تصنيف الفيروسات

تصنيف الفيروسات

تصنيف الفيروسات هو عملية تسمية الفيروسات ووضعها في نظام تصنيفي مماثل لأنظمة التصنيف المستخدمة للكائنات الخلوية .

يتم تصنيف الفيروسات حسب الخصائص الظاهرية ، مثل الشكل ، ونوع الحمض النووي ، وطريقة التكاثر، والكائنات المضيفة ، ونوع المرض الذي تسببه. التصنيف التصنيفي الرسمي للفيروسات هو مسؤولية نظام اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV)، على الرغم من أنه يمكن استخدام نظام تصنيف بالتيمور لوضع الفيروسات في واحدة من سبع مجموعات بناءً على طريقة تخليق mRNA. تحدد اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات اتفاقيات التسمية المحددة وإرشادات التصنيف الإضافية.

في عام 2021، قامت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات بتغيير الكود الدولي لتصنيف الفيروسات والتسمية (ICVCN) لإلزام تنسيق ثنائي (جنس || ||نوع) لتسمية الأنواع الفيروسية الجديدة على غرار ذلك المستخدم للكائنات الخلوية؛ يتم تحويل أسماء الأنواع التي تم صياغتها قبل عام 2021 تدريجيًا إلى التنسيق الجديد، وهي العملية المخطط لها للانتهاء بحلول نهاية عام 2023. [ بحاجة لتحديث ]

اعتبارًا من عام 2022، أدرج تصنيف ICTV 11273 نوعًا من الفيروسات المسماة (بما في ذلك بعضها مصنف على أنه فيروسات قمرية وبعضها الآخر فيروسات) في 2818 جنسًا و264 عائلة و72 رتبة و40 فئة و17 شعبة و9 ممالك و6 عوالم. [1] ومع ذلك، فإن عدد الفيروسات المسماة يتجاوز بشكل كبير عدد أنواع الفيروسات المسماة لأنه، على النقيض من أنظمة التصنيف المستخدمة في أماكن أخرى في علم الأحياء، فإن "نوع" الفيروس هو اسم جماعي لمجموعة من الفيروسات (المرتبطة على الأرجح) التي تشترك في بعض السمات المشتركة (انظر أدناه). أيضًا، لا يعادل استخدام مصطلح "المملكة" في علم الفيروسات استخدامه في المجموعات البيولوجية الأخرى، حيث يعكس مجموعات عالية المستوى تفصل بين أنواع مختلفة تمامًا من الكائنات الحية (انظر المملكة (علم الأحياء) ).

التعاريف

تعريف الفيروس

تم قبول التعريف الرسمي الحالي لـ "الفيروس" من قبل اللجنة التنفيذية لـ ICTV في نوفمبر 2020 وتم التصديق عليه في مارس 2021، وهو على النحو التالي: [2]

تُعرَّف الفيروسات بالمعنى الدقيق للكلمة من قبل اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات على أنها نوع من الجينات الوراثية متعددة الصبغيات التي تشفر بروتينًا واحدًا على الأقل وهو مكون رئيسي للفيروس الذي يغلف الحمض النووي للجينات الوراثية متعددة الصبغيات المعنية وبالتالي الجين الذي يشفر بروتين الفيروس الرئيسي نفسه أو الجينات الوراثية متعددة الصبغيات التي يمكن إثبات أنها أعضاء في خط من السلالة التطورية لمثل هذه الكيانات التي تشفر بروتين الفيروس الرئيسي. يجب تصنيف أي مجموعة أحادية النمط من الجينات الوراثية متعددة الصبغيات التي تنشأ من سلف يشفر بروتين الفيروس كمجموعة من الفيروسات.

