (7143): 396-398 . Bibcode : 2007Natur.447..396B . doi : 10.1038/ nature05913 . PMID 17522671. S2CID 4357965 .
↑ هانتر ب (1 مايو 2008). "ما تتذكره الجينات" . مجلة بروسبكت . مؤرشف من الأصل في 1 مايو 2008. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .
↑ ريك دبليو (مايو 2007). " استقرار ومرونة تنظيم الجينات اللاجيني في نمو الثدييات". نيتشر . 447 (7143): 425-32 . Bibcode : 2007Natur.447..425R . doi : 10.1038/nature05918 . PMID 17522676. S2CID 11794102 .
↑ قاموس أكسفورد الإنجليزي : "استخدم دبليو هارفي هذه الكلمة في كتابه Exercitationes 1651، صفحة 148، وفي كتاب English Anatomical Exercitations 1653، صفحة 272. وقد تم شرحها على أنها تعني 'partium super-exorientium additamentum'، أي 'إضافة أجزاء تنبثق من بعضها البعض'."
1 2 مور دي إس (2015). الجينوم النامي: مقدمة في علم التخلق السلوكي . مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-992235-2.
1 2 بيرغر إس إل، كوزاريدس تي، شيخاتار آر، شيلاتيفارد إيه (أبريل 2009). " تعريف عملي لعلم التخلق" . الجينات والتطور . 23 (7): 781-783 . doi : 10.1101/gad.1787609 . PMC 3959995. PMID 19339683 .
1 2 "نظرة عامة" . مشروع علم التخلق الجيني التابع لخارطة طريق المعاهد الوطنية للصحة . مؤرشف من الأصل في 21 نوفمبر 2019. تم الاطلاع عليه في 7 ديسمبر 2013 .
↑ مورانج م. لا مؤقت لنيكولاي كولتسوف (كولتسوف) من علم الوراثة وعلم الأجنة والفيزياء الكيميائية ، ج. العلوم البيولوجية. 2011. المجلد 36. ص 211-214
↑ وادينجتون سي إتش (1942). "النمط الجيني فوق الجيني". إنديفور . 1 : 18-20 . "لغرض دراسة الوراثة، فإن العلاقة بين الأنماط الظاهرية والأنماط الجينية [...] من وجهة نظر بيولوجية أوسع، ذات أهمية بالغة، لأنها جوهر مشكلة التطور بأكملها."
↑ انظر إلى نظرية التكوين المسبق للاطلاع على الخلفية التاريخية. قاموس أكسفورد الإنجليزي : "النظرية القائلة بأن الجرثومة تُوجد (عن طريق تراكمات متتالية)، وليس مجرد نموها، في عملية التكاثر. [...] كانت النظرية المقابلة تُعرف سابقًا باسم "نظرية التطور"؛ ولتجنب غموض هذا الاسم، يُشار إليها الآن بشكل رئيسي باسم "نظرية التكوين المسبق"، وأحيانًا باسم "نظرية التغليف" أو "الاحتواء"."
↑ وادينجتون، سي إتش (2014). علم التخلق في الطيور . مطبعة جامعة كامبريدج. رقم ISBN 978-1-107-44047-0.
↑ هول، ب. ك. (يناير 2004). "بحثًا عن آليات التطور النمائي: الفجوة الزمنية التي امتدت لثلاثين عامًا بين عامي 1944 و1974" . مجلة علم الحيوان التجريبي، الجزء ب: التطور الجزيئي والنمائي . 302 (1): 5-18 . رمز Bibcode : 2004JEZ...302....5H . doi : 10.1002/jez.b.20002 . PMID 14760651 .
↑ ألفاريز-بويلا إي آر، تشاوس إيه، ألدانا إم، بينيتيز إم، كورتيس-بوزا واي، إسبينوزا-سوتو سي، وآخرون . (3 نوفمبر 2008). "التشكل الزهري: استكشافات عشوائية للمشهد فوق الجيني لشبكة جينية" . PLOS ONE . 3 (11) e3626. Bibcode : 2008PLoSO...3.3626A . doi : 10.1371/ journal.pone.0003626 . PMC 2572848. PMID 18978941 .
1 2 راباجانتي جيه إف، بابيرا إيه إل (مارس 2015). "التفرع والتذبذبات في المشهد فوق الجيني لتحديد مصير الخلية". التقدم في الفيزياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 117 ( 2-3 ): 240-249 . doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2015.01.006 . PMID 25641423. S2CID 2579314 .
↑ هوليداي، ر. (يناير 1990). "مَثْيَلَة الحمض النووي والوراثة فوق الجينية" . المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية في لندن. السلسلة ب، العلوم البيولوجية . 326 (1235): 329-338 . Bibcode : 1990RSPTB.326..329H . doi : 10.1098/rstb.1990.0015 . PMID 1968668 .
1 2 ريغز إيه دي، مارتينسن آر إيه، روسو في إي (1996). الآليات اللاجينية لتنظيم الجينات . بلينفيو، نيويورك: مطبعة مختبر كولد سبرينغ هاربور. ص 1-4 . ISBN 978-0-87969-490-6.
↑ ليدفورد، هـ. (أكتوبر 2008). "اللغة: تعريفات متنازع عليها" . مجلة نيتشر . 455 (7216): 1023-1028 . doi : 10.1038/4551023a . PMID 18948925 .
↑ جيبني إي آر، نولان سي إم (يوليو 2010). "علم التخلق والتعبير الجيني" . الوراثة . 105 (1): 4-13 . Bibcode : 2010Hered.105....4G . doi : 10.1038/hdy.2010.54 . PMID 20461105. S2CID 31611763 .
↑ بتاشن م (أبريل 2007). "حول استخدام كلمة "علم التخلق"" . Current Biology . 17 (7): R233-6. Bibcode : 2007CBio...17.R233P . doi : 10.1016 / j.cub.2007.02.030 . PMID 17407749. S2CID 17490277 .
↑ تشانغ د، تانغ ز، هوانغ هـ، تشو غ، تسوي س، وينغ ي، وآخرون . (أكتوبر 2019). "التنظيم الأيضي للتعبير الجيني عن طريق لاكتلة الهيستون" . نيتشر . 574 (7779): 575-580 . Bibcode : 2019Natur.574..575Z . doi : 10.1038/ s41586-019-1678-1 . PMC 6818755. PMID 31645732 .
↑ كومار إس، تشينوسامي في، موهاباترا تي (2018). " علم التخلق لقواعد الحمض النووي المعدلة: 5-ميثيل سيتوزين وما بعده" . فرونتيرز إن جينيتكس . 9 640. doi : 10.3389/fgene.2018.00640 . PMC 6305559. PMID 30619465 .
↑ غرينبيرغ إم في، بوركيس دي (أكتوبر 2019). "الأدوار المتنوعة لمثيلة الحمض النووي في نمو الثدييات وأمراضها". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 20 (10): 590-607 . doi : 10.1038 / s41580-019-0159-6 . PMID 31399642. S2CID 199512037 .
↑ سبيتز إف، فورلونغ إي إي (سبتمبر 2012). " عوامل النسخ: من ارتباط المُحسِّن إلى التحكم النمائي". نات ريف جينيت . 13 (9): 613-26 . doi : 10.1038/nrg3207 . PMID 22868264. S2CID 205485256 .
1 2 ديوك سي جي، كينيدي إيه جيه، جافين سي إف، داي جيه جيه، سويت جيه دي (يوليو 2017). " إعادة تنظيم الجينوم فوق الجيني المعتمد على الخبرة في الحصين" . مجلة التعلم والذاكرة . 24 (7): 278-288 . doi : 10.1101/lm.045112.117 . PMC 5473107. PMID 28620075 .
1 2 3 4 بيرنشتاين سي (2022). " مثيلة الحمض النووي وتكوين الذاكرة" . رؤى علم التخلق . 15 25168657211072499. doi : 10.1177/25168657211072499 . PMC 8793415. PMID 35098021 .
1 2 روز، ن. ر.، وكلوز ، ر. ج. (ديسمبر 2014). "فهم العلاقة بين مثيلة الحمض النووي ومثيلة الليسين في الهيستون" . بيوشيم بيوفيز أكتا . 1839 (12): 1362-1372 . doi : 10.1016/j.bbagrm.2014.02.007 . PMC 4316174. PMID 24560929 .
1 2 لي واي، تشين إكس، لو سي (مايو 2021). "التفاعل بين مثيلة الحمض النووي ومثيلة الهيستون: الآليات الجزيئية وآثارها على الأمراض" . EMBO Rep . 22 (5) e51803. doi : 10.15252/embr.202051803 . PMC 8097341. PMID 33844406 .
↑ بينداندي أ، باتيلي أ.س، دياسبرو أ، روكيا و (2020). "دور ذيول الهيستون في استقرار النيوكليوسوم: منظور كهروستاتيكي" . مجلة الحوسبة والبنية والتكنولوجيا الحيوية . 18 : 2799-2809 . doi : 10.1016/j.csbj.2020.09.034 . PMC 7575852. PMID 33133421 .
↑ ستيوارت، إم دي، لي، جيه، وونغ، جيه (أبريل 2005). "العلاقة بين مثيلة الليسين 9 في الهيستون H3، وكبت النسخ، وتجنيد بروتين الهيتروكروماتين 1" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 25 (7): 2525-2538 . doi : 10.1128/MCB.25.7.2525-2538.2005 . PMC 1061631. PMID 15767660 .
↑ خان، ف. أ. (2014). "الاضطرابات الوراثية والعلاج الجيني". التكنولوجيا الحيوية في العلوم الطبية . ص 264-289 . doi : 10.1201/b16905-14 . ISBN 978-0-429-17411-7.
↑ جينوين تي، لايبل جي، دورن آر، رويتر جي (يناير 1998). "بروتينات نطاق SET تُعدِّل نطاقات الكروماتين في الكروماتين الحقيقي والمتغاير" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 54 (1): 80-93 . doi : 10.1007/s000180050127 . PMC 11147257. PMID 9487389. S2CID 7769686 .
↑ سلوتكين آر كيه، مارتينسن آر (أبريل 2007). "العناصر القابلة للنقل والتنظيم اللاجيني للجينوم". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 8 (4): 272-285 . doi : 10.1038/nrg2072 . PMID 17363976. S2CID 9719784 .
1 2 لي إي، بيستور تي إتش، جانيش آر (يونيو 1992). "طفرة موجهة في جين ناقل ميثيل الحمض النووي تؤدي إلى موت الجنين". الخلية . 69 ( 6): 915-26 . Bibcode : 1992Cell...69..915L . doi : 10.1016/0092-8674(92)90611-F . PMID 1606615. S2CID 19879601 .
↑ روبرتسون ك.د، أوزفولجي إ، ليانغ ج، تالمادج س، سوميجي ج، غونزاليس ف.أ، وآخرون (يونيو 1999). "إنزيمات ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي البشري (DNMTs) 1 و3أ و3ب: تنسيق التعبير عن الحمض النووي الريبوزي الرسول في الأنسجة الطبيعية والإفراط في التعبير عنه في الأورام" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 27 (11): 2291-2298 . doi : 10.1093/nar/27.11.2291 . PMC 148793. PMID 10325416 .
↑ ليونهاردت هـ، بيج أ.و، وير هـ.و، بيستور ت.هـ (نوفمبر 1992). "تسلسل استهداف يوجه إنزيم ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي إلى مواقع تضاعف الحمض النووي في نوى الثدييات" ( ملف PDF) . مجلة الخلية . 71 (5): 865-73 . doi : 10.1016/0092-8674(92)90561-P . PMID 1423634. S2CID 5995820 .
↑ تشوانغ إل إس، إيان إتش آي، كوه تي دبليو، نغ إتش إتش، شو جي، لي بي إف (سبتمبر 1997). "مركب ناقل ميثيل السيتوزين-5-حمض نووي بشري-PCNA كهدف لـ p21WAF1". مجلة ساينس . 277 (5334): 1996-2000 . رمز Bibcode : 1997Sci...277.1996C . doi : 10.1126/science.277.5334.1996 . PMID 9302295 .
↑ روبرتسون ك.د، وولف أ.ب (أكتوبر 2000). " مثيلة الحمض النووي في الصحة والمرض". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 1 (1): 11-9 . doi : 10.1038/35049533 . PMID 11262868. S2CID 1915808 .
↑ لي إي، بيرد سي، جانيش آر (نوفمبر 1993). " دور مثيلة الحمض النووي في البصمة الجينية". نيتشر . 366 (6453): 362-365 . Bibcode : 1993Natur.366..362L . doi : 10.1038/366362a0 . PMID 8247133. S2CID 4311091 .
↑ فيانز أ، ميكولد يو، برويارد إف، جيلبرت سي، لوكلير بي، أوغريزكو في (يوليو 2006). "تحليل ترسب الهيستون H2AZ البشري في الجسم الحي يُعارض دوره المباشر في آليات القوالب فوق الجينية" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 26 (14): 5325-35 . doi : 10.1128/MCB.00584-06 . PMC 1592707. PMID 16809769 .
↑ أوغريزكو ، ف. ف. (أبريل 2008). "إروين شرودنغر، وفرانسيس كريك، والاستقرار فوق الجيني" . بيولوجي دايركت . 3 : 15. doi : 10.1186/1745-6150-3-15 . PMC 2413215. PMID 18419815 .
↑ باربييري، إي.، وكوزاريدس، ت. (يونيو 2020). "دور تعديلات الحمض النووي الريبوزي في السرطان". مجلة نيتشر ريفيوز. السرطان . 20 (6): 303-322 . Bibcode : 2020NatRC..20..303B . doi : 10.1038/s41568-020-0253-2 . PMID 32300195 .
↑ جيا جي، فو واي، تشاو إكس، داي كيو، تشنغ جي، يانغ واي، وآخرون . (أكتوبر 2011). "إن N6-ميثيل أدينوزين في الحمض النووي الريبي النووي هو ركيزة رئيسية لإنزيم FTO المرتبط بالسمنة" . مجلة Nature Chemical Biology . 7 (12): 885-887 . doi : 10.1038/nchembio.687 . PMC 3218240. PMID 22002720 .
↑ "بحث جديد يربط بين تعديل الحمض النووي الريبوزي الشائع والسمنة" . Physorg.com . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 يوليو 2012 .
↑ نوتكي أ، كولاياكوفو م ب، شي ي (مارس 2009). "الأدوار التطورية لإنزيمات إزالة مثيل الليسين من الهيستون" . التطور . 136 (6): 879-889 . doi : 10.1242/dev.020966 . PMC 2692332. PMID 19234061 .
↑ روزنفيلد، جيه. إيه.، وانغ، زد.، شونيس، دي. إي.، تشاو، ك.، دي سال، آر.، تشانغ، إم. كيو. (مارس 2009). " تحديد تعديلات الهيستون المُثرية في الأجزاء غير الجينية من الجينوم البشري" . بي إم سي جينوميكس . 10 143. doi : 10.1186/1471-2164-10-143 . PMC 2667539. PMID 19335899 .
↑ سنيبن ك، ميشيلسن إم إيه، دود آي بي (15 أبريل 2008). " تنظيم الجينات فائق الحساسية بواسطة حلقات التغذية الراجعة الإيجابية في تعديل النيوكليوسوم" . بيولوجيا الأنظمة الجزيئية . 4 (1) 182. doi : 10.1038/msb.2008.21 . PMC 2387233. PMID 18414483 .
↑ "الذاكرة الخلوية فوق الجينية" . Cmol.nbi.dk. مؤرشف من الأصل في 30 سبتمبر 2011. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .
↑ دود، آي. بي.، ميشيلسن ، إم. إيه.، سنيبن، ك.، ثون، جي. (مايو 2007). "تحليل نظري للذاكرة الخلوية فوق الجينية عن طريق تعديل النيوكليوسوم" . مجلة الخلية . 129 (4): 813-822 . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.053 . PMID 17512413. S2CID 16091877 .
↑ موريس، ك. ل. (2008). "التنظيم اللاجيني للتعبير الجيني". الحمض النووي الريبي وتنظيم التعبير الجيني: طبقة خفية من التعقيد . نورفولك، إنجلترا: دار كايستر الأكاديمية للنشر. ISBN 978-1-904455-25-7.
↑ ماتيك جيه إس، أمارال بي بي، دينجر إم إي، ميرسر تي آر، ميهلر إم إف (يناير 2009). " تنظيم الحمض النووي الريبوزي للعمليات فوق الجينية" . مقالات بيولوجية . 31 (1): 51-59 . doi : 10.1002/bies.080099 . PMID 19154003. S2CID 19293469 .
↑ تشوي سي كيو (25 مايو 2006). "يمكن أن يكون الحمض النووي الريبي جزيئًا وراثيًا" . مجلة ساينتست . مؤرشف من الأصل في 8 فبراير 2007.
وانغ ز، ياو هـ، لين س، تشو إكس، شين ز، لو جي، وآخرون (أبريل 2013). "التنظيم النسخي والوراثي فوق الجيني للميكرو آر إن إيه البشري". رسائل السرطان . 331 ( 1): 1-10 . doi : 10.1016/j.canlet.2012.12.006 . PMID 23246373 .
↑ "تصفح قاعدة بيانات miRBase حسب النوع" .
↑ ليم إل بي، لاو إن سي، غاريت-إنجيل بي، غريمسون إيه، شيلتر جيه إم، كاسل جيه، وآخرون (فبراير 2005). " يُظهر تحليل المصفوفات الدقيقة أن بعض الحمض النووي الريبوزي الميكروي يُثبط أعدادًا كبيرة من الحمض النووي الريبوزي الرسول المستهدف". نيتشر . 433 (7027): 769-773 . Bibcode : 2005Natur.433..769L . doi : 10.1038/nature03315 . PMID 15685193. S2CID 4430576 .
↑ لي د، شين سي (أكتوبر 2012). "تفاعلات الحمض النووي الريبوزي الميكروي مع أهدافه: رؤى جديدة من مناهج شاملة للجينوم" . حوليات أكاديمية نيويورك للعلوم . 1271 (1): 118-128 . Bibcode : 2012NYASA1271..118L . doi : 10.1111/j.1749-6632.2012.06745.x . PMC 3499661. PMID 23050973 .
↑ فريدمان آر سي، فاره كيه كيه، بيرج سي بي، بارتل دي بي (يناير 2009). " معظم الرنا المرسال لدى الثدييات أهداف محفوظة للرنا الميكروي" . أبحاث الجينوم . 19 (1): 92-105 . doi : 10.1101/gr.082701.108 . PMC 2612969. PMID 18955434 .
↑ غول إم جي، بيستور تي إتش (2005). "ناقلات ميثيل السيتوزين في حقيقيات النوى". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 74 : 481-514 . doi : 10.1146/annurev.biochem.74.010904.153721 . PMID 15952895. S2CID 32123961 .
↑ هاودن بي بي، بوم إم، هاريسون بي إف، هيرنانديز دي، شرينزل جيه، سيمان تي، وآخرون . (أغسطس 2013). "تحليل الاستجابة النسخية للحمض النووي الريبوزي الصغير في المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للأدوية المتعددة بعد التعرض للمضادات الحيوية" . العوامل المضادة للميكروبات والعلاج الكيميائي . 57 (8): 3864-74 . doi : 10.1128/AAC.00263-13 . PMC 3719707. PMID 23733475 .
↑ "قاعدة بيانات RNATarBase 2.0: قاعدة بيانات شاملة لأهداف الحمض النووي الريبوزي الصغير البكتيري التي تم التحقق منها تجريبياً" . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 26 سبتمبر 2013.
↑ "خرائط جينومية للحمض النووي الريبوزي الصغير غير المشفر وأهدافه في الجينومات الميكروبية" . مؤرشف من الأصل في 8 يونيو 2017. تم الاطلاع عليه في 13 أغسطس 2013 .
↑ روفو، باولا، وآخرون. "الحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر كمنظمات فوق جينية في الأمراض التنكسية العصبية." أبحاث تجديد الأعصاب 18.6 (2023): 1243.
↑ بريسناهان إس تي، لي إي، كلارك إل، ما آر، رانجيل جيه، غروزينجر سي إم، وآخرون . (يونيو 2023). " دراسة تأثير الأصل الأبوي على النسخ ومثيلة الحمض النووي الريبوزي في التوسط في السلوك العدواني لدى نحل العسل (أبيس ميليفيرا)" . بي إم سي جينوميكس . 24 (1) 315. doi : 10.1186/s12864-023-09411-4 . PMC 10258952. PMID 37308882 .
↑ يول أ، إدموندز دبليو جيه (1998). "الوراثة اللاجينية والبريونات". مجلة علم الأحياء التطوري . 11 (2): 241-42 . doi : 10.1007/s000360050085 (غير نشط في 4 أكتوبر 2025).{{cite journal}}: صيانة CS1: رقم التعريف الرقمي غير نشط اعتبارًا من أكتوبر 2025 ( رابط )
↑ كوكس، ب. س. (1965). " [ PSI ] ، مثبط سيتوبلازمي للكبت الفائق في الخميرة" . الوراثة . 20 (4): 505-21 . Bibcode : 1965Hered..20..505C . doi : 10.1038/hdy.1965.65 .
↑ لاكروت، ف. (مايو 1971). "طفرة غير مندلية تسمح بامتصاص حمض اليوريدوسكسينيك في الخميرة" . مجلة علم البكتيريا . 106 (2): 519-22 . doi : 10.1128/JB.106.2.519-522.1971 . PMC 285125. PMID 5573734 .
↑ ليبمان إس دبليو، شيرمان إف (سبتمبر 1979). "محدد psi+ خارج الكروموسوم يثبط الطفرات غير المنطقية في الخميرة" . مجلة علم البكتيريا . 139 (3): 1068-1071 . doi : 10.1128/JB.139.3.1068-1071.1979 . PMC 218059. PMID 225301 .
↑ ترو إتش إل، ليندكويست إس إل (سبتمبر 2000). "يوفر بريون الخميرة آلية للتنوع الجيني والتنوع الظاهري". نيتشر . 407 ( 6803): 477-483 . Bibcode : 2000Natur.407..477T . doi : 10.1038/35035005 . PMID 11028992. S2CID 4411231 .
↑ شورتر ج، ليندكويست س (يونيو 2005). " البريونات كقنوات تكيفية للذاكرة والوراثة". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 6 (6): 435-450 . doi : 10.1038/nrg1616 . PMID 15931169. S2CID 5575951 .
↑ جياكوميلي إم جي، هانكوك إيه إس، ماسيل جيه (فبراير 2007). "تحويل المناطق غير المترجمة 3' إلى مناطق ترميز" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 24 (2): 457-464 . doi : 10.1093/molbev/msl172 . PMC 1808353. PMID 17099057 .
↑ لانكستر إيه كيه، بارديل جيه بي، ترو إتش إل، ماسيل جيه (فبراير 2010). "معدل الظهور التلقائي لبريون الخميرة [ PSI+ ] وآثاره على تطور خصائص قابلية تطور نظام [ PSI + ] " . علم الوراثة . 184 (2): 393-400 . doi : 10.1534/genetics.109.110213 . PMC 2828720. PMID 19917766 .
↑ غارسيا دي إم، كامبل إي إيه، جاكوبسون سي إم، تسوتشيا إم، شو إي إيه، ديناردو إيه إل، وآخرون . (سبتمبر 2021). " البريون يُسرّع التكاثر على حساب العمر" . eLife . 10 e60917. doi : 10.7554/eLife.60917 . PMC 8455135. PMID 34545808 .
↑ توبارت سي، فيرنر إي، أريموندو بي بي (يوليو 2020). " التجوال على طول الخط الزمني اللاجيني" . علم اللاجينية السريري . 12 (1) 97. doi : 10.1186/s13148-020-00893-7 . PMC 7330981. PMID 32616071 .
↑ تشاندلر ، في. إل. (فبراير 2007). "الطفرة الوراثية: من الذرة إلى الفئران" . مجلة الخلية . 128 (4): 641-645 . رمز Bibcode : 2007Cell..128..641C . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.007 . PMID 17320501. S2CID 6928707 .
↑ زيدي إس كيه، ليان جيه بي، فان واينن إيه، شتاين جيه إل، شتاين جي إس (2017). "تحديد مواقع الجينات أثناء الانقسام الخلوي: آلية فوق جينية لتنسيق التزام السلالة، وهوية الخلية، ونمو الخلية". بروتينات RUNX في النمو والسرطان . التقدم في الطب التجريبي وعلم الأحياء. المجلد 962. الصفحات 95-102 . doi : 10.1007/978-981-10-3233-2_7 . ISBN 978-981-10-3231-8. PMC 7233416 . PMID 28299653 .
↑ سوتر سي إم، مارتن دي آي (يناير 2010). "الطفرة المصاحبة: قمة جبل جليدي فوق جيني؟" . اتجاهات في علم الوراثة . 26 (1): 9-14 . doi : 10.1016/j.tig.2009.11.003 . PMC 3137459. PMID 19945764 .
↑ فيرغسون-سميث ، أ. س. (يوليو 2011). "البصمة الجينية: ظهور نموذج فوق جيني". مجلة نيتشر ريفيوز. علم الوراثة . 12 (8): 565-575 . doi : 10.1038/nrg3032 . PMID 21765458. S2CID 23630392 .
↑ كوفالتشوك، أو.، وبولش، ج. إي. (يناير 2008). "التغيرات فوق الجينية وتأثيرات الإشعاع غير الموجه - هل ثمة رابط؟" . علم الطفرات البيئية والجزيئية . 49 (1): 16-25 . Bibcode : 2008EnvMM..49...16K . doi : 10.1002/em.20361 . PMID: 18172877. S2CID : 38705208 .
↑ إيلنيتسكي، ي.، وكوفالتشوك، أ. (سبتمبر 2011). "تأثيرات الإشعاع غير الموجه - صلة فوق جينية". بحوث الطفرات . 714 ( 1-2 ): 113-125 . Bibcode : 2011MRFMM.714..113I . doi : 10.1016/j.mrfmmm.2011.06.014 . PMID 21784089 .
↑ فريدل، أ.أ.، مازوريك، ب.، سيلر، د.م. (2012). "التغيرات الناجمة عن الإشعاع في أنماط تعديل الهيستون وتأثيرها المحتمل على الآثار الإشعاعية قصيرة المدى" . فرونتيرز إن أونكولوجي . 2 : 117. doi : 10.3389/fonc.2012.00117 . PMC 3445916. PMID 23050241 .
↑ أوهيغان إتش إم، محمد إتش بي، بايلين إس بي (أغسطس 2008). لي جيه تي (محرر). "يمكن أن تؤدي كسور الحمض النووي المزدوجة إلى بدء إسكات الجينات وبدء مثيلة الحمض النووي المعتمدة على SIRT1 في جزيرة CpG للمحفز الخارجي" . PLOS Genetics . 4 (8) e1000155. doi : 10.1371/journal.pgen.1000155 . PMC 2491723. PMID 18704159 .
↑ مالانغا م، ألتهاوس ف ر (يونيو 2005). "دور عديد (أدينوزين ثنائي الفوسفات-ريبوز) في شبكة إشارات تلف الحمض النووي" (ملف PDF) . الكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 83 (3): 354-364 . Bibcode : 2005BCB....83..354M . doi : 10.1139/o05-038 . PMID 15959561 .
↑ غوتشالك إيه جيه، تيمينسكي جي، كونغ إس إي، جين جيه، كاي واي، سوانسون إس كيه، وآخرون . (أغسطس 2009). "يوجه بلمرة (أدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي) استقطاب وتفعيل مُعدِّل الكروماتين المعتمد على الأدينوزين ثلاثي الفوسفات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (33): 13770-4 . Bibcode : 2009PNAS..10613770G . doi : 10.1073/pnas.0906920106 . PMC 2722505. PMID 19666485 .
↑ لين جيه سي، جيونغ إس، ليانغ جي، تاكاي دي، فاطمي إم، تساي واي سي، وآخرون . (نوفمبر 2007). " دور شغل النيوكليوسومات في إسكات جزيرة MLH1 CpG اللاجيني" . خلية السرطان . 12 (5): 432-444 . doi : 10.1016/j.ccr.2007.10.014 . PMC 4657456. PMID 17996647 .
↑ تابيش إيه إم، بولز كيه، هوت بي، غوديريس إل (2012). كياريوتي إل (محرر). "العوامل فوق الجينية في خطر الإصابة بالسرطان: تأثير المواد المسرطنة الكيميائية على نمط مثيلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) الشامل في خلايا TK6 البشرية" . PLOS ONE . 7 (4) e34674. Bibcode : 2012PLoSO...734674T . doi : 10.1371/journal.pone.0034674 . PMC 3324488. PMID 22509344 .
↑ Burdge GC, Hoile SP, Uller T, Thomas NA, Gluckman PD, Hanson MA, et al. (2011). Imhof A (ed.). "التغيرات التدريجية عبر الأجيال في النمط الظاهري والنمط الجيني للذرية بعد التحول الغذائي" . PLOS ONE . 6 (11) e28282. Bibcode : 2011PLoSO...628282B . doi : 10.1371/ journal.pone.0028282 . PMC 3227644. PMID 22140567 .
↑ فانغ م، تشين د، يانغ س س (يناير 2007). "قد تؤثر البوليفينولات الغذائية على مثيلة الحمض النووي" . مجلة التغذية . 137 (1 ملحق): 223S– 228S. doi : 10.1093/jn/137.1.223S . PMID 17182830 .
↑ أولاهارسكي إيه جيه، راين جيه، مارشال بي إل، بابيارز جيه، تشانغ إل، فيردين إي، وآخرون . (ديسمبر 2005). "عامل النكهة ثنائي هيدروكومارين يعكس التثبيط اللاجيني ويثبط إنزيمات دي أسيتيلاز السيرتوين" . مجلة PLOS Genetics . 1 (6) e77. doi : 10.1371/journal.pgen.0010077 . PMC 1315280. PMID 16362078 .
↑ ديوريتش ز، تشين ج، دورج د.ر، هايلبرون ل.ك، كوتشوك أ (أكتوبر 2001). "تأثير مكملات إيزوفلافون الصويا على مؤشرات الإجهاد التأكسدي لدى الرجال والنساء". رسائل السرطان . 172 (1): 1-6 . doi : 10.1016/S0304-3835(01)00627-9 . PMID 11595123 .
↑ كروبات سي، مولر دي، بوتلر يو، زيمرمان كيه، هيس إي إتش، ديرش في إم، وآخرون . (مارس 2013). "تعديل نسخ الجينات المعتمدة على Nrf2 بواسطة أنثوسيانين التوت البري في الجسم الحي". التغذية الجزيئية وبحوث الغذاء . 57 (3): 545-550 . doi : 10.1002/mnfr.201200504 . PMID 23349102 .
↑ سوينبيرغ، جيه إيه، لو، كيه، مولر، بي سي، غاو، إل، أبتون، بي بي، ناكامورا، جيه، وآخرون . (مارس 2011). "نواتج إضافة الحمض النووي الداخلية مقابل الخارجية: دورها في التسرطن، وعلم الأوبئة، وتقييم المخاطر" . مجلة علم السموم . 120 (ملحق 1): ص 130-145. doi : 10.1093/toxsci/kfq371 . PMC 3043087. PMID 21163908 .
1 2 هاميلتون إم إل، غو زد، فولر سي دي، فان ريمن إتش، وارد دبليو إف، أوستاد إس إن، وآخرون . (مايو 2001). "تقييم موثوق لمستويات 8-أوكسو-2-ديوكسي غوانوزين في الحمض النووي النووي والميتوكوندري باستخدام طريقة يوديد الصوديوم لعزل الحمض النووي" . أبحاث الأحماض النووية . 29 (10): 2117-2126 . doi : 10.1093/nar/29.10.2117 . PMC 55450. PMID 11353081 .
↑ مينغ إكس، ماتر بي، سونغ إم، فيلياث إي، شانلي آر، جونز آر، وآخرون (مارس 2014). "رسم خرائط منتجات أكسدة الغوانين ذات البنية المحددة على طول سلاسل الحمض النووي المزدوجة: تأثير سياق التسلسل المحلي ومثيلة السيتوزين الذاتية" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 136 (11): 4223-35 . Bibcode : 2014JAChS.136.4223M . doi : 10.1021/ ja411636j . PMC 3985951. PMID 24571128 .
1 2 3 Zhou X, Zhuang Z, Wang W, He L, Wu H, Cao Y, et al. (سبتمبر 2016). "يُعدّ OGG1 ضروريًا في إزالة مثيلة الحمض النووي DNA المُستحثة بالإجهاد التأكسدي". Cell Signal . 28 (9): 1163–1171 . doi : 10.1016/j.cellsig.2016.05.021 . PMID 27251462 .
↑ بوتش، أ. ر. (2020). "علم جينوم تلف الحمض النووي التأكسدي، وإصلاحه، والطفرات الناتجة عنه" . مجلة الحوسبة والتكنولوجيا الحيوية الهيكلية . 18 : 207-219 . doi : 10.1016/j.csbj.2019.12.013 . PMC 6974700. PMID 31993111 .
↑ D'Augustin O, Huet S, Campalans A, Radicella JP (نوفمبر 2020). "ضائع في الزحام: كيف يجد إنزيم غليكوزيلاز الحمض النووي 8-أوكسوجوانين البشري 1 (OGG1) جزيء 8-أوكسوجوانين في الجينوم؟" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 21 (21): 8360. doi : 10.3390/ijms21218360 . PMC 7664663. PMID 33171795 .
↑ لان إل، ناكاجيما إس، أوهاتا واي، تاكاو إم، أوكانو إس، ماسوتاني إم، وآخرون . (سبتمبر 2004). "تحليل موضعي لعمليات إصلاح تلف الحمض النووي التأكسدي في خلايا الثدييات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 ( 38): 13738-43 . Bibcode : 2004PNAS..10113738L . doi : 10.1073/pnas.0406048101 . PMC 518826. PMID 15365186 .
↑ مايدر إم إل، أنغستمان جيه إف، ريتشاردسون إم إي، ليندر إس جيه، كاسيو في إم، تساي إس كيو، وآخرون . (ديسمبر 2013). "إزالة مثيلة الحمض النووي المستهدفة وتنشيط الجينات الداخلية باستخدام بروتينات اندماج TALE-TET1 القابلة للبرمجة" . نات. بيوتكنولوجي . 31 (12): 1137-1142 . doi : 10.1038/ nbt.2726 . PMC 3858462. PMID 24108092 .
↑ دينغ ن، بونهام إي إم، هانون بي إي، أميك تي آر، بايلين إس بي، أوهيغان إتش إم (يونيو 2016). " بروتينات إصلاح عدم التطابق تستقطب ناقل ميثيل الحمض النووي 1 إلى مواقع تلف الحمض النووي التأكسدي" . مجلة بيولوجيا الخلية الجزيئية . 8 (3): 244-254 . doi : 10.1093/jmcb/mjv050 . PMC 4937888. PMID 26186941 .
جيانغ ز ، لاي ي، بيفر جيه إم، تسجاي بي إس، تشاو إم إل، هورتون جيه كيه، وآخرون . (يناير 2020). "يُعدِّل تلف الحمض النووي التأكسدي نمط مثيلة الحمض النووي في جين سرطان الثدي البشري 1 (BRCA1) عبر التفاعل بين بوليميراز الحمض النووي β وإنزيم مثيل ترانسفيراز الحمض النووي الجديد" . الخلايا . 9 ( 1): 225. doi : 10.3390/cells9010225 . PMC 7016758. PMID 31963223 .
↑ مورتوسيفيتش، أو.، وشيرميله، ل.، ووالتر، ج.، وكاردوسو، م.س.، وليونهارت، هـ. (يونيو 2005). " استقطاب إنزيم ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي الأول إلى مواقع إصلاح الحمض النووي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (25): 8905-9 . Bibcode : 2005PNAS..102.8905M . doi : 10.1073/pnas.0501034102 . PMC 1157029. PMID 15956212 .
1 2 أوهيغان إتش إم، محمد إتش بي، بايلين إس بي (أغسطس 2008). "يمكن أن تؤدي كسور الحمض النووي المزدوجة إلى بدء إسكات الجينات وبدء مثيلة الحمض النووي المعتمدة على SIRT1 في جزيرة CpG للمحفز الخارجي" . PLOS Genet . 4 (8) e1000155. doi : 10.1371/journal.pgen.1000155 . PMC 2491723. PMID 18704159 .
↑ ها ك، لي جي إي، بالي إس إس، براون كيه دي، تاكيدا واي، ليو كيه، وآخرون (يناير 2011). "التجنيد السريع والعابر لإنزيم DNMT1 إلى مواقع انقطاع الحمض النووي المزدوج يتم بوساطة تفاعله مع مكونات متعددة من آلية الاستجابة لتلف الحمض النووي" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 20 (1): 126-140 . doi : 10.1093/hmg/ddq451 . PMC 3000680. PMID 20940144 .
↑ روسو جي، لاندي آر، بيزون إيه، مورانو إيه، زوتشيغنا سي، رومانو إيه، وآخرون . (سبتمبر 2016). "تلف الحمض النووي وإصلاحه يُعدِّلان مثيلة الحمض النووي ونطاق الكروماتين للموقع المستهدف: آلية تعدد أشكال مثيلة الأليلات" . تقارير علمية . 6 33222. Bibcode : 2016NatSR...633222R . doi : 10.1038/srep33222 . PMC 5024116. PMID 27629060 .
↑ فارس إم إتش، تيكستر بي إيه، مورا إيه إيه، وايلز إم في، ماك غاريغل إي إف، كلاوس إس إيه، وآخرون . (ديسمبر 2020). "الكشف عن تعديلات الجينوم بوساطة تقنية كريسبر من خلال أنماط مثيلة متغيرة لجزر CpG" . بي إم سي جينوميكس . 21 (1) 856. doi : 10.1186/s12864-020-07233-2 . PMC 7709351. PMID 33267773 .
↑ ساب ج (1991). "مفاهيم التنظيم: الاستفادة من الأوليات الهدبية". تاريخ مفاهيمي لعلم الأجنة الحديث . علم الأحياء النمائي. المجلد 7. الصفحات 229-258 . doi : 10.1007/978-1-4615-6823-0_11 . ISBN 978-1-4615-6825-4PMID 1804215
↑ ساب ج (2003). التكوين: تطور علم الأحياء . أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-515619-5.
↑ غراي، آر. دي.، أوياما، إس.، غريفيثس، بي. إي. (2003). دورات الطوارئ: الأنظمة النمائية والتطور (الحياة والعقل: قضايا فلسفية في علم الأحياء وعلم النفس) . كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. ISBN 978-0-262-65063-2.
↑ سيريزاي ج، دونغ ي، يانيس ج، تشيسني م، سيراتو س، أهرينغر ج (20 فبراير 2020). "التحليل النسيجي يكشف عن بنى تنظيمية مميزة للجينات المنتشرة، والجينات الجرثومية، والجينات الجسدية". bioRxiv 10.1101/2020.02.20.958579 .
1 2 تيف، في. بي.، بيشنوفا، دي. إيه.، فاينشتين، واي.، مارث، سي.، مالم، جيه. بي.، هوفر، تي.، وآخرون . (أغسطس 2014). "إعادة تموضع النيوكليوسومات تربط بين مثيلة/إزالة مثيلة الحمض النووي وارتباط CTCF التفاضلي أثناء تطور الخلايا الجذعية" . أبحاث الجينوم . 24 (8): 1285-1295 . doi : 10.1101/gr.164418.113 . PMC 4120082. PMID 24812327 .
↑ بوشبيك م، هاك إس بي (مايو 2017). "متغيرات الهيستونات الأساسية وأدوارها في تحديد مصير الخلية، والنمو، والسرطان" . مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 18 (5): 299-314 . doi : 10.1038/nrm.2016.166 . PMID 28144029. S2CID 3307731 .
↑ جانغ سي دبليو، شيباتا واي، ستارمر جيه، يي دي، ماغنوسون تي (يوليو 2015). "يحافظ الهيستون H3.3 على سلامة الجينوم أثناء نمو الثدييات" . الجينات والتطور . 29 (13): 1377-1392 . doi : 10.1101/gad.264150.115 . PMC 4511213. PMID 26159997 .
↑ "الجينوم ثلاثي الأبعاد" . www.nature.com . 2 سبتمبر 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 سبتمبر 2021 .
↑ كيتامورا تي، أوغاوا إس كيه، روي دي إس، أوكوياما تي، موريسي إم دي، سميث إل إم، وآخرون . (أبريل 2017). " البصمات والدوائر ضرورية لتوحيد أنظمة الذاكرة" . مجلة ساينس . 356 (6333): 73-78 . Bibcode : 2017Sci...356...73K . doi : 10.1126/science.aam6808 . PMC 5493329. PMID 28386011 .
1 2 ستوت آر تي، كريتسكي أو، تساي إل إتش (2021). "تحديد مواقع انقطاع الحمض النووي والتغيرات النسخية استجابةً لتعلم الخوف السياقي" . PLOS ONE . 16 (7) e0249691. Bibcode : 2021PLoSO..1649691S . doi : 10.1371/journal.pone.0249691 . PMC 8248687. PMID 34197463 .
↑ لي بي إتش، شيم جيه واي، مون إتش سي، كيم دي دبليو، كيم جيه، يوك جيه إس، وآخرون . (يوليو 2022). " التصوير المرئي في الوقت الحقيقي لتخليق الحمض النووي الريبوزي الرسول أثناء تكوين الذاكرة في الفئران الحية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 119 (27) e2117076119. رمز Bibcode : 2022PNAS..11917076L . doi : 10.1073/pnas.2117076119 . PMC 9271212. PMID 35776545 .
↑ تيشماير دبليو، غريم آر (أبريل 1999). " تنشيط الجينات المبكرة الفورية وتكوين الذاكرة" . مجلة علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 55 (4): 564-74 . doi : 10.1007/s000180050315 . PMC 11146814. PMID 10357227. S2CID 6923522 .
1 2 أوليفيرا إيه إم، هيمستيدت تي جيه، بادينغ إتش (يوليو 2012). "استعادة القدرة المعرفية من خلال إنقاذ التعبير عن Dnmt3a2 من التدهور المرتبط بالشيخوخة". نات نيروسسي . 15 (8): 1111-3 . doi : 10.1038/nn.3151 . PMID 22751036. S2CID 10590208 .
1 2 صن ز، شو إكس، هي جيه، موراي إيه، صن إم إيه، وي إكس، وآخرون . (أغسطس 2019). "يستقطب EGR1 بروتين TET1 لتشكيل ميثيلوم الدماغ أثناء النمو وعند النشاط العصبي" . نات كوميون . 10 (1) 3892. Bibcode : 2019NatCo..10.3892S . doi : 10.1038/ s41467-019-11905-3 . PMC 6715719. PMID 31467272 .
↑ مانزو م، ويرز ج، أمبروزي س، فيلاسينور ر، روشيتزكي ب، باوبيك ت (ديسمبر 2017). "تحديد موقع نظائر DNMT3A بشكل خاص ينظم دقة مثيلة الحمض النووي في جزر CpG ثنائية التكافؤ" . مجلة EMBO . 36 (23): 3421-3434 . doi : 10.15252/embj.201797038 . PMC 5709737. PMID 29074627 .
↑ جويلز جي، لامبريشت آر (2014). "تكوين ذاكرة الخوف قد يؤثر على ذاكرة مختلفة: يؤثر التكييف الخوفي على انطفاء ذاكرة النفور المشروط من الطعم (CTA)، وليس على استرجاعها" . فرونت بيهيف نيوروساينس . 8 : 324. doi : 10.3389/fnbeh.2014.00324 . PMC 4179742. PMID 25324744 .
↑ مور إل دي، لي تي، فان جي (يناير 2013). " مثيلة الحمض النووي ووظيفتها الأساسية" . علم الأدوية النفسية العصبية . 38 (1): 23-38 . doi : 10.1038/npp.2012.112 . PMC 3521964. PMID 22781841 .
1 2 هالدر ر، هينيون م، فيدال ر.و، شومروني أ، رحمن ر.و، راجبوت أ، وآخرون . (يناير 2016). "تغيرات مثيلة الحمض النووي في جينات اللدونة العصبية تصاحب تكوين الذاكرة والحفاظ عليها". نات نيوروساينس . 19 (1): 102-110 . doi : 10.1038 / nn.4194 . PMID 26656643. S2CID 1173959 .
↑ فرانكلاند، ب. و.، بونتيمبي، ب.، تالتون، ل. إ.، كاتشماريك، ل.، سيلفا، أ. ج. (مايو 2004). "دور القشرة الحزامية الأمامية في ذاكرة الخوف السياقية البعيدة". مجلة ساينس . 304 (5672): 881-883 . Bibcode : 2004Sci...304..881F . doi : 10.1126 /science.1094804 . PMID 15131309. S2CID 15893863 .
↑ بارتر، جيه دي، وفوستر ، تي سي (أكتوبر 2018). "الشيخوخة في الدماغ: أدوار جديدة لعلم التخلق في التدهور المعرفي". مجلة عالم الأعصاب . 24 (5): 516-525 . doi : 10.1177/1073858418780971 . PMID 29877135. S2CID 46965080 .
↑ هارمان إم إف، مارتن إم جي (فبراير 2020). " الآليات فوق الجينية المرتبطة بالتدهور المعرفي أثناء الشيخوخة". مجلة أبحاث علم الأعصاب . 98 (2): 234-246 . doi : 10.1002/jnr.24436 . hdl : 11336/128755 . PMID 31045277. S2CID 143423862 .
^ Braga DL، Mousovich-Neto F، Tonon-da-Silva G، Salgueiro WG، Mori MA (أغسطس 2020). “التغيرات اللاجينية أثناء الشيخوخة وآلياتها الأساسية”. علم الشيخوخة الحيوية . 21 (4): 423-443 . دوى : 10.1007 / s10522-020-09874-y . بميد 32356238 . S2CID 254292058 .
↑ تشانغ و، كو ج، ليو جي إتش، بيلمونتي جي سي (مارس 2020). "الجينوم فوق الجيني المُسن وتجديده". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 21 (3): 137-150 . doi : 10.1038/s41580-019-0204-5 . PMID 32020082. S2CID 211028527 .
↑ سيمبسون دي جيه، أولوفا إن إن، تشاندرا تي (سبتمبر 2021). "إعادة برمجة الخلايا والتجديد اللاجيني" . علم اللاجينية السريري . 13 (1) 170. doi : 10.1186/s13148-021-01158-7 . PMC 8419998. PMID 34488874 .
↑ هوانغ جيه واي، أرومولاران كيه إيه، زوكين آر إس (مايو 2017). " المجال الناشئ لعلم التخلق في التنكس العصبي والحماية العصبية" . مجلة نيتشر ريفيوز. علم الأعصاب . 18 (6): 347-361 . doi : 10.1038/nrn.2017.46 . PMC 6380351. PMID 28515491 .
^ غريجورينكو إل، كورنيلوف إس إيه، نوموفا أوي (نوفمبر 2016). “التنظيم اللاجيني للإدراك: مراجعة محدودة للمجال”. التنمية وعلم النفس المرضي . 28 (4pt2): 1285–1304 . دوى : 10.1017/S0954579416000857 . بميد 27691982 . S2CID 21422752 .
↑ بيكون إي آر، برينتون آر دي (يونيو 2021). "علم التخلق في الدماغ النامي والمتقدم في السن: الآليات التي تنظم بدء ونتائج إعادة تنظيم الدماغ" . مراجعات علم الأعصاب والسلوك الحيوي . 125 : 503-516 . doi : 10.1016/j.neubiorev.2021.02.040 . PMC 8989071. PMID 33657435 .
↑ سترايفر إم، وغور إيه سي (2021). "علم التخلق، والمواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء الإستروجينية، والدماغ". المواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء . التقدم في علم الأدوية. المجلد 92. الصفحات 73-99 . doi : 10.1016/bs.apha.2021.03.006 . ISBN 978-0-12-823466-2PMID 34452697 . S2CID 237339845 .
↑ بيكداش، ر. أ. (يناير 2018). "الكولين، الدماغ، والتنكس العصبي: رؤى من علم التخلق". مجلة فرونتيرز إن بيوساينس . 23 (6) 4636: 1113-1143 . doi : 10.2741/4636 . PMID 28930592 .
↑ إكستراند ب، شيرز ن، راسموسن م ك، يونغ ج ف، روس أ ب، لاندبيرغ ر (مايو 2021). "أطعمة مفيدة للدماغ - دور النظام الغذائي في أداء الدماغ وصحته". مراجعات التغذية . 79 (6): 693-708 . doi : 10.1093/nutrit/nuaa091 . PMID 32989449 .
↑ فيرنانديز ج، أريدا ر.م، غوميز-بينيلا ف (سبتمبر 2017). "التمرين البدني كمعدِّل فوق جيني لمرونة الدماغ والإدراك" . مراجعات علم الأعصاب والسلوك الحيوي . 80 : 443-456 . doi : 10.1016/j.neubiorev.2017.06.012 . PMC 5705447. PMID 28666827 .
↑ تميم ب (4 سبتمبر 2022). "اكتشاف جديد: قد يُسهم وجود مشبك عصبي مختبئ في دماغ الفأر في تعزيز فهمنا للتواصل العصبي" . interestingengineering.com . تاريخ الاطلاع: 19 أكتوبر 2022 .
↑ شيو إس إتش، أوباديايولا إس، دوبوي في، بانغ إس، دينغ إف، وان جيه، وآخرون . (سبتمبر 2022). " يحفز مشبك محوري-هدبي سيروتونيني الإشارات النووية لتغيير إمكانية الوصول إلى الكروماتين" . مجلة Cell . 185 (18): 3390–3407.e18. doi : 10.1016/j.cell.2022.07.026 . PMC 9789380. PMID 36055200. S2CID 251958800 .
- بيان صحفي من الجامعة: "علماء يكتشفون نوعًا جديدًا من المشابك العصبية في الشعيرات الدقيقة للخلايا العصبية" . معهد هوارد هيوز الطبي عبر موقع phys.org . تاريخ الاطلاع: 19 أكتوبر 2022 .
↑ كيفرن إي بي (أبريل 2011). "علم التخلق وتطور الدماغ". علم التخلق . 3 (2): 183-191 . doi : 10.2217/epi.11.10 . PMID 22122280 .
↑ غريسمر ج، هابر م.هـ، ياماشيتا ج، غانيت ل (مارس 2005). "ملاحظة هامة: دورات الطوارئ - الأنظمة التنموية والتطور". علم الأحياء والفلسفة . 20 ( 2-3 ): 517-44 . doi : 10.1007/s10539-004-0836-4 . S2CID 2995306 .
↑ الفصل: "تطور الجهاز العصبي" في كتاب "علم التخلق"، من تأليف بينيديكت هالغريمسون وبريان هول
↑ كوستا إس، شو بي (مارس 2007). "الخلايا "المنفتحة": كيف يمكن للخلايا تغيير مصيرها (ملف PDF) . اتجاهات في بيولوجيا الخلية . 17 (3): 101-106 . doi : 10.1016/j.tcb.2006.12.005 . PMID 17194589. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 15 ديسمبر 2013. قد يوحي هذا بأن الخلايا النباتية لا تستخدم أو لا تحتاج إلى آلية ذاكرة خلوية، وأنها تستجيب فقط للمعلومات الموضعية. ومع ذلك، فقد ثبت أن النباتات تستخدم آليات ذاكرة خلوية بوساطة بروتينات PcG في العديد من العمليات، ... (ص 104)
↑ كوني، سي. أ.، ديف، أ. أ.، وولف، ج. ل. (أغسطس 2002). "مكملات الميثيل للأمهات في الفئران تؤثر على التباين اللاجيني ومثيلة الحمض النووي للنسل" . مجلة التغذية . 132 (8 ملحق): 2393S– 2400S. doi : 10.1093/jn/132.8.2393S . PMID 12163699 .
↑ ووترلاند، ر. أ.، وجيرتل ، ر. ل. (أغسطس 2003). "العناصر القابلة للنقل: أهداف للتأثيرات الغذائية المبكرة على تنظيم الجينات اللاجيني" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 23 (15): 5293-5300 . doi : 10.1128/MCB.23.15.5293-5300.2003 . PMC 165709. PMID 12861015 .
↑ دولينوي دي سي (أغسطس 2008). "نموذج فأر أغوتي: مستشعر حيوي فوق جيني للتغيرات الغذائية والبيئية على الجينوم فوق الجيني للجنين" . مراجعات التغذية . 66 (ملحق 1): S7-11. doi : 10.1111/j.1753-4887.2008.00056.x . PMC 2822875. PMID 18673496 .
↑ شولز كيه في، بهات إيه، أزاميان إم إس، سوندغرين إن سي، زاباتا جي إي، هيرنانديز بي، وآخرون . (نوفمبر 2019). "تغير مثيلة الحمض النووي كعلامة حيوية تشخيصية لاعتلال الجنين السكري" . علم الوراثة في الطب . 21 (11): 2453-2461 . doi : 10.1038/s41436-019-0516- z . PMID 30992551. S2CID 116880337 .
↑ كالاواي إي (1 ديسمبر 2013). "ذكريات مخيفة تنتقل إلى نسل الفئران: البصمة الوراثية للتجارب الصادمة تنتقل عبر جيلين على الأقل" . مجلة نيتشر - عبر ساينتفك أمريكان.
↑ لو رو م (13 ديسمبر 2013). "يمكن للفئران أن 'تحذير' الأبناء والأحفاد من المخاطر عبر الحيوانات المنوية" .
↑ فرانسيس ج (أكتوبر 2014). " نجاحٌ كبيرٌ جدًا لتجارب علم التخلق الرائدة الحديثة" . علم الوراثة . 198 (2): 449-451 . doi : 10.1534/genetics.114.163998 . PMC 4196602. PMID 25316784 .
↑ دياس بي جي، ريسلر كيه جيه (يناير 2014). "تؤثر تجربة الشم لدى الوالدين على السلوك والبنية العصبية في الأجيال اللاحقة" . مجلة نيتشر لعلم الأعصاب . 17 (1): 89-96 . doi : 10.1038/nn.3594 . PMC 3923835. PMID 24292232 . (انظر تعليق غونزالو أوتازو)
↑ "ورقة بحثية في علم التخلق تثير تساؤلات" .
↑ هوكسترا، آر. إف. (2000). التطور: مقدمة . أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ص 285. ISBN 978-0-19-854968-0.