تعريف الأنواع

تشكل الأنواع الأساس لأي نظام تصنيف بيولوجي. قبل عام 1982، كان يُعتقد أن الفيروسات لا يمكن جعلها تتناسب مع مفهوم إرنست ماير التكاثري للأنواع، وبالتالي فهي غير قابلة لمثل هذا العلاج. في عام 1982، بدأت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات في تعريف النوع على أنه "مجموعة من السلالات" ذات صفات تعريف فريدة. في عام 1991، تم تبني المبدأ الأكثر تحديدًا بأن نوع الفيروس هو فئة متعددة الأنواع من الفيروسات تشكل سلالة متكاثرة وتحتل مكانة بيئية معينة. [3]

اعتبارًا من عام 2021 (أحدث إصدار من ICVCN)، ينص تعريف ICTV للأنواع على ما يلي: "النوع هو أدنى مستوى تصنيفي في التسلسل الهرمي المعتمد من قبل ICTV. النوع هو مجموعة أحادية النمط من العناصر الجينية المتنقلة (MGEs ) التي يمكن تمييز خصائصها عن خصائص الأنواع الأخرى من خلال معايير متعددة"، مع التعليق "يجب أن تحدد مجموعة الدراسة المناسبة المعايير التي يتم من خلالها تمييز الأنواع المختلفة داخل جنس ما. قد تشمل هذه المعايير، على سبيل المثال لا الحصر، نطاق المضيف الطبيعي والتجريبي، وتوجه الخلايا والأنسجة، والقدرة على إحداث الأمراض، وخصوصية النواقل، والقدرة على توليد المستضدات، ودرجة صلة الجينومات أو الجينات. يجب نشر المعايير المستخدمة في القسم ذي الصلة من تقرير ICTV ومراجعتها بشكل دوري من قبل مجموعة الدراسة المناسبة." [4]

أقل من مرتبة الأنواع (الفيروسات المسماة / سلالات الفيروسات / العزلات)

يوجد العديد من الفيروسات التي تحمل أسماء فردية (يشار إليها أحيانًا باسم "سلالات الفيروسات") في مرتبة أقل من رتبة أنواع الفيروسات . يعطي ICVCN أمثلة على فيروس موزاييك البازلاء السوداء وفيروس خطوط الفول السوداني، وكلاهما مصنف في نوع فيروس موزاييك الفول الشائع ، وهذا الأخير عضو في جنس Potyvirus الذي سيحصل في الوقت المناسب على اسم ثنائي مثل Potyvirus [species...] . كمثال آخر، فإن فيروس SARS-CoV-1 ، الذي يسبب متلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة ( سارس ) يختلف عن فيروس SARS-CoV-2 ، سبب جائحة كوفيد-19 ، لكن كلاهما مصنف ضمن نفس نوع الفيروس، وهو عضو في جنس Betacoronavirus المعروف حاليًا باسم فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة والذي سيحصل أيضًا على اسم ثنائي في الوقت المناسب وفقًا لولاية ICTV لعام 2021. كما هو موضح في القسم 3.4 من ICVCN، لا تخضع أسماء [وتعريفات] الكائنات الحية التي تقع تحت رتبة الأنواع لـ ICTV؛ "إن تسمية مثل هذه الكيانات ليست مسؤولية ICTV بل مسؤولية مجموعات متخصصة دولية. وتقع على عاتق مجموعات دراسة ICTV مسؤولية النظر في أفضل طريقة لتصنيف هذه الكيانات إلى أنواع". [4] باستخدام المثال المذكور أعلاه، تم تسمية الفيروس المسبب لجائحة COVID-19 باسم "SARS-CoV-2" من قبل مجموعة دراسة الفيروسات التاجية (CSG) التابعة للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات في عام 2020؛ في نفس المنشور، أوصت مجموعة الدراسة هذه باتفاقية تسمية لعزلات معينة من هذا الفيروس "تشبه التنسيقات المستخدمة لعزل فيروسات كورونا الطيور والفيروسات الخيطية وفيروس الإنفلونزا" بتنسيق virus/host/location/isolate/date، مع ذكر مثال باسم "SARS-CoV-2/human/Wuhan/X1/2019". [5]