↑ لامب إم جيه، جابلونكا إي (2005). التطور في أربعة أبعاد: التباين الجيني، والوراثي اللاجيني، والسلوكي، والرمزي في تاريخ الحياة . كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. ISBN 978-0-262-10107-3.
↑ انظر أيضًا دينيس نوبل : موسيقى الحياة ، وخاصة الصفحات 93-98 والصفحة 48، حيث يستشهد بكتاب جابلونكا ولامب ومراجعة ماسيمو بيجليوتشي لكتاب جابلونكا ولامب في مجلة نيتشر 435 ، 565-566 (2 يونيو 2005).
↑ دانشان إي، شارمانتييه أ، شامبان إف إيه، مسعودي أ، بوجول ب، بلانشيه إس (يونيو 2011). "ما وراء الحمض النووي: دمج الوراثة الشاملة في نظرية موسعة للتطور" . مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 12 (7): 475-486 . doi : 10.1038/nrg3028 . PMID 21681209. S2CID 8837202 .
↑ ماينارد سميث، ج. (مارس 1990). "نماذج لنظام وراثي مزدوج". مجلة البيولوجيا النظرية . 143 (1): 41-53 . Bibcode : 1990JThBi.143...41M . doi : 10.1016/S0022-5193(05)80287-5 . PMID 2359317 .
↑ لينش، م. (مايو 2007). "هشاشة الفرضيات التكيفية لأصول تعقيد الكائنات الحية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 104 ( ملحق 1): 8597-604 . Bibcode : 2007PNAS..104.8597L . doi : 10.1073/pnas.0702207104 . PMC 1876435. PMID 17494740 .
↑ ديكنز، تي إي، ورحمان، كيو (أغسطس 2012). "التوليف التطوري الموسع ودور الوراثة المرنة في التطور" . وقائع العلوم البيولوجية . 279 (1740): 2913-2921 . Bibcode : 2012PBioS.279.2913D . doi : 10.1098/rspb.2012.0273 . PMC 3385474. PMID 22593110 .
↑ راندو أو جيه، فيرستريبن كيه جيه (فبراير 2007). "الأطر الزمنية للوراثة الجينية والوراثية اللاجينية" . الخلية . 128 (4): 655-668 . doi : 10.1016 / j.cell.2007.01.023 . PMID 17320504. S2CID 17964015 .
↑ لانكستر إيه كيه، ماسيل جيه (سبتمبر 2009). "تطور المفاتيح العكسية في وجود محاكيات غير عكسية" . التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 63 (9): 2350-2362 . Bibcode : 2009Evolu..63.2350L . doi : 10.1111 / j.1558-5646.2009.00729.x . PMC 2770902. PMID 19486147 .
↑ فان دير غراف أ، واردينار ر، نيومان د.أ، تاودت أ، شو ر.ج، جانسن ر.س، وآخرون . (مايو 2015). "معدل ونطاق وديناميكيات التطور للطفرات فوق الجينية التلقائية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 112 (21): 6676-81 . Bibcode : 2015PNAS..112.6676V . doi : 10.1073 / pnas.1424254112 . PMC 4450394. PMID 25964364 .
↑ غريسولد سي كيه، ماسيل جيه (يونيو 2009). "يمكن للتكيفات المعقدة أن تدفع تطور المكثف [ PSI ] ، حتى مع معدلات واقعية للتكاثر الجنسي في الخميرة" . PLOS Genetics . 5 (6) e1000517. doi : 10.1371/journal.pgen.1000517 . PMC 2686163. PMID 19521499 .
↑ جابلونكا إي، راز جي (يونيو 2009). "التوارث اللاجيني عبر الأجيال: الانتشار والآليات والآثار المترتبة على دراسة الوراثة والتطور" ( ملف PDF) . المجلة الفصلية لعلم الأحياء . 84 (2): 131-176 . CiteSeerX 10.1.1.617.6333 . doi : 10.1086/598822 . PMID 19606595. S2CID 7233550. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 15 يوليو 2011. تم الاطلاع عليه في 1 نوفمبر 2017 .
↑ ديفيز، هازل (2008). هل تلدغ الفراشات؟: إجابات رائعة على أسئلة حول الفراشات والعث (أسئلة وأجوبة عن الحيوانات). مطبعة جامعة روتجرز.
↑ لويس، ز. أ.، هوندا، س.، خلف الله، ت. ك.، جيفريس، ج. ك.، فرايتاغ، م.، موهن، ف.، وآخرون . (مارس 2009). "بقايا الطفرة النقطية الناتجة عن التكرار توجه تكوين الكروماتين المغاير في فطر نيوروسبورا كراسا" . أبحاث الجينوم . 19 (3): 427-437 . doi : 10.1101/gr.086231.108 . PMC 2661801. PMID 19092133 .
1 2 توست ج (2008). علم التخلق . نورفولك، إنجلترا: دار كايستر الأكاديمية للنشر. ISBN 978-1-904455-23-3.
↑ شادت إي إي، بانيرجي أو، فانغ جي، فينغ زد، وونغ دبليو إتش، تشانغ إكس، وآخرون . (يناير 2013). " نمذجة تغير معدل الحركة في بيانات تسلسل الحمض النووي من الجيل الثالث للكشف عن التعديلات المحتملة على قواعد الحمض النووي" . أبحاث الجينوم . 23 (1): 129-141 . doi : 10.1101/gr.136739.111 . PMC 3530673. PMID 23093720 .
↑ ديفيس، بي إم، تشاو، إم سي، والدور، إم كيه (أبريل 2013). "دخول عصر علم التخلق البكتيري باستخدام تسلسل الحمض النووي أحادي الجزيء في الوقت الحقيقي" . الرأي الحالي في علم الأحياء الدقيقة . 16 (2): 192-198 . doi : 10.1016/j.mib.2013.01.011 . PMC 3646917. PMID 23434113 .
↑ لوتش-سينار م، لونغ ك، لورينس-ريكو ف، ديلغادو ج، فانغ ج، سبيتل ك، وآخرون (2013). ريتشاردسون ب.م. (محرر). "توصيف شامل للميثيلوم في الميكوبلازما التناسلية والميكوبلازما الرئوية بدقة قاعدة واحدة" . مجلة PLOS Genetics . 9 (1) e1003191. doi : 10.1371/journal.pgen.1003191 . PMC 3536716. PMID 23300489 .
↑ موراي آي إيه، كلارك تي إيه، مورغان آر دي، بويتانو إم، أنطون بي بي، لونغ كيه، وآخرون . (ديسمبر 2012). "ميثيلومات ستة أنواع من البكتيريا" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 40 (22): 11450-11462 . doi : 10.1093/nar/gks891 . PMC 3526280. PMID 23034806 .
↑ فانغ جي، مونيرا دي، فريدمان دي آي، ماندليك إيه، تشاو إم سي، بانيرجي أو، وآخرون . (ديسمبر 2012). "رسم خرائط جينومية لبقايا الأدينين الميثيلية في بكتيريا الإشريكية القولونية الممرضة باستخدام تسلسل الجزيء المفرد في الوقت الحقيقي" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 30 (12): 1232-1239 . Bibcode : 2012NatBi..30.1232F . doi : 10.1038/nbt.2432 . PMC 3879109. PMID 23138224 .
↑ أوليفيرا ، بي. إتش. (أغسطس 2021). " علم التخلق البكتيري: بلوغ مرحلة النضج" . mSystems . 6 (4) 10.1128/msystems.00747-21: e0074721. doi : 10.1128/mSystems.00747-21 . PMC 8407109. PMID 34402642. S2CID 237149441 .
↑ كاساديسوس ج، لو د (سبتمبر 2006). "التنظيم الجيني اللاجيني في عالم البكتيريا" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 70 (3 ) : 830-856 . Bibcode : 2006MMBR...70..830C . doi : 10.1128/MMBR.00016-06 . PMC 1594586. PMID 16959970 .
↑ مانسو إيه إس، تشاي إم إتش، أتاك جيه إم، فوري إل، دي سانت كروا إم، هايغ آر، وآخرون (سبتمبر 2014). "مفتاح عشوائي سداسي المراحل ينظم ضراوة المكورات الرئوية عبر تغييرات جينية شاملة" . نيتشر كوميونيكيشنز . 5 5055. Bibcode : 2014NatCo...5.5055M . doi : 10.1038/ ncomms6055 . PMC 4190663. PMID 25268848 .
↑ أوليفيرا، بي. إتش.، ريبس، جيه. دبليو.، غاريت، إي. إم.، ترزيلوفا، دي.، كيم، إيه.، سيكولوفيتش، أو.، وآخرون . (يناير 2020). "التوصيف فوق الجيني لبكتيريا كلوستريديوم ديفيسيل يكشف عن وجود ناقل ميثيل الحمض النووي المحفوظ الذي يتوسط عملية التبوغ والإمراض" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 5 (1): 166-180 . doi : 10.1038/s41564-019-0613-4 . PMC 6925328. PMID 31768029 .
↑ شهوان ر، وونتاكال س ن، روا س (مارس 2011). "الطبيعة متعددة الأبعاد للمعلومات فوق الجينية ودورها في الأمراض". ديسكفري ميديسين . 11 (58): 233-243 . PMID 21447282 .
1 2 3 فراغا إم إف، باليستار إي، باز إم إف، روبيرو إس، سيتيين إف، باليستار إم إل، وآخرون . (يوليو 2005). "الاختلافات فوق الجينية تنشأ خلال حياة التوائم المتطابقة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (30): 10604-9 . Bibcode : 2005PNAS..10210604F . doi : 10.1073 / pnas.0500398102 . PMC 1174919. PMID 16009939 .
1 2 كامينسكي ZA، تانغ T، وانغ SC، بتاك C، أوه GH، وونغ AH، وآخرون . (فبراير 2009). " ملامح مثيلة الحمض النووي في التوائم المتطابقة وغير المتطابقة". علم الوراثة الطبيعية . 41 (2): 240-245 . doi : 10.1038/ng.286 . PMID 19151718. S2CID 12688031 .
↑ أوكونور أ (11 مارس 2008). "الادعاء: التوائم المتطابقة لديهم حمض نووي متطابق" . نيويورك تايمز . تم الاطلاع عليه في 2 مايو 2010 .
↑ باليستار إي (أغسطس 2010). " دروس في علم التخلق من التوائم: آفاق أمراض المناعة الذاتية". المراجعات السريرية في الحساسية والمناعة . 39 (1): 30-41 . doi : 10.1007/s12016-009-8168-4 . PMID 19653134. S2CID 25040280 .
↑ والاس آر جي، توومي إل سي، كوستود إم إيه، موينا إن، كومينز بي إم، مانغون إم، وآخرون (2016). "المؤشرات الحيوية التشخيصية والتنبؤية المحتملة للانحراف اللاجيني في الحيز القلبي الوعائي" . مجلة BioMed Research International . 2016 2465763. doi : 10.1155/2016/2465763 . PMC 4749768. PMID 26942189 .
^ الوراثة المندلية على الإنترنت في الإنسان (OMIM): 105830
↑ وود إيه جيه، أوكي آر جيه (نوفمبر 2006). "البصمة الجينية في الثدييات: مواضيع ناشئة ونظريات راسخة" . مجلة PLOS Genetics . 2 (11) e147. doi : 10.1371/journal.pgen.0020147 . PMC 1657038. PMID 17121465 .
↑ كنول جيه إتش، نيكولز آر دي، ماجينيس آر إي، غراهام جيه إم، لالاند إم، لات إس إيه (فبراير 1989). "متلازمتا أنجلمان وبرادر-ويلي تشتركان في حذف مشترك في الكروموسوم 15، لكنهما تختلفان في الأصل الأبوي لهذا الحذف". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية . 32 (2): 285-290 . doi : 10.1002/ajmg.1320320235 . PMID 2564739 .
↑ حفيد الشخص من جهة الأب هو ابن ابن ذلك الشخص؛ وحفيده من جهة الأم هو ابن ابنته.
↑ بيمبري مي، بيغرين لو، كاتي جي، إدفينسون إس، نورثستون ك، سيوستروم إم، وآخرون . (فبراير 2006). “الاستجابات عبر الأجيال الخاصة بالجنس والذكور في البشر” . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 14 (2): 159-66 . دوى : 10.1038/sj.ejhg.5201538 . اتش دي ال : 1983/d6732a7a-ebbf-4dfc-9740-75fcc9b9934c . بميد 16391557 . أشار روبرت وينستون إلى هذه الدراسة في "محاضرة" . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 23 مايو 2007.
↑ "نوفا | نصوص | شبح في جيناتك" . بي بي إس. 16 أكتوبر 2007. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .
↑ أندرسون إس جيه، فاي كيه إم، شميدت-ماكورماك جي آر، مالوفيتش إي، ملينارتشيك جي إس، إزبكي بي، وآخرون . (مايو 2016). "تأثيرات دوائية خارج الهدف تؤدي إلى تغييرات في التعبير الجيني ذات أصول فوق جينية و"شبه فوق جينية"". بحث دوائي . 107 : 229-233 . doi : 10.1016/j.phrs.2016.03.028 . PMID 27025785 .
↑ ألافيان-غافانيني أ، رويغ ج (يناير 2018). "فهم التأثيرات اللاجينية للمواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء: من الآليات إلى طرق الاختبار الجديدة" . علم الأدوية الأساسي والسريري وعلم السموم . 122 (1): 38-45 . doi : 10.1111/bcpt.12878 . PMID 28842957 .
↑ كوبلان ج، شانتري إس تي، روزنبلوم إل إيه (2017). "استمرار تأثير الإجهاد في المراحل المبكرة من الحياة على الإبيجينوم: ملاحظات على الرئيسيات غير البشرية☆". وحدة مرجعية في علم الأعصاب وعلم النفس البيولوجي السلوكي . doi : 10.1016/B978-0-12-809324-5.02862-5 . ISBN 978-0-12-809324-5.
1 2 بلومين ر، ديفريز جيه سي، كنوبيك في إس، نيدرهيزر جيه إم (2017). علم الوراثة السلوكية ( الطبعة السابعة). دار نشر وورث. الصفحات 152-153 . ISBN 978-1-4292-4215-8.
↑ هيرد إي، مارتينسن آر إيه (مارس 2014). "الوراثة اللاجينية عبر الأجيال : خرافات وآليات" . الخلية . 157 (1): 95-109 . doi : 10.1016/j.cell.2014.02.045 . PMC 4020004. PMID 24679529 .
↑ روبيسون إيه جيه، نيستلر إي جيه (أكتوبر 2011). " الآليات النسخية والوراثية اللاجينية للإدمان" . مجلة نيتشر ريفيوز. علم الأعصاب . 12 (11): 623-637 . doi : 10.1038/nrn3111 . PMC 3272277. PMID 21989194 .
↑ شيرون ج، كيرشوف دي إكسارد أ (أغسطس 2021). "إدمان المخدرات: من المختبر إلى سرير المريض" . الطب النفسي الانتقالي . 11 (1) 424. doi : 10.1038/s41398-021-01542-0 . PMC 8361217. PMID 34385417 .
^ Biliński P، Wojtyła A، Kapka-Skrzypczak L، Chwedorowicz R، Cyranka M، Studziński T (2012). “التنظيم اللاجيني في إدمان المخدرات”. حوليات الطب الزراعي والبيئي . 19 (3): 491-496 . بميد 23020045 .
↑ فاسولر إف إم، صدري-فاكيلي جي (أبريل 2014). " آليات التوارث عبر الأجيال للسلوكيات الشبيهة بالإدمان" . علم الأعصاب . 264 : 198-206 . doi : 10.1016/j.neuroscience.2013.07.064 . PMC 3872494. PMID 23920159 .
↑ يوان تي إف، لي إيه، صن إكس، أويانغ إتش، كامبوس سي، روشا إن بي، وآخرون . (نوفمبر 2016). "الوراثة عبر الأجيال للأنماط الظاهرية العصبية السلوكية الأبوية: الإجهاد، والإدمان، والشيخوخة، والأيض". علم الأحياء العصبي الجزيئي . 53 (9): 6367-6376 . doi : 10.1007/s12035-015-9526-2 . hdl : 10400.22/7331 . PMID 26572641. S2CID 25694221 .
↑ شارما إس، كيلي تي كي، جونز بي إيه (1 يناير 2010). " علم التخلق في السرطان" . التسرطن . 31 (1): 27-36 . doi : 10.1093/carcin/bgp220 . ISSN 0143-3334 . PMC 2802667. PMID 19752007 .
↑ سوراوير أ، أوبيرن كيه جيه، ريتشارد دي جيه (26 فبراير 2025). " الأدوية اللاجينية في علاج السرطان" . مراجعات السرطان والانتشار . 44 (1): 37. doi : 10.1007/s10555-025-10253-7 . ISSN 1573-7233 . PMC 11865116. PMID 40011240 .
فيرما م، روجرز س، ديفي ر.ل، شولي س.د، نيلسون س، جوزيف سو ل، وآخرون . (1 فبراير 2014). "البحوث اللاجينية في علم أوبئة السرطان: الاتجاهات والفرص والتحديات" . علم أوبئة السرطان، المؤشرات الحيوية والوقاية . 23 ( 2 ) : 223-233 . doi : 10.1158 /1055-9965.EPI-13-0573 . ISSN 1055-9965 . PMC 3925982. PMID 24326628 .
↑ شهوان ر، وونتاكال س ن، روا س (أكتوبر 2010). "التداخل بين المعلومات الجينية والوراثية اللاجينية من خلال نزع أمين السيتوزين". اتجاهات في علم الوراثة . 26 (10): 443-448 . doi : 10.1016/j.tig.2010.07.005 . PMID 20800313 .
↑ بادال س، هير ي ف، ماهر ل ج (سبتمبر 2015). "التأثيرات غير المضادة للمضادات الحيوية للفلوروكينولونات في خلايا الثدييات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 290 (36): 22287-97 . doi : 10.1074/jbc.M115.671222 . PMC 4571980. PMID 26205818 .
↑ ميزنتسيفا ن.ف.، يانغ ج.، كور ك.، إيافالدانو ج.، ريموند م.س.، أيزنبرغ س.أ.، وآخرون . (فبراير 2013). " مثبط ميثيل ترانسفيراز الهيستون BIX01294 يعزز القدرة القلبية لخلايا نخاع العظم" . الخلايا الجذعية والتطور . 22 (4): 654-667 . doi : 10.1089/scd.2012.0181 . PMC 3564468. PMID 22994322 .
↑ يانغ جيه، وكور كيه، وأونغ إل إل، وإيزنبرغ سي إيه، وإيزنبرغ إل إم (2015). "تثبيط إنزيم ميثيل ترانسفيراز الهيستون G9a يحوّل الخلايا الجذعية اللحمية المتوسطة لنخاع العظم إلى خلايا سلفية قلبية مؤهلة" . مجلة الخلايا الجذعية الدولية . 2015 270428. doi : 10.1155/2015/270428 . PMC 4454756. PMID 26089912 .
^ مولر إس، سينديكوبوابو إف، كانييك تي، لافون أ، فيرسيني أ، لومبارد ب، وآخرون . (أكتوبر 2020). "ينظم CD44 اللدونة اللاجينية عن طريق التوسط في الالتقام الخلوي للحديد" . كيمياء الطبيعة . 12 (10): 929– 938. بيب كود : 2020NatCh..12..929M . دوى : 10.1038/s41557-020-0513-5 . بمك 7612580 . بميد 32747755 .
↑ سولير إس، مولر إس، كانيك تي، فيرسيني أ، مانسارت أ، سينديكوبوابو إف، وآخرون . (مايو 2023). "مسار إشارات النحاس القابل للتخدير والذي يؤدي إلى الالتهاب" . طبيعة . 617 (7960): 386–394 . بيب كود : 2023Natur.617..386S . دوى : 10.1038/s41586-023-06017-4 . بمك 10131557 . بميد 37100912 .
↑ ليو ن، بان ت (يناير 2015). " علم التخلق الجيني للرنا" . البحوث الانتقالية . 165 (1): 28-35 . doi : 10.1016/j.trsl.2014.04.003 . PMC 4190089. PMID 24768686 .
↑ رونغ د، صن غ، وو ف، تشنغ ي، صن غ، جيانغ و، وآخرون . (سبتمبر 2021). " علم التخلق: أدوار وآثار تعديلات الحمض النووي الريبوزي غير المشفر في السرطانات البشرية" . العلاج الجزيئي. الأحماض النووية . 25 : 67-82 . doi : 10.1016/j.omtn.2021.04.021 . PMC 8217334. PMID 34188972. S2CID 235558945 .
↑ شين هـ، تشوي و.ل، ليم ج.ي، هوه ج.هـ (مارس 2022). "تعديل الإبيجينوم: التلاعب الموجه بالتعديلات الإبيجينية في النباتات". الجينات وعلم الجينوم . 44 (3): 307-315 . doi : 10.1007/s13258-021-01199-5 . PMID 35000141. S2CID 245848779 .
هاوي جيه إس ، ويلسون آر، شميد كيه تي ، تشو إل، لاكشمانان إل إن، لين بي سي، وآخرون . ( يناير 2022). " التنوع الجيني المؤثر على مثيلة الحمض النووي يوفر رؤى حول الآليات الجزيئية التي تنظم الوظيفة الجينومية" . علم الوراثة الطبيعية . 54 (1): 18-29 . doi : 10.1038/s41588-021-00969-x . PMC 7617265. PMID 34980917. S2CID 245654240. مؤرشف من الأصل في 29 أكتوبر 2022. تم الاسترجاع في 20 يناير 2023 .
↑ لي إس تي، فينغ إم، وي واي، لي زد، تشياو واي، غوان بي، وآخرون . (يوليو 2013). "يُفرط التعبير عن فوسفاتاز التيروزين البروتيني UBASH3B في سرطان الثدي ثلاثي السلبية، ويعزز الغزو والانتشار" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 110 (27): 11121-11126 . Bibcode : 2013PNAS..11011121L . doi : 10.1073/pnas.1300873110 . PMC 3704014. PMID 23784775 .
↑ ينغو إل، سيدورينكو جيه، كيمبر كي إي، تشنغ زد، وود إيه آر، ويدون إم إن، وآخرون . (أكتوبر 2018). "تحليل تجميعي لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم للطول ومؤشر كتلة الجسم في حوالي 700000 فرد من أصول أوروبية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 27 (20): 3641-3649 . doi : 10.1093/hmg/ddy271 . PMC 6488973. PMID 30124842 .
↑ بوليت إس إل، ستونمان سي، موريس إيه بي، وود إيه آر، غلاستونبري سي إيه، تيريل جيه، وآخرون . (يناير 2019). "تحليل تجميعي لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم لتوزيع الدهون في الجسم لدى 694649 فردًا من أصول أوروبية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 28 (1): 166-174 . doi : 10.1093/hmg/ddy327 . PMC 6298238. PMID 30239722 .
↑ تشو ز، غو ي، شي هـ، ليو سي إل، بانغانيان آر إيه، تشونغ دبليو، وآخرون . (فبراير 2020). "روابط جينية وتجريبية مشتركة بين سمات مرتبطة بالسمنة وأنواع فرعية من الربو في بنك البيانات الحيوية في المملكة المتحدة" . مجلة الحساسية والمناعة السريرية . 145 (2): 537-549 . doi : 10.1016/j.jaci.2019.09.035 . PMC 7010560. PMID 31669095 .
↑ ريتشاردسون تي جي، ساندرسون إي، بالمر تي إم، آلا-كوربيلا إم، فيرنس بي إيه، ديفي سميث جي، وآخرون . (مارس 2020). "تقييم العلاقة بين دهون البروتينات الدهنية والبروتينات الشحمية في الدورة الدموية مع خطر الإصابة بأمراض القلب التاجية: تحليل عشوائي مندلي متعدد المتغيرات" . مجلة PLOS Medicine . 17 (3) e1003062. doi : 10.1371/journal.pmed.1003062 . PMC 7089422. PMID 32203549 .
↑ كونيتشنا ج، سانشيز ج، بالو م، بيكو س، بالو أ (مارس 2015). "المؤشرات الحيوية المبكرة القائمة على النسخ الجيني لخلايا الدم للآثار الضارة لتقييد السعرات الحرارية أثناء الحمل وإمكانية عكسها عن طريق مكملات اللبتين" . التقارير العلمية . 5 (1) 9088. Bibcode : 2015NatSR...5.9088K . doi : 10.1038/srep09088 . PMC 4357898. PMID 25766068 .
↑ أوكادا، واي (نوفمبر 2014). "من عصر تحليل الجينوم إلى عصر اكتشاف الأدوية الجينومية: مثال رائد لالتهاب المفاصل الروماتويدي". علم الوراثة السريرية . 86 (5): 432-440 . doi : 10.1111/cge.12465 . PMID 25060537. S2CID 8499325 .
↑ هي ز، تشانغ ر، جيانغ ف، تشانغ هـ، تشاو أ، شو ب، وآخرون . (أغسطس 2018). " ترتبط التغيرات الجينية في FADS1-FADS2 باستقلاب الأحماض الدهنية من خلال تغييرات في مثيلة الحمض النووي والتعبير الجيني" . علم التخلق السريري . 10 (1) 113. doi : 10.1186/s13148-018-0545-5 . PMC 6114248. PMID 30157936 .
↑ غوان وآخرون (يونيو 2014). "دراسة ارتباط على مستوى الجينوم للأحماض الدهنية المتعددة غير المشبعة N6 في بلازما الدم ضمن مجموعات أبحاث القلب والشيخوخة في اتحاد علم الأوبئة الجينومي" . سيركوليشن: علم الوراثة القلبية الوعائية . 7 (3): 321-331 . doi : 10.1161 / circgenetics.113.000208 . PMC 4123862. PMID 24823311 .
↑ شين إس واي، فومان إي بي، بيترسن إيه كيه، كرومسيك جيه، سانتوس آر، هوانغ جيه، وآخرون (يونيو 2014). " أطلس التأثيرات الجينية على مستقلبات الدم البشري" . علم الوراثة الطبيعية . 46 (6): 543-550 . Bibcode : 2014NaGen..46..543S . doi : 10.1038/ng.2982 . PMC 4064254. PMID 24816252 .
↑ أستل دبليو جيه، فريق دراسة الارتباط الجيني على مستوى الجينوم لصفات الدم في المملكة المتحدة، مشروع كامبريدج بلوبرينت للجينوم فوق الجيني (2 ديسمبر 2016). "دراسة ارتباط جيني على مستوى الجينوم لـ 170,000 فرد تحدد آلاف الأليلات التي تؤثر على صفات خلايا الدم، والعديد منها موجود في مُحسِّنات فائقة تحدد هوية الخلية". مجلة الدم . 128 (22): 2652. doi : 10.1182/blood.v128.22.2652.2652 . ISSN 0006-4971 .
↑ كامات إم إيه، بلاكشو جيه إيه، يونغ آر، سوريندران بي، بورغيس إس، دانيش جيه، وآخرون . (نوفمبر 2019). "PhenoScanner V2: أداة موسعة للبحث عن ارتباطات النمط الجيني بالنمط الظاهري البشري" . المعلوماتية الحيوية . 35 (22): 4851-4853 . doi : 10.1093/bioinformatics/btz469 . PMC 6853652. PMID 31233103 .
↑ غورسكي د (4 فبراير 2013). "علم التخلق: لا يعني ما يعتقده الدجالون" . الطب القائم على العلم .