تصنيف ICTV

مقارنة تصنيف الفيروسات لعامي 1991 و2018ب حسب ICTV

بدأت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات في وضع وتنفيذ قواعد تسمية وتصنيف الفيروسات في أوائل سبعينيات القرن العشرين، وهو جهد مستمر حتى الوقت الحاضر. تعد اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات الهيئة الوحيدة المكلفة من قبل الاتحاد الدولي لجمعيات علم الأحياء الدقيقة بمهمة تطوير وتنقيح والحفاظ على تصنيف عالمي للفيروسات، باتباع الأساليب المنصوص عليها في المدونة الدولية لتصنيف الفيروسات وتسميتها. [4] [6] يشترك النظام في العديد من الميزات مع نظام تصنيف الكائنات الخلوية ، مثل بنية التصنيف . ومع ذلك، توجد بعض الاختلافات، مثل الاستخدام العالمي للخط المائل لجميع الأسماء التصنيفية، على عكس المدونة الدولية لتسمية الطحالب والفطريات والنباتات والمدونة الدولية لتسمية علم الحيوان .

يبدأ تصنيف الفيروسات على مستوى العالم ويستمر على النحو التالي، مع اللواحق التصنيفية بين قوسين: [4]

العالَم ( -viria )
عالم فرعي ( -vira )
المملكة ( -virae )
مملكة فرعية ( -virites )
شعبة ( -viricota )
شعبة فرعية ( -viricotina )
الصف ( -viricetes )
الفئة الفرعية ( -viricetidae )
الطلب ( -virales )
رتبة فرعية ( -virineae )
العائلة ( -viridae )
الفصيلة الفرعية ( -virinae )
الجنس ( -فيروس )
الجنس الفرعي ( -virus )
صِنف

بالتوازي مع نظام التسمية الثنائية المعتمد في الأنواع الخلوية، أصدرت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات مؤخرًا (2021) أمرًا بتسمية أنواع الفيروسات الجديدة باستخدام تنسيق ثنائي ( Genus genres ، على سبيل المثال Betacoronavirus pandemicum )، وأن يتم استبدال أسماء أنواع الفيروسات الموجودة مسبقًا تدريجيًا بأسماء جديدة بتنسيق ثنائي. [7] ذكرت مراجعة منتصف عام 2023 لحالة هذا التحول: "... عدد كبير من المقترحات [بشأن تسمية الفيروسات، المقدمة إلى اللجنة التنفيذية للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (EC) للنظر فيها] أعادت تسمية الأنواع الموجودة للامتثال لتنسيق التسمية الثنائية المفروض مؤخرًا. ونتيجة لذلك، أصبح لدى 8982 نوعًا من أصل 11273 نوعًا حاليًا (80٪) أسماء ثنائية. وستنتهي العملية في عام 2023، مع إعادة تسمية الأنواع المتبقية البالغ عددها 2291 نوعًا." [8]

اعتبارًا من عام 2021، سيتم استخدام جميع مستويات الأصناف باستثناء العالم الفرعي والمملكة الفرعية والفئة الفرعية. ستة عوالم، فئة incertae sedis واحدة، 22 عائلة incertae sedis ، واثنين من أجناس incertae sedis معترف بها: [9]

العوالم :

فئات سيديس إنسيرتاي :

عائلات إنسيرتاي سيديس :

أجناس السديس :

تصنيف الفيروسات على أساس البنية

وقد اقترح البعض أن التشابه في تجميع وتركيب الفيروسات الملحوظ لدى مجموعات فيروسية معينة تصيب العوائل من مجالات مختلفة من الحياة (على سبيل المثال، الفيروسات التكتي البكتيرية والفيروسات الغدية حقيقية النواة أو الفيروسات الكادوفيرالية بدائية النواة والفيروسات الهربسية حقيقية النواة) يعكس علاقة تطورية بين هذه الفيروسات. [10] لذلك، فقد اقترح البعض استخدام العلاقة البنيوية بين الفيروسات كأساس لتحديد تصنيفات أعلى مستوى - سلالات فيروسية قائمة على البنية - والتي يمكن أن تكمل مخطط تصنيف ICTV لعام 2010. [11]

أضافت اللجنة الدولية لتصنيف الكائنات الحية تدريجيًا العديد من التصنيفات ذات المستوى الأعلى باستخدام العلاقات في طيات البروتين. يتم تعريف جميع العوالم الأربعة المحددة في إصدار عام 2019 من خلال وجود بروتين من عائلة هيكلية معينة. [12]

تصنيف بالتيمور

يعتمد تصنيف بالتيمور للفيروسات على طريقة تخليق mRNA الفيروسي

تصنيف بالتيمور (تم تعريفه لأول مرة في عام 1971) هو نظام تصنيف يضع الفيروسات في واحدة من سبع مجموعات اعتمادًا على مزيج من حمضها النووي ( DNA أو RNA ) وتسلسلها (سلسلة مفردة أو سلسلة مزدوجة) والمعنى وطريقة التكاثر . [ 13] سميت هذه المجموعات على اسم ديفيد بالتيمور ، عالم الأحياء الحائز على جائزة نوبل ، ويتم تحديدها بالأرقام الرومانية . يتم تحديد التصنيفات الأخرى من خلال المرض الذي يسببه الفيروس أو مورفولوجيته ، ولا يعد أي منهما مرضيًا بسبب الفيروسات المختلفة التي تسبب نفس المرض أو تبدو متشابهة جدًا. بالإضافة إلى ذلك ، غالبًا ما يكون من الصعب تحديد الهياكل الفيروسية تحت المجهر. يعني تصنيف الفيروسات وفقًا لجينومها أن تلك الموجودة في فئة معينة ستتصرف جميعًا بطريقة مماثلة ، مما يوفر بعض المؤشرات حول كيفية المضي قدمًا في المزيد من البحث. يمكن وضع الفيروسات في واحدة من المجموعات السبع التالية: [14]

تصور المجموعات السبع للفيروسات حسب تصنيف بالتيمور

فيروسات الحمض النووي

الفيروسات التي تحتوي على جينوم DNA ، باستثناء فيروسات النسخ العكسي للحمض النووي، هي أعضاء في ثلاثة من العوالم الفيروسية الأربعة المعترف بها : Duplodnaviria و Monodnaviria و Varidnaviria . ولكن رتبة Ligamenvirales incertae sedis ، والعديد من عائلات وأجناس incertae sedis الأخرى ، تُستخدم أيضًا لتصنيف فيروسات الحمض النووي. تتكون مجالات Duplodnaviria و Varidnaviria من فيروسات الحمض النووي مزدوجة السلسلة؛ فيروسات الحمض النووي مزدوجة السلسلة الأخرى هي incertae sedis . يتكون مجال Monodnaviria من فيروسات الحمض النووي أحادية السلسلة التي تشفر عمومًا نوكلياز HUH ؛ فيروسات الحمض النووي أحادية السلسلة الأخرى هي incertae sedis . [15]

  • المجموعة الأولى : تمتلك الفيروسات حمض نووي مزدوج السلسلة. توجد هنا الفيروسات المسببة لجدري الماء والهربس .
  • المجموعة الثانية : الفيروسات تمتلك الحمض النووي أحادي السلسلة.
أمثلة على فيروسات الحمض النووي
عائلة الفيروسات أمثلة (أسماء شائعة) فيريون
عارٍ/مغلف

تناسق الغلاف
نوع الحمض النووي مجموعة
1. الفيروسات الغدية فيروس التهاب الكبد الكلبي ، بعض أنواع نزلات البرد الشائعة عاري متعدد الوجوه د س أنا
2. فيروسات البابوفا فيروس JC ، فيروس الورم الحليمي البشري عاري متعدد الوجوه ds دائرية أنا
3. فيروسات بارفو فيروس بارفو بشري B19 ، فيروس بارفو كلبي عاري متعدد الوجوه س س الثاني
4. فيروسات الهربس فيروس الهربس البسيط ، فيروس الحماق النطاقي ، الفيروس المضخم للخلايا ، فيروس إبشتاين بار مُغلف متعدد الوجوه د س أنا
5. فيروسات الجدري فيروس الجدري ، جدري البقر ، فيروس الورم المخاطي ، جدري القرود ، فيروس الجدري معاطف معقدة معقد د س أنا
6. الفيروسات الحلقية فيروس عزم الدوران عاري متعدد الوجوه ss دائرية الثاني
7. بلوليبوفيريدي فيروس الورم الحليمي البشري 1 ، فيروس الورم الحليمي البشري 1 مُغلف ss/ds خطي/دائري الأول/الثاني