للمزيد من القراءة

حق، ف. ن.، غوتسمان، إ. إ.، وونغ، أ. هـ. (مايو 2009). "ليسوا متطابقين تمامًا: الاختلافات اللاجينية في التوائم المتطابقة وآثارها على دراسات التوائم في الطب النفسي". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية. الجزء ج، ندوات في علم الوراثة الطبية . 151ج ( 2): 136-141 . doi : 10.1002/ajmg.c.30206 . PMID 19378334. S2CID 205327825 .
"ما هو علم التخلق؟" . مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها . 15 أغسطس 2022. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 سبتمبر 2023 .

روابط خارجية

"علم التخلق والوراثة" . learn.genetics.utah.edu . تم الاطلاع عليه بتاريخ 17 أبريل 2019 .
مشروع الجينوم البشري (HEP)
شبكة التميز في علم الجينوم (NoE)
اتحاد الأبحاث الكندي في علم التخلق والبيئة والصحة (CEEHRC)
شبكة التميز في علم الجينوم (NoE) – موقع دولي عام. مؤرشف بتاريخ 28 مايو 2010 في أرشيف الإنترنت (Wayback Machine).
"الحمض النووي ليس قدراً محتوماً" - قصة غلاف مجلة ديسكوفر
"الشبح في جيناتك" ، هورايزون (2005)، بي بي سي
مقال في علم التخلق في كلية الطب بجامعة جونز هوبكنز
نحو خريطة عالمية للتغيرات اللاجينية

[Epigenetics_2009_review-1] دوبونت سي، أرمانت دي آر، برينر سي إيه (سبتمبر 2009). "علم التخلق: التعريف والآليات والمنظور السريري" . ندوات في طب الإنجاب . 27 (5): 351-357 . doi : 10.1055/s-0029-1237423 . PMC 2791696. PMID 19711245. في المعنى الأصلي لهذا التعريف، كان علم التخلق يشير إلى جميع المسارات الجزيئية التي تُعدّل التعبير عن النمط الجيني إلى نمط ظاهري معين. على مر السنين، ومع النمو السريع لعلم الوراثة، ضاق معنى الكلمة تدريجيًا. تم تعريف علم التخلق، وهو مقبول عمومًا اليوم، بأنه "دراسة التغيرات في وظيفة الجينات التي تُورّث انقساميًا و/أو اختزاليًا، والتي لا تستلزم تغييرًا في تسلسل الحمض النووي".

[science-2] 1 2 روثرفورد أ (19 يوليو 2015). "احذروا من عباقرة الجينات الزائفة" . صحيفة الغارديان .

[3] دينز سي، ماجرت كيه إيه (أبريل 2015). "ماذا تقصد بـ "علم التخلق"؟" . علم الوراثة . 199 (4): 887-896 . Bibcode : 2015Genet.199..887D . doi : 10.1534/genetics.114.173492 . PMC 4391566. PMID 25855649 .

[4] كانوال ر، غوبتا س (أبريل 2012). " التعديلات فوق الجينية في السرطان" . علم الوراثة السريرية . 81 (4): 303-311 . doi : 10.1111/j.1399-0004.2011.01809.x . PMC 3590802. PMID 22082348 .

[5] فرياس-لاسير د، فيلاغرا سي إيه (2017). "أهمية الحمض النووي الريبوزي غير المشفر كآليات فوق جينية في التباين الظاهري والتطور العضوي" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 8 2483. doi : 10.3389/fmicb.2017.02483 . PMC 5744636. PMID 29312192 .