فيروسات الحمض النووي الريبوزي

جميع الفيروسات التي تحتوي على جينوم RNA ، والتي تشفر بوليميراز RNA المعتمد على RNA (RdRp)، هي أعضاء في مملكة Orthornavirae ، ضمن عالم Riboviria . [16]

  • المجموعة الثالثة : الفيروسات التي تمتلك جينومات RNA مزدوجة السلسلة، على سبيل المثال الفيروس الروتا .
  • المجموعة الرابعة : تمتلك الفيروسات جينومات RNA أحادية السلسلة ذات اتجاه إيجابي. يوجد العديد من الفيروسات المعروفة في هذه المجموعة، بما في ذلك فيروسات بيكورنا (وهي عائلة من الفيروسات تضم فيروسات معروفة مثل فيروس التهاب الكبد أ، والفيروسات المعوية، وفيروسات الأنف، وفيروس شلل الأطفال، وفيروس الحمى القلاعية)، وفيروس السارس ، وفيروس التهاب الكبد سي ، وفيروس الحمى الصفراء ، وفيروس الحصبة الألمانية .
  • المجموعة الخامسة : تمتلك الفيروسات جينومات RNA أحادية السلسلة ذات الاتجاه السلبي. فيروسات الإيبولا وماربورغ أعضاء معروفة في هذه المجموعة، إلى جانب فيروس الإنفلونزا والحصبة والنكاف وداء الكلب .
أمثلة على الفيروسات ذات الحمض النووي الريبوزي
عائلة الفيروسات أمثلة (أسماء شائعة) الغلاف
العاري/المغلف

تناسق الغلاف
نوع الحمض النووي مجموعة
1. فيروسات ريوفيروس فيروس الروتا ، فيروس الريوفيروس عاري متعدد الوجوه د س ثالثا
2. الفيروسات البيكورناوية الفيروس المعوي ، الفيروس الأنفي ، الفيروس الكبدي ، الفيروس القلبي ، الفيروس القلاعي ، فيروس شلل الأطفال، الفيروس الباريكو ، الفيروس الإربوي ، الفيروس الكوبي ، الفيروس التسكوي ، فيروس كوكساكي عاري متعدد الوجوه س س الرابع
3. كاليسيفيريدي فيروس نورووك عاري متعدد الوجوه س س الرابع
4. الفيروسات الطوخية التهاب الدماغ الخيلي الشرقي ، شيكونغونيا مُغلف متعدد الوجوه س س الرابع
5. الفيروسات الرملية فيروس التهاب السحايا والمشيمة الليمفاوي ، حمى لاسا مُغلف معقد س س(-) الخامس
6. الفيروسات الفلافيرية فيروس حمى الضنك ، فيروس التهاب الكبد الوبائي سي ، فيروس الحمى الصفراء ، فيروس زيكا مُغلف متعدد الوجوه س س الرابع
7. الفيروسات المخاطية فيروس الأنفلونزا أ ، فيروس الأنفلونزا ب ، فيروس الأنفلونزا ج ، فيروس إيزافيروس ، فيروس ثوجوتوف مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
8. الفيروسات المخاطية فيروس الحصبة ، فيروس النكاف ، الفيروس المخلوي التنفسي ، فيروس طاعون البقر ، فيروس حمى الكلاب مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
9. فيروسات بونيا فيروس التهاب الدماغ الكاليفورني ، لا يوجد اسم للفيروس مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
10. فيروسات رابدوفيريدي فيروس داء الكلب ، التهاب الحويصلات الفموية مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
11. الفيروسات الخيطية فيروس إيبولا ، فيروس ماربورغ مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
12. الفيروسات التاجية فيروس كورونا البشري 229E ، وفيروس كورونا البشري NL63 ، وفيروس كورونا البشري OC43 ، وفيروس كورونا البشري HKU1 ، وفيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية ، وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة ، وفيروس كورونا المسبب لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة 2 مُغلف حلزوني س س الرابع
13. الفيروسات النجمية الفيروس النجمي عاري متعدد الوجوه س س الرابع
14. الفيروسات البورنوفيدية فيروس مرض بورنا مُغلف حلزوني س س(-) الخامس
15. الفيروسات الشريانية فيروس الشرايين الخيلية ، فيروس التهاب الشرايين الخيلية مُغلف متعدد الوجوه س س الرابع
16. الفيروسات الكبدية فيروس التهاب الكبد E عاري متعدد الوجوه س س الرابع

الفيروسات النسخية العكسية

جميع الفيروسات التي تشفر النسخ العكسي (المعروف أيضًا باسم RT أو بوليميراز الحمض النووي المعتمد على الحمض النووي الريبي) هي أعضاء في فئة Revtraviricetes ، ضمن شعبة Arterviricota ، ومملكة Pararnavirae ، وعالم Riboviria . تحتوي فئة Blubervirales على عائلة واحدة من فيروسات النسخ العكسي للحمض النووي (النسخ العكسي)؛ جميع فيروسات النسخ العكسي الأخرى هي أعضاء في فئة Ortervirales . [17]

أمثلة على الفيروسات النسخية العكسية
عائلة الفيروسات أمثلة (أسماء شائعة) الغلاف
العاري/المغلف

تناسق الغلاف
نوع الحمض النووي مجموعة
1. الفيروسات الرجعية فيروس العوز المناعي البشري مُغلف الحمض النووي الريبوزي ثنائي الترابط السادس
2. الفيروسات القلوية فيروس الكوليموفيروس ، فيروس براعم الكاكاو (CSSV) عاري سابعا
3. الفيروسات الكبدية فيروس التهاب الكبد B مُغلف متعدد الوجوه دائرية، جزئيا ds سابعا

الأنظمة التاريخية

تصنيف هولمز

استخدم هولمز (1948) تصنيف لينيوس مع تسمية ثنائية لتصنيف الفيروسات إلى ثلاث مجموعات تحت رتبة واحدة، الفيروسات. وهي مرتبة على النحو التالي:

لم يتم قبول هذا النظام من قبل الآخرين بسبب إهماله للتشابهات الصرفية. [18]

العوامل الفرعية الفيروسية

العوامل المعدية أصغر من الفيروسات ولا تمتلك سوى بعض خصائصها. [19] [20] منذ عام 2015، سمحت اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات بتصنيفها بطريقة مماثلة للفيروسات. [21]

الفيرويدات والعوامل المعتمدة على الفيروسات

الفيرويدات

الأقمار الصناعية

تعتمد الفيروسات الفرعية على العدوى المشتركة لخلية مضيفة بفيروس مساعد من أجل التكاثر الإنتاجي. تحتوي أحماضها النووية على تسلسلات نيوكليوتيدية مختلفة بشكل كبير عن الفيروس المساعد أو المضيف. عندما يقوم عامل فيروسي فرعي بتشفير البروتين المغلف الذي يتم تغليفه فيه، يُطلق عليه بعد ذلك اسم الفيروس الفرعي.

تشبه الأحماض النووية الشبيهة بالأقمار الصناعية الأحماض النووية القمرية، حيث تتكاثر بمساعدة الفيروسات المساعدة. ومع ذلك، فإنها تختلف في قدرتها على ترميز الوظائف التي يمكن أن تساهم في نجاح الفيروسات المساعدة؛ وفي حين يُنظر إليها أحيانًا على أنها عناصر جينومية للفيروسات المساعدة، إلا أنها لا توجد دائمًا داخل الفيروسات المساعدة. [19]

الجسيمات المتداخلة المعيبة

الجسيمات المتداخلة المعيبة هي فيروسات معيبة فقدت قدرتها على التكاثر إلا في وجود فيروس مساعد، وهو الفيروس الأصلي عادةً. ويمكنها أيضًا أن تتداخل مع الفيروس المساعد.