[pmid17522671-6] 1 2 بيرد أ (مايو 2007). "تصورات علم التخلق" . مجلة نيتشر . 447 (7143): 396-398 . Bibcode : 2007Natur.447..396B . doi : 10.1038/ nature05913 . PMID 17522671. S2CID 4357965 .

[7] هانتر ب (1 مايو 2008). "ما تتذكره الجينات" . مجلة بروسبكت . مؤرشف من الأصل في 1 مايو 2008. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .

[pmid17522676-8] ريك دبليو (مايو 2007). " استقرار ومرونة تنظيم الجينات اللاجيني في نمو الثدييات". نيتشر . 447 (7143): 425-32 . Bibcode : 2007Natur.447..425R . doi : 10.1038/nature05918 . PMID 17522676. S2CID 11794102 .

[9] قاموس أكسفورد الإنجليزي : "استخدم دبليو هارفي هذه الكلمة في كتابه Exercitationes 1651، صفحة 148، وفي كتاب English Anatomical Exercitations 1653، صفحة 272. وقد تم شرحها على أنها تعني 'partium super-exorientium additamentum'، أي 'إضافة أجزاء تنبثق من بعضها البعض'."

[Moore_2015-10] 1 2 مور دي إس (2015). الجينوم النامي: مقدمة في علم التخلق السلوكي . مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-992235-2.

[pmid19339683-11] 1 2 بيرغر إس إل، كوزاريدس تي، شيخاتار آر، شيلاتيفارد إيه (أبريل 2009). " تعريف عملي لعلم التخلق" . الجينات والتطور . 23 (7): 781-783 . doi : 10.1101/gad.1787609 . PMC 3959995. PMID 19339683 .

[NIH-12] 1 2 "نظرة عامة" . مشروع علم التخلق الجيني التابع لخارطة طريق المعاهد الوطنية للصحة . مؤرشف من الأصل في 21 نوفمبر 2019. تم الاطلاع عليه في 7 ديسمبر 2013 .

[13] مورانج م. لا مؤقت لنيكولاي كولتسوف (كولتسوف) من علم الوراثة وعلم الأجنة والفيزياء الكيميائية ، ج. العلوم البيولوجية. 2011. المجلد 36. ص 211-214

[waddington-14] وادينجتون سي إتش (1942). "النمط الجيني فوق الجيني". إنديفور . 1 : 18-20 . "لغرض دراسة الوراثة، فإن العلاقة بين الأنماط الظاهرية والأنماط الجينية [...] من وجهة نظر بيولوجية أوسع، ذات أهمية بالغة، لأنها جوهر مشكلة التطور بأكملها."

[15] انظر إلى نظرية التكوين المسبق للاطلاع على الخلفية التاريخية. قاموس أكسفورد الإنجليزي : "النظرية القائلة بأن الجرثومة تُوجد (عن طريق تراكمات متتالية)، وليس مجرد نموها، في عملية التكاثر. [...] كانت النظرية المقابلة تُعرف سابقًا باسم "نظرية التطور"؛ ولتجنب غموض هذا الاسم، يُشار إليها الآن بشكل رئيسي باسم "نظرية التكوين المسبق"، وأحيانًا باسم "نظرية التغليف" أو "الاحتواء"."

[Waddington2014-16] وادينجتون، سي إتش (2014). علم التخلق في الطيور . مطبعة جامعة كامبريدج. رقم ISBN 978-1-107-44047-0.

[17] هول، ب. ك. (يناير 2004). "بحثًا عن آليات التطور النمائي: الفجوة الزمنية التي امتدت لثلاثين عامًا بين عامي 1944 و1974" . مجلة علم الحيوان التجريبي، الجزء ب: التطور الجزيئي والنمائي . 302 (1): 5-18 . رمز Bibcode : 2004JEZ...302....5H . doi : 10.1002/jez.b.20002 . PMID 14760651 .

[18] ألفاريز-بويلا إي آر، تشاوس إيه، ألدانا إم، بينيتيز إم، كورتيس-بوزا واي، إسبينوزا-سوتو سي، وآخرون . (3 نوفمبر 2008). "التشكل الزهري: استكشافات عشوائية للمشهد فوق الجيني لشبكة جينية" . PLOS ONE . 3 (11) e3626. Bibcode : 2008PLoSO...3.3626A . doi : 10.1371/ journal.pone.0003626 . PMC 2572848. PMID 18978941 .

[sciencedirect.com-19] 1 2 راباجانتي جيه إف، بابيرا إيه إل (مارس 2015). "التفرع والتذبذبات في المشهد فوق الجيني لتحديد مصير الخلية". التقدم في الفيزياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 117 ( 2-3 ): 240-249 . doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2015.01.006 . PMID 25641423. S2CID 2579314 .

[pmid2265224-20] هوليداي، ر. (يناير 1990). "مَثْيَلَة الحمض النووي والوراثة فوق الجينية" . المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية في لندن. السلسلة ب، العلوم البيولوجية . 326 (1235): 329-338 . Bibcode : 1990RSPTB.326..329H . doi : 10.1098/rstb.1990.0015 . PMID 1968668 .

[isbn0-87969-490-4-21] 1 2 ريغز إيه دي، مارتينسن آر إيه، روسو في إي (1996). الآليات اللاجينية لتنظيم الجينات . بلينفيو، نيويورك: مطبعة مختبر كولد سبرينغ هاربور. ص 1-4 . ISBN 978-0-87969-490-6.

[nature2008-22] ليدفورد، هـ. (أكتوبر 2008). "اللغة: تعريفات متنازع عليها" . مجلة نيتشر . 455 (7216): 1023-1028 . doi : 10.1038/4551023a . PMID 18948925 .

[23] جيبني إي آر، نولان سي إم (يوليو 2010). "علم التخلق والتعبير الجيني" . الوراثة . 105 (1): 4-13 . Bibcode : 2010Hered.105....4G . doi : 10.1038/hdy.2010.54 . PMID 20461105. S2CID 31611763 .

[pmid17407749-24] بتاشن م (أبريل 2007). "حول استخدام كلمة "علم التخلق"" . Current Biology . 17 (7): R233-6. Bibcode : 2007CBio...17.R233P . doi : 10.1016 / j.cub.2007.02.030 . PMID 17407749. S2CID 17490277 .

[25] تشانغ د، تانغ ز، هوانغ هـ، تشو غ، تسوي س، وينغ ي، وآخرون . (أكتوبر 2019). "التنظيم الأيضي للتعبير الجيني عن طريق لاكتلة الهيستون" . نيتشر . 574 (7779): 575-580 . Bibcode : 2019Natur.574..575Z . doi : 10.1038/ s41586-019-1678-1 . PMC 6818755. PMID 31645732 .

[pmid30619465-26] كومار إس، تشينوسامي في، موهاباترا تي (2018). " علم التخلق لقواعد الحمض النووي المعدلة: 5-ميثيل سيتوزين وما بعده" . فرونتيرز إن جينيتكس . 9 640. doi : 10.3389/fgene.2018.00640 . PMC 6305559. PMID 30619465 .

[pmid31399642-27] غرينبيرغ إم في، بوركيس دي (أكتوبر 2019). "الأدوار المتنوعة لمثيلة الحمض النووي في نمو الثدييات وأمراضها". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 20 (10): 590-607 . doi : 10.1038 / s41580-019-0159-6 . PMID 31399642. S2CID 199512037 .

[pmid22868264-28] سبيتز إف، فورلونغ إي إي (سبتمبر 2012). " عوامل النسخ: من ارتباط المُحسِّن إلى التحكم النمائي". نات ريف جينيت . 13 (9): 613-26 . doi : 10.1038/nrg3207 . PMID 22868264. S2CID 205485256 .

[pmid28620075-29] 1 2 ديوك سي جي، كينيدي إيه جيه، جافين سي إف، داي جيه جيه، سويت جيه دي (يوليو 2017). " إعادة تنظيم الجينوم فوق الجيني المعتمد على الخبرة في الحصين" . مجلة التعلم والذاكرة . 24 (7): 278-288 . doi : 10.1101/lm.045112.117 . PMC 5473107. PMID 28620075 .

[Bernstein-30] 1 2 3 4 بيرنشتاين سي (2022). " مثيلة الحمض النووي وتكوين الذاكرة" . رؤى علم التخلق . 15 25168657211072499. doi : 10.1177/25168657211072499 . PMC 8793415. PMID 35098021 .

[Rose-31] 1 2 روز، ن. ر.، وكلوز ، ر. ج. (ديسمبر 2014). "فهم العلاقة بين مثيلة الحمض النووي ومثيلة الليسين في الهيستون" . بيوشيم بيوفيز أكتا . 1839 (12): 1362-1372 . doi : 10.1016/j.bbagrm.2014.02.007 . PMC 4316174. PMID 24560929 .

[Li2021-32] 1 2 لي واي، تشين إكس، لو سي (مايو 2021). "التفاعل بين مثيلة الحمض النووي ومثيلة الهيستون: الآليات الجزيئية وآثارها على الأمراض" . EMBO Rep . 22 (5) e51803. doi : 10.15252/embr.202051803 . PMC 8097341. PMID 33844406 .

[pmid33133421-33] بينداندي أ، باتيلي أ.س، دياسبرو أ، روكيا و (2020). "دور ذيول الهيستون في استقرار النيوكليوسوم: منظور كهروستاتيكي" . مجلة الحوسبة والبنية والتكنولوجيا الحيوية . 18 : 2799-2809 . doi : 10.1016/j.csbj.2020.09.034 . PMC 7575852. PMID 33133421 .

[34] ستيوارت، إم دي، لي، جيه، وونغ، جيه (أبريل 2005). "العلاقة بين مثيلة الليسين 9 في الهيستون H3، وكبت النسخ، وتجنيد بروتين الهيتروكروماتين 1" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 25 (7): 2525-2538 . doi : 10.1128/MCB.25.7.2525-2538.2005 . PMC 1061631. PMID 15767660 .

[35] خان، ف. أ. (2014). "الاضطرابات الوراثية والعلاج الجيني". التكنولوجيا الحيوية في العلوم الطبية . ص 264-289 . doi : 10.1201/b16905-14 . ISBN 978-0-429-17411-7.

[pmid9487389-36] جينوين تي، لايبل جي، دورن آر، رويتر جي (يناير 1998). "بروتينات نطاق SET تُعدِّل نطاقات الكروماتين في الكروماتين الحقيقي والمتغاير" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 54 (1): 80-93 . doi : 10.1007/s000180050127 . PMC 11147257. PMID 9487389. S2CID 7769686 .

[slotkin2007-37] سلوتكين آر كيه، مارتينسن آر (أبريل 2007). "العناصر القابلة للنقل والتنظيم اللاجيني للجينوم". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 8 (4): 272-285 . doi : 10.1038/nrg2072 . PMID 17363976. S2CID 9719784 .

[li92-38] 1 2 لي إي، بيستور تي إتش، جانيش آر (يونيو 1992). "طفرة موجهة في جين ناقل ميثيل الحمض النووي تؤدي إلى موت الجنين". الخلية . 69 ( 6): 915-26 . Bibcode : 1992Cell...69..915L . doi : 10.1016/0092-8674(92)90611-F . PMID 1606615. S2CID 19879601 .

[robertson99-39] روبرتسون ك.د، أوزفولجي إ، ليانغ ج، تالمادج س، سوميجي ج، غونزاليس ف.أ، وآخرون (يونيو 1999). "إنزيمات ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي البشري (DNMTs) 1 و3أ و3ب: تنسيق التعبير عن الحمض النووي الريبوزي الرسول في الأنسجة الطبيعية والإفراط في التعبير عنه في الأورام" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 27 (11): 2291-2298 . doi : 10.1093/nar/27.11.2291 . PMC 148793. PMID 10325416 .

[leonhardt92-40] ليونهاردت هـ، بيج أ.و، وير هـ.و، بيستور ت.هـ (نوفمبر 1992). "تسلسل استهداف يوجه إنزيم ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي إلى مواقع تضاعف الحمض النووي في نوى الثدييات" ( ملف PDF) . مجلة الخلية . 71 (5): 865-73 . doi : 10.1016/0092-8674(92)90561-P . PMID 1423634. S2CID 5995820 .

[chuang97-41] تشوانغ إل إس، إيان إتش آي، كوه تي دبليو، نغ إتش إتش، شو جي، لي بي إف (سبتمبر 1997). "مركب ناقل ميثيل السيتوزين-5-حمض نووي بشري-PCNA كهدف لـ p21WAF1". مجلة ساينس . 277 (5334): 1996-2000 . رمز Bibcode : 1997Sci...277.1996C . doi : 10.1126/science.277.5334.1996 . PMID 9302295 .

[robertson00-42] روبرتسون ك.د، وولف أ.ب (أكتوبر 2000). " مثيلة الحمض النووي في الصحة والمرض". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 1 (1): 11-9 . doi : 10.1038/35049533 . PMID 11262868. S2CID 1915808 .

[li93-43] لي إي، بيرد سي، جانيش آر (نوفمبر 1993). " دور مثيلة الحمض النووي في البصمة الجينية". نيتشر . 366 (6453): 362-365 . Bibcode : 1993Natur.366..362L . doi : 10.1038/366362a0 . PMID 8247133. S2CID 4311091 .

[44] فيانز أ، ميكولد يو، برويارد إف، جيلبرت سي، لوكلير بي، أوغريزكو في (يوليو 2006). "تحليل ترسب الهيستون H2AZ البشري في الجسم الحي يُعارض دوره المباشر في آليات القوالب فوق الجينية" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 26 (14): 5325-35 . doi : 10.1128/MCB.00584-06 . PMC 1592707. PMID 16809769 .

[pmid18419815-45] أوغريزكو ، ف. ف. (أبريل 2008). "إروين شرودنغر، وفرانسيس كريك، والاستقرار فوق الجيني" . بيولوجي دايركت . 3 : 15. doi : 10.1186/1745-6150-3-15 . PMC 2413215. PMID 18419815 .

[pmid32300195-46] باربييري، إي.، وكوزاريدس، ت. (يونيو 2020). "دور تعديلات الحمض النووي الريبوزي في السرطان". مجلة نيتشر ريفيوز. السرطان . 20 (6): 303-322 . Bibcode : 2020NatRC..20..303B . doi : 10.1038/s41568-020-0253-2 . PMID 32300195 .

[47] جيا جي، فو واي، تشاو إكس، داي كيو، تشنغ جي، يانغ واي، وآخرون . (أكتوبر 2011). "إن N6-ميثيل أدينوزين في الحمض النووي الريبي النووي هو ركيزة رئيسية لإنزيم FTO المرتبط بالسمنة" . مجلة Nature Chemical Biology . 7 (12): 885-887 . doi : 10.1038/nchembio.687 . PMC 3218240. PMID 22002720 .

[48] "بحث جديد يربط بين تعديل الحمض النووي الريبوزي الشائع والسمنة" . Physorg.com . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 يوليو 2012 .

[pmid19234061-49] نوتكي أ، كولاياكوفو م ب، شي ي (مارس 2009). "الأدوار التطورية لإنزيمات إزالة مثيل الليسين من الهيستون" . التطور . 136 (6): 879-889 . doi : 10.1242/dev.020966 . PMC 2692332. PMID 19234061 .

[Rosenfeld_2009-50] روزنفيلد، جيه. إيه.، وانغ، زد.، شونيس، دي. إي.، تشاو، ك.، دي سال، آر.، تشانغ، إم. كيو. (مارس 2009). " تحديد تعديلات الهيستون المُثرية في الأجزاء غير الجينية من الجينوم البشري" . بي إم سي جينوميكس . 10 143. doi : 10.1186/1471-2164-10-143 . PMC 2667539. PMID 19335899 .

[51] سنيبن ك، ميشيلسن إم إيه، دود آي بي (15 أبريل 2008). " تنظيم الجينات فائق الحساسية بواسطة حلقات التغذية الراجعة الإيجابية في تعديل النيوكليوسوم" . بيولوجيا الأنظمة الجزيئية . 4 (1) 182. doi : 10.1038/msb.2008.21 . PMC 2387233. PMID 18414483 .

[52] "الذاكرة الخلوية فوق الجينية" . Cmol.nbi.dk. مؤرشف من الأصل في 30 سبتمبر 2011. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .

[pmid17512413-53] دود، آي. بي.، ميشيلسن ، إم. إيه.، سنيبن، ك.، ثون، جي. (مايو 2007). "تحليل نظري للذاكرة الخلوية فوق الجينية عن طريق تعديل النيوكليوسوم" . مجلة الخلية . 129 (4): 813-822 . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.053 . PMID 17512413. S2CID 16091877 .

[Morris-54] موريس، ك. ل. (2008). "التنظيم اللاجيني للتعبير الجيني". الحمض النووي الريبي وتنظيم التعبير الجيني: طبقة خفية من التعقيد . نورفولك، إنجلترا: دار كايستر الأكاديمية للنشر. ISBN 978-1-904455-25-7.

[pmid19154003-55] ماتيك جيه إس، أمارال بي بي، دينجر إم إي، ميرسر تي آر، ميهلر إم إف (يناير 2009). " تنظيم الحمض النووي الريبوزي للعمليات فوق الجينية" . مقالات بيولوجية . 31 (1): 51-59 . doi : 10.1002/bies.080099 . PMID 19154003. S2CID 19293469 .

[choi06-56] تشوي سي كيو (25 مايو 2006). "يمكن أن يكون الحمض النووي الريبي جزيئًا وراثيًا" . مجلة ساينتست . مؤرشف من الأصل في 8 فبراير 2007.

[Wang-57] وانغ ز، ياو هـ، لين س، تشو إكس، شين ز، لو جي، وآخرون (أبريل 2013). "التنظيم النسخي والوراثي فوق الجيني للميكرو آر إن إيه البشري". رسائل السرطان . 331 ( 1): 1-10 . doi : 10.1016/j.canlet.2012.12.006 . PMID 23246373 .

[58] "تصفح قاعدة بيانات miRBase حسب النوع" .

[59] ليم إل بي، لاو إن سي، غاريت-إنجيل بي، غريمسون إيه، شيلتر جيه إم، كاسل جيه، وآخرون (فبراير 2005). " يُظهر تحليل المصفوفات الدقيقة أن بعض الحمض النووي الريبوزي الميكروي يُثبط أعدادًا كبيرة من الحمض النووي الريبوزي الرسول المستهدف". نيتشر . 433 (7027): 769-773 . Bibcode : 2005Natur.433..769L . doi : 10.1038/nature03315 . PMID 15685193. S2CID 4430576 .

[60] لي د، شين سي (أكتوبر 2012). "تفاعلات الحمض النووي الريبوزي الميكروي مع أهدافه: رؤى جديدة من مناهج شاملة للجينوم" . حوليات أكاديمية نيويورك للعلوم . 1271 (1): 118-128 . Bibcode : 2012NYASA1271..118L . doi : 10.1111/j.1749-6632.2012.06745.x . PMC 3499661. PMID 23050973 .

[61] فريدمان آر سي، فاره كيه كيه، بيرج سي بي، بارتل دي بي (يناير 2009). " معظم الرنا المرسال لدى الثدييات أهداف محفوظة للرنا الميكروي" . أبحاث الجينوم . 19 (1): 92-105 . doi : 10.1101/gr.082701.108 . PMC 2612969. PMID 18955434 .

[62] غول إم جي، بيستور تي إتش (2005). "ناقلات ميثيل السيتوزين في حقيقيات النوى". المراجعة السنوية للكيمياء الحيوية . 74 : 481-514 . doi : 10.1146/annurev.biochem.74.010904.153721 . PMID 15952895. S2CID 32123961 .

[63] هاودن بي بي، بوم إم، هاريسون بي إف، هيرنانديز دي، شرينزل جيه، سيمان تي، وآخرون . (أغسطس 2013). "تحليل الاستجابة النسخية للحمض النووي الريبوزي الصغير في المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للأدوية المتعددة بعد التعرض للمضادات الحيوية" . العوامل المضادة للميكروبات والعلاج الكيميائي . 57 (8): 3864-74 . doi : 10.1128/AAC.00263-13 . PMC 3719707. PMID 23733475 .

[64] "قاعدة بيانات RNATarBase 2.0: قاعدة بيانات شاملة لأهداف الحمض النووي الريبوزي الصغير البكتيري التي تم التحقق منها تجريبياً" . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 26 سبتمبر 2013.

[65] "خرائط جينومية للحمض النووي الريبوزي الصغير غير المشفر وأهدافه في الجينومات الميكروبية" . مؤرشف من الأصل في 8 يونيو 2017. تم الاطلاع عليه في 13 أغسطس 2013 .

[66] روفو، باولا، وآخرون. "الحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر كمنظمات فوق جينية في الأمراض التنكسية العصبية." أبحاث تجديد الأعصاب 18.6 (2023): 1243.

[67] بريسناهان إس تي، لي إي، كلارك إل، ما آر، رانجيل جيه، غروزينجر سي إم، وآخرون . (يونيو 2023). " دراسة تأثير الأصل الأبوي على النسخ ومثيلة الحمض النووي الريبوزي في التوسط في السلوك العدواني لدى نحل العسل (أبيس ميليفيرا)" . بي إم سي جينوميكس . 24 (1) 315. doi : 10.1186/s12864-023-09411-4 . PMC 10258952. PMID 37308882 .