  • الجسيمات المتداخلة المعيبة (RNA)
  • الجسيمات المتداخلة المعيبة (DNA)

الفيروسات

الفيروسات هي فئة متعددة السلالات من العناصر الفيروسية الذاتية . في وقت ما من تطورها، أصبحت "مدجنة" من قبل مضيفها كجزء أساسي من دورة حياة المضيف. المثال النموذجي هو أعضاء Polydnaviriformidae (متعددة السلالات أيضًا) ، والتي تستخدمها الدبابير لإرسال قطع من الحمض النووي الذي يضعف المناعة إلى الفريسة عن طريق تعبئتها في جزيئات تشبه الفيروسات . الأعضاء الآخرون هم ما يسمى بعوامل نقل الجينات (GTAs) الموجودة بين بدائيات النوى. تشبه جزيئات GTA العاثيات الذيلية ، ولكنها أصغر وتحمل في الغالب قطعًا عشوائية من الحمض النووي للمضيف. يتم إنتاج GTAs بواسطة المضيف في أوقات الإجهاد؛ يؤدي إطلاق GTAs إلى قتل الخلية المضيفة، ولكنه يسمح لقطع من مادتها الوراثية بالعيش في بكتيريا أخرى، عادةً من نفس النوع. [25] نشأت المجموعات الثلاث المعروفة من GTAs، Rhodogtaviriformidae و Bartogtaviriformidae و Brachygtaviriformidae ، بشكل مستقل من أجزاء مختلفة من شجرة عائلة Caudoviricetes . [26]