[68] يول أ، إدموندز دبليو جيه (1998). "الوراثة اللاجينية والبريونات". مجلة علم الأحياء التطوري . 11 (2): 241-42 . doi : 10.1007/s000360050085 (غير نشط في 4 أكتوبر 2025).{{cite journal}}: صيانة CS1: رقم التعريف الرقمي غير نشط اعتبارًا من أكتوبر 2025 ( رابط )

[69] كوكس، ب. س. (1965). " [ PSI ] ، مثبط سيتوبلازمي للكبت الفائق في الخميرة" . الوراثة . 20 (4): 505-21 . Bibcode : 1965Hered..20..505C . doi : 10.1038/hdy.1965.65 .

[pmid5573734-70] لاكروت، ف. (مايو 1971). "طفرة غير مندلية تسمح بامتصاص حمض اليوريدوسكسينيك في الخميرة" . مجلة علم البكتيريا . 106 (2): 519-22 . doi : 10.1128/JB.106.2.519-522.1971 . PMC 285125. PMID 5573734 .

[pmid225301-71] ليبمان إس دبليو، شيرمان إف (سبتمبر 1979). "محدد psi+ خارج الكروموسوم يثبط الطفرات غير المنطقية في الخميرة" . مجلة علم البكتيريا . 139 (3): 1068-1071 . doi : 10.1128/JB.139.3.1068-1071.1979 . PMC 218059. PMID 225301 .

[pmid11028992-72] ترو إتش إل، ليندكويست إس إل (سبتمبر 2000). "يوفر بريون الخميرة آلية للتنوع الجيني والتنوع الظاهري". نيتشر . 407 ( 6803): 477-483 . Bibcode : 2000Natur.407..477T . doi : 10.1038/35035005 . PMID 11028992. S2CID 4411231 .

[pmid15931169-73] شورتر ج، ليندكويست س (يونيو 2005). " البريونات كقنوات تكيفية للذاكرة والوراثة". مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 6 (6): 435-450 . doi : 10.1038/nrg1616 . PMID 15931169. S2CID 5575951 .

[74] جياكوميلي إم جي، هانكوك إيه إس، ماسيل جيه (فبراير 2007). "تحويل المناطق غير المترجمة 3' إلى مناطق ترميز" . علم الأحياء الجزيئي والتطور . 24 (2): 457-464 . doi : 10.1093/molbev/msl172 . PMC 1808353. PMID 17099057 .

[75] لانكستر إيه كيه، بارديل جيه بي، ترو إتش إل، ماسيل جيه (فبراير 2010). "معدل الظهور التلقائي لبريون الخميرة [ PSI+ ] وآثاره على تطور خصائص قابلية تطور نظام [ PSI + ] " . علم الوراثة . 184 (2): 393-400 . doi : 10.1534/genetics.109.110213 . PMC 2828720. PMID 19917766 .

[76] غارسيا دي إم، كامبل إي إيه، جاكوبسون سي إم، تسوتشيا إم، شو إي إيه، ديناردو إيه إل، وآخرون . (سبتمبر 2021). " البريون يُسرّع التكاثر على حساب العمر" . eLife . 10 e60917. doi : 10.7554/eLife.60917 . PMC 8455135. PMID 34545808 .

[Topart-77] توبارت سي، فيرنر إي، أريموندو بي بي (يوليو 2020). " التجوال على طول الخط الزمني اللاجيني" . علم اللاجينية السريري . 12 (1) 97. doi : 10.1186/s13148-020-00893-7 . PMC 7330981. PMID 32616071 .

[pmid17320501-78] تشاندلر ، في. إل. (فبراير 2007). "الطفرة الوراثية: من الذرة إلى الفئران" . مجلة الخلية . 128 (4): 641-645 . رمز Bibcode : 2007Cell..128..641C . doi : 10.1016/j.cell.2007.02.007 . PMID 17320501. S2CID 6928707 .

[79] زيدي إس كيه، ليان جيه بي، فان واينن إيه، شتاين جيه إل، شتاين جي إس (2017). "تحديد مواقع الجينات أثناء الانقسام الخلوي: آلية فوق جينية لتنسيق التزام السلالة، وهوية الخلية، ونمو الخلية". بروتينات RUNX في النمو والسرطان . التقدم في الطب التجريبي وعلم الأحياء. المجلد 962. الصفحات 95-102 . doi : 10.1007/978-981-10-3233-2_7 . ISBN 978-981-10-3231-8. PMC 7233416 . PMID 28299653 .

[80] سوتر سي إم، مارتن دي آي (يناير 2010). "الطفرة المصاحبة: قمة جبل جليدي فوق جيني؟" . اتجاهات في علم الوراثة . 26 (1): 9-14 . doi : 10.1016/j.tig.2009.11.003 . PMC 3137459. PMID 19945764 .

[81] فيرغسون-سميث ، أ. س. (يوليو 2011). "البصمة الجينية: ظهور نموذج فوق جيني". مجلة نيتشر ريفيوز. علم الوراثة . 12 (8): 565-575 . doi : 10.1038/nrg3032 . PMID 21765458. S2CID 23630392 .

[82] كوفالتشوك، أو.، وبولش، ج. إي. (يناير 2008). "التغيرات فوق الجينية وتأثيرات الإشعاع غير الموجه - هل ثمة رابط؟" . علم الطفرات البيئية والجزيئية . 49 (1): 16-25 . Bibcode : 2008EnvMM..49...16K . doi : 10.1002/em.20361 . PMID: 18172877. S2CID : 38705208 .

[83] إيلنيتسكي، ي.، وكوفالتشوك، أ. (سبتمبر 2011). "تأثيرات الإشعاع غير الموجه - صلة فوق جينية". بحوث الطفرات . 714 ( 1-2 ): 113-125 . Bibcode : 2011MRFMM.714..113I . doi : 10.1016/j.mrfmmm.2011.06.014 . PMID 21784089 .

[84] فريدل، أ.أ.، مازوريك، ب.، سيلر، د.م. (2012). "التغيرات الناجمة عن الإشعاع في أنماط تعديل الهيستون وتأثيرها المحتمل على الآثار الإشعاعية قصيرة المدى" . فرونتيرز إن أونكولوجي . 2 : 117. doi : 10.3389/fonc.2012.00117 . PMC 3445916. PMID 23050241 .

[85] أوهيغان إتش إم، محمد إتش بي، بايلين إس بي (أغسطس 2008). لي جيه تي (محرر). "يمكن أن تؤدي كسور الحمض النووي المزدوجة إلى بدء إسكات الجينات وبدء مثيلة الحمض النووي المعتمدة على SIRT1 في جزيرة CpG للمحفز الخارجي" . PLOS Genetics . 4 (8) e1000155. doi : 10.1371/journal.pgen.1000155 . PMC 2491723. PMID 18704159 .

[86] مالانغا م، ألتهاوس ف ر (يونيو 2005). "دور عديد (أدينوزين ثنائي الفوسفات-ريبوز) في شبكة إشارات تلف الحمض النووي" (ملف PDF) . الكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 83 (3): 354-364 . Bibcode : 2005BCB....83..354M . doi : 10.1139/o05-038 . PMID 15959561 .

[87] غوتشالك إيه جيه، تيمينسكي جي، كونغ إس إي، جين جيه، كاي واي، سوانسون إس كيه، وآخرون . (أغسطس 2009). "يوجه بلمرة (أدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي) استقطاب وتفعيل مُعدِّل الكروماتين المعتمد على الأدينوزين ثلاثي الفوسفات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 106 (33): 13770-4 . Bibcode : 2009PNAS..10613770G . doi : 10.1073/pnas.0906920106 . PMC 2722505. PMID 19666485 .

[88] لين جيه سي، جيونغ إس، ليانغ جي، تاكاي دي، فاطمي إم، تساي واي سي، وآخرون . (نوفمبر 2007). " دور شغل النيوكليوسومات في إسكات جزيرة MLH1 CpG اللاجيني" . خلية السرطان . 12 (5): 432-444 . doi : 10.1016/j.ccr.2007.10.014 . PMC 4657456. PMID 17996647 .

[89] تابيش إيه إم، بولز كيه، هوت بي، غوديريس إل (2012). كياريوتي إل (محرر). "العوامل فوق الجينية في خطر الإصابة بالسرطان: تأثير المواد المسرطنة الكيميائية على نمط مثيلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) الشامل في خلايا TK6 البشرية" . PLOS ONE . 7 (4) e34674. Bibcode : 2012PLoSO...734674T . doi : 10.1371/journal.pone.0034674 . PMC 3324488. PMID 22509344 .

[90] Burdge GC, Hoile SP, Uller T, Thomas NA, Gluckman PD, Hanson MA, et al. (2011). Imhof A (ed.). "التغيرات التدريجية عبر الأجيال في النمط الظاهري والنمط الجيني للذرية بعد التحول الغذائي" . PLOS ONE . 6 (11) e28282. Bibcode : 2011PLoSO...628282B . doi : 10.1371/ journal.pone.0028282 . PMC 3227644. PMID 22140567 .

[91] فانغ م، تشين د، يانغ س س (يناير 2007). "قد تؤثر البوليفينولات الغذائية على مثيلة الحمض النووي" . مجلة التغذية . 137 (1 ملحق): 223S– 228S. doi : 10.1093/jn/137.1.223S . PMID 17182830 .

[92] أولاهارسكي إيه جيه، راين جيه، مارشال بي إل، بابيارز جيه، تشانغ إل، فيردين إي، وآخرون . (ديسمبر 2005). "عامل النكهة ثنائي هيدروكومارين يعكس التثبيط اللاجيني ويثبط إنزيمات دي أسيتيلاز السيرتوين" . مجلة PLOS Genetics . 1 (6) e77. doi : 10.1371/journal.pgen.0010077 . PMC 1315280. PMID 16362078 .

[93] ديوريتش ز، تشين ج، دورج د.ر، هايلبرون ل.ك، كوتشوك أ (أكتوبر 2001). "تأثير مكملات إيزوفلافون الصويا على مؤشرات الإجهاد التأكسدي لدى الرجال والنساء". رسائل السرطان . 172 (1): 1-6 . doi : 10.1016/S0304-3835(01)00627-9 . PMID 11595123 .

[94] كروبات سي، مولر دي، بوتلر يو، زيمرمان كيه، هيس إي إتش، ديرش في إم، وآخرون . (مارس 2013). "تعديل نسخ الجينات المعتمدة على Nrf2 بواسطة أنثوسيانين التوت البري في الجسم الحي". التغذية الجزيئية وبحوث الغذاء . 57 (3): 545-550 . doi : 10.1002/mnfr.201200504 . PMID 23349102 .

[pmid21163908-95] سوينبيرغ، جيه إيه، لو، كيه، مولر، بي سي، غاو، إل، أبتون، بي بي، ناكامورا، جيه، وآخرون . (مارس 2011). "نواتج إضافة الحمض النووي الداخلية مقابل الخارجية: دورها في التسرطن، وعلم الأوبئة، وتقييم المخاطر" . مجلة علم السموم . 120 (ملحق 1): ص 130-145. doi : 10.1093/toxsci/kfq371 . PMC 3043087. PMID 21163908 .

[Hamilton-96] 1 2 هاميلتون إم إل، غو زد، فولر سي دي، فان ريمن إتش، وارد دبليو إف، أوستاد إس إن، وآخرون . (مايو 2001). "تقييم موثوق لمستويات 8-أوكسو-2-ديوكسي غوانوزين في الحمض النووي النووي والميتوكوندري باستخدام طريقة يوديد الصوديوم لعزل الحمض النووي" . أبحاث الأحماض النووية . 29 (10): 2117-2126 . doi : 10.1093/nar/29.10.2117 . PMC 55450. PMID 11353081 .

[pmid24571128-97] مينغ إكس، ماتر بي، سونغ إم، فيلياث إي، شانلي آر، جونز آر، وآخرون (مارس 2014). "رسم خرائط منتجات أكسدة الغوانين ذات البنية المحددة على طول سلاسل الحمض النووي المزدوجة: تأثير سياق التسلسل المحلي ومثيلة السيتوزين الذاتية" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 136 (11): 4223-35 . Bibcode : 2014JAChS.136.4223M . doi : 10.1021/ ja411636j . PMC 3985951. PMID 24571128 .

[Zhou-98] 1 2 3 Zhou X, Zhuang Z, Wang W, He L, Wu H, Cao Y, et al. (سبتمبر 2016). "يُعدّ OGG1 ضروريًا في إزالة مثيلة الحمض النووي DNA المُستحثة بالإجهاد التأكسدي". Cell Signal . 28 (9): 1163–1171 . doi : 10.1016/j.cellsig.2016.05.021 . PMID 27251462 .

[pmid31993111-99] بوتش، أ. ر. (2020). "علم جينوم تلف الحمض النووي التأكسدي، وإصلاحه، والطفرات الناتجة عنه" . مجلة الحوسبة والتكنولوجيا الحيوية الهيكلية . 18 : 207-219 . doi : 10.1016/j.csbj.2019.12.013 . PMC 6974700. PMID 31993111 .

[pmid33171795-100] D'Augustin O, Huet S, Campalans A, Radicella JP (نوفمبر 2020). "ضائع في الزحام: كيف يجد إنزيم غليكوزيلاز الحمض النووي 8-أوكسوجوانين البشري 1 (OGG1) جزيء 8-أوكسوجوانين في الجينوم؟" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 21 (21): 8360. doi : 10.3390/ijms21218360 . PMC 7664663. PMID 33171795 .

[pmid15365186-101] لان إل، ناكاجيما إس، أوهاتا واي، تاكاو إم، أوكانو إس، ماسوتاني إم، وآخرون . (سبتمبر 2004). "تحليل موضعي لعمليات إصلاح تلف الحمض النووي التأكسدي في خلايا الثدييات" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 101 ( 38): 13738-43 . Bibcode : 2004PNAS..10113738L . doi : 10.1073/pnas.0406048101 . PMC 518826. PMID 15365186 .

[pmid24108092-102] مايدر إم إل، أنغستمان جيه إف، ريتشاردسون إم إي، ليندر إس جيه، كاسيو في إم، تساي إس كيو، وآخرون . (ديسمبر 2013). "إزالة مثيلة الحمض النووي المستهدفة وتنشيط الجينات الداخلية باستخدام بروتينات اندماج TALE-TET1 القابلة للبرمجة" . نات. بيوتكنولوجي . 31 (12): 1137-1142 . doi : 10.1038/ nbt.2726 . PMC 3858462. PMID 24108092 .

[pmid26186941-103] دينغ ن، بونهام إي إم، هانون بي إي، أميك تي آر، بايلين إس بي، أوهيغان إتش إم (يونيو 2016). " بروتينات إصلاح عدم التطابق تستقطب ناقل ميثيل الحمض النووي 1 إلى مواقع تلف الحمض النووي التأكسدي" . مجلة بيولوجيا الخلية الجزيئية . 8 (3): 244-254 . doi : 10.1093/jmcb/mjv050 . PMC 4937888. PMID 26186941 .

[Jiang-104] جيانغ ز ، لاي ي، بيفر جيه إم، تسجاي بي إس، تشاو إم إل، هورتون جيه كيه، وآخرون . (يناير 2020). "يُعدِّل تلف الحمض النووي التأكسدي نمط مثيلة الحمض النووي في جين سرطان الثدي البشري 1 (BRCA1) عبر التفاعل بين بوليميراز الحمض النووي β وإنزيم مثيل ترانسفيراز الحمض النووي الجديد" . الخلايا . 9 ( 1): 225. doi : 10.3390/cells9010225 . PMC 7016758. PMID 31963223 .

[pmid15956212-105] مورتوسيفيتش، أو.، وشيرميله، ل.، ووالتر، ج.، وكاردوسو، م.س.، وليونهارت، هـ. (يونيو 2005). " استقطاب إنزيم ميثيل ترانسفيراز الحمض النووي الأول إلى مواقع إصلاح الحمض النووي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (25): 8905-9 . Bibcode : 2005PNAS..102.8905M . doi : 10.1073/pnas.0501034102 . PMC 1157029. PMID 15956212 .

[pmid18704159-106] 1 2 أوهيغان إتش إم، محمد إتش بي، بايلين إس بي (أغسطس 2008). "يمكن أن تؤدي كسور الحمض النووي المزدوجة إلى بدء إسكات الجينات وبدء مثيلة الحمض النووي المعتمدة على SIRT1 في جزيرة CpG للمحفز الخارجي" . PLOS Genet . 4 (8) e1000155. doi : 10.1371/journal.pgen.1000155 . PMC 2491723. PMID 18704159 .

[pmid20940144-107] ها ك، لي جي إي، بالي إس إس، براون كيه دي، تاكيدا واي، ليو كيه، وآخرون (يناير 2011). "التجنيد السريع والعابر لإنزيم DNMT1 إلى مواقع انقطاع الحمض النووي المزدوج يتم بوساطة تفاعله مع مكونات متعددة من آلية الاستجابة لتلف الحمض النووي" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 20 (1): 126-140 . doi : 10.1093/hmg/ddq451 . PMC 3000680. PMID 20940144 .

[pmid27629060-108] روسو جي، لاندي آر، بيزون إيه، مورانو إيه، زوتشيغنا سي، رومانو إيه، وآخرون . (سبتمبر 2016). "تلف الحمض النووي وإصلاحه يُعدِّلان مثيلة الحمض النووي ونطاق الكروماتين للموقع المستهدف: آلية تعدد أشكال مثيلة الأليلات" . تقارير علمية . 6 33222. Bibcode : 2016NatSR...633222R . doi : 10.1038/srep33222 . PMC 5024116. PMID 27629060 .

[pmid33267773-109] فارس إم إتش، تيكستر بي إيه، مورا إيه إيه، وايلز إم في، ماك غاريغل إي إف، كلاوس إس إيه، وآخرون . (ديسمبر 2020). "الكشف عن تعديلات الجينوم بوساطة تقنية كريسبر من خلال أنماط مثيلة متغيرة لجزر CpG" . بي إم سي جينوميكس . 21 (1) 856. doi : 10.1186/s12864-020-07233-2 . PMC 7709351. PMID 33267773 .

[pmid1804215-110] ساب ج (1991). "مفاهيم التنظيم: الاستفادة من الأوليات الهدبية". تاريخ مفاهيمي لعلم الأجنة الحديث . علم الأحياء النمائي. المجلد 7. الصفحات 229-258 . doi : 10.1007/978-1-4615-6823-0_11 . ISBN 978-1-4615-6825-4PMID 1804215

[isbn0-19-515619-6-111] ساب ج (2003). التكوين: تطور علم الأحياء . أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-515619-5.

[isbn0-262-65063-0-112] غراي، آر. دي.، أوياما، إس.، غريفيثس، بي. إي. (2003). دورات الطوارئ: الأنظمة النمائية والتطور (الحياة والعقل: قضايا فلسفية في علم الأحياء وعلم النفس) . كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. ISBN 978-0-262-65063-2.

[113] سيريزاي ج، دونغ ي، يانيس ج، تشيسني م، سيراتو س، أهرينغر ج (20 فبراير 2020). "التحليل النسيجي يكشف عن بنى تنظيمية مميزة للجينات المنتشرة، والجينات الجرثومية، والجينات الجسدية". bioRxiv 10.1101/2020.02.20.958579 .

[Teif_2014-114] 1 2 تيف، في. بي.، بيشنوفا، دي. إيه.، فاينشتين، واي.، مارث، سي.، مالم، جيه. بي.، هوفر، تي.، وآخرون . (أغسطس 2014). "إعادة تموضع النيوكليوسومات تربط بين مثيلة/إزالة مثيلة الحمض النووي وارتباط CTCF التفاضلي أثناء تطور الخلايا الجذعية" . أبحاث الجينوم . 24 (8): 1285-1295 . doi : 10.1101/gr.164418.113 . PMC 4120082. PMID 24812327 .

[115] بوشبيك م، هاك إس بي (مايو 2017). "متغيرات الهيستونات الأساسية وأدوارها في تحديد مصير الخلية، والنمو، والسرطان" . مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 18 (5): 299-314 . doi : 10.1038/nrm.2016.166 . PMID 28144029. S2CID 3307731 .

[116] جانغ سي دبليو، شيباتا واي، ستارمر جيه، يي دي، ماغنوسون تي (يوليو 2015). "يحافظ الهيستون H3.3 على سلامة الجينوم أثناء نمو الثدييات" . الجينات والتطور . 29 (13): 1377-1392 . doi : 10.1101/gad.264150.115 . PMC 4511213. PMID 26159997 .

[117] "الجينوم ثلاثي الأبعاد" . www.nature.com . 2 سبتمبر 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 سبتمبر 2021 .

[pmid28386011-118] كيتامورا تي، أوغاوا إس كيه، روي دي إس، أوكوياما تي، موريسي إم دي، سميث إل إم، وآخرون . (أبريل 2017). " البصمات والدوائر ضرورية لتوحيد أنظمة الذاكرة" . مجلة ساينس . 356 (6333): 73-78 . Bibcode : 2017Sci...356...73K . doi : 10.1126/science.aam6808 . PMC 5493329. PMID 28386011 .

[Stott-119] 1 2 ستوت آر تي، كريتسكي أو، تساي إل إتش (2021). "تحديد مواقع انقطاع الحمض النووي والتغيرات النسخية استجابةً لتعلم الخوف السياقي" . PLOS ONE . 16 (7) e0249691. Bibcode : 2021PLoSO..1649691S . doi : 10.1371/journal.pone.0249691 . PMC 8248687. PMID 34197463 .

[pmid35776545-120] لي بي إتش، شيم جيه واي، مون إتش سي، كيم دي دبليو، كيم جيه، يوك جيه إس، وآخرون . (يوليو 2022). " التصوير المرئي في الوقت الحقيقي لتخليق الحمض النووي الريبوزي الرسول أثناء تكوين الذاكرة في الفئران الحية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 119 (27) e2117076119. رمز Bibcode : 2022PNAS..11917076L . doi : 10.1073/pnas.2117076119 . PMC 9271212. PMID 35776545 .

[pmid10357227-121] تيشماير دبليو، غريم آر (أبريل 1999). " تنشيط الجينات المبكرة الفورية وتكوين الذاكرة" . مجلة علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 55 (4): 564-74 . doi : 10.1007/s000180050315 . PMC 11146814. PMID 10357227. S2CID 6923522 .

[pmid22751036-122] 1 2 أوليفيرا إيه إم، هيمستيدت تي جيه، بادينغ إتش (يوليو 2012). "استعادة القدرة المعرفية من خلال إنقاذ التعبير عن Dnmt3a2 من التدهور المرتبط بالشيخوخة". نات نيروسسي . 15 (8): 1111-3 . doi : 10.1038/nn.3151 . PMID 22751036. S2CID 10590208 .

[Sun-123] 1 2 صن ز، شو إكس، هي جيه، موراي إيه، صن إم إيه، وي إكس، وآخرون . (أغسطس 2019). "يستقطب EGR1 بروتين TET1 لتشكيل ميثيلوم الدماغ أثناء النمو وعند النشاط العصبي" . نات كوميون . 10 (1) 3892. Bibcode : 2019NatCo..10.3892S . doi : 10.1038/ s41467-019-11905-3 . PMC 6715719. PMID 31467272 .

[pmid29074627-124] مانزو م، ويرز ج، أمبروزي س، فيلاسينور ر، روشيتزكي ب، باوبيك ت (ديسمبر 2017). "تحديد موقع نظائر DNMT3A بشكل خاص ينظم دقة مثيلة الحمض النووي في جزر CpG ثنائية التكافؤ" . مجلة EMBO . 36 (23): 3421-3434 . doi : 10.15252/embj.201797038 . PMC 5709737. PMID 29074627 .

[pmid25324744-125] جويلز جي، لامبريشت آر (2014). "تكوين ذاكرة الخوف قد يؤثر على ذاكرة مختلفة: يؤثر التكييف الخوفي على انطفاء ذاكرة النفور المشروط من الطعم (CTA)، وليس على استرجاعها" . فرونت بيهيف نيوروساينس . 8 : 324. doi : 10.3389/fnbeh.2014.00324 . PMC 4179742. PMID 25324744 .

[pmid22781841-126] مور إل دي، لي تي، فان جي (يناير 2013). " مثيلة الحمض النووي ووظيفتها الأساسية" . علم الأدوية النفسية العصبية . 38 (1): 23-38 . doi : 10.1038/npp.2012.112 . PMC 3521964. PMID 22781841 .

[Halder-127] 1 2 هالدر ر، هينيون م، فيدال ر.و، شومروني أ، رحمن ر.و، راجبوت أ، وآخرون . (يناير 2016). "تغيرات مثيلة الحمض النووي في جينات اللدونة العصبية تصاحب تكوين الذاكرة والحفاظ عليها". نات نيوروساينس . 19 (1): 102-110 . doi : 10.1038 / nn.4194 . PMID 26656643. S2CID 1173959 .

[pmid15131309-128] فرانكلاند، ب. و.، بونتيمبي، ب.، تالتون، ل. إ.، كاتشماريك، ل.، سيلفا، أ. ج. (مايو 2004). "دور القشرة الحزامية الأمامية في ذاكرة الخوف السياقية البعيدة". مجلة ساينس . 304 (5672): 881-883 . Bibcode : 2004Sci...304..881F . doi : 10.1126 /science.1094804 . PMID 15131309. S2CID 15893863 .

[129] بارتر، جيه دي، وفوستر ، تي سي (أكتوبر 2018). "الشيخوخة في الدماغ: أدوار جديدة لعلم التخلق في التدهور المعرفي". مجلة عالم الأعصاب . 24 (5): 516-525 . doi : 10.1177/1073858418780971 . PMID 29877135. S2CID 46965080 .

[130] هارمان إم إف، مارتن إم جي (فبراير 2020). " الآليات فوق الجينية المرتبطة بالتدهور المعرفي أثناء الشيخوخة". مجلة أبحاث علم الأعصاب . 98 (2): 234-246 . doi : 10.1002/jnr.24436 . hdl : 11336/128755 . PMID 31045277. S2CID 143423862 .

[131] Braga DL، Mousovich-Neto F، Tonon-da-Silva G، Salgueiro WG، Mori MA (أغسطس 2020). “التغيرات اللاجينية أثناء الشيخوخة وآلياتها الأساسية”. علم الشيخوخة الحيوية . 21 (4): 423-443 . دوى : 10.1007 / s10522-020-09874-y . بميد 32356238 . S2CID 254292058 .

[132] تشانغ و، كو ج، ليو جي إتش، بيلمونتي جي سي (مارس 2020). "الجينوم فوق الجيني المُسن وتجديده". مراجعات الطبيعة. بيولوجيا الخلية الجزيئية . 21 (3): 137-150 . doi : 10.1038/s41580-019-0204-5 . PMID 32020082. S2CID 211028527 .

[133] سيمبسون دي جيه، أولوفا إن إن، تشاندرا تي (سبتمبر 2021). "إعادة برمجة الخلايا والتجديد اللاجيني" . علم اللاجينية السريري . 13 (1) 170. doi : 10.1186/s13148-021-01158-7 . PMC 8419998. PMID 34488874 .

[134] هوانغ جيه واي، أرومولاران كيه إيه، زوكين آر إس (مايو 2017). " المجال الناشئ لعلم التخلق في التنكس العصبي والحماية العصبية" . مجلة نيتشر ريفيوز. علم الأعصاب . 18 (6): 347-361 . doi : 10.1038/nrn.2017.46 . PMC 6380351. PMID 28515491 .

[135] غريجورينكو إل، كورنيلوف إس إيه، نوموفا أوي (نوفمبر 2016). “التنظيم اللاجيني للإدراك: مراجعة محدودة للمجال”. التنمية وعلم النفس المرضي . 28 (4pt2): 1285–1304 . دوى : 10.1017/S0954579416000857 . بميد 27691982 . S2CID 21422752 .

[136] بيكون إي آر، برينتون آر دي (يونيو 2021). "علم التخلق في الدماغ النامي والمتقدم في السن: الآليات التي تنظم بدء ونتائج إعادة تنظيم الدماغ" . مراجعات علم الأعصاب والسلوك الحيوي . 125 : 503-516 . doi : 10.1016/j.neubiorev.2021.02.040 . PMC 8989071. PMID 33657435 .

[137] سترايفر إم، وغور إيه سي (2021). "علم التخلق، والمواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء الإستروجينية، والدماغ". المواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء . التقدم في علم الأدوية. المجلد 92. الصفحات 73-99 . doi : 10.1016/bs.apha.2021.03.006 . ISBN 978-0-12-823466-2PMID 34452697 . S2CID 237339845 .

[138] بيكداش، ر. أ. (يناير 2018). "الكولين، الدماغ، والتنكس العصبي: رؤى من علم التخلق". مجلة فرونتيرز إن بيوساينس . 23 (6) 4636: 1113-1143 . doi : 10.2741/4636 . PMID 28930592 .

[139] إكستراند ب، شيرز ن، راسموسن م ك، يونغ ج ف، روس أ ب، لاندبيرغ ر (مايو 2021). "أطعمة مفيدة للدماغ - دور النظام الغذائي في أداء الدماغ وصحته". مراجعات التغذية . 79 (6): 693-708 . doi : 10.1093/nutrit/nuaa091 . PMID 32989449 .

[140] فيرنانديز ج، أريدا ر.م، غوميز-بينيلا ف (سبتمبر 2017). "التمرين البدني كمعدِّل فوق جيني لمرونة الدماغ والإدراك" . مراجعات علم الأعصاب والسلوك الحيوي . 80 : 443-456 . doi : 10.1016/j.neubiorev.2017.06.012 . PMC 5705447. PMID 28666827 .

[141] تميم ب (4 سبتمبر 2022). "اكتشاف جديد: قد يُسهم وجود مشبك عصبي مختبئ في دماغ الفأر في تعزيز فهمنا للتواصل العصبي" . interestingengineering.com . تاريخ الاطلاع: 19 أكتوبر 2022 .

[142] شيو إس إتش، أوباديايولا إس، دوبوي في، بانغ إس، دينغ إف، وان جيه، وآخرون . (سبتمبر 2022). " يحفز مشبك محوري-هدبي سيروتونيني الإشارات النووية لتغيير إمكانية الوصول إلى الكروماتين" . مجلة Cell . 185 (18): 3390–3407.e18. doi : 10.1016/j.cell.2022.07.026 . PMC 9789380. PMID 36055200. S2CID 251958800 .
بيان صحفي من الجامعة: "علماء يكتشفون نوعًا جديدًا من المشابك العصبية في الشعيرات الدقيقة للخلايا العصبية" . معهد هوارد هيوز الطبي عبر موقع phys.org . تاريخ الاطلاع: 19 أكتوبر 2022 .

[mwED0] بيان صحفي من الجامعة: "علماء يكتشفون نوعًا جديدًا من المشابك العصبية في الشعيرات الدقيقة للخلايا العصبية" . معهد هوارد هيوز الطبي عبر موقع phys.org . تاريخ الاطلاع: 19 أكتوبر 2022 .

[143] كيفرن إي بي (أبريل 2011). "علم التخلق وتطور الدماغ". علم التخلق . 3 (2): 183-191 . doi : 10.2217/epi.11.10 . PMID 22122280 .

[Griesemer_2005-144] غريسمر ج، هابر م.هـ، ياماشيتا ج، غانيت ل (مارس 2005). "ملاحظة هامة: دورات الطوارئ - الأنظمة التنموية والتطور". علم الأحياء والفلسفة . 20 ( 2-3 ): 517-44 . doi : 10.1007/s10539-004-0836-4 . S2CID 2995306 .

[145] الفصل: "تطور الجهاز العصبي" في كتاب "علم التخلق"، من تأليف بينيديكت هالغريمسون وبريان هول

[pmid17194589-146] كوستا إس، شو بي (مارس 2007). "الخلايا "المنفتحة": كيف يمكن للخلايا تغيير مصيرها (ملف PDF) . اتجاهات في بيولوجيا الخلية . 17 (3): 101-106 . doi : 10.1016/j.tcb.2006.12.005 . PMID 17194589. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 15 ديسمبر 2013. قد يوحي هذا بأن الخلايا النباتية لا تستخدم أو لا تحتاج إلى آلية ذاكرة خلوية، وأنها تستجيب فقط للمعلومات الموضعية. ومع ذلك، فقد ثبت أن النباتات تستخدم آليات ذاكرة خلوية بوساطة بروتينات PcG في العديد من العمليات، ... (ص 104)

[pmid12163699-147] كوني، سي. أ.، ديف، أ. أ.، وولف، ج. ل. (أغسطس 2002). "مكملات الميثيل للأمهات في الفئران تؤثر على التباين اللاجيني ومثيلة الحمض النووي للنسل" . مجلة التغذية . 132 (8 ملحق): 2393S– 2400S. doi : 10.1093/jn/132.8.2393S . PMID 12163699 .

[waterland-148] ووترلاند، ر. أ.، وجيرتل ، ر. ل. (أغسطس 2003). "العناصر القابلة للنقل: أهداف للتأثيرات الغذائية المبكرة على تنظيم الجينات اللاجيني" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 23 (15): 5293-5300 . doi : 10.1128/MCB.23.15.5293-5300.2003 . PMC 165709. PMID 12861015 .

[149] دولينوي دي سي (أغسطس 2008). "نموذج فأر أغوتي: مستشعر حيوي فوق جيني للتغيرات الغذائية والبيئية على الجينوم فوق الجيني للجنين" . مراجعات التغذية . 66 (ملحق 1): S7-11. doi : 10.1111/j.1753-4887.2008.00056.x . PMC 2822875. PMID 18673496 .

[150] شولز كيه في، بهات إيه، أزاميان إم إس، سوندغرين إن سي، زاباتا جي إي، هيرنانديز بي، وآخرون . (نوفمبر 2019). "تغير مثيلة الحمض النووي كعلامة حيوية تشخيصية لاعتلال الجنين السكري" . علم الوراثة في الطب . 21 (11): 2453-2461 . doi : 10.1038/s41436-019-0516- z . PMID 30992551. S2CID 116880337 .

[151] كالاواي إي (1 ديسمبر 2013). "ذكريات مخيفة تنتقل إلى نسل الفئران: البصمة الوراثية للتجارب الصادمة تنتقل عبر جيلين على الأقل" . مجلة نيتشر - عبر ساينتفك أمريكان.

[152] لو رو م (13 ديسمبر 2013). "يمكن للفئران أن 'تحذير' الأبناء والأحفاد من المخاطر عبر الحيوانات المنوية" .

[Francis_2014-153] فرانسيس ج (أكتوبر 2014). " نجاحٌ كبيرٌ جدًا لتجارب علم التخلق الرائدة الحديثة" . علم الوراثة . 198 (2): 449-451 . doi : 10.1534/genetics.114.163998 . PMC 4196602. PMID 25316784 .

[154] دياس بي جي، ريسلر كيه جيه (يناير 2014). "تؤثر تجربة الشم لدى الوالدين على السلوك والبنية العصبية في الأجيال اللاحقة" . مجلة نيتشر لعلم الأعصاب . 17 (1): 89-96 . doi : 10.1038/nn.3594 . PMC 3923835. PMID 24292232 . (انظر تعليق غونزالو أوتازو)

[155] "ورقة بحثية في علم التخلق تثير تساؤلات" .

[isbn0-19-854968-7-156] هوكسترا، آر. إف. (2000). التطور: مقدمة . أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ص 285. ISBN 978-0-19-854968-0.

[isbn0-262-10107-6-157] لامب إم جيه، جابلونكا إي (2005). التطور في أربعة أبعاد: التباين الجيني، والوراثي اللاجيني، والسلوكي، والرمزي في تاريخ الحياة . كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا. ISBN 978-0-262-10107-3.

[158] انظر أيضًا دينيس نوبل : موسيقى الحياة ، وخاصة الصفحات 93-98 والصفحة 48، حيث يستشهد بكتاب جابلونكا ولامب ومراجعة ماسيمو بيجليوتشي لكتاب جابلونكا ولامب في مجلة نيتشر 435 ، 565-566 (2 يونيو 2005).

[159] دانشان إي، شارمانتييه أ، شامبان إف إيه، مسعودي أ، بوجول ب، بلانشيه إس (يونيو 2011). "ما وراء الحمض النووي: دمج الوراثة الشاملة في نظرية موسعة للتطور" . مراجعات الطبيعة. علم الوراثة . 12 (7): 475-486 . doi : 10.1038/nrg3028 . PMID 21681209. S2CID 8837202 .

[160] ماينارد سميث، ج. (مارس 1990). "نماذج لنظام وراثي مزدوج". مجلة البيولوجيا النظرية . 143 (1): 41-53 . Bibcode : 1990JThBi.143...41M . doi : 10.1016/S0022-5193(05)80287-5 . PMID 2359317 .

[161] لينش، م. (مايو 2007). "هشاشة الفرضيات التكيفية لأصول تعقيد الكائنات الحية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 104 ( ملحق 1): 8597-604 . Bibcode : 2007PNAS..104.8597L . doi : 10.1073/pnas.0702207104 . PMC 1876435. PMID 17494740 .

[162] ديكنز، تي إي، ورحمان، كيو (أغسطس 2012). "التوليف التطوري الموسع ودور الوراثة المرنة في التطور" . وقائع العلوم البيولوجية . 279 (1740): 2913-2921 . Bibcode : 2012PBioS.279.2913D . doi : 10.1098/rspb.2012.0273 . PMC 3385474. PMID 22593110 .

[rando_and_verstrepen-163] راندو أو جيه، فيرستريبن كيه جيه (فبراير 2007). "الأطر الزمنية للوراثة الجينية والوراثية اللاجينية" . الخلية . 128 (4): 655-668 . doi : 10.1016 / j.cell.2007.01.023 . PMID 17320504. S2CID 17964015 .

[164] لانكستر إيه كيه، ماسيل جيه (سبتمبر 2009). "تطور المفاتيح العكسية في وجود محاكيات غير عكسية" . التطور؛ المجلة الدولية للتطور العضوي . 63 (9): 2350-2362 . Bibcode : 2009Evolu..63.2350L . doi : 10.1111 / j.1558-5646.2009.00729.x . PMC 2770902. PMID 19486147 .

[van_der_Graaf_et_al-165] فان دير غراف أ، واردينار ر، نيومان د.أ، تاودت أ، شو ر.ج، جانسن ر.س، وآخرون . (مايو 2015). "معدل ونطاق وديناميكيات التطور للطفرات فوق الجينية التلقائية" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 112 (21): 6676-81 . Bibcode : 2015PNAS..112.6676V . doi : 10.1073 / pnas.1424254112 . PMC 4450394. PMID 25964364 .

[166] غريسولد سي كيه، ماسيل جيه (يونيو 2009). "يمكن للتكيفات المعقدة أن تدفع تطور المكثف [ PSI ] ، حتى مع معدلات واقعية للتكاثر الجنسي في الخميرة" . PLOS Genetics . 5 (6) e1000517. doi : 10.1371/journal.pgen.1000517 . PMC 2686163. PMID 19521499 .

[Jablonka09-167] جابلونكا إي، راز جي (يونيو 2009). "التوارث اللاجيني عبر الأجيال: الانتشار والآليات والآثار المترتبة على دراسة الوراثة والتطور" ( ملف PDF) . المجلة الفصلية لعلم الأحياء . 84 (2): 131-176 . CiteSeerX 10.1.1.617.6333 . doi : 10.1086/598822 . PMID 19606595. S2CID 7233550. مؤرشف من الأصل (ملف PDF) في 15 يوليو 2011. تم الاطلاع عليه في 1 نوفمبر 2017 .

[168] ديفيز، هازل (2008). هل تلدغ الفراشات؟: إجابات رائعة على أسئلة حول الفراشات والعث (أسئلة وأجوبة عن الحيوانات). مطبعة جامعة روتجرز.

[pmid19092133-169] لويس، ز. أ.، هوندا، س.، خلف الله، ت. ك.، جيفريس، ج. ك.، فرايتاغ، م.، موهن، ف.، وآخرون . (مارس 2009). "بقايا الطفرة النقطية الناتجة عن التكرار توجه تكوين الكروماتين المغاير في فطر نيوروسبورا كراسا" . أبحاث الجينوم . 19 (3): 427-437 . doi : 10.1101/gr.086231.108 . PMC 2661801. PMID 19092133 .

[JorgTost-170] 1 2 توست ج (2008). علم التخلق . نورفولك، إنجلترا: دار كايستر الأكاديمية للنشر. ISBN 978-1-904455-23-3.

[171] شادت إي إي، بانيرجي أو، فانغ جي، فينغ زد، وونغ دبليو إتش، تشانغ إكس، وآخرون . (يناير 2013). " نمذجة تغير معدل الحركة في بيانات تسلسل الحمض النووي من الجيل الثالث للكشف عن التعديلات المحتملة على قواعد الحمض النووي" . أبحاث الجينوم . 23 (1): 129-141 . doi : 10.1101/gr.136739.111 . PMC 3530673. PMID 23093720 .

[172] ديفيس، بي إم، تشاو، إم سي، والدور، إم كيه (أبريل 2013). "دخول عصر علم التخلق البكتيري باستخدام تسلسل الحمض النووي أحادي الجزيء في الوقت الحقيقي" . الرأي الحالي في علم الأحياء الدقيقة . 16 (2): 192-198 . doi : 10.1016/j.mib.2013.01.011 . PMC 3646917. PMID 23434113 .

[173] لوتش-سينار م، لونغ ك، لورينس-ريكو ف، ديلغادو ج، فانغ ج، سبيتل ك، وآخرون (2013). ريتشاردسون ب.م. (محرر). "توصيف شامل للميثيلوم في الميكوبلازما التناسلية والميكوبلازما الرئوية بدقة قاعدة واحدة" . مجلة PLOS Genetics . 9 (1) e1003191. doi : 10.1371/journal.pgen.1003191 . PMC 3536716. PMID 23300489 .

[174] موراي آي إيه، كلارك تي إيه، مورغان آر دي، بويتانو إم، أنطون بي بي، لونغ كيه، وآخرون . (ديسمبر 2012). "ميثيلومات ستة أنواع من البكتيريا" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 40 (22): 11450-11462 . doi : 10.1093/nar/gks891 . PMC 3526280. PMID 23034806 .

[175] فانغ جي، مونيرا دي، فريدمان دي آي، ماندليك إيه، تشاو إم سي، بانيرجي أو، وآخرون . (ديسمبر 2012). "رسم خرائط جينومية لبقايا الأدينين الميثيلية في بكتيريا الإشريكية القولونية الممرضة باستخدام تسلسل الجزيء المفرد في الوقت الحقيقي" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 30 (12): 1232-1239 . Bibcode : 2012NatBi..30.1232F . doi : 10.1038/nbt.2432 . PMC 3879109. PMID 23138224 .

[176] أوليفيرا ، بي. إتش. (أغسطس 2021). " علم التخلق البكتيري: بلوغ مرحلة النضج" . mSystems . 6 (4) 10.1128/msystems.00747-21: e0074721. doi : 10.1128/mSystems.00747-21 . PMC 8407109. PMID 34402642. S2CID 237149441 .

[Casadesus-177] كاساديسوس ج، لو د (سبتمبر 2006). "التنظيم الجيني اللاجيني في عالم البكتيريا" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 70 (3 ) : 830-856 . Bibcode : 2006MMBR...70..830C . doi : 10.1128/MMBR.00016-06 . PMC 1594586. PMID 16959970 .

[MansoOggioni2014-178] مانسو إيه إس، تشاي إم إتش، أتاك جيه إم، فوري إل، دي سانت كروا إم، هايغ آر، وآخرون (سبتمبر 2014). "مفتاح عشوائي سداسي المراحل ينظم ضراوة المكورات الرئوية عبر تغييرات جينية شاملة" . نيتشر كوميونيكيشنز . 5 5055. Bibcode : 2014NatCo...5.5055M . doi : 10.1038/ ncomms6055 . PMC 4190663. PMID 25268848 .

[179] أوليفيرا، بي. إتش.، ريبس، جيه. دبليو.، غاريت، إي. إم.، ترزيلوفا، دي.، كيم، إيه.، سيكولوفيتش، أو.، وآخرون . (يناير 2020). "التوصيف فوق الجيني لبكتيريا كلوستريديوم ديفيسيل يكشف عن وجود ناقل ميثيل الحمض النووي المحفوظ الذي يتوسط عملية التبوغ والإمراض" . مجلة نيتشر مايكروبيولوجي . 5 (1): 166-180 . doi : 10.1038/s41564-019-0613-4 . PMC 6925328. PMID 31768029 .

[pmid21447282-180] شهوان ر، وونتاكال س ن، روا س (مارس 2011). "الطبيعة متعددة الأبعاد للمعلومات فوق الجينية ودورها في الأمراض". ديسكفري ميديسين . 11 (58): 233-243 . PMID 21447282 .

[pmid16009939-181] 1 2 3 فراغا إم إف، باليستار إي، باز إم إف، روبيرو إس، سيتيين إف، باليستار إم إل، وآخرون . (يوليو 2005). "الاختلافات فوق الجينية تنشأ خلال حياة التوائم المتطابقة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 102 (30): 10604-9 . Bibcode : 2005PNAS..10210604F . doi : 10.1073 / pnas.0500398102 . PMC 1174919. PMID 16009939 .

[pmid19151718-182] 1 2 كامينسكي ZA، تانغ T، وانغ SC، بتاك C، أوه GH، وونغ AH، وآخرون . (فبراير 2009). " ملامح مثيلة الحمض النووي في التوائم المتطابقة وغير المتطابقة". علم الوراثة الطبيعية . 41 (2): 240-245 . doi : 10.1038/ng.286 . PMID 19151718. S2CID 12688031 .

[183] أوكونور أ (11 مارس 2008). "الادعاء: التوائم المتطابقة لديهم حمض نووي متطابق" . نيويورك تايمز . تم الاطلاع عليه في 2 مايو 2010 .

[pmid19653134-184] باليستار إي (أغسطس 2010). " دروس في علم التخلق من التوائم: آفاق أمراض المناعة الذاتية". المراجعات السريرية في الحساسية والمناعة . 39 (1): 30-41 . doi : 10.1007/s12016-009-8168-4 . PMID 19653134. S2CID 25040280 .

[185] والاس آر جي، توومي إل سي، كوستود إم إيه، موينا إن، كومينز بي إم، مانغون إم، وآخرون (2016). "المؤشرات الحيوية التشخيصية والتنبؤية المحتملة للانحراف اللاجيني في الحيز القلبي الوعائي" . مجلة BioMed Research International . 2016 2465763. doi : 10.1155/2016/2465763 . PMC 4749768. PMID 26942189 .

[186] الوراثة المندلية على الإنترنت في الإنسان (OMIM): 105830

[pmid17121465-187] وود إيه جيه، أوكي آر جيه (نوفمبر 2006). "البصمة الجينية في الثدييات: مواضيع ناشئة ونظريات راسخة" . مجلة PLOS Genetics . 2 (11) e147. doi : 10.1371/journal.pgen.0020147 . PMC 1657038. PMID 17121465 .

[pmid2564739-188] كنول جيه إتش، نيكولز آر دي، ماجينيس آر إي، غراهام جيه إم، لالاند إم، لات إس إيه (فبراير 1989). "متلازمتا أنجلمان وبرادر-ويلي تشتركان في حذف مشترك في الكروموسوم 15، لكنهما تختلفان في الأصل الأبوي لهذا الحذف". المجلة الأمريكية لعلم الوراثة الطبية . 32 (2): 285-290 . doi : 10.1002/ajmg.1320320235 . PMID 2564739 .

[paternal-grandson-189] حفيد الشخص من جهة الأب هو ابن ابن ذلك الشخص؛ وحفيده من جهة الأم هو ابن ابنته.

[pmid16391557-190] بيمبري مي، بيغرين لو، كاتي جي، إدفينسون إس، نورثستون ك، سيوستروم إم، وآخرون . (فبراير 2006). “الاستجابات عبر الأجيال الخاصة بالجنس والذكور في البشر” . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 14 (2): 159-66 . دوى : 10.1038/sj.ejhg.5201538 . اتش دي ال : 1983/d6732a7a-ebbf-4dfc-9740-75fcc9b9934c . بميد 16391557 . أشار روبرت وينستون إلى هذه الدراسة في "محاضرة" . مؤرشفة من الأصل بتاريخ 23 مايو 2007.

[191] "نوفا | نصوص | شبح في جيناتك" . بي بي إس. 16 أكتوبر 2007. تم الاطلاع عليه في 26 يوليو 2012 .

[192] أندرسون إس جيه، فاي كيه إم، شميدت-ماكورماك جي آر، مالوفيتش إي، ملينارتشيك جي إس، إزبكي بي، وآخرون . (مايو 2016). "تأثيرات دوائية خارج الهدف تؤدي إلى تغييرات في التعبير الجيني ذات أصول فوق جينية و"شبه فوق جينية"". بحث دوائي . 107 : 229-233 . doi : 10.1016/j.phrs.2016.03.028 . PMID 27025785 .

[193] ألافيان-غافانيني أ، رويغ ج (يناير 2018). "فهم التأثيرات اللاجينية للمواد الكيميائية المسببة لاضطرابات الغدد الصماء: من الآليات إلى طرق الاختبار الجديدة" . علم الأدوية الأساسي والسريري وعلم السموم . 122 (1): 38-45 . doi : 10.1111/bcpt.12878 . PMID 28842957 .

[ReferenceB-194] كوبلان ج، شانتري إس تي، روزنبلوم إل إيه (2017). "استمرار تأثير الإجهاد في المراحل المبكرة من الحياة على الإبيجينوم: ملاحظات على الرئيسيات غير البشرية☆". وحدة مرجعية في علم الأعصاب وعلم النفس البيولوجي السلوكي . doi : 10.1016/B978-0-12-809324-5.02862-5 . ISBN 978-0-12-809324-5.

[PlominDeFries2012-195] 1 2 بلومين ر، ديفريز جيه سي، كنوبيك في إس، نيدرهيزر جيه إم (2017). علم الوراثة السلوكية ( الطبعة السابعة). دار نشر وورث. الصفحات 152-153 . ISBN 978-1-4292-4215-8.

[196] هيرد إي، مارتينسن آر إيه (مارس 2014). "الوراثة اللاجينية عبر الأجيال : خرافات وآليات" . الخلية . 157 (1): 95-109 . doi : 10.1016/j.cell.2014.02.045 . PMC 4020004. PMID 24679529 .

[Nestler-197] روبيسون إيه جيه، نيستلر إي جيه (أكتوبر 2011). " الآليات النسخية والوراثية اللاجينية للإدمان" . مجلة نيتشر ريفيوز. علم الأعصاب . 12 (11): 623-637 . doi : 10.1038/nrn3111 . PMC 3272277. PMID 21989194 .

[Cheron2021-198] شيرون ج، كيرشوف دي إكسارد أ (أغسطس 2021). "إدمان المخدرات: من المختبر إلى سرير المريض" . الطب النفسي الانتقالي . 11 (1) 424. doi : 10.1038/s41398-021-01542-0 . PMC 8361217. PMID 34385417 .

[G9a_reverses_ΔFosB_plasticity-199] Biliński P، Wojtyła A، Kapka-Skrzypczak L، Chwedorowicz R، Cyranka M، Studziński T (2012). “التنظيم اللاجيني في إدمان المخدرات”. حوليات الطب الزراعي والبيئي . 19 (3): 491-496 . بميد 23020045 .

[pmid23920159-200] فاسولر إف إم، صدري-فاكيلي جي (أبريل 2014). " آليات التوارث عبر الأجيال للسلوكيات الشبيهة بالإدمان" . علم الأعصاب . 264 : 198-206 . doi : 10.1016/j.neuroscience.2013.07.064 . PMC 3872494. PMID 23920159 .

[pmid26572641-201] يوان تي إف، لي إيه، صن إكس، أويانغ إتش، كامبوس سي، روشا إن بي، وآخرون . (نوفمبر 2016). "الوراثة عبر الأجيال للأنماط الظاهرية العصبية السلوكية الأبوية: الإجهاد، والإدمان، والشيخوخة، والأيض". علم الأحياء العصبي الجزيئي . 53 (9): 6367-6376 . doi : 10.1007/s12035-015-9526-2 . hdl : 10400.22/7331 . PMID 26572641. S2CID 25694221 .

[202] شارما إس، كيلي تي كي، جونز بي إيه (1 يناير 2010). " علم التخلق في السرطان" . التسرطن . 31 (1): 27-36 . doi : 10.1093/carcin/bgp220 . ISSN 0143-3334 . PMC 2802667. PMID 19752007 .

[203] سوراوير أ، أوبيرن كيه جيه، ريتشارد دي جيه (26 فبراير 2025). " الأدوية اللاجينية في علاج السرطان" . مراجعات السرطان والانتشار . 44 (1): 37. doi : 10.1007/s10555-025-10253-7 . ISSN 1573-7233 . PMC 11865116. PMID 40011240 .

[Verma_223–233-204] فيرما م، روجرز س، ديفي ر.ل، شولي س.د، نيلسون س، جوزيف سو ل، وآخرون . (1 فبراير 2014). "البحوث اللاجينية في علم أوبئة السرطان: الاتجاهات والفرص والتحديات" . علم أوبئة السرطان، المؤشرات الحيوية والوقاية . 23 ( 2 ) : 223-233 . doi : 10.1158 /1055-9965.EPI-13-0573 . ISSN 1055-9965 . PMC 3925982. PMID 24326628 .

[pmid20800313-205] شهوان ر، وونتاكال س ن، روا س (أكتوبر 2010). "التداخل بين المعلومات الجينية والوراثية اللاجينية من خلال نزع أمين السيتوزين". اتجاهات في علم الوراثة . 26 (10): 443-448 . doi : 10.1016/j.tig.2010.07.005 . PMID 20800313 .

[206] بادال س، هير ي ف، ماهر ل ج (سبتمبر 2015). "التأثيرات غير المضادة للمضادات الحيوية للفلوروكينولونات في خلايا الثدييات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 290 (36): 22287-97 . doi : 10.1074/jbc.M115.671222 . PMC 4571980. PMID 26205818 .

[207] ميزنتسيفا ن.ف.، يانغ ج.، كور ك.، إيافالدانو ج.، ريموند م.س.، أيزنبرغ س.أ.، وآخرون . (فبراير 2013). " مثبط ميثيل ترانسفيراز الهيستون BIX01294 يعزز القدرة القلبية لخلايا نخاع العظم" . الخلايا الجذعية والتطور . 22 (4): 654-667 . doi : 10.1089/scd.2012.0181 . PMC 3564468. PMID 22994322 .

[208] يانغ جيه، وكور كيه، وأونغ إل إل، وإيزنبرغ سي إيه، وإيزنبرغ إل إم (2015). "تثبيط إنزيم ميثيل ترانسفيراز الهيستون G9a يحوّل الخلايا الجذعية اللحمية المتوسطة لنخاع العظم إلى خلايا سلفية قلبية مؤهلة" . مجلة الخلايا الجذعية الدولية . 2015 270428. doi : 10.1155/2015/270428 . PMC 4454756. PMID 26089912 .

[209] مولر إس، سينديكوبوابو إف، كانييك تي، لافون أ، فيرسيني أ، لومبارد ب، وآخرون . (أكتوبر 2020). "ينظم CD44 اللدونة اللاجينية عن طريق التوسط في الالتقام الخلوي للحديد" . كيمياء الطبيعة . 12 (10): 929– 938. بيب كود : 2020NatCh..12..929M . دوى : 10.1038/s41557-020-0513-5 . بمك 7612580 . بميد 32747755 .

[210] سولير إس، مولر إس، كانيك تي، فيرسيني أ، مانسارت أ، سينديكوبوابو إف، وآخرون . (مايو 2023). "مسار إشارات النحاس القابل للتخدير والذي يؤدي إلى الالتهاب" . طبيعة . 617 (7960): 386–394 . بيب كود : 2023Natur.617..386S . دوى : 10.1038/s41586-023-06017-4 . بمك 10131557 . بميد 37100912 .

[211] ليو ن، بان ت (يناير 2015). " علم التخلق الجيني للرنا" . البحوث الانتقالية . 165 (1): 28-35 . doi : 10.1016/j.trsl.2014.04.003 . PMC 4190089. PMID 24768686 .

[212] رونغ د، صن غ، وو ف، تشنغ ي، صن غ، جيانغ و، وآخرون . (سبتمبر 2021). " علم التخلق: أدوار وآثار تعديلات الحمض النووي الريبوزي غير المشفر في السرطانات البشرية" . العلاج الجزيئي. الأحماض النووية . 25 : 67-82 . doi : 10.1016/j.omtn.2021.04.021 . PMC 8217334. PMID 34188972. S2CID 235558945 .

[213] شين هـ، تشوي و.ل، ليم ج.ي، هوه ج.هـ (مارس 2022). "تعديل الإبيجينوم: التلاعب الموجه بالتعديلات الإبيجينية في النباتات". الجينات وعلم الجينوم . 44 (3): 307-315 . doi : 10.1007/s13258-021-01199-5 . PMID 35000141. S2CID 245848779 .

[Hawe_2022-214] هاوي جيه إس ، ويلسون آر، شميد كيه تي ، تشو إل، لاكشمانان إل إن، لين بي سي، وآخرون . ( يناير 2022). " التنوع الجيني المؤثر على مثيلة الحمض النووي يوفر رؤى حول الآليات الجزيئية التي تنظم الوظيفة الجينومية" . علم الوراثة الطبيعية . 54 (1): 18-29 . doi : 10.1038/s41588-021-00969-x . PMC 7617265. PMID 34980917. S2CID 245654240. مؤرشف من الأصل في 29 أكتوبر 2022. تم الاسترجاع في 20 يناير 2023 .

[215] لي إس تي، فينغ إم، وي واي، لي زد، تشياو واي، غوان بي، وآخرون . (يوليو 2013). "يُفرط التعبير عن فوسفاتاز التيروزين البروتيني UBASH3B في سرطان الثدي ثلاثي السلبية، ويعزز الغزو والانتشار" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 110 (27): 11121-11126 . Bibcode : 2013PNAS..11011121L . doi : 10.1073/pnas.1300873110 . PMC 3704014. PMID 23784775 .

[216] ينغو إل، سيدورينكو جيه، كيمبر كي إي، تشنغ زد، وود إيه آر، ويدون إم إن، وآخرون . (أكتوبر 2018). "تحليل تجميعي لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم للطول ومؤشر كتلة الجسم في حوالي 700000 فرد من أصول أوروبية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 27 (20): 3641-3649 . doi : 10.1093/hmg/ddy271 . PMC 6488973. PMID 30124842 .

[217] بوليت إس إل، ستونمان سي، موريس إيه بي، وود إيه آر، غلاستونبري سي إيه، تيريل جيه، وآخرون . (يناير 2019). "تحليل تجميعي لدراسات الارتباط على مستوى الجينوم لتوزيع الدهون في الجسم لدى 694649 فردًا من أصول أوروبية" . علم الوراثة الجزيئية البشرية . 28 (1): 166-174 . doi : 10.1093/hmg/ddy327 . PMC 6298238. PMID 30239722 .

[218] تشو ز، غو ي، شي هـ، ليو سي إل، بانغانيان آر إيه، تشونغ دبليو، وآخرون . (فبراير 2020). "روابط جينية وتجريبية مشتركة بين سمات مرتبطة بالسمنة وأنواع فرعية من الربو في بنك البيانات الحيوية في المملكة المتحدة" . مجلة الحساسية والمناعة السريرية . 145 (2): 537-549 . doi : 10.1016/j.jaci.2019.09.035 . PMC 7010560. PMID 31669095 .

[219] ريتشاردسون تي جي، ساندرسون إي، بالمر تي إم، آلا-كوربيلا إم، فيرنس بي إيه، ديفي سميث جي، وآخرون . (مارس 2020). "تقييم العلاقة بين دهون البروتينات الدهنية والبروتينات الشحمية في الدورة الدموية مع خطر الإصابة بأمراض القلب التاجية: تحليل عشوائي مندلي متعدد المتغيرات" . مجلة PLOS Medicine . 17 (3) e1003062. doi : 10.1371/journal.pmed.1003062 . PMC 7089422. PMID 32203549 .

[220] كونيتشنا ج، سانشيز ج، بالو م، بيكو س، بالو أ (مارس 2015). "المؤشرات الحيوية المبكرة القائمة على النسخ الجيني لخلايا الدم للآثار الضارة لتقييد السعرات الحرارية أثناء الحمل وإمكانية عكسها عن طريق مكملات اللبتين" . التقارير العلمية . 5 (1) 9088. Bibcode : 2015NatSR...5.9088K . doi : 10.1038/srep09088 . PMC 4357898. PMID 25766068 .

[221] أوكادا، واي (نوفمبر 2014). "من عصر تحليل الجينوم إلى عصر اكتشاف الأدوية الجينومية: مثال رائد لالتهاب المفاصل الروماتويدي". علم الوراثة السريرية . 86 (5): 432-440 . doi : 10.1111/cge.12465 . PMID 25060537. S2CID 8499325 .

[222] هي ز، تشانغ ر، جيانغ ف، تشانغ هـ، تشاو أ، شو ب، وآخرون . (أغسطس 2018). " ترتبط التغيرات الجينية في FADS1-FADS2 باستقلاب الأحماض الدهنية من خلال تغييرات في مثيلة الحمض النووي والتعبير الجيني" . علم التخلق السريري . 10 (1) 113. doi : 10.1186/s13148-018-0545-5 . PMC 6114248. PMID 30157936 .

[223] غوان وآخرون (يونيو 2014). "دراسة ارتباط على مستوى الجينوم للأحماض الدهنية المتعددة غير المشبعة N6 في بلازما الدم ضمن مجموعات أبحاث القلب والشيخوخة في اتحاد علم الأوبئة الجينومي" . سيركوليشن: علم الوراثة القلبية الوعائية . 7 (3): 321-331 . doi : 10.1161 / circgenetics.113.000208 . PMC 4123862. PMID 24823311 .

[pmid24816252-224] شين إس واي، فومان إي بي، بيترسن إيه كيه، كرومسيك جيه، سانتوس آر، هوانغ جيه، وآخرون (يونيو 2014). " أطلس التأثيرات الجينية على مستقلبات الدم البشري" . علم الوراثة الطبيعية . 46 (6): 543-550 . Bibcode : 2014NaGen..46..543S . doi : 10.1038/ng.2982 . PMC 4064254. PMID 24816252 .

[225] أستل دبليو جيه، فريق دراسة الارتباط الجيني على مستوى الجينوم لصفات الدم في المملكة المتحدة، مشروع كامبريدج بلوبرينت للجينوم فوق الجيني (2 ديسمبر 2016). "دراسة ارتباط جيني على مستوى الجينوم لـ 170,000 فرد تحدد آلاف الأليلات التي تؤثر على صفات خلايا الدم، والعديد منها موجود في مُحسِّنات فائقة تحدد هوية الخلية". مجلة الدم . 128 (22): 2652. doi : 10.1182/blood.v128.22.2652.2652 . ISSN 0006-4971 .

[226] كامات إم إيه، بلاكشو جيه إيه، يونغ آر، سوريندران بي، بورغيس إس، دانيش جيه، وآخرون . (نوفمبر 2019). "PhenoScanner V2: أداة موسعة للبحث عن ارتباطات النمط الجيني بالنمط الظاهري البشري" . المعلوماتية الحيوية . 35 (22): 4851-4853 . doi : 10.1093/bioinformatics/btz469 . PMC 6853652. PMID 31233103 .

[227] غورسكي د (4 فبراير 2013). "علم التخلق: لا يعني ما يعتقده الدجالون" . الطب القائم على العلم .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[

[

[

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[

[

[

[

[

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[

[

[

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[

[

[

[

،

[ 90 ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ 93 ]

[

[ 95 ]

[ 96 ]

[ 97 ]

[ 98 ]

[ 99 ]

[ 100 ]

اللغة	العربية (RTL)
روابط موسوعية	30 رابطاً
المصدر الأصلي	ويكيبيديا ↗