انظر أيضا

ملحوظات

  1. ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2022 v3". ictv.global . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 5 يناير 2024 .
  2. ^ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Kuhn JH (2021-09-01). "الفيروسات التي يتم تحديدها من خلال موضع الغلاف الفيروسي داخل حيز النسخ". مراجعات علم الأحياء الدقيقة وعلم الأحياء الجزيئي . 85 (4): e0019320. doi : 10.1128/MMBR.00193-20. PMC 8483706. PMID  34468181. 
  3. ^ Alimpiev E (15 مارس 2019). إعادة التفكير في مفهوم أنواع الفيروسات (PDF) . مؤرشف من الأصل (PDF) في 22 سبتمبر 2020.
  4. ^ abcd "المدونة الدولية لتصنيف وتسمية الفيروسات (ICVCN)، طبعة مارس 2021". اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 6 يناير 2024 .
  5. ^ مجموعة دراسة الفيروسات التاجية التابعة للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (أبريل 2020). "نوع فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة: تصنيف 2019-nCoV وتسميته SARS-CoV-2". علم الأحياء الدقيقة الطبيعي . 5 (4): 536-544. doi :10.1038/s41564-020-0695-z. PMC 7095448. PMID  32123347 . 
  6. ^ Lefkowitz EJ, Dempsey DM, Hendrickson RC, Orton RJ, Siddell SG, Smith DB (يناير 2018). "تصنيف الفيروسات: قاعدة بيانات اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV)". أبحاث الأحماض النووية . 46 (D1): D708–D717. doi :10.1093/nar/gkx932. PMC 5753373. PMID  29040670 . 
  7. ^ Walker PJ, Siddell SG, Lefkowitz EJ, et al. (6 يوليو 2021). "التغييرات التي تم إجراؤها على تصنيف الفيروسات وعلى الكود الدولي لتصنيف الفيروسات والتسمية التي أقرتها اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (2021)". أرشيف علم الفيروسات . 168 (9): 2633-2648. doi :10.1007/s00705-021-05156-1. hdl : 10362/134245 . PMID  34231026.
  8. ^ Zerbini F, Siddell S, Lefkowitz E, et al. (10 يونيو 2023). "التغييرات على تصنيف الفيروسات وقوانين ICTV التي أقرتها اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (2023)". أرشيف علم الفيروسات . 168 (رقم المقال 175): 175. doi :10.1007/s00705-023-05797-4. PMC 10861154. PMID  37296227 . 
  9. ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2021". ictv.global . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 26 يناير 2023 .
  10. ^ Bamford DH (مايو 2003). "هل تشكل الفيروسات سلالات عبر مجالات مختلفة من الحياة؟". البحث في علم الأحياء الدقيقة . 154 (4): 231-6. doi : 10.1016/S0923-2508(03)00065-2 . PMID  12798226.
  11. ^ Krupovič M, Bamford DH (ديسمبر 2010). "Order to the viral universe". مجلة علم الفيروسات . 84 (24): 12476–9. doi :10.1128/JVI.01489-10. PMC 3004316. PMID  20926569 . 
  12. ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2019". talk.ictvonline.org . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 26 أبريل 2020 .
  13. ^ "9.3B: تصنيف فيروس بالتيمور". Biology LibreTexts . 2017-06-24 . تم الاسترجاع في 2024-09-11 .
  14. ^ "تصنيف بالتيمور للفيروسات". www.web-books.com . تم الاسترجاع في 2023-01-02 .
  15. ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2019". talk.ictvonline.org . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 26 أبريل 2020 .
  16. ^ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2019". talk.ictvonline.org . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاسترجاع في 25 أبريل 2020 .
  17. ^ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH. "اقتراح: إنشاء إطار تصنيفي ضخم، يملأ جميع الرتب التصنيفية الرئيسية، لعالم Riboviria". اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV) . تم الاسترجاع في 2020-05-21 .{{cite web}}:CS1 maint: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين ( الرابط )
  18. ^ Kuhn JH (2020). "تصنيف الفيروسات". وحدة مرجعية في علوم الحياة . موسوعة علم الفيروسات. ص 28-37. doi :10.1016/B978-0-12-809633-8.21231-4. ISBN 978-0-12-809633-8. PMC  7157452 .
  19. ^ ab "Subviral Agents". ICTV 9th Report (2011) . International Committee on Taxonomy of Viruses. مؤرشف من الأصل في 7 يوليو 2022. تم الاسترجاع في 2020-06-15 .نسخة محدثة متزامنة مع الإصدار الحالي: "العوامل الفرعية الفيروسية". التقرير العاشر . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات. مؤرشف من الأصل في 2 يوليو 2022.
  20. ^ شتراوس جيه إتش، شتراوس إي جي (2008). "العوامل الفرعية الفيروسية". الفيروسات والأمراض البشرية . إلسيفير. ص. 345-368. doi : 10.1016/b978-0-12-373741-0.50012-x . ISBN 978-0-12-373741-0. S2CID  80872659.
  21. ^ TaxoProp 2015.002aG
  22. ^ Di Serio F, Li SF, Matoušek J, Owens RA, Pallás V, Randles JW, Sano T, Verhoeven JT, Vidalakis G, Flores R (يونيو 2020). "العائلة: Avsunviroidae". تقرير ICTV العاشر حول تصنيف الفيروسات وتسمية الأصنوفات . ICTV . تم الاسترجاع في 16 يناير 2023 .
  23. ^ Di Serio F, Owens RA, Li SF, Matoušek J, Pallás V, Randles JW, Sano T, Verhoeven JT, Vidalakis G, Flores R (نوفمبر 2020). "العائلة: Pospiviroidae". تقرير ICTV العاشر حول تصنيف الفيروسات وتسمية الأصنوفات . ICTV . تم الاسترجاع في 16 يناير 2023 .
  24. ^ Krupovic M, Kuhn JH, Fischer MG (7 أكتوبر 2015). "نظام تصنيف للفيروسات العاثية والفيروسات القمرية". أرشيف علم الفيروسات . 161 (1): 233–247. doi : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . PMID  26446887.
  25. ^ Kuhn JH, Koonin EV (3 فبراير 2023). "Viriforms-A New Category of Classifiable Virus-Derived Genetic Elements". Biomolecules . 13 ( 2): 289. doi : 10.3390/biom13020289 . PMC 9953437. PMID  36830658. 
  26. ^ Kogay R، Koppenhöfer S، Beatty JT، Kuhn JH، Lang AS، Zhaxybayeva O (2022). "التعرف الرسمي وتصنيف عوامل نقل الجينات كفيروسات". تطور الفيروسات . 8 (2): veac100. doi :10.1093/ve/veac100. PMC 9662315. PMID 36381234  . 
  • موقع ICTV على الويب محفوظ في 2017-02-03 على موقع Wayback Machine
  • قائمة الأنواع الرئيسية للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات، الإصدار 2009، النسخة 10 (نُشرت هذه النسخة في 24 أغسطس 2011)
  • طريقة بالتيمور
  • قاعدة بيانات وتحليل مسببات الأمراض الفيروسية (ViPR)
  • كيف يتم تصنيف الفيروسات؟
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=تصنيف_الفيروسات&oldid=1248766022"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate